Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1750
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1750, 417 aa
  1>>>pF1KSDA1750 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2945+/-0.000756; mu= 14.5198+/- 0.046
 mean_var=123.8200+/-24.855, 0's: 0 Z-trim(113.1): 29  B-trim: 217 in 2/50
 Lambda= 0.115260
 statistics sampled from 13725 (13750) to 13725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.422), width:  16
 Scan time:  3.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8        ( 417) 2807 477.5  1e-134
CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6         ( 414)  784 141.1 1.9e-33
CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6         ( 437)  784 141.1 1.9e-33
CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2       ( 410)  707 128.3 1.3e-29
CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX        ( 693)  672 122.7 1.1e-27
CCDS65365.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY    ( 308)  553 102.6 5.5e-22
CCDS48204.1 TSPY3 gene_id:728137|Hs108|chrY        ( 308)  553 102.6 5.5e-22
CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY        ( 314)  553 102.6 5.6e-22
CCDS35465.1 TSPY2 gene_id:64591|Hs108|chrY         ( 308)  552 102.4 6.1e-22
CCDS59533.1 TSPY8 gene_id:728403|Hs108|chrY        ( 308)  539 100.3 2.7e-21
CCDS48205.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY          ( 308)  538 100.1 3.1e-21
CCDS83519.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY    ( 294)  485 91.3 1.3e-18
CCDS76071.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY          ( 294)  470 88.8 7.6e-18
CCDS48037.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9            ( 290)  418 80.1   3e-15
CCDS59150.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9            ( 266)  397 76.6 3.2e-14
CCDS59149.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9            ( 268)  394 76.1 4.5e-14
CCDS6907.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9             ( 277)  394 76.1 4.6e-14
CCDS72821.1 SETSIP gene_id:646817|Hs108|chr1       ( 302)  390 75.5 7.8e-14


>>CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8             (417 aa)
 initn: 2807 init1: 2807 opt: 2807  Z-score: 2532.1  bits: 477.5 E(32554): 1e-134
Smith-Waterman score: 2807; 100.0% identity (100.0% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AGEEKKEERDAGSGPPATEGSMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGEEKKEERDAGSGPPATEGSMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLER
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       
pF1KSD ESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
              370       380       390       400       410       

>>CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6              (414 aa)
 initn: 1034 init1: 523 opt: 784  Z-score: 714.1  bits: 141.1 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 1008; 43.3% identity (67.2% similar) in 439 aa overlap (1-416:1-413)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
       ::: . : :   :.. : .        ::: :  ::: .: :.: :.:.:.::.:..: :
CCDS51 MSGLDGGNKLPLAQTGGLA--------APDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGG
               10                20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
       .::..:        : .: . :.::: :::. .::..: ::.. :   :   .. : : .
CCDS51 SLETVA--------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAAS
                     60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170          
pF1KSD VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKK--------GA
          .. .. .  ::. ..:. :::::.:: :.:...: : :.: : . :.        .:
CCDS51 ---AAEAADSSQKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISA
             110       120       130       140       150       160 

              180           190              200       210         
pF1KSD A--GENTSVSAGEEKK----EERDAG-----SGP--PATEGSMDTLENVQLKLENMNAQA
       :   :. . .: ::::    :.. ::     . :  :  .. ::.:: .. .: :.::::
CCDS51 AVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQA
             170       180       190       200       210       220 

     220       230       240       250       260       270         
pF1KSD DRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNS
       :::.:.: ::::..:  :..::. .::::::::  ::.:::::. ....:....: :. .
CCDS51 DRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMIN
             230       240       250       260       270       280 

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD LEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSL
       ::::::   : : :.:: :. ::::.:. :.:::    ::.::: ::::.:  :.: :. 
CCDS51 LEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAH
             290       300       310       320       330       340 

     340         350       360       370       380       390       
pF1KSD SQGNPENNR--SFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEG
        . : :.:   :::.:::.:: .: :.:.:::. ::::::::.::..:: :       .:
CCDS51 IHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPR-------RG
             350       360       370       380       390           

       400       410       
pF1KSD RQGPGKQPMETTQPGVSQSN
        .:: .::.:...    :: 
CCDS51 IRGPPRQPVESARSFRFQSG
          400       410    

