seq1 = pF1KSDA1716.tfa, 2277 bp seq2 = pF1KSDA1716/gi568815597r_1193567.tfa (gi568815597r:1193567_1403260), 209694 bp >pF1KSDA1716 2277 >gi568815597r:1193567_1403260 (Chr1) (complement) 1-99 (100001-100099) 100% -> 100-153 (100286-100339) 100% -> 154-212 (101215-101273) 100% -> 213-396 (102569-102752) 100% -> 397-441 (103059-103103) 100% -> 442-537 (103193-103288) 100% -> 538-624 (103356-103435) 91% -> 625-737 (104582-104694) 100% -> 738-789 (104840-104891) 100% -> 790-890 (105148-105248) 100% -> 891-1002 (105328-105439) 100% -> 1003-1211 (106628-106836) 100% -> 1212-1281 (106981-107050) 100% -> 1282-1376 (107152-107246) 100% -> 1377-1579 (107323-107525) 100% -> 1580-1687 (107707-107814) 100% -> 1688-1914 (108633-108859) 100% -> 1915-2024 (109062-109171) 100% -> 2025-2135 (109328-109438) 100% -> 2136-2277 (109553-109694) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAG 50 . : . : . : . : . : 51 CGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 100051 CGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCGG 100 . : . : . : . : . : 100 GAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTG >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TG...CAGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTG 150 . : . : . : . : . : 142 AACTACCACATG ATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGT ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 100328 AACTACCACATGGTG...CAGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGT 200 . : . : . : . : . : 183 GCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGA GGATGTGCGGA ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 101244 GCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGTG...CAGGGATGTGCGGA 250 . : . : . : . : . : 224 AGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102580 AGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAG 300 . : . : . : . : . : 274 CTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102630 CTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGT 350 . : . : . : . : . : 324 GGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102680 GGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACC 400 . : . : . : . : . : 374 TGGCACTGGACTATGTGCTCCAG ATCAATGTTCTGCAGGCC |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 102730 TGGCACTGGACTATGTGCTCCAGGTC...CAGATCAATGTTCTGCAGGCC 450 . : . : . : . : . : 415 AAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCT ATGCTGTCCTTCAT |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 103077 AAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTGTG...CAGATGCTGTCCTTCAT 500 . : . : . : . : . : 456 GCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103207 GCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGC 550 . : . : . : . : . : 506 TGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAG CTGGACCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 103257 TGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGGTG...CAGCTGGACCAG 600 . : . : . : . : . : 547 CTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103365 CTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGC 650 . : . : . : . : . : 597 CGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAG GACTTCTCCTACG ||||||||||||||||--|-||----||>>>...>>>||||||||||||| 103415 CGCCATCCAGCAGCGG G TG AGGCC...CAGGACTTCTCCTACG 700 . : . : . : . : . : 638 ATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104595 ATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATG 750 . : . : . : . : . : 688 GAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104645 GAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCG 800 . : . : . : . : . : 738 GCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104695 GTG...TAGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGA 850 . : . : . : . : . : 779 AGAAGCTCAAG GATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTC |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 104881 AGAAGCTCAAGGTG...CAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTC 900 . : . : . : . : . : 820 CGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105178 CGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTT 950 . : . : . : . : . : 870 CGAGGTGCTGTCACCCACCAA GAGCTGCATGCTGCAGGCTG |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 105228 CGAGGTGCTGTCACCCACCAAGTG...CAGGAGCTGCATGCTGCAGGCTG 1000 . : . : . : . : . : 911 ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105348 ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATC 1050 . : . : . : . : . : 961 GCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 105398 GCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGGTG...CA 1100 . : . : . : . : . : 1003 AGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCA >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106627 GAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCA 1150 . : . : . : . : . : 1052 CCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106677 CCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTG 1200 . : . : . : . : . : 1102 CAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106727 CAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCC 1250 . : . : . : . : . : 1152 CCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106777 CCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCG 1300 . : . : . : . : . : 1202 GCATCCACAG GAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 106827 GCATCCACAGGTG...CAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGG 1350 . : . : . : . : . : 1243 TCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAG CT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 107012 TCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGGTG...TAGCT 1400 . : . : . : . : . : 1284 GATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107154 GATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGT 1450 . : . : . : . : . : 1334 GTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 107204 GTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGTG...C 1500 . : . : . : . : . : 1377 GCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTT >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107321 AGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTT 1550 . : . : . : . : . : 1425 TCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107371 TCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGA 1600 . : . : . : . : . : 1475 GGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107421 GGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCC 1650 . : . : . : . : . : 1525 CGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107471 CGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTC 1700 . : . : . : . : . : 1575 CTCAG TGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107521 CTCAGGTG...CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCC 1750 . : . : . : . : . : 1616 TCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107743 TCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGG 1800 . : . : . : . : . : 1666 GCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCA AGGGTGCAGAGTCGGAGGA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 107793 GCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTA...CAGAGGGTGCAGAGTCGGAGGA 1850 . : . : . : . : . : 1707 GTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108652 GTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGG 1900 . : . : . : . : . : 1757 CGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108702 CGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGT 1950 . : . : . : . : . : 1807 GCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108752 GCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGT 2000 . : . : . : . : . : 1857 CAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108802 CAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCG 2050 . : . : . : . : . : 1907 TGCTAGGG GGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAA ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 108852 TGCTAGGGGTG...CAGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAA 2100 . : . : . : . : . : 1948 AACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109095 AACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCA 2150 . : . : . : . : . : 1998 CCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGG CCAGGTTTGCCTGT |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 109145 CCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGGTG...CAGCCAGGTTTGCCTGT 2200 . : . : . : . : . : 2039 TCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109342 TCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGAC 2250 . : . : . : . : . : 2089 CCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 109392 CCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGTG 2300 . : . : . : . : . : 2136 GCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109442 ...TAGGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGG 2350 . : . : . : . : . : 2180 CTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109597 CTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAG 2400 . : . : . : . : . 2230 TTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109647 TTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC