Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1382, 506 aa
  1>>>pF1KSDA1382 506 - 506 aa - 506 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8737+/-0.000503; mu= 20.5913+/- 0.031
 mean_var=69.8883+/-14.935, 0's: 0 Z-trim(107.2): 121  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.153416
 statistics sampled from 15118 (15246) to 15118 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.179), width:  16
 Scan time:  9.400

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_061849 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral am ( 506) 3232 725.4 9.7e-209
NP_001294865 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral ( 406) 2558 576.1 6.6e-164
NP_006832 (OMIM: 604437) sodium-coupled neutral am ( 504) 1668 379.2 1.5e-104
XP_006713017 (OMIM: 604437) PREDICTED: sodium-coup ( 504) 1668 379.2 1.5e-104
NP_001137296 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral ( 547) 1006 232.7 2.1e-60
NP_060488 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral am ( 547) 1006 232.7 2.1e-60
XP_005269054 (OMIM: 608065) PREDICTED: sodium-coup ( 547) 1006 232.7 2.1e-60
XP_016875479 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 456)  786 183.9 8.4e-46
XP_011537089 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 456)  786 183.9 8.4e-46
XP_011537088 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 478)  786 184.0 8.7e-46
NP_001265316 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487)  786 184.0 8.8e-46
NP_001070952 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487)  786 184.0 8.8e-46
NP_001265318 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487)  786 184.0 8.8e-46
NP_109599 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral am ( 487)  786 184.0 8.8e-46
NP_001265317 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487)  786 184.0 8.8e-46
XP_011537086 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 497)  786 184.0 8.9e-46
NP_001265319 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 503)  786 184.0   9e-46
XP_006720113 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 255)  726 170.4 5.4e-42
NP_722518 (OMIM: 616518) probable sodium-coupled n ( 456)  726 170.7 8.3e-42
NP_277053 (OMIM: 300649) sodium-coupled neutral am ( 472)  709 166.9 1.2e-40
XP_016885450 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 472)  709 166.9 1.2e-40
XP_016885449 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 478)  709 166.9 1.2e-40
XP_005272755 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 492)  709 166.9 1.2e-40
XP_006724632 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 492)  709 166.9 1.2e-40
XP_005272754 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 498)  709 166.9 1.2e-40
XP_005272752 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 519)  709 166.9 1.2e-40
XP_005272751 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 539)  709 167.0 1.3e-40
NP_001166173 (OMIM: 616518) probable sodium-couple ( 521)  657 155.4 3.6e-37
XP_016876517 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 258)  645 152.5 1.4e-36
XP_016876516 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 258)  645 152.5 1.4e-36
XP_016876512 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 435)  646 152.9 1.7e-36
XP_016876514 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 405)  645 152.7 1.9e-36
XP_016876515 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 405)  645 152.7 1.9e-36
XP_016876511 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 436)  645 152.7   2e-36
XP_016876509 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 459)  645 152.7 2.1e-36
XP_016876513 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 419)  609 144.7 4.9e-34
XP_016876510 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 441)  601 143.0 1.7e-33
XP_006720112 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 309)  597 142.0 2.5e-33
XP_011534771 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 348)  597 142.0 2.7e-33
NP_612637 (OMIM: 616525) putative sodium-coupled n ( 780)  317 80.3 2.2e-14
XP_011522592 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1045)  317 80.4 2.8e-14
NP_001033073 (OMIM: 616525) putative sodium-couple (1119)  317 80.5 2.9e-14
XP_011522591 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1126)  317 80.5 2.9e-14
XP_005257076 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1127)  317 80.5 2.9e-14
XP_011522590 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1134)  317 80.5 2.9e-14
XP_006712400 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 408)  283 72.6 2.5e-12
XP_016858951 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 395)  274 70.6 9.8e-12
XP_016858950 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 397)  274 70.6 9.8e-12
XP_016858949 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 408)  274 70.6   1e-11
XP_005246407 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 462)  274 70.6 1.1e-11


>>NP_061849 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral amino   (506 aa)
 initn: 3232 init1: 3232 opt: 3232  Z-score: 3868.6  bits: 725.4 E(85289): 9.7e-209
Smith-Waterman score: 3232; 100.0% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-506)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500      
pF1KSD SGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
       ::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
              490       500      

>>NP_001294865 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral ami  (406 aa)
 initn: 2558 init1: 2558 opt: 2558  Z-score: 3063.6  bits: 576.1 E(85289): 6.6e-164
Smith-Waterman score: 2558; 99.8% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (105-506:5-406)

