Result of FASTA (omim) for pF1KSDB0068
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0068, 1032 aa
  1>>>pF1KSDB0068 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2169+/-0.000798; mu= -15.2094+/- 0.049
 mean_var=616.0664+/-126.778, 0's: 0 Z-trim(115.0): 372  B-trim: 238 in 1/54
 Lambda= 0.051673
 statistics sampled from 24786 (25157) to 24786 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.295), width:  16
 Scan time: 15.770

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004975 (OMIM: 602821,604187) kinesin heavy chai (1032) 6605 509.3 4.4e-143
XP_016859551 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kine ( 957) 4656 364.0 2.3e-99
NP_004513 (OMIM: 604593,615282) kinesin heavy chai ( 957) 4656 364.0 2.3e-99
NP_004512 (OMIM: 602809) kinesin-1 heavy chain [Ho ( 963) 4384 343.7 2.9e-93
XP_016871713 (OMIM: 602809) PREDICTED: kinesin-1 h ( 869) 3920 309.1   7e-83
XP_011509459 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kine ( 725) 3231 257.6 1.8e-67
XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 724)  969 89.0   1e-16
NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 726)  969 89.0   1e-16
NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3 ( 747)  953 87.8 2.4e-16
XP_016864484 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 700)  948 87.4   3e-16
NP_001287721 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 702)  948 87.4   3e-16
XP_016864485 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 697)  931 86.1 7.2e-16
NP_008985 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3 ( 699)  931 86.1 7.2e-16
XP_016863148 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2551)  925 86.3 2.4e-15
XP_011529851 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2553)  925 86.3 2.4e-15
XP_011529850 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2604)  925 86.3 2.4e-15
XP_011529849 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2605)  925 86.3 2.4e-15
XP_011529848 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2633)  925 86.3 2.4e-15
XP_011529847 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2648)  925 86.3 2.4e-15
NP_001804 (OMIM: 117143,616051) centromere-associa (2701)  925 86.3 2.5e-15
NP_001092763 (OMIM: 609184) chromosome-associated  (1234)  910 84.8 3.2e-15
NP_036442 (OMIM: 300521,300923) chromosome-associa (1232)  899 84.0 5.6e-15
NP_001273663 (OMIM: 117143,616051) centromere-asso (2580)  873 82.4 3.5e-14
XP_011529846 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2676)  873 82.4 3.6e-14
XP_005246008 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 984)  859 80.9 3.8e-14
XP_005246007 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 985)  859 80.9 3.8e-14
XP_011540147 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 992)  859 80.9 3.8e-14
XP_011540146 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 997)  859 80.9 3.8e-14
XP_011540145 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1017)  859 80.9 3.9e-14
NP_001116291 (OMIM: 605037) kinesin-like protein K (1028)  859 80.9 3.9e-14
NP_065867 (OMIM: 605037) kinesin-like protein KIF1 (1029)  859 80.9 3.9e-14
XP_011540144 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1031)  859 80.9 3.9e-14
XP_011540143 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1038)  859 81.0 3.9e-14
XP_011540142 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1042)  859 81.0 3.9e-14
XP_011540141 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1043)  859 81.0 3.9e-14
XP_011540140 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1062)  859 81.0   4e-14
XP_011540139 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1063)  859 81.0   4e-14
NP_112494 (OMIM: 611271) kinesin-like protein KIF1 ( 898)  743 72.2 1.4e-11
XP_016873868 (OMIM: 611271) PREDICTED: kinesin-lik ( 898)  743 72.2 1.4e-11
NP_904325 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1153)  746 72.6 1.4e-11
NP_055889 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1770)  746 72.8 1.9e-11
NP_001252506 (OMIM: 614570) kinesin-like protein K ( 852)  733 71.5 2.3e-11
XP_011522690 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 861)  733 71.5 2.3e-11
XP_011522693 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 437)  721 70.3 2.7e-11
NP_001305643 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 687)  724 70.7 3.2e-11
NP_001123571 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 687)  724 70.7 3.2e-11
NP_001305644 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 687)  724 70.7 3.2e-11
XP_011521381 (OMIM: 604535) PREDICTED: kinesin-lik ( 694)  724 70.7 3.2e-11
XP_011521380 (OMIM: 604535) PREDICTED: kinesin-lik ( 694)  724 70.7 3.2e-11
NP_001305641 (OMIM: 604535) kinesin-like protein K ( 724)  724 70.7 3.3e-11


