seq1 = pF1KSDA1540.tfa, 1269 bp seq2 = pF1KSDA1540/gi568815587r_94280152.tfa (gi568815587r:94280152_94501247), 221096 bp >pF1KSDA1540 1269 >gi568815587r:94280152_94501247 (Chr11) (complement) 1-387 (100001-100387) 100% -> 388-513 (104724-104849) 100% -> 514-647 (107630-107763) 100% -> 648-1269 (120475-121096) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGTCCCTCACCTCTTGCTGCTCTGTCTCCTCCCCTTGGTGCGAGCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGTCCCTCACCTCTTGCTGCTCTGTCTCCTCCCCTTGGTGCGAGCCAC 50 . : . : . : . : . : 51 CGAGCCCCACGAGGGCCGGGCCGACGAGCAGAGCGCGGAGGCGGCCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CGAGCCCCACGAGGGCCGGGCCGACGAGCAGAGCGCGGAGGCGGCCCTGG 100 . : . : . : . : . : 101 CCGTGCCCAATGCCTCGCACTTCTTCTCTTGGAACAACTACACCTTCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CCGTGCCCAATGCCTCGCACTTCTTCTCTTGGAACAACTACACCTTCTCC 150 . : . : . : . : . : 151 GACTGGCAGAACTTTGTGGGCAGGAGGCGCTACGGCGCTGAGTCCCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 GACTGGCAGAACTTTGTGGGCAGGAGGCGCTACGGCGCTGAGTCCCAGAA 200 . : . : . : . : . : 201 CCCCACGGTGAAAGCCCTGCTCATTGTGGCTTACTCCTTCATCATTGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CCCCACGGTGAAAGCCCTGCTCATTGTGGCTTACTCCTTCATCATTGTCT 250 . : . : . : . : . : 251 TCTCACTCTTTGGCAACGTCCTGGTCTGTCATGTCATCTTCAAGAACCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 TCTCACTCTTTGGCAACGTCCTGGTCTGTCATGTCATCTTCAAGAACCAG 300 . : . : . : . : . : 301 CGAATGCACTCGGCCACCAGCCTCTTCATCGTCAACCTGGCAGTTGCCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 CGAATGCACTCGGCCACCAGCCTCTTCATCGTCAACCTGGCAGTTGCCGA 350 . : . : . : . : . : 351 CATAATGATCACGCTGCTCAACACCCCCTTCACTTTG GTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 100351 CATAATGATCACGCTGCTCAACACCCCCTTCACTTTGGTA...CAGGTTC 400 . : . : . : . : . : 392 GCTTTGTGAACAGCACATGGATATTTGGGAAGGGCATGTGCCATGTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104728 GCTTTGTGAACAGCACATGGATATTTGGGAAGGGCATGTGCCATGTCAGC 450 . : . : . : . : . : 442 CGCTTTGCCCAGTACTGCTCACTGCACGTCTCAGCACTGACACTGACAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104778 CGCTTTGCCCAGTACTGCTCACTGCACGTCTCAGCACTGACACTGACAGC 500 . : . : . : . : . : 492 CATTGCGGTGGATCGCCACCAG GTCATCATGCACCCCTTGA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 104828 CATTGCGGTGGATCGCCACCAGGTG...CAGGTCATCATGCACCCCTTGA 550 . : . : . : . : . : 533 AACCCCGGATCTCAATCACAAAGGGTGTCATCTACATCGCTGTCATCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107649 AACCCCGGATCTCAATCACAAAGGGTGTCATCTACATCGCTGTCATCTGG 600 . : . : . : . : . : 583 ACCATGGCTACGTTCTTTTCACTCCCACATGCTATCTGCCAGAAATTATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107699 ACCATGGCTACGTTCTTTTCACTCCCACATGCTATCTGCCAGAAATTATT 650 . : . : . : . : . : 633 TACCTTCAAATACAG TGAGGACATTGTGCGCTCCCTCTGCC |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 107749 TACCTTCAAATACAGGTG...CAGTGAGGACATTGTGCGCTCCCTCTGCC 700 . : . : . : . : . : 674 TGCCAGACTTCCCTGAGCCAGCTGACCTCTTCTGGAAGTACCTGGACTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120501 TGCCAGACTTCCCTGAGCCAGCTGACCTCTTCTGGAAGTACCTGGACTTG 750 . : . : . : . : . : 724 GCCACCTTCATCCTGCTCTACATCCTGCCCCTCCTCATCATCTCTGTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120551 GCCACCTTCATCCTGCTCTACATCCTGCCCCTCCTCATCATCTCTGTGGC 800 . : . : . : . : . : 774 CTACGCTCGTGTGGCCAAGAAACTGTGGCTGTGTAATATGATTGGCGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120601 CTACGCTCGTGTGGCCAAGAAACTGTGGCTGTGTAATATGATTGGCGATG 850 . : . : . : . : . : 824 TGACCACAGAGCAGTACTTTGCCCTGCGGCGCAAAAAGAAGAAGACCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120651 TGACCACAGAGCAGTACTTTGCCCTGCGGCGCAAAAAGAAGAAGACCATC 900 . : . : . : . : . : 874 AAGATGTTGATGCTGGTGGTAGTCCTCTTTGCCCTCTGCTGGTTCCCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120701 AAGATGTTGATGCTGGTGGTAGTCCTCTTTGCCCTCTGCTGGTTCCCCCT 950 . : . : . : . : . : 924 CAACTGCTACGTCCTCCTCCTGTCCAGCAAGGTCATCCGCACCAACAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120751 CAACTGCTACGTCCTCCTCCTGTCCAGCAAGGTCATCCGCACCAACAATG 1000 . : . : . : . : . : 974 CCCTCTACTTTGCCTTCCACTGGTTTGCCATGAGCAGCACCTGCTATAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120801 CCCTCTACTTTGCCTTCCACTGGTTTGCCATGAGCAGCACCTGCTATAAC 1050 . : . : . : . : . : 1024 CCCTTCATATACTGCTGGCTGAACGAGAACTTCAGGATTGAGCTAAAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120851 CCCTTCATATACTGCTGGCTGAACGAGAACTTCAGGATTGAGCTAAAGGC 1100 . : . : . : . : . : 1074 ATTACTGAGCATGTGTCAAAGACCTCCCAAGCCTCAGGAGGACAGGCAAC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || 120901 ATTACTGAGCATGTGTCAAAGACCTCCCAAGCCTCAGGAGGACAGGCCAC 1150 . : . : . : . : . : 1124 CCTCCCCAGTTCCTTCCTTCAGGGTGGCCTGGACAGAGAAGAATGATGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120951 CCTCCCCAGTTCCTTCCTTCAGGGTGGCCTGGACAGAGAAGAATGATGGC 1200 . : . : . : . : . : 1174 CAGAGGGCTCCCCTTGCCAATAACCTCCTGCCCACCTCCCAACTCCAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121001 CAGAGGGCTCCCCTTGCCAATAACCTCCTGCCCACCTCCCAACTCCAGTC 1250 . : . : . : . : . 1224 TGGGAAGACAGACCTGTCATCTGTGGAACCCATTGTGACGATGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121051 TGGGAAGACAGACCTGTCATCTGTGGAACCCATTGTGACGATGAGT