Result of SIM4 for pF1KSDA2038

seq1 = pF1KSDA2038.tfa, 2622 bp
seq2 = pF1KSDA2038/gi568815596f_26073221.tfa (gi568815596f:26073221_26288254), 215034 bp

>pF1KSDA2038 2622
>gi568815596f:26073221_26288254 (Chr2)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-253  (103124-103264)   100% ->
254-384  (109747-109877)   100% ->
385-1428  (111013-112056)   99% ->
1429-1598  (112969-113138)   100% ->
1599-2622  (114011-115034)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAGCTGGCGGCCGGGCTGGCCGGCCTGCGCTGGAGCATGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAGCTGGCGGCCGGGCTGGCCGGCCTGCGCTGGAGCATGGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCCGCTCGACCTCATCGTCAGCCGCTGCCGCCTGCCCACGCTCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCCGCTCGACCTCATCGTCAGCCGCTGCCGCCTGCCCACGCTCGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTTGGGCCAG         GGGAGTACGCCGAGGGCGTCAGTGAGCGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTTGGGCCAGGTA...CAGGGGAGTACGCCGAGGGCGTCAGTGAGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACATCCTGCTCATCCACTCCTGCCGGCAGTGGACAACGGTGACAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103153 GACATCCTGCTCATCCACTCCTGCCGGCAGTGGACAACGGTGACAGCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACCCTGGAGGAGGGCCACTATGTCATCGGGCCCAAGATCGACATCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103203 TACCCTGGAGGAGGGCCACTATGTCATCGGGCCCAAGATCGACATCCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCAGTACCCAG         GGAAGTTCAAGCTCCTGGAACAGGCCCGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103253 TGCAGTACCCAGGTG...CAGGGAAGTTCAAGCTCCTGGAACAGGCCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGTGCGGGAGCCAGTGAGGTACTTCAGCAGCGTGGAGGAGGTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109776 GATGTGCGGGAGCCAGTGAGGTACTTCAGCAGCGTGGAGGAGGTGGCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTCTTCCCTGACCGCATCTTCGTGATGGAAGCCATCACCTTCAGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109826 TGTCTTCCCTGACCGCATCTTCGTGATGGAAGCCATCACCTTCAGCGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AG         GTGGTGTCGGGCGAGTTCAGCGAGGACAGCGAGGTGTAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109876 AGGTC...CAGGTGGTGTCGGGCGAGTTCAGCGAGGACAGCGAGGTGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACTTCACGCTGCATGCGGGCGACGAGCTCACTCTTATGGGCCAGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111052 AACTTCACGCTGCATGCGGGCGACGAGCTCACTCTTATGGGCCAGGCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATCCTGTGCGCCAAGACCACCAAGGAGCGCTCGCGCTTCACCACCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111102 GATCCTGTGCGCCAAGACCACCAAGGAGCGCTCGCGCTTCACCACCCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCGAAAGCTGGGCCGGGCCGGGGCGCTGGCCGGGGTGGGCGGCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111152 TGCGAAAGCTGGGCCGGGCCGGGGCGCTGGCCGGGGTGGGCGGCGGCGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCAGCGAGCGCGGGGGCCGCGGGAGGCACTGGCGGCGGGGGCGCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111202 CCAGCGAGCGCGGGGGCCGCGGGAGGCACTGGCGGCGGGGGCGCCAGGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGTCAAAGGCAAGATGCCCTGCCTCATCTGCATGAACCACCGCACCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111252 GGTCAAAGGCAAGATGCCCTGCCTCATCTGCATGAACCACCGCACCAACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAAGCCTGAGCCTGCCCTTTCAGTGCCAGGGCCGCTTCAGCACTCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111302 AAAGCCTGAGCCTGCCCTTTCAGTGCCAGGGCCGCTTCAGCACTCGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCGCTGGAGCTGCAGATGCAAGAGGGCGAGCACACGGTGCGCGCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111352 CCGCTGGAGCTGCAGATGCAAGAGGGCGAGCACACGGTGCGCGCCATCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGAGCGCGTGAGGCTGCCGGTGAACGTGCTGGTGCCCAGCCGGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111402 