Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1724, 386 aa
  1>>>pF1KSDA1724 386 - 386 aa - 386 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8132+/-0.000485; mu= 19.2016+/- 0.030
 mean_var=64.8127+/-13.484, 0's: 0 Z-trim(108.6): 60  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.159310
 statistics sampled from 16699 (16743) to 16699 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.196), width:  16
 Scan time:  7.640

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_277040 (OMIM: 607915) ethanolaminephosphotransf ( 397) 2614 610.2 2.7e-174
XP_011538798 (OMIM: 616751) PREDICTED: choline/eth ( 416)  501 124.5 4.4e-28
NP_001317672 (OMIM: 616751) choline/ethanolamineph ( 416)  489 121.8   3e-27
NP_001007795 (OMIM: 616751) choline/ethanolamineph ( 416)  489 121.8   3e-27
NP_006081 (OMIM: 616751) choline/ethanolaminephosp ( 416)  489 121.8   3e-27
NP_064629 (OMIM: 616747) cholinephosphotransferase ( 406)  470 117.4 6.1e-26
XP_011536876 (OMIM: 616747) PREDICTED: cholinephos ( 362)  383 97.4 5.8e-20
XP_011536877 (OMIM: 616747) PREDICTED: cholinephos ( 234)  136 40.5  0.0051


>>NP_277040 (OMIM: 607915) ethanolaminephosphotransferas  (397 aa)
 initn: 2614 init1: 2614 opt: 2614  Z-score: 3250.0  bits: 610.2 E(85289): 2.7e-174
Smith-Waterman score: 2614; 100.0% identity (100.0% similar) in 386 aa overlap (1-386:1-386)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPFWNTIVKVFPTWLAPNLITFSGFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_277 MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPFWNTIVKVFPTWLAPNLITFSGFLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGILNFVAYTLDGVDGKQARRTNSSTPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_277 VVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGILNFVAYTLDGVDGKQARRTNSSTPL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GELFDHGLDSWSCVYFVVTVYSIFGRGSTGVSVFVLYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_277 GELFDHGLDSWSCVYFVVTVYSIFGRGSTGVSVFVLYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FLPWGYDISQVTISFVYIVTAVVGVEAWYEPFLFNFLYRDLFTAMIIGCALCVTLPMSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_277 FLPWGYDISQVTISFVYIVTAVVGVEAWYEPFLFNFLYRDLFTAMIIGCALCVTLPMSLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLFILSTAWILWSPSDILELHPRVFYFMVGTAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_277 NFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLFILSTAWILWSPSDILELHPRVFYFMVGTAF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLVPLFLVVLVVNLGVASYVESILLYTLTTAFTLAHIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_277 ANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLVPLFLVVLVVNLGVASYVESILLYTLTTAFTLAHIH
              310       320       330       340       350       360

              370       380                 
pF1KSD YGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNSD           
       ::::::::::::::::::::::::::           
NP_277 YGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNSDCLGMEEKNIGL
              370       380       390       

>>XP_011538798 (OMIM: 616751) PREDICTED: choline/ethanol  (416 aa)
 initn: 368 init1: 195 opt: 501  Z-score: 625.1  bits: 124.5 E(85289): 4.4e-28
Smith-Waterman score: 501; 27.7% identity (61.1% similar) in 386 aa overlap (7-381:43-407)

                                       10        20        30      
pF1KSD                         MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPF
                                     .: .::  .....:...  . :   .:. .
XP_011 DSHPESPVGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLE-PLMQGY
             20        30        40        50        60         70 

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD WNTIVKVFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGIL
       :. .:.  :.:.::::::. :. . . . .:.... :       . ...: :..:. .  
XP_011 WEWLVRRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTILLVFYCPT------ATEQAPLWAYIACACG
              80        90       100             110       120     

        100       110       120       130        140       150     
pF1KSD NFVAYTLDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVV-TVYSIFGRGSTGVSVFV
        :.  .::..:::::::::::.::::::::: :: : :. :. :  ..    . :..   
XP_011 LFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAV----QLGTNPDW
         130       140       150       160       170           180 

         160       170       180         190       200       210   
pF1KSD LYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDI--SQVTISFVYIVTAVVGVEAWYEPFL
       ...  ..  : :  .::. : .: : .   .:.  ::. : .  ..:...:      :..
XP_011 MFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGI-FDVTESQIIIIICQLLTGTLG------PWF
             190       200       210        220       230          

