Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1599
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1599, 593 aa
  1>>>pF1KSDA1599 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3918+/-0.000904; mu= 10.5035+/- 0.055
 mean_var=120.3182+/-23.905, 0's: 0 Z-trim(110.2): 45  B-trim: 85 in 2/51
 Lambda= 0.116925
 statistics sampled from 11402 (11445) to 11402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.352), width:  16
 Scan time:  2.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6          ( 593) 3970 680.7 1.4e-195
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12        ( 564) 2439 422.5 7.4e-118
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3         ( 553) 2379 412.3 8.1e-115
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3        ( 503) 2085 362.7 6.3e-100
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6         ( 301) 1982 345.2 6.9e-95
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3         ( 557) 1472 259.3 9.3e-69
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3        ( 575) 1472 259.3 9.5e-69
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8           ( 537) 1453 256.1 8.3e-68
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16       ( 548) 1444 254.6 2.4e-67
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20         ( 537) 1432 252.6 9.6e-67
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20         ( 542) 1432 252.6 9.7e-67
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14          ( 557) 1406 248.2 2.1e-65
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14         ( 612) 1406 248.2 2.3e-65
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16        ( 558) 1375 243.0 7.8e-64
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16        ( 633) 1366 241.5 2.5e-63


>>CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6               (593 aa)
 initn: 3970 init1: 3970 opt: 3970  Z-score: 3624.8  bits: 680.7 E(32554): 1.4e-195
Smith-Waterman score: 3970; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD RSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590   
pF1KSD RLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
              550       560       570       580       590   

>>CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12             (564 aa)
 initn: 3141 init1: 2412 opt: 2439  Z-score: 2229.4  bits: 422.5 E(32554): 7.4e-118
Smith-Waterman score: 3106; 77.6% identity (90.4% similar) in 586 aa overlap (8-593:9-564)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
               :.......:...::::.::..::::::::.: ::::::.::.:.::. ::.:
CCDS87 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
       ::::::::::::::::::::::.::::::..::::::::::::::.:::::::::.::::
CCDS87 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
       :::::: :::::::..                    :.::::::::::.::::. :::..
CCDS87 GEIVGSQGSRLEKPIV--------------------GIPGKKCGTIILTAEELNCCRDAV
              130                           140       150       160

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
        ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:.: ::::
CCDS87 LMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGSFTICHKTEVVKNTLNPVWQAFKISVRAL
              170       180       190       200       210       220

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: :::::.
CCDS87 CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSRGQSQFNVYEVVNPKKKGKKKKYT
              230       240       250       260       270       280

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
       :::::::::: ::.: .::::::::::::::::::::::::::.: ::::::.:::::::
CCDS87 NSGTVTLLSFLVETEVSFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPAQPTSLHYMNPYQLNAY
              290       300       310       320       330       340

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
       ..:: :::::.: :::::::::::::::::::::.:::: :::: .:: : ::.:..:::
CCDS87 GMALKAVGEIVQDYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRISHEFALNGNPQNPYCDGIEGVMEAY
              350       360       370       380       390       400

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
       .:::..::::::::::::..:::: :..:.::::: ::::.:::::::::::::.::::.
CCDS87 YRSLKSVQLYGPTNFAPVINHVARYASSVKDGSQYFVLLIVTDGVISDMAQTKESIVNAS
              410       420       430       440       450       460

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
       :::::::::::: :::::::::::::::.::::: ::::::::::::::.::.:::.:::
CCDS87 KLPMSIIIVGVGPAEFDAMVELDGDDVRVSSRGKYAERDIVQFVPFRDYIDRSGNHILSM
              470       480       490       500       510       520

     540       550       560       570       580       590   
pF1KSD ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
       ::::.:::::::.:..:::.:.::.: : :          :  :::.  :.:.:
CCDS87 ARLAKDVLAEIPEQFLSYMRARGIKPSPAP----------PPYTPPTHVLQTQI
              530       540       550                 560    

>>CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3              (553 aa)
 initn: 2969 init1: 2363 opt: 2379  Z-score: 2174.9  bits: 412.3 E(32554): 8.1e-115
Smith-Waterman score: 2918; 76.1% identity (89.8% similar) in 568 aa overlap (19-585:10-553)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
                         :.::::.::::::::::: : ::::::. :.:::.  ...::
CCDS25          MSLGGASERSVPATKIEITVSCRNLLDLDTFSKSDPMVVLYTQSRASQEWR
                        10        20        30        40        50 

