Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1169
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1169, 816 aa
  1>>>pF1KSDA1169 816 - 816 aa - 816 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1586+/-0.000985; mu= 16.5447+/- 0.059
 mean_var=84.5969+/-17.242, 0's: 0 Z-trim(106.3): 102  B-trim: 498 in 1/50
 Lambda= 0.139443
 statistics sampled from 8781 (8883) to 8781 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.273), width:  16
 Scan time:  4.250

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31908.1 TPCN1 gene_id:53373|Hs108|chr12        ( 816) 5349 1086.5       0
CCDS44985.1 TPCN1 gene_id:53373|Hs108|chr12        ( 888) 5349 1086.5       0
CCDS76605.1 TPCN1 gene_id:53373|Hs108|chr12        ( 748) 4894 994.9       0
CCDS8189.1 TPCN2 gene_id:219931|Hs108|chr11        ( 752)  436 98.1 5.8e-20
CCDS45999.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19        (2261)  326 76.2 6.9e-13
CCDS82302.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19        (2263)  326 76.2 6.9e-13
CCDS82301.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19        (2266)  326 76.2 6.9e-13
CCDS82300.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19        (2512)  326 76.2 7.5e-13
CCDS45998.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19        (2506)  321 75.2 1.5e-12
CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9         (2237)  302 71.4 1.9e-11
CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9         (2339)  302 71.4   2e-11


>>CCDS31908.1 TPCN1 gene_id:53373|Hs108|chr12             (816 aa)
 initn: 5349 init1: 5349 opt: 5349  Z-score: 5812.9  bits: 1086.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5349; 100.0% identity (100.0% similar) in 816 aa overlap (1-816:1-816)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAVSLDDDVPLILTLDEGGSAPLAPSNGLGQEELPSKNGGSYAIHDSQAPSLSSGGESSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVSLDDDVPLILTLDEGGSAPLAPSNGLGQEELPSKNGGSYAIHDSQAPSLSSGGESSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SSPAHNWEMNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKDAKALAAYLFAHNHLFYLMELATALLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSPAHNWEMNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKDAKALAAYLFAHNHLFYLMELATALLLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VVQFVEAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGVRRNLRQIFQSLPPFMDILLLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVQFVEAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGVRRNLRQIFQSLPPFMDILLLLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMMPSYSRNPWSCVFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMMPSYSRNPWSCVFF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYRLLISQRRPAGISY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYRLLISQRRPAGISY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKDFYDIYEVAALKWKAKKNREHWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKDFYDIYEVAALKWKAKKNREHWF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALALNMEPFYFIVVLRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALALNMEPFYFIVVLRP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD STVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD SHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRKNQDSEVDGGITLEKEISKEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRKNQDSEVDGGITLEKEISKEEL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810      
pF1KSD YEEHAREQEQQRQLSSSAAPAAQQPPGSRQRSQTVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YEEHAREQEQQRQLSSSAAPAAQQPPGSRQRSQTVT
              790       800       810      

>>CCDS44985.1 TPCN1 gene_id:53373|Hs108|chr12             (888 aa)
 initn: 5349 init1: 5349 opt: 5349  Z-score: 5812.3  bits: 1086.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5349; 100.0% identity (100.0% similar) in 816 aa overlap (1-816:73-888)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MAVSLDDDVPLILTLDEGGSAPLAPSNGLG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PWPSGFERELKPETISSPGYHILRATGEENMAVSLDDDVPLILTLDEGGSAPLAPSNGLG
             50        60        70        80        90       100  

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD QEELPSKNGGSYAIHDSQAPSLSSGGESSPSSPAHNWEMNYQEAAIYLQEGENNDKFFTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEELPSKNGGSYAIHDSQAPSLSSGGESSPSSPAHNWEMNYQEAAIYLQEGENNDKFFTH
            110       120       130       140       150       160  

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD PKDAKALAAYLFAHNHLFYLMELATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PKDAKALAAYLFAHNHLFYLMELATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMV
            170       180       190       200       210       220  

