Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1990, 879 aa
  1>>>pF1KSDA1990 879 - 879 aa - 879 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9802+/-0.000499; mu= 16.8308+/- 0.031
 mean_var=74.1729+/-14.729, 0's: 0 Z-trim(108.4): 32  B-trim: 65 in 1/52
 Lambda= 0.148920
 statistics sampled from 16483 (16509) to 16483 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.194), width:  16
 Scan time: 10.480

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_037523 (OMIM: 605849,605850) dimethylglycine de ( 866) 1289 287.4   2e-76
XP_011541656 (OMIM: 605849,605850) PREDICTED: dime ( 757) 1136 254.5 1.4e-66
XP_006714660 (OMIM: 605849,605850) PREDICTED: dime ( 774) 1125 252.1 7.4e-66
XP_011541657 (OMIM: 605849,605850) PREDICTED: dime ( 750) 1124 251.9 8.3e-66
XP_016869857 (OMIM: 268900,604455) PREDICTED: sarc ( 837)  989 222.9   5e-57
XP_016869856 (OMIM: 268900,604455) PREDICTED: sarc ( 878)  989 222.9 5.2e-57
NP_009032 (OMIM: 268900,604455) sarcosine dehydrog ( 918)  989 222.9 5.4e-57
NP_001128179 (OMIM: 268900,604455) sarcosine dehyd ( 918)  989 222.9 5.4e-57
NP_057602 (OMIM: 616713) peroxisomal sarcosine oxi ( 390)  261 66.4   3e-10
NP_001158184 (OMIM: 238310,605899) aminomethyltran ( 386)  233 60.4 1.9e-08
NP_000472 (OMIM: 238310,605899) aminomethyltransfe ( 403)  233 60.4   2e-08
NP_001158183 (OMIM: 238310,605899) aminomethyltran ( 347)  228 59.3 3.7e-08
NP_001158182 (OMIM: 238310,605899) aminomethyltran ( 359)  211 55.6 4.8e-07
XP_016873494 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 275)  161 44.8 0.00065
XP_006718944 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 275)  161 44.8 0.00065
XP_016873492 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 275)  161 44.8 0.00065
XP_016873493 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 275)  161 44.8 0.00065
XP_011541198 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 316)  161 44.9 0.00074
XP_011541197 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 316)  161 44.9 0.00074
XP_016873491 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 316)  161 44.9 0.00074
XP_016873490 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 316)  161 44.9 0.00074
XP_006718942 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 316)  161 44.9 0.00074
XP_016873495 (OMIM: 252010,256000,613622) PREDICTE ( 274)  157 44.0  0.0012
XP_016880211 (OMIM: 616713) PREDICTED: peroxisomal ( 294)  149 42.3  0.0041
XP_016877147 (OMIM: 236792,609584) PREDICTED: L-2- ( 236)  146 41.6  0.0053


>>NP_037523 (OMIM: 605849,605850) dimethylglycine dehydr  (866 aa)
 initn: 998 init1: 424 opt: 1289  Z-score: 1493.0  bits: 287.4 E(85289): 2e-76
Smith-Waterman score: 1289; 32.3% identity (63.2% similar) in 801 aa overlap (42-827:49-828)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KSD RQRASPGWQNWSSARNSTSAAEARSMALPTQAQVVICGGGITGTSVAYHLSKMGWKDIVL
                                     .:..:: ::: .:.:.::::.: : ::.::
NP_037 LQGSPGRPRSVCGREGEEKPPLSAETQWKDRAETVIIGGGCVGVSLAYHLAKAGMKDVVL
       20        30        40        50        60        70        

              80        90       100        110       120       130
pF1KSD LEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADY-SNKLYYQLEQETGIQTGYTRTGSIFL
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NP_037 LEKSELTAGSTWHAAG-LTTYFHPGINLKKIHYDSIKLYEKLEEETGQVVGFHQPGSIRL
       80        90        100       110       120       130       