               70        80        90       100        110         
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSK-HDFLGQAFCTL
       ::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:.::::. ..:: .::::::: .:
CCDS25 EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFVLDYFFEEKQNLRFDVYNVDSKT-NISKPKDFLGQAFLAL
              60        70        80        90        100       110

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
       ::..:. :::.:. ::                    ::::::::::.:.:::::::::.:
CCDS25 GEVIGGQGSRVERTLT--------------------GVPGKKCGTILLTAEELSNCRDIA
              120                           130       140       150

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::
CCDS25 TMQLCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVVKNTLNPVWQPFSIPVRAL
              160       170       180       190       200       210

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
       ::::::::.:..:::::::::::::::::::::::...:.::..:::.::.:: ::::::
CCDS25 CNGDYDRTVKIDVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSKAQNQFTVYEVLNPRKKCKKKKYV
              220       230       240       250       260       270

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
       ::::::::::.:.:: ::.::::::::.::::::::::::::: : :::::::::::.::
CCDS25 NSGTVTLLSFSVDSEFTFVDYIKGGTQLNFTVAIDFTASNGNPLQPTSLHYMSPYQLSAY
              280       290       300       310       320       330

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
       :.:: ::::::: :::::.::: ::::::::.::.::.::::.:.:.:.: ::.:.::.:
CCDS25 AMALKAVGEIIQDYDSDKLFPAYGFGAKLPPEGRISHQFPLNNNDEDPNCAGIEGVLESY
              340       350       360       370       380       390

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
        .::::::::::: ::::...::: :: ..::::: :::::::::::::.:::::::.:.
CCDS25 FQSLRTVQLYGPTYFAPVINQVARAAAKISDGSQYYVLLIITDGVISDMTQTKEAIVSAS
              400       410       420       430       440       450

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
       .::::::::::: : :.:: ::::::::.::::. :::::::::::::::::.::.::::
CCDS25 SLPMSIIIVGVGPAMFEAMEELDGDDVRVSSRGRYAERDIVQFVPFRDYVDRSGNQVLSM
              460       470       480       490       500       510

     540       550       560       570       580       590   
pF1KSD ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
       ::::.:::::::.::.:::... :.::::: :   .::  ::   :        
CCDS25 ARLAKDVLAEIPEQLLSYMRTRDIQPRPPPPA---NPSPIPAPEQP        
              520       530       540          550           

>>CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3             (503 aa)
 initn: 2659 init1: 2085 opt: 2085  Z-score: 1907.5  bits: 362.7 E(32554): 6.3e-100
Smith-Waterman score: 2624; 77.0% identity (90.5% similar) in 504 aa overlap (19-521:10-492)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
                         :.::::.::::::::::: : ::::::. :.:::.  ...::
CCDS77          MSLGGASERSVPATKIEITVSCRNLLDLDTFSKSDPMVVLYTQSRASQEWR
                        10        20        30        40        50 

               70        80        90       100        110         
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSK-HDFLGQAFCTL
       ::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:.::::. ..:: .::::::: .:
CCDS77 EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFVLDYFFEEKQNLRFDVYNVDSKT-NISKPKDFLGQAFLAL
              60        70        80        90        100       110

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
       ::..:. :::.:. ::                    ::::::::::.:.:::::::::.:
CCDS77 GEVIGGQGSRVERTLT--------------------GVPGKKCGTILLTAEELSNCRDIA
              120                           130       140       150

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::
CCDS77 TMQLCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVVKNTLNPVWQPFSIPVRAL
              160       170       180       190       200       210

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYV
       ::::::::.:..:::::::::::::::::::::::...:.::..:::.::.:: ::::::
CCDS77 CNGDYDRTVKIDVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELSKAQNQFTVYEVLNPRKKCKKKKYV
              220       230       240       250       260       270

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
       ::::::::::.:.:: ::.::::::::.::::::::::::::: : :::::::::::.::
CCDS77 NSGTVTLLSFSVDSEFTFVDYIKGGTQLNFTVAIDFTASNGNPLQPTSLHYMSPYQLSAY
              280       290       300       310       320       330

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
       :.:: ::::::: :::::.::: ::::::::.::.::.::::.:.:.:.: ::.:.::.:
CCDS77 AMALKAVGEIIQDYDSDKLFPAYGFGAKLPPEGRISHQFPLNNNDEDPNCAGIEGVLESY
              340       350       360       370       380       390

