Result of SIM4 for pF1KSDA1753

seq1 = pF1KSDA1753.tfa, 2430 bp
seq2 = pF1KSDA1753/gi568815581f_75684881.tfa (gi568815581f:75684881_75924414), 239534 bp

>pF1KSDA1753 2430
>gi568815581f:75684881_75924414 (Chr17)

1-104  (100001-100104)   100% ->
105-314  (124880-125089)   100% ->
315-491  (127232-127408)   100% ->
492-622  (127575-127705)   100% ->
623-758  (128198-128333)   100% ->
759-876  (128881-128998)   100% ->
877-961  (130289-130373)   100% ->
962-1104  (131890-132032)   99% ->
1105-1305  (132446-132646)   100% ->
1306-1371  (133223-133288)   100% ->
1372-1546  (133762-133936)   100% ->
1547-1648  (134804-134905)   100% ->
1649-1837  (135040-135228)   99% ->
1838-2019  (137597-137778)   100% ->
2020-2277  (138385-138642)   100% ->
2278-2430  (139382-139534)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAAGGGCCCCGGGCCCGGCGGCTCCGCAGCTTCCTCGGCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAAGGGCCCCGGGCCCGGCGGCTCCGCAGCTTCCTCGGCGCCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCTACCGCTCAGGTGCTGCAGGCACAGCCCGAGAAACCGCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGCTACCGCTCAGGTGCTGCAGGCACAGCCCGAGAAACCGCAGCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAC         GTACCTGAAAGAATTCCGCACAGAGCAGTGCCCACTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACACGTA...CAGGTACCTGAAAGAATTCCGCACAGAGCAGTGCCCACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGTGCAACACAAATGCACGCAGCATCGGCCCTACACCTGCTTCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124917 TTTGTGCAACACAAATGCACGCAGCATCGGCCCTACACCTGCTTCCACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCACTTCGTGAACCAGCGGCGCCGCCGGTCCATCCGCCGTCGGGACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124967 GCACTTCGTGAACCAGCGGCGCCGCCGGTCCATCCGCCGTCGGGACGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTTCAATTACAGCCCTGACGTCTACTGCACCAAGTACGACGAGGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125017 CCTTCAATTACAGCCCTGACGTCTACTGCACCAAGTACGACGAGGCTACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCCTCTGCCCGGAGGGCGACGA         GTGCCCATTCCTGCACAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 125067 GGCCTCTGCCCGGAGGGCGACGAGTG...CAGGTGCCCATTCCTGCACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACCACAGGGGACACTGAGCGCAGGTACCACCTTCGTTACTACAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127250 AACCACAGGGGACACTGAGCGCAGGTACCACCTTCGTTACTACAAAACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAATCTGCATCCACGAGACAGACTCGAAAGGCAACTGCACCAAAAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127300 GAATCTGCATCCACGAGACAGACTCGAAAGGCAACTGCACCAAAAACGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGCACTGCGCTTTTGCCCACGGGCCCCATGACCTCCGCTCCCCTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127350 CTGCACTGCGCTTTTGCCCACGGGCCCCATGACCTCCGCTCCCCTGTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGACATCAG         GGAGCTTCAGGCCATGGAGGCCTTGCAGAATG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 127400 CGACATCAGGTG...CAGGGAGCTTCAGGCCATGGAGGCCTTGCAGAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCAGACCACGGTAGAGGGGAGCATAGAGGGCCAGTCGGCTGGGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127607 GCCAGACCACGGTAGAGGGGAGCATAGAGGGCCAGTCGGCTGGGGCTGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCCATGCCATGATAGAAAAGATCCTCAGCGAGGAGCCTCGGTGGCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 127657 AGCCATGCCATGATAGAAAAGATCCTCAGCGAGGAGCCTCGGTGGCAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    623         AGACTGCTTATGTGCTGGGGAACTATAAGACGGAGCCTTGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127707 TA...CAGAGACTGCTTATGTGCTGGGGAACTATAAGACGGAGCCTTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAGCCCCCGCGGCTGTGCCGCCAAGGCTATGCCTGTCCCTACTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128240 AGAAGCCCCCGCGGCTGTGCCGCCAAGGCTATGCCTGTCCCTACTACCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AACAGCAAGGACCGGCGGCGGAGCCCCCGGAAGCACAAATACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 128290 AACAGCAAGGACCGGCGGCGGAGCCCCCGGAAGCACAAATACAGGTC...