              140       150       160       170       180       190
pF1KSD AQTQDRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKKVAELHHLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSAD
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NP_037 ATTPVRVDEFKYQMTRTGWHATEQYLIEPEKIQEMFPLLNMNKVLAGLYNPGDGHIDPYS
       140       150       160       170       180       190       

              200       210       220       230       240          
pF1KSD VALALASAASQNGVQIYDRTSVLHVMVKKGQVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYELG-
       ...:::..: . :. .   . :  . ...  .  ::: .:... . .:: :: :: :.: 
NP_037 LTMALAAGARKCGALLKYPAPVTSLKARSDGTWDVETPQGSMRANRIVNAAGFWAREVGK
       200       210       220       230       240       250       

      250       260       270         280       290       300      
pF1KSD -LSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLET--PLQSSTPTIVDADGRIYIRNWQGGILSGGFE
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NP_037 MIGLEHPL-IPV---QHQYVVTSTISEVKALKRELPVLRDLEGSYYLRQERDGLLFGPYE
       260           270       280       290       300       310   

        310            320        330       340       350       360
pF1KSD KNPK-----PIFTEGKNQLEIQNLQE-DWDHFEPLLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPET
       .. :        :.:      ..: : : :..   ... .. .: :.  .:...:: : :
NP_037 SQEKMKVQDSWVTNGVPPGFGKELFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLKKADIINVVNGPIT
           320       330       340       350       360       370   

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FTPDMRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGGAGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRF
       ..::.  ..:   .:..:.:  :..  :.  .::.::::..:..:: :  .. ::: .:.
NP_037 YSPDILPMVGPHQGVRNYWVAIGFGY-GIIHAGGVGKYLSDWILHGEPPFDLIELDPNRY
           380       390        400       410       420       430  

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pF1KSD GALQSSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQTGRQL-RTSPLYDRLDAQGARWMEKH-G
       :   ... . . .. : . .   .  :. .  .::   :.: ::.::... .  :  : :
NP_037 GKWTTTQ-YTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLESKCS--MGFHAG
             440       450       460       470       480           

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD FERPKYFVPPDKDLLALEQSKTFYKPDWFDIVESEVKCCKEAVCVIDMSSFTKFEITSTG
       .:.:..:  : .:    .   .: . .::. : :: :   . : : :.: : ::.:   :
NP_037 WEQPHWFYKPGQDT---QYRPSFRRTNWFEPVGSEYKQVMQRVAVTDLSPFGKFNIK--G
     490       500          510       520       530       540      

      540       550        560       570       580       590       
pF1KSD DQALEVLQYLFSNDLDVP-VGHIVHTGMLNEGGGYENDCSIARLNKRSFFMISPTDQQVH
       ......:..::.:   .: ::    . ::.  :    . .... .   :..:. . ...:
NP_037 QDSIRLLDHLFAN--VIPKVGFTNISHMLTPKGRVYAELTVSHQSPGEFLLITGSGSELH
          550         560       570       580       590       600  

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pF1KSD CWAWLKKHMPKDS-NLLLEDVTWKYTALNLIGPRAVDVLSELSYAPMTPDHFPSLFCKEM
          :....  : . .. ....: .  .:.. ::.:  ::..:.   .. : :  :  : .
NP_037 DLRWIEEEAVKGGYDVEIKNITDELGVLGVAGPQARKVLQKLTSEDLSDDVFKFLQTKSL
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pF1KSD SVGYANGIRVMSMTHTGEPGFMLYIPIEYALHVYNEVMSVGQKYGIRNAGYYALRSLRIE
       .:.    . .. ...::: :. ::   : .. .:. .:..::. :: : : ::. .::.:
NP_037 KVSNIP-VTAIRISYTGELGWELYHRREDSVALYDAIMNAGQEEGIDNFGTYAMNALRLE
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pF1KSD KFFAFWGQDINNLTTPLECGRESRVKLEKGMDFIGRDALLQQKQNGVYKRLTMFILDDHD
       : :  :: ..:  :.::: : :  :::.:  ::::..:: : : .:. .::. . :   :
NP_037 KAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNKPADFIGKQALKQIKAKGLKRRLVCLTLATDD
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pF1KSD SDLDLWPWWGEPIYRNGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVTADFIN
        :    :  .: :. ::. ::.:::..::::... . ...:     ..:..         
NP_037 VD----PEGNESIWYNGKVVGNTTSGSYSYSIQKSLAFAYVPVQLSEVGQQVEVELLGKN
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pF1KSD RGEYEIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK
                                                  