>>NP_004975 (OMIM: 602821,604187) kinesin heavy chain is  (1032 aa)
 initn: 6605 init1: 6605 opt: 6605  Z-score: 2689.8  bits: 509.3 E(85289): 4.4e-143
Smith-Waterman score: 6605; 99.9% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030  
pF1KSD KLFPLHQETAAS
       ::::::::::::
NP_004 KLFPLHQETAAS
             1030  

>>XP_016859551 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kinesin   (957 aa)
 initn: 4634 init1: 3190 opt: 4656  Z-score: 1905.0  bits: 364.0 E(85289): 2.3e-99
Smith-Waterman score: 4656; 75.3% identity (92.4% similar) in 952 aa overlap (7-952:6-956)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPPNTTQ
             ::::::.:::::::.::::::::::: :.::..:::: :::::::::.::::::
XP_016  MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQ
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD EQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNH
       ::::.::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
XP_016 EQVYNACAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDH
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::::::::::::
XP_016 IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEE
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD ILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKV
       ..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
XP_016 VMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKV
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
XP_016 SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD MFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKET
       . :::::: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:. :..
XP_016 IVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNV
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400        410        
pF1KSD IAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYE
       : .:: ::.:::::: ::: :......   . : :..::. :: . .:. :. ::..::.
XP_016 IQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK-NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYD
     360       370       380        390       400       410        

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD EEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSEND
       :::  ::.::::::::::::::: ::::::::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.
XP_016 EEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENE
      420       430       440       450       460       470        

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD AAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQE
       :::::::::::.::::::::::::::::.:.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::
XP_016 AAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQE
      480       490       500       510       520       530        

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD VSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEV
       .:.::.:: .:.:: :.:::.:.. :.:....:  ....:.::::::.:::::::.::::
XP_016 LSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEV
      540       550       560       570       580       590        

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD KSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLE
       ::.:.: .:::. :.. .:::... :::..::::::::::::.:::.:::..: :.:.::
XP_016 KSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLE
      600       610       620       630       640       650        

      660       670       680           690       700       710    
pF1KSD ESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPD----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
       :: ::::.:::::.::: .:::...::: .     :::.:.::::: :::::::::..::
XP_016 ESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQL
      660       670       680       690       700       710        

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
       .::::::.:::: :::..::::::::: :::..::.::: :..:.  ::..: .: ...:
XP_016 SRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKRE
      720       730       740       750       760       770        

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
       :...:::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:.. .:.::  .:::::::::
XP_016 QAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLE
      780       790       800       810       820       830        

          840       850       860       870       880       890    
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::.:..:::
XP_016 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQ
      840       850       860       870       880       890        

          900       910       920       930       940       950    
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
       ::::::::::: :. ..:.::::::::.:::::::::::  .. :.    : ... .:  
XP_016 QEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK 
      900       910       920       930       940       950        

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY

>>NP_004513 (OMIM: 604593,615282) kinesin heavy chain is  (957 aa)
 initn: 4634 init1: 3190 opt: 4656  Z-score: 1905.0  bits: 364.0 E(85289): 2.3e-99
Smith-Waterman score: 4656; 75.3% identity (92.4% similar) in 952 aa overlap (7-952:6-956)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPPNTTQ
             ::::::.:::::::.::::::::::: :.::..:::: :::::::::.::::::
NP_004  MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQ
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD EQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNH
       ::::.::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
NP_004 EQVYNACAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDH
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::::::::::::
NP_004 IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEE
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD ILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKV
       ..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
NP_004 VMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKV
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
NP_004 SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD MFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKET
       . :::::: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:. :..
NP_004 IVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNV
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400        410        
pF1KSD IAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYE
       : .:: ::.:::::: ::: :......   . : :..::. :: . .:. :. ::..::.
NP_004 IQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK-NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYD
     360       370       380        390       400       410        

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD EEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSEND
       :::  ::.::::::::::::::: ::::::::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.
NP_004 EEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENE
      420       430       440       450       460       470        

