Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1716
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1716, 759 aa
  1>>>pF1KSDA1716 759 - 759 aa - 759 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4357+/-0.00108; mu= 15.7705+/- 0.065
 mean_var=180.2996+/-35.542, 0's: 0 Z-trim(109.2): 180  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.095516
 statistics sampled from 10487 (10710) to 10487 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.329), width:  16
 Scan time:  3.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1           ( 834) 3847 543.7 4.4e-154
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3         ( 778) 2260 325.0 2.9e-88
CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17         ( 740) 1676 244.5 4.7e-64
CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1           ( 903)  590 94.9   6e-19
CCDS44087.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1         ( 894)  560 90.8   1e-17
CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7        ( 580)  443 74.4 5.7e-13
CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7        ( 911)  443 74.7 7.5e-13
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10        ( 663)  436 73.5 1.2e-12
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10       ( 686)  436 73.5 1.2e-12
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2         ( 804)  434 73.4 1.6e-12
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2        ( 857)  434 73.4 1.7e-12
CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10       ( 658)  432 73.0 1.8e-12
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12        ( 836)  429 72.7 2.7e-12
CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10       ( 686)  426 72.2 3.2e-12
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12       (1192)  429 72.9 3.4e-12
CCDS46224.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2          ( 961)  393 67.8 9.2e-11
CCDS1661.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2           (1006)  393 67.8 9.5e-11


>>CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1                (834 aa)
 initn: 3834 init1: 3773 opt: 3847  Z-score: 2879.7  bits: 543.7 E(32554): 4.4e-154
Smith-Waterman score: 4950; 95.7% identity (95.8% similar) in 791 aa overlap (1-758:43-833)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PRFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLVKLCSGMVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
             20        30        40        50        60        70  

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
             80        90       100       110       120       130  

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
            140       150       160       170       180       190  

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
            200       210       220       230       240       250  

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
            260       270       280       290       300       310  

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
            320       330       340       350       360       370  

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
            380       390       400       410       420       430  

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
            440       450       460       470       480       490  

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
            500       510       520       530       540       550  

              520       530       540       550       560          
pF1KSD KVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPR--------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS19 KVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRSLSSDSGL
            560       570       580       590       600       610  

                                     570       580       590       
pF1KSD -------------------------KGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLA
                                .::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GGSSDGSSDVLAFGSGSVVDSVTEEEGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLA
            620       630       640       650       660       670  

       600       610       620       630       640       650       
pF1KSD HRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 HRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQR
            680       690       700       710       720       730  

       660       670       680       690       700       710       
pF1KSD DSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLAR
            740       750       760       770       780       790  

       720       730       740       750         
pF1KSD MAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS19 MAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
            800       810       820       830    

>>CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3              (778 aa)
 initn: 2825 init1: 866 opt: 2260  Z-score: 1698.1  bits: 325.0 E(32554): 2.9e-88
Smith-Waterman score: 2859; 60.2% identity (81.4% similar) in 737 aa overlap (1-733:45-746)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
                                     :...:::.  ... :..:.:::.:  ..:.
CCDS33 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
           20        30        40        50        60        70    

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
       :.   : .:.:::::..:.: :::::.:::.. :::.:::::.::::..::::.:: :. 
CCDS33 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
           80        90       100       110       120       130    

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
       : .::.:::. :.. :::::::. :: :::::::.::::::::::::.:.. ::: ::::
CCDS33 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
          140       150       160       170       180       190    

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
       ::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.::.:.: ::::::.::..:::.    ::
CCDS33 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DF
          200       210       220       230       240           250

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
       : :.::.:..::: .:.::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::  ::::
CCDS33 SSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVV
              260       270       280       290       300       310

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
       .:::::.:: ::::::::::::.:::::::::::::::::::..:::.:::.::::. : 
CCDS33 EDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDE
              320       330       340       350       360       370

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
         ::.::. .::::.:.::.....:. .::::.::::: . ::..: :::  ::::::::
CCDS33 --SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASIN
                380       390       400       410       420        