           220       230         240       250       260       270 
pF1KSD FNFLYRDLFTAMIIGCALCVTLP--MSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLF-
       .::    :   : :  :::..    .:  :.::   .. .  :.   : . ..:: : . 
XP_011 WNFTIPVLNIQMKIFPALCTVAGTIFSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIG
          240       250       260       270       280       290    

               280         290       300       310       320       
pF1KSD -ILSTAWILWSPSDI--LELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLV-P
        ... : .... : .  .: :: .. .  : . :. : .:.: .:....    .  .. :
XP_011 SVITLAAMIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGP
          300       310       320       330       340       350    

        330       340       350        360       370       380     
pF1KSD LFLVVLVVNLGVASYVESILLYTLTTAFTLAH-IHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNS
          ..: ..    :...  ..  .. .:..   :.: : : .:..::..:. : ..    
XP_011 ---ALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTA
             360       370       380       390       400       410 

            
pF1KSD D    
            
XP_011 HSNHH
            

>>NP_001317672 (OMIM: 616751) choline/ethanolaminephosph  (416 aa)
 initn: 340 init1: 195 opt: 489  Z-score: 610.2  bits: 121.8 E(85289): 3e-27
Smith-Waterman score: 489; 27.2% identity (62.2% similar) in 386 aa overlap (7-381:43-407)

                                       10        20        30      
pF1KSD                         MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPF
                                     .: .::  .....:...  . :   .:. .
NP_001 DSHPESPVGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLE-PLMQGY
             20        30        40        50        60         70 

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD WNTIVKVFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGIL
       :. .:.  :.:.::::::. :. . . . .:.... :       . ...: :..:. .  
NP_001 WEWLVRRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTILLVFYCPT------ATEQAPLWAYIACACG
              80        90       100             110       120     

        100       110       120       130        140       150     
pF1KSD NFVAYTLDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVV-TVYSIFGRGSTGVSVFV
        :.  .::..:::::::::::.::::::::: :: : :. :. :  ..    . :..   
NP_001 LFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAV----QLGTNPDW
         130       140       150       160       170           180 

         160       170       180       190         200       210   
pF1KSD LYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDISQVTISFVYIV--TAVVGVEAWYEPFL
       ...  ..  : :  .::. : .: : .    :...: : :. :.   ::.:   ... ..
NP_001 MFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGI-IDVTEVQI-FIIIMHLLAVIGGPPFWQSMI
             190       200       210         220       230         

             220       230       240       250       260       270 
pF1KSD --FNFLYRDLFTAMIIGCALCVTLPMSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLF-
         .:. .. .: :.   :..  :. .:  :.::   .. .  :.   : . ..:: : . 
NP_001 PVLNIQMK-IFPAL---CTVAGTI-FSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIG
     240        250           260       270       280       290    

               280         290       300       310       320       
pF1KSD -ILSTAWILWSPSDI--LELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLV-P
        ... : .... : .  .: :: .. .  : . :. : .:.: .:....    .  .. :
NP_001 SVITLAAMIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGP
          300       310       320       330       340       350    

        330       340       350        360       370       380     
pF1KSD LFLVVLVVNLGVASYVESILLYTLTTAFTLAH-IHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNS
          ..: ..    :...  ..  .. .:..   :.: : : .:..::..:. : ..    
NP_001 ---ALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTA
             360       370       380       390       400       410 

            
pF1KSD D    
            
NP_001 HSNHH
            

>>NP_001007795 (OMIM: 616751) choline/ethanolaminephosph  (416 aa)
 initn: 340 init1: 195 opt: 489  Z-score: 610.2  bits: 121.8 E(85289): 3e-27
Smith-Waterman score: 489; 27.2% identity (62.2% similar) in 386 aa overlap (7-381:43-407)

                                       10        20        30      
pF1KSD                         MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPF
                                     .: .::  .....:...  . :   .:. .
NP_001 DSHPESPVGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLE-PLMQGY
             20        30        40        50        60         70 

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD WNTIVKVFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGIL
       :. .:.  :.:.::::::. :. . . . .:.... :       . ...: :..:. .  
NP_001 WEWLVRRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTILLVFYCPT------ATEQAPLWAYIACACG
              80        90       100             110       120     