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD AAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQE
       :::::::::::.::::::::::::::::.:.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::
NP_004 AAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQE
      480       490       500       510       520       530        

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD VSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEV
       .:.::.:: .:.:: :.:::.:.. :.:....:  ....:.::::::.:::::::.::::
NP_004 LSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEV
      540       550       560       570       580       590        

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD KSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLE
       ::.:.: .:::. :.. .:::... :::..::::::::::::.:::.:::..: :.:.::
NP_004 KSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLE
      600       610       620       630       640       650        

      660       670       680           690       700       710    
pF1KSD ESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPD----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
       :: ::::.:::::.::: .:::...::: .     :::.:.::::: :::::::::..::
NP_004 ESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQL
      660       670       680       690       700       710        

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
       .::::::.:::: :::..::::::::: :::..::.::: :..:.  ::..: .: ...:
NP_004 SRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKRE
      720       730       740       750       760       770        

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
       :...:::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:.. .:.::  .:::::::::
NP_004 QAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLE
      780       790       800       810       820       830        

          840       850       860       870       880       890    
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::.:..:::
NP_004 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQ
      840       850       860       870       880       890        

          900       910       920       930       940       950    
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
       ::::::::::: :. ..:.::::::::.:::::::::::  .. :.    : ... .:  
NP_004 QEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK 
      900       910       920       930       940       950        

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY

>>NP_004512 (OMIM: 602809) kinesin-1 heavy chain [Homo s  (963 aa)
 initn: 4366 init1: 1521 opt: 4384  Z-score: 1795.3  bits: 343.7 E(85289): 2.9e-93
Smith-Waterman score: 4384; 72.0% identity (90.4% similar) in 939 aa overlap (7-939:6-941)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
             ::.:::.:::::::..:. ::::.:  :::.:.:::..:::.:::::  .:.::
NP_004  MADLAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYIAKFQGEDTVVIASKPYAFDRVFQSSTSQE
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
       :::. :: .:::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::::::..::::.:
NP_004 QVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::.:.
NP_004 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEV
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
       .:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::::::::::::
NP_004 MDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::::::::::::::::::::::.
NP_004 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGS-TYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTI
     240       250       260       270        280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
        :::::::::..::::::.:::::::::::. ::.:::::::::::::::::.:  ..::
NP_004 VICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTI
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390         400           410    
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEE--TPVNDNSSIVVRI----APEER
         :: ::.::::::.::  :..  :.: : :   ..  : .::. . .. .    .  ::
NP_004 QWLENELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KSD QKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQ
       .: :::: .:::::::::.::::::::.:::: :::::::::.::: :....: ::..::
NP_004 RKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQ
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KSD SENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQ
       .::::.:.:::::::.::::::::::::::::.:... .:: :::.:: ::. :...:::
NP_004 AENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQ
      480       490       500       510       520       530        

          540       550       560       570       580       590    
pF1KSD RLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKI
       .:.:...::.:: ::.. .:.:::.:... :::...: : : .: :.::::::::::::.
NP_004 KLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQP-EGTGMIDEEFTVARLYISKM
      540       550       560       570        580       590       

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pF1KSD KSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKK
       :::::..::::.:::. :.: ..::: . .::..::: ::::::::.:::::.:.:: ::
NP_004 KSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKK
       600       610       620       630       640       650       

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pF1KSD RHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
       :.:::: :.::.::..:.::: :::.  :..   .: :.:::.:.: :..::::.:..:.
NP_004 RQLEESVDALSEELVQLRAQEKVHEME-KEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQI
       660       670       680        690       700       710      

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pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
       . ::::.. : : : .:.: :::..:: :.:....::::. ..::: ::.::: . .:.:
NP_004 SSLRDEVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRRE
        720       730       740       750       760       770      

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
       :..:::::::::::.:::::::::::::::..::::::::.. .:.::  .:::::::::
NP_004 QARQDLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLE
        780       790       800       810       820       830      

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pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:..:::
NP_004 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQ
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pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
       ::::::::::: :. ..::::::::::.:::..::.:::.: . :               
NP_004 QEVDRIKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVR
        900       910       920       930       940       950      

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pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
                                                                   
NP_004 GGGGKQV                                                     
        960                                                        

>>XP_016871713 (OMIM: 602809) PREDICTED: kinesin-1 heavy  (869 aa)
 initn: 3902 init1: 1159 opt: 3920  Z-score: 1608.9  bits: 309.1 E(85289): 7e-83
Smith-Waterman score: 3920; 71.8% identity (90.4% similar) in 850 aa overlap (96-939:1-847)

          70        80        90       100       110       120     
pF1KSD CAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHIYSMDE
                                     ::::::::. :::::::..::::.::::::
XP_016                               MEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDE
                                             10        20        30

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pF1KSD NLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEILDVID
       ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::.:..:.::
XP_016 NLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTID
               40        50        60        70        80        90

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pF1KSD EGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAE
       :::::::::::::::::::::::::::.:::: .::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAE
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pF1KSD GAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCS
       :::::::::::::::::::::::::::. .::::::::::::::::::::::::. ::::
XP_016 GAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGS-TYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCS
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pF1KSD PSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEA
       :::::..::::::.:::::::::::. ::.:::::::::::::::::.:  ..::  :: 
XP_016 PSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTIQWLEN
     210       220       230       240       250       260         

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pF1KSD ELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEE--TPVNDNSSIVVRI----APEERQKYEE
       ::.::::::.::  :..  :.: : :   ..  : .::. . .. .    .  ::.: ::
XP_016 ELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAERRKCEE
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pF1KSD EIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDA
       :: .:::::::::.::::::::.:::: :::::::::.::: :....: ::..::.::::
XP_016 EIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDA
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pF1KSD AKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEV
       .:.:::::::.::::::::::::::::.:... .:: :::.:: ::. :...:::.:.:.
XP_016 SKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQKLKEM
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pF1KSD SGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVK
       ..::.:: ::.. .:.:::.:... :::...: : : .: :.::::::::::::.:::::
XP_016 TNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQP-EGTGMIDEEFTVARLYISKMKSEVK
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       ..::::.:::. :.: ..::: . .::..::: ::::::::.:::::.:.:: :::.:::
XP_016 TMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKKRQLEE
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pF1KSD SYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRD
       : :.::.::..:.::: :::.  :..   .: :.:::.:.: :..::::.:..:.. :::
XP_016 SVDALSEELVQLRAQEKVHEME-KEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQISSLRD
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pF1KSD EINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQD
       :.. : : : .:.: :::..:: :.:....::::. ..::: ::.::: . .:.::..::
XP_016 EVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRREQARQD
       630       640       650       660       670       680       

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pF1KSD LKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQ
       :::::::::.:::::::::::::::..::::::::.. .:.::  .::::::::::::::
XP_016 LKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLENNLEQ
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pF1KSD LTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:..::::::::
XP_016 LTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQQEVDR
       750       760       770       780       790       800       

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pF1KSD IKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYL
       :::::: :. ..::::::::::.:::..::.:::.: . :                    
XP_016 IKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVRGGGGK
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pF1KSD QATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQ
                                                                   
XP_016 QV                                                          
                                                                   

>>XP_011509459 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kinesin   (725 aa)
 initn: 3211 init1: 1978 opt: 3231  Z-score: 1332.3  bits: 257.6 E(85289): 1.8e-67
Smith-Waterman score: 3231; 70.2% identity (90.5% similar) in 719 aa overlap (239-952:7-724)

      210       220       230       240       250       260        
pF1KSD FLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                         MATYIHVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISA
                                       10        20        30      

      270       280       290       300       310       320        
pF1KSD LAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIK
       ::::::..:::::::::::::::::::::::. :::::: .:.:::::::::::::::::
XP_011 LAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIK
         40        50        60        70        80        90      

      330       340       350       360       370       380        
pF1KSD NTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAA
       ::.:::::::::.:::::::::::.:. :..: .:: ::.:::::: ::: :......  
XP_011 NTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNVIQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK
        100       110       120       130       140       150      

      390       400        410       420       430       440       
pF1KSD LGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQ
        . : :..::. :: . .:. :. ::..::.:::  ::.::::::::::::::: :::::
XP_011 -NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYDEEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQ
         160       170       180       190       200       210     

