Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1349
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1349, 739 aa
  1>>>pF1KSDA1349 739 - 739 aa - 739 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8110+/-0.00111; mu= 15.4973+/- 0.068
 mean_var=338.8460+/-70.195, 0's: 0 Z-trim(107.5): 2107  B-trim: 131 in 2/51
 Lambda= 0.069674
 statistics sampled from 13285 (15600) to 13285 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.46), E-opt: 0.2 (0.183), width:  16
 Scan time: 10.140

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2624 280.1 2.4e-74
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2624 280.1 2.4e-74
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2624 280.1 2.4e-74
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2624 280.1 2.5e-74
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2624 280.1 2.5e-74
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2605 278.4 1.1e-73
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2605 278.4 1.1e-73
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2605 278.4 1.1e-73
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2605 278.4 1.1e-73
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2605 278.4 1.1e-73
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2605 278.5 1.1e-73
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2605 278.5 1.1e-73
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2586 276.6 4.3e-73
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2582 275.9 4.7e-73
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2582 276.0 4.9e-73
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2582 276.0 4.9e-73
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2568 274.7 1.5e-72
NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 2491 266.8 2.7e-70
XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 2491 266.8 2.7e-70
NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 2491 266.8 2.7e-70
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2490 266.7 2.9e-70
XP_016865207 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 806) 2482 265.8 4.9e-70
XP_016865205 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 821) 2482 265.8 4.9e-70
XP_016865210 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 753) 2481 265.7 5.1e-70
XP_016865209 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 786) 2481 265.7 5.2e-70
XP_016865208 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2481 265.7 5.2e-70
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2480 265.6 5.4e-70
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2480 265.6 5.4e-70
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2480 265.6 5.6e-70
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2480 265.6 5.6e-70


>>NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (782 aa)
 initn: 2609 init1: 2609 opt: 2624  Z-score: 1455.7  bits: 280.1 E(85289): 2.4e-74
Smith-Waterman score: 2624; 54.9% identity (76.8% similar) in 665 aa overlap (49-711:120-782)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
                                     ..  ....... ..: :  .:  ..: :  
NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
      90       100       110       120       130        140        

       80        90       100       110         120       130      
pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
      150        160       170       180       190       200       

        140       150       160       170       180       190      
pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
       ::  .:.:.  :::::. : :::   : : .:.: :. ::::.:.::::::.  : :. :
NP_001 LTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIH
       210       220       230       240       250       260       

        200       210       220       230       240       250      
pF1KSD KKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQ
       . ::::::::::.::::.:  .: : .:.:::: ::::.:: :::.:   . :. :: :.
NP_001 QVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIH
       270       280       290       300       310       320       

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
       :::::.::.:::: :...:.:  : . :.:::::::..:::::  .: :..::  :: ::
NP_001 TGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEK
       330       340       350       360       370       380       

        320       330       340       350       360       370      
pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
       ::.:::::: :. .. .. :.:.::::::..:::::::.  .:.: .:   ::: ::..:
NP_001 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC
       390       400       410       420       430       440       

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pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
       :::.:.:.. .....:.::::::::::::::::::   : ::.:. .:.::::::: :::
NP_001 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
       450       460       470       480       490       500       

