Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1458
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1458, 581 aa
  1>>>pF1KSDA1458 581 - 581 aa - 581 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8576+/-0.00035; mu= -10.3498+/- 0.022
 mean_var=353.4830+/-72.836, 0's: 0 Z-trim(123.6): 10  B-trim: 141 in 2/60
 Lambda= 0.068217
 statistics sampled from 43804 (43814) to 43804 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.803), E-opt: 0.2 (0.514), width:  16
 Scan time: 11.980

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_065897 (OMIM: 610492) SLAIN motif-containing pr ( 581) 3865 394.1 6.5e-109
XP_005248178 (OMIM: 610492) PREDICTED: SLAIN motif ( 607) 3013 310.3 1.2e-83
NP_001229797 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing ( 590)  674 80.1 2.3e-14
XP_011533231 (OMIM: 610491) PREDICTED: SLAIN motif ( 476)  639 76.6 2.1e-13
NP_001035243 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing ( 426)  566 69.4 2.8e-11
XP_011533232 (OMIM: 610491) PREDICTED: SLAIN motif ( 305)  441 57.0 1.1e-07
NP_653196 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing pr ( 305)  441 57.0 1.1e-07
NP_001229800 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing ( 304)  279 41.0  0.0067


>>NP_065897 (OMIM: 610492) SLAIN motif-containing protei  (581 aa)
 initn: 3865 init1: 3865 opt: 3865  Z-score: 2076.3  bits: 394.1 E(85289): 6.5e-109
Smith-Waterman score: 3865; 100.0% identity (100.0% similar) in 581 aa overlap (1-581:1-581)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEDVNSNVNADQEVRKLQELVKKLEKQNEQLRSRSGAVQGAGSLGPGSPVRAGASIPSSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MEDVNSNVNADQEVRKLQELVKKLEKQNEQLRSRSGAVQGAGSLGPGSPVRAGASIPSSG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD AASPRGFPLGLSAKSGGGPGSGPRRTSSEELRDATSLLAAGEGGLLDEVEPLRPDELERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AASPRGFPLGLSAKSGGGPGSGPRRTSSEELRDATSLLAAGEGGLLDEVEPLRPDELERL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SGWEEEEESWLYSSPKKKLTPMQKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SGWEEEEESWLYSSPKKKLTPMQKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSPNASSPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSPNASSPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATTSRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATTSRR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SPRSRSPARGIEYSRVSPQPMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SPRSRSPARGIEYSRVSPQPMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SNTQVDSVKSSRSDSNFQVPNGGIPRMQPQASAIPSPGKFRSPAAPSPLALRQPVKAFSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SNTQVDSVKSSRSDSNFQVPNGGIPRMQPQASAIPSPGKFRSPAAPSPLALRQPVKAFSN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD HGSGSPGSQEITQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANPPSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HGSGSPGSQEITQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANPPSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580 
pF1KSD APSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSMKDDSWKDGCY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 APSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSMKDDSWKDGCY
              550       560       570       580 

>>XP_005248178 (OMIM: 610492) PREDICTED: SLAIN motif-con  (607 aa)
 initn: 3850 init1: 2994 opt: 3013  Z-score: 1622.8  bits: 310.3 E(85289): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 3802; 95.6% identity (95.7% similar) in 607 aa overlap (1-581:1-607)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEDVNSNVNADQEVRKLQELVKKLEKQNEQLRSRSGAVQGAGSLGPGSPVRAGASIPSSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MEDVNSNVNADQEVRKLQELVKKLEKQNEQLRSRSGAVQGAGSLGPGSPVRAGASIPSSG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD AASPRGFPLGLSAKSGGGPGSGPRRTSSEELRDATSLLAAGEGGLLDEVEPLRPDELERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AASPRGFPLGLSAKSGGGPGSGPRRTSSEELRDATSLLAAGEGGLLDEVEPLRPDELERL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SGWEEEEESWLYSSPKKKLTPMQKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGWEEEEESWLYSSPKKKLTPMQKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSPNASSPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSPNASSPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATTSRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATTSRR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SPRSRSPARGIEYSRVSPQPMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPRSRSPARGIEYSRVSPQPMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450                              
pF1KSD SNTQVDSVKSSRSDSNFQVPNGGIPRMQPQASA--------------------------I
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                          .
XP_005 SNTQVDSVKSSRSDSNFQVPNGGIPRMQPQASATSQRLKNLPRTSLKAKQLLQTSSTKRV
              430       440       450       460       470       480