           80        90       100       110       120       130    
pF1KSD MSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                           MKQNLILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
                                         10        20        30    

          140       150       160       170       180       190    
pF1KSD EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
           40        50        60        70        80        90    

          200       210       220       230       240       250    
pF1KSD NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
          100       110       120       130       140       150    

          260       270       280       290       300       310    
pF1KSD ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
          160       170       180       190       200       210    

          320       330       340       350       360       370    
pF1KSD ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
          220       230       240       250       260       270    

          380       390       400       410       420       430    
pF1KSD VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
          280       290       300       310       320       330    

          440       450       460       470       480       490    
pF1KSD RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
          340       350       360       370       380       390    

          500      
pF1KSD LDWVHNAPGGGH
       ::::::::::::
NP_001 LDWVHNAPGGGH
          400      

>>NP_006832 (OMIM: 604437) sodium-coupled neutral amino   (504 aa)
 initn: 1531 init1: 826 opt: 1668  Z-score: 1997.8  bits: 379.2 E(85289): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1668; 56.7% identity (81.7% similar) in 464 aa overlap (47-506:44-504)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KSD SSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMS
                                     :...:: .:  .:. . :.:. : ::::::
NP_006 PNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSP-SKEPHFTDFE-GKTSFGMS
            20        30        40        50         60         70 

         80        90       100       110       120       130      
pF1KSD VFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQ
       ::::::::.:::::::.:::::::: ::..::: :...: ::.:::::...  :   :::
NP_006 VFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQ
              80        90       100       110       120       130 

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD LGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNY
       :::.:::  :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::::
NP_006 LGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNY
             140       150       160       170       180       190 

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD LVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINET
       ::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::.   .  : :
NP_006 LVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-NTT
             200       210       220       230       240        250

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD INTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEEL
        : . .. .     :. .   .  : : :: .::::.:..::. :.::::: ::::: ::
NP_006 GNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTEL
              260       270       280       290       300       310

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD KDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVR
       :: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::..   :.:.: ::
NP_006 KDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVR
              320       330       340       350       360       370

        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD LAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRD
       .::: :::::::.:.::.: .. ..:  ...::: :: ::.:..:.  ::::::.:.:  
NP_006 VAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILG
              380       390       400       410       420       430

        440       450       460         470       480       490    
pF1KSD IFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
       ::: :::..: .::::.:. ::....  .::: .:. :: :: : . : :.:: :...:.
NP_006 IFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFLLMTMSLSFII
              440       450       460       470       480       490

          500        
pF1KSD LDWVHNAP--GGGH
       .::. ..   ::.:
NP_006 IDWASGTSRHGGNH
              500    

>>XP_006713017 (OMIM: 604437) PREDICTED: sodium-coupled   (504 aa)
 initn: 1531 init1: 826 opt: 1668  Z-score: 1997.8  bits: 379.2 E(85289): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1668; 56.7% identity (81.7% similar) in 464 aa overlap (47-506:44-504)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KSD SSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMS
                                     :...:: .:  .:. . :.:. : ::::::
XP_006 PNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSP-SKEPHFTDFE-GKTSFGMS
            20        30        40        50         60         70 

         80        90       100       110       120       130      
pF1KSD VFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQ
       ::::::::.:::::::.:::::::: ::..::: :...: ::.:::::...  :   :::
XP_006 VFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQ
              80        90       100       110       120       130 

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD LGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNY
       :::.:::  :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::::
XP_006 LGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNY
             140       150       160       170       180       190 

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD LVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINET
       ::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::.   .  : :
XP_006 LVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-NTT
             200       210       220       230       240        250

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD INTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEEL
        : . .. .     :. .   .  : : :: .::::.:..::. :.::::: ::::: ::
XP_006 GNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTEL
              260       270       280       290       300       310

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD KDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVR
       :: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::..   :.:.: ::
XP_006 KDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVR
              320       330       340       350       360       370

        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD LAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRD
       .::: :::::::.:.::.: .. ..:  ...::: :: ::.:..:.  ::::::.:.:  
XP_006 VAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILG
              380       390       400       410       420       430

        440       450       460         470       480       490    
pF1KSD IFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
       ::: :::..: .::::.:. ::....  .::: .:. :: :: : . : :.:: :...:.
XP_006 IFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFLLMTMSLSFII
              440       450       460       470       480       490