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD VVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVLVVQFVEAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVLVVQFVEAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLV
            230       240       250       260       270       280  

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD DCRYCGGVRRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DCRYCGGVRRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSI
            290       300       310       320       330       340  

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD VSLFVLLTTANFPDVMMPSYSRNPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VSLFVLLTTANFPDVMMPSYSRNPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRK
            350       360       370       380       390       400  

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD FKSLLLHKRTAIQHAYRLLISQRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FKSLLLHKRTAIQHAYRLLISQRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNN
            410       420       430       440       450       460  

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD TPLLSLKDFYDIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPLLSLKDFYDIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLV
            470       480       490       500       510       520  

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD VAVNGVWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VAVNGVWILVETFMLKGGNFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLF
            530       540       550       560       570       580  

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD DFSVTVFAFLGLLALALNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFSVTVFAFLGLLALALNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASL
            590       600       610       620       630       640  

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD GLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNF
            650       660       670       680       690       700  

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD DNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAF
            710       720       730       740       750       760  

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD VFRMNYSRKNQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VFRMNYSRKNQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERY
            770       780       790       800       810       820  

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD QQHSMVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHAREQEQQRQLSSSAAPAAQQPPGSRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQHSMVFLGRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHAREQEQQRQLSSSAAPAAQQPPGSRQ
            830       840       850       860       870       880  

             
pF1KSD RSQTVT
       ::::::
CCDS44 RSQTVT
             

>>CCDS76605.1 TPCN1 gene_id:53373|Hs108|chr12             (748 aa)
 initn: 4894 init1: 4894 opt: 4894  Z-score: 5318.8  bits: 994.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4894; 100.0% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (69-816:1-748)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KSD GGSYAIHDSQAPSLSSGGESSPSSPAHNWEMNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKDAKALA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76                               MNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKDAKALA
                                             10        20        30

      100       110       120       130       140       150        
pF1KSD AYLFAHNHLFYLMELATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AYLFAHNHLFYLMELATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMK
               40        50        60        70        80        90

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD LRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVLVVQFVEAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LRWLGLHTFIRHKRTMVKTSVLVVQFVEAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGV
              100       110       120       130       140       150

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD RRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSIVSLFVLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RRNLRQIFQSLPPFMDILLLLLFFMIIFAILGFYLFSPNPSDPYFSTLENSIVSLFVLLT
              160       170       180       190       200       210

      280       290       300       310       320       330        
pF1KSD TANFPDVMMPSYSRNPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TANFPDVMMPSYSRNPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHK
              220       230       240       250       260       270

      340       350       360       370       380       390        
pF1KSD RTAIQHAYRLLISQRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RTAIQHAYRLLISQRRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKD
              280       290       300       310       320       330

      400       410       420       430       440       450        
pF1KSD FYDIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FYDIYEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWI
              340       350       360       370       380       390

      460       470       480       490       500       510        
pF1KSD LVETFMLKGGNFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LVETFMLKGGNFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFA
              400       410       420       430       440       450

      520       530       540       550       560       570        
pF1KSD FLGLLALALNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FLGLLALALNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERYRNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFY
              460       470       480       490       500       510

      580       590       600       610       620       630        
pF1KSD YSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFV
              520       530       540       550       560       570

      640       650       660       670       680       690        
pF1KSD TLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSR
              580       590       600       610       620       630

      700       710       720       730       740       750        
pF1KSD KNQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KNQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFL
              640       650       660       670       680       690

      760       770       780       790       800       810      
pF1KSD GRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHAREQEQQRQLSSSAAPAAQQPPGSRQRSQTVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GRRSRTKSDLSLKMYQEEIQEWYEEHAREQEQQRQLSSSAAPAAQQPPGSRQRSQTVT
              700       710       720       730       740        

