Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1830
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1830, 454 aa
  1>>>pF1KSDA1830 454 - 454 aa - 454 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7356+/-0.000985; mu= 15.5459+/- 0.059
 mean_var=68.4545+/-13.610, 0's: 0 Z-trim(103.6): 36  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.155015
 statistics sampled from 7436 (7472) to 7436 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  2.660

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32840.1 TMX3 gene_id:54495|Hs108|chr18         ( 454) 3012 682.9 1.8e-196
CCDS11787.1 P4HB gene_id:5034|Hs108|chr17          ( 508)  320 80.9 3.4e-15
CCDS5893.1 PDIA4 gene_id:9601|Hs108|chr7           ( 645)  303 77.1 5.9e-14
CCDS10101.1 PDIA3 gene_id:2923|Hs108|chr15         ( 505)  299 76.2 8.8e-14
CCDS62852.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2         ( 437)  282 72.3 1.1e-12
CCDS1675.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2          ( 440)  282 72.3 1.1e-12
CCDS62853.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2         ( 445)  282 72.3 1.1e-12
CCDS62855.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2         ( 488)  282 72.4 1.2e-12
CCDS62854.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2         ( 492)  282 72.4 1.2e-12


>>CCDS32840.1 TMX3 gene_id:54495|Hs108|chr18              (454 aa)
 initn: 3012 init1: 3012 opt: 3012  Z-score: 3640.7  bits: 682.9 E(32554): 1.8e-196
Smith-Waterman score: 3012; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (1-454:1-454)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDDIWLVDFYAPWCGHCKKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDDIWLVDFYAPWCGHCKKLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PIWNEVGLEMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PIWNEVGLEMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FSASEEVVPEYVTLKEMPAVLVFKDETYFVYDEYEDGDLSSWINRERFQNYLAMDGFLLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FSASEEVVPEYVTLKEMPAVLVFKDETYFVYDEYEDGDLSSWINRERFQNYLAMDGFLLY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ELGDTGKLVALAVIDEKNTSVEHTRLKSIIQEVARDYRDLFHRDFQFGHMDGNDYINTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELGDTGKLVALAVIDEKNTSVEHTRLKSIIQEVARDYRDLFHRDFQFGHMDGNDYINTLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD MDELTVPTVVVLNTSNQQYFLLDRQIKNVEDMVQFINNILDGTVEAQGGDSILQRLKRIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDELTVPTVVVLNTSNQQYFLLDRQIKNVEDMVQFINNILDGTVEAQGGDSILQRLKRIV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FDAKSTIVSIFKSSPLMGCFLFGLPLGVISIMCYGIYTADTDGGYIEERYEVSKSENENQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FDAKSTIVSIFKSSPLMGCFLFGLPLGVISIMCYGIYTADTDGGYIEERYEVSKSENENQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450    
pF1KSD EQIEESKEQQEPSSGGSVVPTVQEPKDVLEKKKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQIEESKEQQEPSSGGSVVPTVQEPKDVLEKKKD
              430       440       450    

>>CCDS11787.1 P4HB gene_id:5034|Hs108|chr17               (508 aa)
 initn: 288 init1: 249 opt: 320  Z-score: 386.3  bits: 80.9 E(32554): 3.4e-15
Smith-Waterman score: 320; 31.3% identity (63.6% similar) in 195 aa overlap (45-232:45-229)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KSD TVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGLEMKSIG
                                     ::.:::::::::: : : . ... ..:. :
CCDS11 VRADAPEEEDHVLVLRKSNFAEALAAHKYLLVEFYAPWCGHCKALAPEYAKAAGKLKAEG
           20        30        40        50        60        70    

           80        90       100        110         120       130 
pF1KSD SPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLK-GDLAY--NYRGPRTKDDIIEFAHRVSG
       : ....:.:::  :..:...:::::::::... :: :   .: . :  :::... .. .:
CCDS11 SEIRLAKVDATEESDLAQQYGVRGYPTIKFFRNGDTASPKEYTAGREADDIVNWLKKRTG
           80        90       100       110       120       130    

             140       150           160       170       180       
pF1KSD ALIRPLPSQQMFEHMQKRHRV----FFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYFFSASEEV
            ::.    : . .  .:    ::  :  ::   .....::  .    . .... .:
CCDS11 PAATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDV--ESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDV
          140       150       160         170       180       190  

