seq1 = pF1KSDA1874.tfa, 1563 bp seq2 = pF1KSDA1874/gi568815581r_18561940.tfa (gi568815581r:18561940_18780828), 218889 bp >pF1KSDA1874 1563 >gi568815581r:18561940_18780828 (Chr17) (complement) 1-37 (99178-99214) 100% -> 38-127 (100000-100089) 98% == 330-1563 (117656-118889) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGACAGATTTGGCTGAAATGCCTGAGAAAGGAG CTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> ||| 99178 ATGGAGACAGATTTGGCTGAAATGCCTGAGAAAGGAGGTG...TAGTTCT 50 . : . : . : . : . : 42 GTCTTCCCAGGATTCTCCCCATTTCCAAGAGAAGAGCACAGAAGAGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100004 GTCTTCCCAGGATTCTCCCCATTTCCAAGAGAAGAGCACAGAAGAGGGAG 100 . : . : . : . 92 AAGTGGCTGCTCTGCGCCTCACGGCCAGATCCCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100054 AAGTGGCTGCTCTGCGCCTCACGGCCAGATCCCAGG 0 . : . : . : . : . : 330 TTCAGACATGGAGACTAGACCACAGAGCAAGGATTCAACTTCAGTGCAAG ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117656 TTCAGACGTGGAGACTAGACCACAGAGCAAGGATTCAACTTCAGTGCAAG 50 . : . : . : . : . : 380 ATTTTTCCAAAGCAGAATCATGCAAAGTTGCAATAATAGACAGACTGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117706 ATTTTTCCAAAGCAGAATCATGCAAAGTTGCAATAATAGACAGACTGACA 100 . : . : . : . : . : 430 CGGAATAGTGTCTATGACTCTAACTTGGAAGCAGCCCTTGAATGTGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117756 CGGAATAGTGTCTATGACTCTAACTTGGAAGCAGCCCTTGAATGTGAAAA 150 . : . : . : . : . : 480 TTGGTTAGAGAATCAGCAAGGAAATCAGGAGAGACATTTGAGAGAAATGT |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117806 TTGGTTAGAGAAGCAGCAAGGAAATCAGGAGAGACATTTGAGAGAAATGT 200 . : . : . : . : . : 530 TCACTCACATGAATTCACTCTCTGAGGAAACAGACCATAAGCATGATGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 117856 TCACTCACATGAATTCACTCTCTGAGGAAACAGACCATGAGCATGATGTA 250 . : . : . : . : . : 580 TACTGGAAAAGCTTCAATCAGAAATCTGTCCTTATCACTGAAGACAGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117906 TACTGGAAAAGCTTCAATCAGAAATCTGTCCTTATCACTGAAGACAGAGT 300 . : . : . : . : . : 630 TCCCAAAGGATCTTATGCCTTCCATACACTTGAAAAAAGCTTGAAACAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117956 TCCCAAAGGATCTTATGCCTTCCATACACTTGAAAAAAGCTTGAAACAAA 350 . : . : . : . : . : 680 AATCAAACTTAATGAAAAAGCAGAGAACTTATAAAGAGAAAAAACCTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118006 AATCAAACTTAATGAAAAAGCAGAGAACTTATAAAGAGAAAAAACCTCAT 400 . : . : . : . : . : 730 AAATGTAATGATTGTGGTGAACTCTTCACCTACCATTCAGTGCTTATTCG ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| 118056 AAATGTAATGATTGTGGTGAACTCTTCACCTGCCATTCAGTGCATATTCA 450 . : . : . : . : . : 780 ACACCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCCTATACCTGCAATGAATGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118106 ACACCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCCTATACCTGCAATGAATGTG 500 . : . : . : . : . : 830 GGAAATCTTTTAGCCACAGAGCTAATTTAACTAAACACCAGAGAACTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118156 GGAAATCTTTTAGCCACAGAGCTAATTTAACTAAACACCAGAGAACTCAT 550 . : . : . : . : . : 880 ACTAGAATTCTCTTTGAATGCAGTGAATGCAAGAAAACCTTCACAGAAAG ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| 118206 ACTAGAATTCTCTTTGAATGCCGTGAATGTAAGAAAACCTTCACAGAAAG 600 . : . : . : . : . : 930 CTCATCCCTTGCAACACATCAGAGAATTCACGTTGGAGAGAGACCTTATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118256 CTCATCCCTTGCAACACATCAGAGAATTCACGTTGGAGAGAGACCTTATG 650 . : . : . : . : . : 980 AATGCAATGAATGTGGGAAAGGTTTTAATCGAAGTACACATCTTGTGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118306 AATGCAATGAATGTGGGAAAGGTTTTAATCGAAGTACACATCTTGTGCAG 700 . : . : . : . : . : 1030 CATCAGTTGATTCATACTGGAGTGAAGCCTTATGAATGTAATGAATGTGA ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 118356 CATCAGTTGATTCATACTGGAGTGAGGCCTTATGAATGTAATGAATGTGA 750 . : . : . : . : . : 1080 TAAAGCTTTTATTCATTCATCAGCACTCATTAAACATCAAAGAACTCATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118406 TAAAGCTTTTATTCATTCATCAGCACTCATTAAACATCAAAGAACTCATA 800 . : . : . : . : . : 1130 CTGGAGAGAAACCTTATAAATGTCAAGAATGTGGGAAAGCCTTTAGCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118456 CTGGAGAGAAACCTTATAAATGTCAAGAATGTGGGAAAGCCTTTAGCCAT 850 . : . : . : . : . : 1180 TGCTCATCCCTAACTAAGCATCAGAGAGTTCATACTGGAGAAAAGCCATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118506 TGCTCATCCCTAACTAAGCATCAGAGAGTTCATACTGGAGAAAAGCCATA 900 . : . : . : . : . : 1230 TGAATGCAGTGAATGTGGAAAAACTTTTAGTCAGAGCACACATCTTGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118556 TGAATGCAGTGAATGTGGAAAAACTTTTAGTCAGAGCACACATCTTGTTC 950 . : . : . : . : . : 1280 AACATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAATGAATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 118606 AACATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAGTGAATGT 1000 . : . : . : . : . : 1330 GGGAAAACCTTCAGCCGGAGCTCCAATTTTGCTAAACATCAAAGAATTCA |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 118656 GGGAAAACCTTCAGCCAGAGCTCCAATTTTGCTAAACATCAAAGAATTCA 1050 . : . : . : . : . : 1380 TATTGGAAAGAAACCGTACAAATGTAGCGAGTGTGGAAAAGCCTTCATTC ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 118706 TATTGGAAAGAAACCGTACAAATGTAGTGAGTGTGGAAAAGCCTTCATTC 1100 . : . : . : . : . : 1430 ATTCATCAGCTCTTATTCAACATCAGAGAACTCATACCGGAGAGAAACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118756 ATTCATCAGCTCTTATTCAACATCAGAGAACTCATACCGGAGAGAAACCC 1150 . : . : . : . : . : 1480 TTTAGATGTAATGAGTGTGGGAAAAGCTTTAAGTGCAGTTCATCTCTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118806 TTTAGATGTAATGAGTGTGGGAAAAGCTTTAAGTGCAGTTCATCTCTCAT 1200 . : . : . : 1530 CAGACATCAAAGAGTTCACACTGAAGAGCAACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||| 118856 CAGACATCAAAGAGTTCACACTGAAGAGCAACCC