Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1904
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1904, 820 aa
  1>>>pF1KSDA1904 820 - 820 aa - 820 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3034+/-0.000395; mu= 11.7837+/- 0.025
 mean_var=152.0756+/-32.983, 0's: 0 Z-trim(116.8): 321  B-trim: 1369 in 1/54
 Lambda= 0.104003
 statistics sampled from 27841 (28220) to 27841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.331), width:  16
 Scan time: 12.260

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_006715788 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_011513699 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_006715789 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_006715790 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_011513700 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
NP_001122108 (OMIM: 614964) protein ELFN1 precurso ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_011513703 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_016867692 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELF ( 828) 1557 246.3 4.2e-64
XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 468)  309 58.8 6.4e-08
NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamil ( 745)  309 59.0 9.1e-08
NP_001123608 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745)  309 59.0 9.1e-08
NP_001123609 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745)  309 59.0 9.1e-08
XP_011520142 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745)  309 59.0 9.1e-08
XP_011520143 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745)  309 59.0 9.1e-08
NP_001123610 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745)  309 59.0 9.1e-08
NP_003052 (OMIM: 603742) slit homolog 1 protein pr (1534)  313 59.8   1e-07
NP_958934 (OMIM: 602059) immunoglobulin superfamil ( 428)  301 57.6 1.4e-07
NP_005536 (OMIM: 602059) immunoglobulin superfamil ( 428)  301 57.6 1.4e-07
NP_001010847 (OMIM: 615212) leucine-rich repeat-co ( 294)  296 56.7 1.7e-07
XP_016874279 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-ric ( 623)  301 57.7 1.8e-07
XP_011536195 (OMIM: 608870) PREDICTED: leucine-ric (1041)  301 57.9 2.7e-07
NP_001129523 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats a (1059)  301 57.9 2.7e-07
NP_700356 (OMIM: 608870) leucine-rich repeats and  (1119)  301 57.9 2.8e-07
XP_016865268 (OMIM: 603745) PREDICTED: slit homolo (1460)  302 58.2 3.1e-07
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523)  302 58.2 3.2e-07
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530)  302 58.2 3.2e-07
XP_011512212 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1159)  295 57.1 5.4e-07
XP_005271426 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leuc ( 958)  290 56.2 7.9e-07
NP_001299615 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich re ( 962)  290 56.2 7.9e-07
NP_115605 (OMIM: 221200,609681) SLIT and NTRK-like ( 841)  289 56.0 7.9e-07
NP_055628 (OMIM: 608869,615112) leucine-rich repea (1065)  290 56.3 8.6e-07
XP_016864334 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1495)  290 56.4 1.1e-06
XP_011512211 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1499)  290 56.4 1.1e-06
XP_006714049 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1509)  290 56.4 1.1e-06
NP_001276065 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1521)  290 56.4 1.1e-06
NP_001276064 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein (1525)  290 56.4 1.1e-06
NP_004778 (OMIM: 603746) slit homolog 2 protein is (1529)  290 56.4 1.1e-06
XP_005248268 (OMIM: 603746) PREDICTED: slit homolo (1533)  290 56.4 1.1e-06
NP_004479 (OMIM: 173511) platelet glycoprotein V p ( 560)  278 54.2 1.8e-06
NP_001094861 (OMIM: 609792) leucine-rich repeat an ( 592)  277 54.1 2.1e-06
NP_036425 (OMIM: 269400,605158) peroxidasin homolo (1479)  276 54.3 4.7e-06
NP_443142 (OMIM: 137580,609678,613229) SLIT and NT ( 696)  266 52.5 7.5e-06
NP_001268432 (OMIM: 137580,609678,613229) SLIT and ( 696)  266 52.5 7.5e-06
NP_001005214 (OMIM: 615218) leucine-rich repeat-co ( 313)  255 50.6 1.3e-05
XP_016872400 (OMIM: 600512,604619) PREDICTED: leuc ( 281)  253 50.3 1.5e-05
NP_001295204 (OMIM: 600512,604619) leucine-rich gl ( 291)  253 50.3 1.5e-05
NP_644807 (OMIM: 608302) leucine-rich repeat LGI f ( 548)  257 51.1 1.6e-05
NP_001137481 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845)  260 51.7 1.6e-05
NP_001137475 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845)  260 51.7 1.6e-05
NP_001137477 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845)  260 51.7 1.6e-05


