Result of FASTA (ccds) for pF1KB8806
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8806, 355 aa
  1>>>pF1KB8806 355 - 355 aa - 355 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4409+/-0.00115; mu= 14.9606+/- 0.068
 mean_var=117.5740+/-36.933, 0's: 0 Z-trim(103.1): 316  B-trim: 929 in 2/44
 Lambda= 0.118282
 statistics sampled from 6718 (7253) to 6718 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  2.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355) 2350 413.0  2e-115
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355) 1528 272.7 3.4e-73
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376) 1528 272.7 3.5e-73
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352) 1367 245.2 6.2e-65
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360) 1349 242.1 5.3e-64
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374) 1253 225.8 4.7e-59
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360) 1145 207.3 1.6e-53
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  976 178.5 7.6e-45
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  918 168.6 7.3e-42
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  918 168.6 7.7e-42
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 344)  863 159.2 4.8e-39
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 356)  863 159.2 4.9e-39
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  839 155.1 8.8e-38
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  773 143.8 2.1e-34
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  773 143.9 2.1e-34
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  760 141.7 9.8e-34
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  760 141.7 9.9e-34
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  749 139.8 3.6e-33
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  686 129.0 6.1e-30
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  670 126.3 4.1e-29
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  670 126.3 4.4e-29
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  668 125.9   5e-29
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  668 125.9 5.1e-29
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  658 124.2 1.7e-28
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  658 124.3 1.8e-28
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  658 124.3 1.8e-28
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  652 123.2 3.3e-28
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  645 122.0 7.6e-28
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  641 121.3 1.3e-27
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  613 116.6 3.5e-26
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14          ( 391)  600 114.4 1.7e-25
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  581 111.1 1.5e-24
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  570 109.2 5.6e-24
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  567 108.7 7.6e-24
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  553 106.3   4e-23
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  547 105.3 8.8e-23
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  547 105.3 8.9e-23
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  547 105.3   9e-23
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  547 105.3   9e-23
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  547 105.3   9e-23
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  547 105.3 9.1e-23
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  547 105.4 9.3e-23
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  547 105.4 9.3e-23
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  547 105.4 9.6e-23
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  547 105.4   1e-22
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  541 104.3 1.8e-22
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  540 104.1   2e-22
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  534 103.1 3.9e-22
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  528 102.1 8.4e-22
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  525 101.5 1.1e-21


>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 2350 init1: 2350 opt: 2350  Z-score: 2185.7  bits: 413.0 E(32554): 2e-115
Smith-Waterman score: 2350; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLVLV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 QYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLYSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLYSE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWEFTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWEFTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 HTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSKAVRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSKAVRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 IFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCVNPVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCVNPVI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350     
pF1KB8 YAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHELSAGF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 YAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHELSAGF
              310       320       330       340       350     

>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 1510 init1: 1510 opt: 1528  Z-score: 1427.6  bits: 272.7 E(32554): 3.4e-73
Smith-Waterman score: 1528; 63.2% identity (86.3% similar) in 351 aa overlap (5-355:6-355)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLVL
            .:.: . ::. .:   .  :.:.. ::. ::..::::::::..::.::..::..:
CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNVVVVMIL
               10         20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 VQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLYS
       ..:.::. ::.:::::::::::::: :::::: :    .:::: .:::.:::::.:::::
CCDS27 IKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYS
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWEFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.::.::..: . : .:.  : 
CCDS27 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFYETEELFE
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 HHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSKAVR
       .  ::  .:....  :. :..:....: :::::::: :::::::: ::: :..:: ::.:
CCDS27 ETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIR
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB8 LIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCVNPV
       :::::: .::.::::::..::.: .:..:: ..::.:.::::.. :::::::.:::.:::
CCDS27 LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPV
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 IYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHELSAGF
       ::::::::::::::..:::.. .:: ...:::  ..:::.::.::::.: :::  :
CCDS27 IYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
     300       310       320       330       340       350     

>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                (376 aa)
 initn: 1510 init1: 1510 opt: 1528  Z-score: 1427.3  bits: 272.7 E(32554): 3.5e-73
Smith-Waterman score: 1528; 63.2% identity (86.3% similar) in 351 aa overlap (5-355:27-376)

                                     10        20        30        
pF1KB8                       METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLP
                                 .:.: . ::. .:   .  :.:.. ::. ::..:
CCDS54 MPFGIRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVP
               10        20        30         40        50         

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB8 PLYSLVFVIGLVGNILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDD
       :::::::..::.::..::..:..:.::. ::.:::::::::::::: :::::: :    .
CCDS54 PLYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHN
      60        70        80        90       100       110         

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB8 WVFGDAMCKILSGFYYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIW
       :::: .:::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
CCDS54 WVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTW
     120       130       140       150       160       170         

