seq1 = pF1KSDA1234.tfa, 2157 bp seq2 = pF1KSDA1234/gi568815593f_243893.tfa (gi568815593f:243893_534831), 290939 bp >pF1KSDA1234 2157 >gi568815593f:243893_534831 (Chr5) 1-74 (99999-100072) 98% -> 75-256 (109838-110019) 100% -> 257-363 (132718-132824) 100% -> 364-453 (169452-169541) 100% -> 454-583 (178837-178966) 99% -> 584-720 (179949-180085) 100% -> 721-774 (183745-183798) 100% -> 775-974 (183915-184114) 100% -> 975-1036 (188571-188632) 100% -> 1037-1178 (188914-189055) 100% -> 1179-2157 (189961-190939) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCCGAGGACGATGATCCCGCCGGGGGAGTGCACGTACGCGGGCCGGAA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99999 AGGCCGAGGACGATGATCCCGCCGGGGGAGTGCACGTACGCGGGCCGGAA 50 . : . : . : . : . : 51 GCGGAGGAGGCCCCTGCAGAAACA GAGGCCCGCCGTGGGGG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 100049 GCGGAGGAGGCCCCTGCAGAAACAGTA...CAGGAGGCCCGCCGTGGGGG 100 . : . : . : . : . : 92 CAGAGAAGTCCAACCCCTCCAAGCGACACCGGGACCGCCTCAACGCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109855 CAGAGAAGTCCAACCCCTCCAAGCGACACCGGGACCGCCTCAACGCCGAG 150 . : . : . : . : . : 142 TTGGACCACCTGGCCAGCCTGCTGCCGTTCCCGCCTGACATCATCTCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109905 TTGGACCACCTGGCCAGCCTGCTGCCGTTCCCGCCTGACATCATCTCCAA 200 . : . : . : . : . : 192 GCTGGACAAGCTTTCTGTCCTGCGCCTCAGTGTCAGTTACCTCCGGGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109955 GCTGGACAAGCTTTCTGTCCTGCGCCTCAGTGTCAGTTACCTCCGGGTGA 250 . : . : . : . : . : 242 AGAGCTTCTTCCAAG TCGTGCAGGAGCAGAGCTCACGGCAG |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 110005 AGAGCTTCTTCCAAGGTA...CAGTCGTGCAGGAGCAGAGCTCACGGCAG 300 . : . : . : . : . : 283 CCTGCGGCCGGCGCCCCCTCGCCCGGAGACAGCTGTCCTCTTGCAGGGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132744 CCTGCGGCCGGCGCCCCCTCGCCCGGAGACAGCTGTCCTCTTGCAGGGTC 350 . : . : . : . : . : 333 TGCCGTGCTGGAGGGAAGGCTGCTGTTGGAG TCTCTTAATG |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 132794 TGCCGTGCTGGAGGGAAGGCTGCTGTTGGAGGTG...TAGTCTCTTAATG 400 . : . : . : . : . : 374 GCTTTGCTCTGGTCGTGAGTGCAGAAGGGACGATATTTTATGCATCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 169462 GCTTTGCTCTGGTCGTGAGTGCAGAAGGGACGATATTTTATGCATCAGCA 450 . : . : . : . : . : 424 ACGATCGTGGACTATCTGGGCTTCCATCAG ACGGATGTAAT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 169512 ACGATCGTGGACTATCTGGGCTTCCATCAGGTA...CAGACGGATGTAAT 500 . : . : . : . : . : 465 GCACCAGAACATTTATGACTACATCCACGTGGACGACCGCCAGGACTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178848 GCACCAGAACATTTATGACTACATCCACGTGGACGACCGCCAGGACTTCT 550 . : . : . : . : . : 515 GCCGGCAGCTCCACTGGGCCATGGACCCTCCCCAGGTGGTGTTTGGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178898 GCCGGCAGCTCCACTGGGCCATGGACCCTCCCCAGGTGGTGTTTGGGCAG 600 . : . : . : . : . : 565 GCCCCGCCCTTGGAGACAG GAGATGATGCTATCCTGGGGAG ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 178948 CCCCCGCCCTTGGAGACAGGTG...CAGGAGATGATGCTATCCTGGGGAG 650 . : . : . : . : . : 606 