          500        
pF1KSD LDWVHNAP--GGGH
       .::. ..   ::.:
XP_006 IDWASGTSRHGGNH
              500    

>>NP_001137296 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral ami  (547 aa)
 initn: 1961 init1: 973 opt: 1006  Z-score: 1205.4  bits: 232.7 E(85289): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1956; 59.0% identity (80.1% similar) in 537 aa overlap (10-506:10-546)

               10        20        30         40        50         
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYP-TKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGK
                .: ::..:::  :  :   .   ...::..:..:. : :.:.:: .. :::
NP_001 MDPMELRNVNIEPDDESSSGESAPDSYIGIGNSEKAAMSSQFANEDTESQKFLTNGFLGK
               10        20        30        40        50        60

      60           70        80        90       100       110      
pF1KSD KK---YETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSL
       ::   :  : :::::::::: :::::::.:::::::::::::::: ::::.:  :.:.::
NP_001 KKLADYADEHHPGTTSFGMSSFNLSNAIMGSGILGLSYAMANTGIILFIIMLLAVAILSL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD YSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLV
       ::::::::::.:::::.::.:: ::::  ::..:  ::::::::::::::::.::::: :
NP_001 YSVHLLLKTAKEGGSLIYEKLGEKAFGWPGKIGAFVSITMQNIGAMSSYLFIIKYELPEV
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD IQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVV
       :.:. ..:..:: ::::::::...::. .::::::..::::::::::.:: :::::. ::
NP_001 IRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVV
              190       200       210       220       230       240

        240       250         260       270                        
pF1KSD ICKKFQVPCPVEAA--LIINETINTTLTQPTALVPALSHN----------------VTEN
       : ::::.:::. .    . : ..:.:: . ....:  :..                . ::
NP_001 IYKKFQIPCPLPVLDHSVGNLSFNNTLPMHVVMLPNNSESSDVNFMMDYTHRNPAGLDEN
              250       260       270       280       290       300

                        280       290       300       310       320
pF1KSD ------------------DSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRS
                         :.:.:.::.:::.:.::.:::.:.::::: ::::: ::::::
NP_001 QAKGSLHDSGVEYEAHSDDKCEPKYFVFNSRTAYAIPILVFAFVCHPEVLPIYSELKDRS
              310       320       330       340       350       360

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD RRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVL
       ::.:..::.::. .:..:::::::::::::: .::.::::.::..   :: ::.::::::
NP_001 RRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVL
              370       380       390       400       410       420

              390       400       410       420       430       440
pF1KSD MAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGF
       .:::::::.:.::::.::  ::  .. ::: :: ::.. ..:..:.:::.::::. ::::
NP_001 VAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGF
              430       440       450       460       470       480

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD IGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHN
       ::::.:.:::::::..::.:::::: ..: ::.:::.::. :.. : ::::::..::...
NP_001 IGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYD
              490       500       510       520       530       540

              
pF1KSD APGGGH 
        :.. : 
NP_001 PPNSKHH
              

>>NP_060488 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral amino   (547 aa)
 initn: 1961 init1: 973 opt: 1006  Z-score: 1205.4  bits: 232.7 E(85289): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1956; 59.0% identity (80.1% similar) in 537 aa overlap (10-506:10-546)

               10        20        30         40        50         
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYP-TKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGK
                .: ::..:::  :  :   .   ...::..:..:. : :.:.:: .. :::
NP_060 MDPMELRNVNIEPDDESSSGESAPDSYIGIGNSEKAAMSSQFANEDTESQKFLTNGFLGK
               10        20        30        40        50        60

      60           70        80        90       100       110      
pF1KSD KK---YETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSL
       ::   :  : :::::::::: :::::::.:::::::::::::::: ::::.:  :.:.::
NP_060 KKLADYADEHHPGTTSFGMSSFNLSNAIMGSGILGLSYAMANTGIILFIIMLLAVAILSL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD YSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLV
       ::::::::::.:::::.::.:: ::::  ::..:  ::::::::::::::::.::::: :
NP_060 YSVHLLLKTAKEGGSLIYEKLGEKAFGWPGKIGAFVSITMQNIGAMSSYLFIIKYELPEV
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD IQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVV
       :.:. ..:..:: ::::::::...::. .::::::..::::::::::.:: :::::. ::
NP_060 IRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVV
              190       200       210       220       230       240

