Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1874, 521 aa
  1>>>pF1KSDA1874 521 - 521 aa - 521 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0695+/-0.00208; mu= 11.7328+/- 0.124
 mean_var=300.9489+/-54.466, 0's: 0 Z-trim(105.0): 962  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.073931
 statistics sampled from 7123 (8189) to 7123 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.252), width:  16
 Scan time:  3.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 521) 3597 398.6 9.3e-111
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 511) 3526 391.0 1.7e-108
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17     ( 522) 3034 338.5 1.1e-92
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19      ( 569) 1598 185.4 1.5e-46
CCDS9283.1 ZNF10 gene_id:7556|Hs108|chr12          ( 573) 1514 176.5 7.4e-44
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19      ( 528) 1492 174.1 3.6e-43
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19      ( 535) 1491 174.0 3.9e-43
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1466 171.4 2.7e-42
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1466 171.4 2.8e-42
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1466 171.4 2.8e-42
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1466 171.5 2.8e-42
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7        ( 524) 1440 168.5 1.7e-41
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19   ( 536) 1438 168.3   2e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1430 167.6 4.1e-41
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1427 167.3   5e-41
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19      ( 542) 1425 166.9 5.2e-41
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1411 165.6 1.6e-40
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1411 165.6 1.6e-40
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1411 165.6 1.7e-40
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10         ( 778) 1408 165.4 2.2e-40
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 539) 1390 163.2 6.9e-40
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 560) 1390 163.2   7e-40
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 503) 1389 163.0 7.1e-40
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 555) 1389 163.1 7.5e-40
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 564) 1389 163.1 7.6e-40
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 577) 1389 163.1 7.7e-40
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 616) 1389 163.2 7.9e-40
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19       ( 629) 1389 163.2   8e-40
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 699) 1386 162.9 1.1e-39
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 810) 1386 163.0 1.1e-39
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 811) 1386 163.0 1.1e-39
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 817) 1386 163.0 1.1e-39
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 829) 1386 163.1 1.2e-39
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1383 162.7 1.4e-39
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 714) 1381 162.4 1.5e-39
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 769) 1381 162.5 1.6e-39
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1379 162.2 1.8e-39
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1378 162.0 1.8e-39
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7       ( 495) 1375 161.5   2e-39
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1375 161.8 2.5e-39
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1372 161.3 2.7e-39
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059) 1376 162.2 2.8e-39
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1372 161.4 2.9e-39
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19       ( 609) 1369 161.0 3.5e-39
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1368 160.9 3.6e-39
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1368 161.0 3.8e-39
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19       ( 541) 1365 160.5 4.4e-39
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19        ( 516) 1360 160.0 6.2e-39
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19       ( 792) 1363 160.6 6.2e-39
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 839) 1360 160.3   8e-39


>>CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17           (521 aa)
 initn: 3597 init1: 3597 opt: 3597  Z-score: 2102.0  bits: 398.6 E(32554): 9.3e-111
Smith-Waterman score: 3597; 99.8% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESYNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520 
pF1KSD LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
              490       500       510       520 

>>CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17           (511 aa)
 initn: 3526 init1: 3526 opt: 3526  Z-score: 2061.1  bits: 391.0 E(32554): 1.7e-108
Smith-Waterman score: 3526; 99.8% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (12-521:2-511)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
                  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73           MGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
                         10        20        30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESYNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
               60        70        80        90       100       110

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
              120       130       140       150       160       170

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
              180       190       200       210       220       230

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
              240       250       260       270       280       290

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
              300       310       320       330       340       350

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
              360       370       380       390       400       410

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
              420       430       440       450       460       470

              490       500       510       520 
pF1KSD LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
              480       490       500       510 

>>CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17          (522 aa)
 initn: 2818 init1: 2818 opt: 3034  Z-score: 1777.4  bits: 338.5 E(32554): 1.1e-92
Smith-Waterman score: 3034; 85.6% identity (91.5% similar) in 527 aa overlap (1-521:1-522)

               10        20        30        40             50     
pF1KSD METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTF-----KDVAMDFT
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: ...      ...    .
CCDS58 METDLAEMPEKGVLSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQAAAAAAAPGSRSLRGVHV
               10        20        30        40        50        60