GCTGCTCAGGGCCCAGGAGTGGGGCACAGGCACGCCCACCGAGTACTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 179971 GCTGCTCAGGGCCCAGGAGTGGGGCACAGGCACGCCCACCGAGTACTCGG 700 . : . : . : . : . : 656 CCTTCCTGACCCGCTGCTTCATCTGCCGTGTGCGCTGCCTGCTGGACAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 180021 CCTTCCTGACCCGCTGCTTCATCTGCCGTGTGCGCTGCCTGCTGGACAGC 750 . : . : . : . : . : 706 ACCTCGGGCTTCCTG GCCCGGGGGTCACAGGCTTGGCAGCT |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 180071 ACCTCGGGCTTCCTGGTG...CAGGCCCGGGGGTCACAGGCTTGGCAGCT 800 . : . : . : . : . : 747 GCGGCTCTGCTGTCCCGAGCCACTCATG ACGATGCAGTTTC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 183771 GCGGCTCTGCTGTCCCGAGCCACTCATGGTG...CAGACGATGCAGTTTC 850 . : . : . : . : . : 788 AAGGAAAACTAAAATTCCTGTTTGGACAGAAGAAGAAGGCGCCGTCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183928 AAGGAAAACTAAAATTCCTGTTTGGACAGAAGAAGAAGGCGCCGTCAGGA 900 . : . : . : . : . : 838 GCCATGCTCCCGCCGCGGCTGTCGCTGTTCTGCATTGCGGCACCCGTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183978 GCCATGCTCCCGCCGCGGCTGTCGCTGTTCTGCATTGCGGCACCCGTTCT 950 . : . : . : . : . : 888 CCTCCCCTCCGCAGCGGAGATGAAAATGAGGAGCGCGCTCCTGAGGGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 184028 CCTCCCCTCCGCAGCGGAGATGAAAATGAGGAGCGCGCTCCTGAGGGCAA 1000 . : . : . : . : . : 938 AACCCAGAGCAGACACCGCAGCCACCGCGGATGCAAA AGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 184078 AACCCAGAGCAGACACCGCAGCCACCGCGGATGCAAAGTG...CAGAGTA 1050 . : . : . : . : . : 979 AAAGCCACCACCAGTCTGTGCGAATCGGAACTGCATGGAAAACCCAATTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 188575 AAAGCCACCACCAGTCTGTGCGAATCGGAACTGCATGGAAAACCCAATTA 1100 . : . : . : . : . : 1029 CTCAGCAG GAAGGAGCAGCAGAGAGAGCGGCGTTTTGGTGC ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 188625 CTCAGCAGGTA...CAGGAAGGAGCAGCAGAGAGAGCGGCGTTTTGGTGC 1150 . : . : . : . : . : 1070 TCAGGGAACAGACTGACGCTGGCCGATGGGCACAGGTTCCCGCCAGGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 188947 TCAGGGAACAGACTGACGCTGGCCGATGGGCACAGGTTCCCGCCAGGGCC 1200 . : . : . : . : . : 1120 CCATGCCTGTGCCTCCGGGGTGGCCCTGACCTTGTCCTTGACCCCAAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 188997 CCATGCCTGTGCCTCCGGGGTGGCCCTGACCTTGTCCTTGACCCCAAGGG 1250 . : . : . : . : . : 1170 GGGCTCAGG GGACAGGGAGGAGGAGCAGCACAGGATGCTGA |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 189047 GGGCTCAGGGTA...CAGGGACAGGGAGGAGGAGCAGCACAGGATGCTGA 1300 . : . : . : . : . : 1211 GCAGGGCCTCTGGAGTGACAGGGCGGAGGGAGACTCCAGGACCCACAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189993 GCAGGGCCTCTGGAGTGACAGGGCGGAGGGAGACTCCAGGACCCACAAAG 1350 . : . : . : . : . : 1261 CCCCTGCCCTGGACAGCGGGAAAGCACAGTGAGGATGGTGCCAGGCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190043 CCCCTGCCCTGGACAGCGGGAAAGCACAGTGAGGATGGTGCCAGGCCGAG 1400 . : . : . : . : . : 1311 GCTGCAGCCCAGCAAGAATGACCCGCCCTCCCTGCGCCCCATGCCCCGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190093 GCTGCAGCCCAGCAAGAATGACCCGCCCTCCCTGCGCCCCATGCCCCGCG 1450 . : . : . : . : . : 1361 