Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1490
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1490, 748 aa
  1>>>pF1KSDA1490 748 - 748 aa - 748 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8095+/-0.000903; mu= 8.2637+/- 0.054
 mean_var=127.5083+/-26.579, 0's: 0 Z-trim(109.5): 153  B-trim: 472 in 2/52
 Lambda= 0.113581
 statistics sampled from 10772 (10938) to 10772 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.336), width:  16
 Scan time:  4.250

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748) 5101 847.5       0
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687) 3578 598.0 1.7e-170
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709) 3104 520.3 4.1e-147
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755) 3104 520.3 4.3e-147
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568) 3079 516.2 5.7e-146
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718) 3074 515.4 1.2e-145
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720) 2985 500.8 3.1e-141
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694) 2850 478.7 1.4e-134
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609) 1681 287.1 5.6e-77
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642) 1527 261.9 2.3e-69
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587) 1467 252.0 1.9e-66
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574) 1456 250.2 6.6e-66
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555) 1455 250.0 7.2e-66
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593) 1426 245.3 2.1e-64
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597) 1426 245.3 2.1e-64
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568) 1406 242.0 1.9e-63
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505) 1310 226.3 9.4e-59
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624) 1228 212.9 1.3e-54
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571)  987 173.4   9e-43
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585)  987 173.4 9.2e-43
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 655)  941 165.9 1.9e-40
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 639)  940 165.7 2.1e-40
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 613)  936 165.0 3.1e-40
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 658)  936 165.0 3.4e-40
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  935 164.8 3.4e-40
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9          ( 617)  926 163.4 9.9e-40
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  875 155.0 2.9e-37
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  847 150.4 7.6e-36
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  829 147.5 6.1e-35
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6       ( 634)  775 138.6 2.8e-32
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  766 137.2 7.5e-32
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  749 134.4   5e-31
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  731 131.5 5.6e-30
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  717 129.1   2e-29
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  709 127.8   5e-29
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589)  673 121.9 2.9e-27
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427)  670 121.4   3e-27
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496)  670 121.4 3.4e-27
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505)  670 121.4 3.5e-27
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  666 120.8 6.3e-27
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  627 114.4 5.2e-25
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 437)  621 113.3   8e-25
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544)  621 113.4 9.8e-25
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620)  621 113.4 1.1e-24
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  609 111.4 4.3e-24
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  585 107.5 6.2e-23
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  585 107.5 6.2e-23
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 553)  582 107.0 8.3e-23
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516)  561 103.5 8.5e-22
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11      ( 583)  550 101.8 3.3e-21


>>CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13              (748 aa)
 initn: 5101 init1: 5101 opt: 5101  Z-score: 4522.8  bits: 847.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5101; 100.0% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
              670       680       690       700       710       720

              730       740        
pF1KSD DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
              730       740        

>>CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13             (687 aa)
 initn: 3578 init1: 3578 opt: 3578  Z-score: 3174.6  bits: 598.0 E(32554): 1.7e-170
Smith-Waterman score: 4568; 91.8% identity (91.8% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-687)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
CCDS73 YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRL-------------
              130       140       150       160                    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
                                                       ::::::::::::
CCDS73 ------------------------------------------------VLSSVSDYFAAM
                                                       170         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
     180       190       200       210       220       230         

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
     240       250       260       270       280       290         

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
     300       310       320       330       340       350         

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
     360       370       380       390       400       410         

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
     420       430       440       450       460       470         

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
     480       490       500       510       520       530         

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
     540       550       560       570       580       590         

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
     600       610       620       630       640       650         

              730       740        
pF1KSD DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
     660       670       680       

>>CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4              (709 aa)
 initn: 3943 init1: 3067 opt: 3104  Z-score: 2754.6  bits: 520.3 E(32554): 4.1e-147
Smith-Waterman score: 3164; 64.1% identity (82.7% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-708)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
       :::: ::.::::.::..::. :.: . : .. . .    :.:    : :. .:.      
CCDS33 MSGS-RKEFDVKQILKIRWRWFGHQASSPNSTVDS----QQG----EFWNRGQTGA----
                10        20        30                40           