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD QMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEE
       :::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.:::::::::::.::::::::::::::::.
XP_011 QMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVED
         220       230       240       250       260       270     

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD KSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGN
       :.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::.:.::.:: .:.:: :.:::.:.. :.:.
XP_011 KTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGT
         280       290       300       310       320       330     

       570       580       590       600       610       620       
pF1KSD GEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELS
       ...:  ....:.::::::.:::::::.::::::.:.: .:::. :.. .:::... :::.
XP_011 NDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELA
         340       350       360       370       380       390     

       630       640       650       660       670       680       
pF1KSD SCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEP
       .::::::::::::.:::.:::..: :.:.:::: ::::.:::::.::: .:::...::: 
XP_011 ACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLEESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEK
         400       410       420       430       440       450     

           690       700       710       720       730       740   
pF1KSD D----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELE
       .     :::.:.::::: :::::::::..::.::::::.:::: :::..::::::::: :
XP_011 EHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQLSRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQE
         460       470       480       490       500       510     

           750       760       770       780       790       800   
pF1KSD KLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQ
       ::..::.::: :..:.  ::..: .: ...::...:::::::::.:::::::::::::::
XP_011 KLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKREQAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQ
         520       530       540       550       560       570     

           810       820       830       840       850       860   
pF1KSD DVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEK
       :.:::::::.:.. .:.::  .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEK
         580       590       600       610       620       630     

           870       880       890       900       910       920   
pF1KSD RLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVR
       :::::::::::::.:::::::.::.:..:::::::::::::: :. ..:.::::::::.:
XP_011 RLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIR
         640       650       660       670       680       690     

           930       940       950       960       970       980   
pF1KSD PGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSS
       ::::::::::  .. :.    : ... .:                               
XP_011 PGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK                              
         700       710       720                                   

>>XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-like pr  (724 aa)
 initn: 881 init1: 407 opt: 969  Z-score: 421.0  bits: 89.0 E(85289): 1e-16
Smith-Waterman score: 1002; 32.8% identity (60.2% similar) in 716 aa overlap (2-676:6-699)

                    10        20                    30        40   
pF1KSD     MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
            .:  . : ..::. : ::::. :             .::   : . . :.:    
XP_006 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
               10        20        30        40          50        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
        : ..:: :: :.. : .::.  :  :. .:: ::::::::::::..::: ::::    :
XP_006 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
        60        70        80        90       100       110       

           110       120       130       140       150        160  
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
       .: ::::     ::.:: . . . .: ..:::.::: ...::::   .:. : :.:  . 
XP_006 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210         220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
         ..:  .   :.. ...  ..  :..:: :..:::::::::::.:: :.:.  ..... 
XP_006 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
       180       190       200       210       220       230       

               230       240       250       260       270         
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
       ....  :::.::::::::. .:::: :  : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
XP_006 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
       :.::.::.:::::::: .: :    .:..::  :: ::: ...:::.::: : .: :   
XP_006 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
       300       310       320       330       340       350       

     340       350       360                370       380       390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKL---------EAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALG
       .   ....:: :. : . :   ..         : .  . . ::.  . ..  :  .. .
XP_006 DALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSS
        360       370       380       390       400       410      

                 400          410           420       430       440
pF1KSD AE-LCE--ETPVND---NSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQ
       ..  :   : :..    :..   ...:    : . : .:: . :  .:: ...: :.   
XP_006 SDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARA
        420       430       440       450       460       470      

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD LIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQ
        .:: ....:  ..       ..... ..:: :  :. .    : ..:   ::     ..
XP_006 ELEKREKDLLKAQQ-------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEE
        480       490              500         510        520      

              510       520       530       540       550       560
pF1KSD KSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSE
       ...:.::. .. . :  :: .:    :..: .   ::: .  . :.. .: . ::   ::
XP_006 SNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSE
        530       540       550       560       570       580      

              570       580        590       600       610         
pF1KSD FSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKM
       .. .    . .   :: : .:.   ..: : .. .   . . . :  : : ..   : . 
XP_006 MADL----QQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNE
        590           600       610         620        630         