CGAGCGCGTGAGGCTGCCGGTGAACGTGCTGGTGCCCAGCCGGCCGCCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCAACCCCTACGACCTGCACCCGGTGCGGGAGGGTCATTGCTACAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111452 GCAACCCCTACGACCTGCACCCGGTGCGGGAGGGTCATTGCTACAAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GTTAGCATCATCTCCAAGACGGTGGTGCTGGGGCTGGCGCTGCGCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111502 GTTAGCATCATCTCCAAGACGGTGGTGCTGGGGCTGGCGCTGCGCCGCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGGCCCGGCGCCGCTGCACTTCCTGCTGCTCACGGACACGCCGCGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111552 GGGCCCGGCGCCGCTGCACTTCCTGCTGCTCACGGACACGCCGCGCTTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CGCTGCCGCAGGGCCTGCTGGCCGGGGACCCGCGCGTCGAGCGCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111602 CGCTGCCGCAGGGCCTGCTGGCCGGGGACCCGCGCGTCGAGCGCCTGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CGCGACAGCGCCTCCTACTGCCGCGAGCGCTTCGACCCCGACGAGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111652 CGCGACAGCGCCTCCTACTGCCGCGAGCGCTTCGACCCCGACGAGTACTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CACGGCCGTGCGCGAGGCGCCAGCGGAGCTCGCCGAAGACTGCGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111702 CACGGCCGTGCGCGAGGCGCCAGCGGAGCTCGCCGAAGACTGCGCCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CGCGCCGCGCGCGCCTCTGCCTGCCCGCGCCGCGCGCCCCCGGGCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111752 CGCGCCGCGCGCGCCTCTGCCTGCCCGCGCCGCGCGCCCCCGGGCTCGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CGCGCCCCCGGCCCGCTAGCGCCGGCTCCCGCCGGCGAGGGCGACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111802 CGCGCCCCCGGCCCGCTAGCGCCGGCTCCCGCCGGCGAGGGCGACCAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GTACGTGAGCCCCGACTGGGCAGCCGCGCCCGAGCCCGCCGCGCCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111852 GTACGTGAGCCCCGACTGGGCAGCCGCGCCCGAGCCCGCCGCGCCGCCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCGAGATCCCCTACGAGGAGTTGTGGGCGCACCAGGGGCCCGAGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111902 CCGAGATCCCCTACGAGGAGTTGTGGGCGCACCAGGGGCCCGAGGGCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GTCCGGCCGCCCCCAGGGCTCGACCTCATCTCCTTCGGGGCCGCGGGACC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 111952 GTCCGGCCGCCCCCAGGGCTCGATCTCATCTCCTTCGGGGCCGCGGGACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GCCGCGTCGGGAGCCGGAAGCGCCGCCGCCTCCAGTCCCTCCCAAATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112002 GCCGCGTCGGGAGCCGGAAGCGCCGCCGCCTCCAGTCCCTCCCAAATCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AGGCG         GTGAAGGAGGAGTGCCGCCTGCTCAATGCCCCTCCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112052 AGGCGGTG...TAGGTGAAGGAGGAGTGCCGCCTGCTCAATGCCCCTCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GTGCCTCCCCGGGGTGGCAATGGCAGCGGCCGGCTCTCCAGCAGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113005 GTGCCTCCCCGGGGTGGCAATGGCAGCGGCCGGCTCTCCAGCAGCCCCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GGTTCCCCCTCGCTTCCCCAAGCTGCAGCCGGTACATTCCCCCAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113055 GGTTCCCCCTCGCTTCCCCAAGCTGCAGCCGGTACATTCCCCCAGCTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GCCTCTCCTACTACTCCTCTGGCCTCCAGGATGG         GGCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113105 GCCTCTCCTACTACTCCTCTGGCCTCCAGGATGGGTG...CAGGGCGGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 TCCCGCAGTGGCAGTGGCTCCCCATCGCCGGACACCTACTCCCTCTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114018 TCCCGCAGTGGCAGTGGCTCCCCATCGCCGGACACCTACTCCCTCTATTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CTACCCATGCACCTGGGGAGACTGCAAGGTGGGCGAGTCCTCTAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114068 CTACCCATGCACCTGGGGAGACTGCAAGGTGGGCGAGTCCTCTAGCCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CAGCCCCCGGTCCCCTACCCTCAACCACACAGCCCAGCCAGGCCTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114118 