NP_037 YPAVIIQEPLVLTEPTRNRLQKKGGKDKT              
       840       850       860                    

>>XP_011541656 (OMIM: 605849,605850) PREDICTED: dimethyl  (757 aa)
 initn: 853 init1: 424 opt: 1136  Z-score: 1316.3  bits: 254.5 E(85289): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 1136; 32.0% identity (62.9% similar) in 723 aa overlap (42-749:49-755)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KSD RQRASPGWQNWSSARNSTSAAEARSMALPTQAQVVICGGGITGTSVAYHLSKMGWKDIVL
                                     .:..:: ::: .:.:.::::.: : ::.::
XP_011 LQGSPGRPRSVCGREGEEKPPLSAETQWKDRAETVIIGGGCVGVSLAYHLAKAGMKDVVL
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pF1KSD LEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADY-SNKLYYQLEQETGIQTGYTRTGSIFL
       ::...:.::::   :: :.:  :  :. :   : : ::: .::.:::  .:. . ::: :
XP_011 LEKSELTAGSTWHAAG-LTTYFHPGINLKKIHYDSIKLYEKLEEETGQVVGFHQPGSIRL
       80        90        100       110       120       130       

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pF1KSD AQTQDRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKKVAELHHLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSAD
       : :  :.  .:   .  .  .  . .: :.:. :.  :::.. ...... : :. ..  .
XP_011 ATTPVRVDEFKYQMTRTGWHATEQYLIEPEKIQEMFPLLNMNKVLAGLYNPGDGHIDPYS
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pF1KSD VALALASAASQNGVQIYDRTSVLHVMVKKGQVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYELG-
       ...:::..: . :. .   . :  . ...  .  ::: .:... . .:: :: :: :.: 
XP_011 LTMALAAGARKCGALLKYPAPVTSLKARSDGTWDVETPQGSMRANRIVNAAGFWAREVGK
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pF1KSD -LSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLET--PLQSSTPTIVDADGRIYIRNWQGGILSGGFE
        .. :.:. ::.   .: :..:  .     :.   :.. : .:  :.:. . :.: : .:
XP_011 MIGLEHPL-IPV---QHQYVVTSTISEVKALKRELPVLRDLEGSYYLRQERDGLLFGPYE
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        310            320        330       340       350       360
pF1KSD KNPK-----PIFTEGKNQLEIQNLQE-DWDHFEPLLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPET
       .. :        :.:      ..: : : :..   ... .. .: :.  .:...:: : :
XP_011 SQEKMKVQDSWVTNGVPPGFGKELFESDLDRIMEHIKAAMEMVPVLKKADIINVVNGPIT
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pF1KSD FTPDMRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGGAGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRF
       ..::.  ..:   .:..:.:  :..  :.  .::.::::..:..:: :  .. ::: .:.
XP_011 YSPDILPMVGPHQGVRNYWVAIGFGY-GIIHAGGVGKYLSDWILHGEPPFDLIELDPNRY
           380       390        400       410       420       430  

