seq1 = pF1KSDB1480.tfa, 2958 bp seq2 = pF1KSDB1480/gi568815597f_22610983.tfa (gi568815597f:22610983_23013567), 402585 bp >pF1KSDB1480 2958 >gi568815597f:22610983_23013567 (Chr1) 1-61 (100001-100061) 100% -> 62-126 (170439-170503) 100% -> 127-811 (173410-174094) 100% -> 812-967 (252055-252210) 100% -> 968-1303 (253895-254230) 100% -> 1304-1428 (271377-271501) 100% -> 1429-1591 (281902-282064) 99% -> 1592-1700 (284490-284598) 100% -> 1701-1765 (285432-285496) 100% -> 1766-1888 (295005-295127) 100% -> 1889-2136 (295728-295975) 100% -> 2137-2352 (296971-297186) 100% -> 2353-2502 (298040-298189) 100% -> 2503-2696 (299400-299593) 100% -> 2697-2852 (301462-301617) 100% -> 2853-2958 (302480-302585) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCTCTGCGGAGGCTGGGGGCCGCGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCTCTGCGGAGGCTGGGGGCCGCGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTCGC 50 . : . : . : . : . : 51 CGCCGTGGAAG AAACGCTAATGGACTCCACTACAGCGACTG |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CGCCGTGGAAGGTG...CAGAAACGCTAATGGACTCCACTACAGCGACTG 100 . : . : . : . : . : 92 CTGAGCTGGGCTGGATGGTGCATCCTCCATCAGGG TGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 170469 CTGAGCTGGGCTGGATGGTGCATCCTCCATCAGGGGTG...CAGTGGGAA 150 . : . : . : . : . : 133 GAGGTGAGTGGCTACGATGAGAACATGAACACGATCCGCACGTACCAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173416 GAGGTGAGTGGCTACGATGAGAACATGAACACGATCCGCACGTACCAGGT 200 . : . : . : . : . : 183 GTGCAACGTGTTTGAGTCAAGCCAGAACAACTGGCTACGGACCAAGTTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173466 GTGCAACGTGTTTGAGTCAAGCCAGAACAACTGGCTACGGACCAAGTTTA 250 . : . : . : . : . : 233 TCCGGCGCCGTGGCGCCCACCGCATCCACGTGGAGATGAAGTTTTCGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173516 TCCGGCGCCGTGGCGCCCACCGCATCCACGTGGAGATGAAGTTTTCGGTG 300 . : . : . : . : . : 283 CGTGACTGCAGCAGCATCCCCAGCGTGCCTGGCTCCTGCAAGGAGACCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173566 CGTGACTGCAGCAGCATCCCCAGCGTGCCTGGCTCCTGCAAGGAGACCTT 350 . : . : . : . : . : 333 CAACCTCTATTACTATGAGGCTGACTTTGACTCGGCCACCAAGACCTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173616 CAACCTCTATTACTATGAGGCTGACTTTGACTCGGCCACCAAGACCTTCC 400 . : . : . : . : . : 383 CCAACTGGATGGAGAATCCATGGGTGAAGGTGGATACCATTGCAGCCGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173666 CCAACTGGATGGAGAATCCATGGGTGAAGGTGGATACCATTGCAGCCGAC 450 . : . : . : . : . : 433 GAGAGCTTCTCCCAGGTGGACCTGGGTGGCCGCGTCATGAAAATCAACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173716 GAGAGCTTCTCCCAGGTGGACCTGGGTGGCCGCGTCATGAAAATCAACAC 500 . : . : . : . : . : 483 CGAGGTGCGGAGCTTCGGACCTGTGTCCCGCAGCGGCTTCTACCTGGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173766 CGAGGTGCGGAGCTTCGGACCTGTGTCCCGCAGCGGCTTCTACCTGGCCT 550 . : . : . : . : . : 533 TCCAGGACTATGGCGGCTGCATGTCCCTCATCGCCGTGCGTGTCTTCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173816 TCCAGGACTATGGCGGCTGCATGTCCCTCATCGCCGTGCGTGTCTTCTAC 600 . : . : . : . : . : 583 CGCAAGTGCCCCCGCATCATCCAGAATGGCGCCATCTTCCAGGAAACCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173866 