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    759    GTCGTCTCCATGTCCAAACGTCAAGCACGGGGATGAGTGGGGAGACC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128878 CAGGTCGTCTCCATGTCCAAACGTCAAGCACGGGGATGAGTGGGGAGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTGGCAAGTGTGAGAACGGAGACGCCTGCCAGTACTGCCACACCCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128928 CTGGCAAGTGTGAGAACGGAGACGCCTGCCAGTACTGCCACACCCGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAGCAGCAGTTCCACCCCGAG         ATCTACAAGTCCACCAAGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128978 GAGCAGCAGTTCCACCCCGAGGTG...CAGATCTACAAGTCCACCAAGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAACGACATGCAGCAGTCGGGCAGCTGTCCCCGAGGACCCTTCTGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130309 CAACGACATGCAGCAGTCGGGCAGCTGTCCCCGAGGACCCTTCTGCGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGCCCACGTAGAAC         AGCCACCCCTGAGTGACGACCTGCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 130359 TTGCCCACGTAGAACGTA...CAGAGCCACCCCTGAGTGACGACCTGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCTTCCTCAGCTGTGTCCAGCCCCACCCAGCCGGGTCCTGTCCTGTACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 131916 CCTTCCTCAGCTGTGTCCAGCCCCACCCAGCCAGGTCCTGTCCTGTACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCCATCTGCCGCCGGAGACTCGGTGCCTGTGAGCCCCTCCAGCCCGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131966 GCCATCTGCCGCCGGAGACTCGGTGCCTGTGAGCCCCTCCAGCCCGCATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCCCTGACCTCAGTGCC         CTCCTCTGTAGAAACAGCAGCCTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 132016 CCCCTGACCTCAGTGCCGTA...CAGCTCCTCTGTAGAAACAGCAGCCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGCAGCCCGTCTAACCTCTGCGGCTCCCCACCGGGCTCCATCAGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132470 GGCAGCCCGTCTAACCTCTGCGGCTCCCCACCGGGCTCCATCAGGAAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCCAAACCTGGAGGGCATCGTCTTCCCTGGGGAGTCTGGCCTGGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132520 CCCAAACCTGGAGGGCATCGTCTTCCCTGGGGAGTCTGGCCTGGCCCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCAGCTATAAGAAGGCTCCCGGCTTCGAGAGGGAAGACCAGGTGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132570 GCAGCTATAAGAAGGCTCCCGGCTTCGAGAGGGAAGACCAGGTGGGAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGTACCTGAAAAATTTCAAATGCCAG         GCCAAATTAAAACC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 132620 GAGTACCTGAAAAATTTCAAATGCCAGGTA...CAGGCCAAATTAAAACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCACTCATTAGAGCCCAGGAGTCAAGAGCAGCCTCTGCTTCAGCCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133237 CCACTCATTAGAGCCCAGGAGTCAAGAGCAGCCTCTGCTTCAGCCCAAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AG         GACATGCTGGGCATCCTCCCCGCAGGCAGCCCCCTGACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133287 AGGTA...CAGGACATGCTGGGCATCCTCCCCGCAGGCAGCCCCCTGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCAAGCATCTCTTCTAGTATCACCTCCAGCCTGGCAGCTACCCCCCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133801 TCAAGCATCTCTTCTAGTATCACCTCCAGCCTGGCAGCTACCCCCCCTAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CCCAGTGGGCACCAGCAGCGTCCCCGGCATGAATGCAAACGCTCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133851 CCCAGTGGGCACCAGCAGCGTCCCCGGCATGAATGCAAACGCTCTGCCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCTACCCCACCAGCGACACGGTAGAGTCAGTCATAG         AGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 133901 TCTACCCCACCAGCGACACGGTAGAGTCAGTCATAGGTA...TAGAGTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GCTTTGGATGACCTGGACCTGAATGAGTTTGGCGTGGCCGCCCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134809 GCTTTGGATGACCTGGACCTGAATGAGTTTGGCGTGGCCGCCCTGGAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GACTTTCGATAACAGCACAGTGCCCCACCCAGGAAGCATCACCATCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 134859 GACTTTCGATAACAGCACAGTGCCCCACCCAGGAAGCATCACCATCGGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1649       GCGGCAGCTTGCTGCAGAGCTCTGCGCCCGTGAACATCCCCGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 134909 ...CAGGCGGCAGCTTGCTGCAGAGCTCTGCACCCGTGAACATCCCCGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TCCTTGGGCAGCTCTGCCTCCTTCCACTCAGCATCCCCGTCCCCTCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135084 TCCTTGGGCAGCTCTGCCTCCTTCCACTCAGCATCCCCGTCCCCTCCCGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CAGCCTCTCCTCGCATTTCCTGCAGCAGCCCCAGGGCCACCTGAGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135134 CAGCCTCTCCTCGCATTTCCTGCAGCAGCCCCAGGGCCACCTGAGTCAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CGGAAAACACATTTTTGGGAACCTCAGCATCACATGGATCTTTGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 135184 CGGAAAACACATTTTTGGGAACCTCAGCATCACATGGATCTTTGGGTA..