              430       440       450        460       470         
pF1KSD GALQSSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQTGRQL-RTSPLYDRLDAQGARWMEKH-G
       :   ... . . .. : . .   .  :. .  .::   :.: ::.::... .  :  : :
XP_011 GKWTTTQ-YTEAKARESYGFNNIVGYPKEERFAGRPTQRVSGLYQRLESKCS--MGFHAG
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       .:.:..:  : .:    .   .: . .::. : :: :   . : : :.: : ::.:   :
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       ......:..::.: .   ::    . ::.  :    . .... .   :..:. . ...: 
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       .:.    . .. ...::: :. ::   : .. .:. .:..::. :: : : ::. .::.:
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pF1KSD KNPK-----PIFTEGKNQLEIQNLQE-DWDHFEPLLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPET
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XP_011 KAFRAWGLEMNCDTNPLEAGLEYFVKLNK                               
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>>XP_016869856 (OMIM: 268900,604455) PREDICTED: sarcosin  (878 aa)
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       .  :  :.    .::: :     ::.. . :.::.:: ::.  :. .::. : ..:.   
XP_016 YRHWHADLRPDDSPLEAGLAFTCKLKSPVPFLGREALEQQRAAGLRRRLVCFTMEDK---
        780       790       800       810       820       830      

      780        790       800       810       820       830       
pF1KSD LDLWPWWG-EPIYRNGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVTADFINR
           : .: : :.:::: ::..  . ....... .  :..:. :                
XP_016 ---VPMFGLEAIWRNGQVVGHVRRADFGFAIDKTIAYGYIHDPSGGPA            
              840       850       860       870                    

       840       850       860       870         
pF1KSD GEYEIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK

>>NP_009032 (OMIM: 268900,604455) sarcosine dehydrogenas  (918 aa)
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NP_009 ALRVAAAHPRQSPTRGMGPCNLSSAAGPTAEKSVPYQRTLKEGQGTSVVAQGPSRPLPST
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pF1KSD AQVVICGGGITGTSVAYHLSKMGWKDIVLLEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMA
       :.::. :::  : .. :::.:.: .  ::::. ::..:.:   ::.:   :   .: .. 
NP_009 ANVVVIGGGSLGCQTLYHLAKLGMSGAVLLERERLTSGTTWHTAGLLWQLRPSDVEVELL
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pF1KSD DYSNKLY-YQLEQETGIQTGYTRTGSIFLAQTQDRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKK
        .. ..   .::.:::..::. ..:..:.:....::   ::. .  .. :. :...:: .
NP_009 AHTRRVVSRELEEETGLHTGWIQNGGLFIASNRQRLDEYKRLMSLGKAYGVESHVLSPAE
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       .  :. :.:: :: :...::.:.... : .  .:: :::  :.:. .   :  . :    
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pF1KSD ----QVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYELGLSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLETP
           .:.::::..:.:.    ::::: ::  .:      :..:: : .: :..:. .:  
NP_009 FGVRRVAGVETQHGSIQTPCVVNCAGVWASAVG--RMAGVKVPLVAMHHAYVVTERIEG-
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pF1KSD LQSSTPTIVDADGRIYIRNWQGGILS-GGFEKNPKPIF-TEGKNQLEIQNLQEDWDHFEP
       .:.  :.. : :. .:.:  ::  :: ::.: ::  ::  : .... .  .. ::. :  