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
         .:   :    : .   .:     ::...  :.   :.:.          .. ::   :
CCDS33 --NGGRKFLDPCSLQLPLASIGYRRSSQLDFQNSPSWPMAST---------SEVPA---F
          50        60        70        80                 90      

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
          . .   .  .: :   :     .: . : :.::      :  : :.......    .
CCDS33 EFTAEDCGGAHWLDRP---EVDDGTSEEENESDSSS------C--RTSNSSQTLSSCHTM
           100          110       120               130       140  

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
       .  .:.::.::..::::::.:::.::...:::::::..:.:.::::::::::::::::::
CCDS33 EPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAM
            150       160       170       180       190       200  

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
       ::.:: ::.::::::::..::.::.:.:.:::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.
CCDS33 FTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEA
            210       220       230       240       250       260  

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
       ::.:::: ::::::::::.::::::: .: ::::.::::..:::::::::.:::: :. :
CCDS33 CCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAK
            270       280       290       300       310       320  

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
       ::::::.:.:.::::..::. ::..:...: .::: :::.:::::: ::.:::.::..::
CCDS33 LLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLF
            330       340       350       360       370       380  

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
       ..:.::::::.:::::::::::: ..:::::::::::::::.::::::..::::.:::::
CCDS33 RDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYD
            390       400       410       420       430       440  

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
       ::::.:  .. ::::::::::::.::::.:.::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS33 LRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMS
            450       460       470       480       490       500  

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
       ::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::..::.:::.::  :::::::.:.:
CCDS33 THRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSG
            510       520       530       540       550       560  

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
       :::.::::::::::.:.: .:::::::..:: : ::::::::.: .:.:::.::::::::
CCDS33 KLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPAS
            570       580       590       600       610       620  

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
       :  ::: : ::::::::: :: :: .:. :::::::::::.::::::::::.::::.:.:
CCDS33 NLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAY
            630       640       650       660       670       680  

              730       740        
pF1KSD DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
       :::::::::.: : .::::::::..:  
CCDS33 DPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL 
            690       700          

>>CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4              (755 aa)
 initn: 3943 init1: 3067 opt: 3104  Z-score: 2754.2  bits: 520.3 E(32554): 4.3e-147
Smith-Waterman score: 3164; 64.1% identity (82.7% similar) in 746 aa overlap (1-746:47-754)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTG
                                     :::: ::.::::.::..::. :.: . : .
CCDS33 AYTSLVLVGCTNLCAVLFARCLDDHLVSLRMSGS-RKEFDVKQILKIRWRWFGHQASSPN
         20        30        40        50         60        70     

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD GPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFN
       . . .    :.:    : :. .:.        .:   :    : .   .:     ::...
CCDS33 STVDS----QQG----EFWNRGQTGA------NGGRKFLDPCSLQLPLASIGYRRSSQLD
          80                90             100       110       120 

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD PLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLFYVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKV
         :.   :.:.          .. ::   :   . .   .  .: :   :     .: . 
CCDS33 FQNSPSWPMAST---------SEVPA---FEFTAEDCGGAHWLDRP---EVDDGTSEEEN
             130                   140       150          160      

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD EPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQ
       : :.::      :  : :.......    ..  .:.::.::..::::::.:::.::...:
CCDS33 ESDSSS------C--RTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQ
        170               180       190       200       210        

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD LCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFA
       ::::::..:.:.::::::::::::::::::::.:: ::.::::::::..::.::.:.:.:
CCDS33 LCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYA
      220       230       240       250       260       270        

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD YTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELM
       ::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.::.:::: ::::::::::.::::::: .: 
CCDS33 YTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLH
      280       290       300       310       320       330        