>>XP_006715788 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELFN1 i  (828 aa)
 initn: 2061 init1: 1013 opt: 1557  Z-score: 1271.9  bits: 246.3 E(85289): 4.2e-64
Smith-Waterman score: 2348; 49.1% identity (71.3% similar) in 863 aa overlap (4-819:9-827)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINS
               : .:.::   .   : .::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::
XP_006 MAGRGWGALWVCVAAATLLHAGGLARADCWLIEGDKGFVWLAICSQNQPPYEAIPQQINS
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD TVHDLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKL
       :. :::::::....: :.::.:::::: ::::::::.::::::: :: .:::::::::.:
XP_006 TIVDLRLNENRIRSVQYASLSRFGNLTYLNLTKNEIGYIEDGAFSGQFNLQVLQLGYNRL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD SNLTEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLA
        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
XP_006 RNLTEGMLRGLGKLEYLYLQANLIEVVMASSFWECPNIVNIDLSMNRIQQLNSGTFAGLA
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD SLMVCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPYHSL
       .: :::: .::: : :.:.::: ::..:.:.:..:::.:::::  ..:: ::        
XP_006 KLSVCELYSNPFYCSCELLGFLRWLAAFTNATQTYDRMQCESPPVYSGYYLLGQGRRGHR
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pF1KSD NAIIVLQAKCRNGSLPARPVSHPTPYSTDAQ--REPDENSGFNP-------DEILSVE--
       . .  ::. : . :  :. :. : : :  .:  : :      .:       :: .: .  
XP_006 SILSKLQSVCTEDSYAAEVVGPPRPASGRSQPGRSPPPPPPPEPSDMPCADDECFSGDGT
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD PP----ASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLK
        :     . .:.: : : ::....: .:::..: .: :. .:: : ..:::  : :  : 
XP_006 TPLVALPTLATQAEARPLIKVKQLTQNSATITVQLPSPFHRMYTLEHFNNSKASTVSRLT
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pF1KSD NKKEIVTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTT-RDPVPGDLAPSTSTTTHYIM
       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
XP_006 KAQEEIRLTNLFTLTNYTYCVVSTSAGLRHNHTCLTICLPRLPSPPGPVPSPSTATHYIM
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pF1KSD TILGCLFGMVIVLGAVYYCLRKRRMQEEKQKSV-------NVKKTILEMRYGADVDAGSI
       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
XP_006 TILGCLFGMVLVLGAVYYCLRRRRRQEEKHKKAASAAAAGSLKKTIIELKYGPELEAPGL
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pF1KSD VHAAQKLGEPPVL-P--VSRMASIPSMIGEKLPTAKGLEAGLDTPKVATKGNYIEVRTGA
       .     :.. :.: :  :.:.  .:.  :: .   : .:.. :::: :.::.:.::::: 
XP_006 A----PLSQGPLLGPEAVTRIPYLPAA-GE-VEQYKLVESA-DTPK-ASKGSYMEVRTGD
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pF1KSD GGDG----LARPEDDLPDLENGQGSAAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKLDSASFLG-
         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
XP_006 PPERRDCELGRPG---PD---SQSSVAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKSESTSFQGV
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pF1KSD --GGSSSGDPELAFECQSLPAAAAASSATGPGALERPSFLSPSYKESSHHPLQRQLSADA
         :  : ..: :..   : : ::            . .::.:.::..  : :::. :..:
XP_006 KSGPVSVAEPPLVL--LSEPLAA------------KHGFLAPGYKDAFGHSLQRHHSVEA
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pF1KSD AVTRKTCSVSSSGSIKSAKVFSLD-VPDHPAATGLAKGDSKYIEKGSPLNSPLDRLPLVP
       :   .. :.:::::..: ..:  . :  : ::..    ..::::::::  . .  : ..:
XP_006 AGPPRA-STSSSGSVRSPRAFRAEAVGVHKAAAA----EAKYIEKGSPAADAI--LTVTP
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pF1KSD AGSGGGSGGGGGIHHLEVKPAYHCSEHRHSFPALYYEEGA-----------DSLSQRVSF
       :..         . . :.. . . .:::::.:. .  :             ..:....:.
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pF1KSD LKPLTRSK-RDSTYSQLSPRHYYSGYSSSPEYSSESTHKIWERFR-PYKKHHREEVYMAA
       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
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       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
XP_006 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
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>>XP_011513699 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELFN1 i  (828 aa)
 initn: 2061 init1: 1013 opt: 1557  Z-score: 1271.9  bits: 246.3 E(85289): 4.2e-64
Smith-Waterman score: 2348; 49.1% identity (71.3% similar) in 863 aa overlap (4-819:9-827)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINS
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XP_011 MAGRGWGALWVCVAAATLLHAGGLARADCWLIEGDKGFVWLAICSQNQPPYEAIPQQINS
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pF1KSD TVHDLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKL
       :. :::::::....: :.::.:::::: ::::::::.::::::: :: .:::::::::.:
XP_011 TIVDLRLNENRIRSVQYASLSRFGNLTYLNLTKNEIGYIEDGAFSGQFNLQVLQLGYNRL
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pF1KSD SNLTEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLA
        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
XP_011 RNLTEGMLRGLGKLEYLYLQANLIEVVMASSFWECPNIVNIDLSMNRIQQLNSGTFAGLA
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pF1KSD SLMVCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPYHSL
       .: :::: .::: : :.:.::: ::..:.:.:..:::.:::::  ..:: ::        
XP_011 KLSVCELYSNPFYCSCELLGFLRWLAAFTNATQTYDRMQCESPPVYSGYYLLGQGRRGHR
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pF1KSD NAIIVLQAKCRNGSLPARPVSHPTPYSTDAQ--REPDENSGFNP-------DEILSVE--
       . .  ::. : . :  :. :. : : :  .:  : :      .:       :: .: .  
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pF1KSD PP----ASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLK
        :     . .:.: : : ::....: .:::..: .: :. .:: : ..:::  : :  : 
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       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
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       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
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         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
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         :  : ..: :..   : : ::            . .::.:.::..  : :::. :..:
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       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
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       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
XP_011 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
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       :. :::::::....: :.::.:::::: ::::::::.::::::: :: .:::::::::.:
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        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
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XP_006 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
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>>XP_006715790 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELFN1 i  (828 aa)
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Smith-Waterman score: 2348; 49.1% identity (71.3% similar) in 863 aa overlap (4-819:9-827)