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
       ::. ::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::...:..:::. :  : 
CCDS33 LGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGI
      430       440       450       460       470       480        

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
       .::  .. ::.:::.:. ::::.::. :  ..  :  :..   :: .  .::      ..
CCDS33 KKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS--LSPPEQ---QKKFVSKSSE-----EK
      490        500       510         520          530            

              520           530       540       550       560      
pF1KSD KVRLEPVLPC----VAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKGAE
       .. .    :     ..: ::: . :  ....:    :  .:: :  .:.           
CCDS33 RLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSS---DDGRESLPSTVSAN-----------
       540       550       560          570       580              

        570       580       590       600       610       620      
pF1KSD SEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAED
          :  : .:. .  .  : : ..:.:::  .::.  ..:: .: ::::::.::::..:.
CCDS33 ---SLYEPEGERQDSSMFL-DSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEE
              590        600       610       620       630         

        630       640       650       660       670       680      
pF1KSD EGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGAD
       .  :::.::::::::..:::::::::.::::: .::.::::::.::.::::::::::::.
CCDS33 NKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGAN
     640       650       660       670       680       690         

        690       700       710       720       730       740      
pF1KSD QHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRR
       ::: :.: .:::.:::.::::::::::::::: :::::.:.  : ::             
CCDS33 QHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQ
     700       710       720       730       740       750         

        750               
pF1KSD CIQEFISLHLEES      
                          
CCDS33 MASNNPEKLNRFQQDSQKF
     760       770        

>>CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17              (740 aa)
 initn: 1668 init1: 1000 opt: 1676  Z-score: 1263.4  bits: 244.5 E(32554): 4.7e-64
Smith-Waterman score: 2126; 49.3% identity (71.9% similar) in 740 aa overlap (1-733:45-708)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
                                     ..:.:. :...:: :: :. ::..    . 
CCDS11 PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
           20        30        40        50        60        70    

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
       ...:::..:. ::.. .. :  :.: .:....::.:..::: .: :.:....: .  :.:
CCDS11 MMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESL
           80        90       100       110       120       130    

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
       : .:..::..::.: .:.::: .::  .:  .:  ::::.:::::.. :.::.:.. .: 
CCDS11 EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
          140       150       160       170       180       190    

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
       ...::.. ::::.  : .:. : :.:.:.: :::..:: :::.::..:. ..:. :    
CCDS11 LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKEL----
          200       210       220       230       240       250    

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
       . .: .  .  ..:.:.::::.::::::::::::.::::.::..::::::: :: .::::
CCDS11 GGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVV
              260        270       280       290       300         

              280       290       300       310       320          
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRES--P
       ::::::.:: : : ::::::::.: .:::.::::::.: : ::.:::.:::::. ..   
CCDS11 DDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLD
     310       320       330       340       350       360         

      330         340       350         360       370       380    
pF1KSD DSCYS--ERLDRTASPSTSSIDSA--TDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDP
       ::  .  .   . :  :.... :.  .  :: :  :. : : :::: ::.:: :: .: :
CCDS11 DSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQ-VQSVDGNAQCCDCREPAP
     370       380       390       400       410        420        

          390       400       410       420       430       440    
pF1KSD RWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQ
       .:::::::: :::.::::::::::: :::::::::::::::.::::::::  .::::::.
CCDS11 EWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEAR
      430       440       450       460       470       480        

          450       460       470       480       490       500    
pF1KSD CEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPR
        :. . .::  : :::.:::::. :::::::: : :   . .. :        ::...: 
CCDS11 VEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRG-------RPRGQPP
      490       500       510       520       530              540 

          510       520       530       540       550       560    
pF1KSD APTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKG
       .:  . ..: .:           :.:  :                           :.  
CCDS11 VPP-KPSIRPRP-----------GSLRSK---------------------------PEPP
              550                                             560  