     620       630       640           650       660       670     
pF1KSD EVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQE
       .. :.   .:    ...  :   . .  ..    :.:.. .:  . .:: . : ::.  .
XP_006 DI-GEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
     640        650       660       670       680       690        

         680       690       700       710       720       730     
pF1KSD TVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLN
       :                                                           
XP_006 TSKGKARPKTGRSSGAMVSSFIKRYH                                  
      700       710       720                                      

>>NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3A  (726 aa)
 initn: 881 init1: 407 opt: 969  Z-score: 421.0  bits: 89.0 E(85289): 1e-16
Smith-Waterman score: 1002; 32.8% identity (60.2% similar) in 716 aa overlap (2-676:6-699)

                    10        20                    30        40   
pF1KSD     MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
            .:  . : ..::. : ::::. :             .::   : . . :.:    
NP_001 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
               10        20        30        40          50        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
        : ..:: :: :.. : .::.  :  :. .:: ::::::::::::..::: ::::    :
NP_001 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
        60        70        80        90       100       110       

           110       120       130       140       150        160  
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
       .: ::::     ::.:: . . . .: ..:::.::: ...::::   .:. : :.:  . 
NP_001 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210         220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
         ..:  .   :.. ...  ..  :..:: :..:::::::::::.:: :.:.  ..... 
NP_001 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
       180       190       200       210       220       230       

               230       240       250       260       270         
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
       ....  :::.::::::::. .:::: :  : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
NP_001 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
       :.::.::.:::::::: .: :    .:..::  :: ::: ...:::.::: : .: :   
NP_001 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
       300       310       320       330       340       350       

     340       350       360                370       380       390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKL---------EAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALG
       .   ....:: :. : . :   ..         : .  . . ::.  . ..  :  .. .
NP_001 DALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSS
        360       370       380       390       400       410      

                 400          410           420       430       440
pF1KSD AE-LCE--ETPVND---NSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQ
       ..  :   : :..    :..   ...:    : . : .:: . :  .:: ...: :.   
NP_001 SDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARA
        420       430       440       450       460       470      

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD LIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQ
        .:: ....:  ..       ..... ..:: :  :. .    : ..:   ::     ..
NP_001 ELEKREKDLLKAQQ-------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEE
        480       490              500         510        520      

              510       520       530       540       550       560
pF1KSD KSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSE
       ...:.::. .. . :  :: .:    :..: .   ::: .  . :.. .: . ::   ::
NP_001 SNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSE
        530       540       550       560       570       580      

              570       580        590       600       610         
pF1KSD FSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKM
       .. .    . .   :: : .:.   ..: : .. .   . . . :  : : ..   : . 
NP_001 MADL----QQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNE
        590           600       610         620        630         

     620       630       640           650       660       670     
pF1KSD EVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQE
       .. :.   .:    ...  :   . .  ..    :.:.. .:  . .:: . : ::.  .
NP_001 DI-GEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
     640        650       660       670       680       690        

         680       690       700       710       720       730     
pF1KSD TVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLN
       :                                                           
NP_001 TSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ                                
      700       710       720                                      

>>NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3B [H  (747 aa)
 initn: 806 init1: 416 opt: 953  Z-score: 414.4  bits: 87.8 E(85289): 2.4e-16
Smith-Waterman score: 1014; 33.1% identity (62.9% similar) in 726 aa overlap (1-692:1-702)

               10        20         30        40                 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRG-DKFIPIFQGDDSVVIGG---------KPYVFD
       :.. ..  :..:. : ::.:  :   . :: . .     .: . .         : ..::
NP_004 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD RVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIP
        :.  :. : ..:      .: .:: :.::::::::::..:::.::::   ::.  :.::
NP_004 AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150        160         
pF1KSD RIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNRVPFVKGC
            ::.:: : ..: .. ...::.::: ..:::::.  .:. : ..:  .   .::  
NP_004 NSFDHIFTHI-SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
              130        140       150       160       170         

     170       180       190       200       210         220       
pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMETEQKLS-G
       .   ..: .::  :.. :..:: :..:::::::::::.::.:.:.  . ... :...  :
NP_004 SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
     180       190       200       210       220       230         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KSD KLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTR
       :: ::::::::. .::::.:  : :: .:: ::::::::::::..: ....::::::.::
NP_004 KLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTR
     240       250       260       270       280       290         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KSD ILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKY
       .:::::::: .:.:    .:.:::  :: .:: ...:::.:::   :: :   .   ...
NP_004 LLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVN-EDPKDALLREF
     300       310       320       330       340        350        