>>CCDS8189.1 TPCN2 gene_id:219931|Hs108|chr11             (752 aa)
 initn: 459 init1: 242 opt: 436  Z-score: 471.8  bits: 98.1 E(32554): 5.8e-20
Smith-Waterman score: 671; 26.1% identity (57.6% similar) in 710 aa overlap (39-695:19-702)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KSD VPLILTLDEGGSAPLAPSNGLGQEELPSKNGGSYAIHDSQAPSLSSGGESSPSSPAHNWE
                                     ::..    .   :.. :    :.. :. :.
CCDS81             MAEPQAESEPLLGGARGGGGDWPAGLTTYRSIQVG----PGAAAR-WD
                           10        20        30            40    

       70        80        90       100       110       120        
pF1KSD MNYQEAAIYLQEGENNDKFFTHPKDAKALAAYLFAHNHLFYLMELATALLLLLLSLCEAP
       .  ..:.... :   . . ..:  ::...  :   ....       : .:.:.:.. :.:
CCDS81 LCIDQAVVFI-EDAIQYRSINHRVDASSMWLYRRYYSNVCQRTLSFTIFLILFLAFIETP
            50         60        70        80        90       100  

      130       140                  150       160       170       
pF1KSD AVPALRLGIYVHA-----------TLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRTMVKT
       .  .    .  .:           ..:.. :.: . .: .:   .:   : ..   .   
CCDS81 SSLTSTADVRYRAAPWEPPCGLTESVEVLCLLVFAADLSVKGYLFGWAHFQKNLWLLGYL
            110       120       130       140       150       160  

       180       190         200       210       220       230     
pF1KSD SVLVVQFVEAIVVLVRQMSH--VRVTRALRCIFLVDCRYCGGVRRNLRQIFQSLPPFMDI
        ::::..:.  : :   . :  .:. : :: .::.  .  . ....:. :  ::: . ..
CCDS81 VVLVVSLVDWTVSL-SLVCHEPLRIRRLLRPFFLL--QNSSMMKKTLKCIRWSLPEMASV
            170        180       190         200       210         

         240       250       260               270       280       
pF1KSD LLLLLFFMIIFAILGFYLFSPNPSDP--------YFSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMM
        ::: . . .:...:. ::. . .:         ::..: .:..::.::::::: ::::.
CCDS81 GLLLAIHLCLFTMFGMLLFAGGKQDDGQDRERLTYFQNLPESLTSLLVLLTTANNPDVMI
     220       230       240       250       260       270         

       290       300       310       320       330       340       
pF1KSD PSYSRNPWSCVFFIVYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYR
       :.::.:    .::::.  :   :.:::: :.... :     ..... :...: . . :..
CCDS81 PAYSKNRAYAIFFIVFTVIGSLFLMNLLTAIIYSQFRGYLMKSLQTSLFRRRLGTRAAFE
     280       290       300       310       320       330         

       350            360       370       380       390       400  
pF1KSD LLISQ-----RRPAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKDFYDI
       .: :.       : ... .  . :. . : .... ..   .. . . .. ::: ..:  .
CCDS81 VLSSMVGEGGAFPQAVGVKPQNLLQVLQKVQLDSSHKQAMMEKVRSYGSVLLSAEEFQKL
     340       350       360       370       380       390         

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD YEVAALKWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVET
       ..   :  .. :  ::     :.    .... ..:     :.:.  :.. .: : : :  
CCDS81 FN--ELDRSVVK--EH--PPRPEYQSPFLQSAQFLFGHYYFDYLGNLIALANLVSICV--
     400           410         420       430       440       450   

            470       480            490       500       510       
pF1KSD FMLKGGNFFSKHVPWSYL-----VFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVF
       :..  .. .  .     :     ::.. : .:..::: .::   :::   :.::  .:: 
CCDS81 FLVLDADVLPAERDDFILGILNCVFIVYYLLEMLLKVFALGLRGYLSYPSNVFDGLLTVV
             460       470       480       490       500       510 

