FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1969, 576 aa 1>>>pF1KSDA1969 576 - 576 aa - 576 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3283+/-0.00111; mu= 16.5955+/- 0.069 mean_var=343.0338+/-66.476, 0's: 0 Z-trim(108.8): 2097 B-trim: 103 in 2/50 Lambda= 0.069248 statistics sampled from 14589 (16929) to 14589 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16 Scan time: 7.810 The best scores are: opt bits E(85289) NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 2880 303.5 1.2e-81 NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2795 295.1 4.3e-79 NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2779 293.5 1.3e-78 NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2758 291.4 5.5e-78 NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2710 286.7 1.6e-76 NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2694 285.3 5.5e-76 XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2687 284.2 7.4e-76 XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2687 284.2 7.4e-76 NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2684 283.9 9e-76 XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2684 283.9 9.1e-76 XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2684 283.9 9.1e-76 NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2666 282.2 3.2e-75 XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2666 282.2 3.2e-75 NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2653 280.9 7.9e-75 NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2655 281.7 9.5e-75 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2619 277.5 8.7e-74 XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2590 274.5 6e-73 NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2589 274.8 7.8e-73 NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2588 274.7 8.3e-73 XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72 NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2562 272.1 5.2e-72 NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72 XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2529 268.4 4e-71 NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2505 266.0 2.2e-70 XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70 XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70 XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70 XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70 XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70 >>NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [Homo (542 aa) initn: 5579 init1: 2469 opt: 2880 Z-score: 1587.1 bits: 303.5 E(85289): 1.2e-81 Smith-Waterman score: 2901; 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75.9% identity (86.4% similar) in 528 aa overlap (35-562:4-531) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM :::::: ::::::::.::. ::.::: .:: NP_689 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVM 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD ::::.::::::.:::: : .: ::: :::::.:::::::. :.:::.:..:.:::..::: NP_689 LENYRNLVFLGIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKD 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV :::.:::: ::: :::::::: ::: ::.: ::: ::::::::.:::: ::::::: NP_689 SFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF :::: :.::.: :::::::::::. ::::::: .:.:::.:: :: ::.::::::::.: NP_689 FHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT ::::.:: :::::::.:::::::::..::.:: :::::::::::.:::::::::::: :: NP_689 STLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLT 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI :: ::: ::::::::::::::: : :. :: :: .:::::::: ::: :: : :::: NP_689 KHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKI 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG :::::: ::::::::.:: :.::::: ::::::::::. ::::::.::.:: :: :::: NP_689 IHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTG 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY :::::::::::::..: :: ::::::::::::::.:::::: :: .: ::: : .::: NP_689 EKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPY 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE :::::::::. :.::::::::: :: :::::::::::::: .:::. :::. : :.::. NP_689 KCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEK 460 470 480 490 500 510 550 560 570 pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL : :.::::::: .. : NP_689 CGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAF 520 530 540 550 560 570 >>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa) initn: 6238 init1: 2436 opt: 2779 Z-score: 1532.3 bits: 293.5 E(85289): 1.3e-78 Smith-Waterman score: 2785; 72.5% identity (84.4% similar) in 553 aa overlap (35-558:4-556) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM ::::::::::::.::.::. ::.::: ::: NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVM 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHE-MVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIK ::::.::::::..::: : .::::: :: :.::::: :: .: .:::.:..::::::.:: NP_003 LENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIK 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVK ::::.: :.:::::.:::: :::: :.:: :.:: : : ::::::.:::::: :::::: NP_003 DSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD VFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKW : ::: :.:::. ::: :::::: :::::: :. :..:.::: : : :.::::::::.: NP_003 VAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNW 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD FSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHL ::::.::::::::::.:::::::::.:::.: :: ::::::::.::::::.::: : : NP_003 SSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHK :::::::::::::::.:::::::.::::.::. ::.:::::::::: :::.. : :: :: NP_003 TTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHK 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KSD IIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHT ::::::: :::..:::.:: :. :: :. ::::::::::: ::::::. :.:::::.::: NP_003 IIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHT 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KSD GEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKP :::::::.::::::..: :: :::::::::::::.:: :::.::: :: ::.::::::: NP_003 GEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKP 400 410 420 430 440 450 490 500 510 pF1KSD YKCEECGKAFNRSSNLTKHK----------------------------IIHTGEKSYKCE :.::.::::::.:::::.:: ::::::: :::: NP_003 YECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCE 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KSD ECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWES :::::::::: ::::.:::: .:::.:::: ..::::::: :. NP_003 ECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDK 520 530 540 550 560 570 pF1KSD L NP_003 AFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 580 590 >>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa) initn: 6391 init1: 2755 opt: 2758 Z-score: 1521.1 bits: 291.4 E(85289): 5.5e-78 Smith-Waterman score: 2758; 73.4% identity (87.0% similar) in 538 aa overlap (30-567:8-545) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY .: .:::::::.:::::::.::. :::::: NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLY 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ :::::::.::::.:.:.:: : .::::: :::::.:::::: :::.. :::..::::.: NP_001 RNVMLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQ 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK :. ::.:::: : :: .::::::: :.:: ::::: :: :::::::::.::: :: NP_001 GKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA :::::::: :.:::: ::::: ::::.: :::::: ::.:::::: :. :.:.::::: NP_001 YVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKA 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS .. :.:. :::::::.::.:::::::::.. : ::::::::::.:::.:::::::::.: NP_001 YNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQS 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT ..::::: ::::::::::::::.::.:::::..::.::::::::::::: :::.. : :: NP_001 ANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLT 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM ::::::::: ::::::::.:. : :: :::::.:::::::: :::::..::.::::: NP_001 THKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKR 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG ::.::: :::: :.:::.: .::.:: :::::::::::::::::. :: ::::: :::: NP_001 IHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTG 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY ::::::::::::::.::.:.:::.:::::: :::::::::::::: :: :. ::: .::: NP_001 EKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPY 460 470 480 490 500 510 550 560 570 pF1KSD NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL .:::: ..::.:: : ... . : : NP_001 KCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK 520 530 540 550 560 570 >>NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 isofo (659 aa) initn: 13056 init1: 2703 opt: 2710 Z-score: 1494.7 bits: 286.7 E(85289): 1.6e-76 Smith-Waterman score: 2710; 73.0% identity (85.4% similar) in 541 aa overlap (18-558:2-536) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY :: :.: : :::::::::::::::. :. :::::: NP_975 MPGPPRSL------EMGLLTFRDVAIEFSLEEWQHLDIAQQNLY 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ :::::::.::.:::.:::: : .::::: ::::::::::::::::.:: .:..:::::: NP_975 RNVMLENYRNLAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQ 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK ..::::..::::::: ::::::::: :::::::.::::: ::::.::.:::.: ::: NP_975 GMEDSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA :.:::.::::.:: : ::: :: ::::: : :::: : .::: :. ::.::.:.::::. NP_975 YLKVFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS :.: :::: :..:.: :::.:::: .:. :: ::::::.:::.::: :.:::::.::::: NP_975 FNWSSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRS 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT :.::::::::::::::::::::::: ::::. :: ::. .:::::::: ::: : :: NP_975 SNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLT 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM .:: .::::: ::::::::.:. ::::: :: :::::: ::: :::::.. :.:::::. NP_975 RHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHKI 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG ::.::: ::::::::.:::: .::.:::::::::::::::::::: :: :: :::::: NP_975 IHVGEKLYKCEECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTR 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY ::::::::::::: ::.::.:: .::::: ::::::::.:.:::::: :. ::: .::: NP_975 EKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPY 460 470 480 490 500 510 550 560 570 pF1KSD NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL .:::: ..:: ::.: :. NP_975 KCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEE 520 530 540 550 560 570 >-- initn: 2342 init1: 620 opt: 620 Z-score: 366.2 bits: 77.9 E(85289): 1.2e-13 Smith-Waterman score: 620; 71.5% identity (89.4% similar) in 123 aa overlap (447-569:537-659) 420 430 440 450 460 470 pF1KSD THKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKR ::::: :::::::.:::::.::::::.::: NP_975 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKR 510 520 530 540 550 560 480 490 500 510 520 530 pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTR :::::::::::::::.:::::..::::.:::: : :::::::::: :::::::..::: NP_975 IHTGEKPYKCEECGKSFNRSSTFTKHKVIHTGVKPYKCEECGKAFFWSSTLTKHKRIHTG 570 580 590 600 610 620 540 550 560 570 pF1KSD QKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL ..::. :. ..::.::.: .. ..::: ::. NP_975 EQPYKWEKFGKAFNRSSHLTTDKITHWREILQV 630 640 650 >>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa) initn: 11252 init1: 2689 opt: 2694 Z-score: 1485.1 bits: 285.3 E(85289): 5.5e-76 Smith-Waterman score: 2694; 71.9% identity (87.6% similar) in 526 aa overlap (33-558:2-527) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD DLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMN : :::.:::::::::::.::. ::..:: : NP_001 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRN 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD VMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDI :.::::.::::::.:::: .:::::.:::::.:::::: .::.: .:..::::::.: NP_001 VLLENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD KDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYV :::::.: ::::::::.:::::::: ::: :: :.: .:::::.: :::: :.::: NP_001 KDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD KVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFK ::: :: :.::.: ::::.: ::::.:.::::.: .:.::.::: : :::.::::::::. NP_001 KVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFN 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD WFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSH ::::::.::::::::::.:::::::::.::: :: :::::: ::: .::::::::...:: NP_001 WFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASH 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD LTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKH :: :::::::::::: :::::.:.::: :.:.:..:.::. :::.:: :::: :: ::.: NP_001 LTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNH 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KSD KIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIH : ::.::: :::.:::..:: ::.:.:...:::: : ::: : ::::.: .::.:: : NP_001 KRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKIL 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KSD TGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEK :::::::::::.::. :: :::::::::::::.::::::.::: :: ::.:::.:: NP_001 MEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEK 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KSD PYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNC :::::::::::. ::: .:. :..::: :::::::::::.:::::.:.:::: .:::.: NP_001 SYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKC 460 470 480 490 500 510 550 560 570 pF1KSD EECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL :::: .:.::::: .. 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72.7% identity (87.5% similar) in 521 aa overlap (35-555:4-524) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM : :::::::::::::.::. ::.::: ::: XP_011 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVM 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD ::::.::::::..::: : .::::: :.: .::.:::: .: . ::.:..::::::.::: XP_011 LENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV :::.: :::: . :.:::..:: :::: ::::.::: ::: ::::::::: ::::::: XP_011 SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF .::: :.:::: :::::::::: .:::.: . :. ::.:: :. ..::::::::.: XP_011 IHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT : :: ::::::::: .:::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::::.:::.:: XP_011 SHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLT 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI :::::::::::::::::::::..:: :..::.::.:::::::::: :::.. : :: :: XP_011 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKR 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG :::::: :::::::..:.. :.:: :: ::.:::::::: :::::: ::.::::: :::: XP_011 IHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTG 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY ::::::::::.::. : .::.:::::::..:.:::::::::. :::::::::::::::: XP_011 EKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPY 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE :::::::::: ::.:: :: :::::: ::::.:::::..: ::.:..::: .:::.::: XP_011 KCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEE 460 470 480 490 500 510 550 560 570 pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL : . :. :.: XP_011 CGKGFKCPSTLTTHKFFVYCREVAVLLENCYSHLYPH 520 530 540 550 576 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 07:52:40 2016 done: Thu Nov 3 07:52:41 2016 Total Scan time: 7.810 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]