Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1253
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1253, 453 aa
  1>>>pF1KSDA1253 453 - 453 aa - 453 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8036+/-0.000436; mu= 20.4661+/- 0.027
 mean_var=66.3913+/-13.224, 0's: 0 Z-trim(110.7): 38  B-trim: 41 in 1/49
 Lambda= 0.157405
 statistics sampled from 19061 (19091) to 19061 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.224), width:  16
 Scan time:  8.400

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_065806 (OMIM: 614548) serine incorporator 1 pre ( 453) 3064 705.1 9.6e-203
NP_849196 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 iso ( 455) 1792 416.3 8.7e-116
NP_061035 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 iso ( 459) 1753 407.4  4e-113
NP_001185966 (OMIM: 614549) serine incorporator 2  ( 459) 1749 406.5 7.6e-113
NP_001185967 (OMIM: 614549) serine incorporator 2  ( 464) 1749 406.5 7.6e-113
NP_001185968 (OMIM: 614549) serine incorporator 2  ( 400) 1542 359.4 9.7e-99
NP_006802 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 pre ( 473) 1341 313.9   6e-85
NP_945179 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 pre ( 473) 1341 313.9   6e-85
NP_001167543 (OMIM: 614551) serine incorporator 5  ( 461) 1124 264.6   4e-70
XP_016883090 (OMIM: 607165) PREDICTED: serine inco ( 418) 1082 255.0 2.8e-67
NP_001167542 (OMIM: 614551) serine incorporator 5  ( 420) 1006 237.7 4.4e-62
XP_011541606 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 543) 1006 237.8 5.3e-62
NP_840060 (OMIM: 614551) serine incorporator 5 iso ( 423) 1004 237.3   6e-62
XP_016864812 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 506)  901 214.0 7.6e-55
XP_016864813 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 506)  901 214.0 7.6e-55
NP_001244960 (OMIM: 614550) serine incorporator 4  ( 518)  696 167.4   8e-41
XP_016864815 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 235)  425 105.6 1.5e-22
XP_016864814 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 317)  307 78.9 2.2e-14
NP_001244961 (OMIM: 614550) serine incorporator 4  ( 274)  245 64.8 3.3e-10


>>NP_065806 (OMIM: 614548) serine incorporator 1 precurs  (453 aa)
 initn: 3064 init1: 3064 opt: 3064  Z-score: 3760.9  bits: 705.1 E(85289): 9.6e-203
Smith-Waterman score: 3064; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD MEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGYNTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGYNTT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD STVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 STVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGAR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450   
pF1KSD TAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
              430       440       450   

>>NP_849196 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isoform  (455 aa)
 initn: 1799 init1: 909 opt: 1792  Z-score: 2199.8  bits: 416.3 E(85289): 8.7e-116
Smith-Waterman score: 1792; 54.7% identity (79.7% similar) in 459 aa overlap (1-452:1-454)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
       ::. :: ::. :   ::::::::.:: :::.. ::::.:::...::..:: :. .:: ::
NP_849 MGACLGACSLLSCASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVLVSIIMLSPG
               10        20        30        40        50        60

               70               80        90       100       110   
pF1KSD MEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKS
       .: :: :.:  ::.  :.       . :. :.::.::::.::. : :.....:::. :.:
NP_849 VESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLMLCVSS
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD SSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLID
       : :::::..::::::::   ... .:::.::.:.::..::: :..:.: :::::::::::
NP_849 SRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLVLLID
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD FAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFI
       ::::::. :. : :: .:: :::.:.  : : ::::..:..:.:.:::.:..: :.:.::
NP_849 FAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEGKVFI
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD SVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLS
       :.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... :: .::: : .
NP_849 SLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNPHLPT
              250       260       270       280       290       300

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD IIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTL
        .: .:. . : ::  .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.:  : .   .
NP_849 QLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEECPPM
              310        320       330       340       350         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD IEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPS
       ..    ... .  .:    :: :::.:::::::::::: : ::::..::::::::.   .
NP_849 LDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYKPGET
     360       370           380       390       400       410     

           420       430       440       450   
pF1KSD REMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
       :.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: :::: 
NP_849 RKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
         420       430       440       450     

>>NP_061035 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isoform  (459 aa)
 initn: 1756 init1: 909 opt: 1753  Z-score: 2151.8  bits: 407.4 E(85289): 4e-113
Smith-Waterman score: 1753; 54.2% identity (79.4% similar) in 452 aa overlap (8-452:12-458)

