FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1916, 545 aa 1>>>pF1KSDA1916 545 - 545 aa - 545 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7959+/-0.00123; mu= 15.8492+/- 0.072 mean_var=96.3176+/-19.352, 0's: 0 Z-trim(102.8): 168 B-trim: 50 in 1/50 Lambda= 0.130684 statistics sampled from 6911 (7101) to 6911 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16 Scan time: 2.900 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3431.1 LGI2 gene_id:55203|Hs108|chr4 ( 545) 3634 696.5 2.1e-200 CCDS7431.1 LGI1 gene_id:9211|Hs108|chr10 ( 557) 2129 412.7 5.6e-115 CCDS6025.1 LGI3 gene_id:203190|Hs108|chr8 ( 548) 2006 389.5 5.3e-108 CCDS81490.1 LGI1 gene_id:9211|Hs108|chr10 ( 509) 1733 338.0 1.6e-92 CCDS12444.1 LGI4 gene_id:163175|Hs108|chr19 ( 537) 1494 293.0 6e-79 CCDS76325.1 LGI1 gene_id:9211|Hs108|chr10 ( 291) 998 199.3 5.3e-51 CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 ( 420) 348 76.9 5.4e-14 CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 353 78.3 7.5e-14 CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 352 78.1 8.6e-14 CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 305 68.9 2.1e-11 CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 307 69.4 2.3e-11 CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 307 69.5 2.4e-11 CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 305 69.1 3.1e-11 CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 298 67.9 1e-10 >>CCDS3431.1 LGI2 gene_id:55203|Hs108|chr4 (545 aa) initn: 3634 init1: 3634 opt: 3634 Z-score: 3711.3 bits: 696.5 E(32554): 2.1e-200 Smith-Waterman score: 3634; 99.8% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD GDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 GDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD IETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 IETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD WLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 WLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD DVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQLFGGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 DVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQLFGGS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD HIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIADSSKAGLSTVYKWNSKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 HIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIADSSKAGLSTVYKWNSKG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD FYSYQSLHEWFRDTDAEFVDIDGKSHLILSSRSQVPIILQWNKSSKKFVPHGDIPNMEDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 FYSYQSLHEWFRDTDAEFVDIDGKSHLILSSRSQVPIILQWNKSSKKFVPHGDIPNMEDV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LAVKSFRMQNTLYLSLTRFIGDSRVMRWNSKQFVEIQALPSRGAMTLQPFSFKDNHYLAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LAVKSFRMQNTLYLSLTRFIGDSRVMRWNSKQFVEIQALPSRGAMTLQPFSFKDNHYLAL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD GSDYTFSQIYQWDKEKQLFKKFKEIYVQAPRSFTAVSTDRRDFLFASSFKGKTKIFEHII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS34 GSDYTFSQIYQWDKEKQLFKKFKEIYVQAPRSFTAVSTDRRDFFFASSFKGKTKIFEHII 490 500 510 520 530 540 pF1KSD VDLSL ::::: CCDS34 VDLSL >>CCDS7431.1 LGI1 gene_id:9211|Hs108|chr10 (557 aa) initn: 2272 init1: 1484 opt: 2129 Z-score: 2177.7 bits: 412.7 E(32554): 5.6e-115 Smith-Waterman score: 2129; 56.1% identity (81.1% similar) in 540 aa overlap (11-544:19-556) 10 20 30 40 50 pF1KSD MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGS .. .: ::.: : . .. .:::.:.:::.. .: .. CCDS74 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAK--PKCPAVCTCTKDNALCENA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD SWVPRIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLE .:: :: :. :::.: . :.::.. : :::::::..:::: .: :::: :: ::: CCDS74 RSIPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLLLFTSNSFDVISDDAFIGLPHLE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD YLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECD :::::.:.:..:::..::::..: :::::::....::.:.:. :::: ..:::::.:.:: CCDS74 YLFIENNNIKSISRHTFRGLKSLIHLSLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD CKAKWLYLWLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVS :: ::: :: ::.:: :. : :::::...:.:...: :..: :.:. : :::::.: CCDS74 CKLKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD VDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVV .:::. :: ::.:::: .:. :::::.: .::.:::::: : : :: :.:. :..:. 