>>CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6              (437 aa)
 initn: 835 init1: 742 opt: 784  Z-score: 713.8  bits: 141.1 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 852; 39.8% identity (62.8% similar) in 425 aa overlap (30-416:22-436)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
                                    :..: : :  ::  : ....:.::.:  : :
CCDS34         MSGLDGVKRTTPLQTHSIIISDQVPSDQDAHQYLRLRDQSEATQVMAEPGEG
                       10        20        30        40        50  

               70        80           90       100       110       
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDC---GLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLA
       : :..:       .::..  .: :    : . . :..: .:..: . :  ..   .: ::
CCDS34 GSETVALPPP-PPSEEGG--VPQDAAGRGGTPQIRVVGGRGHVAIKAGQEEGQPPAEGLA
             60           70        80        90       100         

       120            130       140           150                  
pF1KSD ADTVFVGT-----AGTVGRPKNAPRVGNRRGP----AGKKAPET------CSTAG-----
       : .: ...      :. :  :     : .:.     :: .:         :.:..     
CCDS34 AASVVMAADRSLKKGVQGGEKALEICGAQRSASELTAGAEAEAEEVKTGKCATVSAAVAE
     110       120       130       140       150       160         

        160       170                   180       190        200   
pF1KSD -RGPQVIAGGRQKKGAA------------GENTSVSAGEEKKEERDAGSGP-PATEG-SM
        .. .:.  :  .: .             ::.  :.  .. .::     :: :  :.  :
CCDS34 RESAEVVKEGLAEKEVMEEQMEVEEQPPEGEEIEVAEEDRLEEEAREEEGPWPLHEALRM
     170       180       190       200       210       220         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KSD DTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQL
       : :: .::.:...:::::::. .: .:::..: ..:::::..::::::::  ::.:::::
CCDS34 DPLEAIQLELDTVNAQADRAFQQLEHKFGRMRRHYLERRNYIIQNIPGFWMTAFRNHPQL
     230       240       250       260       270       280         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KSD ASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVV
       .... .:. :.: :...:::.::   : : :.::.: :::::.::...:::    ::.::
CCDS34 SAMIRGQDAEMLRYITNLEVKELRHPRTGCKFKFFFRRNPYFRNKLIVKEYEVRSSGRVV
     290       300       310       320       330       340         

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD SRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYL
       : :::: :  ::. ::. . : .   ::: :::.::  :::::.:::.:.:::::::.::
CCDS34 SLSTPIIWRRGHEPQSFIRRNQDLICSFFTWFSDHSLPESDKIAEIIKEDLWPNPLQYYL
     350       360       370       380       390       400         

            390       400       410       
pF1KSD LSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
       : ::.:       ..:. : ..:.:  .:   :: 
CCDS34 LREGVR-------RARRRPLREPVEIPRPFGFQSG
     410              420       430       

>>CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2            (410 aa)
 initn: 714 init1: 666 opt: 707  Z-score: 645.0  bits: 128.3 E(32554): 1.3e-29
Smith-Waterman score: 776; 40.0% identity (63.5% similar) in 408 aa overlap (27-411:10-404)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
                                 ::  :   . :: : :   : ..:..:.:    :
CCDS42                  MSLPESPHSPATLDYALE-DPHQGQRSREKSKATEVMADMFDG
                                10         20        30        40  

               70         80        90       100       110         
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEA-ACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAAD
        ::  .     :: ::. : . : : : ...  . . ....: . :   .   .: : : 
CCDS42 RLEPIVFPPP-RLPEEGVAPQDPADGGHTFHILVDAGRSHGAIKAGQEVTPPPAEGLEAA
             50         60        70        80        90       100 

     120       130       140       150       160        170        
pF1KSD TVFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGP-QVIAGGRQKKGAAGENTS
       .. . : :..   ::.    . .: .:.:: :::. :::.  .::: :. .     : . 
CCDS42 SASLTTDGSL---KNGFPGEETHGLGGEKALETCG-AGRSESEVIAEGKAEDVKPEECAM
             110          120       130        140       150       

      180                        190          200        210       
pF1KSD VSA-------GEEKK--EE--------RDAGSGP---PATEG-SMDTLENVQLKLENMNA
        ::       :::    ::        :.:: ::   : . :  .. ::..::.:...::
CCDS42 FSAPVDEKPGGEEMDVAEENRAIDEVNREAGPGPGPGPLNVGLHLNPLESIQLELDSVNA
       160       170       180       190       200       210       