       190       200       210       220       230       240       
pF1KSD VPEYVTLKEMPAVLVFKDETYFVYDEYEDGDLSSWINRERFQNYLAMDGFLLYELGDTGK
         .:   :.  .:..::      .:: .. .. . ...: . ...               
CCDS11 FSKYQLDKD--GVVLFKK-----FDEGRN-NFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQT
            200              210        220       230       240    

       250       260       270       280       290       300       
pF1KSD LVALAVIDEKNTSVEHTRLKSIIQEVARDYRDLFHRDFQFGHMDGNDYINTLLMDELTVP
                                                                   
CCDS11 APKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEF
          250       260       270       280       290       300    

>>CCDS5893.1 PDIA4 gene_id:9601|Hs108|chr7                (645 aa)
 initn: 301 init1: 301 opt: 303  Z-score: 364.1  bits: 77.1 E(32554): 5.9e-14
Smith-Waterman score: 352; 38.8% identity (66.9% similar) in 160 aa overlap (33-187:185-344)

             10        20        30        40         50        60 
pF1KSD AWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND-DIWLVDFYAPWCGHCKKLEP
                                     :.: :  :: :: ::.:::::::::::: :
CCDS58 RTQEEIVAKVREVSQPDWTPPPEVTLVLTKENFDEVVNDADIILVEFYAPWCGHCKKLAP
          160       170       180       190       200       210    

              70        80        90       100       110       120 
pF1KSD IWNEVGLEMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKDD
        ..... :... . :. ..:.:::. ...:..: : ::::.:...    :.: ::: :  
CCDS58 EYEKAAKELSKRSPPIPLAKVDATAETDLAKRFDVSGYPTLKIFRKGRPYDYNGPREKYG
          220       230       240       250       260       270    

             130        140       150        160        170        
pF1KSD IIEFAHRVSGALIRP-LPSQQMFEHMQKRHRVFFVYV-GGES-PLKEKYIDAASELIV-Y
       :...  . ::   .  :  .:. : ..    :... :  ::: :  ..: :::..:   :
CCDS58 IVDYMIEQSGPPSKEILTLKQVQEFLKDGDDVIIIGVFKGESDPAYQQYQDAANNLREDY
          280       290       300       310       320       330    

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD TYFFSASEEVVPEYVTLKEMPAVLVFKDETYFVYDEYEDGDLSSWINRERFQNYLAMDGF
        .  . : :.                                                  
CCDS58 KFHHTFSTEIAKFLKVSQGQLVVMQPEKFQSKYEPRSHMMDVQGSTQDSAIKDFVLKYAL
          340       350       360       370       380       390    

>--
 initn: 296 init1: 296 opt: 303  Z-score: 364.1  bits: 77.1 E(32554): 5.9e-14
Smith-Waterman score: 303; 43.5% identity (69.4% similar) in 108 aa overlap (32-138:69-176)

              10        20        30        40         50        60
pF1KSD AAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND-DIWLVDFYAPWCGHCKKLE
                                     : .: .   : :  :..::::::::::.. 
CCDS58 EDEEEEEEEDDDEEEDDLEVKEENGVLVLNDANFDNFVADKDTVLLEFYAPWCGHCKQFA
       40        50        60        70        80        90        

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PIWNEVGLEMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAYNYRGPRTKD
       : .....  .:.   :. :.:.:::: : .::.: : ::::::.::   : .:.: ::..
CCDS58 PEYEKIANILKDKDPPIPVAKIDATSASVLASRFDVSGYPTIKILKKGQAVDYEGSRTQE
      100       110       120       130       140       150        

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYF
       .:.  ...::     : :                                          
CCDS58 EIVAKVREVSQPDWTPPPEVTLVLTKENFDEVVNDADIILVEFYAPWCGHCKKLAPEYEK
      160       170       180       190       200       210        

>>CCDS10101.1 PDIA3 gene_id:2923|Hs108|chr15              (505 aa)
 initn: 229 init1: 134 opt: 299  Z-score: 360.9  bits: 76.2 E(32554): 8.8e-14
Smith-Waterman score: 339; 24.7% identity (59.3% similar) in 344 aa overlap (28-345:28-362)

               10        20        30        40             50     
pF1KSD MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDD-----IWLVDFYAPWCGH
                                  .:  :..: :.: .:     . ::.:.::::::
CCDS10 MRLRRLALFPGVALLLAAARLAAASDVLELTDDNF-ESRISDTGSAGLMLVEFFAPWCGH
               10        20        30         40        50         

