Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0032
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0032, 479 aa
1>>>pF1KSDB0032 479 - 479 aa - 479 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6958+/-0.000807; mu= 12.2596+/- 0.049
mean_var=101.8770+/-20.219, 0's: 0 Z-trim(110.5): 35 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.127068
statistics sampled from 11591 (11621) to 11591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6214.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 ( 479) 3155 588.7 4.6e-168
CCDS55248.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 ( 538) 3150 587.8 9.6e-168
CCDS55246.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 ( 473) 3117 581.7 5.7e-166
CCDS55247.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 ( 570) 3115 581.4 8.6e-166
CCDS55245.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 ( 504) 2697 504.7 9.1e-143
CCDS55244.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 ( 398) 2203 414.1 1.4e-115
CCDS13414.1 STAU1 gene_id:6780|Hs108|chr20 ( 577) 1203 230.9 2.8e-60
CCDS13415.1 STAU1 gene_id:6780|Hs108|chr20 ( 496) 1130 217.5 2.7e-56
CCDS33481.1 STAU1 gene_id:6780|Hs108|chr20 ( 502) 1108 213.4 4.4e-55
>>CCDS6214.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 (479 aa)
initn: 3155 init1: 3155 opt: 3155 Z-score: 3130.7 bits: 588.7 E(32554): 4.6e-168
Smith-Waterman score: 3155; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD SISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV
430 440 450 460 470
>>CCDS55248.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 (538 aa)
initn: 3150 init1: 3150 opt: 3150 Z-score: 3125.0 bits: 587.8 E(32554): 9.6e-168
Smith-Waterman score: 3150; 100.0% identity (100.0% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD SISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQAA
430 440 450 460 470 480
CCDS55 LSALKQFSEQGLDPIDGAMNIEKGSLEKQAKHLREKADNNQAPPGSIAQDCKKSNSAV
490 500 510 520 530
>>CCDS55246.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 (473 aa)
initn: 3117 init1: 3117 opt: 3117 Z-score: 3093.2 bits: 581.7 E(32554): 5.7e-166
Smith-Waterman score: 3117; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (7-479:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQEL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSER
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KSD SISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS55247.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 (570 aa)
initn: 3115 init1: 3115 opt: 3115 Z-score: 3090.0 bits: 581.4 E(32554): 8.6e-166
Smith-Waterman score: 3115; 99.6% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (5-478:37-510)
10 20 30
pF1KSD MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVA
..::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KTAMCLVNELARFNRVQPQYKLLNERGPAHSKMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPGSITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NKALTESTLPKPVQKPPKSNVNNNPGSITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NYNFRGMYNQRYHCPVPKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RSPQNGESGKDVDDDKDANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQELKKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFSAEGEGNSKKLSKKRAATTVLQELKKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD NPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NPISRLAQIQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAA
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENKGWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EAMLLQLGYKASTNLQDQLEKTGENKGWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEAS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD RHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RHKVISGTTLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSS
430 440 450 460 470 480
460 470
pF1KSD PTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQV
::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGFQAALSALKQFSEQGLDPIDGAMNIEKGSLEKQAKHLR
490 500 510 520 530 540
>>CCDS55245.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 (504 aa)
initn: 2697 init1: 2697 opt: 2697 Z-score: 2676.6 bits: 504.7 E(32554): 9.1e-143
Smith-Waterman score: 2697; 100.0% identity (100.0% similar) in 407 aa overlap (73-479:1-407)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD LPKPVQKPPKSNVNNNPGSITPTVELNGLAMKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKRGEPAIYRPLDPKPFPNYRANYNFRGMY
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD NQRYHCPVPKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQRYHCPVPKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGES
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KSD GKDVDDDKDANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GKDVDDDKDANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NSKKLSKKRAATTVLQELKKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NSKKLSKKRAATTVLQELKKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQ
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KSD IQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLG
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KSD YKASTNLQDQLEKTGENKGWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YKASTNLQDQLEKTGENKGWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGT
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KSD TLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLGYLSPKDMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPV
340 350 360 370 380 390
470
pF1KSD QPSKQLEYLARIQGFQV
:::::::::::::::::
CCDS55 QPSKQLEYLARIQGFQVHYCDRQSGKECVTCLTLAPVQMTFHAIGSSIEASHDQAALSAL
400 410 420 430 440 450
>>CCDS55244.1 STAU2 gene_id:27067|Hs108|chr8 (398 aa)
initn: 2203 init1: 2203 opt: 2203 Z-score: 2188.8 bits: 414.1 E(32554): 1.4e-115
Smith-Waterman score: 2203; 100.0% identity (100.0% similar) in 338 aa overlap (141-478:1-338)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PKIFYVQLTVGNNEFFGEGKTRQAARHNAAMKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKALQALQNEPIPERSPQNGESGKDVDDDK
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KSD DANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DANKSEISLVFEIALKRNMPVSFEVIKESGPPHMKSFVTRVSVGEFSAEGEGNSKKLSKK
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RAATTVLQELKKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RAATTVLQELKKLPPLPVVEKPKLFFKKRPKTIVKAGPEYGQGMNPISRLAQIQQAKKEK
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLLQLGYKASTNLQ
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DQLEKTGENKGWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DQLEKTGENKGWSGPKPGFPEPTNNTPKGILHLSPDVYQEMEASRHKVISGTTLGYLSPK
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KSD DMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DMNQPSSSFFSISPTSNSSATIARELLMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEY
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LARIQGFQV
::::::::
CCDS55 LARIQGFQAALSALKQFSEQGLDPIDGAMNIEKGSLEKQAKHLREKADNNQAPPGSIAQD
340 350 360 370 380 390
>>CCDS13414.1 STAU1 gene_id:6780|Hs108|chr20 (577 aa)
initn: 664 init1: 530 opt: 1203 Z-score: 1195.6 bits: 230.9 E(32554): 2.8e-60
Smith-Waterman score: 1349; 49.3% identity (72.9% similar) in 513 aa overlap (7-479:1-504)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLQINQMFSVQLSLGEQTWESEGSSIKKAQQAVANKAL-----TESTLP-----KPVQKP
: .::... . . ::.: . .:.. .. : : :.:: .:.:.
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60 70 80 90 100
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CCDS13 ALPSASITSTSAAAESITPTVELNALCMKLGKKPMYKPVDPYSRMQSTYNYNMRGGAYPP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
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170 180 190 200 210 220
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CCDS13 ES----EEENLNKSEISQVFEIALKRNLPVNFEVARESGPPHMKNFVTKVSVGEFVGEGE
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230 240 250 260 270
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CCDS13 GKSKKISKKNAAIAVLEELKKLPPLPAVERVKPRIKKKTKPIVKPQTSPEYGQGINPISR
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280 290 300 310 320 330
pF1KSD LAQIQQAKKEKEPDYVLLSERGMPRRREFVMQVKVGNEVATGTGPNKKIAKKNAAEAMLL
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CCDS13 LAQIQQAKKEKEPEYTLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGTGTNKKVAKRNAAENMLE
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340 350 360 370 380 390
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CCDS13 ILGFKVPQAQPTKPALKSE-EKTPIKKPGDGRKVTFFEPGSGDENGTSN-KEDEFRMPYL
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400 410 420 430 440
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450 460 470
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CCDS13 TAETI-LKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSS
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CCDS13 QPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPMSVCGRC
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CCDS13 ISRLAQIQQAKKEKEPEYTLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGTGTNKKVAKRNAAEN
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CCDS13 MLEILGFKVPQAQPTKPALKSE-EKTPIKKPGDGRKVTFFEPGSGDENGTSN-KEDEFRM
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CCDS13 PYLSHQQLPAGIL--PMVPEVAQAVGVSQGHHTKDFTRAAPNPAKATVTAMIARELLYGG
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CCDS13 TSPTAETI-LKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQGFQVEYKDFPKNNKNEFVSLIN
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CCDS13 CSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNILKLLSELDQQSTEMPRTGNGPMSVCGRC
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CCDS33 MKLGKKPMYKPVDPYSRMQSTYNYNMRGGA
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40 50 60 70 80 90
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CCDS33 NGRE----SEEENLNKSEISQVFEIALKRNLPVNFESFPLKQVARESGPPHMKNFVTKVS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]