                   10        20        30        40        50      
pF1KSD     MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVM
                  :  .    ::::::::.:: :::.. ::::.:::...::..:: :. .:
NP_061 MGAEGAPDFLSCPRVRRASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVLVSIIM
               10        20        30        40        50        60

         60        70               80        90       100         
pF1KSD LIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMI
       : ::.: :: :.:  ::.  :.       . :. :.::.::::.::. : :.....:::.
NP_061 LSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLML
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KSD KVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLV
        :.:: :::::..::::::::   ... .:::.::.:.::..::: :..:.: :::::::
NP_061 CVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLV
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD LLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSEN
       ::::::::::. :. : :: .:: :::.:.  : : ::::..:..:.:.:::.:..: :.
NP_061 LLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEG
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD KAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNP
       :.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... :: .:::
NP_061 KVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNP
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD SLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSD
        : . .: .:. . : ::  .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.:  : .
NP_061 HLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEE
              310        320       330       340       350         

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD ESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYR
          ...    ... .  .:    :: :::.:::::::::::: : ::::..::::::::.
NP_061 CPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYK
     360       370           380       390       400       410     

     410       420       430       440       450   
pF1KSD YEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
          .:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: :::: 
NP_061 PGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
         420       430       440       450         

>>NP_001185966 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isof  (459 aa)
 initn: 1756 init1: 909 opt: 1749  Z-score: 2146.9  bits: 406.5 E(85289): 7.6e-113
Smith-Waterman score: 1749; 55.0% identity (80.4% similar) in 444 aa overlap (16-452:20-458)

                   10        20        30        40        50      
pF1KSD     MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVM
                          ::::::::.:: :::.. ::::.:::...::..:: :. .:
NP_001 MRSMRLREEESPGPSHTASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVLVSIIM
               10        20        30        40        50        60

         60        70               80        90       100         
pF1KSD LIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMI
       : ::.: :: :.:  ::.  :.       . :. :.::.::::.::. : :.....:::.
NP_001 LSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLML
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KSD KVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLV
        :.:: :::::..::::::::   ... .:::.::.:.::..::: :..:.: :::::::
NP_001 CVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLV
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD LLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSEN
       ::::::::::. :. : :: .:: :::.:.  : : ::::..:..:.:.:::.:..: :.
NP_001 LLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEG
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD KAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNP
       :.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... :: .:::
NP_001 KVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNP
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD SLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSD
        : . .: .:. . : ::  .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.:  : .
NP_001 HLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEE
              310        320       330       340       350         

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD ESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYR
          ...    ... .  .:    :: :::.:::::::::::: : ::::..::::::::.
NP_001 CPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYK
     360       370           380       390       400       410     

     410       420       430       440       450   
pF1KSD YEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
          .:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: :::: 
NP_001 PGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
         420       430       440       450         

>>NP_001185967 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isof  (464 aa)
 initn: 1756 init1: 909 opt: 1749  Z-score: 2146.9  bits: 406.5 E(85289): 7.6e-113
Smith-Waterman score: 1749; 55.0% identity (80.4% similar) in 444 aa overlap (16-452:25-463)

                        10        20        30        40        50 
pF1KSD          MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVC
                               ::::::::.:: :::.. ::::.:::...::..:: 
NP_001 MDGRMMRSMRLREEESPGPSHTASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVL
               10        20        30        40        50        60

              60        70               80        90       100    
pF1KSD VACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLL
       :. .:: ::.: :: :.:  ::.  :.       . :. :.::.::::.::. : :....
NP_001 VSIIMLSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFF
               70        80        90       100       110       120

          110       120       130       140       150       160    
pF1KSD SLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFI
       .:::. :.:: :::::..::::::::   ... .:::.::.:.::..::: :..:.: ::
NP_001 TLLMLCVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFI
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KSD LIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPA
       :::::::::::::::. :. : :: .:: :::.:.  : : ::::..:..:.:.:::.:.
NP_001 LIQLVLLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPS
              190       200       210       220       230       240

          230       240       250       260       270       280    
pF1KSD SCSENKAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPE
       .: :.:.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... ::
NP_001 GCHEGKVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPE
              250       260       270       280       290       300

          290       300       310       320       330       340    
pF1KSD TNCNPSLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKL
        .::: : . .: .:. . : ::  .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.:
NP_001 QKCNPHLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSL
              310       320        330       340       350         