          60        70         80        90       100       110    
pF1KSD PEEWGKLDPAQRDVMLE-NYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDME
       :       ::....    . .   :: : ..  ..  : . ..  .:. . :    ::.:
CCDS58 PPPLHPA-PAREEIKSTCSLKACFSLSLTLTYYRTAFLLSTENEGNLHFQCP----SDVE
                70        80        90       100       110         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KSD TRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS58 TRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLEKQQGNQERHLR
         120       130       140       150       160       170     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KSD EMFTHMNSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQ
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMFTHMNSLSEETDHEHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQ
         180       190       200       210       220       230     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KSD RTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT
       ::::::::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTYKEKKPHKCNDCGELFTCHSVHIQHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT
         240       250       260       270       280       290     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
       :::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS58 RILFECRECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVRPY
         300       310       320       330       340       350     

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
         360       370       380       390       400       410     

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECSECGKTFSQSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
         420       430       440       450       460       470     

          480       490       500       510       520 
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
         480       490       500       510       520  

>>CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19           (569 aa)
 initn: 7531 init1: 1066 opt: 1598  Z-score: 949.3  bits: 185.4 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1687; 49.3% identity (75.6% similar) in 491 aa overlap (41-521:2-491)

               20        30        40        50        60          
pF1KSD KGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRD--
                                     :.. ::: :::..:. :::  :.::::.  
CCDS12                              MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLY
                                            10        20        30 

         70        80        90        100       110       120     
pF1KSD --VMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSV
         :::::::.:::: . ::::.  .: :.::::  ..... ..   : :   .... .: 
CCDS12 RKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQGKEPWMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSSK
              40        50        60        70        80        90 

         130       140        150       160       170        180   
pF1KSD QDFSKAESCKVAIID-RLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMF-THMNSL
       :. .  :: ::. .  :    :.   .:.   . :.: .:: :.:: :: ... :: . :
CCDS12 QE-TYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEIL
              100       110       120       130       140       150

           190       200       210         220       230       240 
pF1KSD SEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKK
        :  .....  :..:.: ...  ..  :  . ..  .  .:: ..::  ::....: :::
CCDS12 PEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQSFPTKEKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEKK
              160       170       180       190       200       210

             250       260       270       280       290        300
pF1KSD PHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFEC
         ::::: ..:.  : :  :::.:::::::.: ::::.::. :::..:.: :: .  .::
CCDS12 LLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYEC
              220       230       240       250       260       270

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
       .::.:.:.... :: :::.:.::.::.:.:: :.:.. .::.::: .::: .:.:: :: 
CCDS12 KECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECG
              280       290       300       310       320       330

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
       ::: ..: : .::: ::::::: :. ::::::: . :  :::.::::.::::.:: :.::
CCDS12 KAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKAFSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAFS
              340       350       360       370       380       390

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
       : .::.::::.:::::::::. : :.::. . . .:::.: :.:::.: :::::: .::.
CCDS12 QYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSS
              400       410       420       430       440       450

              490       500       510       520                    
pF1KSD LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP                   
       : ::::.::::::. :.:: :.:. ...: .:::.:: :.:                   
CCDS12 LAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLAQHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTLH
              460       470       480       490       500       510

CCDS12 QRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHERIHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFIS
              520       530       540       550       560         

>>CCDS9283.1 ZNF10 gene_id:7556|Hs108|chr12               (573 aa)
 initn: 4809 init1: 1171 opt: 1514  Z-score: 900.8  bits: 176.5 E(32554): 7.4e-44
Smith-Waterman score: 1534; 46.9% identity (69.9% similar) in 518 aa overlap (34-520:3-515)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KSD DLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLD
                                     :  ::: :.  :::::: .::: :::  ::
CCDS92                             MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLD
                                           10        20        30  

                70        80         90       100       110        
pF1KSD PAQ----RDVMLENYRNLVSLWLPVSKPES-HNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQ
        ::    :.::::::.:::::   ..::.    ::.:.::  .::.  . .. : ::  .
CCDS92 TAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFE
             40        50        60        70        80        90  

      120        130       140       150       160       170       
pF1KSD SKDSTSVQD-FSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREM-
        :.:.: .. :.  .:: . . . ..::...  .:: . .:.. :.. : : :::::.. 
CCDS92 IKSSVSSRSIFKDKQSCDIKM-EGMARNDLWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVA
            100       110        120       130       140       150 