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        :     . .:.: : : ::....: .:::..: .: :. .:: : ..:::  : :  : 
XP_006 TPLVALPTLATQAEARPLIKVKQLTQNSATITVQLPSPFHRMYTLEHFNNSKASTVSRLT
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370        380       390         
pF1KSD NKKEIVTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTT-RDPVPGDLAPSTSTTTHYIM
       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
XP_006 KAQEEIRLTNLFTLTNYTYCVVSTSAGLRHNHTCLTICLPRLPSPPGPVPSPSTATHYIM
              370       380       390       400       410       420

     400       410       420       430              440       450  
pF1KSD TILGCLFGMVIVLGAVYYCLRKRRMQEEKQKSV-------NVKKTILEMRYGADVDAGSI
       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
XP_006 TILGCLFGMVLVLGAVYYCLRRRRRQEEKHKKAASAAAAGSLKKTIIELKYGPELEAPGL
              430       440       450       460       470       480

            460          470       480       490       500         
pF1KSD VHAAQKLGEPPVL-P--VSRMASIPSMIGEKLPTAKGLEAGLDTPKVATKGNYIEVRTGA
       .     :.. :.: :  :.:.  .:.  :: .   : .:.. :::: :.::.:.::::: 
XP_006 A----PLSQGPLLGPEAVTRIPYLPAA-GE-VEQYKLVESA-DTPK-ASKGSYMEVRTGD
                  490       500         510         520       530  

     510           520       530       540       550       560     
pF1KSD GGDG----LARPEDDLPDLENGQGSAAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKLDSASFLG-
         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
XP_006 PPERRDCELGRPG---PD---SQSSVAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKSESTSFQGV
            540             550       560       570       580      