        100       110       120       130        140       150     
pF1KSD NFVAYTLDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVV-TVYSIFGRGSTGVSVFV
        :.  .::..:::::::::::.::::::::: :: : :. :. :  ..    . :..   
NP_001 LFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAV----QLGTNPDW
         130       140       150       160       170           180 

         160       170       180       190         200       210   
pF1KSD LYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDISQVTISFVYIV--TAVVGVEAWYEPFL
       ...  ..  : :  .::. : .: : .    :...: : :. :.   ::.:   ... ..
NP_001 MFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGI-IDVTEVQI-FIIIMHLLAVIGGPPFWQSMI
             190       200       210         220       230         

             220       230       240       250       260       270 
pF1KSD --FNFLYRDLFTAMIIGCALCVTLPMSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLF-
         .:. .. .: :.   :..  :. .:  :.::   .. .  :.   : . ..:: : . 
NP_001 PVLNIQMK-IFPAL---CTVAGTI-FSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIG
     240        250           260       270       280       290    

               280         290       300       310       320       
pF1KSD -ILSTAWILWSPSDI--LELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLV-P
        ... : .... : .  .: :: .. .  : . :. : .:.: .:....    .  .. :
NP_001 SVITLAAMIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGP
          300       310       320       330       340       350    

        330       340       350        360       370       380     
pF1KSD LFLVVLVVNLGVASYVESILLYTLTTAFTLAH-IHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNS
          ..: ..    :...  ..  .. .:..   :.: : : .:..::..:. : ..    
NP_001 ---ALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTA
             360       370       380       390       400       410 

            
pF1KSD D    
            
NP_001 HSNHH
            

>>NP_006081 (OMIM: 616751) choline/ethanolaminephosphotr  (416 aa)
 initn: 340 init1: 195 opt: 489  Z-score: 610.2  bits: 121.8 E(85289): 3e-27
Smith-Waterman score: 489; 27.2% identity (62.2% similar) in 386 aa overlap (7-381:43-407)

                                       10        20        30      
pF1KSD                         MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTNPLSLYVMHPF
                                     .: .::  .....:...  . :   .:. .
NP_006 DSHPESPVGFGHMSTTGCVLNKLFQLPTPPLSRHQLKRLEEHRYQSAGRSLLE-PLMQGY
             20        30        40        50        60         70 

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD WNTIVKVFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGIL
       :. .:.  :.:.::::::. :. . . . .:.... :       . ...: :..:. .  
NP_006 WEWLVRRVPSWIAPNLITIIGLSINICTTILLVFYCPT------ATEQAPLWAYIACACG
              80        90       100             110       120     

        100       110       120       130        140       150     
pF1KSD NFVAYTLDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVV-TVYSIFGRGSTGVSVFV
        :.  .::..:::::::::::.::::::::: :: : :. :. :  ..    . :..   
NP_006 LFIYQSLDAIDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDSLSTVFVVLGTCIAV----QLGTNPDW
         130       140       150       160       170           180 

         160       170       180       190         200       210   
pF1KSD LYLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDISQVTISFVYIV--TAVVGVEAWYEPFL
       ...  ..  : :  .::. : .: : .    :...: : :. :.   ::.:   ... ..
NP_006 MFFCCFAGTFMFYCAHWQTYVSGTLRFGI-IDVTEVQI-FIIIMHLLAVIGGPPFWQSMI
             190       200       210         220       230         

             220       230       240       250       260       270 
pF1KSD --FNFLYRDLFTAMIIGCALCVTLPMSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLF-
         .:. .. .: :.   :..  :. .:  :.::   .. .  :.   : . ..:: : . 
NP_006 PVLNIQMK-IFPAL---CTVAGTI-FSCTNYFRVIFTGGVGKNGSTIAGTSVLSPFLHIG
     240        250           260       270       280       290    

               280         290       300       310       320       
pF1KSD -ILSTAWILWSPSDI--LELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLV-P
        ... : .... : .  .: :: .. .  : . :. : .:.: .:....    .  .. :
NP_006 SVITLAAMIYKKSAVQLFEKHPCLYILTFGFVSAKITNKLVVAHMTKSEMHLHDTAFIGP
          300       310       320       330       340       350    