        180                             190       200        210   
pF1KSD FTHMNSLSEETD----------------------HKHDVYWKSFNQKSVLIT-EDRVPKG
       ::. . :..:                        ::.: . ::...  ::   .:   ..
CCDS92 FTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASN
             160       170       180       190       200       210 

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD SYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTC
       :   .   ... :. .:..  ::.   : .:: :  . .:. : :   . .:  :::: :
CCDS92 S---NECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYEC
                220       230       240       250       260        

           280       290        300       310       320       330  
pF1KSD NECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECG
       .:::: :: :.:::.::  :: .  .::.:: :.:..:: :  ::. :.::.::::.:::
CCDS92 KECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECG
       270       280       290       300       310       320       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KSD KGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFS
       :.:.  .::: ::  ::: : : ::.: :.:.::: ::.:::::::::::.: ::::.: 
CCDS92 KSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFR
       330       340       350       360       370       380       

            400       410       420       430       440       450  
pF1KSD HCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSN
       . . :  :::.:.  .::::.::::..:: .::: :.::::: ::.::..::: :::::.
CCDS92 QSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSH
       390       400       410       420       430       440       

            460       470       480       490       500       510  
pF1KSD FAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRH
       . .::: : :.:::.: .:::.: .::::: ::: ::::::..: .:::.:  ...::.:
CCDS92 LYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKH
       450       460       470       480       490       500       

            520                                                    
pF1KSD QRVHTEEQP                                                   
       ::.:. :.                                                    
CCDS92 QRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNH
       510       520       530       540       550       560       

>>CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19           (528 aa)
 initn: 6196 init1: 1007 opt: 1492  Z-score: 888.5  bits: 174.1 E(32554): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 1492; 46.2% identity (71.8% similar) in 489 aa overlap (47-521:6-480)

         20        30        40        50        60            70  
pF1KSD QDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRD----VMLE
                                     :.:::..:. :::  :: :::.    ::::
CCDS42                          MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLE
                                        10        20        30     

             80        90        100       110       120       130 
pF1KSD NYRNLVSLWLPVSKPESHN-LENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKA
       :: ::: : . ::::.  . ::.:..:: ..:       ..: ..:.   :  .::.   
CCDS42 NYSNLVFLGITVSKPDLITCLEQGRKPLTMKR-------NEMIAKPSVMCSHFAQDLWPE
          40        50        60               70        80        

                140       150       160       170       180        
pF1KSD ESCKVA---IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNSLSEETD
       .: : .   .. :  ..  .: ::.    : .  : .      : .: ....:.    : 
CCDS42 QSMKDSFQKVVLRRYEKCEHD-NLQLKKGCISVDECKV-----H-KEGYNELNQCLTTTP
       90       100        110       120             130       140 

      190          200       210       220         230       240   
pF1KSD HK---HDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLE--KSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPH
       .:    : : : ..:      . :   :.  :. .:  :..:: :.:  ... .   ::.
CCDS42 RKICQCDKYVKVLHQFPNSNGQKRGHTGKKPFKYIECGKAFKQFSTLTTHKKIHTGGKPY
             150       160       170       180       190       200 

           250       260       270       280       290        300  
pF1KSD KCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSE
       ::..::. :..   : ::...::::::: :.::::.:.: ..:: :.:.:: .  ..:..
CCDS42 KCEECGKAFNHSCSLTRHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKHSSTLTTHKRNHTGEKPYKCDK
             210       220       230       240       250       260 

            310       320       330       340       350       360  
pF1KSD CKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKA
       : :.:  ::.:. :. ::. ..::.:.::::.::::. :. :..:::: :::.:.:::::
CCDS42 CGKAFMSSSTLSKHEIIHTEKKPYKCEECGKAFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECDKA
             270       280       290       300       310       320 

            370       380       390       400       410       420  
pF1KSD FIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQS
       : .: .:  :.: :: .:::::.::::::.. :.:: :.:.:::::::.: ::::.:..:
CCDS42 FKYSYTLTTHKRIHTEDKPYKCEECGKAFKYSSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKRS
             330       340       350       360       370       380 

            430       440       450       460       470       480  
pF1KSD THLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALI
       . :. :. ::::::::.:.::::.:. :::.. :..:: :..:::: :::::: .:: : 
CCDS42 SDLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKYSSNLTTHKKIHTGERPYKCEECGKAFNQSSILT
             390       400       410       420       430       440 