CGCAAGTGCCCCCGCATCATCCAGAATGGCGCCATCTTCCAGGAAACCCT 650 . : . : . : . : . : 633 GTCGGGGGCTGAGAGCACATCGCTGGTGGCTGCCCGGGGCAGCTGCATCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173916 GTCGGGGGCTGAGAGCACATCGCTGGTGGCTGCCCGGGGCAGCTGCATCG 700 . : . : . : . : . : 683 CCAATGCGGAAGAGGTGGATGTACCCATCAAGCTCTACTGTAACGGGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173966 CCAATGCGGAAGAGGTGGATGTACCCATCAAGCTCTACTGTAACGGGGAC 750 . : . : . : . : . : 733 GGCGAGTGGCTGGTGCCCATCGGGCGCTGCATGTGCAAAGCAGGCTTCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174016 GGCGAGTGGCTGGTGCCCATCGGGCGCTGCATGTGCAAAGCAGGCTTCGA 800 . : . : . : . : . : 783 GGCCGTTGAGAATGGCACCGTCTGCCGAG GTTGTCCATCTG |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 174066 GGCCGTTGAGAATGGCACCGTCTGCCGAGGTA...CAGGTTGTCCATCTG 850 . : . : . : . : . : 824 GGACTTTCAAGGCCAACCAAGGGGATGAGGCCTGTACCCACTGTCCCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 252067 GGACTTTCAAGGCCAACCAAGGGGATGAGGCCTGTACCCACTGTCCCATC 900 . : . : . : . : . : 874 AACAGCCGGACCACTTCTGAAGGGGCCACCAACTGTGTCTGCCGCAATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 252117 AACAGCCGGACCACTTCTGAAGGGGCCACCAACTGTGTCTGCCGCAATGG 950 . : . : . : . : . : 924 CTACTACAGAGCAGACCTGGACCCCCTGGACATGCCCTGCACAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 252167 CTACTACAGAGCAGACCTGGACCCCCTGGACATGCCCTGCACAAGTA... 1000 . : . : . : . : . : 968 CCATCCCCTCCGCGCCCCAGGCTGTGATTTCCAGTGTCAATGAGACC >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253892 CAGCCATCCCCTCCGCGCCCCAGGCTGTGATTTCCAGTGTCAATGAGACC 1050 . : . : . : . : . : 1015 TCCCTCATGCTGGAGTGGACCCCTCCCCGCGACTCCGGAGGCCGAGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253942 TCCCTCATGCTGGAGTGGACCCCTCCCCGCGACTCCGGAGGCCGAGAGGA 1100 . : . : . : . : . : 1065 CCTCGTCTACAACATCATCTGCAAGAGCTGTGGCTCGGGCCGGGGTGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253992 CCTCGTCTACAACATCATCTGCAAGAGCTGTGGCTCGGGCCGGGGTGCCT 1150 . : . : . : . : . : 1115 GCACCCGCTGCGGGGACAATGTACAGTACGCACCACGCCAGCTAGGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 254042 GCACCCGCTGCGGGGACAATGTACAGTACGCACCACGCCAGCTAGGCCTG 1200 . : . : . : . : . : 1165 ACCGAGCCACGCATTTACATCAGTGACCTGCTGGCCCACACCCAGTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 254092 ACCGAGCCACGCATTTACATCAGTGACCTGCTGGCCCACACCCAGTACAC 1250 . : . : . : . : . : 1215 CTTCGAGATCCAGGCTGTGAACGGCGTTACTGACCAGAGCCCCTTCTCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 254142 CTTCGAGATCCAGGCTGTGAACGGCGTTACTGACCAGAGCCCCTTCTCGC 1300 . : . : . : . : . : 1265 CTCAGTTCGCCTCTGTGAACATCACCACCAACCAGGCAG CT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 254192 CTCAGTTCGCCTCTGTGAACATCACCACCAACCAGGCAGGTA...CAGCT 1350 . : . : . : . : . : 1306 CCATCGGCAGTGTCCATCATGCATCAGGTGAGCCGCACCGTGGACAGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271379 CCATCGGCAGTGTCCATCATGCATCAGGTGAGCCGCACCGTGGACAGCAT 1400 . : . : . : . : . : 1356 TACCCTGTCGTGGTCCCAGCCGGACCAGCCCAATGGCGTGATCCTGGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271429 TACCCTGTCGTGGTCCCAGCCGGACCAGCCCAATGGCGTGATCCTGGACT 1450 . : . : . : . : . : 1406 