seq1 = pF1KSDA1733.tfa, 1452 bp seq2 = pF1KSDA1733/gi568815592f_12618745.tfa (gi568815592f:12618745_13372920), 754176 bp >pF1KSDA1733 1452 >gi568815592f:12618745_13372920 (Chr6) 1-103 (100001-100103) 100% -> 104-250 (130900-131046) 100% == 408-496 (541452-541540) 96% -> 497-664 (563775-563942) 100% -> 665-986 (587071-587392) 100% -> 987-1234 (609072-609319) 100% -> 1235-1394 (611293-611449) 97% -> 1395-1452 (654119-654176) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGATTATCCCAAAATGGATTATTTTCTGGATGTAGAGTCTGCTCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGATTATCCCAAAATGGATTATTTTCTGGATGTAGAGTCTGCTCACAG 50 . : . : . : . : . : 51 ACTCTTGGATGTTGAGTCAGCTCAAAGATTCTTCTACAGTCAAGGAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 ACTCTTGGATGTTGAGTCAGCTCAAAGATTCTTCTACAGTCAAGGAGCTC 100 . : . : . : . : . : 101 AAG CTCGCCGGGCGACCCTGCTCCTGCCTCCCACATTAATG |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 AAGGTA...CAGCTCGCCGGGCGACCCTGCTCCTGCCTCCCACATTAATG 150 . : . : . : . : . : 142 GCGGCATCCTCGGAGGATGATATAGACCGGCGGCCCATCCGGAGAGTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130938 GCGGCATCCTCGGAGGATGATATAGACCGGCGGCCCATCCGGAGAGTGCG 200 . : . : . : . : . : 192 CTCCAAGAGCGACACGCCGTACCTCGCAGAGGCCAGGATCTCCTTTAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130988 CTCCAAGAGCGACACGCCGTACCTCGCAGAGGCCAGGATCTCCTTTAACC 250 . 242 TGGGGGCAG ||||||||| 131038 TGGGGGCAG 0 . : . : . : . : . : 408 GTCAGCAGCCCTGGAAAGGAAAATATCTATGAGGCAAAGCAGAGAAGAGC || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 541452 GTTTGTAGCCCTGGAAAGGAAAATATCTATGAGGCAAAGCAGAGAAGAGC 50 . : . : . : . : . : 458 TGATAAAGCGAGGAGTCCTGAAGGAAATCTATGATAAAG AT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 541502 TGATAAAGCGAGGAGTCCTGAAGGAAATCTATGATAAAGGTA...CAGAT 100 . : . : . : . : . : 499 GGGGAACTCTCTATATCCAATGAAGAGGACTCCCTAGAAAATGGGCAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 563777 GGGGAACTCTCTATATCCAATGAAGAGGACTCCCTAGAAAATGGGCAGTC 150 . : . : . : . : . : 549 CCTGAGCTCCAGCCAGCTGTCTCTGCCTGCCCTGTCCGAAATGGAGCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 563827 CCTGAGCTCCAGCCAGCTGTCTCTGCCTGCCCTGTCCGAAATGGAGCCAG 200 . : . : . : . : . : 599 TCCCAATGCCCAGGGATCCCTGCTCATATGAGGTGCTCCAACCGTCAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 563877 TCCCAATGCCCAGGGATCCCTGCTCATATGAGGTGCTCCAACCGTCAGAC 250 . : . : . : . : . : 649 ATCATGGATGGGCCAG ATCCTGGCGCCCCTGTGAAATTGCC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 563927 ATCATGGATGGGCCAGGTA...CAGATCCTGGCGCCCCTGTGAAATTGCC 300 . : . : . : . : . : 690 TTGTCTGCCAGTGAAACTGTCGCCTCCGCTACCTCCAAAGAAAGTCATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 587096 TTGTCTGCCAGTGAAACTGTCGCCTCCGCTACCTCCAAAGAAAGTCATGA 350 . : . : . : . : . : 740 