Result of SIM4 for pF1KSDA1135

seq1 = pF1KSDA1135.tfa, 2268 bp
seq2 = pF1KSDA1135/gi568815580r_12349641.tfa (gi568815580r:12349641_12757754), 408114 bp

>pF1KSDA1135 2268
>gi568815580r:12349641_12757754 (Chr18)

(complement)

1-337  (99889-100225)   100% ->
338-372  (122659-122693)   100% ->
373-603  (210851-211081)   100% ->
604-729  (222154-222279)   100% ->
730-807  (245224-245301)   100% ->
808-972  (251114-251278)   100% ->
973-1059  (261653-261739)   100% ->
1060-1189  (264554-264683)   100% ->
1190-1231  (271755-271796)   100% ->
1232-1404  (277884-278056)   100% ->
1405-1495  (292797-292887)   100% ->
1496-1638  (294262-294404)   100% ->
1639-1776  (303272-303409)   100% ->
1777-1847  (304617-304687)   100% ->
1848-1875  (305243-305270)   100% ->
1876-2012  (305364-305500)   100% ->
2013-2268  (307859-308114)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAGGCGGCTGGCCCGGCGGGCGGCGGGGAGCCGCGGACTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99889 ATGGCTCAGGCGGCTGGCCCGGCGGGCGGCGGGGAGCCGCGGACTGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGGCGGCGAGGGGCCGCGGGAGCCCGGGGCAGCCGGCGGCGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99939 AGTGGGCGGCGAGGGGCCGCGGGAGCCCGGGGCAGCCGGCGGCGCGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGCTCCCGGGACGCGCTGAGCCTGGAGGAGATCCTGCGGCTGTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99989 GGGGCTCCCGGGACGCGCTGAGCCTGGAGGAGATCCTGCGGCTGTACAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCCCATCAACGAGGAGCAGGCGTGGGCCGTGTGCTACCAGTGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100039 CAGCCCATCAACGAGGAGCAGGCGTGGGCCGTGTGCTACCAGTGCTGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCCCTGCGCGCCGCCGCCCGCCGCCGCCAGCCCCGCCACCGTGTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100089 TTCCCTGCGCGCCGCCGCCCGCCGCCGCCAGCCCCGCCACCGTGTGCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCCGCGCAGATCCGCGTCTGGAGGGACGGCGCCGTCACCCTGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100139 CGGCCGCGCAGATCCGCGTCTGGAGGGACGGCGCCGTCACCCTGGCGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCCGACGACGCGGGAGAGCCGCCCCCAGTTGCGG         GTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100189 GCGGCCGACGACGCGGGAGAGCCGCCCCCAGTTGCGGGTG...CAGGTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATTGGGATATTCACAATGTATGGAAACAGAG         GTCATTGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 122663 ATTGGGATATTCACAATGTATGGAAACAGAGGTA...TAGGTCATTGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTTTGGGAATTATTATTTATAAAGCACTGGACTATGGTTTGAAGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210861 CTTTGGGAATTATTATTTATAAAGCACTGGACTATGGTTTGAAGGAGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAAAGGGAATTAAGCCCTCCCCTAGAGCAGCTTATCGATCACATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210911 GAAGAAAGGGAATTAAGCCCTCCCCTAGAGCAGCTTATCGATCACATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAACACGGTGGAAGCTGACGGTAGCAATGATGAGGGCTATGAGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210961 CAACACGGTGGAAGCTGACGGTAGCAATGATGAGGGCTATGAGGCTGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGAAGGCCTGGGAGATGAAGATGAAAAGAGAAAAATCTCAGCTATTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211011 AAGAAGGCCTGGGAGATGAAGATGAAAAGAGAAAAATCTCAGCTATTCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCATATAGAGATGTCATGAAG         TTGTGTGCTGCTCATCTCCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 211061 TCATATAGAGATGTCATGAAGGTA...TAGTTGTGTGCTGCTCATCTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TACTGAATCAGATGCACCAAATCATTATCAGGCAGTATGTCGTGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222174 