          350       360       370       380       390       400    
pF1KSD TLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTL
         : .   ...    ... .  .:    :: :::.:::::::::::: : ::::..::::
NP_001 MQTEECPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTL
     360       370       380           390       400       410     

          410       420       430       440       450   
pF1KSD TNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
       ::::.   .:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: :::: 
NP_001 TNWYKPGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
         420       430       440       450       460    

>>NP_001185968 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isof  (400 aa)
 initn: 1549 init1: 909 opt: 1542  Z-score: 1893.7  bits: 359.4 E(85289): 9.7e-99
Smith-Waterman score: 1542; 54.2% identity (79.5% similar) in 404 aa overlap (56-452:1-399)

          30        40        50        60        70               
pF1KSD CRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------
                                     :: ::.: :: :.:  ::.  :.       
NP_001                               MLSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGH
                                             10        20        30

       80        90       100       110       120       130        
pF1KSD VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIII
       . :. :.::.::::.::. : :.....:::. :.:: :::::..::::::::   ... .
NP_001 IDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLMLCVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTV
               40        50        60        70        80        90

      140       150       160       170       180       190        
pF1KSD GAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAAL
       :::.::.:.::..::: :..:.: :::::::::::::::::. :. : :: .:: :::.:
NP_001 GAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLVLLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGL
              100       110       120       130       140       150

      200       210       220       230       240       250        
pF1KSD LSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPR
       .  : : ::::..:..:.:.:::.:..: :.:.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: 
NP_001 FFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEGKVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPN
              160       170       180       190       200       210

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD SGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGI
       :::::.::::.:::..::::... :: .::: : . .: .:. . : ::  .::: : .:
NP_001 SGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNPHLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSI
              220       230       240       250        260         

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD IGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNE
       .:::.::::... :.:.:.. :::.:  : .   ...    ... .  .:    :: :::
NP_001 VGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEECPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNE
     270       280       290       300       310           320     

      380       390       400       410       420       430        
pF1KSD RDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYV
       .:::::::::::: : ::::..::::::::.   .:.: : :::::::: .:: :..::.
NP_001 QDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYKPGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYL
         330       340       350       360       370       380     

      440       450   
pF1KSD WTLVAPLVLTNRDFD
       :::::::.: :::: 
NP_001 WTLVAPLLLRNRDFS
         390       400

>>NP_006802 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 precurs  (473 aa)
 initn: 1685 init1: 1040 opt: 1341  Z-score: 1646.0  bits: 313.9 E(85289): 6e-85
Smith-Waterman score: 1859; 59.2% identity (82.5% similar) in 473 aa overlap (1-452:1-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
       ::.:::. :.:::.::::..: :::: :::...::::::::::..::... :. .:    
NP_006 MGAVLGVFSLASWVPCLCSGASCLLCSCCPNSKNSTVTRLIYAFILLLSTVVSYIMQRKE
               10        20        30        40        50        60

               70             80           90       100       110  
pF1KSD MEEQLNKIPGFCE-----NEKGVVP---CNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVK
       ::  :.:::::::     .:  .     :..:::::::::. :..:.:....::::.:::
NP_006 METYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCDVLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVK
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KSD SSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLI
       .:.: ::::::::::::.:: :.:..:.:.:: : :..::: ::: ::  :::::::::.
NP_006 TSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFYIPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLV
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KSD DFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAF
       :::::::::::..::::: : ::::::: :.  :.::.. . :...:::.: .:.::: :
NP_006 DFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFTSAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFF
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KSD ISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLL
       ::.:..::: ::..:: ::::: ::::::::::.::.::::::::::.:::. .:::.:.
NP_006 ISINLILCVVASIISIHPKIQEHQPRSGLLQSSLITLYTMYLTWSAMSNEPDRSCNPNLM
              250       260       270       280       290       300

                     300          310       320       330       340
pF1KSD SIIGY---------NTTSTVPKE---GQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQ
       :.:           :.:..::     ..: .   ....:::..:.::..:::::::.:::
NP_006 SFITRITAPTLAPGNSTAVVPTPTPPSKSGSLLDSDNFIGLFVFVLCLLYSSIRTSTNSQ
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD VNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYI
       :.::::....:... :  . . .. :::.  .::::::..:: ::::.::.:: ::::::
NP_006 VDKLTLSGSDSVILGDTTTSGASDEEDGQP-RRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYI
              370       380       390        400       410         