ATGAGCTGCAGTACTATGAGAAG GAGCTCAGTGAGTACAAC |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 271479 ATGAGCTGCAGTACTATGAGAAGGTA...CAGGAGCTCAGTGAGTACAAC 1500 . : . : . : . : . : 1447 GCCACAGCCATAAAAAGCCCCACCAACACGGTCACCGTGCAGGGCCTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 281920 GCCACAGCCATAAAAAGCCCCACCAACACGGTCACCGTGCAGGGCCTCAA 1550 . : . : . : . : . : 1497 AGCCGGCGCCATCTATGTCTTCCAGGTGCGGGCACGCACCGTGGCAGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 281970 AGCCGGCGCCATCTATGTCTTCCAGGTGCGGGCACGCACCGTGGCAGGTT 1600 . : . : . : . : . : 1547 ACGGGCGCTACAGCGGCAAGATGTACTTCCAGACCATGACAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 282020 ACGGGCGCTACAGCGGCAAGATGTACTTCCAGACCATGACAGAAGGTG.. 1650 . : . : . : . : . : 1592 CCGAGTACCAGACAAGCATCCAGGAGAAGTTGCCACTCATCATCGG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 282070 .CAGCCGAGTACCAGACAAGCATCCAGGAGAAGTTGCCACTCATCATCGG 1700 . : . : . : . : . : 1638 CTCCTCGGCCGCTGGCCTGGTCTTCCTCATTGCTGTGGTTGTCATCGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 284536 CTCCTCGGCCGCTGGCCTGGTCTTCCTCATTGCTGTGGTTGTCATCGCCA 1750 . : . : . : . : . : 1688 TCGTGTGTAACAG ACGGGGGTTTGAGCGTGCTGACTCGGAG |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 284586 TCGTGTGTAACAGGTG...AAGACGGGGGTTTGAGCGTGCTGACTCGGAG 1800 . : . : . : . : . : 1729 TACACGGACAAGCTGCAACACTACACCAGTGGCCACA TGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 285460 TACACGGACAAGCTGCAACACTACACCAGTGGCCACAGTA...CAGTGAC 1850 . : . : . : . : . : 1770 CCCAGGCATGAAGATCTACATCGATCCTTTCACCTACGAGGACCCCAACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295009 CCCAGGCATGAAGATCTACATCGATCCTTTCACCTACGAGGACCCCAACG 1900 . : . : . : . : . : 1820 AGGCAGTGCGGGAGTTTGCCAAGGAAATTGACATCTCCTGTGTCAAAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295059 AGGCAGTGCGGGAGTTTGCCAAGGAAATTGACATCTCCTGTGTCAAAATT 1950 . : . : . : . : . : 1870 GAGCAGGTGATCGGAGCAG GGGAGTTTGGCGAGGTCTGCAG |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 295109 GAGCAGGTGATCGGAGCAGGTA...CAGGGGAGTTTGGCGAGGTCTGCAG 2000 . : . : . : . : . : 1911 TGGCCACCTGAAGCTGCCAGGCAAGAGAGAGATCTTTGTGGCCATCAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295750 TGGCCACCTGAAGCTGCCAGGCAAGAGAGAGATCTTTGTGGCCATCAAGA 2050 . : . : . : . : . : 1961 CGCTCAAGTCGGGCTACACGGAGAAGCAGCGCCGGGACTTCCTGAGCGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295800 CGCTCAAGTCGGGCTACACGGAGAAGCAGCGCCGGGACTTCCTGAGCGAA 2100 . : . : . : . : . : 2011 GCCTCCATCATGGGCCAGTTCGACCATCCCAACGTCATCCACCTGGAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295850 GCCTCCATCATGGGCCAGTTCGACCATCCCAACGTCATCCACCTGGAGGG 2150 . : . : . : . : . : 2061 TGTCGTGACCAAGAGCACACCTGTGATGATCATCACCGAGTTCATGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 295900 TGTCGTGACCAAGAGCACACCTGTGATGATCATCACCGAGTTCATGGAGA 2200 . : . : . : . : . : 2111 ATGGCTCCCTGGACTCCTTTCTCCGG CAAAACGATGGGCAG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 295950 ATGGCTCCCTGGACTCCTTTCTCCGGGTA...AAGCAAAACGATGGGCAG 2250 . : . : . : . : . : 2152 TTCACAGTCATCCAGCTGGTGGGCATGCTTCGGGGCATCGCAGCTGGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 