            490       500       510       520                      
pF1KSD QHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP                     
        :.: ::::: ..:.::::.:::::.:  :...:: :.:                     
CCDS42 THRRIHTGEKFYKCEECGKAFKCSSNLTTHKKIHTGERPYKCEECGKAFNQSSILTTHER
             450       460       470       480       490       500 

CCDS42 IILERNSTNVKNVAKPSSGPHTLLHIR
             510       520        

>>CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19           (535 aa)
 initn: 6398 init1: 1055 opt: 1491  Z-score: 887.9  bits: 174.0 E(32554): 3.9e-43
Smith-Waterman score: 1491; 45.7% identity (72.0% similar) in 497 aa overlap (39-521:21-510)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD PEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR-
                                     :  :  .::.:::..:.  ::  :::::: 
CCDS12           MLCDEKAQKRRKRKAKESGMALPQGHLTFRDVAIEFSQAEWKCLDPAQRA
                         10        20        30        40        50

           70        80        90       100       110       120    
pF1KSD ---DVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTS
          :::::::::::::   .: :.  :...  :    .:. : :. :...   .:     
CCDS12 LYKDVMLENYRNLVSL--GISLPDL-NINSMLE----QRREPWSGESEVKIAKNSDGREC
               60          70         80            90       100   

          130         140       150       160       170       180  
pF1KSD VQDFSKAESCKVA--IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNS
       ..  . . :  ..    :.  ....  :      : : . ...  :   .......: .:
CCDS12 IKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCNQVENFINHSSS
           110       120       130       140       150       160   

                190        200       210         220       230     
pF1KSD LS--EETDH--KHDVYWKS-FNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
       .:  .: .   :  .. .. :...: :  :..:   .  :  .   : .. .:.: :.: 
CCDS12 VSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVFRVSSSLTKHQV
           170       180       190       200       210       220   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTR
        .  .::.:::.::..:. .: : .: :.::::::: :: ::: ::. .:...::: :::
CCDS12 IHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNSNFARHQRIHTR
           230       240       250       260       270       280   

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD IL-FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
          .::.:: :.:...: :: :::::. :.::.::::::::.... :..:  :.:: :::
CCDS12 EKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLANHWRIYTGEKPY
           290       300       310       320       330       340   

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
       .:.:: ::: . . :..::. :::::::::.::::.: . : :..: :.:::::::.:.:
CCDS12 KCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRIHTGEKPYKCNE
           350       360       370       380       390       400   

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
       :::.:.: ..:..:.:::::::::.::::::.::. :... :  :: :.:::::::::::
CCDS12 CGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGEKPYKCSECGKA
           410       420       430       440       450       460   

          480       490       500       510       520              
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP             
       : :. .: .::: ::::.:..:::::: :.  . : ::...:: :.:             
CCDS12 FRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYKCNECGKAFSRI
           470       480       490       500       510       520   

CCDS12 SYLAQHWTIHMG
           530     

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 872.9  bits: 171.4 E(32554): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 1504; 46.9% identity (72.0% similar) in 482 aa overlap (70-521:1-479)

      40        50        60        70        80          90       
pF1KSD RSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-ENGK
                                     ::...: :::.  :::  ::.  .: :.  
CCDS74                               MLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLEQEA
                                             10          20        

        100       110       120       130       140            150 
pF1KSD EPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVY-----DSN
       :   .: . :.. : :.::::. : :.  : .:.  : .: ...:.  ....     :..
CCDS74 ELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTE
       30        40        50        60        70        80        

             160                 170       180       190           
pF1KSD LEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDHKHDV-------Y
        .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::. .  :.  .        
CCDS74 GHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHT
       90        100       110       120       130       140       

          200           210       220       230       240       250
pF1KSD WKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGE
       : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :....::.  ..:..:..: .
CCDS74 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
       150       160       170       180       190       200       

              260       270       280       290        300         
pF1KSD LFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTE
        :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: .  .::::: :.:. 
CCDS74 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
       210       220       230       240       250       260       

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD SSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSAL
        ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :::.:.:: ::: :::.:
CCDS74 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
       270       280       290       300       310       320       

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD IKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQ
        :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.::::.::::: :..:.
CCDS74 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
       330       340       350       360       370       380       

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD RIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHT
       ::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::: .:. : :::: ::
CCDS74 RIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHT
       390       400       410       420       430       440       