        330       340       350        360       370       380     
pF1KSD LFLVVLVVNLGVASYVESILLYTLTTAFTLAH-IHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNS
          ..: ..    :...  ..  .. .:..   :.: : : .:..::..:. : ..    
NP_006 ---ALLFLDQYFNSFIDEYIVLWIALVFSFFDLIRYCVSVCNQIASHLHIHVFRIKVSTA
             360       370       380       390       400       410 

            
pF1KSD D    
            
NP_006 HSNHH
            

>>NP_064629 (OMIM: 616747) cholinephosphotransferase 1 [  (406 aa)
 initn: 356 init1: 189 opt: 470  Z-score: 586.7  bits: 117.4 E(85289): 6.1e-26
Smith-Waterman score: 474; 27.6% identity (58.7% similar) in 387 aa overlap (5-378:19-382)

                             10        20            30        40  
pF1KSD               MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTN----PLSLYVMHPFWNTIVK
                         : .:  ::  .....:::. ..    ::.::     :. ...
NP_064 MAAGAGAGSAPRWLRALSEPLSAAQLRRLEEHRYSAAGVSLLEPPLQLY-----WTWLLQ
               10        20        30        40             50     

             50        60        70        80        90       100  
pF1KSD VFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGILNFVAYT
        .: :.::: ::. :. . : . :..  . :       . ...: :.... ..  :.  .
NP_064 WIPLWMAPNSITLLGLAVNVVTTLVLISYCP------TATEEAPYWTYLLCALGLFIYQS
          60        70        80              90       100         

            110       120       130       140       150       160  
pF1KSD LDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVVTVYSIFGRGSTGVSVFVLYLLLWV
       ::..:::::::::: .::::::::: :: : :...: . :: .: .:  . :  ..  ..
NP_064 LDAIDGKQARRTNSCSPLGELFDHGCDSLSTVFMAVGA-SIAARLGTYPDWF--FFCSFI
     110       120       130       140        150       160        

            170       180       190         200       210       220
pF1KSD VLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDISQVTISFV--YIVTAVVGVEAWYEPFLFNFLYRD
        .: :  .::. : .:.: .    :.... :..:  ....:  :.  :   . . .:   
NP_064 GMFVFYCAHWQTYVSGMLRFG-KVDVTEIQIALVIVFVLSAFGGATMW--DYTIPILEIK
        170       180        190       200       210         220   

              230       240       250       260           270      
pF1KSD LFTAMIIGCALCVTLPMSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCL----LFILSTAW
       :    ..:    : .  :  :.:.   .. .  :.   : . ..:: :    ..::.   
NP_064 LKILPVLGFLGGVIFSCS--NYFHVILHGGVGKNGSTIAGTSVLSPGLHIGLIIILAIMI
           230       240         250       260       270       280 

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD ILWSPSDILELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLVPLFLV--VLVV
          : .:..: :: .. .: : .::. . .:.: .:....     .:   .::   .: .
NP_064 YKKSATDVFEKHPCLYILMFGCVFAKVSQKLVVAHMTKSEL----YLQDTVFLGPGLLFL
             290       300       310       320           330       

          340        350       360       370       380             
pF1KSD NLGVASYV-ESILLYTLTTAFTLAHIHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNSD       
       .    ... : ..:.   .  ..  . :   .  :.: :...  :               
NP_064 DQYFNNFIDEYVVLWMAMVISSFDMVIYFSALCLQISRHLHLNIFKTACHQAPEQVQVLS
       340       350       360       370       380       390       

NP_064 SKSHQNNMD
       400      

>>XP_011536876 (OMIM: 616747) PREDICTED: cholinephosphot  (362 aa)
 initn: 356 init1: 189 opt: 383  Z-score: 479.4  bits: 97.4 E(85289): 5.8e-20
Smith-Waterman score: 398; 25.6% identity (54.8% similar) in 383 aa overlap (5-378:19-338)

                             10        20            30        40  
pF1KSD               MAGYEYVSPEQLAGFDKYKYSAVDTN----PLSLYVMHPFWNTIVK
                         : .:  ::  .....:::. ..    ::.::     :. ...
XP_011 MAAGAGAGSAPRWLRALSEPLSAAQLRRLEEHRYSAAGVSLLEPPLQLY-----WTWLLQ
               10        20        30        40             50     

             50        60        70        80        90       100  
pF1KSD VFPTWLAPNLITFSGFLLVVFNFLLMAYFDPDFYASAPGHKHVPDWVWIVVGILNFVAYT
        .: :.::: ::. :. . : . :..  . :       . ...: :.... ..  :.  .
XP_011 WIPLWMAPNSITLLGLAVNVVTTLVLISYCP------TATEEAPYWTYLLCALGLFIYQS
          60        70        80              90       100         