          60        70        80        90       100        110    
pF1KSD CKKLEPIWNEVGLEMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLK-GDLAYNYR
       ::.: : .. .. ..:.:   : ..:.: :. ..  ...:: ::::.:... :. :  : 
CCDS10 CKRLAPEYEAAATRLKGI---VPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYD
      60        70           80        90       100       110      

          120       130       140         150       160       170  
pF1KSD GPRTKDDIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHM--QKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAAS
       :::: : :.   .. .:    :: ... :...  .:   .   .  . :  . ... :::
CCDS10 GPRTADGIVSHLKKQAGPASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAAS
        120       130       140       150       160       170      

             180       190            200          210       220   
pF1KSD ELI-VYTYFFSASEEVVPEYVTLKE-----MPAVLV--FKDETY-FVYDEYEDGDLSSWI
       .:   : .  .  : .: ::    :      :. :.  :.:.:  .. ... .: ....:
CCDS10 NLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFI
        180       190       200       210       220       230      

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD NRERFQ--NYLAMDGFLLYELGDTGKLVALAVIDEKNTSVEHTRLKSIIQEVARDYRDLF
       ... :    ... :.  : .  :   :.:   .: ....   .  .. .. ::. . :  
CCDS10 QENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDL--LIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAG
        240       250       260         270       280       290    

                    290       300       310       320       330    
pF1KSD HR-DFQ------FGHMDGNDYINTLLMDELTVPTVVVLNTSNQQYFLLDRQIKNVEDMVQ
       :. .:       :.: . .:.   :      .:.:.. ....... . ..  .. . . .
CCDS10 HKLNFAVASRKTFSH-ELSDF--GLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALER
          300        310         320       330       340       350 

          340       350       360       370       380       390    
pF1KSD FINNILDGTVEAQGGDSILQRLKRIVFDAKSTIVSIFKSSPLMGCFLFGLPLGVISIMCY
       :... .::...                                                 
CCDS10 FLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNNENKDVLIEFYAPWCGHCKN
             360       370       380       390       400       410 

>>CCDS62852.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2              (437 aa)
 initn: 428 init1: 159 opt: 282  Z-score: 341.4  bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 329; 46.2% identity (72.6% similar) in 106 aa overlap (25-126:157-262)

                     10        20        30        40          50  
pF1KSD       MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND--DIWLVDFYAPW
                                     :  .:  :.:: .:  :  :.:.:.:::::
CCDS62 ALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPW
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pF1KSD CGHCKKLEPIWNEVGLEMK-SIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLL-KGDLA
       :::::.::: :  .. :.: .  . ::.. .:::  . .::..:.::.::::.. ::.  
CCDS62 CGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESP
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pF1KSD YNYRGPRTKDDIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDA
        .: : ::..::.  :                                            
CCDS62 VDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTG
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>--
 initn: 276 init1: 159 opt: 282  Z-score: 341.4  bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 282; 38.4% identity (74.7% similar) in 99 aa overlap (39-135:38-133)

       10        20        30        40        50        60        
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CCDS62 CTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAAT
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pF1KSD EMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAY--NYRGPRTKDDIIEFA
        .:..   :::: .:: .. :.....::.:.::::.. ..     .:.: :: . :.. :
CCDS62 ALKDV---VKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAA
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pF1KSD HRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYFFSASEE
         .   :..                                                   
CCDS62 LSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYA
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>>CCDS1675.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2               (440 aa)
 initn: 428 init1: 159 opt: 282  Z-score: 341.3  bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 329; 46.2% identity (72.6% similar) in 106 aa overlap (25-126:160-265)

                     10        20        30        40          50  
pF1KSD       MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND--DIWLVDFYAPW
                                     :  .:  :.:: .:  :  :.:.:.:::::
CCDS16 ALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPW
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pF1KSD CGHCKKLEPIWNEVGLEMK-SIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLL-KGDLA
       :::::.::: :  .. :.: .  . ::.. .:::  . .::..:.::.::::.. ::.  
CCDS16 CGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESP
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pF1KSD YNYRGPRTKDDIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDA
        .: : ::..::.  :                                            
CCDS16 VDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTG
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>--
 initn: 276 init1: 159 opt: 282  Z-score: 341.3  bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 282; 38.4% identity (74.7% similar) in 99 aa overlap (39-135:41-136)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD ALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGL
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CCDS16 CTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAAT
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       70        80        90       100       110         120      
pF1KSD EMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAY--NYRGPRTKDDIIEFA
        .:..   :::: .:: .. :.....::.:.::::.. ..     .:.: :: . :.. :
CCDS16 ALKDV---VKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAA
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pF1KSD HRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYFFSASEE
         .   :..                                                   
CCDS16 LSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYA
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>>CCDS62853.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2              (445 aa)
 initn: 428 init1: 159 opt: 282  Z-score: 341.3  bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 329; 46.2% identity (72.6% similar) in 106 aa overlap (25-126:165-270)