            570       580       590       600       610       620  
pF1KSD --GGSSSGDPELAFECQSLPAAAAASSATGPGALERPSFLSPSYKESSHHPLQRQLSADA
         :  : ..: :..   : : ::            . .::.:.::..  : :::. :..:
XP_006 KSGPVSVAEPPLVL--LSEPLAA------------KHGFLAPGYKDAFGHSLQRHHSVEA
        590       600                     610       620       630  

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pF1KSD AVTRKTCSVSSSGSIKSAKVFSLD-VPDHPAATGLAKGDSKYIEKGSPLNSPLDRLPLVP
       :   .. :.:::::..: ..:  . :  : ::..    ..::::::::  . .  : ..:
XP_006 AGPPRA-STSSSGSVRSPRAFRAEAVGVHKAAAA----EAKYIEKGSPAADAI--LTVTP
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             690       700       710       720                  730
pF1KSD AGSGGGSGGGGGIHHLEVKPAYHCSEHRHSFPALYYEEGA-----------DSLSQRVSF
       :..         . . :.. . . .:::::.:. .  :             ..:....:.
XP_006 AAA---------VLRAEAEKGRQYGEHRHSYPGSHPAEPPAPPGPPPPPPHEGLGRKASI
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               740       750       760       770        780        
pF1KSD LKPLTRSK-RDSTYSQLSPRHYYSGYSSSPEYSSESTHKIWERFR-PYKKHHREEVYMAA
       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
XP_006 LEPLTRPRPRDLAYSQLSPQYHSLSYSSSPEYTCRASQSIWERFRLSRRRHKEEEEFMAA
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      790       800       810       820
pF1KSD GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQQKL
       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
XP_006 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
        800       810       820        

>>XP_011513700 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELFN1 i  (828 aa)
 initn: 2061 init1: 1013 opt: 1557  Z-score: 1271.9  bits: 246.3 E(85289): 4.2e-64
Smith-Waterman score: 2348; 49.1% identity (71.3% similar) in 863 aa overlap (4-819:9-827)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINS
               : .:.::   .   : .::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::
XP_011 MAGRGWGALWVCVAAATLLHAGGLARADCWLIEGDKGFVWLAICSQNQPPYEAIPQQINS
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD TVHDLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKL
       :. :::::::....: :.::.:::::: ::::::::.::::::: :: .:::::::::.:
XP_011 TIVDLRLNENRIRSVQYASLSRFGNLTYLNLTKNEIGYIEDGAFSGQFNLQVLQLGYNRL
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pF1KSD SNLTEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLA
        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
XP_011 RNLTEGMLRGLGKLEYLYLQANLIEVVMASSFWECPNIVNIDLSMNRIQQLNSGTFAGLA
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pF1KSD SLMVCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPYHSL
       .: :::: .::: : :.:.::: ::..:.:.:..:::.:::::  ..:: ::        
XP_011 KLSVCELYSNPFYCSCELLGFLRWLAAFTNATQTYDRMQCESPPVYSGYYLLGQGRRGHR
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pF1KSD NAIIVLQAKCRNGSLPARPVSHPTPYSTDAQ--REPDENSGFNP-------DEILSVE--
       . .  ::. : . :  :. :. : : :  .:  : :      .:       :: .: .  
XP_011 SILSKLQSVCTEDSYAAEVVGPPRPASGRSQPGRSPPPPPPPEPSDMPCADDECFSGDGT
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pF1KSD PP----ASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLK
        :     . .:.: : : ::....: .:::..: .: :. .:: : ..:::  : :  : 
XP_011 TPLVALPTLATQAEARPLIKVKQLTQNSATITVQLPSPFHRMYTLEHFNNSKASTVSRLT
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pF1KSD NKKEIVTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTT-RDPVPGDLAPSTSTTTHYIM
       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
XP_011 KAQEEIRLTNLFTLTNYTYCVVSTSAGLRHNHTCLTICLPRLPSPPGPVPSPSTATHYIM
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pF1KSD TILGCLFGMVIVLGAVYYCLRKRRMQEEKQKSV-------NVKKTILEMRYGADVDAGSI
       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
XP_011 TILGCLFGMVLVLGAVYYCLRRRRRQEEKHKKAASAAAAGSLKKTIIELKYGPELEAPGL
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pF1KSD VHAAQKLGEPPVL-P--VSRMASIPSMIGEKLPTAKGLEAGLDTPKVATKGNYIEVRTGA
       .     :.. :.: :  :.:.  .:.  :: .   : .:.. :::: :.::.:.::::: 
XP_011 A----PLSQGPLLGPEAVTRIPYLPAA-GE-VEQYKLVESA-DTPK-ASKGSYMEVRTGD
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pF1KSD GGDG----LARPEDDLPDLENGQGSAAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKLDSASFLG-
         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
XP_011 PPERRDCELGRPG---PD---SQSSVAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKSESTSFQGV
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            570       580       590       600       610       620  
pF1KSD --GGSSSGDPELAFECQSLPAAAAASSATGPGALERPSFLSPSYKESSHHPLQRQLSADA
         :  : ..: :..   : : ::            . .::.:.::..  : :::. :..:
XP_011 KSGPVSVAEPPLVL--LSEPLAA------------KHGFLAPGYKDAFGHSLQRHHSVEA
        590       600                     610       620       630  