        240       250         260       270                        
pF1KSD ICKKFQVPCPVEAA--LIINETINTTLTQPTALVPALSHN----------------VTEN
       : ::::.:::. .    . : ..:.:: . ....:  :..                . ::
NP_060 IYKKFQIPCPLPVLDHSVGNLSFNNTLPMHVVMLPNNSESSDVNFMMDYTHRNPAGLDEN
              250       260       270       280       290       300

                        280       290       300       310       320
pF1KSD ------------------DSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRS
                         :.:.:.::.:::.:.::.:::.:.::::: ::::: ::::::
NP_060 QAKGSLHDSGVEYEAHSDDKCEPKYFVFNSRTAYAIPILVFAFVCHPEVLPIYSELKDRS
              310       320       330       340       350       360

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD RRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVL
       ::.:..::.::. .:..:::::::::::::: .::.::::.::..   :: ::.::::::
NP_060 RRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVL
              370       380       390       400       410       420

              390       400       410       420       430       440
pF1KSD MAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGF
       .:::::::.:.::::.::  ::  .. ::: :: ::.. ..:..:.:::.::::. ::::
NP_060 VAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGF
              430       440       450       460       470       480

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD IGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHN
       ::::.:.:::::::..::.:::::: ..: ::.:::.::. :.. : ::::::..::...
NP_060 IGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYD
              490       500       510       520       530       540

              
pF1KSD APGGGH 
        :.. : 
NP_060 PPNSKHH
              

>>XP_005269054 (OMIM: 608065) PREDICTED: sodium-coupled   (547 aa)
 initn: 1961 init1: 973 opt: 1006  Z-score: 1205.4  bits: 232.7 E(85289): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1956; 59.0% identity (80.1% similar) in 537 aa overlap (10-506:10-546)

               10        20        30         40        50         
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYP-TKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGK
                .: ::..:::  :  :   .   ...::..:..:. : :.:.:: .. :::
XP_005 MDPMELRNVNIEPDDESSSGESAPDSYIGIGNSEKAAMSSQFANEDTESQKFLTNGFLGK
               10        20        30        40        50        60

      60           70        80        90       100       110      
pF1KSD KK---YETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSL
       ::   :  : :::::::::: :::::::.:::::::::::::::: ::::.:  :.:.::
XP_005 KKLADYADEHHPGTTSFGMSSFNLSNAIMGSGILGLSYAMANTGIILFIIMLLAVAILSL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD YSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLV
       ::::::::::.:::::.::.:: ::::  ::..:  ::::::::::::::::.::::: :
XP_005 YSVHLLLKTAKEGGSLIYEKLGEKAFGWPGKIGAFVSITMQNIGAMSSYLFIIKYELPEV
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD IQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVV
       :.:. ..:..:: ::::::::...::. .::::::..::::::::::.:: :::::. ::
XP_005 IRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVV
              190       200       210       220       230       240

        240       250         260       270                        
pF1KSD ICKKFQVPCPVEAA--LIINETINTTLTQPTALVPALSHN----------------VTEN
       : ::::.:::. .    . : ..:.:: . ....:  :..                . ::
XP_005 IYKKFQIPCPLPVLDHSVGNLSFNNTLPMHVVMLPNNSESSDVNFMMDYTHRNPAGLDEN
              250       260       270       280       290       300

                        280       290       300       310       320
pF1KSD ------------------DSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRS
                         :.:.:.::.:::.:.::.:::.:.::::: ::::: ::::::
XP_005 QAKGSLHDSGVEYEAHSDDKCEPKYFVFNSRTAYAIPILVFAFVCHPEVLPIYSELKDRS
              310       320       330       340       350       360

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD RRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVL
       ::.:..::.::. .:..:::::::::::::: .::.::::.::..   :: ::.::::::
XP_005 RRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVL
              370       380       390       400       410       420

              390       400       410       420       430       440
pF1KSD MAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGF
       .:::::::.:.::::.::  ::  .. ::: :: ::.. ..:..:.:::.::::. ::::
XP_005 VAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGF
              430       440       450       460       470       480

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD IGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHN
       ::::.:.:::::::..::.:::::: ..: ::.:::.::. :.. : ::::::..::...
XP_005 IGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYD
              490       500       510       520       530       540

              
pF1KSD APGGGH 
        :.. : 
XP_005 PPNSKHH
              

>>XP_016875479 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coupled   (456 aa)
 initn: 1461 init1: 737 opt: 786  Z-score: 943.3  bits: 183.9 E(85289): 8.4e-46
Smith-Waterman score: 1493; 51.6% identity (78.9% similar) in 473 aa overlap (1-473:8-453)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLL
              .. .:.  ... :..:. : .:: ::.    .... ..:.. . : :..  : 
XP_016 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
               10         20         30           40         50    