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
       :.: ..: :  :. ::. :::: :::::. :   :.:. : :.:::::::::.:: :::.
NP_001 KSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFS
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        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
          .:  :: :::: :::::..::: :: .::: .:.: :::::::::::: :::.  :.
NP_001 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
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pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
       ::.:.  ::::::::::.::::::.:: . .::::::::::..::.::::::    .: :
NP_001 LTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTH
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        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
       : ::.:.:::::. :::.: ....:. : : ::::::: : ::::.  . :.:: :. ::
NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
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pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
       :::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::                         
NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (782 aa)
 initn: 2609 init1: 2609 opt: 2624  Z-score: 1455.7  bits: 280.1 E(85289): 2.4e-74
Smith-Waterman score: 2624; 54.9% identity (76.8% similar) in 665 aa overlap (49-711:120-782)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
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NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
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pF1KSD KKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQ
       . ::::::::::.::::.:  .: : .:.:::: ::::.:: :::.:   . :. :: :.
NP_001 QVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIH
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pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
       :::::.::.:::: :...:.:  : . :.:::::::..:::::  .: :..::  :: ::
NP_001 TGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEK
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pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
       ::.:::::: :. .. .. :.:.::::::..:::::::.  .:.: .:   ::: ::..:
NP_001 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC
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        380       390       400       410       420       430      
pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
       :::.:.:.. .....:.::::::::::::::::::   : ::.:. .:.::::::: :::
NP_001 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
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pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
       :.: ..: :  :. ::. :::: :::::. :   :.:. : :.:::::::::.:: :::.
NP_001 KSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFS
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pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
          .:  :: :::: :::::..::: :: .::: .:.: :::::::::::: :::.  :.
NP_001 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
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pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
       ::.:.  ::::::::::.::::::.:: . .::::::::::..::.::::::    .: :
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pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
       : ::.:.:::::. :::.: ....:. : : ::::::: : ::::.  . :.:: :. ::
NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
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pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
       :::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::                         
NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (782 aa)
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NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
       ::  .:.:.  :::::. : :::   : : .:.: :. ::::.:.::::::.  : :. :
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pF1KSD KKIHTGEKPYKCNECGKAFIASSSLMVHQRIHTKEKPYQCNVCGKSFSQCARLNQHQRIQ
       . ::::::::::.::::.:  .: : .:.:::: ::::.:: :::.:   . :. :: :.
NP_001 QVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIH
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pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
       :::::.::.:::: :...:.:  : . :.:::::::..:::::  .: :..::  :: ::
NP_001 TGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEK
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pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
       ::.:::::: :. .. .. :.:.::::::..:::::::.  .:.: .:   ::: ::..:
NP_001 PYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKC
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pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
       :::.:.:.. .....:.::::::::::::::::::   : ::.:. .:.::::::: :::
NP_001 NECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECG
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pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
       :.: ..: :  :. ::. :::: :::::. :   :.:. : :.:::::::::.:: :::.
NP_001 KSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFS
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pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
          .:  :: :::: :::::..::: :: .::: .:.: :::::::::::: :::.  :.
NP_001 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
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pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
       ::.:.  ::::::::::.::::::.:: . .::::::::::..::.::::::    .: :
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pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
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pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
       :::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::                         
NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (818 aa)
 initn: 2609 init1: 2609 opt: 2624  Z-score: 1455.5  bits: 280.1 E(85289): 2.5e-74
Smith-Waterman score: 2624; 54.9% identity (76.8% similar) in 665 aa overlap (49-711:156-818)

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pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
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NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
       ::  .:.:.  :::::. : :::   : : .:.: :. ::::.:.::::::.  : :. :
NP_001 LTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIH
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pF1KSD TGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEEK
       :::::.::.:::: :...:.:  : . :.:::::::..:::::  .: :..::  :: ::
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pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
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pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
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pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
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NP_001 LTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTH
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pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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NP_001 QAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIH
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pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
       :::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::                         
NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (818 aa)
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
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       :::::.::.:::: :...:.:  : . :.:::::::..:::::  .: :..::  :: ::
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       :::.:.:.. .....:.::::::::::::::::::   : ::.:. .:.::::::: :::
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pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 isofo  (818 aa)
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pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
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NP_942 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
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NP_942 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
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pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
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NP_942 DRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSN
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pF1KSD LTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEH
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pF1KSD QKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIH
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pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
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NP_942 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (818 aa)
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pF1KSD DLSQEAILEKLTENGLWDSRMEGLWKWNDRILRLQNNQENHLSQRIIPLKKTPTSQRGFR
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NP_001 IEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIE-NKLMNNQLGVS
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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
NP_001 FHSHL-PELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSL
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pF1KSD LTLGKKSNNKEKPYKCSTCEKAFHYRSLLIQHQRTHTKEKPYECNECGKTFSQPSYLSQH
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pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
       :::.:.:.. .....:.::::::::::::::::::   : ::.:. .:.::::::: :::
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pF1KSD KAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCERAFT
       :.: ..: :  :. ::. :::: :::::. :   :.:. : :.:::::::::.:: :::.
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pF1KSD KMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQ
          .:  :: :::: :::::..::: :: .::: .:.: :::::::::::: :::.  :.
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       : ::.:.:::::. :::.: ....:. : : ::::::: : ::::.  . :.:: :. ::
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       :::. :::.::::.:: .:... : ::::::::::                         
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pF1KSD QLI

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pF1KSD FESILIPEPGIATEELHSRCQTQEENFTENLNLITDTHL--GKIICKEMKGSKAIRQTSE
       :.: : ::  .   : .    .: :. :.: . ..  .   ...  .. :  . . . : 
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       . ::::::::::.::::.:  .: : .:.:::: ::::.:: :::.:   . :. :: :.
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       :::::.::.:::: :...:.:  : . :.:::::::..:::::  .: :..::  :: ::
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pF1KSD PYQCNECGKSFKNTTIFNVHQRIHTGEKPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKPYEC
       ::.:::::: :. .. .. :.:.::::::..:::::::.  .:.: .:   ::: ::..:
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pF1KSD NECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCTECG
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pF1KSD QLI

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pF1KSD TGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRET
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NP_001 TGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK                         
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pF1KSD QLI

>>NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (818 aa)
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739 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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