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD KVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSR
       ::::.::::..:::::::::.:::: :. :::::::.:.:.::::..::. ::..:...:
CCDS33 KVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQR
      340       350       360       370       380       390        

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD CNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPR
        .::: :::.:::::: ::.:::.::..::..:.::::::.:::::::::::: ..::::
CCDS33 RKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPR
      400       410       420       430       440       450        

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD TKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFV
       :::::::::::.::::::..::::.:::::::::.:  .. ::::::::::::.::::.:
CCDS33 TKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYV
      460       470       480       490       500       510        

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD IGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTV
       .::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::.:::::.:::::::::::::::
CCDS33 VGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
      520       530       540       550       560       570        

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD ERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMC
       ::::::..::.:::.::  :::::::.:.::::.::::::::::.:.: .:::::::..:
CCDS33 ERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLC
      580       590       600       610       620       630        

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD APMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPR
       : : ::::::::.: .:.:::.:::::::::  ::: : ::::::::: :: :: .:. :
CCDS33 AQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISR
      640       650       660       670       680       690        

              700       710       720       730       740        
pF1KSD DAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
       ::::::::::.::::::::::.::::.:.::::::::::.: : .::::::::..:  
CCDS33 DAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL 
      700       710       720       730       740       750      

>>CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4              (568 aa)
 initn: 3943 init1: 3067 opt: 3079  Z-score: 2734.0  bits: 516.2 E(32554): 5.7e-146
Smith-Waterman score: 3079; 76.4% identity (93.8% similar) in 567 aa overlap (180-746:1-567)

     150       160       170       180       190       200         
pF1KSD VEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQ
                                     ..  .:.::.::..::::::.:::.::...
CCDS54                               MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHK
                                             10        20        30

     210       220       230       240       250       260         
pF1KSD QLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQF
       :::::::..:.:.::::::::::::::::::::.:: ::.::::::::..::.::.:.:.
CCDS54 QLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQY
               40        50        60        70        80        90

     270       280       290       300       310       320         
pF1KSD AYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIEL
       :::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.::.:::: ::::::::::.::::::: .:
CCDS54 AYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDL
              100       110       120       130       140       150

     330       340       350       360       370       380         
pF1KSD MKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQS
        ::::.::::..:::::::::.:::: :. :::::::.:.:.::::..::. ::..:...
CCDS54 HKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQ
              160       170       180       190       200       210

     390       400       410       420       430       440         
pF1KSD RCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSP
       : .::: :::.:::::: ::.:::.::..::..:.::::::.:::::::::::: ..:::
CCDS54 RRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSP
              220       230       240       250       260       270

     450       460       470       480       490       500         
pF1KSD RTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLF
       ::::::::::::.::::::..::::.:::::::::.:  .. ::::::::::::.::::.
CCDS54 RTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLY
              280       290       300       310       320       330

     510       520       530       540       550       560         
pF1KSD VIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNT
       :.::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::
CCDS54 VVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNT
              340       350       360       370       380       390

     570       580       590       600       610       620         
pF1KSD VERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNM
       :::::::..::.:::.::  :::::::.:.::::.::::::::::.:.: .:::::::..
CCDS54 VERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTL
              400       410       420       430       440       450

     630       640       650       660       670       680         
pF1KSD CAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMP
       :: : ::::::::.: .:.:::.:::::::::  ::: : ::::::::: :: :: .:. 
CCDS54 CAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSIS
              460       470       480       490       500       510

     690       700       710       720       730       740        
pF1KSD RDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
       :::::::::::.::::::::::.::::.:.::::::::::.: : .::::::::..:  
CCDS54 RDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL 
              520       530       540       550       560         

>>CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX              (718 aa)
 initn: 3720 init1: 3058 opt: 3074  Z-score: 2728.0  bits: 515.4 E(32554): 1.2e-145
Smith-Waterman score: 3242; 66.0% identity (83.5% similar) in 752 aa overlap (1-748:1-718)