TCTGTATGCCCGTGGGGGGGCCAGACCTCTCACTGGTGTCCTACACAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 587146 TCTGTATGCCCGTGGGGGGGCCAGACCTCTCACTGGTGTCCTACACAGCC 400 . : . : . : . : . : 790 CAGAAGAGTGGCCAGCAGGGTGTGGCCCAGCACCACCACACTGTCCTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 587196 CAGAAGAGTGGCCAGCAGGGTGTGGCCCAGCACCACCACACTGTCCTGCC 450 . : . : . : . : . : 840 CTCCCAGATCCAGCACCAGCTGCAGTACGGCAGCCACGGCCAGCACCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 587246 CTCCCAGATCCAGCACCAGCTGCAGTACGGCAGCCACGGCCAGCACCTCC 500 . : . : . : . : . : 890 CCTCCACCACCGGCTCCCTCCCCATGCACCCCTCGGGCTGCAGAATGATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 587296 CCTCCACCACCGGCTCCCTCCCCATGCACCCCTCGGGCTGCAGAATGATA 550 . : . : . : . : . : 940 GACGAGCTCAACAAAACGCTGGCCATGACCATGCAGAGGCTGGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 587346 GACGAGCTCAACAAAACGCTGGCCATGACCATGCAGAGGCTGGAAAGGTA 600 . : . : . : . : . : 987 CTCTGAGCAGCGGGTCCCCTGTTCCACTTCTTACCACAGCTCTG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 587396 ...CAGCTCTGAGCAGCGGGTCCCCTGTTCCACTTCTTACCACAGCTCTG 650 . : . : . : . : . : 1031 GGTTGCACTCGGGTGATGGGGTCACCAAAGCAGGACCTATGGGCCTTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 609116 GGTTGCACTCGGGTGATGGGGTCACCAAAGCAGGACCTATGGGCCTTCCA 700 . : . : . : . : . : 1081 GAAATAAGACAAGTGCCAACTGTTGTGATTGAATGTGATGACAATAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 609166 GAAATAAGACAAGTGCCAACTGTTGTGATTGAATGTGATGACAATAAAGA 750 . : . : . : . : . : 1131 AAATGTGCCTCATGAGTCAGACTACGAAGACTCTTCTTGCCTGTATACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 609216 AAATGTGCCTCATGAGTCAGACTACGAAGACTCTTCTTGCCTGTATACAA 800 . : . : . : . : . : 1181 GAGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGACGAAGACGACGACAGCTCATTATAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 609266 GAGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGACGAAGACGACGACAGCTCATTATAC 850 . : . : . : . : . : 1231 ACCA GCTCCCTGGCCATGAAGGTCTGCAGGAAGGACTCCTT ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 609316 ACCAGTG...CAGGCTCCCTGGCCATGAAGGTCTGCAGGAAGGACTCCTT 900 . : . : . : . : . : 1272 AGCCATTAAACTCAGCAACAGGCCCTCCAAGCGAGAGCTGGAAGAAAAGA |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 611330 AGCCATCAAACTCAGCAACAGGCCCTCCAAGCGAGAGCTGGAAGAAAAGA 950 . : . : . : . : . : 1322 ACATCCTTCCCAGGCAGACGGATGAGGAGCGGCTGGAGCTGAGGCAACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 611380 ACATCCTTCCCAGGCAGACGGATGAGGAGCGGCTGGAGCTGAGGCAACAG 1000 . : . : . : . : . : 1372 ATTGGCACCAAGCTCACCAGGCG GCTGAGCCAGAGGCCAAC ||||||||||||||||||||--->>>...>>>|||||||||||||||||| 611430 ATTGGCACCAAGCTCACCAG GTA...GCGGCTGAGCCAGAGGCCAAC 1050 . : . : . : . : 1413 TGCAGAGGAACTGGAACAGAGGAACATTTTGAAACGTAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 654137 TGCAGAGGAACTGGAACAGAGGAACATTTTGAAACGTAAG