          460       470       480       490       500       510    
pF1KSD PSPGKFRSPAAPSPLALRQPVKAFSNHGSGSPGSQEITQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSPGKFRSPAAPSPLALRQPVKAFSNHGSGSPGSQEITQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANP
              490       500       510       520       530       540

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD PSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPSAPSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSMKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPSAPSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSMKDD
              550       560       570       580       590       600

          580 
pF1KSD SWKDGCY
       :::::::
XP_005 SWKDGCY
              

>>NP_001229797 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing pro  (590 aa)
 initn: 622 init1: 284 opt: 674  Z-score: 378.9  bits: 80.1 E(85289): 2.3e-14
Smith-Waterman score: 906; 36.0% identity (55.4% similar) in 663 aa overlap (8-581:23-590)

                              10        20        30        40     
pF1KSD                MEDVNSNVNADQEVRKLQELVKKLEKQNEQLRSRSGAVQGAGSL-
                             :::. ::.::::::.::::::::::::.... .:  : 
NP_001 MMAEQVKCASAGVSSGAGSGPVVNAELEVKKLQELVRKLEKQNEQLRSRAASAAAAPHLL
               10        20        30        40        50        60

                50                60        70        80           
pF1KSD -----GPGSPVRAGA------SIP--SSGAASPRGFPLGLSAKSGGGPGSG---------
             :..:  ::       : :  .. ::.  :. :::.  .::: :::         
NP_001 LLPPPPPAAPPPAGLQPLGPRSPPAATATAAASGGLGLGLALGAGGGGGSGSGSGGGSSP
               70        80        90       100       110       120

                                  90       100                     
pF1KSD ---------------------PRRTSSEELRDATSLLAAGEGG-----------------
                            : ..    .. :.....:: ::                 
NP_001 AFPGTFCLPSPAPSLLCSLAQPPEAPFVYFKPAAGFFGAGGGGPEPGGAGTPPGAAAAPP
              130       140       150       160       170       180

               110       120        130       140       150        
pF1KSD -----LLDEVEPLRPDELERLSGWEEEEE-SWLYSSPKKKLTPMQKSVSPLVWCRQVLDY
            :::::: :   .:: ...:..:.. .::: . .: .:  .::..:: :::.::: 
NP_001 SPPPTLLDEVELL---DLESVAAWRDEDDYTWLYIGSSKTFTSSEKSLTPLQWCRHVLDN
              190          200       210       220       230       

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD PSPDVECAKKSLIHKLDQTMSALKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSPNASSPYSSGFNSPSST
       :.:..: :..::  .:.:                  .:::                    
NP_001 PTPEMEAARRSLCFRLEQ------------------GYTS--------------------
       240       250                                               

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD PVRPPIVKQLILPGNSGNLKSSDRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDV
                              :. :::::::::::::.:::..:::. .:::.:.:::
NP_001 -----------------------RGSPLSPQSSIDSELSTSELEDDSISMGYKLQDLTDV
                            260       270       280       290      

      280       290          300       310       320       330     
pF1KSD QILARMQEESLRQEYAATT---SRRSSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAV
       ::.::.:::::::.::.:.   ::.::. : .: ..:: :::: :  ::.::..  :   
NP_001 QIMARLQEESLRQDYASTSASVSRHSSSVSLSSGKKGTCSDQEYDQYSLEDEEEFDH---
        300       310       320       330       340       350      

         340       350       360       370           380       390 
pF1KSD YPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRNSPRSRSPARGIEYSRVSPQ----PMISRLQQPRLS
        :      :.::  :: :: :  :. :.:.. . .:.  : ::.    :  .  ::   :
NP_001 LPP-----PQPR-LPRCSPFQ--RGIPHSQTFS-SIRECRRSPSSQYFPSNNYQQQQYYS
                360          370        380       390       400    