       220       230       240       250       260       270       
pF1KSD QADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYL
       .:::: :.. :.:::..  .::.:: .:.::::::  ::..::::.... .:. :.::::
CCDS42 EADRALLQVERRFGQIHEYYLEQRNDIIRNIPGFWVTAFRHHPQLSAMIRGQDAEMLSYL
       220       230       240       250       260       270       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KSD NSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQ
       ..:::.::   : : :.::.:.:::::.::...: :     ::::: :: :.:  ::  :
CCDS42 TNLEVKELRHPRTGCKFKFFFQRNPYFRNKLIVKVYEVRSFGQVVSFSTLIMWRRGHGPQ
       280       290       300       310       320       330       

       340       350       360       370       380       390       
pF1KSD SLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEG
       :. . : .   ::: :::.::  :::.:..::.:.:: ::::.:::.: :.       ..
CCDS42 SFIHRNRHVICSFFTWFSDHSLPESDRIAQIIKEDLWSNPLQYYLLGEDAH-------RA
       340       350       360       370       380              390

       400       410       
pF1KSD RQGPGKQPMETTQPGVSQSN
       :.   ..:.:  .:      
CCDS42 RRRLVREPVEIPRPFGFQCG
              400       410

>>CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX             (693 aa)
 initn: 735 init1: 659 opt: 672  Z-score: 610.6  bits: 122.7 E(32554): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 733; 34.5% identity (62.9% similar) in 420 aa overlap (13-403:10-418)

               10        20         30              40        50   
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVR-PAPDDAPRD------PDPSQYQSLGEDTQAAQV
                   ::.:  . ...  : : :   :        : :.:   : :.:.::::
CCDS14    MDRPDEGPPAKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQV
                  10        20        30        40        50       

               60        70        80        90       100       110
pF1KSD QA---GAGWGGLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAA
        :   :.: :   :        . ::.. :  .  :    :.  :   ... . : :.: 
CCDS14 LADMRGVGLG--PALPPPPPYVILEEGGIRAYFTLG----AECPG--WDSTIESGYGEAP
        60          70        80        90             100         

              120       130       140       150       160       170
pF1KSD SLSERLAADTVFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKK
         .: : :  .  ...:..   .   .: .  . .:. : ::::..: .:: ..  ..:.
CCDS14 PPTESLEALPTPEASGGSL---EIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKE
     110       120          130       140       150       160      

                      180       190                 200       210  
pF1KSD GAA--------GENTSVSAGEEKKEERDAGS----------GPPATEGSMDTLENVQLKL
        :          :  :. ........:   .          .    :. ...::..:: :
CCDS14 EAIIIVEDEDEDERESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDL
        170       180       190       200       210       220      

            220       230       240       250       260       270  
pF1KSD ENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKE
       : .: .: .:.:::.::: :.:   ::::. .::.::::: .:: :::... ..: ....
CCDS14 EAVNIKAGKAFLRLKRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDED
        230       240       250       260       270       280      

            280       290       300       310       320       330  
pF1KSD VLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLP
       .. ::..:.:..:    .:::.:.::. :::: : :..::.  . ::..::.::::.:  
CCDS14 IFRYLTNLQVQDLRHISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHR
        290       300       310       320       330       340      

            340       350       360       370       380       390  
pF1KSD GHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKG
       :.. :.  .:: . ..:::.::::::  :.:.:.:::...:: :::..::  .:.:... 
CCDS14 GQEPQARRHGNQDASHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRK
        350       360       370       380       390       400      

             400       410                                         
pF1KSD K-EKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN                                  
       : : . :.  :.                                                
CCDS14 KQEMKKRKTRGRCEVVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTD
        410       420       430       440       450       460      

>>CCDS65365.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY         (308 aa)
 initn: 571 init1: 538 opt: 553  Z-score: 508.2  bits: 102.6 E(32554): 5.5e-22
Smith-Waterman score: 553; 39.2% identity (70.0% similar) in 227 aa overlap (173-397:78-302)

            150       160       170       180       190         200
pF1KSD GPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVSAGEEKKEERDA--GSGPPATEG
                                     : :.  :   :: .. ..:  : :: . :.
CCDS65 GAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIMAEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPES
        50        60        70        80        90       100       

              210       220       230       240       250       260
pF1KSD SMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHP
       ... :  ::..:: .:::: .:. :  .:. . :  ::.::. .::..::::.... :::
CCDS65 ALEELLAVQVELEPVNAQARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHP
       110       120       130       140       150       160       