NP_009 IQN-MPNVRDHDASVYLR-LQGDALSVGGYEANP--IFWEEVSDKFAFGLFDLDWEVFTQ
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pF1KSD LLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPETFTPDMRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGG
        . . . :.: ::   : . :  ::.:::: . .:::.: ..:.:.  :.::::. .:::
NP_009 HIEGAINRVPVLEKTGIKSTVCGPESFTPDHKPLMGEAPELRGFFLGCGFNSAGMMLGGG
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pF1KSD AGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRFG-ALQSSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQT
        :. ::.:..:: : ...   :..::  .: .   ..:.:  : .   :..  :. .  .
NP_009 CGQELAHWIIHGRPEKDMHGYDIRRFHHSLTDHPRWIRERSHESYAKNYSVVFPHDEPLA
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pF1KSD GRQLRTSPLYDRLDAQGARWMEKHGFERPKYFVP--P----DKDLLALEQSK--------
       ::..: .::...: .::  ..:.::.::: .: :  :    . :  .   :.        
NP_009 GRNMRRDPLHEELLGQGCVFQERHGWERPGWFHPRGPAPVLEYDYYGAYGSRAHEDYAYR
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pF1KSD -------TFYKPDWFDIVESEVKCCKEAVCVIDMSSFTKFEITSTGDQALEVLQYLFSND
              ::  :   : ...:   :. :. :.::: : :: .  .: .: .. ..::: :
NP_009 RLLADEYTFAFPPHHDTIKKECLACRGAAAVFDMSYFGKFYL--VGLDARKAADWLFSAD
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            560       570       580                    590         
pF1KSD LDVPVGHIVHTGMLNEGGGYENDCSIARLNKR-------------SFFMISPTDQQVHCW
       .. : :  :.: :::. :: :.: ...::                ....        : :
NP_009 VSRPPGSTVYTCMLNHRGGTESDLTVSRLAPSHQASPLAPAFEGDGYYLAMGGAVAQHNW
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     600        610       620       630       640       650        
pF1KSD AWLKKHMP-KDSNLLLEDVTWKYTALNLIGPRAVDVLSELSYAPMTPDHFPSLFCKEMSV
       . .   .  . :.  : : .     ... :: .  .:.:.  : .. . ::    : . .
NP_009 SHITTVLQDQKSQCQLIDSSEDLGMISIQGPASRAILQEVLDADLSNEAFPFSTHKLLRA
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      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD GYANGIRVMSMTHTGEPGFMLYIPIEYALHVYNEVMSVGQKYGIRNAGYYALRSLRIEKF
       . .. .:.: .. .:: :. :.::    . ::  ::..: :.:. :::: :. :: ::: 
NP_009 A-GHLVRAMRLSFVGELGWELHIPKASCVPVYRAVMAAGAKHGLINAGYRAIDSLSIEKG
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      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD FAFWGQDINNLTTPLECGRESRVKLEKGMDFIGRDALLQQKQNGVYKRLTMFILDDHDSD
       .  :  :.    .::: :     ::.. . :.::.:: ::.  :. .::. : ..:.   
NP_009 YRHWHADLRPDDSPLEAGLAFTCKLKSPVPFLGREALEQQRAAGLRRRLVCFTMEDK---
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      780        790       800       810       820       830       
pF1KSD LDLWPWWG-EPIYRNGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVTADFINR
           : .: : :.:::: ::..  . ....... .  :..:. :   :    :. ::.. 
NP_009 ---VPMFGLEAIWRNGQVVGHVRRADFGFAIDKTIAYGYIHDPS--GGP---VSLDFVKS
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       840       850       860       870         
pF1KSD GEYEIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK
       :.: ..  :  . :.:.:                        
NP_009 GDYALERMGVTYGAQAHLKSPFDPNNKRVKGIY         
         890       900       910                 