            630       640        650       660       670       680 
pF1KSD AVTRKTCSVSSSGSIKSAKVFSLD-VPDHPAATGLAKGDSKYIEKGSPLNSPLDRLPLVP
       :   .. :.:::::..: ..:  . :  : ::..    ..::::::::  . .  : ..:
XP_011 AGPPRA-STSSSGSVRSPRAFRAEAVGVHKAAAA----EAKYIEKGSPAADAI--LTVTP
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pF1KSD AGSGGGSGGGGGIHHLEVKPAYHCSEHRHSFPALYYEEGA-----------DSLSQRVSF
       :..         . . :.. . . .:::::.:. .  :             ..:....:.
XP_011 AAA---------VLRAEAEKGRQYGEHRHSYPGSHPAEPPAPPGPPPPPPHEGLGRKASI
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pF1KSD LKPLTRSK-RDSTYSQLSPRHYYSGYSSSPEYSSESTHKIWERFR-PYKKHHREEVYMAA
       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
XP_011 LEPLTRPRPRDLAYSQLSPQYHSLSYSSSPEYTCRASQSIWERFRLSRRRHKEEEEFMAA
        740       750       760       770       780       790      

      790       800       810       820
pF1KSD GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQQKL
       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
XP_011 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
        800       810       820        

>>NP_001122108 (OMIM: 614964) protein ELFN1 precursor [H  (828 aa)
 initn: 2061 init1: 1013 opt: 1557  Z-score: 1271.9  bits: 246.3 E(85289): 4.2e-64
Smith-Waterman score: 2348; 49.1% identity (71.3% similar) in 863 aa overlap (4-819:9-827)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINS
               : .:.::   .   : .::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::
NP_001 MAGRGWGALWVCVAAATLLHAGGLARADCWLIEGDKGFVWLAICSQNQPPYEAIPQQINS
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD TVHDLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKL
       :. :::::::....: :.::.:::::: ::::::::.::::::: :: .:::::::::.:
NP_001 TIVDLRLNENRIRSVQYASLSRFGNLTYLNLTKNEIGYIEDGAFSGQFNLQVLQLGYNRL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD SNLTEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLA
        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
NP_001 RNLTEGMLRGLGKLEYLYLQANLIEVVMASSFWECPNIVNIDLSMNRIQQLNSGTFAGLA
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pF1KSD SLMVCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPYHSL
       .: :::: .::: : :.:.::: ::..:.:.:..:::.:::::  ..:: ::        
NP_001 KLSVCELYSNPFYCSCELLGFLRWLAAFTNATQTYDRMQCESPPVYSGYYLLGQGRRGHR
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pF1KSD NAIIVLQAKCRNGSLPARPVSHPTPYSTDAQ--REPDENSGFNP-------DEILSVE--
       . .  ::. : . :  :. :. : : :  .:  : :      .:       :: .: .  
NP_001 SILSKLQSVCTEDSYAAEVVGPPRPASGRSQPGRSPPPPPPPEPSDMPCADDECFSGDGT
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pF1KSD PP----ASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLK
        :     . .:.: : : ::....: .:::..: .: :. .:: : ..:::  : :  : 
NP_001 TPLVALPTLATQAEARPLIKVKQLTQNSATITVQLPSPFHRMYTLEHFNNSKASTVSRLT
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370        380       390         
pF1KSD NKKEIVTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTT-RDPVPGDLAPSTSTTTHYIM
       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
NP_001 KAQEEIRLTNLFTLTNYTYCVVSTSAGLRHNHTCLTICLPRLPSPPGPVPSPSTATHYIM
              370       380       390       400       410       420