               10        20        30        40        50          
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWG-PSQSRLLK-
       :: ::.:.::::.::::::. ::::    :.   :.::::.:   .:: : : :.:: . 
CCDS14 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPF--QGSTNTGSCLQQEG---YEHRGTPVQGRLKSH
               10        20          30        40           50     

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD SQERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPART
       :..:.:.    ::       :.::   .  . :. :   : :   :...  :. ::    
CCDS14 SRDRNGL----KK-------SNSPVHHNI-LAPVPG---P-APAHQRAV--QNLQQHNLI
          60                   70            80           90       

       120       130        140       150       160       170      
pF1KSD L-FYVESLEEEVVPGMD-FPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTP
       . : ..    . ::  . :    ::    :.:..  :..     :    ::. : ::   
CCDS14 VHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKRA--QDLEMMADDNI----EDSTARLD-TQHS---
       100       110       120         130           140           

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD QSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDY
         :.... ::: .....:::::.::::.:::..:::::.::.:. .:::::::::.::::
CCDS14 -EDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDY
        150       160       170       180       190       200      

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD FAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQ
       ::::::.:: ::::::..:::.::::: .:::.:::: :.:::::::.:::::::::: :
CCDS14 FAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQ
        210       220       230       240       250       260      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD VVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAE
       :..:: .::.: ::::::::::.:.::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.
CCDS14 VIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPAN
        270       280       290       300       310       320      

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD ELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLEN
       :. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::.
CCDS14 EISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLET
        330       340       350       360       370       380      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KSD HALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTI
        ..: .:::::::..::::::::::::..::::::::::::::.::::::::  ::.:::
CCDS14 SSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTI
        390       400       410       420       430       440      

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD EKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVL
       :::::::: :.. : ::::::::::::::.::.:.::::::::::::::.::  : :::.
CCDS14 EKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVM
        450       460       470       480       490       500      

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD PPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVA
       ::::::::::::..::::.::::::::::::::::::::...::..:::::  ::::::.
CCDS14 PPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVV
        510       520       530       540       550       560      

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD ALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHD
       :::.:::..:::::::::.::::.:::::::..:::: :::::::::: .::::.:::::
CCDS14 ALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHD
        570       580       590       600       610       620      

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD APASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNT
       :::::::::: : ::::::: :.:. :::::.:::::.:: :::.::.::::::.:::::
CCDS14 APASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNT
        630       640       650       660       670       680      

        720       730       740        
pF1KSD MESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
       .:::: : ::: . . .:::::::::::.: :
CCDS14 VESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
        690       700       710        

>>CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX              (720 aa)
 initn: 3631 init1: 2969 opt: 2985  Z-score: 2649.2  bits: 500.8 E(32554): 3.1e-141
Smith-Waterman score: 3153; 65.8% identity (83.8% similar) in 733 aa overlap (1-729:1-699)

               10        20        30        40        50          
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWG-PSQSRLLK-
       :: ::.:.::::.::::::. ::::    :.   :.::::.:   .:: : : :.:: . 
CCDS14 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQ--GSTNTGSCLQQEG---YEHRGTPVQGRLKSH
               10        20          30        40           50     

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD SQERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPART
       :..:.:.    ::       :.::   .  . :. :   :. .. :...  :. ::    
CCDS14 SRDRNGL----KK-------SNSPVHHNI-LAPVPG---PAPAH-QRAV--QNLQQHNLI
          60                   70            80           90       

       120       130        140       150       160       170      
pF1KSD L-FYVESLEEEVVPGMD-FPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTP
       . : ..    . ::  . :    ::    :.:..  :..     :    ::. : ::   
CCDS14 VHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKR--AQDLEMMADDNI----EDSTARLD-TQHS---
       100       110       120         130           140           

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD QSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDY
         :.... ::: .....:::::.::::.:::..:::::.::.:. .:::::::::.::::
CCDS14 -EDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDY
        150       160       170       180       190       200      

