Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1872
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1872, 371 aa
  1>>>pF1KSDA1872 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6340+/-0.000761; mu= 15.1874+/- 0.046
 mean_var=74.2049+/-14.603, 0's: 0 Z-trim(108.8): 20  B-trim: 7 in 1/52
 Lambda= 0.148887
 statistics sampled from 10401 (10420) to 10401 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.32), width:  16
 Scan time:  2.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19        ( 371) 2476 541.0 6.4e-154
CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9       ( 353) 1004 224.8 9.3e-59
CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9       (3088) 1012 227.0 1.7e-58
CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15          ( 376)  974 218.3 8.5e-57
CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15          ( 435)  974 218.4 9.6e-57
CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1          ( 357)  969 217.3 1.7e-56
CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9       (3062)  976 219.3 3.7e-56
CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1        ( 275)  845 190.6 1.4e-48
CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22      ( 305)  348 83.8 2.1e-16
CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11         ( 439)  349 84.1 2.5e-16
CCDS14060.2 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22      ( 433)  348 83.9 2.9e-16
CCDS54538.2 ARHGAP8 gene_id:553158|Hs108|chr22     ( 564)  348 84.0 3.6e-16


>>CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19             (371 aa)
 initn: 2476 init1: 2476 opt: 2476  Z-score: 2876.9  bits: 541.0 E(32554): 6.4e-154
Smith-Waterman score: 2476; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWED
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSA
              310       320       330       340       350       360

              370 
pF1KSD LVSEDQETSMS
       :::::::::::
CCDS45 LVSEDQETSMS
              370 

>>CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9            (353 aa)
 initn: 1249 init1: 962 opt: 1004  Z-score: 1168.4  bits: 224.8 E(32554): 9.3e-59
Smith-Waterman score: 1275; 61.6% identity (82.5% similar) in 315 aa overlap (22-336:27-328)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNG
                                 ::.   .: : :: :  : ..    :::.:..: 
CCDS83 MLKSCSRASFSPSVRKPPLILRRLLSEDVGMDIPFEEGV-LSPSAADMRPEPPNSLDLND
               10        20        30         40        50         

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD AHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNE
       .: .:  :.::.::.::::::::.:::: ::.::..:::::...::::.::.:. :.   
CCDS83 THPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTGH---
      60        70        80        90       100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD LEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYM
          ::  :  ::..  :. .. . . :.:.    : ::::::.:::::.:::...:.:: 
CCDS83 ---ED--P--TANKDSGQESESIPEYTAEEEREDN-RLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYR
               120       130       140        150       160        

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD KVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYL
       .:..::::::.:::::::::::::::::  ::::.::::::::::.:::.::::::::::
CCDS83 RVISHGGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYL
      170       180       190       200       210       220        

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD NGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINK
       :::::::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::.::..::::: :: .:
CCDS83 NGATPRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSK
      230       240       250       260       270       280        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD IQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPV
       :.::.:: .:  ::::. ..::. ... .:: :.   :.:.                   
CCDS83 IKYVNSLSELSGLIPMDCIHIPESIIKLDEE-LREASEAAKTSCLYNDPEMSSMEKDIDL
      290       300       310        320       330       340       

         360       370 
pF1KSD ENRSALVSEDQETSMS
                       
CCDS83 KLKEKP          
       350             

>>CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9            (3088 aa)
 initn: 1286 init1: 962 opt: 1012  Z-score: 1163.5  bits: 227.0 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1268; 61.0% identity (81.9% similar) in 315 aa overlap (22-336:2763-3063)

                        10        20        30        40        50 
pF1KSD          MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTL
                                     ::.   .: : :: :  : ..    :::.:
CCDS47 KNMIPDTEMEEETEFLELGTRISRPNGLLSEDVGMDIPFEEGV-LSPSAADMRPEPPNSL
           2740      2750      2760      2770       2780      2790 

              60        70        80        90       100       110 
pF1KSD NFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLG
       ..: .: .:  :.::.::.::::::::.:::: ::.::..:::::...::::.::.:. :
CCDS47 DLNDTHPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTG
            2800      2810      2820      2830      2840      2850 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KSD NGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMI
       .          :  ::..  :. .. . . :.:.    : ::::::.:::::.:::...:
CCDS47 HD---------P--TANKDSGQESESIPEYTAEEEREDN-RLWRTVVIGEQEQRIDMKVI
                       2860      2870       2880      2890         