          570       580       590       600        610       620   
pF1KSD AESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAA-RARDLPALAAALAHGAEVNWAD
       .:                    :.  :::: :  ::. .  .::..: ::::::.:::..
CCDS11 SE--------------------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVN
                                570       580       590       600  

           630       640       650       660       670       680   
pF1KSD AEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKR
       . ... :::.::. ..::..:::::::::.::: :: ::.::::::.::.:: .::::::
CCDS11 GGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKR
            610       620       630       640       650       660  

           690       700       710       720       730       740   
pF1KSD GADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQ
       :::  : :.: ::::.::...::::::::::::.    ::::::: :  :          
CCDS11 GADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAK----MREAEAAQGQAGDETYLDIFRD
            670       680       690           700       710        

           750               
pF1KSD FRRCIQEFISLHLEES      
                             
CCDS11 FSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
      720       730       740

>>CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1                (903 aa)
 initn: 610 init1: 384 opt: 590  Z-score: 453.7  bits: 94.9 E(32554): 6e-19
Smith-Waterman score: 651; 28.5% identity (60.0% similar) in 498 aa overlap (4-483:65-548)

                                          10        20          30 
pF1KSD                            MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDL--SQQCQGDTV
                                     .: ..: . . .  .:..:  :.  :..  
CCDS23 RGAALAREEILEGDQAILQRIKKAVRAIHSSGLGHVENEEQYREAVESLGNSHLSQNSHE
           40        50        60        70        80        90    

              40        50        60        70         80        90
pF1KSD ISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKE-TKKQFDKVREDL
       .:  .  .:   .::.     :... .  :   :.:..: ..:  .. .:::..:. .: 
CCDS23 LSTGFLNLAVFTREVAALFKNLIQNLNNIVSFPLDSLMKGQLRDGRQDSKKQLEKAWKDY
          100       110       120       130       140       150    

               100            110       120       130       140    
pF1KSD ELSLVR-NAQAPRHR-----PHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEI
       : .... . .  : :     : :: .    .   :. :.    .:.:. .  : :.  ..
CCDS23 EAKMAKLEKERDRARVTGGIPGEVAQD---MQRERRIFQLHMCEYLLKAGESQMKQGPDF
          160       170       180          190       200       210 

          150       160       170       180         190         200
pF1KSD LDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQL--VIDSAVEKREMERK--HAA
       :.:...:.::: .:::.:..  ..: :...:::: .  :  . .. ..:  . :   ...
CCDS23 LQSLIKFFHAQHNFFQDGWKAAQSLFPFIEKLAASVHALHQAQEDELQKLTQLRDSLRGT
             220       230       240       250       260       270 

              210       220            230       240       250     
pF1KSD IQQRTLLQDFSYDESKVEFDV-----DAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQ
       .: ..  . .:  .:   ...     .   :.   :.:.:....  ..:..:  ... . 
CCDS23 LQLESREEHLSRKNSGCGYSIHQHQGNKQFGTEKVGFLYKKSDGIRRVWQKRKCGVKYGC
             280       290       300       310       320       330 

         260       270       280       290       300       310     
pF1KSD LVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQA
       :. ...  .   : .  :  :.:.:  . :.. ::.... ...  .::..:.  .:::..
CCDS23 LTISHSTINRPPVKLT-LLTCQVRP--NPEEKKCFDLVTHNRTYHFQAEDEHECEAWVSV
             340        350         360       370       380        

         320       330       340       350       360       370     
pF1KSD VQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQ
       .:        .: :   :  .    : . .:  ::    :     . .. .:.:  ::::
CCDS23 LQ--------NSKDEALSSAFLGEPSAGPGSWGSAGHDGEPHDLTKLLIAEVKSRPGNSQ
      390               400       410       420       430       440

         380       390       400       410       420       430     
pF1KSD CGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNS
       : :::  :: : : ::::: ::.:::.:: :::. :...:::::   :  : :  ..::.
CCDS23 CCDCGAADPTWLSTNLGVLTCIQCSGVHRELGVRFSRMQSLTLDLLGPSELLLALNMGNT
              450       460       470       480       490       500