       520                            530       540       550      
pF1KSD AFL---------------------GLLALALNMEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERYRNV
        ..                     :::.:    . . ...:.: :...  .::   .  :
CCDS81 LLVLEISTLAVYRLPHPGWRPEMVGLLSLWDMTRMLNMLIVFRFLRIIPSMKL---MAVV
             520       530       540       550       560           

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD LDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVGMEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGN
        .:.. :.  : ..:  :.. :: :::.:...: :..     :.: .: :    : ..  
CCDS81 ASTVLGLVQNMRAFGGILVVVYYVFAIIGINLFRGVIVALPGNSS-LAPA----NGSAPC
      570       580       590       600       610            620   

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD RTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTVVNNWYIIMEGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTM
        .  :.  :. ::::..  ..:::..: ::::: .....    .. ::..::. ...:. 
CCDS81 GSF-EQLEYWANNFDDFAAALVTLWNLMVVNNWQVFLDAYRRYSGPWSKIYFVLWWLVSS
            630       640       650       660       670       680  

         680       690       700       710       720       730     
pF1KSD VV-MTIIVAFILEAFVFRMNYSRKNQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASS
       :. .....:.::: :. . .                                        
CCDS81 VIWVNLFLALILENFLHKWDPRSHLQPLAGTPEATYQMTVELLFRDILEEPGEDELTERL
            690       700       710       720       730       740  

>>CCDS45999.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19             (2261 aa)
 initn: 249 init1: 155 opt: 326  Z-score: 344.9  bits: 76.2 E(32554): 6.9e-13
Smith-Waterman score: 395; 22.8% identity (53.9% similar) in 649 aa overlap (144-718:137-745)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD ATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRT
                                     : . . .  ::  .:.  ::   :  :: .
CCDS45 TIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG---FAFHKGS
        110       120       130       140       150          160   

           180          190       200       210          220       
pF1KSD MVKTSVLVVQFV---EAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGV---RRNLRQIFQ
       .....  :..::    .:.. :     .:. ::.:   :   .  .:.   .  :..:..
CCDS45 YLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRTLRAVR--VLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMK
           170       180       190         200       210       220 

       230       240       250                                     
pF1KSD SLPPFMDILLLLLFFMIIFAILG--FYL--F---------------SPNPS---------
       .. :...: :::.: ..::::.:  ::.  :               :: :          
CCDS45 AMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEEPARTC
             230       240       250       260       270       280 

           260                 270       280       290         300 
pF1KSD ------DPY----------FSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMMPSY--SRNPWSCVFFI
             .::          :...  .....:  .:  .. :... :   : : :. ..::
CCDS45 PNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWNWLYFI
             290       300       310       320       330       340 

             310       320           330       340          350    
pF1KSD VYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFND----IEKRKFKSLLLHKRTAIQ---HAYRLLISQRR
         . :  .:..::.:.:.   :      .:.:.   : :...  :.   ..:   ::. .
CCDS45 PLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRR-AFLKLRRQQQIERELNGYMEWISKAE
             350       360       370        380       390       400

          360       370       380       390       400              
pF1KSD PAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKDFYDIYEV------AAL
        . ..  . .: .:  .:  .: .:    :. ..  .:  .  .. ::  :      :..
CCDS45 EVILAEDETDGEQR--HPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARASI
              410         420       430       440       450        

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD KWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGG
       : .:: .   .: .  :   .    :  .::..:: . .  .::.: . . .  .  .  
CCDS45 K-SAKLENSTFFHKKERRMRFY---IRRMVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHY--NQP
       460       470          480       490       500         510  