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAA
        .::::::::::: ::::...::: :: ..::::: :::::::::::::.:::::::.:.
CCDS77 FQSLRTVQLYGPTYFAPVINQVARAAAKISDGSQYYVLLIITDGVISDMTQTKEAIVSAS
              400       410       420       430       440       450

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD KLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSM
       .::::::::::: : :.:: ::::::::.::::. :::::::                  
CCDS77 SLPMSIIIVGVGPAMFEAMEELDGDDVRVSSRGRYAERDIVQEGCCSLGTSVV       
              460       470       480       490       500          

     540       550       560       570       580       590   
pF1KSD ARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI

>>CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6              (301 aa)
 initn: 1982 init1: 1982 opt: 1982  Z-score: 1817.0  bits: 345.2 E(32554): 6.9e-95
Smith-Waterman score: 1982; 100.0% identity (100.0% similar) in 301 aa overlap (293-593:1-301)

            270       280       290       300       310       320  
pF1KSD FIGEFTTSYRELARGQSQFNIYEVVNPKKKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83                               MKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIK
                                             10        20        30

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD GGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPAL
               40        50        60        70        80        90

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD GFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVA
              100       110       120       130       140       150

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD RNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RNAAAVQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELD
              160       170       180       190       200       210

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD GDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GDDVRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQG
              220       230       240       250       260       270

            570       580       590   
pF1KSD IRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
              280       290       300 

>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3              (557 aa)
 initn: 1542 init1: 653 opt: 1472  Z-score: 1347.9  bits: 259.3 E(32554): 9.3e-69
Smith-Waterman score: 1734; 50.2% identity (74.9% similar) in 550 aa overlap (23-566:24-543)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
                              ::::. :.:... :.: .:: ::  ..  :.  . ::
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQS--HGQW
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
        :  ::::: . .:: . . : ::..::: : :::...:..:.   :.. ::::   :::
CCDS30 FEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTL
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
       :.::..   .: : :                 ...:.. ::.  :.:  :::::.  : .
CCDS30 GQIVSQ--RKLSKSL-----------------LKHGNTAGKSSITVI--AEELSGNDDYV
      120         130                        140         150       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
        . : : ::: ::::.:::::: ..: :.:.:  . :.:::. :.:.:.:..:.. : .:
CCDS30 ELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSL
       160       170       180       190       200       210       

     240       250       260       270         280       290       
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARG--QSQFNIYEVVNPKKKMKKKK
       :.:: :: .:  :.::: .:.::::::::....:. ::  ...   .: .::: : :::.
CCDS30 CSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEM-RGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKN
       220       230       240       250        260       270      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD YVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLN
       : ::::: :    ...  .::::: :: ::.::::::::::::.: .: ::::. ::: :
CCDS30 YKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPN
        280       290       300       310       320       330      

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD AYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILE
        :  ::.::::: : :::::::::.::::..::.  :::.: .: :..:: : ::.:..:
CCDS30 EYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVE
        340       350       360       370       380       390      

       420       430       440          450       460       470    
pF1KSD AYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAA---VQDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEA
       ::.  :  .:::::::.::.. .::..:.    ....::: .:::.:::::.:::.:.::
CCDS30 AYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREA
        400       410       420       430       440       450      

          480       490       500        510       520       530   
pF1KSD IVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDD-VRISSRGKLAERDIVQFVPFRDYVDRTG
       ::.:..::::.::::::.:.:. :  ::::: .  : .:. . ::::::::::..     
CCDS30 IVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNF-----
        460       470       480       490       500       510      

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD NHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
       .:. : : ::..::::.:.:.:.:....::.:.                           
CCDS30 KHA-SPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP             
              520       530       540       550                    

>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3             (575 aa)
 initn: 1542 init1: 653 opt: 1472  Z-score: 1347.7  bits: 259.3 E(32554): 9.5e-69
Smith-Waterman score: 1734; 50.2% identity (74.9% similar) in 550 aa overlap (23-566:42-561)

                       10        20        30        40        50  
pF1KSD         MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQ
                                     ::::. :.:... :.: .:: ::  ..  :
CCDS75 KRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQ
              20        30        40        50        60        70 

             60        70        80        90       100       110  
pF1KSD GMENKQWREFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFL
       .  . :: :  ::::: . .:: . . : ::..::: : :::...:..:.   :.. :::
CCDS75 S--HGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFL
                80        90       100       110       120         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KSD GQAFCTLGEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEEL
       :   ::::.::..   .: : :                 ...:.. ::.  :.:  ::::
CCDS75 GGMECTLGQIVSQ--RKLSKSL-----------------LKHGNTAGKSSITVI--AEEL
     130       140                          150       160          