         440       450       460       470       480       490     
pF1KSD AVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQK
       . :...:::  . :. ::.: :.   .. .:  ::::..: :.    :            
CCDS23 SFNEVMEAQLPSHGGPKPSAESDMGTRRDYIMAKYVEHRFARRCTPEPQRLWTAICNRDL
              510       520       530       540       550       560

         500       510       520       530       540       550     
pF1KSD CLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAG
                                                                   
CCDS23 LSVLEAFANGQDFGQPLPGPDAQAPEELVLHLAVKVANQASLPLVDFIIQNGGHLDAKAA
              570       580       590       600       610       620

>>CCDS44087.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1              (894 aa)
 initn: 610 init1: 384 opt: 560  Z-score: 431.4  bits: 90.8 E(32554): 1e-17
Smith-Waterman score: 621; 28.3% identity (59.5% similar) in 491 aa overlap (4-483:65-539)

                                          10        20          30 
pF1KSD                            MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDL--SQQCQGDTV
                                     .: ..: . . .  .:..:  :.  :..  
CCDS44 RGAALAREEILEGDQAILQRIKKAVRAIHSSGLGHVENEEQYREAVESLGNSHLSQNSHE
           40        50        60        70        80        90    

              40        50        60        70        80        90 
pF1KSD ISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLE
       .:  .  .:   .::.     :... .  :   :.:..: ..:  .... .. . :  ::
CCDS44 LSTGFLNLAVFTREVAALFKNLIQNLNNIVSFPLDSLMKGQLRDGRQASLSLGS-RAKLE
          100       110       120       130       140        150   

             100       110       120       130       140       150 
pF1KSD LSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSF
           : :..    : :: .    .   :. :.    .:.:. .  : :.  ..:.:...:
CCDS44 KERDR-ARVTGGIPGEVAQD---MQRERRIFQLHMCEYLLKAGESQMKQGPDFLQSLIKF
            160       170          180       190       200         

             160       170       180         190         200       
pF1KSD MHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQL--VIDSAVEKREMERK--HAAIQQRTLL
       .::: .:::.:..  ..: :...:::: .  :  . .. ..:  . :   ....: ..  
CCDS44 FHAQHNFFQDGWKAAQSLFPFIEKLAASVHALHQAQEDELQKLTQLRDSLRGTLQLESRE
     210       220       230       240       250       260         

       210       220            230       240       250       260  
pF1KSD QDFSYDESKVEFDV-----DAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKL
       . .:  .:   ...     .   :.   :.:.:....  ..:..:  ... . :. ... 
CCDS44 EHLSRKNSGCGYSIHQHQGNKQFGTEKVGFLYKKSDGIRRVWQKRKCGVKYGCLTISHST
     270       280       290       300       310       320         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KSD KDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIAS
        .   : .  :  :.:.:  . :.. ::.... ...  .::..:.  .:::...:     
CCDS44 INRPPVKLT-LLTCQVRP--NPEEKKCFDLVTHNRTYHFQAEDEHECEAWVSVLQ-----
     330        340         350       360       370       380      

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD AYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQP
          .: :   :  .    : . .:  ::    :     . .. .:.:  ::::: :::  
CCDS44 ---NSKDEALSSAFLGEPSAGPGSWGSAGHDGEPHDLTKLLIAEVKSRPGNSQCCDCGAA
                390       400       410       420       430        

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD DPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYE
       :: : : ::::: ::.:::.:: :::. :...:::::   :  : :  ..::.. :...:
CCDS44 DPTWLSTNLGVLTCIQCSGVHRELGVRFSRMQSLTLDLLGPSELLLALNMGNTSFNEVME
      440       450       460       470       480       490        

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD AQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSS
       ::  . :. ::.: :.   .. .:  ::::..: :.    :                   
CCDS44 AQLPSHGGPKPSAESDMGTRRDYIMAKYVEHRFARRCTPEPQRLWTAICNRDLLSVLEAF
      500       510       520       530       540       550        