             400       410       420               430        440  
pF1KSD LQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT-SNTQVDS-------VKSSRS-DSNFQVPNG
        :..  : :  :  : .:::::.:::.:  :.: ..:       :..:.: ::...  ..
NP_001 PQAQTPD-QQPNRTNGDKLRRSMPNLARMPSTTAISSNISSPVTVRNSQSFDSSLHGAGN
          410        420       430       440       450       460   

            450       460          470       480       490         
pF1KSD GIPRMQPQASAIPSPGKFRS---PAAPSPLALRQPVKAFSNHGSGSPGSQEITQLTQTTS
       :: :.:   : :::::...     ..  :...:::.:: .  .    ::...        
NP_001 GISRIQ---SCIPSPGQLQHRVHSVGHFPVSIRQPLKATAYVSPTVQGSSNMPL------
              470       480       490       500       510          

     500       510       520       530       540       550         
pF1KSD SPGPPMVQSTVSANPPSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPSAPSAGGIPVPRSKLAQPVR
       : :  . ..:   .:    :.:. .   :    ::.:::::  . .:  .::::.:::::
NP_001 SNGLQLYSNTGIPTP----NKAAASGIMG----RSALPRPSL-AINGSNLPRSKIAQPVR
          520           530           540        550       560     

     560       570          580 
pF1KSD RSLPAPKTYGSM---KDDSWKDGCY
         :  ::  .:.   .: .:.::::
NP_001 SFLQPPKPLSSLSTLRDGNWRDGCY
         570       580       590

>>XP_011533231 (OMIM: 610491) PREDICTED: SLAIN motif-con  (476 aa)
 initn: 585 init1: 284 opt: 639  Z-score: 361.7  bits: 76.6 E(85289): 2.1e-13
Smith-Waterman score: 911; 40.3% identity (63.8% similar) in 494 aa overlap (120-581:28-476)

      90       100       110       120              130       140  
pF1KSD ELRDATSLLAAGEGGLLDEVEPLRPDELERLSGWEEEEES-------WLYSSPKKKLTPM
                                     : ::... .:        :: . .: .:  
XP_011    MVGVGLCLRLLLFFRFKRTLDRICVLFLLGWHRKPRSDGSLFIERLYIGSSKTFTSS
                  10        20        30        40        50       

            150       160       170       180       190       200  
pF1KSD QKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSALKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSP
       .::..:: :::.::: :.:..: :..::  .:.:   : . ..:...   . : . ::::
XP_011 EKSLTPLQWCRHVLDNPTPEMEAARRSLCFRLEQ---ASRWRSLFSS---TASLAFPYSP
        60        70        80        90          100          110 

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pF1KSD NAS-SPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSSDRNPPLSPQSSIDSELSASEL
        :  ::::.:.:.:: . .     : .. : ..:    ..:. :::::::::::::.:::
XP_011 VARLSPYSNGINTPSFSKTSN---KAILTPEKTGY---TSRGSPLSPQSSIDSELSTSEL
             120       130          140          150       160     

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pF1KSD DEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATT---SRRSSGSSCNSTRRGTFSDQE
       ..:::. .:::.:.:::::.::.:::::::.::.:.   ::.::. : .: ..:: ::::
XP_011 EDDSISMGYKLQDLTDVQIMARLQEESLRQDYASTSASVSRHSSSVSLSSGKKGTCSDQE
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pF1KSD LDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRNSPRSRSPARGIEYSRVSP
        :  ::.::..  :    :      :.::  :: :: :  :. :.:.. . .:.  : ::
XP_011 YDQYSLEDEEEFDH---LP-----PPQPR-LPRCSPFQ--RGIPHSQTFS-SIRECRRSP
         230          240             250         260        270   

          380       390       400       410       420              
pF1KSD Q----PMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT-SNTQVDS------
       .    :  .  ::   : :..  : :  :  : .:::::.:::.:  :.: ..:      
XP_011 SSQYFPSNNYQQQQYYSPQAQTPD-QQPNRTNGDKLRRSMPNLARMPSTTAISSNISSPV
           280       290        300       310       320       330  