        350         360       370         380       390       400  
pF1KSD EKEKEKTKAQ--KETIAKLEAELSRWRNGENVP--ETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN
       ..:  . :::  :..:.. . . .: ..: .    : :.  :::.   ..  ..   ...
NP_004 QEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQ
      360       370       380       390       400       410        

              410       420       430       440       450          
pF1KSD SSIVV--RIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQE-ELLVST
        .. .  :   :...   ::  :: :. . : ... ....  : :  ..  .: .:::. 
NP_004 EKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGG
      420       430       440       450       460       470        

     460           470       480       490       500       510     
pF1KSD RG----DNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
       ..     ::. :. : . ..:    : . .:. : .:    . :... :..:  .. :  
NP_004 KNIVDHTNEQ-QKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQME----SRDEETLELKETYSSLQQE
      480        490       500       510           520       530   

         520           530       540       550       560       570 
pF1KSD VDELSQKVATMLS----LESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIK
       ::  ..:.  ..:    ...:.. :::   ..:... .. : : ..:.   .:. :    
NP_004 VDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENF---
           540       550       560       570       580       590   

             580       590       600       610       620           
pF1KSD LPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTG--RELSSC
       .:.:     :.   . : .... ... :  ..   .::: :.  .: . ..:  : ::. 
NP_004 IPLE-----EKSKIMNRAFFDEEEDHWK--LHPITRLENQQMM-KRPVSAVGYKRPLSQH
                   600       610         620        630       640  

       630       640       650       660        670       680      
pF1KSD --QLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELA-KLQAQETVHEVALKDKE
         . .. . ::. :. .  .  ... .:    . :  .  .: :.::   . ..::.:..
NP_004 ARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSR---TTRDYEGPAIAPKVQA---ALDAALQDED
            650       660       670          680          690      

        690       700       710       720       730       740      
pF1KSD PDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQ
           ::                                                      
NP_004 EIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK         
        700       710       720       730       740                

>>XP_016864484 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-like pr  (700 aa)
 initn: 881 init1: 407 opt: 948  Z-score: 412.7  bits: 87.4 E(85289): 3e-16
Smith-Waterman score: 1018; 33.5% identity (60.8% similar) in 701 aa overlap (2-676:6-675)

                    10        20                    30        40   
pF1KSD     MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
            .:  . : ..::. : ::::. :             .::   : . . :.:    
XP_016 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
               10        20        30        40          50        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
        : ..:: :: :.. : .::.  :  :. .:: ::::::::::::..::: ::::    :
XP_016 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
        60        70        80        90       100       110       

           110       120       130       140       150        160  
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
       .: ::::     ::.:: . . . .: ..:::.::: ...::::   .:. : :.:  . 
XP_016 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210         220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
         ..:  .   :.. ...  ..  :..:: :..:::::::::::.:: :.:.  ..... 
XP_016 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
       180       190       200       210       220       230       

               230       240       250       260       270         
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
       ....  :::.::::::::. .:::: :  : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
XP_016 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
       :.::.::.:::::::: .: :    .:..::  :: ::: ...:::.::: : .: :   
XP_016 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
       300       310       320       330       340       350       

     340       350       360       370       380       390         
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPV
       .   ....:: :. : . :       :.:    : ..  .:.   ::. .: .  ..   
XP_016 DALLRQFQKEIEELKKKLEE----GEEIS----GSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKR
        360       370           380           390       400        

     400       410           420       430       440       450     
pF1KSD NDNSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEEL
        :...   ...:    : . : .:: . :  .:: ...: :.    .:: ....:  .. 
XP_016 RDQAGKK-KVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQ-
      410        420       430       440       450       460       

         460       470       480       490       500       510     
pF1KSD LVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
             ..... ..:: :  :. .    : ..:   ::     .....:.::. .. . :
XP_016 ------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQL
              470         480        490       500       510       

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pF1KSD VDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVE
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