>>NP_001128179 (OMIM: 268900,604455) sarcosine dehydroge  (918 aa)
 initn: 1121 init1: 432 opt: 989  Z-score: 1144.2  bits: 222.9 E(85289): 5.4e-57
Smith-Waterman score: 1517; 32.3% identity (60.9% similar) in 888 aa overlap (13-855:37-903)

                                 10        20        30        40  
pF1KSD                   MMFYRLLSIVGRQRASPGWQNWSSARNSTSAAEARSMALPTQ
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NP_001 ALRVAAAHPRQSPTRGMGPCNLSSAAGPTAEKSVPYQRTLKEGQGTSVVAQGPSRPLPST
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             50        60        70        80        90       100  
pF1KSD AQVVICGGGITGTSVAYHLSKMGWKDIVLLEQGRLAAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMA
       :.::. :::  : .. :::.:.: .  ::::. ::..:.:   ::.:   :   .: .. 
NP_001 ANVVVIGGGSLGCQTLYHLAKLGMSGAVLLERERLTSGTTWHTAGLLWQLRPSDVEVELL
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pF1KSD DYSNKLY-YQLEQETGIQTGYTRTGSIFLAQTQDRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKK
        .. ..   .::.:::..::. ..:..:.:....::   ::. .  .. :. :...:: .
NP_001 AHTRRVVSRELEEETGLHTGWIQNGGLFIASNRQRLDEYKRLMSLGKAYGVESHVLSPAE
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pF1KSD VAELHHLLNVHDLVGAMHVPEDAVVSSADVALALASAASQNGVQIYDRTSVLHVMVKKG-
       .  :. :.:: :: :...::.:.... : .  .:: :::  :.:. .   :  . :    
NP_001 TKTLYPLMNVDDLYGTLYVPHDGTMDPAGTCTTLARAASARGAQVIENCPVTGIRVWTDD
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pF1KSD ----QVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYELGLSNEEPVSIPLHACEHFYLLTRPLETP
           .:.::::..:.:.    ::::: ::  .:      :..:: : .: :..:. .:  
NP_001 FGVRRVAGVETQHGSIQTPCVVNCAGVWASAVG--RMAGVKVPLVAMHHAYVVTERIEG-
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pF1KSD LQSSTPTIVDADGRIYIRNWQGGILS-GGFEKNPKPIF-TEGKNQLEIQNLQEDWDHFEP
       .:.  :.. : :. .:.:  ::  :: ::.: ::  ::  : .... .  .. ::. :  
NP_001 IQN-MPNVRDHDASVYLR-LQGDALSVGGYEANP--IFWEEVSDKFAFGLFDLDWEVFTQ
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pF1KSD LLSSLLRRMPELETLEIMKLVNCPETFTPDMRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGG
        . . . :.: ::   : . :  ::.:::: . .:::.: ..:.:.  :.::::. .:::
NP_001 HIEGAINRVPVLEKTGIKSTVCGPESFTPDHKPLMGEAPELRGFFLGCGFNSAGMMLGGG
     360       370       380       390       400       410         

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pF1KSD AGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRFG-ALQSSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQT
        :. ::.:..:: : ...   :..::  .: .   ..:.:  : .   :..  :. .  .
NP_001 CGQELAHWIIHGRPEKDMHGYDIRRFHHSLTDHPRWIRERSHESYAKNYSVVFPHDEPLA
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KSD GRQLRTSPLYDRLDAQGARWMEKHGFERPKYFVP--P----DKDLLALEQSK--------
       ::..: .::...: .::  ..:.::.::: .: :  :    . :  .   :.        
NP_001 GRNMRRDPLHEELLGQGCVFQERHGWERPGWFHPRGPAPVLEYDYYGAYGSRAHEDYAYR
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pF1KSD -------TFYKPDWFDIVESEVKCCKEAVCVIDMSSFTKFEITSTGDQALEVLQYLFSND
              ::  :   : ...:   :. :. :.::: : :: .  .: .: .. ..::: :
NP_001 RLLADEYTFAFPPHHDTIKKECLACRGAAAVFDMSYFGKFYL--VGLDARKAADWLFSAD
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            560       570       580                    590         
pF1KSD LDVPVGHIVHTGMLNEGGGYENDCSIARLNKR-------------SFFMISPTDQQVHCW
       .. : :  :.: :::. :: :.: ...::                ....        : :
NP_001 VSRPPGSTVYTCMLNHRGGTESDLTVSRLAPSHQASPLAPAFEGDGYYLAMGGAVAQHNW
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pF1KSD AWLKKHMP-KDSNLLLEDVTWKYTALNLIGPRAVDVLSELSYAPMTPDHFPSLFCKEMSV
       . .   .  . :.  : : .     ... :: .  .:.:.  : .. . ::    : . .
NP_001 SHITTVLQDQKSQCQLIDSSEDLGMISIQGPASRAILQEVLDADLSNEAFPFSTHKLLRA
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      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD GYANGIRVMSMTHTGEPGFMLYIPIEYALHVYNEVMSVGQKYGIRNAGYYALRSLRIEKF
       . .. .:.: .. .:: :. :.::    . ::  ::..: :.:. :::: :. :: ::: 
NP_001 A-GHLVRAMRLSFVGELGWELHIPKASCVPVYRAVMAAGAKHGLINAGYRAIDSLSIEKG
        720       730       740       750       760       770      