                     10        20        30        40          50  
pF1KSD       MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND--DIWLVDFYAPW
                                     :  .:  :.:: .:  :  :.:.:.:::::
CCDS62 ALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPW
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pF1KSD CGHCKKLEPIWNEVGLEMK-SIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLL-KGDLA
       :::::.::: :  .. :.: .  . ::.. .:::  . .::..:.::.::::.. ::.  
CCDS62 CGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESP
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pF1KSD YNYRGPRTKDDIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDA
        .: : ::..::.  :                                            
CCDS62 VDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTG
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>--
 initn: 276 init1: 159 opt: 282  Z-score: 341.3  bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 282; 38.4% identity (74.7% similar) in 99 aa overlap (39-135:46-141)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD ALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGL
                                     ..:..:::.:::::::::..: : :.... 
CCDS62 CTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAAT
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       70        80        90       100       110         120      
pF1KSD EMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAY--NYRGPRTKDDIIEFA
        .:..   :::: .:: .. :.....::.:.::::.. ..     .:.: :: . :.. :
CCDS62 ALKDV---VKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAA
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pF1KSD HRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYFFSASEE
         .   :..                                                   
CCDS62 LSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYA
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>>CCDS62855.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2              (488 aa)
 initn: 428 init1: 159 opt: 282  Z-score: 340.6  bits: 72.4 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 329; 46.2% identity (72.6% similar) in 106 aa overlap (25-126:208-313)

                     10        20        30        40          50  
pF1KSD       MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND--DIWLVDFYAPW
                                     :  .:  :.:: .:  :  :.:.:.:::::
CCDS62 ALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYAPW
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       :::::.::: :  .. :.: .  . ::.. .:::  . .::..:.::.::::.. ::.  
CCDS62 CGHCKNLEPEWAAAASEVKEQTKGKVKLAAVDATVNQVLASRYGIRGFPTIKIFQKGESP
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pF1KSD YNYRGPRTKDDIIEFAHRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDA
        .: : ::..::.  :                                            
CCDS62 VDYDGGRTRSDIVSRALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKRTCEEHQLCVVAVLPHILDTG
       300       310       320       330       340       350       

>--
 initn: 269 init1: 159 opt: 282  Z-score: 340.6  bits: 72.4 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 282; 38.4% identity (74.7% similar) in 99 aa overlap (39-135:89-184)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD ALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRNDDIWLVDFYAPWCGHCKKLEPIWNEVGL
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CCDS62 CTFFLAVNGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDSLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAAT
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       70        80        90       100       110         120      
pF1KSD EMKSIGSPVKVGKMDATSYSSIASEFGVRGYPTIKLLKGDLAY--NYRGPRTKDDIIEFA
        .:..   :::: .:: .. :.....::.:.::::.. ..     .:.: :: . :.. :
CCDS62 ALKDV---VKVGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIKIFGSNKNRPEDYQGGRTGEAIVDAA
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pF1KSD HRVSGALIRPLPSQQMFEHMQKRHRVFFVYVGGESPLKEKYIDAASELIVYTYFFSASEE
         .   :..                                                   
CCDS62 LSALRQLVKDRLGGRSGGYSSGKQGRSDSSSKKDVIELTDDSFDKNVLDSEDVWMVEFYA
         180       190       200       210       220       230     

>>CCDS62854.1 PDIA6 gene_id:10130|Hs108|chr2              (492 aa)
 initn: 428 init1: 159 opt: 282  Z-score: 340.6  bits: 72.4 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 329; 46.2% identity (72.6% similar) in 106 aa overlap (25-126:212-317)

                     10        20        30        40          50  
pF1KSD       MAAWKSWTALRLCATVVVLDMVVCKGFVEDLDESFKENRND--DIWLVDFYAPW
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