GCTCCTGCCTGCCCTGCCCGTGTGTCCAGGGCACTTTCAGGAACTCGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190143 GCTCCTGCCTGCCCTGCCCGTGTGTCCAGGGCACTTTCAGGAACTCGCCC 1500 . : . : . : . : . : 1411 ATCTCTCACCCGCCGAGCCCGTCCCCCAGTGCCTACTCCAGCCGGACCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190193 ATCTCTCACCCGCCGAGCCCGTCCCCCAGTGCCTACTCCAGCCGGACCAG 1550 . : . : . : . : . : 1461 CAGACCCATGCGGGATGTCGGTGAGGACCAGGTGCACCCTCCCCTCTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190243 CAGACCCATGCGGGATGTCGGTGAGGACCAGGTGCACCCTCCCCTCTGCC 1600 . : . : . : . : . : 1511 ACTTTCCCCAGAGGAGCCTGCAGCACCAGCTCCCTCAGCCTGGAGCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190293 ACTTTCCCCAGAGGAGCCTGCAGCACCAGCTCCCTCAGCCTGGAGCTCAG 1650 . : . : . : . : . : 1561 CGTTTTGCCACGAGGGGCTATCCCATGGAGGACATGAAGCTGCAAGGTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190343 CGTTTTGCCACGAGGGGCTATCCCATGGAGGACATGAAGCTGCAAGGTGT 1700 . : . : . : . : . : 1611 ACCGATGCCTCCGGGGGACCTGTGTGGTCCGACGCTGCTGCTAGATGTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190393 ACCGATGCCTCCGGGGGACCTGTGTGGTCCGACGCTGCTGCTAGATGTGT 1750 . : . : . : . : . : 1661 CCATCAAGATGGAGAAGGACTCTGGGTGTGAGGGTGCTGCAGACGGCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190443 CCATCAAGATGGAGAAGGACTCTGGGTGTGAGGGTGCTGCAGACGGCTGT 1800 . : . : . : . : . : 1711 GTGCCCAGCCAGGTGTGGCTGGGGGCCAGTGACAGGAGCCACCCAGCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190493 GTGCCCAGCCAGGTGTGGCTGGGGGCCAGTGACAGGAGCCACCCAGCCAC 1850 . : . : . : . : . : 1761 CTTCCCTACCAGGATGCACCTGAAAACAGAGCCAGACTCTCGGCAACAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190543 CTTCCCTACCAGGATGCACCTGAAAACAGAGCCAGACTCTCGGCAACAGG 1900 . : . : . : . : . : 1811 TGTACATCTCGCACCTGGGGCACGGCGTGCGGGGGGCTCAGCCCCATGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190593 TGTACATCTCGCACCTGGGGCACGGCGTGCGGGGGGCTCAGCCCCATGGG 1950 . : . : . : . : . : 1861 AGGGCCACTGCTGGGCGCAGCAGGGAGCTGACCCCTTTCCACCCTGCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190643 AGGGCCACTGCTGGGCGCAGCAGGGAGCTGACCCCTTTCCACCCTGCACA 2000 . : . : . : . : . : 1911 CTGTGCCTGCCTGGAGCCCACAGACGGCCTTCCCCAGTCGGAGCCTCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190693 CTGTGCCTGCCTGGAGCCCACAGACGGCCTTCCCCAGTCGGAGCCTCCCC 2050 . : . : . : . : . : 1961 ACCAGCTCTGTGCACGGGGCCGAGGTGAACAGTCCTGCACCTGCAGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190743 ACCAGCTCTGTGCACGGGGCCGAGGTGAACAGTCCTGCACCTGCAGAGCT 2100 . : . : . : . : . : 2011 GCTGAGGCCGCCCCTGTGGTCAAGCGGGAGCCCTTGGACTCACCCCAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190793 GCTGAGGCCGCCCCTGTGGTCAAGCGGGAGCCCTTGGACTCACCCCAGTG 2150 . : . : . : . : . : 2061 GGCTACTCACAGCCAGGGAATGGTGCCCGGGATGTTGCCCAAAAGTGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190843 GGCTACTCACAGCCAGGGAATGGTGCCCGGGATGTTGCCCAAAAGTGCCT 2200 . : . : . : . : . 2111 TGGCCACGCTGGTCCCGCCCCAAGCTTCGGGGTGCACATTCCTGCCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190893 TGGCCACGCTGGTCCCGCCCCAAGCTTCGGGGTGCACATTCCTGCCA