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD FAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQ
       ::::::.:: ::::::..:::.::::: .:::.:::: :.:::::::.:::::::::: :
CCDS14 FAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQ
        210       220       230       240       250       260      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD VVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAE
       :..:: .::.: ::::::::::.:.::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.
CCDS14 VIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPAN
        270       280       290       300       310       320      

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD ELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLEN
       :. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::.
CCDS14 EISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLET
        330       340       350       360       370       380      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KSD HALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTI
        ..: .:::::::..::::::::::::..::::::::::::::.::::::::  ::.:::
CCDS14 SSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTI
        390       400       410       420       430       440      

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD EKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVL
       :::::::: :.. : ::::::::::::::.::.:.::::::::::::::.::  : :::.
CCDS14 EKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVM
        450       460       470       480       490       500      

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD PPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVA
       ::::::::::::..::::.::::::::::::::::::::...::..:::::  ::::::.
CCDS14 PPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVV
        510       520       530       540       550       560      

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD ALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHD
       :::.:::..:::::::::.::::.:::::::..:::: :::::::::: .::::.:::::
CCDS14 ALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHD
        570       580       590       600       610       620      

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD APASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNT
       :::::::::: : ::::::: :.:. :::::.:::::.:: :::.::.::::::.:::::
CCDS14 APASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNT
        630       640       650       660       670       680      

        720       730       740          
pF1KSD MESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP  
       .:::: : ::: .                     
CCDS14 VESYDAQRNEWKESMQELLQNFYTTQKLKETLGH
        690       700       710       720

>>CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4               (694 aa)
 initn: 3726 init1: 2850 opt: 2850  Z-score: 2529.9  bits: 478.7 E(32554): 1.4e-134
Smith-Waterman score: 2850; 77.7% identity (93.7% similar) in 520 aa overlap (227-746:174-693)

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD QTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKME
                                     ::::::::::::::::.:: ::.:::::::
CCDS34 EDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDSSSCRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKME
           150       160       170       180       190       200   

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD GIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLG
       :..::.::.:.:.:::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.::.:::: ::::::::
CCDS34 GVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLG
           210       220       230       240       250       260   

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD IRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIF
       ::.::::::: .: ::::.::::..:::::::::.:::: :. :::::::.:.:.::::.
CCDS34 IRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETIL
           270       280       290       300       310       320   

        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD HALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKY
       .::. ::..:...: .::: :::.:::::: ::.:::.::..::..:.::::::.:::::
CCDS34 NALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKY
           330       340       350       360       370       380   

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD HLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRR
       ::::::: ..:::::::::::::::.::::::..::::.:::::::::.:  .. :::::
CCDS34 HLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRR
           390       400       410       420       430       440   

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD LQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIY
       :::::::.::::.:.::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::.:::::.:
CCDS34 LQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMY
           450       460       470       480       490       500   

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD AVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSS
       ::::::::::::::::::::..::.:::.::  :::::::.:.::::.::::::::::.:
CCDS34 AVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKS
           510       520       530       540       550       560   

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD MEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPK
       .: .:::::::..:: : ::::::::.: .:.:::.:::::::::  ::: : :::::::
CCDS34 VECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPK
           570       580       590       600       610       620   

        680       690       700       710       720       730      
pF1KSD TDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIG
       :: :: :: .:. :::::::::::.::::::::::.::::.:.::::::::::.: : .:
CCDS34 TDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLG
           630       640       650       660       670       680   

        740        
pF1KSD RAGACVVVIKQP
       :::::::..:  
CCDS34 RAGACVVTVKL 
           690     

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 2133 init1: 725 opt: 1681  Z-score: 1495.5  bits: 287.1 E(32554): 5.6e-77
Smith-Waterman score: 1681; 45.9% identity (76.2% similar) in 562 aa overlap (189-746:45-600)

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD TGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIV
                                     : . .: .::.. ..   :...::::.:.:
CCDS13 GETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVV
           20        30        40        50        60        70    