              270       280       290       300       310       320
pF1KSD QLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQ
       :............:::. ::::::        :: ..:  ::::::::. :::  . .  
CCDS65 QMSALITDEDEDMLSYMVSLEVEEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEY
       170       180       190       200       210       220       

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD VVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQF
        .:.::::.: : .....  . . ... .::.:::.:.   :.::.::. ..:: ::::.
CCDS65 RASHSTPIEWYPDYEVEAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAEILCKDLWRNPLQY
       230       240       250       260       270       280       

              390       400       410       
pF1KSD YLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
       :   .    :.: :  :                    
CCDS65 YKRMKPP--EEGTETSGDSQLLS              
       290         300                      

>>CCDS48204.1 TSPY3 gene_id:728137|Hs108|chrY             (308 aa)
 initn: 571 init1: 538 opt: 553  Z-score: 508.2  bits: 102.6 E(32554): 5.5e-22
Smith-Waterman score: 553; 39.2% identity (70.0% similar) in 227 aa overlap (173-397:78-302)

            150       160       170       180       190         200
pF1KSD GPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVSAGEEKKEERDA--GSGPPATEG
                                     : :.  :   :: .. ..:  : :: . :.
CCDS48 GAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIMAEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPES
        50        60        70        80        90       100       

              210       220       230       240       250       260
pF1KSD SMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHP
       ... :  ::..:: .:::: .:. :  .:. . :  ::.::. .::..::::.... :::
CCDS48 ALEELLAVQVELEPVNAQARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHP
       110       120       130       140       150       160       

              270       280       290       300       310       320
pF1KSD QLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQ
       :............:::. ::::::        :: ..:  ::::::::. :::  . .  
CCDS48 QMSALITDEDEDMLSYMVSLEVEEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEY
       170       180       190       200       210       220       

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD VVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQF
        .:.::::.: : .....  . . ... .::.:::.:.   :.::.::. ..:: ::::.
CCDS48 RASHSTPIEWYPDYEVEAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAEILCKDLWRNPLQY
       230       240       250       260       270       280       

              390       400       410       
pF1KSD YLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
       :   .    :.: :  :                    
CCDS48 YKRMKPP--EEGTETSGDSQLLS              
       290         300                      

>>CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY             (314 aa)
 initn: 571 init1: 538 opt: 553  Z-score: 508.1  bits: 102.6 E(32554): 5.6e-22
Smith-Waterman score: 553; 39.2% identity (70.0% similar) in 227 aa overlap (173-397:84-308)

            150       160       170       180       190         200
pF1KSD GPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVSAGEEKKEERDA--GSGPPATEG
                                     : :.  :   :: .. ..:  : :: . :.
CCDS48 SEQAALGEEAVLLLDDIMAEVEVVAEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPES
            60        70        80        90       100       110   

              210       220       230       240       250       260
pF1KSD SMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHP
       ... :  ::..:: .:::: .:. :  .:. . :  ::.::. .::..::::.... :::
CCDS48 ALEELLAVQVELEPVNAQARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHP
           120       130       140       150       160       170   

              270       280       290       300       310       320
pF1KSD QLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQ
       :............:::. ::::::        :: ..:  ::::::::. :::  . .  
CCDS48 QMSALITDEDEDMLSYMVSLEVEEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEY
           180       190       200       210       220       230   

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD VVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQF
        .:.::::.: : .....  . . ... .::.:::.:.   :.::.::. ..:: ::::.
CCDS48 RASHSTPIEWYPDYEVEAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAEILCKDLWRNPLQY
           240       250       260       270       280       290   

              390       400       410       
pF1KSD YLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
       :   .    :.: :  :                    
CCDS48 YKRMKPP--EEGTETSGDSQLLS              
           300         310                  

>>CCDS35465.1 TSPY2 gene_id:64591|Hs108|chrY              (308 aa)
 initn: 570 init1: 537 opt: 552  Z-score: 507.3  bits: 102.4 E(32554): 6.1e-22
Smith-Waterman score: 552; 39.2% identity (70.0% similar) in 227 aa overlap (173-397:78-302)

            150       160       170       180       190         200
pF1KSD GPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVSAGEEKKEERDA--GSGPPATEG
                                     : :.  :   :: .. ..:  : :: . :.
CCDS35 GAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIMAEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPES
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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