              410        420       430       440       450   
pF1KSD MMTLTNWYRYEPS-REMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
       :::::.::  . . . : :.: ::::::::::. ..:::::::::::::.::: 
NP_006 MMTLTSWYSPDAKFQSMTSKWPAVWVKISSSWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDFS
     420       430       440       450       460       470   

>>NP_945179 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 precurs  (473 aa)
 initn: 1685 init1: 1040 opt: 1341  Z-score: 1646.0  bits: 313.9 E(85289): 6e-85
Smith-Waterman score: 1859; 59.2% identity (82.5% similar) in 473 aa overlap (1-452:1-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
       ::.:::. :.:::.::::..: :::: :::...::::::::::..::... :. .:    
NP_945 MGAVLGVFSLASWVPCLCSGASCLLCSCCPNSKNSTVTRLIYAFILLLSTVVSYIMQRKE
               10        20        30        40        50        60

               70             80           90       100       110  
pF1KSD MEEQLNKIPGFCE-----NEKGVVP---CNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVK
       ::  :.:::::::     .:  .     :..:::::::::. :..:.:....::::.:::
NP_945 METYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCDVLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVK
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KSD SSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLI
       .:.: ::::::::::::.:: :.:..:.:.:: : :..::: ::: ::  :::::::::.
NP_945 TSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFYIPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLV
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KSD DFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAF
       :::::::::::..::::: : ::::::: :.  :.::.. . :...:::.: .:.::: :
NP_945 DFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFTSAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFF
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KSD ISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLL
       ::.:..::: ::..:: ::::: ::::::::::.::.::::::::::.:::. .:::.:.
NP_945 ISINLILCVVASIISIHPKIQEHQPRSGLLQSSLITLYTMYLTWSAMSNEPDRSCNPNLM
              250       260       270       280       290       300

                     300          310       320       330       340
pF1KSD SIIGY---------NTTSTVPKE---GQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQ
       :.:           :.:..::     ..: .   ....:::..:.::..:::::::.:::
NP_945 SFITRITAPTLAPGNSTAVVPTPTPPSKSGSLLDSDNFIGLFVFVLCLLYSSIRTSTNSQ
              310       320       330       340       350       360

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD VNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYI
       :.::::....:... :  . . .. :::.  .::::::..:: ::::.::.:: ::::::
NP_945 VDKLTLSGSDSVILGDTTTSGASDEEDGQP-RRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYI
              370       380       390        400       410         

              410        420       430       440       450   
pF1KSD MMTLTNWYRYEPS-REMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
       :::::.::  . . . : :.: ::::::::::. ..:::::::::::::.::: 
NP_945 MMTLTSWYSPDAKFQSMTSKWPAVWVKISSSWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDFS
     420       430       440       450       460       470   

>>NP_001167543 (OMIM: 614551) serine incorporator 5 isof  (461 aa)
 initn: 919 init1: 266 opt: 1124  Z-score: 1379.9  bits: 264.6 E(85289): 4e-70
Smith-Waterman score: 1124; 40.0% identity (68.3% similar) in 460 aa overlap (11-452:7-459)

               10        20         30        40        50         
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPC-LLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIP
                 :. . : :::: : : : :::   .:  ::..:::.... : . :.:.  
NP_001     MSAQCCAGQLACCCGSAGCSLCCDCCPRIRQSLSTRFMYALYFILVVVLCCIMMST
                   10        20        30        40        50      

      60         70        80           90       100       110     
pF1KSD GMEEQLNK-IPGFCENEKGVVP---CNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSS
        . ..... :: : .  ::.     :. ::::.::::.:::.: :.... :: .:...:.
NP_001 TVAHKMKEHIPFFEDMCKGIKAGDTCEKLVGYSAVYRVCFGMACFFFIFCLLTLKINNSK
         60        70        80        90       100       110      

         120       130       140        150       160       170    
pF1KSD DPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPE-GTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDF
       . :: .::::::::.    :.  ::::::.  :: ..: ::: .:.: :: :::.::..:
NP_001 SCRAHIHNGFWFFKLLLLGAMCSGAFFIPDQDTFLNAWRYVGAVGGFLFIGIQLLLLVEF
        120       130       140       150       160       170      