             180       190       200       210       220       230 
pF1KSD RPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYM
       .:: .:..::::::.:::::::::::::::::  ::::.::::::::::.:::.::::::
CCDS47 EPYRRVISHGGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYM
    2900      2910      2920      2930      2940      2950         

             240       250       260       270       280       290 
pF1KSD IVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVK
       :::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::.::..::::: :
CCDS47 IVYLNGATPRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSK
    2960      2970      2980      2990      3000      3010         

             300       310       320       330       340       350 
pF1KSD FINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPE
       : .::.::.:: .:  ::::. ..::. ... .:: :.   :.:.               
CCDS47 FSSKIKYVNSLSELSGLIPMDCIHIPESIIKLDEE-LREASEAAKTSCLYNDPEMSSMEK
    3020      3030      3040      3050       3060      3070        

             360       370 
pF1KSD VAPVENRSALVSEDQETSMS
                           
CCDS47 DIDLKLKEKP          
     3080                  

>>CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15               (376 aa)
 initn: 1191 init1: 886 opt: 974  Z-score: 1133.2  bits: 218.3 E(32554): 8.5e-57
Smith-Waterman score: 1200; 53.8% identity (78.5% similar) in 340 aa overlap (5-340:58-375)

                                         10        20        30    
pF1KSD                           MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGV
                                     :. ::::.:..::::::::.: ::::. ..
CCDS81 YDQRPSWYRTKKLGLLDIGSLDYQEFVVDIESRLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSI
        30        40        50        60        70        80       

           40        50        60        70        80        90    
pF1KSD ELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDIN
       :     .    . :..:. :: .. :: :.::.:...:: :.::.:::: ::   ..:. 
CCDS81 EADILAITGPEDQPGSLEVNG-NKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL-
        90       100        110       120       130        140     

          100       110       120       130       140           150
pF1KSD VDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAA----N
        : ..::.:        :.::.::::: :       :  .....  :.  . .::    .
CCDS81 -DGLDTPSE--------NSNEFEWEDDLP------KP-KTTEVIRKGSITEYTAAEEKED
           150               160              170       180        

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD GRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYI
       :: ::   ::::.::.:.. :.:: ::..::::::.:::::.:::.::.:.:: :.:.:.
CCDS81 GRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYL
      190       200       210       220       230       240        

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD MENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLII
       :.::: :::..:::::::.:::::::::: ::.::..:::.::::.::::::::::::::
CCDS81 MDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLII
      250       260       270       280       290       300        

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD VHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKA
       :::::::::.::..::::: :: .::.:: .: .: .:.:::.: ::.:. : ..: :..
CCDS81 VHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQE-LNG
      310       320       330       340       350       360        

              340       350       360       370 
pF1KSD RRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
       ...  .:. :                               
CCDS81 KQD--EPKNEQ                              
       370                                      

>>CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15               (435 aa)
 initn: 1191 init1: 886 opt: 974  Z-score: 1132.2  bits: 218.4 E(32554): 9.6e-57
Smith-Waterman score: 1200; 53.8% identity (78.5% similar) in 340 aa overlap (5-340:117-434)

                                         10        20        30    
pF1KSD                           MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGV
                                     :. ::::.:..::::::::.: ::::. ..
CCDS10 PAWRGEEDEGAKASSGDIGSLDYQEFVVDIESRLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSI
         90       100       110       120       130       140      

           40        50        60        70        80        90    
pF1KSD ELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDIN
       :     .    . :..:. :: .. :: :.::.:...:: :.::.:::: ::   ..:. 
CCDS10 EADILAITGPEDQPGSLEVNG-NKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL-
        150       160        170       180       190        200    

          100       110       120       130       140           150
pF1KSD VDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAA----N
        : ..::.:        :.::.::::: :       :  .....  :.  . .::    .
CCDS10 -DGLDTPSE--------NSNEFEWEDDLP------KP-KTTEVIRKGSITEYTAAEEKED
            210               220              230       240       