     400       410       420       430              440       450  
pF1KSD TILGCLFGMVIVLGAVYYCLRKRRMQEEKQKSV-------NVKKTILEMRYGADVDAGSI
       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
NP_001 TILGCLFGMVLVLGAVYYCLRRRRRQEEKHKKAASAAAAGSLKKTIIELKYGPELEAPGL
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pF1KSD VHAAQKLGEPPVL-P--VSRMASIPSMIGEKLPTAKGLEAGLDTPKVATKGNYIEVRTGA
       .     :.. :.: :  :.:.  .:.  :: .   : .:.. :::: :.::.:.::::: 
NP_001 A----PLSQGPLLGPEAVTRIPYLPAA-GE-VEQYKLVESA-DTPK-ASKGSYMEVRTGD
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pF1KSD GGDG----LARPEDDLPDLENGQGSAAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKLDSASFLG-
         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
NP_001 PPERRDCELGRPG---PD---SQSSVAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKSESTSFQGV
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pF1KSD --GGSSSGDPELAFECQSLPAAAAASSATGPGALERPSFLSPSYKESSHHPLQRQLSADA
         :  : ..: :..   : : ::            . .::.:.::..  : :::. :..:
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pF1KSD AVTRKTCSVSSSGSIKSAKVFSLD-VPDHPAATGLAKGDSKYIEKGSPLNSPLDRLPLVP
       :   .. :.:::::..: ..:  . :  : ::..    ..::::::::  . .  : ..:
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pF1KSD AGSGGGSGGGGGIHHLEVKPAYHCSEHRHSFPALYYEEGA-----------DSLSQRVSF
       :..         . . :.. . . .:::::.:. .  :             ..:....:.
NP_001 AAA---------VLRAEAEKGRQYGEHRHSYPGSHPAEPPAPPGPPPPPPHEGLGRKASI
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       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
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pF1KSD GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQQKL
       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
NP_001 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
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>>XP_011513703 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELFN1 i  (828 aa)
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       :. :::::::....: :.::.:::::: ::::::::.::::::: :: .:::::::::.:
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        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
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       .: :::: .::: : :.:.::: ::..:.:.:..:::.:::::  ..:: ::        
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       . .  ::. : . :  :. :. : : :  .:  : :      .:       :: .: .  
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pF1KSD PP----ASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLK
        :     . .:.: : : ::....: .:::..: .: :. .:: : ..:::  : :  : 
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       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
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       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
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pF1KSD GGDG----LARPEDDLPDLENGQGSAAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKLDSASFLG-
         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
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       :   .. :.:::::..: ..:  . :  : ::..    ..::::::::  . .  : ..:
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pF1KSD AGSGGGSGGGGGIHHLEVKPAYHCSEHRHSFPALYYEEGA-----------DSLSQRVSF
       :..         . . :.. . . .:::::.:. .  :             ..:....:.
XP_011 AAA---------VLRAEAEKGRQYGEHRHSYPGSHPAEPPAPPGPPPPPPHEGLGRKASI
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       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
XP_011 LEPLTRPRPRDLAYSQLSPQYHSLSYSSSPEYTCRASQSIWERFRLSRRRHKEEEEFMAA
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       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
XP_011 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
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>>XP_016867692 (OMIM: 614964) PREDICTED: protein ELFN1 i  (828 aa)
 initn: 2061 init1: 1013 opt: 1557  Z-score: 1271.9  bits: 246.3 E(85289): 4.2e-64
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pF1KSD      MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINS
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XP_016 MAGRGWGALWVCVAAATLLHAGGLARADCWLIEGDKGFVWLAICSQNQPPYEAIPQQINS
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pF1KSD TVHDLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKL
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XP_016 TIVDLRLNENRIRSVQYASLSRFGNLTYLNLTKNEIGYIEDGAFSGQFNLQVLQLGYNRL
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pF1KSD SNLTEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLA
        :::::::::...:..:..: ::::::  ..: :::....:::: ::...:...:::.::
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pF1KSD SLMVCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPYHSL
       .: :::: .::: : :.:.::: ::..:.:.:..:::.:::::  ..:: ::        
XP_016 KLSVCELYSNPFYCSCELLGFLRWLAAFTNATQTYDRMQCESPPVYSGYYLLGQGRRGHR
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pF1KSD PP----ASSTTDASAGPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLK
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pF1KSD NKKEIVTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTT-RDPVPGDLAPSTSTTTHYIM
       . .: . : .: . :.::.::.:   . : ::::::.   : : :   .:: ::.:::::
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pF1KSD TILGCLFGMVIVLGAVYYCLRKRRMQEEKQKSV-------NVKKTILEMRYGADVDAGSI
       ::::::::::.::::::::::.:: ::::.:..       ..::::.:..:: ...: ..
XP_016 TILGCLFGMVLVLGAVYYCLRRRRRQEEKHKKAASAAAAGSLKKTIIELKYGPELEAPGL
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pF1KSD VHAAQKLGEPPVL-P--VSRMASIPSMIGEKLPTAKGLEAGLDTPKVATKGNYIEVRTGA
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XP_016 A----PLSQGPLLGPEAVTRIPYLPAA-GE-VEQYKLVESA-DTPK-ASKGSYMEVRTGD
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pF1KSD GGDG----LARPEDDLPDLENGQGSAAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKLDSASFLG-
         .     :.::    ::   .:.:.::::::::::::::::::::::::: .:.:: : 
XP_016 PPERRDCELGRPG---PD---SQSSVAEISTIAKEVDKVNQIINNCIDALKSESTSFQGV
            540             550       560       570       580      