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD FAFWGQDINNLTTPLECGRESRVKLEKGMDFIGRDALLQQKQNGVYKRLTMFILDDHDSD
       .  :  :.    .::: :     ::.. . :.::.:: ::.  :. .::. : ..:.   
NP_001 YRHWHADLRPDDSPLEAGLAFTCKLKSPVPFLGREALEQQRAAGLRRRLVCFTMEDK---
        780       790       800       810       820       830      

      780        790       800       810       820       830       
pF1KSD LDLWPWWG-EPIYRNGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVTADFINR
           : .: : :.:::: ::..  . ....... .  :..:. :   :    :. ::.. 
NP_001 ---VPMFGLEAIWRNGQVVGHVRRADFGFAIDKTIAYGYIHDPS--GGP---VSLDFVKS
              840       850       860       870            880     

       840       850       860       870         
pF1KSD GEYEIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK
       :.: ..  :  . :.:.:                        
NP_001 GDYALERMGVTYGAQAHLKSPFDPNNKRVKGIY         
         890       900       910                 

>>NP_057602 (OMIM: 616713) peroxisomal sarcosine oxidase  (390 aa)
 initn: 156 init1: 105 opt: 261  Z-score: 304.9  bits: 66.4 E(85289): 3e-10
Smith-Waterman score: 261; 23.9% identity (55.2% similar) in 393 aa overlap (46-423:11-385)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KSD SPGWQNWSSARNSTSAAEARSMALPTQAQVVICGGGITGTSVAYHLSKMGWKDIVLLEQG
                                     .. :.:: :  .::::.:   : :.:::: 
NP_057                     MAAQKDLWDAIVIGAGIQGCFTAYHLAKHR-KRILLLEQF
                                   10        20        30          

            80        90       100       110       120       130   
pF1KSD RL--AAGSTRFCAGILSTARHLTIEQKMADYSNKLYYQLEQETGIQTGYTRTGSIFLAQT
        :  . ::..  . :.  :    .  .:     ... :::.:.: :  . .:: ..:.. 
NP_057 FLPHSRGSSHGQSRIIRKAYLEDFYTRMMHECYQIWAQLEHEAGTQL-HRQTGLLLLGMK
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pF1KSD QDRLISLKRINAGLNVIGIPSEIISPKKVAELHHLLNVHDLVGAMHVPEDA--VVSSADV
       ...   :: :.:.:.   .  . .: ... .  .. :..   : . . ...  :. .  .
NP_057 ENQ--ELKTIQANLSRQRVEHQCLSSEELKQ--RFPNIRLPRGEVGLLDNSGGVIYAYKA
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pF1KSD ALALASAASQNGVQIYDRTSVLHVMVKKGQVTGVETDKGQIECQYFVNCAGQWAYEL--G
         :: .:  : :  . :  .:  : .. : .. :.: . . . . .:  :: :. .:   
NP_057 LRALQDAIRQLGGIVRDGEKV--VEINPGLLVTVKTTSRSYQAKSLVITAGPWTNQLLRP
          160       170         180       190       200       210  

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pF1KSD LSNEEPV-SIPLHACEHFYLLTRPLETPLQSSTPTIV---DADGRIYIRNWQGGILSGGF
       :. : :. .. ...:  ..    :    .... : ..       .::      :. .: .
NP_057 LGIEMPLQTLRINVC--YWREMVPGSYGVSQAFPCFLWLGLCPHHIY------GLPTGEY
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pF1KSD EKNPKPIFTEGKN----QLEIQNLQEDWDHFEPLLSSLLR-RMPELETLEIMKLVNCPET
           :  . .:..    . .  . . :    . .:::..: ..:.:.  :   . .:  :
NP_057 PGLMKVSYHHGNHADPEERDCPTARTDIGDVQ-ILSSFVRDHLPDLKP-EPAVIESCMYT
          270       280       290        300       310        320  