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD GRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYI
       :: ::   ::::.::.:.. :.:: ::..::::::.:::::.:::.::.:.:: :.:.:.
CCDS10 GRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYL
       250       260       270       280       290       300       

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD MENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLII
       :.::: :::..:::::::.:::::::::: ::.::..:::.::::.::::::::::::::
CCDS10 MDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLII
       310       320       330       340       350       360       

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD VHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKA
       :::::::::.::..::::: :: .::.:: .: .: .:.:::.: ::.:. : ..: :..
CCDS10 VHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQE-LNG
       370       380       390       400       410       420       

              340       350       360       370 
pF1KSD RRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
       ...  .:. :                               
CCDS10 KQD--EPKNEQ                              
          430                                   

>>CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1               (357 aa)
 initn: 897 init1: 760 opt: 969  Z-score: 1127.7  bits: 217.3 E(32554): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 969; 42.9% identity (77.8% similar) in 329 aa overlap (6-326:26-350)

                                   10        20        30          
pF1KSD                     MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGV-ELLGS
                                :.::  ....:::::::..:: ::::.:. :   .
CCDS97 MGTIQEAGKKTDVGVREIAEAPELGAALRHGELELKEEWQDEEFPRLLPEEAGTSEDPED
               10        20        30        40        50        60

      40           50        60        70           80         90  
pF1KSD PVEDTSSP---PNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQ---SEGSLLSDDFLDTPD-DLD
       :  :...    :.:: . : .  :: : :::. .:: .   ..:.  ...  ..:: . :
CCDS97 PKGDSQAAAGTPSTLALCGQRPMRKRLSAPELRLSLTKGPGNDGASPTQSAPSSPDGSSD
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KSD INVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGR
       ...:..:::.....:.   .:.:.::::. : : . .  ...:. .: :   : .. .:.
CCDS97 LEIDELETPSDSEQLD---SGHEFEWEDELPRAEGLGT-SETAERLGRGCMWDVTGEDGH
              130          140       150        160       170      

            160       170       180       190       200       210  
pF1KSD LWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIME
        ::.  .: .:.:.:. .:.:: ::..::::.:.::::.:.::.:.:: ::.:.: :.::
CCDS97 HWRVFRMGPREQRVDMTVIEPYKKVLSHGGYHGDGLNAVILFASCYLPRSSIPNYTYVME
        180       190       200       210       220       230      

            220       230       240       250       260       270  
pF1KSD NLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVH
       .:: :....:::::::.:..:.:.:.: : ..: ..:...::. .::::::::..:..::
CCDS97 HLFRYMVGTLELLVAENYLLVHLSGGTSRAQVPPLSWIRQCYRTLDRRLRKNLRALVVVH
        240       250       260       270       280       290      

            280       290       300       310       320       330  
pF1KSD PSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARR
        .:.... ::. ::::: ::  ::... :: .: ::: ...:.::. : : ...      
CCDS97 ATWYVKAFLALLRPFISSKFTRKIRFLDSLGELAQLISLDQVHIPEAVRQLDRDLHGSGG
        300       310       320       330       340       350      

            340       350       360       370 
pF1KSD ESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
                                              
CCDS97 T                                      
                                              

>>CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9            (3062 aa)
 initn: 1269 init1: 788 opt: 976  Z-score: 1121.8  bits: 219.3 E(32554): 3.7e-56
Smith-Waterman score: 1232; 60.4% identity (81.2% similar) in 313 aa overlap (22-331:2763-3061)

                        10        20        30        40        50 
pF1KSD          MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTL
                                     ::.   .: : :: :  : ..    :::.:
CCDS78 KNMIPDTEMEEETEFLELGTRISRPNGLLSEDVGMDIPFEEGV-LSPSAADMRPEPPNSL
           2740      2750      2760      2770       2780      2790 

              60        70        80        90       100       110 
pF1KSD NFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLG
       ..: .: .:  :.::.::.::::::::.:::: ::.::..:::::...::::.::.:. :
CCDS78 DLNDTHPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTG
            2800      2810      2820      2830      2840      2850 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KSD NGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMI
       .          :  ::..  :. .. . . :.:.    : ::::::.:::::.:::...:
CCDS78 HD---------P--TANKDSGQESESIPEYTAEEEREDN-RLWRTVVIGEQEQRIDMKVI
                       2860      2870       2880      2890         