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD GNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELK
       : .:: :::..::. : :: ::::... :..: :. .. ::  :.  :..::::. . ..
CCDS13 GAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVE
           80        90       100       110       120       130    

      280       290       300       310       320       330        
pF1KSD EDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTM
       : ....:: ::::::: .. :.::.:: . : ::::::::::::...: ::...: ..:.
CCDS13 EGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQ
          140       150       160       170       180       190    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KSD ENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLL
       .:..::....::.::::..:  ...::..:: .:: .:.:.: ::::..: :  .: ..:
CCDS13 HNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVL
          200       210       220       230       240       250    

      400       410        420       430       440       450       
pF1KSD AFIRLPLLPPQILAD-LENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKST
         .::::: :..:.  . .  :.:.: ::. :. :: .: :::..: :::.:::.:::  
CCDS13 QHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPI
          260       270       280       290       300       310    

         460       470       480       490       500       510     
pF1KSD -VG-TLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD
         : .:.::::  .. . ...:.:: .:: : ... :. ::   ::.:.:: :...::.:
CCDS13 RCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHD
          320       330       340       350       360       370    

         520       530        540       550       560       570    
pF1KSD GLKTLNTVECYNPKTKTWTV-LPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWD
       : . ::.:: :.:::. :.  . : :: : ..::.:: : .:::::.:: : :: :::.:
CCDS13 GSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYD
          380       390       400       410       420       430    

          580       590       600       610       620       630    
pF1KSD PQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMC
       :. ..:: :::::  :  :.::.:.: ::.::: ::.: :...: :.:. :.:.  ::: 
CCDS13 PKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMG
          440       450       460       470       480       490    

          640       650       660       670       680       690    
pF1KSD KRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVG
        ::  .: :. . ..:::::.:  .       :. .:::.:.:. :. :. ..  :..::
CCDS13 TRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTE------LSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVG
          500       510       520             530       540        

          700       710       720       730       740              
pF1KSD VCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP      
       . ... .:.::::.:: :::.:.: .::..: :  ....:  : :. : :::        
CCDS13 LAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHI
      550       560       570       580       590       600        

CCDS13 W
        

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 2495 init1: 646 opt: 1527  Z-score: 1358.8  bits: 261.9 E(32554): 2.3e-69
Smith-Waterman score: 1540; 40.1% identity (71.2% similar) in 621 aa overlap (131-746:22-623)

              110       120       130       140        150         
pF1KSD TRLQQGAPGQGTQQPARTLFYVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQEL-KVEPDNSSQAT
                                     :: . : :        :  ...: ..  :.
CCDS30          MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAA
                        10        20        30        40        50 

     160        170       180       190       200       210        
pF1KSD G-EGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIV
         ::  . ::  :::.. .:              .: ...:  :  . ..  :::..: :
CCDS30 PMEGAVQLLSREGHSVAHNSK-------------RHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHV
              60        70                     80        90        

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD GNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELK
       . ..: ::..::.: : :: ::::... :..: .. .. :::.:: .:::::::. . . 
CCDS30 AAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVG
      100       110       120       130       140       150        

      280       290       300       310       320       330        
pF1KSD EDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTM
       : ....:: :: ::::  : ..::.::.. : ::::::::.::::..: .:.:.:: :..
CCDS30 EGNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVL
      160       170       180       190       200       210        

      340       350       360       370       380       390        
pF1KSD ENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLL
       .....: ...::.::: ... .:..::..:::.:: ...:.. :::.:...: . .  :.
CCDS30 QHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLM
      220       230       240       250       260       270        

      400        410       420       430       440       450       
pF1KSD AFIRLPLLPPQ-ILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKST
         .:::::  . .:. .. ..: ..  .:. :..::.:.:::::.: .. . ::.::.  
CCDS30 KCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCE
      280       290       300       310       320       330        

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pF1KSD -VG-TLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD
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