          180       190       200       210       220       230    
pF1KSD AHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFIS
       ::.::..:.     .... :::.:  .: . : ..  ..::. :.::.  :: ::: ...
NP_001 AHKWNKNWTAG--TASNKLWYASLALVTLIMYSIATGGLVLMAVFYTQKDSCMENKILLG
        180         190       200       210       220       230    

          240       250       260       270       280       290    
pF1KSD VNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSI
       ::  ::.  :...: : .:. ::.::::::.::. :. :::.::....:       .:. 
NP_001 VNGGLCLLISLVAISPWVQNRQPHSGLLQSGVISCYVTYLTFSALSSKPAE----VVLDE
          240       250       260       270       280           290

          300       310        320       330       340             
pF1KSD IGYNTTSTVPKEGQSVQW-WHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLT-------L
        : :.:  ::  ::..    .   :.:  :.. :..:: . ... :. . :        :
NP_001 HGKNVTICVPDFGQDLYRDENLVTILGTSLLIGCILYSCLTSTTRSSSDALQGRYAAPEL
              300       310       320       330       340       350

        350       360       370       380       390       400      
pF1KSD TSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTN
          .  .  . :...    . : .  :.. .:. :..: ::.:::..::::::.:::.::
NP_001 EIARCCFCFSPGGEDTEEQQPGKEGPRVIYDEKKGTVYIYSYFHFVFFLASLYVMMTVTN
              360       370       380       390       400       410

        410           420       430       440       450    
pF1KSD WYRYEPSREMKS----QWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD 
       :. :: : ...:    .:.  :::..: :: ..::. ::::::   .:.:  
NP_001 WFNYE-SANIESFFSGSWSIFWVKMASCWICVLLYLCTLVAPLCCPTREFSV
               420       430       440       450       460 

>>XP_016883090 (OMIM: 607165) PREDICTED: serine incorpor  (418 aa)
 initn: 1426 init1: 1040 opt: 1082  Z-score: 1328.9  bits: 255.0 E(85289): 2.8e-67
Smith-Waterman score: 1600; 59.3% identity (82.1% similar) in 413 aa overlap (61-452:6-417)

               40        50        60        70             80     
pF1KSD SGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCE-----NEKGVVP---CN
                                     ::  :.:::::::     .:  .     :.
XP_016                          MQRKEMETYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCD
                                        10        20        30     

             90       100       110       120       130       140  
pF1KSD ILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFF
       .:::::::::. :..:.:....::::.:::.:.: ::::::::::::.:: :.:..:.:.
XP_016 VLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVKTSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFY
          40        50        60        70        80        90     

            150       160       170       180       190       200  
pF1KSD IPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSAT
       :: : :..::: ::: ::  :::::::::.:::::::::::..::::: : ::::::: :
XP_016 IPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFT
         100       110       120       130       140       150     

            210       220       230       240       250       260  
pF1KSD ALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLL
       .  :.::.. . :...:::.: .:.::: :::.:..::: ::..:: ::::: :::::::
XP_016 SAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFFISINLILCVVASIISIHPKIQEHQPRSGLL
         160       170       180       190       200       210     

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pF1KSD QSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGY---------NTTSTVPKE---GQSV
       :::.::.::::::::::.:::. .:::.:.:.:           :.:..::     ..: 
XP_016 QSSLITLYTMYLTWSAMSNEPDRSCNPNLMSFITRITAPTLAPGNSTAVVPTPTPPSKSG
         220       230       240       250       260       270     

              320       330       340       350       360       370
pF1KSD QWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDD
       .   ....:::..:.::..:::::::.::::.::::....:... :  . . .. :::. 
XP_016 SLLDSDNFIGLFVFVLCLLYSSIRTSTNSQVDKLTLSGSDSVILGDTTTSGASDEEDGQP
         280       290       300       310       320       330     

              380       390       400       410        420         
pF1KSD VHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPS-REMKSQWTAVWVKISS
        .::::::..:: ::::.::.:: :::::::::::.::  . . . : :.: ::::::::
XP_016 -RRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYIMMTLTSWYSPDAKFQSMTSKWPAVWVKISS
          340       350       360       370       380       390    

     430       440       450   
pF1KSD SWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
       ::. ..:::::::::::::.::: 
XP_016 SWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDFS
          400       410        




453 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 05:34:58 2016 done: Thu Nov  3 05:35:00 2016
 Total Scan time:  8.400 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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