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD NFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALALN
       ...:  . .. ..:: ..  :.:.:. :::   :. :..: :: .: . ... ..  ...
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      530       540       550          560       570       580     
pF1KSD MEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERY---RNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVG
           . : ::: :.:::.::. . .   ::.. .... .  . :: . :..:   ::..:
CCDS45 PGTSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLG
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pF1KSD MEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTV
       :..:                         :..   .::    .:::..  ...:.:.. .
CCDS45 MQLF-------------------------GGQFNFDEGTPP-TNFDTFPAAIMTVFQILT
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pF1KSD VNNWYIIM-EGVTSQTSHWSRLYFMTFYIV-----TMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRK
        ..:  .: .:. :: .  . . :  ..::     .........:. .. ..  .. .. 
CCDS45 GEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTKD
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pF1KSD NQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFLG
       .:. :  ..  :  . .::                                         
CCDS45 EQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEMRKQN
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>>CCDS82302.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19             (2263 aa)
 initn: 249 init1: 155 opt: 326  Z-score: 344.9  bits: 76.2 E(32554): 6.9e-13
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                                     : . . .  ::  .:.  ::   :  :: .
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       .....  :..::    .:.. :     .:. ::.:   :   .  .:.   .  :..:..
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       .. :...: :::.: ..::::.:  ::.  :               :: :          
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CCDS82 PNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWNWLYFI
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pF1KSD VYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFND----IEKRKFKSLLLHKRTAIQ---HAYRLLISQRR
         . :  .:..::.:.:.   :      .:.:.   : :...  :.   ..:   ::. .
CCDS82 PLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRR-AFLKLRRQQQIERELNGYMEWISKAE
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        . ..  . .: .:  .:  .: .:    :. ..  .:  .  .. ::  :      :..
CCDS82 EVILAEDETDGEQR--HPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARASI
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pF1KSD KWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGG
       : .:: .   .: .  :   .    :  .::..:: . .  .::.: . . .  .  .  
CCDS82 K-SAKLENSTFFHKKERRMRFY---IRRMVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHY--NQP
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       ...:  . .. ..:: ..  :.:.:. :::   :. :..: :: .: . ... ..  ...
CCDS82 EWLSDFLYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYGLGTRPYFHSSFNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIK
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      530       540       550          560       570       580     
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           . : ::: :.:::.::. . .   ::.. .... .  . :: . :..:   ::..:
CCDS82 PGTSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLG
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pF1KSD MEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTV
       :..:                         :..   .::    .:::..  ...:.:.. .
CCDS82 MQLF-------------------------GGQFNFDEGTPP-TNFDTFPAAIMTVFQILT
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pF1KSD VNNWYIIM-EGVTSQTSHWSRLYFMTFYIV-----TMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRK
        ..:  .: .:. :: .  . . :  ..::     .........:. .. ..  .. .. 
CCDS82 GEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTKD
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pF1KSD NQDSEVDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFLG
       .:. :  ..  :  . .::                                         
CCDS82 EQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEMRKQN
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>>CCDS82301.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19             (2266 aa)
 initn: 249 init1: 155 opt: 326  Z-score: 344.8  bits: 76.2 E(32554): 6.9e-13
Smith-Waterman score: 389; 22.8% identity (53.6% similar) in 646 aa overlap (144-720:137-741)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD ATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRT
                                     : . . .  ::  .:.  ::   :  :: .
CCDS82 TIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG---FAFHKGS
        110       120       130       140       150          160   

           180          190       200       210          220       
pF1KSD MVKTSVLVVQFV---EAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGV---RRNLRQIFQ
       .....  :..::    .:.. :     .:. ::.:   :   .  .:.   .  :..:..
CCDS82 YLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRTLRAVRV--LRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMK
           170       180       190         200       210       220 

       230       240       250                                     
pF1KSD SLPPFMDILLLLLFFMIIFAILG--FYL--F---------------SPNPS---------
       .. :...: :::.: ..::::.:  ::.  :               :: :          
CCDS82 AMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEEPARTC
             230       240       250       260       270       280 