            180       190       200       210       220       230  
pF1KSD SNCRDVATMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTF
       :.  : . . : : ::: ::::.:::::: ..: :.:.:  . :.:::. :.:.:.:..:
CCDS75 SGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSF
      170       180       190       200       210       220        

            240       250       260       270         280       290
pF1KSD SIPVRALCNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARG--QSQFNIYEVVNPK
       .. : .::.:: :: .:  :.::: .:.::::::::....:. ::  ...   .: .:::
CCDS75 KVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEM-RGAMEGKQVQWECINPK
      230       240       250       260       270        280       

              300       310       320       330       340       350
pF1KSD KKMKKKKYVNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHY
        : :::.: ::::: :    ...  .::::: :: ::.::::::::::::.: .: ::::
CCDS75 YKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHY
       290       300       310       320       330       340       

              360       370       380       390       400       410
pF1KSD MSPYQLNAYALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCC
       . ::: : :  ::.::::: : :::::::::.::::..::.  :::.: .: :..:: : 
CCDS75 IHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECA
       350       360       370       380       390       400       

              420       430       440          450       460       
pF1KSD GIDGILEAYHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAA---VQDGSQYSVLLIITDGVISD
       ::.:..:::.  :  .:::::::.::.. .::..:.    ....::: .:::.:::::.:
CCDS75 GIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITD
       410       420       430       440       450       460       

       470       480       490       500        510       520      
pF1KSD MAQTKEAIVNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDD-VRISSRGKLAERDIVQFVPFR
       ::.:.::::.:..::::.::::::.:.:. :  ::::: .  : .:. . ::::::::::
CCDS75 MADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFR
       470       480       490       500       510       520       

        530       540       550       560       570       580      
pF1KSD DYVDRTGNHVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPA
       ..     .:. : : ::..::::.:.:.:.:....::.:.                    
CCDS75 NF-----KHA-SPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP      
            530        540       550       560       570           

        590   
pF1KSD SPLHTHI

>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8                (537 aa)
 initn: 1178 init1: 677 opt: 1453  Z-score: 1330.9  bits: 256.1 E(32554): 8.3e-68
Smith-Waterman score: 1813; 52.1% identity (75.6% similar) in 553 aa overlap (23-570:7-531)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
                             ::: ..::: ::::::. ::::::::.. .   ..:: 
CCDS62                 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLN-TSGQQWY
                               10        20        30         40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
       :  ::: : : :::.: . ::.::.::  :.:.: .::.:.:. .::  ::::.  ::::
CCDS62 EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD EIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVAT
       .::.:  ..: .::..       .::.:          ::  :.: .::::... : :. 
CCDS62 QIVSS--KKLTRPLVM-------KTGRPA---------GK--GSITISAEEIKDNR-VVL
             110              120                  130        140  

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRALC
       ... : :::.::.::::::.: :.... ::.. . :.:::.::.:::::. :.: . .::
CCDS62 FEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLC
            150       160       170       180       190       200  

              250       260       270       280        290         
pF1KSD NGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNI-YEVVNPKKKMKKKKYV
        ::.:.::::: ::.: :::::.:: : :.. .: ... .  . .: .: ::..:::.: 
CCDS62 YGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYK
            210       220       230       240       250       260  

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD NSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNAY
       :::.... .  .  :::::::: :: :.::::..:::.:::.: .  ::::.::  .: :
CCDS62 NSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEY
            270       280       290       300       310       320  

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEAY
         :: .:: .:: ::.::::::.::::..::. .::::::.: :  :: : ::.::.:::
CCDS62 LTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAY
            330       340       350       360       370       380  

     420       430       440          450       460       470      
pF1KSD HRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAAAV---QDGSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAIV
       .  :  ..:::::::.:...:::: :::.   : .::: ::::::::::.:. .:..:::
CCDS62 RSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIV
            390       400       410       420       430       440  

        480       490       500       510        520       530     
pF1KSD NAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSR-GKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGNH
       ::..::::::::::: :.:.::  ::::   . :  :..: ::::::::::.. .   . 
CCDS62 NASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEA
            450       460       470       480       490       500  