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CCDS60 HQNGFYSHQALHPWHRDTDLEFVDGEGKPRLIVSSSSQAPVIYQWSRTQKQFVAQGEVTQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KSD MEDVLAVKSFRMQNTLYLSLTRFIGDSRVMRWNSKQFVEIQALPSRGAMTLQPFSFKDNH . :. ::: :: :: :.:.::::...::.. .: :.:::::::...:::: . CCDS60 VPDAQAVKHFRAGRDSYLCLSRYIGDSKILRWEGTRFSEVQALPSRGSLALQPFLVGGRR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KSD YLALGSDYTFSQIYQWDKEKQLFKKFKEIYVQAPRSFTAVSTDRRDFLFASSFKGKTKIF :::::::..:.::::::. .: : .:.:. :::::.: . . ..:.: ::::.: .. CCDS60 YLALGSDFSFTQIYQWDEGRQKFVRFQELAVQAPRAFCYMPAGDAQLLLAPSFKGQTLVY 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD EHIIVDLSL .::.:::: CCDS60 RHIVVDLSA 540 >>CCDS81490.1 LGI1 gene_id:9211|Hs108|chr10 (509 aa) initn: 1976 init1: 1092 opt: 1733 Z-score: 1774.7 bits: 338.0 E(32554): 1.6e-92 Smith-Waterman score: 1812; 50.2% identity (73.1% similar) in 540 aa overlap (11-544:19-508) 10 20 30 40 50 pF1KSD MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGS .. .: ::.: : . .. .:::.:.:::.. .: .. CCDS81 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAK--PKCPAVCTCTKDNALCENA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD SWVPRIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLE .:: :: :. :::.: . :.::.. : :::::: CCDS81 RSIPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLL---------------------- 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KSD YLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECD :::::....::.:.:. :::: ..:::::.:.:: CCDS81 --------------------------SLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCD 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KSD CKAKWLYLWLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVS :: ::: :: ::.:: :. : :::::...:.:...: :..: :.:. : :::::.: CCDS81 CKLKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLS 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KSD VDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVV .:::. :: ::.:::: .:. :::::.: .::.:::::: : : :: :.:. :..:. CCDS81 IDTFSYLNDEYVVIAQPFTGKCIFLEWDHVEKTFRNYDNITGTSTVVCKPIVIETQLYVI 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KSD VAQLFGGSHIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIADSSKAGLST :::::::::::: : .::.:.::::. .: :::::: :.:... .::.:::::::..: CCDS81 VAQLFGGSHIYKRDSFANKFIKIQDIEILKIRKPNDIETFKIENNWYFVVADSSKAGFTT 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 pF1KSD VYKWNSKGFYSYQSLHEWFRDTDAEFVDIDGKS------HLILSSRSQVPIILQWNKSSK .::::..::::.:::: :.::::.:...: :::::: :: :.: ::::... CCDS81 IYKWNGNGFYSHQSLHAWYRDTDVEYLEIVRTPQTLRTPHLILSSSSQRPVIYQWNKATQ 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KSD KFVPHGDIPNMEDVLAVKSFRMQNTLYLSLTRFIGDSRVMRWNSKQFVEIQALPSRGAMT :. . :::::::: ::: : ... .:. ::::::::.::.:....: .:: .::::.:. CCDS81 LFTNQTDIPNMEDVYAVKHFSVKGDVYICLTRFIGDSKVMKWGGSSFQDIQRMPSRGSMV 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KSD LQPFSFKDNHYLALGSDYTFSQIYQWDKEKQLFKKFKEIYVQAPRSFTAVSTDRRDFLFA .::..... .: :::::.:.:.:.:: :: : ::.:. :::::::: :: ..:.:::: CCDS81 FQPLQINNYQYAILGSDYSFTQVYNWDAEKAKFVKFQELNVQAPRSFTHVSINKRNFLFA 440 450 460 470 480 490 530 540 pF1KSD SSFKGKTKIFEHIIVDLSL :::::.:.:..:.::::: CCDS81 SSFKGNTQIYKHVIVDLSA 500 >>CCDS12444.1 LGI4 gene_id:163175|Hs108|chr19 (537 aa) initn: 1507 init1: 1099 opt: 1494 Z-score: 1530.9 bits: 293.0 E(32554): 6e-79 Smith-Waterman score: 1494; 41.2% identity (71.1% similar) in 539 aa overlap (9-544:2-536) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVP :. :.:::::..: .. : ..:: :::.:.: .: :: .: CCDS12 MGGAGILLLLLAGAGVV--VAWRPPKGKCPLRCSCSKDSALCEGSPDLPVSFS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KSD GDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNK . ::::: ...: : ..:::.:::..::::..:.::::::: ::.::::: :. CCDS12 PTLLSLSLVRTGVTQLKAGSFLRIPSLHLLLFTSNSFSVIEDDAFAGLSHLQYLFIEDNE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KSD IETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYL : .::.::.::::.::::::::::...::: .: ::.: ..::::: :.:::.. :: CCDS12 IGSISKNALRGLRSLTHLSLANNHLETLPRFLFRGLDTLTHVDLRGNPFQCDCRVLWLLQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD WLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKN :. .:..:. : :: .. .:. . ..: . .. ::. ...::. :. .. CCDS12 WMPTVNASVGTGACAGPASLSHMQLHHLDPKTFKCRAIELSWFQTVGESALSVEPFSYQG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KSD DVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQLFGGS . ....::: :..: ::. . :: ... . :.:.:: ... ..::..:.:.::: CCDS12 EPHIVLAQPFAGRCLILSWDYSLQRFRPEEELPAASVVSCKPLVLGPSLFVLAARLWGGS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KSD HIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIADSSKAGLSTVYKWNSKG ... ... : . :. .::: ::. .. . ::.::.:::: .:. .. : CCDS12 QLWARPSPGLRLAPTQTLAPRRLLRPNDAELLWLEGQPCFVVADASKAGSTTLLCRDGPG 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KSD FYSYQSLHEWFRDTDAEFVDIDGKSHLILSSRSQVPIILQWNKSSKKFVPHGDIPNMEDV :: .:::: : :::::: ...::. ::.:.: :: :....: .. .: . :::. ::: CCDS12 FYPHQSLHAWHRDTDAEALELDGRPHLLLASASQRPVLFHW--TGGRFERRTDIPEAEDV 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LAVKSFRMQNTLYLSLTRFIGDSRVMRWNSKQFVEIQALPSRGAMTLQPFSFKDNHYLAL :.. :. . ..: :::.:::: ::::....: .: :::::: ..::. . .. : CCDS12 YATRHFQAGGDVFLCLTRYIGDSMVMRWDGSMFRLLQQLPSRGAHVFQPLLIARDQLAIL 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 pF1KSD GSDYTFSQIYQWDKEKQLFKKFKEI---YVQAPRSFTAVSTDRRDFLFASSFKGKTKIFE :::..:::. . . .: :.. ..:. . :::.:. .. : ::::. ::: :.:.. CCDS12 GSDFAFSQVLRLEPDKGLLEPLQELGPPALVAPRAFAHITMAGRRFLFAACFKGPTQIYQ 470 480 490 500 510 520 540 pF1KSD HIIVDLSL : .::: CCDS12 HHEIDLSA 530 >>CCDS76325.1 LGI1 gene_id:9211|Hs108|chr10 (291 aa) initn: 996 init1: 996 opt: 998 Z-score: 1029.1 bits: 199.3 E(32554): 5.3e-51 Smith-Waterman score: 998; 54.0% identity (79.1% similar) in 263 aa overlap (11-273:19-279) 10 20 30 40 50 pF1KSD MALRRGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGS .. .: ::.: : . .. .:::.:.:::.. .: .. CCDS76 MESERSKRMGNACIPLKRIAYFLCLLSALLLTEGKKPAK--PKCPAVCTCTKDNALCENA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD SWVPRIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLE .:: :: :. :::.: . :.::.. : :::::::..:::: .: :::: :: ::: CCDS76 RSIPRTVPPDVISLSFVRSGFTEISEGSFLFTPSLQLLLFTSNSFDVISDDAFIGLPHLE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD YLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECD :::::.:.:..:::..::::..: :::::::....::.:.:. :::: ..:::::.:.:: CCDS76 YLFIENNNIKSISRHTFRGLKSLIHLSLANNNLQTLPKDIFKGLDSLTNVDLRGNSFNCD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD CKAKWLYLWLKMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVS :: ::: :: ::.:: :. : :::::...:.:...: :..: :.:. : :::::.: CCDS76 CKLKWLVEWLGHTNATVEDIYCEGPPEYKKRKINSLSSKDFDCIITEFAKSQDLPYQSLS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD VDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVV .:::. :: ::.:::: .:. :::::.: .::.::::: CCDS76 IDTFSYLNDEYVVIAQPFTGKCIFLEWDHVEKTFRNYDNITVLREIHRFTNMS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD VAQLFGGSHIYKYDESWTKFVKFQDIEVSRISKPNDIELFQIDDETFFVIADSSKAGLST >>CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 (420 aa) initn: 564 init1: 273 opt: 348 Z-score: 364.6 bits: 76.9 E(32554): 5.4e-14 Smith-Waterman score: 348; 35.3% identity (62.9% similar) in 170 aa overlap (49-215:141-310) 20 30 40 50 60 70 pF1KSD GAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVPGDIS--SLSLVNGTFSEI : :: : : .: : : .... .. CCDS79 LDLGDNRHLRSLEPDTFQGLERLQSLHLYRCQLSSLPGNIFRGLVSLQYLYLQENSLLHL 120 130 140 150 160 170 80 90 100 110 120 130 pF1KSD KDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLT .: .:. : .:. :.:..: . .. . .: :: :. :...::... . : ::::: :: CCDS79 QDDLFADLANLSHLFLHGNRLRLLTEHVFRGLGSLDRLLLHGNRLQGVHRAAFRGLSRLT 180 190 200 210 220 230 140 150 160 170 180 190 pF1KSD HLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYLWLKMTNSTVSDVLCIG : : :: . .:: ....:: :: : : .: . :::.:. :. :.. . . ::: : CCDS79 ILYLFNNSLASLPGEALADLPSLEFLRLNANPWACDCRARPLWAWFQRARVSSSDVTCAT 240 250 260 270 280 290 200 210 220 230 240 250 pF1KSD PPEYQEKKLNDVTSFDYE-CTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCM ::: : . : . :.. : CCDS79 PPERQGRDLRALREADFQACPPAAPTRPGSRARGNSSSNHLYGVAEAGAPPADPSTLYRD 300 310 320 330 340 350 >>CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530 aa) initn: 460 init1: 232 opt: 353 Z-score: 362.1 bits: 78.3 E(32554): 7.5e-14 Smith-Waterman score: 353; 30.9% identity (61.2% similar) in 188 aa overlap (35-220:724-910) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD RGGCGALGLLLLLLGAACLIPRSAQVRRLARCPATCSCTKESIICV--GSSWVPRIVPGD ::: :.: . . : : .:: .: : CCDS64 FFLKEIPIQDVAIQDFTCDGNEESSCQLSPRCPEQCTCMETVVRCSNKGLRALPRGMPKD 700 710 720 730 740 750 70 80 90 100 110 120 pF1KSD ISSLSLVNGTFSEIKDRMFSHLPSLQLLLLNSNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNKIE .. : : .. .. . : .: : : :. :..::.... . .:... :: :.. :... CCDS64 VTELYLEGNHLTAVP-RELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLR 760 770 780 790 800 810 130 140 150 160 170 180 pF1KSD TISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYLWL : .:: :::.: :.: .: :...:. :.:: :: .: : : ..:::. .:: :. 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CCDS43 VTELYLEGNHLTAVP-RELSALRHLTLIDLSNNSISMLTNYTFSNMSHLSTLILSYNRLR 760 770 780 790 800 810 130 140 150 160 170 180 pF1KSD TISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVFSDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYLWL : .:: :::.: :.: .: :...:. :.:: :: .: : : ..:::. .:: :. CCDS43 CIPVHAFNGLRSLRVLTLHGNDISSVPEGSFNDLTSLSHLALGTNPLHCDCSLRWLSEWV 820 830 840 850 860 870 190 200 210 220 230 240 pF1KSD KMTNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTSFDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKNDV : . . . : .: . .. : . . ..: CCDS43 KAGYKEPGIARCSSPEPMADRLLLTTPTHRFQCKGPVDINIVAKCNACLSSPCKNNGTCT 880 890 900 910 920 930 250 260 270 280 290 300 pF1KSD YVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYDNITGQSIVGCKAILIDDQVFVVVAQLFGGSHI CCDS43 QDPVELYRCACPYSYKGKDCTVPINTCIQNPCQHGGTCHLSDSHKDGFSCSCPLGFEGQR 940 950 960 970 980 990 >>CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 (653 aa) initn: 587 init1: 247 opt: 305 Z-score: 318.2 bits: 68.9 E(32554): 2.1e-11 Smith-Waterman score: 305; 35.3% identity (66.0% similar) in 156 aa overlap (65-216:197-351) 40 50 60 70 80 90 pF1KSD RCPATCSCTKESIICVGSSWVPRIVPGDISSLSLVNGTFSEIKDR-MFSHLPSLQLLLLN .:. .: . .::: .. : .:. : .. CCDS57 FNRVPSLMRLDLGELKKLEYISEGAFEGLFNLKYLNLGMCNIKDMPNLTPLVGLEELEMS 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 pF1KSD SNSFTIIRDDAFAGLFHLEYLFIEGNKIETISRNAFRGLRDLTHLSLANNHIKALPRDVF .: : :: .: :: :. :.. .... : :::: :: .:..:.::.:....::.:.: CCDS57 GNHFPEIRPGSFHGLSSLKKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSLPHDLF 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 pF1KSD SDLDSLIELDLRGNKFECDCKAKWLYLWLKM---TNSTVSDVLCIGPPEYQEKKLNDVTS . : :.:: :. : ..::: :: ::. :::: : .: ... . : .: . CCDS57 TPLRYLVELHLHHNPWNCDCDILWLAWWLREYIPTNSTCCGR-CHAPMHMRGRYLVEVDQ 290 300 310 320 330 340 220 230 240 250 260 270 pF1KSD FDYECTTTDFVVHQTLPYQSVSVDTFNSKNDVYVAIAQPSMENCMVLEWDHIEMNFRSYD ...:. 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