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pF1KSD -VKSSRS-DSNFQVPNGGIPRMQPQASAIPSPGKFRS---PAAPSPLALRQPVKAFSNHG
        :..:.: ::...  ..:: :.:   : :::::...     ..  :...:::.:: .  .
XP_011 TVRNSQSFDSSLHGAGNGISRIQ---SCIPSPGQLQHRVHSVGHFPVSIRQPLKATAYVS
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pF1KSD SGSPGSQEI--TQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANPPSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPS
           ::...  ..  :  :. : :        .:    :.:. .   :    ::.:::::
XP_011 PTVQGSSNMPLSNGLQLYSNTGIP--------TP----NKAAASGIMG----RSALPRPS
     390       400       410                   420           430   

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pF1KSD APSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSM---KDDSWKDGCY
         . .:  .::::.:::::  :  ::  .:.   .: .:.::::
XP_011 L-AINGSNLPRSKIAQPVRSFLQPPKPLSSLSTLRDGNWRDGCY
            440       450       460       470      

>>NP_001035243 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing pro  (426 aa)
 initn: 455 init1: 284 opt: 566  Z-score: 323.6  bits: 69.4 E(85289): 2.8e-11
Smith-Waterman score: 731; 37.1% identity (57.0% similar) in 493 aa overlap (120-581:28-426)

      90       100       110       120              130       140  
pF1KSD ELRDATSLLAAGEGGLLDEVEPLRPDELERLSGWEEEEES-------WLYSSPKKKLTPM
                                     : ::... .:        :: . .: .:  
NP_001    MVGVGLCLRLLLFFRFKRTLDRICVLFLLGWHRKPRSDGSLFIERLYIGSSKTFTSS
                  10        20        30        40        50       

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pF1KSD QKSVSPLVWCRQVLDYPSPDVECAKKSLIHKLDQTMSALKRQNLYNNPFNSMSYTSPYSP
       .::..:: :::.::: :.:..: :..::  .:.:                  .:::    
NP_001 EKSLTPLQWCRHVLDNPTPEMEAARRSLCFRLEQ------------------GYTS----
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pF1KSD NASSPYSSGFNSPSSTPVRPPIVKQLILPGNSGNLKSSDRNPPLSPQSSIDSELSASELD
                                              :. :::::::::::::.:::.
NP_001 ---------------------------------------RGSPLSPQSSIDSELSTSELE
                                                100       110      

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pF1KSD EDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATT---SRRSSGSSCNSTRRGTFSDQEL
       .:::. .:::.:.:::::.::.:::::::.::.:.   ::.::. : .: ..:: :::: 
NP_001 DDSISMGYKLQDLTDVQIMARLQEESLRQDYASTSASVSRHSSSVSLSSGKKGTCSDQEY
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KSD DAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQSPRNSPRSRSPARGIEYSRVSPQ
       :  ::.::..  :    :      :.::  :: :: :  :. :.:.. . .:.  : ::.
NP_001 DQYSLEDEEEFDH---LP-----PPQPR-LPRCSPFQ--RGIPHSQTFS-SIRECRRSPS
        180          190             200         210        220    

         380       390       400       410       420               
pF1KSD ----PMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRRSLPNLSRT-SNTQVDS-------
           :  .  ::   : :..  : :  :  : .:::::.:::.:  :.: ..:       
NP_001 SQYFPSNNYQQQQYYSPQAQTPD-QQPNRTNGDKLRRSMPNLARMPSTTAISSNISSPVT
          230       240        250       260       270       280   

       430        440       450       460          470       480   
pF1KSD VKSSRS-DSNFQVPNGGIPRMQPQASAIPSPGKFRS---PAAPSPLALRQPVKAFSNHGS
       :..:.: ::...  ..:: :.:   : :::::...     ..  :...:::.:: .  . 
NP_001 VRNSQSFDSSLHGAGNGISRIQ---SCIPSPGQLQHRVHSVGHFPVSIRQPLKATAYVSP
           290       300          310       320       330       340

           490         500       510       520       530       540 
pF1KSD GSPGSQEI--TQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANPPSNINSATLTRPAGTTAMRSGLPRPSA
          ::...  ..  :  :. : :        .:    :.:. .   :    ::.::::: 
NP_001 TVQGSSNMPLSNGLQLYSNTGIP--------TP----NKAAASGIMG----RSALPRPSL
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             550       560       570          580 
pF1KSD PSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSM---KDDSWKDGCY
        . .:  .::::.:::::  :  ::  .:.   .: .:.::::
NP_001 -AINGSNLPRSKIAQPVRSFLQPPKPLSSLSTLRDGNWRDGCY
           390       400       410       420      