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB8 ALAILASMPGLYFSKTQWEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIIC
       .::.::..: . : .:.  : .  ::  .:....  :. :..:....: :::::::: ::
CCDS54 GLAVLAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAIC
     180       190       200       210       220       230         

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB8 YTGIIKILLRRPNEKKSKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRH
       :::::: ::: :..:: ::.::::::: .::.::::::..::.: .:..:: ..::.:.:
CCDS54 YTGIIKTLLRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKH
     240       250       260       270       280       290         

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB8 LDLAVQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLER
       :::.. :::::::.:::.:::::::::::::::::..:::.. .:: ...:::  ..:::
CCDS54 LDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLER
     300       310       320       330       340       350         

      340       350     
pF1KB8 VSSTSPSTGEHELSAGF
       .::.::::.: :::  :
CCDS54 TSSVSPSTAEPELSIVF
     360       370      

>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3                 (352 aa)
 initn: 635 init1: 635 opt: 1367  Z-score: 1279.2  bits: 245.2 E(32554): 6.2e-65
Smith-Waterman score: 1367; 56.0% identity (85.5% similar) in 352 aa overlap (9-355:2-352)

               10           20        30        40        50       
pF1KB8 METPNTTEDYDTTT---EFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVL
               ::....   ...:  . ::::.: . ..:.::::::::::..:.:::.::.:
CCDS27        MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVIL
                      10        20        30        40        50   

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB8 VLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGL
       .:.. ::::.::.:::::::::::.::.:.:::  :   . : ::..::..:.:.:. :.
CCDS27 ILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQ-WDFGNTMCQLLTGLYFIGF
            60        70        80        90        100       110  

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB8 YSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWE
       .: ::::::::::::::.:::::::.::::::::.::.: :..:..::.::. :...: :
CCDS27 FSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTRSQKE
            120       130       140       150       160       170  

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB8 FTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKS-K
         :.::: :::. . . :: ::.::. ..:::::::::.:::.::.: :::  ::::  .
CCDS27 GLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHR
            180       190       200       210       220       230  

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 AVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCV
       ::::::.:::..::::.:::...:...::.:.  ..: .: .:: :.::::....::::.
CCDS27 AVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCI
            240       250       260       270       280       290  

        300       310       320       330       340        350     
pF1KB8 NPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSST-SPSTGEHELSAGF
       ::.:::::::.::.::  .:....: .. :   ... .  ::.::. . ::::.:.:.:.
CCDS27 NPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEISVGL
            300       310       320       330       340       350  

>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (360 aa)
 initn: 1319 init1: 412 opt: 1349  Z-score: 1262.5  bits: 242.1 E(32554): 5.3e-64
Smith-Waterman score: 1349; 56.2% identity (84.5% similar) in 354 aa overlap (5-355:12-360)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB8        METPNTTED-YDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGN
                  ::.:.  ..:: :::  ..::.: . . .:::::::::::::..:.:::
CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 ILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGF
       .::::.:.. :.:: .:.::::::::::::::.:::.:  ..  ..::::.::::...:.
CCDS46 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWA-HSAANEWVFGNAMCKLFTGL
               70        80        90        100       110         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB8 YYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFS
       :. : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::.: : .:..::.::. :.
CCDS46 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB8 KTQWEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNE
       : : : . ..:. .::    : :. :...  :..:::::::.:.:::.::.: :::  ::
CCDS46 KCQKEDSVYVCGPYFP----RGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
     180       190           200       210       220       230     

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pF1KB8 KKS-KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAY
       ::  .:::.::.:::..::::::::..::...::.:.   .::.. .:: :.::::....
CCDS46 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
         240       250       260       270       280       290     

             300       310       320       330       340        350
pF1KB8 THCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSST-SPSTGEHE
       ::::.::.:::::::.::.::  .:..... .. :  : .  . .. :.:: .:::::.:
CCDS46 THCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQE
         300       310       320       330       340       350     

            
pF1KB8 LSAGF
       .:::.
CCDS46 VSAGL
         360

>>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (374 aa)
 initn: 1100 init1: 412 opt: 1253  Z-score: 1173.8  bits: 225.8 E(32554): 4.7e-59
Smith-Waterman score: 1253; 57.7% identity (85.0% similar) in 319 aa overlap (5-321:12-325)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB8        METPNTTED-YDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGN
                  ::.:.  ..:: :::  ..::.: . . .:::::::::::::..:.:::
CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 ILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGF
       .::::.:.. :.:: .:.::::::::::::::.:::.:  ..  ..::::.::::...:.
CCDS43 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWA-HSAANEWVFGNAMCKLFTGL
               70        80        90        100       110         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB8 YYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFS
       :. : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::.: : .:..::.::. :.
CCDS43 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB8 KTQWEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNE
       : : : . ..:. .::    : :. :...  :..:::::::.:.:::.::.: :::  ::
CCDS43 KCQKEDSVYVCGPYFP----RGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE
     180       190           200       210       220       230     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB8 KKS-KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAY
       ::  .:::.::.:::..::::::::..::...::.:.   .::.. .:: :.::::....
CCDS43 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM
         240       250       260       270       280       290     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB8 THCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHEL
       ::::.::.:::::::.::. ..  .  :.:                              
CCDS43 THCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRG
         300       310       320       330       340       350     