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pF1KSD ------DPY----------FSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMMPSY--SRNPWSCVFFI
             .::          :...  .....:  .:  .. :... :   : : :. ..::
CCDS82 PNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWNWLYFI
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pF1KSD VYLSIELYFIMNLLLAVVFDTFND----IEKRKFKSLLLHKRTAIQ---HAYRLLISQRR
         . :  .:..::.:.:.   :      .:.:.   : :...  :.   ..:   ::. .
CCDS82 PLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRR-AFLKLRRQQQIERELNGYMEWISKAE
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pF1KSD PAGISYRQFEGLMRFYKPRMSARERYLTFKALNQNNTPLLSLKDFYDIYEV------AAL
        . ..  . .: .:  .:  .: .:    :. ..  .:  .  .. ::  :      :..
CCDS82 EVILAEDETDGEQR--HPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARASI
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pF1KSD KWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGG
       : .:: .   .: .  :   . ..    .::..:: . .  .::.: . . .  .  .  
CCDS82 K-SAKLENSTFFHKKERRMRFYIRR---MVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHY--NQP
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pF1KSD NFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALALN
       ...:  . .. ..:: ..  :.:.:. :::   :. :..: :: .: . ... ..  ...
CCDS82 EWLSDFLYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYGLGTRPYFHSSFNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIK
            520       530       540       550       560       570  

      530       540       550          560       570       580     
pF1KSD MEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERY---RNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVG
           . : ::: :.:::.::. . .   ::.. .... .  . :: . :..:   ::..:
CCDS82 PGTSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLG
            580       590       600       610       620       630  

         590       600       610       620       630       640     
pF1KSD MEFFCGIVFPNCCNTSTVADAYRWRNHTVGNRTVVEEGYYYLNNFDNILNSFVTLFELTV
       :..:                         :..   .::    .:::..  ...:.:.. .
CCDS82 MQLF-------------------------GGQFNFDEGTPP-TNFDTFPAAIMTVFQILT
                                     640        650       660      

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pF1KSD VNNWYIIM-EGVTSQTSHWSRLYFMTFYIVTMVVMTIIVAFILEAFVFRMNYSRKNQDSE
        ..:  .: .:. :: .  . . :  ..::  .  .  .  .. :..   : .  .. ..
CCDS82 GEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVD-NLANAQELTK
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pF1KSD VDGGITLEKEISKEELVAVLELYREARGASSDVTRLLETLSQMERYQQHSMVFLGRRSRT
       :..    :.: ....:                                            
CCDS82 VEADEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEM
         730       740       750       760       770       780     