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD PRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPR
                                                                   
CCDS44 ANGQDFGQPLPGPDAQAPEELVLHLAVKVANQASLPLVDFIIQNGGHLDAKAADGNTALH
      560       570       580       590       600       610        

>>CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7             (580 aa)
 initn: 587 init1: 364 opt: 443  Z-score: 346.3  bits: 74.4 E(32554): 5.7e-13
Smith-Waterman score: 483; 32.3% identity (58.1% similar) in 341 aa overlap (192-488:137-453)

             170       180       190       200       210       220 
pF1KSD GYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDV
                                     :.. .... :       :.. ... .:  :
CCDS64 YSSSVPSTPSISQRELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLDREKKAAECKV
        110       120       130       140       150       160      

                 230       240        250        260               
pF1KSD DA-PSGVVM---EGYLFKRASNAF-KTWNRRWFSI-QNSQLVYQKKLKDAL---------
       :.  :: ..   .: :.::..... : :.... .. .:. :.:. .:.: .         
CCDS64 DSIGSGRAIPIKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEID
        170       180       190       200       210       220      

            270       280                               290        
pF1KSD ----TVVVDDLRLCSVKPCE-----------DIERR-------------FCFEVLSPT-K
           :: :   ::  . :             ..::              : : :.: : .
CCDS64 LLRTTVKVPGKRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTEAEESFEFVVVSLTGQ
        230       240       250       260       270       280      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD SCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERG
       .  ..:.. . :. :::.:::.: .. .    .: : . :.:              :  .
CCDS64 TWHFEASTAEERELWVQSVQAQILASLQ----GCRSAK-DKT--------------RLGN
        290       300       310           320                      

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD VKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLT
        ..  ..: :..: ::: : ::  :.: :::.:::.:.::::::::: ::.: :.:::: 
CCDS64 QNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIHRHLGAHLSRVRSLD
       330       340       350       360       370       380       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD LDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLR
       ::.: :::: .:  .::. .:...:.    .:  ::  .. :..:: ::. :: .: :: 
CCDS64 LDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGAL--GGYSKPGPDACREEKERWIRAKYEQKLFL-
       390       400       410         420       430       440     

       480       490       500       510       520       530       
pF1KSD KAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRD
        ::. :. ..:                                                 
CCDS64 -APL-PSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHLSSAMA
            450       460       470       480       490       500  

>>CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7             (911 aa)
 initn: 534 init1: 364 opt: 443  Z-score: 344.2  bits: 74.7 E(32554): 7.5e-13
Smith-Waterman score: 480; 40.9% identity (65.9% similar) in 208 aa overlap (282-488:601-784)

             260       270       280       290        300       310
pF1KSD QNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQ
                                     :. :. : : :.: : ..  ..:.. . :.
CCDS43 PPPSPHSNRKKHRRKKSTGTPRPDGPSSATEEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERE
              580       590       600       610       620       630

              320       330       340       350       360       370
pF1KSD AWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSV
        :::.:::.: .. .    .: : . :.:              :  . ..  ..: :..:
CCDS43 LWVQSVQAQILASLQ----GCRSAK-DKT--------------RLGNQNAALAVQAVRTV
              640           650                      660       670 

              380       390       400       410       420       430
pF1KSD AGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMC
        ::: : ::  :.: :::.:::.:.::::::::: ::.: :.:::: ::.: :::: .: 
CCDS43 RGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIHRHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMT
             680       690       700       710       720       730 

              440       450       460       470       480       490
pF1KSD ELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRR
        .::. .:...:.    .:  ::  .. :..:: ::. :: .: ::  ::. :. ..:  
CCDS43 AMGNALANSVWEGAL--GGYSKPGPDACREEKERWIRAKYEQKLFL--APL-PSSDVPLG
             740         750       760       770          780      

              500       510       520       530       540       550
pF1KSD WRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFS
                                                                   