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pF1KSD FTPDMRCIMGESPAVQGYFVLAGMNSAGLSFGGGAGKYLAEWMVHGYPSENVWELDLKRF
        ::: . :. . :  ..  . ::... :....  .:: : :  ..  :: ..  . ..::
NP_057 NTPDEQFILDRHPKYDNIVIGAGFSGHGFKLAPVVGKILYELSMKLTPSYDLAPFRISRF
            330       340       350       360       370       380  

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pF1KSD GALQSSRTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQTGRQLRTSPLYDRLDAQGARWMEKHGFE
        .:                                                         
NP_057 PSLGKAHL                                                    
            390                                                    

>>NP_001158184 (OMIM: 238310,605899) aminomethyltransfer  (386 aa)
 initn: 162 init1:  80 opt: 233  Z-score: 272.4  bits: 60.4 E(85289): 1.9e-08
Smith-Waterman score: 238; 23.4% identity (53.2% similar) in 376 aa overlap (457-817:33-365)

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pF1KSD RTFLRHRVMEVMPLMYDLKVPRWDFQTGRQLRTSPLYDRLDAQGARWMEKHGFERPKYFV
                                     :: .::::   :.:.. .   :.  :  . 
NP_001 RAVSVVARLGFRLQAFPPALCRPLSCAQEVLRRTPLYDFHLAHGGKMVAFAGWSLPVQYR
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pF1KSD PPDKDLLALEQSKTFYKPDWFDIVESEVKCCKEAVCVIDMSSFTKFEITSTGDQALEVLQ
           :                . .... .:      ..:.: . . .:   :.. .....
NP_001 DSHTD----------------SHLHTRQHCS-----LFDVSHMLQTKIL--GSDRVKLME
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pF1KSD YLFSNDL-DVPVGHIVHTGMLNEGGGYENDCSIARLNKRSFFMISPTDQQVHCW----AW
        :  .:. ..  .. . . . ::.::  .:  ..  ..  ....:    .. ::    : 
NP_001 SLVVGDIAELRPNQGTLSLFTNEAGGILDDLIVTNTSEGHLYVVS----NAGCWEKDLAL
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pF1KSD LKKHMPKDSNLLLEDVTWKY---TALNLIGPRAVDVLSELSYAPMTPD--HFPSLFCKEM
       .. .. . .:   .::  .    . : : :: :..::.    : .. :  ..: .    :
NP_001 MQDKVRELQNQG-RDVGLEVLDNALLALQGPTAAQVLQ----AGVADDLRKLPFMTSAVM
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pF1KSD SVGYANGIRVMSMTHTGEPGFMLYIPIEYALHVYNEVMSVGQKYGIRNAGYYALRSLRIE
        :  ..: ::    .::: :  . .:.  :.:. . ...  .   .. ::  :  :::.:
NP_001 EVFGVSGCRVTRCGYTGEDGVEISVPVAGAVHLATAILKNPE---VKLAGLAARDSLRLE
              220       230       240       250          260       

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pF1KSD KFFAFWGQDINNLTTPLECGRESRV---KLEKGMDFIGRDALLQQKQNGVYKRLTMFILD
         . ..:.::.. :::.: :  : .   . . .::: :  ... : .. : .: . .. .
NP_001 AGLCLYGNDIDEHTTPVE-GSLSWTLGKRRRAAMDFPGAKVIVPQLKGRVQRRRVGLMCE
       270       280        290       300       310       320      

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pF1KSD DHDSDLDLWPWWGE-PIYR-NGQYVGKTTSSAYSYSLERHVCLGFVHNFSEDTGEEQVVT
                :  .. ::   .:  .: .::.  : ::...: .:.:              
NP_001 GA-------PMRAHSPILNMEGTKIGTVTSGCPSPSLKKNVAMGYVPCEYSRPGTMLLVE
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pF1KSD ADFINRGEYEIDIAGYRFQAKAKLYPVASLFTQKRRKDDMELSDLHGK
                                                       
NP_001 LPSGPCF                                         
     380                                               




879 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 07:55:12 2016 done: Thu Nov  3 07:55:14 2016
 Total Scan time: 10.480 Total Display time:  0.240

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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