>>CCDS82300.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19             (2512 aa)
 initn: 249 init1: 155 opt: 326  Z-score: 344.2  bits: 76.2 E(32554): 7.5e-13
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                                     : . . .  ::  .:.  ::   :  :: .
CCDS82 TIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG---FAFHKGS
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       .....  :..::    .:.. :     .:. ::.:   :   .  .:.   .  :..:..
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       .. :...: :::.: ..::::.:  ::.  :               :: :          
CCDS82 AMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEEPARTC
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             .::          :...  .....:  .:  .. :... :   : : :. ..::
CCDS82 PNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDLLYNSNDASGNTWNWLYFI
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         . :  .:..::.:.:.   :      .:.:.   : :...  :.   ..:   ::. .
CCDS82 PLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRR-AFLKLRRQQQIERELNGYMEWISKAE
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        . ..  . .: .:  .:  .: .:    :. ..  .:  .  .. ::  :      :..
CCDS82 EVILAEDETDGEQR--HPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPFARASI
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pF1KSD KWKAKKNREHWFDELPRTALLIFKGINILVKSKAFQYFMYLVVAVNGVWILVETFMLKGG
       : .:: .   .: .  :   . ..    .::..:: . .  .::.: . . .  .  .  
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       ...:  . .. ..:: ..  :.:.:. :::   :. :..: :: .: . ... ..  ...
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pF1KSD MEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERY---RNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVG
           . : ::: :.:::.::. . .   ::.. .... .  . :: . :..:   ::..:
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       :..:                         :..   .::    .:::..  ...:.:.. .
CCDS82 MQLF-------------------------GGQFNFDEGTPP-TNFDTFPAAIMTVFQILT
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        ..:  .: .:. :: .  . . :  ..::  .  .  .  .. :..   : .  .. ..
CCDS82 GEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVD-NLANAQELTK
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       :..    :.: ....:                                            
CCDS82 VEADEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEM
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>>CCDS45998.1 CACNA1A gene_id:773|Hs108|chr19             (2506 aa)
 initn: 249 init1: 155 opt: 321  Z-score: 338.7  bits: 75.2 E(32554): 1.5e-12
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pF1KSD ATALLLLLLSLCEAPAVPALRLGIYVHATLELFALMVVVFELCMKLRWLGLHTFIRHKRT
                                     : . . .  ::  .:.  ::   :  :: .
CCDS45 TIIANCIVLALEQHLPDDDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG---FAFHKGS
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pF1KSD MVKTSVLVVQFV---EAIVVLVRQMSHVRVTRALRCIFLVDCRYCGGV---RRNLRQIFQ
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pF1KSD SLPPFMDILLLLLFFMIIFAILG--FYL--F---------------SPNPS---------
       .. :...: :::.: ..::::.:  ::.  :               :: :          
CCDS45 AMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFEEGTDDIQGESPAPCGTEEPARTC
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pF1KSD ------DPY----------FSTLENSIVSLFVLLTTANFPDVMMPSY--SRNPWSCVFFI
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         . :  .:..::.:.:.   :      .:.:.   : :...  :.   ..:   ::. .
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pF1KSD NFFSKHVPWSYLVFLTIYGVELFLKVAGLGPVEYLSSGWNLFDFSVTVFAFLGLLALALN
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pF1KSD MEPFYFIVVLRPLQLLRLFKLKERY---RNVLDTMFELLPRMASLGLTLLIFYYSFAIVG
           . : ::: :.:::.::. . .   ::.. .... .  . :: . :..:   ::..:
CCDS45 PGTSFGISVLRALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLG
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       :..:                         :..   .::    .:::..  ...:.:.. .
CCDS45 MQLF-------------------------GGQFNFDEGTPP-TNFDTFPAAIMTVFQILT
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        ..:  .: .:. :: .  . . :  ..::     .........:. .. ..  .. .. 
CCDS45 GEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTKD
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CCDS45 EQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVWEQRTSEMRKQN
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>>CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9              (2237 aa)
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CCDS59 TIIANCIVLALEQHLPDGDKTPMSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALG---FVFHKGS
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pF1KSD MVKTSVLVVQFVEAIV-VLVRQMSH--VRVTRALRCIFLVDCRYCGGV---RRNLRQIFQ
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CCDS59 YLRNGWNVMDFVVVLTGILATAGTDFDLRTLRAVRV--LRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMK
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pF1KSD SLPPFMDILLLLLFFMIIFAILG--FYL--FS----PNPSD-------------------
       .. :...: :::.: ...:::.:  ::.  :     :: .:                   
CCDS59 AMVPLLQIGLLLFFAILMFAIIGLEFYMGKFHKACFPNSTDAEPVGDFPCGKEAPARLCE
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CCDS59 GDTECREYWPGPNFGITNFDNILFAILTVFQCITMEGWTDILYNTNDAAGNTWNWLYFIP
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pF1KSD YLSIELYFIMNLLLAVVFDTFNDIEKRKFKSLLLHKRTAIQHAYRLLISQRRPAGISYRQ
        . :  .:..::.:.:.   :   ..:      ...: :. .  :    .:.  :     
CCDS59 LIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERER------VENRRAFLKLRRQQQIERELNGYLEWI
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pF1KSD F--EGLMRFYKPRMSARER----YLTFKALNQNNTPLLSLKD----FYDIYEVAALKWKA
       :  : .:   . : .:.:.     :   : ... . :.  ..    : :.  :..   .:
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