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838     GTCTGAACGGGATGAACAGCAGCATCTGGGAGCATTTTGCCTCTGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135234 .CAGGTCTGAACGGGATGAACAGCAGCATCTGGGAGCATTTTGCCTCTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AAGCTTCTCCCCGGGCACTTCCCCCGCTTTCCTATCAGGGCCAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137643 AAGCTTCTCCCCGGGCACTTCCCCCGCTTTCCTATCAGGGCCAGGGGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCGAGCTGGCCCGACTTCGGCAAGAGCTGGATGAAGCCAACAGCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137693 CCGAGCTGGCCCGACTTCGGCAAGAGCTGGATGAAGCCAACAGCACCATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AAGCAGTGGGAGGAGTCCTGGAAGCAGGCCAAGCAG         GCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 137743 AAGCAGTGGGAGGAGTCCTGGAAGCAGGCCAAGCAGGTA...CAGGCTTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TGATGCCTGGAAGAAAGAGGCGGAGGAGGCTGGTGAGCGGGCCAGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138390 TGATGCCTGGAAGAAAGAGGCGGAGGAGGCTGGTGAGCGGGCCAGTGCGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CGGGCGCCGAGTGCGAGCTGGCCCGGGAGCAGCGGGATGCACTGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138440 CGGGCGCCGAGTGCGAGCTGGCCCGGGAGCAGCGGGATGCACTGGAGGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CAGGTGAAGAAGCTCCAGGAGGAGCTGGAGCGGCTACACGCGGGGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138490 CAGGTGAAGAAGCTCCAGGAGGAGCTGGAGCGGCTACACGCGGGGCCTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GCCCCAGGCCCTGCCCGCCTTCTCCGACCTGGAGGCGCTCTCACTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138540 GCCCCAGGCCCTGCCCGCCTTCTCCGACCTGGAGGCGCTCTCACTCTCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCCTCTACTCCCTCCAGAAACAACTGCGGGCCCACCTGGAACAAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138590 CCCTCTACTCCCTCCAGAAACAACTGCGGGCCCACCTGGAACAAGTGGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 AAG         GCCGTGTTCCACATGCAGTCGGTGAAATGCCTTAAGTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138640 AAGGTC...CAGGCCGTGTTCCACATGCAGTCGGTGAAATGCCTTAAGTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TCAGGAACAGAAGCGGGCAGTGCTGCCGTGCCAACACGCTGCGCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139420 TCAGGAACAGAAGCGGGCAGTGCTGCCGTGCCAACACGCTGCGCTGTGTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AGCTCTGCGCTGAGGGCAGCGAGTGCCCCATCTGCCAGCCTGGCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139470 AGCTCTGCGCTGAGGGCAGCGAGTGCCCCATCTGCCAGCCTGGCCGGGCC

   2550     .    :    .
   2416 CACACCCTCCAGTCG
        |||||||||||||||
 139520 CACACCCTCCAGTCG

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