>>XP_011533232 (OMIM: 610491) PREDICTED: SLAIN motif-con  (305 aa)
 initn: 265 init1: 159 opt: 441  Z-score: 259.2  bits: 57.0 E(85289): 1.1e-07
Smith-Waterman score: 567; 39.8% identity (62.0% similar) in 334 aa overlap (270-581:3-305)

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD SDRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATT--
                                     :::.:.:::::.::.:::::::.::.:.  
XP_011                             MGYKLQDLTDVQIMARLQEESLRQDYASTSAS
                                           10        20        30  

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD -SRRSSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQ
        ::.::. : .: ..:: :::: :  ::.::..  :  . :      :.::  :: :: :
XP_011 VSRHSSSVSLSSGKKGTCSDQEYDQYSLEDEEEFDH--LPP------PQPR-LPRCSPFQ
             40        50        60          70               80   

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pF1KSD SPRNSPRSRSPARGIEYSRVSPQ----PMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRR
         :. :.:.. . .:.  : ::.    :  .  ::   : :..  : :  :  : .::::
XP_011 --RGIPHSQTFS-SIRECRRSPSSQYFPSNNYQQQQYYSPQAQTPD-QQPNRTNGDKLRR
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pF1KSD SLPNLSRT-SNTQVDS-------VKSSRS-DSNFQVPNGGIPRMQPQASAIPSPGKFRS-
       :.:::.:  :.: ..:       :..:.: ::...  ..:: :.:   : :::::...  
XP_011 SMPNLARMPSTTAISSNISSPVTVRNSQSFDSSLHGAGNGISRIQ---SCIPSPGQLQHR
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pF1KSD --PAAPSPLALRQPVKAFSNHGSGSPGSQEITQLTQTTSSPGPPMVQSTVSANPPSNINS
          ..  :...:::.:: .  .    ::...        : :  . ..:   .:    :.
XP_011 VHSVGHFPVSIRQPLKATAYVSPTVQGSSNMPL------SNGLQLYSNTGIPTP----NK
        200       210       220             230       240          

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pF1KSD ATLTRPAGTTAMRSGLPRPSAPSAGGIPVPRSKLAQPVRRSLPAPKTYGSM---KDDSWK
       :. .   :    ::.:::::  . .:  .::::.:::::  :  ::  .:.   .: .:.
XP_011 AAASGIMG----RSALPRPSL-AINGSNLPRSKIAQPVRSFLQPPKPLSSLSTLRDGNWR
        250           260        270       280       290       300 

       580 
pF1KSD DGCY
       ::::
XP_011 DGCY
           

>>NP_653196 (OMIM: 610491) SLAIN motif-containing protei  (305 aa)
 initn: 265 init1: 159 opt: 441  Z-score: 259.2  bits: 57.0 E(85289): 1.1e-07
Smith-Waterman score: 567; 39.8% identity (62.0% similar) in 334 aa overlap (270-581:3-305)

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD SDRNPPLSPQSSIDSELSASELDEDSIGSNYKLNDVTDVQILARMQEESLRQEYAATT--
                                     :::.:.:::::.::.:::::::.::.:.  
NP_653                             MGYKLQDLTDVQIMARLQEESLRQDYASTSAS
                                           10        20        30  

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD -SRRSSGSSCNSTRRGTFSDQELDAQSLDDEDDNMHHAVYPAVNRFSPSPRNSPRPSPKQ
        ::.::. : .: ..:: :::: :  ::.::..  :  . :      :.::  :: :: :
NP_653 VSRHSSSVSLSSGKKGTCSDQEYDQYSLEDEEEFDH--LPP------PQPR-LPRCSPFQ
             40        50        60          70               80   

        360       370           380       390       400       410  
pF1KSD SPRNSPRSRSPARGIEYSRVSPQ----PMISRLQQPRLSLQGHPTDLQTSNVKNEEKLRR
         :. :.:.. . .:.  : ::.    :  .  ::   : :..  : :  :  : .::::
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