             180          190       200       210       220        
pF1KSD RPYMKVVTHGG---YYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAE
       .:: .:..:::   :::.:::::::::::::::::  ::::.::::::::::.:::.:::
CCDS78 EPYRRVISHGGDSGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAE
    2900      2910      2920      2930      2940      2950         

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD DYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFI
       ::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::.::..::::
CCDS78 DYMIVYLNGATPRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFI
    2960      2970      2980      2990      3000      3010         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD SVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEE
       : :: .::.::.:: .:  ::::. ..::. ... .  .:: .                 
CCDS78 SSKFSSKIKYVNSLSELSGLIPMDCIHIPESIINIDL-KLKEKP                
    3020      3030      3040      3050       3060                  

      350       360       370 
pF1KSD KPEVAPVENRSALVSEDQETSMS

>>CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1             (275 aa)
 initn: 796 init1: 739 opt: 845  Z-score: 985.5  bits: 190.6 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 845; 43.2% identity (79.7% similar) in 271 aa overlap (60-326:2-268)

      30        40        50        60        70           80      
pF1KSD EETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQ---SEGSLLSDDFLD
                                     :: : :::. .:: .   ..:.  ...  .
CCDS53                              MRKRLSAPELRLSLTKGPGNDGASPTQSAPS
                                            10        20        30 

          90       100       110       120       130       140     
pF1KSD TPD-DLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTED
       .:: . :...:..:::.....:.   .:.:.::::. : : . .  ...:. .: :   :
CCDS53 SPDGSSDLEIDELETPSDSEQLD---SGHEFEWEDELPRAEGLGT-SETAERLGRGCMWD
              40        50           60        70         80       

         150       160       170       180       190       200     
pF1KSD GSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLP
        .. .:. ::.  .: .:.:.:. .:.:: ::..::::.:.::::.:.::.:.:: ::.:
CCDS53 VTGEDGHHWRVFRMGPREQRVDMTVIEPYKKVLSHGGYHGDGLNAVILFASCYLPRSSIP
        90       100       110       120       130       140       

         210       220       230       240       250       260     
pF1KSD DYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNL
       .: :.::.:: :....:::::::.:..:.:.:.: : ..: ..:...::. .::::::::
CCDS53 NYTYVMEHLFRYMVGTLELLVAENYLLVHLSGGTSRAQVPPLSWIRQCYRTLDRRLRKNL
       150       160       170       180       190       200       

         270       280       290       300       310       320     
pF1KSD KSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEE
       ..:..:: .:.... ::. ::::: ::  ::... :: .: ::: ...:.::. : : ..
CCDS53 RALVVVHATWYVKAFLALLRPFISSKFTRKIRFLDSLGELAQLISLDQVHIPEAVRQLDR
       210       220       230       240       250       260       

         330       340       350       360       370 
pF1KSD ERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
       .                                             
CCDS53 DLHGSGGT                                      
       270                                           

>>CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22           (305 aa)
 initn: 280 init1: 280 opt: 348  Z-score: 407.8  bits: 83.8 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 348; 32.4% identity (62.6% similar) in 182 aa overlap (173-350:13-189)

            150       160       170       180       190            
pF1KSD TEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNA----IIVFAACF
                                     :.. :. ::     : .     ...:. : 
CCDS56                   MAGQDPALSTSHPFYDVARHGILQVAGDDRFGRRVVTFSCCR
                                 10        20        30        40  

      200       210       220       230       240       250        
pF1KSD LPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMID
       .: :   :.. ..:    :.  .:.  : .:: :::.. .   :  :..:::.. :. .:
CCDS56 MPPSHELDHQRLLE----YLKYTLDQYVENDYTIVYFHYGLNSRNKPSLGWLQSAYKEFD
             50            60        70        80        90        

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD RRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPD
       :. .::::.: .:::. ::...  : .:.:: :: .:. : . : .:.. . .... :: 
CCDS56 RKYKKNLKALYVVHPTSFIKVLWNILKPLISHKFGKKVIYFNYLSELHEHLKYDQLVIPP
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        ::.:.: .:.. .:.  : :  . :     :                            
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