CAGCCCCCGGTCCCCTACCCTCAACCACACAGCCCAGCCAGGCCTCCCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GCCCTCACAGAGCCTCTGAGCGGTCGAGCCGCCTCCCTTCTGGGGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114168 GCCCTCACAGAGCCTCTGAGCGGTCGAGCCGCCTCCCTTCTGGGGGCTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 CACCCCTGTTAAGACCTACCACAGCTGCCCTCCTCTATTCAAGCCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114218 CACCCCTGTTAAGACCTACCACAGCTGCCCTCCTCTATTCAAGCCCTCAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 ATCCCCAGAAGCGCTTTGCTCCGTTTGGAGCTCTCAACCCTTTTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114268 ATCCCCAGAAGCGCTTTGCTCCGTTTGGAGCTCTCAACCCTTTTTCCGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 CCTGCCTACCCCTCAGGCCCTTCAGCGGCCTTGTCTTCTGGGCCCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114318 CCTGCCTACCCCTCAGGCCCTTCAGCGGCCTTGTCTTCTGGGCCCAGAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CACCTCGGGTCCTGTGGCTACCTCTGGCCCTGCGTATTCCCCAGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114368 CACCTCGGGTCCTGTGGCTACCTCTGGCCCTGCGTATTCCCCAGGCCCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CCTCGCCAGGCCAGGCCTATTCAGCTGCTCCCCCCTCCTCCTGCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114418 CCTCGCCAGGCCAGGCCTATTCAGCTGCTCCCCCCTCCTCCTGCGCCCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 TCCTCCTCCTCTTCTTCTGAATGGCAGGAACCAGTCCTGGAGCCCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114468 TCCTCCTCCTCTTCTTCTGAATGGCAGGAACCAGTCCTGGAGCCCTTCGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 TCCCTTTGAGCTGGGGCAGGGCAGTTCTCCAGAGCCTGAGCTGCTGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114518 TCCCTTTGAGCTGGGGCAGGGCAGTTCTCCAGAGCCTGAGCTGCTGCGTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 CTCAGGAGCCCAGAGCAGTGGGGACACCTGGGCCTGGACCCCGCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114568 CTCAGGAGCCCAGAGCAGTGGGGACACCTGGGCCTGGACCCCGCCTTTCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 CCACTTGGCCCCTCCAAGGCCTTTGAGCCTGAAGGTTTGGTGCTGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114618 CCACTTGGCCCCTCCAAGGCCTTTGAGCCTGAAGGTTTGGTGCTGCACCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 GGTCCCCACCCCACTGTCACCAGCTGCTCTGCAGGGACCCGAGGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114668 GGTCCCCACCCCACTGTCACCAGCTGCTCTGCAGGGACCCGAGGCGGGAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 GAGCACTTTTTCTAACCCAAGGGCGCCTGGAAGGGCCTCCTGCCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114718 GAGCACTTTTTCTAACCCAAGGGCGCCTGGAAGGGCCTCCTGCCAGTCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 CGGGATGGAGCCACAGGCTTTGGAGTCCGAGATGCCTCCTCCTGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114768 CGGGATGGAGCCACAGGCTTTGGAGTCCGAGATGCCTCCTCCTGGCAGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 CCCTGCTGACCTGTCTGCACTCTCCCTGGAGGAGGTCTCTCGCAGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114818 CCCTGCTGACCTGTCTGCACTCTCCCTGGAGGAGGTCTCTCGCAGTCTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 GTTTCATCGGGCTCTCAGAGGATGTGGTGAGCTTCTTTGCCCGAGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114868 GTTTCATCGGGCTCTCAGAGGATGTGGTGAGCTTCTTTGCCCGAGAACGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2506 ATCGATGGTAGCATCTTTGTGCAGCTCAGTGAGGACATCCTGGCAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114918 ATCGATGGTAGCATCTTTGTGCAGCTCAGTGAGGACATCCTGGCAGATGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2556 CTTCCACCTCACCAAGCTGCAGGTCAAGAAGATCATGCAGTTCATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114968 CTTCCACCTCACCAAGCTGCAGGTCAAGAAGATCATGCAGTTCATCAAAG

   2650     .    :    .
   2606 GCTGGAGGCCCAAGATC
        |||||||||||||||||
 115018 GCTGGAGGCCCAAGATC

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