>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3                 (360 aa)
 initn: 1126 init1: 459 opt: 1145  Z-score: 1074.3  bits: 207.3 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1145; 50.2% identity (79.8% similar) in 331 aa overlap (23-351:28-356)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB8      METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILV
                                  :: : . .:::  .::::::::::.::.:: .:
CCDS26 MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNSVV
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB8 VLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYT
       :::: .::::..::..::::::::::::.:.::::  :   :.:::: ..::..: .: .
CCDS26 VLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFW-GYYAADQWVFGLGLCKMISWMYLV
               70        80        90        100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB8 GLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQ
       :.:: :::..:..::::::::::::.:::::.:.:::::.  :..:..::.::. ::   
CCDS26 GFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFSTCY
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 WEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKS
        : .:  :. ..  .:   ::....:..:..:::.:: .:..::. ::. : .  ::::.
CCDS26 TERNHTYCKTKYSLNSTT-WKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKKN
     180       190        200       210       220       230        

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCC
       :::..::.....:. ::::::..... .. ..   ..:   :.:: :.:.::..:..:::
CCDS26 KAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFVHCC
      240       250       260       270       280       290        

         300       310        320       330       340        350   
pF1KB8 VNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHR-RVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSST-SPSTGEHELSA
       .::.:: :.::.::::. :::.  :    : ..  .:..   .  ::. . :: .:.:  
CCDS26 LNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLHD
      300       310       320       330       340       350        

         
pF1KB8 GF
         
CCDS26 AL
      360

>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 943 init1: 429 opt: 976  Z-score: 918.6  bits: 178.5 E(32554): 7.6e-45
Smith-Waterman score: 976; 42.6% identity (76.0% similar) in 329 aa overlap (12-335:11-337)

               10        20          30        40        50        
pF1KB8 METPNTTEDYDTTTEFDYGD--ATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLV
                  :.:.. : :  ..::.    .. :  ::  .: :.::..:.:: ::.::
CCDS26  MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFSLLGNSLVILV
                10        20        30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB8 LVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLY
       ::  :.:...:..::::::.:::::.:..::   : : :.:::: .:::..::::: :.:
CCDS26 LVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQT-YYLLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFY
      60        70        80        90        100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB8 SEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQWEF
       : .::: :...:::::.::::.::..::. .:.   . .:  ::.:..: : : ..  : 
CCDS26 SSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLLVFYQVASED
      120       130       140       150       160       170        

      180       190       200       210       220       230        
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           :   . ...:. ::.:  .:.:..::..:. ....::  :.. : :  :..:.::.
CCDS26 GVLQCYSFYNQQTLK-WKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQNHNKTKAI
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pF1KB8 RLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYTHCCVNP
       ::.....:  .:::.:.:...... .... .   :  :..:  :..:::.:..:::::::
CCDS26 RLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEIISFTHCCVNP
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       ::::::::.:.:.: ..:..   ..  .: . .:  : ..                    
CCDS26 VIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRSSSVDYIL  
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                   : .:.: : :  :   .  .::. .:  .::..:.::::::.:::..:
CCDS43     MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFAL
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       .. :. :..:.:::::::.:::::. :::::  : : ..  . .::::. ..:.. :...
CCDS43 TNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHY-LINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFG
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        :::: ...:::::::: :. ..  :::  ::  :. .:: :::.. : ..:.: .    
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       .. :   .: : :.: : ... .. :..:..::::.:  ::  ::. :.   :.::.::.
CCDS43 ENECLGDYP-EVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAI
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       .::....:.:::::::::. :.. ... . :   :.. . : ::..:::..:..:::.::
CCDS43 KLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAFSHCCLNP
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       .::::.::.::.:: .:. . .::                                    
CCDS43 LIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGD
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>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (387 aa)
 initn: 890 init1: 449 opt: 918  Z-score: 864.6  bits: 168.6 E(32554): 7.7e-42
Smith-Waterman score: 918; 44.9% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (13-322:41-346)

                                 10        20         30        40 
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CCDS54 ADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFY
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CCDS54 SVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHY-LINEKGL
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CCDS54 ILVAAPQFMFTKQK----ENECLGDYP-EVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYF
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CCDS54 RIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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