     490       500       510       520                             
pF1KSD GEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP                            
       ::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:                            
CCDS74 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
       450       460       470       480       490       500       

CCDS74 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
       510       520       530       540       550       560       

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 442.9  bits: 91.8 E(32554): 2.4e-18
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:480-616)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
CCDS74 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
     450       460       470       480       490       500         

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
CCDS74 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
     510       520       530       540       550       560         

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
CCDS74 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
     570       580       590       600       610                   

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 872.6  bits: 171.4 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 1569; 47.5% identity (71.9% similar) in 499 aa overlap (57-521:26-521)

         30        40        50        60            70        80  
pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
                                     ::::.: ::::    ::::...: :::.  
CCDS74      MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGH
                    10        20        30        40        50     

               90        100       110       120       130         
pF1KSD WLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAII
       :::  ::.  .: :.  :   .: . :.. : :.::::. : :.  : .:.  : .: ..
CCDS74 WLP--KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
            60        70        80        90       100       110   

     140            150       160                 170       180    
pF1KSD DRLTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLS
       .:.  ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::.
CCDS74 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
           120       130        140       150       160       170  

          190              200           210       220       230   
pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
        .  :.  .        : . ...      .. .  : .  :  .   :.....: :...
CCDS74 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
            180       190       200       210       220       230  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD QRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTH
       .::.  ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::
CCDS74 HRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
            240       250       260       270       280       290  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
       : .  .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :
CCDS74 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
            300       310       320       330       340       350  

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD PYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYEC
       ::.:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::
CCDS74 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
            360       370       380       390       400       410  

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
       .::::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::
CCDS74 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
            420       430       440       450       460       470  

            480       490       500       510       520            
pF1KSD KAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP           
       ::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:           
CCDS74 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
            480       490       500       510       520       530  

CCDS74 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
            540       550       560       570       580       590  

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 442.6  bits: 91.9 E(32554): 2.5e-18
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:522-658)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
CCDS74 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
             500       510       520       530       540       550 

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
CCDS74 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
             560       570       580       590       600       610 

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pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
CCDS74 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
             620       630       640       650                     

         480       490       500       510       520 
pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP

>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466  Z-score: 872.5  bits: 171.4 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 1496; 46.7% identity (70.6% similar) in 497 aa overlap (67-521:40-533)

         40        50        60        70        80          90    
pF1KSD LTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-E
                                     :::::...: :::.  :::  ::.  .: :
CCDS12 DPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLE
      10        20        30        40        50          60       

           100       110                   120       130       140 
pF1KSD NGKEPLKLERKAPKSSY------------SDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDR
       .  :   .: . :.. :            ::.::::. : :.  : .:.  : .: ...:
CCDS12 QEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVER
        70        80        90       100       110       120       

                  150       160                 170       180      
pF1KSD LTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEE
       .  ....     :.. .    ::. ::.          .    :.  :. : .  ::. .
CCDS12 FLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPD
       130       140       150        160       170       180      

        190                200         210       220       230     
pF1KSD TDHK---------HDVYWKSFNQKSVLITEDR--VPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
         :.         :    ..  .:  : . ..  : .  :  .   :.....: :....:
CCDS12 LPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHR
        190       200       210       220       230       240      

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-
       :.  ..:..:..: . :   :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: 
CCDS12 THTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTG
        250       260       270       280       290       300      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
       .  .::::: :.:.  ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.::  :::: :::
CCDS12 EKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
        310       320       330       340       350       360      

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
       .:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.:
CCDS12 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
        370       380       390       400       410       420      

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
       :::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::
CCDS12 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
        430       440       450       460       470       480      

          480       490       500       510       520              
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP             
       : .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:             
CCDS12 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
        490       500       510       520       530       540      

CCDS12 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
        550       560       570       580       590       600      

>--
 initn: 1260 init1: 720 opt: 720  Z-score: 442.5  bits: 91.9 E(32554): 2.5e-18
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:534-670)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
                                     ::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
CCDS12 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
           510       520       530       540       550       560   

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
       ::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
CCDS12 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
           570       580       590       600       610       620   

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
       ::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :             
CCDS12 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG             
           630       640       650       660       670             

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pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP




521 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 07:34:58 2016 done: Thu Nov  3 07:34:58 2016
 Total Scan time:  3.240 Total Display time:  0.130

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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