seq1 = pF1KSDA1439.tfa, 1527 bp seq2 = pF1KSDA1439/gi568815597f_60988147.tfa (gi568815597f:60988147_61526556), 538410 bp >pF1KSDA1439 1527 >gi568815597f:60988147_61526556 (Chr1) 1-27 (94646-94672) 100% -> 28-559 (100003-100534) 100% -> 560-625 (289374-289439) 100% -> 626-700 (344366-344440) 100% -> 701-818 (364304-364421) 100% -> 819-946 (371001-371128) 100% -> 947-1075 (395091-395219) 100% -> 1076-1254 (415958-416136) 100% -> 1255-1420 (418416-418581) 100% -> 1421-1512 (438319-438410) 100% -> 1513-1527 (467157-467171) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAG GATGAATTTCATCC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 94646 ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGTA...TAGGATGAATTTCATCC 50 . : . : . : . : . : 42 TTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGCCTTTGCCTACACATGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100017 TTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGCCTTTGCCTACACATGGT 100 . : . : . : . : . : 92 TCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100067 TCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGT 150 . : . : . : . : . : 142 ATGTCAAAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100117 ATGTCAAAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAA 200 . : . : . : . : . : 192 ACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGACTTCTGGCAAAGTTGCGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100167 ACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGACTTCTGGCAAAGTTGCGGA 250 . : . : . : . : . : 242 AAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100217 AAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGG 300 . : . : . : . : . : 292 AAAAAACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100267 AAAAAACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGAT 350 . : . : . : . : . : 342 GCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAGATAAAGTCTGGAGGTTGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100317 GCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAGATAAAGTCTGGAGGTTGGACC 400 . : . : . : . : . : 392 TTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100367 TTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGC 450 . : . : . : . : . : 442 GAGCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100417 GAGCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCA 500 . : . : . : . : . : 492 ACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAAGGAACTCGATTTATATTTGGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100467 ACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAAGGAACTCGATTTATATTTGGCAT 550 . : . : . : . : . : 542 ACTTTGTGCATGCAGCAG ATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCC ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 100517 ACTTTGTGCATGCAGCAGGTA...CAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCC 600 . : . : . : . : . : 583 AGCCAGCCAAGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 289397 AGCCAGCCAAGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGTA...C 650 . : . : . : . : . : 626 GACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTTTTTAGTG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 344364 AGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTTTTTAGTG 700 . : . : . : . : . : 674 TCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGA CACCAATAGCTGCA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 344414 TCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGAGTA...TAGCACCAATAGCTGCA 750 . : . : . : . : . : 715 GGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTCAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 364318 GGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTCAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTA 800 . : . : . : . : . : 765 CAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 364368 CAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA 850 . : . : . : . : . : 815 CGAG CTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 364418 CGAGGTA...CAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATG 900 . : . : . : . : . : 856 GACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGCCAAGGGCGCTCCCCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 371038 GACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGCCAAGGGCGCTCCCCAGG 950 . : . : . : . : . : 906 AAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 371088 AAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGTA...CAG 1000 . : . : . : . : . : 947 GAATGCCATCTCCAACCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 395091 GAATGCCATCTCCAACCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGC 1050 . : . : . : . : . : 997 AGCCCCTCCCCTTCACAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGTTCACACAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 395141 AGCCCCTCCCCTTCACAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGTTCACACAGCA 1100 . : . : . : . : . : 1047 TCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAG CAAGTCCGCATG |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 395191 TCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGGTG...CAGCAAGTCCGCATG 1150 . : . : . : . : . : 1088 CAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 415970 CAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCT 1200 . : . : . : . : . : 1138 GGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 416020 GGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCT 1250 . : . : . : . : . : 1188 GAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 416070 GAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGAC 1300 . : . : . : . : . : 1238 AGGTGGGGTTCCTCAAT CCCAATGGGAGCAGCCAAGGCAAG |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 416120 AGGTGGGGTTCCTCAATGTA...CAGCCCAATGGGAGCAGCCAAGGCAAG 1350 . : . : . : . : . : 1279 GTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 418440 GTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACC 1400 . : . : . : . : . : 1329 ACCGATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 418490 ACCGATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAA 1450 . : . : . : . : . : 1379 CCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCACGTCACCAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 418540 CCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCACGTCACCAAGTA...CA 1500 . : . : . : . : . : 1421 CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 438318 GCCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGG 1550 . : . : . : . : . : 1470 ACCACGGGATCCAAGCTTTGTAAATATCCCTCAACAGACACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 438368 ACCACGGGATCCAAGCTTTGTAAATATCCCTCAACAGACACAGGTG...C 1600 . : . 1513 TCCTGGTACCTGGGA >>||||||||||||||| 467155 AGTCCTGGTACCTGGGA