TACTGAATCAGATGCACCAAATCATTATCAGGCAGTATGTCGTGCACTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTGCAGAAACAATGGAGCTCCATACATTTCTGACCAAAATTAAGAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222224 TTGCAGAAACAATGGAGCTCCATACATTTCTGACCAAAATTAAGAGTGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAAGAG         AATCTTAAGAAGATTCAAGAAATGGAAAAGAGCGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222274 AAAGAGGTG...TAGAATCTTAAGAAGATTCAAGAAATGGAAAAGAGCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGAATCTAGCACAGACTTGGAAGAGCTGAAAAACGCTGACTGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 245259 TGAATCTAGCACAGACTTGGAAGAGCTGAAAAACGCTGACTGGGTA...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808   GCACGATTCTGGGTACAGGTGATGAGGGATTTGAGGAATGGGGTAAAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251112 AGGCACGATTCTGGGTACAGGTGATGAGGGATTTGAGGAATGGGGTAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTAAGAAGGTCCAAGAGCGGCAGTACAACCCTTTGCCCATTGAATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251162 CTTAAGAAGGTCCAAGAGCGGCAGTACAACCCTTTGCCCATTGAATATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCTCACCCCTTATGAGATGTTAATGGATGACATTCGCTGCAAAAGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251212 GCTCACCCCTTATGAGATGTTAATGGATGACATTCGCTGCAAAAGATACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCTTGCGAAAAGTGATG         GTGAATGGTGATATTCCCCCTCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 251262 CCTTGCGAAAAGTGATGGTA...TAGGTGAATGGTGATATTCCCCCTCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTAAAAAAGAGTGCTCATGAAATCATCCTCGACTTCATCAGATCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261677 TTAAAAAAGAGTGCTCATGAAATCATCCTCGACTTCATCAGATCCAGACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCCTTTAAATCCA         GTCTCAGCCAGAAAACTGAAACCAACTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 261727 TCCTTTAAATCCAGTA...AAGGTCTCAGCCAGAAAACTGAAACCAACTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CACCACGGCCACGGAGCCTCCATGAAAGAATATTAGAAGAAATTAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264582 CACCACGGCCACGGAGCCTCCATGAAAGAATATTAGAAGAAATTAAAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAAAGAAAGCTGCGGCCTGTATCACCAGAGGAGATTAGACGTAGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264632 GAAAGAAAGCTGCGGCCTGTATCACCAGAGGAGATTAGACGTAGCAGATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AG         CAATGCGGCCACTTAGCATGTCTTACAGTTTTGACTTGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264682 AGGTG...CAGCAATGCGGCCACTTAGCATGTCTTACAGTTTTGACTTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAG         ATGTGACTACCCCTGAATCTACAAAGAATCTTGTGGAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271794 CAGGTA...CAGATGTGACTACCCCTGAATCTACAAAGAATCTTGTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TCATCTATGGTGAATGGAGGTTTGACATCACAAACAAAAGAAAACGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277922 TCATCTATGGTGAATGGAGGTTTGACATCACAAACAAAAGAAAACGGGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AAGTACCTCACAGCAGGTGCCTGCACAGCGGAAGAAGCTCCTCAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277972 AAGTACCTCACAGCAGGTGCCTGCACAGCGGAAGAAGCTCCTCAGAGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CAACTCTGGCCGAACTGGACAGCTCTGAGTCTGAG         GAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 278022 CAACTCTGGCCGAACTGGACAGCTCTGAGTCTGAGGTG...CAGGAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ACGCTGCACAAGTCGACCAGCAGCAGCAGCGTGTCTCCCTCTTTCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292803 ACGCTGCACAAGTCGACCAGCAGCAGCAGCGTGTCTCCCTCTTTCCCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGAGCCAGTCCTGGAGGCCGTGTCCACAAGGAAGA         AGCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 292853 AGAGCCAGTCCTGGAGGCCGTGTCCACAAGGAAGAGTG...TAGAGCCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CAAAATTCCTGCCCATATCATCAACACCCCAGCCAGAGAGACGGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294268 CAAAATTCCTGCCCATATCATCAACACCCCAGCCAGAGAGACGGCAGCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CCCCAGAGACGACATTCCATTGAAAAGGAAACGCCTACTAACGTGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294318 CCCCAGAGACGACATTCCATTGAAAAGGAAACGCCTACTAACGTGAGGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GTTCCTGCCGCCTTCCAGGCAGAGTTCCCGCTCTCTT         GAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 294368 GTTCCTGCCGCCTTCCAGGCAGAGTTCCCGCTCTCTTGTA...CAGGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AATTCTGCTACCCAGTGGAATGCCTCGCTCTTACTGTGGAAGAAGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 303276 AATTCTGCTACCCAGTGGAATGCCTCGCTCTTACTGTGGAAGAAGTGATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CATATTCGCCAGGTCCTGGTGAAGGCAGAGCTGGAAAAATACCAACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 303326 CATATTCGCCAGGTCCTGGTGAAGGCAGAGCTGGAAAAATACCAACAGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TAAAGACATCTACACCGCCTTGAAAAAAGGAAAG         CTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 303376 TAAAGACATCTACACCGCCTTGAAAAAAGGAAAGGTA...TAGCTCTGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TTTGTTGCCGAACCAGGAGGTTTTCCTTCTTCACTTGGTCTTATACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304624 TTTGTTGCCGAACCAGGAGGTTTTCCTTCTTCACTTGGTCTTATACCTGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CAGTTCTGTAAGAG         GCCGGTGTGCTCACAGTGTTGCAAAAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 304674 CAGTTCTGTAAGAGGTA...CAGGCCGGTGTGCTCACAGTGTTGCAAAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 G         ATGCGGCTGCCCTCCAAACCATACTCCACTCTTCCTATCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305270 GGTA...TAGATGCGGCTGCCCTCCAAACCATACTCCACTCTTCCTATCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TTTCATTGGGACCTTCTGCTCTGCAAAGAGGGGAAAGTAGTATGAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305404 TTTCATTGGGACCTTCTGCTCTGCAAAGAGGGGAAAGTAGTATGAGGTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GAAAAACCCTCCACTGCCCATCATCGGCCACTTCGGAGCATTGCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 305454 GAAAAACCCTCCACTGCCCATCATCGGCCACTTCGGAGCATTGCCAGGTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2013       GTTCTCCTCAAAATCTAAGTCTATGGACAAATCAGATGAAGAAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305504 ...CAGGTTCTCCTCAAAATCTAAGTCTATGGACAAATCAGATGAAGAAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TCCAGTTTCCCAAAGAGTTGATGGAGGACTGGAGCACCATGGAGGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307903 TCCAGTTTCCCAAAGAGTTGATGGAGGACTGGAGCACCATGGAGGTGTGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GTGGACTGCAAGAAGTTCATTTCGGAAATCATCAGTTCAAGCCGGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 307953 GTGGACTGCAAGAAGTTCATTTCGGAAATCATCAGTTCAAGCCGGCGCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TCTGGTGTTGGCCAACAAAAGGGCCCGATTGAAAAGGAAAACGCAGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308003 TCTGGTGTTGGCCAACAAAAGGGCCCGATTGAAAAGGAAAACGCAGTCTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TCTACATGTCCTCGCCAGGCCCCTCGGAGTACTGCCCTTCAGAGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308053 TCTACATGTCCTCGCCAGGCCCCTCGGAGTACTGCCCTTCAGAGAGGACG

   2400     .    :
   2257 ATCAGTGAGATC
        ||||||||||||
 308103 ATCAGTGAGATC

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