CCDS43 QQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHLSSAMANVVFTQLLIWYGV
        790       800       810       820       830       840      

>>CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10             (663 aa)
 initn: 459 init1: 344 opt: 436  Z-score: 340.5  bits: 73.5 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 478; 42.4% identity (68.2% similar) in 198 aa overlap (290-486:388-561)

     260       270       280       290        300       310        
pF1KSD KKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQAWVQAVQA
                                     : ..: : ..  ..: . . :.:::::.:.
CCDS72 ISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQS
       360       370       380       390       400       410       

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD SIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGD
       .: .. .    :: :       : : :.. : . .         .:: .:.. ::..: :
CCDS72 QILASLQ----SCES-------SKSKSQLTSQSKAM--------ALQSIQNMRGNAHCVD
       420                  430       440               450        

      380       390       400       410       420       430        
pF1KSD CGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVN
       :   .:.:::.:::::.::::::::::::.. :.:::: ::.:  :: :.:  .::. .:
CCDS72 CETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLAN
      460       470       480       490       500       510        

      440       450       460       470       480       490        
pF1KSD QIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLR
       .:.:.. .  :. ::. .:.:..:: ::..:: :: ::  ::. :  :            
CCDS72 SIWEGSSQ--GQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFL--APL-PCTELSLGQQLLRATA
      520         530       540       550          560       570   

      500       510       520       530       540       550        
pF1KSD PHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAG
                                                                   
CCDS72 DEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAH
           580       590       600       610       620       630   

>>CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10            (686 aa)
 initn: 452 init1: 339 opt: 436  Z-score: 340.3  bits: 73.5 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 476; 42.4% identity (67.7% similar) in 198 aa overlap (290-486:411-584)

     260       270       280       290        300       310        
pF1KSD KKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQAWVQAVQA
                                     : ..: : ..  ..: . . :.:::::.:.
CCDS44 ISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQS
              390       400       410       420       430       440

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD SIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGD
       .: .. .    :: :       : : :.. : ...         .:: .:.. ::..: :
CCDS44 QILASLQ----SCES-------SKSKSQLTSQSEAM--------ALQSIQNMRGNAHCVD
                  450              460               470       480 

      380       390       400       410       420       430        
pF1KSD CGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVN
       :   .:.:::.:::::.:::::::::::: : :.:::: ::.:  :: :.:  . :. .:
CCDS44 CETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGPHLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIVNDLAN
             490       500       510       520       530       540 

      440       450       460       470       480       490        
pF1KSD QIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLR
       .:.:.. .  :. ::. .:.:..:: ::..:: :: ::  ::. :  :            
CCDS44 SIWEGSSQ--GQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFL--APL-PCTELSLGQQLLRATA
               550       560       570         580        590      

      500       510       520       530       540       550        
pF1KSD PHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAG
                                                                   
CCDS44 DEDLQTAILLLAHGSCEEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAH
        600       610       620       630       640       650      

>>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2              (804 aa)
 initn: 490 init1: 341 opt: 434  Z-score: 338.1  bits: 73.4 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 472; 39.8% identity (66.5% similar) in 206 aa overlap (282-486:495-676)

             260       270       280       290        300       310
pF1KSD QNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPT-KSCMLQADSEKLRQ
                                     :. :. : : ..: : ..  ..: . . :.
CCDS25 PPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERD
          470       480       490       500       510       520    

              320       330       340       350       360       370
pF1KSD AWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSV
       :::::....: .. .    :: :       : . : . : ...         .:: ....
CCDS25 AWVQAIESQILASLQ----SCES-------SKNKSRLTSQSEAM--------ALQSIRNM
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pF1KSD AGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMC
        :::.: ::   .: :::.:::.:.:::::::::.::.: :.:::: ::.:  ::.:.: 
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pF1KSD ELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRR
        .::  .:...: . .:    ::...:.:..:: ::. :: .: ::  ::. :  :    
CCDS25 SIGNELANSVWEESSQG--RTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFL--APL-PCTELSLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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