         540       550       560       570       580       590   
pF1KSD VLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
             ::. ::::::.:.:.:...  . :   ::                       
CCDS62 ------LAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ                 
                  510       520       530                        

>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16            (548 aa)
 initn: 1091 init1: 669 opt: 1444  Z-score: 1322.5  bits: 254.6 E(32554): 2.4e-67
Smith-Waterman score: 1787; 52.1% identity (75.9% similar) in 547 aa overlap (24-565:25-542)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQW
                               :::..:: .::::.:. :::::.::..:..  : .:
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTEN--NGRW
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTL
        :. :::.  :.::: : .::..:: ::: :.:.: :.: :..:  :..::::::  :.:
CCDS10 IEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSL
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD GEIVGSPGSRLEKPLTIGAFSLNSRTGKPMPAVSNGGVPGKKCGTIILSAEELSNCRDVA
       : ::.:  ... .:: .    ::..     ::       ::  : : ..:.:::. : : 
CCDS10 GTIVSS--KKITRPLLL----LNDK-----PA-------GK--GLITIAAQELSDNR-VI
      120         130                       140         150        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TMQFCANKLDKKDFFGKSDPFLVFYRSNEDGTFTICHKTEVMKNTLNPVWQTFSIPVRAL
       :... . .:::::.:::::::: ::. ..:: . . :.:::.: ::.:::. :..:. .:
CCDS10 TLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSL
       160       170       180       190       200       210       

     240       250       260       270       280        290        
pF1KSD CNGDYDRTIKVEVYDWDRDGSHDFIGEFTTSYRELARGQSQFNI-YEVVNPKKKMKKKKY
       :.::... :.:  ::.: ::.::::::: ::  .. .....  . .: .::::. :::.:
CCDS10 CDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNY
       220       230       240       250       260       270       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD VNSGTVTLLSFAVESECTFLDYIKGGTQINFTVAIDFTASNGNPSQSTSLHYMSPYQLNA
        ::: . : :  .. . .::::: :: :. :::.:::::::::: . .::::..:.  : 
CCDS10 KNSGIIILRSCKINRDYSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNE
       280       290       300       310       320       330       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD YALALTAVGEIIQHYDSDKMFPALGFGAKLPPDGRVSHEFPLNGNQENPSCCGIDGILEA
       :  :. :::.::: ::::::::::::::.:::: .::::: .: :  :: : :.::: .:
CCDS10 YLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQA
       340       350       360       370       380       390       

      420       430       440        450         460       470     
pF1KSD YHRSLRTVQLYGPTNFAPVVTHVARNAA-AVQD--GSQYSVLLIITDGVISDMAQTKEAI
       :   :  ...::::::.:.:.:::: :: :.:.  ..:: .:::::::::::: .:..:.
CCDS10 YSACLPHIRFYGPTNFSPIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAV
       400       410       420       430       440       450       

         480       490       500       510        520       530    
pF1KSD VNAAKLPMSIIIVGVGQAEFDAMVELDGDDVRISSR-GKLAERDIVQFVPFRDYVDRTGN
       :.:.::::::::::::.:.: ::  ::::.  . :. :. : ::::::::::.. .    
CCDS10 VQASKLPMSIIIVGVGNADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNA---
       460       470       480       490       500       510       

          540       550       560       570       580       590   
pF1KSD HVLSMARLARDVLAEIPDQLVSYMKAQGIRPRPPPAAPTHSPSQSPARTPPASPLHTHI
          .   ::. ::::.:.:.:.:.: ... :                            
CCDS10 ---AKETLAKAVLAELPQQVVQYFKHKNLPPTNSEPA                      
             520       530       540                              

>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20              (537 aa)
 initn: 1230 init1: 684 opt: 1432  Z-score: 1311.7  bits: 252.6 E(32554): 9.6e-67
Smith-Waterman score: 1739; 49.8% identity (74.1% similar) in 564 aa overlap (23-580:6-535)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEQPEDMASLSEFDSLAGSIPATKVEITVSCRNLLDKDMFSKSDPLCVMYTQGMENKQWR
                             : :....:: .:.:::. ::::::::.  : . . .: 
CCDS13                  MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLL-QDVGGGSWA
                                10        20        30         40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EFGRTEVIDNTLNPDFVRKFIVDYFFEEKQNLRFDLYDVDSKSPDLSKHDFLGQAFCTLG
       :.:::: . :  .:.: . . ..: ::  :.::: .::.:.:.:.:   :::: : :.::
CCDS13 ELGRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLG
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