296986 TTCACAGTCATCCAGCTGGTGGGCATGCTTCGGGGCATCGCAGCTGGCAT 2300 . : . : . : . : . : 2202 GAAGTACCTGGCAGACATGAACTATGTTCACCGTGACCTGGCTGCCCGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 297036 GAAGTACCTGGCAGACATGAACTATGTTCACCGTGACCTGGCTGCCCGCA 2350 . : . : . : . : . : 2252 ACATCCTCGTCAACAGCAACCTGGTCTGCAAGGTGTCGGACTTTGGGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 297086 ACATCCTCGTCAACAGCAACCTGGTCTGCAAGGTGTCGGACTTTGGGCTC 2400 . : . : . : . : . : 2302 TCACGCTTTCTAGAGGACGATACCTCAGACCCCACCTACACCAGTGCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 297136 TCACGCTTTCTAGAGGACGATACCTCAGACCCCACCTACACCAGTGCCCT 2450 . : . : . : . : . : 2352 G GGCGGAAAGATCCCCATCCGCTGGACAGCCCCGGAAGCCA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 297186 GGTA...CAGGGCGGAAAGATCCCCATCCGCTGGACAGCCCCGGAAGCCA 2500 . : . : . : . : . : 2393 TCCAGTACCGGAAGTTCACCTCGGCCAGTGATGTGTGGAGCTACGGCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 298080 TCCAGTACCGGAAGTTCACCTCGGCCAGTGATGTGTGGAGCTACGGCATT 2550 . : . : . : . : . : 2443 GTCATGTGGGAGGTGATGTCCTATGGGGAGCGGCCCTACTGGGACATGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 298130 GTCATGTGGGAGGTGATGTCCTATGGGGAGCGGCCCTACTGGGACATGAC 2600 . : . : . : . : . : 2493 CAACCAGGAT GTAATCAATGCCATTGAGCAGGACTATCGGC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 298180 CAACCAGGATGTA...CAGGTAATCAATGCCATTGAGCAGGACTATCGGC 2650 . : . : . : . : . : 2534 TGCCACCGCCCATGGACTGCCCGAGCGCCCTGCACCAACTCATGCTGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 299431 TGCCACCGCCCATGGACTGCCCGAGCGCCCTGCACCAACTCATGCTGGAC 2700 . : . : . : . : . : 2584 TGTTGGCAGAAGGACCGCAACCACCGGCCCAAGTTCGGCCAAATTGTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 299481 TGTTGGCAGAAGGACCGCAACCACCGGCCCAAGTTCGGCCAAATTGTCAA 2750 . : . : . : . : . : 2634 CACGCTAGACAAGATGATCCGCAATCCCAACAGCCTCAAAGCCATGGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 299531 CACGCTAGACAAGATGATCCGCAATCCCAACAGCCTCAAAGCCATGGCGC 2800 . : . : . : . : . : 2684 CCCTCTCCTCTGG CATCAACCTGCCGCTGCTGGACCGCACG |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 299581 CCCTCTCCTCTGGGTA...CAGCATCAACCTGCCGCTGCTGGACCGCACG 2850 . : . : . : . : . : 2725 ATCCCCGACTACACCAGCTTTAACACGGTGGACGAGTGGCTGGAGGCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 301490 ATCCCCGACTACACCAGCTTTAACACGGTGGACGAGTGGCTGGAGGCCAT 2900 . : . : . : . : . : 2775 CAAGATGGGGCAGTACAAGGAGAGCTTCGCCAATGCCGGCTTCACCTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 301540 CAAGATGGGGCAGTACAAGGAGAGCTTCGCCAATGCCGGCTTCACCTCCT 2950 . : . : . : . : . : 2825 TTGACGTCGTGTCTCAGATGATGATGGA GGACATTCTCCGG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 301590 TTGACGTCGTGTCTCAGATGATGATGGAGTA...AAGGGACATTCTCCGG 3000 . : . : . : . : . : 2866 GTTGGGGTCACTTTGGCTGGCCACCAGAAAAAAATCCTGAACAGTATCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 302493 GTTGGGGTCACTTTGGCTGGCCACCAGAAAAAAATCCTGAACAGTATCCA 3050 . : . : . : . : 2916 GGTGATGCGGGCGCAGATGAACCAGATTCAGTCTGTGGAGGTT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 302543 GGTGATGCGGGCGCAGATGAACCAGATTCAGTCTGTGGAGGTT