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
       .:.: ::: . :. :::::.:::::::::::.:::::::..:.::::: ::..::: :..
XP_016 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
           60         70        80        90       100       110   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD FSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYEL
       .:.::..:::  ..: : ..::.:: ..:: .::..  :. ..:: ::: ::::::: ::
XP_016 LSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKFVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNEL
           120       130       140       150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD PLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFL
       : .:. : . :.  . ::..:  ::..:.. .:::: :..::::::::::.:: ::::::
XP_016 PSAIKFLMGKEETFSAWYVDGRVLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFL
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD IVVICKKFQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTV
       :::: ::::.::      :. : .:.:.          : : :. :.: :.:  :::.::
XP_016 IVVIYKKFQIPC------IVPE-LNSTI----------SANSTNADTCTPKYVTFNSKTV
           240              250                 260       270      

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD YAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEH
       ::.: . :.:::::.::::: ::::::...:. ::.:::::::.::.:.:.:::::::..
XP_016 YALPTIAFAFVCHPSVLPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFAMFVMYFLTAIFGYLTFYDN
        280       290       300       310       320       330      

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD VESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRH
       :.:.::: :.:    :::.: :::::..:: :::::..: .:::. .:   .: :.  ::
XP_016 VQSDLLHKYQS--KDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTK-FNLCRH
        340         350       360       370       380        390   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD SLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKI
       ...:  .:.  ::::::.:...:::: .:...:.::::::::..:.:.. ..  :..:.:
XP_016 TVVTCILLVVINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITDQDGDKGTQRI
           400       410       420       430       440       450   

           480       490       500      
pF1KSD GALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
                                        
XP_016 WVW                              
                                        

>>XP_011537089 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coupled   (456 aa)
 initn: 1461 init1: 737 opt: 786  Z-score: 943.3  bits: 183.9 E(85289): 8.4e-46
Smith-Waterman score: 1493; 51.6% identity (78.9% similar) in 473 aa overlap (1-473:8-453)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLL
              .. .:.  ... :..:. : .:: ::.    .... ..:.. . : :..  : 
XP_011 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
               10         20         30           40         50    

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
       .:.: ::: . :. :::::.:::::::::::.:::::::..:.::::: ::..::: :..
XP_011 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
           60         70        80        90       100       110   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD FSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYEL
       .:.::..:::  ..: : ..::.:: ..:: .::..  :. ..:: ::: ::::::: ::
XP_011 LSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKFVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNEL
           120       130       140       150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD PLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFL
       : .:. : . :.  . ::..:  ::..:.. .:::: :..::::::::::.:: ::::::
XP_011 PSAIKFLMGKEETFSAWYVDGRVLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFL
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD IVVICKKFQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTV
       :::: ::::.::      :. : .:.:.          : : :. :.: :.:  :::.::
XP_011 IVVIYKKFQIPC------IVPE-LNSTI----------SANSTNADTCTPKYVTFNSKTV
           240              250                 260       270      

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD YAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEH
       ::.: . :.:::::.::::: ::::::...:. ::.:::::::.::.:.:.:::::::..
XP_011 YALPTIAFAFVCHPSVLPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFAMFVMYFLTAIFGYLTFYDN
        280       290       300       310       320       330      

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD VESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRH
       :.:.::: :.:    :::.: :::::..:: :::::..: .:::. .:   .: :.  ::
XP_011 VQSDLLHKYQS--KDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTK-FNLCRH
        340         350       360       370       380        390   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD SLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKI
       ...:  .:.  ::::::.:...:::: .:...:.::::::::..:.:.. ..  :..:.:
XP_011 TVVTCILLVVINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITDQDGDKGTQRI
           400       410       420       430       440       450   

           480       490       500      
pF1KSD GALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
                                        
XP_011 WVW                              
                                        

>>XP_011537088 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coupled   (478 aa)
 initn: 1461 init1: 737 opt: 786  Z-score: 943.0  bits: 184.0 E(85289): 8.7e-46
Smith-Waterman score: 1495; 51.4% identity (78.4% similar) in 477 aa overlap (1-477:8-457)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLL
              .. .:.  ... :..:. : .:: ::.    .... ..:.. . : :..  : 
XP_011 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
               10         20         30           40         50    

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
       .:.: ::: . :. :::::.:::::::::::.:::::::..:.::::: ::..::: :..
XP_011 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
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