            570       580       590       600       610       620  
pF1KSD --GGSSSGDPELAFECQSLPAAAAASSATGPGALERPSFLSPSYKESSHHPLQRQLSADA
         :  : ..: :..   : : ::            . .::.:.::..  : :::. :..:
XP_016 KSGPVSVAEPPLVL--LSEPLAA------------KHGFLAPGYKDAFGHSLQRHHSVEA
        590       600                     610       620       630  

            630       640        650       660       670       680 
pF1KSD AVTRKTCSVSSSGSIKSAKVFSLD-VPDHPAATGLAKGDSKYIEKGSPLNSPLDRLPLVP
       :   .. :.:::::..: ..:  . :  : ::..    ..::::::::  . .  : ..:
XP_016 AGPPRA-STSSSGSVRSPRAFRAEAVGVHKAAAA----EAKYIEKGSPAADAI--LTVTP
             640       650       660           670       680       

             690       700       710       720                  730
pF1KSD AGSGGGSGGGGGIHHLEVKPAYHCSEHRHSFPALYYEEGA-----------DSLSQRVSF
       :..         . . :.. . . .:::::.:. .  :             ..:....:.
XP_016 AAA---------VLRAEAEKGRQYGEHRHSYPGSHPAEPPAPPGPPPPPPHEGLGRKASI
                  690       700       710       720       730      

               740       750       760       770        780        
pF1KSD LKPLTRSK-RDSTYSQLSPRHYYSGYSSSPEYSSESTHKIWERFR-PYKKHHREEVYMAA
       :.:::: . :: .::::::...  .:::::::. .....::::::   ..:..:: .:::
XP_016 LEPLTRPRPRDLAYSQLSPQYHSLSYSSSPEYTCRASQSIWERFRLSRRRHKEEEEFMAA
        740       750       760       770       780       790      

      790       800       810       820
pF1KSD GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQQKL
       :::::::::::::::::::::::::::::.: 
XP_016 GHALRKKVQFAKDEDLHDILDYWKGVSAQHKS
        800       810       820        

>>XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobulin   (468 aa)
 initn: 331 init1: 299 opt: 309  Z-score: 263.2  bits: 58.8 E(85289): 6.4e-08
Smith-Waterman score: 323; 27.1% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (10-365:12-369)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINSTVH
                  ::: :   :.    :  .  ::    .: :. ..   . .:. . ..: 
XP_016 MFPLRALWLVWALLGVA--GSCPEPCACV--DKYAHQFADCAYKE--LREVPEGLPANVT
               10          20          30        40          50    