            110       120       130       140       150       160  
pF1KSD LDGVDGKQARRTNSSTPLGELFDHGLDSWSCVYFVVTVYSIFGRGSTGVSVFVLYLLLWV
       ::..:::::::::: .::::::::: :: : :...: . :: .: .:  . :  ..  ..
XP_011 LDAIDGKQARRTNSCSPLGELFDHGCDSLSTVFMAVGA-SIAARLGTYPDWF--FFCSFI
     110       120       130       140        150       160        

            170       180       190         200       210       220
pF1KSD VLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDISQVTISFV--YIVTAVVGVEAWYEPFLFNFLYRD
        .: :  .::. : .:.: .    :.... :..:  ....:  :.  :            
XP_011 GMFVFYCAHWQTYVSGMLRFG-KVDVTEIQIALVIVFVLSAFGGATMW------------
        170       180        190       200       210               

              230       240       250       260       270       280
pF1KSD LFTAMIIGCALCVTLPMSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCLLFILSTAWILWS
                               .: ....        . : .   :..::.      :
XP_011 ------------------------DYTGTSV--------LSPGLHIGLIIILAIMIYKKS
                                   220               230       240 

              290       300       310       320       330          
pF1KSD PSDILELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLVPLFLV--VLVVNLGV
        .:..: :: .. .: : .::. . .:.: .:....     .:   .::   .: ..   
XP_011 ATDVFEKHPCLYILMFGCVFAKVSQKLVVAHMTKSEL----YLQDTVFLGPGLLFLDQYF
             250       260       270           280       290       

      340        350       360       370       380                 
pF1KSD ASYV-ESILLYTLTTAFTLAHIHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNSD           
        ... : ..:.   .  ..  . :   .  :.: :...  :                   
XP_011 NNFIDEYVVLWMAMVISSFDMVIYFSALCLQISRHLHLNIFKTACHQAPEQVQVLSSKSH
       300       310       320       330       340       350       

XP_011 QNNMD
       360  

>>XP_011536877 (OMIM: 616747) PREDICTED: cholinephosphot  (234 aa)
 initn:  93 init1:  93 opt: 136  Z-score: 175.2  bits: 40.5 E(85289): 0.0051
Smith-Waterman score: 136; 21.4% identity (53.7% similar) in 201 aa overlap (187-378:18-210)

        160       170       180       190         200       210    
pF1KSD YLLLWVVLFSFILSHWEKYNTGILFLPWGYDISQVTISFV--YIVTAVVGVEAWYEPFLF
                                     :.... :..:  ....:  :.  :   . .
XP_011              MCTERGPALTTVTSIRVDVTEIQIALVIVFVLSAFGGATMW--DYTI
                            10        20        30        40       

          220       230       240       250       260           270
pF1KSD NFLYRDLFTAMIIGCALCVTLPMSLLNFFRSYKNNTLKLNSVYEAMVPLFSPCL----LF
        .:   :    ..:    : .  :  :.:.   .. .  :.   : . ..:: :    ..
XP_011 PILEIKLKILPVLGFLGGVIFSCS--NYFHVILHGGVGKNGSTIAGTSVLSPGLHIGLII
          50        60          70        80        90       100   

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD ILSTAWILWSPSDILELHPRVFYFMVGTAFANSTCQLIVCQMSSTRCPTLNWLLVPLFLV
       ::.      : .:..: :: .. .: : .::. . .:.: .:....     .:   .:: 
XP_011 ILAIMIYKKSATDVFEKHPCLYILMFGCVFAKVSQKLVVAHMTKSEL----YLQDTVFLG
           110       120       130       140       150             

                340        350       360       370       380       
pF1KSD --VLVVNLGVASYV-ESILLYTLTTAFTLAHIHYGVRVVKQLSSHFQIYPFSLRKPNSD 
         .: ..    ... : ..:.   .  ..  . :   .  :.: :...  :         
XP_011 PGLLFLDQYFNNFIDEYVVLWMAMVISSFDMVIYFSALCLQISRHLHLNIFKTACHQAPE
     160       170       180       190       200       210         

XP_011 QVQVLSSKSHQNNMD
     220       230    




386 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 07:08:36 2016 done: Thu Nov  3 07:08:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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