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD DLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKLSNL
        : :. ::. ..  ...    ..:.: :..::.  .: ::.   :.:. :.:..: .:..
XP_016 TLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSHNFISSF
           60        70        80        90       100       110    

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pF1KSD TEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLASLM
         . ::..: ::.: ..:: .  .   :..  :.: :. ...:::  :  .:: .:..: 
XP_016 PWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFDALSALS
          120       130       140       150       160       170    

      180       190       200       210       220        230       
pF1KSD VCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLL-VPR-----PY
         .:  :::.: : :  . :: .       . : . : ::  . : :.  .:      : 
XP_016 HLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRLPALPCAPPS
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KSD HSLNAIIVLQAK---CRNG---SLPARPVSHPTPYSTDAQREPDENSGFNPDEILSVEPP
         :.:   :.:     : :    :     .::::      . :  .  ..:  .:: :  
XP_016 VHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPP-VLSGEDD
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pF1KSD ASSTTDASA-GPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLKNKKEI
       . .. .. . : .  : ..   . : .   : : .   .:.  :.: .  ... : .  .
XP_016 GVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAK-EAGV
           300       310       320       330       340        350  

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pF1KSD VTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTTRDPVPGDLAPSTSTTTHYIMTILGCL
        :    :::.:     ::.:                                        
XP_016 YT---CRAHNELGANSTSIRVAVAATGPPKHAPGAGGEPDGQAPTSERKSTAKGRGNSVL
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>>NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamily co  (745 aa)
 initn: 364 init1: 299 opt: 309  Z-score: 260.5  bits: 59.0 E(85289): 9.1e-08
Smith-Waterman score: 323; 27.1% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (10-365:12-369)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MLRLGLCAAALLCVCRPGAVRADCWLIEGDKGYVWLAICSQNQPPYETIPQHINSTVH
                  ::: :   :.    :  .  ::    .: :. ..   . .:. . ..: 
NP_065 MFPLRALWLVWALLGVA--GSCPEPCACV--DKYAHQFADCAYKE--LREVPEGLPANVT
               10          20          30        40          50    

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD DLRLNENKLKAVLYSSLNRFGNLTDLNLTKNEISYIEDGAFLGQSSLQVLQLGYNKLSNL
        : :. ::. ..  ...    ..:.: :..::.  .: ::.   :.:. :.:..: .:..
NP_065 TLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNLDLSHNFISSF
           60        70        80        90       100       110    

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pF1KSD TEGMLRGMSRLQFLFVQHNLIEVVTPTAFSECPSLISIDLSSNRLSRLDGATFASLASLM
         . ::..: ::.: ..:: .  .   :..  :.: :. ...:::  :  .:: .:..: 
NP_065 PWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFDALSALS
          120       130       140       150       160       170    

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pF1KSD VCELAGNPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLL-VPR-----PY
         .:  :::.: : :  . :: .       . : . : ::  . : :.  .:      : 
NP_065 HLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRLPALPCAPPS
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KSD HSLNAIIVLQAK---CRNG---SLPARPVSHPTPYSTDAQREPDENSGFNPDEILSVEPP
         :.:   :.:     : :    :     .::::      . :  .  ..:  .:: :  
NP_065 VHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPP-VLSGEDD
          240       250       260       270       280        290   

        290        300       310       320       330       340     
pF1KSD ASSTTDASA-GPAIKLHHVTFTSATLVVIIPHPYSKMYILVQYNNSYFSDVMTLKNKKEI
       . .. .. . : .  : ..   . : .   : : .   .:.  :.: .  ... : .  .
NP_065 GVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAK-EAGV
           300       310       320       330       340        350  

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pF1KSD VTLDKLRAHTEYTFCVTSLRNSRRFNHTCLTFTTRDPVPGDLAPSTSTTTHYIMTILGCL
        :    :::.:     ::.:                                        
NP_065 YT---CRAHNELGANSTSIRVAVAATGPPKHAPGAGGEPDGQAPTSERKSTAKGRGNSVL
               360       370       380       390       400         




820 residues in 1 query   sequences
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 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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