seq1 = pF1KSDA1089.tfa, 3048 bp seq2 = pF1KSDA1089/gi568815597r_156150590.tfa (gi568815597r:156150590_156382662), 232073 bp >pF1KSDA1089 3048 >gi568815597r:156150590_156382662 (Chr1) (complement) 1-74 (99983-100056) 100% -> 75-173 (103629-103727) 100% -> 174-297 (104615-104738) 100% -> 298-454 (105422-105578) 100% -> 455-544 (107977-108066) 100% -> 545-634 (109213-109302) 100% -> 635-713 (110265-110343) 100% -> 714-839 (114248-114373) 100% -> 840-908 (114480-114548) 100% -> 909-1117 (114985-115193) 100% -> 1118-1255 (115985-116122) 100% -> 1256-1855 (116283-116882) 100% -> 1856-2031 (119093-119268) 100% -> 2032-2107 (121255-121330) 100% -> 2108-2283 (122037-122212) 100% -> 2284-2442 (123500-123658) 100% -> 2443-2502 (129155-129214) 100% -> 2503-2662 (129585-129744) 100% -> 2663-2753 (130159-130249) 100% -> 2754-2828 (131186-131260) 100% -> 2829-2967 (131667-131805) 100% -> 2968-3048 (131993-132073) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGCCAAGGCCCCCCCACAGGGGAGAGCAGCGAGCCCGAAGCAAAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99983 ATGAGCCAAGGCCCCCCCACAGGGGAGAGCAGCGAGCCCGAAGCAAAAGT 50 . : . : . : . : . : 51 CCTCCACACTAAGCGGCTTTACCG GGCTGTGGTGGAGGCTG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 100033 CCTCCACACTAAGCGGCTTTACCGGTG...CAGGGCTGTGGTGGAGGCTG 100 . : . : . : . : . : 92 TGCATCGACTTGACCTCATCCTTTGCAACAAAACTGCTTATCAAGAAGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103646 TGCATCGACTTGACCTCATCCTTTGCAACAAAACTGCTTATCAAGAAGTA 150 . : . : . : . : . : 142 TTCAAACCAGAAAACATTAGCCTGAGGAACAA GCTGCGTGA ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 103696 TTCAAACCAGAAAACATTAGCCTGAGGAACAAGTA...CAGGCTGCGTGA 200 . : . : . : . : . : 183 GCTCTGCGTCAAGCTTATGTTCCTGCACCCAGTGGACTATGGGAGAAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104624 GCTCTGCGTCAAGCTTATGTTCCTGCACCCAGTGGACTATGGGAGAAAGG 250 . : . : . : . : . : 233 CTGAGGAGCTGCTGTGGAGAAAGGTATACTATGAAGTTATCCAGCTTATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104674 CTGAGGAGCTGCTGTGGAGAAAGGTATACTATGAAGTTATCCAGCTTATC 300 . : . : . : . : . : 283 AAGACTAACAAAAAG CACATCCACAGCCGGAGCACTTTGGA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 104724 AAGACTAACAAAAAGGTA...TAGCACATCCACAGCCGGAGCACTTTGGA 350 . : . : . : . : . : 324 ATGTGCCTACAGGACGCACCTGGTTGCTGGTATTGGCTTCTACCAGCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105448 ATGTGCCTACAGGACGCACCTGGTTGCTGGTATTGGCTTCTACCAGCATC 400 . : . : . : . : . : 374 TCCTTCTCTATATCCAGTCCCACTACCAGCTGGAACTGCAGTGCTGCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105498 TCCTTCTCTATATCCAGTCCCACTACCAGCTGGAACTGCAGTGCTGCATC 450 . : . : . : . : . : 424 GACTGGACCCATGTCACTGACCCCCTCATAG GATGCAAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 105548 GACTGGACCCATGTCACTGACCCCCTCATAGGTC...TAGGATGCAAGAA 500 . : . : . : . : . : 465 GCCAGTGTCTGCCTCAGGGAAGGAGATGGATTGGGCACAGATGGCATGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107987 GCCAGTGTCTGCCTCAGGGAAGGAGATGGATTGGGCACAGATGGCATGTC 550 . : . : . : . : . : 515 ACCGATGTCTGGTGTATCTGGGGGATTTGT CCCGATATCAG ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 108037 ACCGATGTCTGGTGTATCTGGGGGATTTGTGTA...CAGCCCGATATCAG 600 . : . : . : . : . : 556 AATGAATTAGCTGGCGTAGATACCGAGCTGCTAGCCGAGAGATTTTACTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109224 AATGAATTAGCTGGCGTAGATACCGAGCTGCTAGCCGAGAGATTTTACTA 650 . : . : . : . : . : 606 CCAAGCCCTGTCAGTAGCTCCTCAGATTG GAATGCCCTTCA |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 109274 CCAAGCCCTGTCAGTAGCTCCTCAGATTGGTA...TAGGAATGCCCTTCA 700 . : . : . : . : . : 647 ATCAGCTGGGCACCCTGGCAGGCAGCAAGTACTATAATGTGGAAGCCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110277 ATCAGCTGGGCACCCTGGCAGGCAGCAAGTACTATAATGTGGAAGCCATG 750 . : . : . : . : . : 697 TATTGCTACCTGCGCTG CATCCAGTCAGAAGTGTCCTTTGA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 110327 TATTGCTACCTGCGCTGGTG...CAGCATCCAGTCAGAAGTGTCCTTTGA 800 . : . : . : . : . : 738 GGGAGCCTATGGGAACCTCAAGCGGCTGTATGACAAGGCAGCCAAAATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114272 GGGAGCCTATGGGAACCTCAAGCGGCTGTATGACAAGGCAGCCAAAATGT 850 . : . : . : . : . : 788 ACCACCAACTGAAGAAGTGTGAGACTCGGAAACTGTCTCCTGGCAAAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114322 ACCACCAACTGAAGAAGTGTGAGACTCGGAAACTGTCTCCTGGCAAAAAG 900 . : . : . : . : . : 838 CG ATGTAAAGACATTAAAAGGTTGCTAGTGAACTTTATGTA ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114372 CGGTG...CAGATGTAAAGACATTAAAAGGTTGCTAGTGAACTTTATGTA 950 . : . : . : . : . : 879 TCTGCAAAGCCTCCTACAGCCCAAAAGCAG CTCCGTGGACT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 114519 TCTGCAAAGCCTCCTACAGCCCAAAAGCAGGTG...TAGCTCCGTGGACT 1000 . : . : . : . : . : 920 CAGAGCTGACCTCACTTTGCCAGTCAGTCCTGGAGGACTTCAACCTCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114996 CAGAGCTGACCTCACTTTGCCAGTCAGTCCTGGAGGACTTCAACCTCTGC 1050 . : . : . : . : . : 970 CTCTTCTACCTGCCCTCCTCACCCAACCTCAGCCTGGCCAGTGAGGATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115046 CTCTTCTACCTGCCCTCCTCACCCAACCTCAGCCTGGCCAGTGAGGATGA 1100 . : . : . : . : . : 1020 GGAGGAGTATGAGAGTGGATATGCTTTCCTCCCGGACCTTCTCATCTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115096 GGAGGAGTATGAGAGTGGATATGCTTTCCTCCCGGACCTTCTCATCTTTC 1150 . : . : . : . : . : 1070 AAATGGTCATCATCTGCCTTATGTGTGTGCACAGCTTGGAGAGAGCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 115146 AAATGGTCATCATCTGCCTTATGTGTGTGCACAGCTTGGAGAGAGCAGGT 1200 . : . : . : . : . : 1118 GATCCAAGCAGTACAGTGCAGCCATTGCCTTCACCCTGGCCCT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115196 A...CAGGATCCAAGCAGTACAGTGCAGCCATTGCCTTCACCCTGGCCCT 1250 . : . : . : . : . : 1161 CTTTTCCCACCTCGTCAATCATGTCAACATACGGCTGCAGGCTGAGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116028 CTTTTCCCACCTCGTCAATCATGTCAACATACGGCTGCAGGCTGAGCTGG 1300 . : . : . : . : . : 1211 AAGAGGGCGAGAATCCCGTCCCGGCATTCCAGAGTGATGGCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 116078 AAGAGGGCGAGAATCCCGTCCCGGCATTCCAGAGTGATGGCACAGGTG.. 1350 . : . : . : . : . : 1256 ATGAACCAGAGTCCAAGGAACCTGTGGAGAAAGAGGAGGAGCCAGA .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116128 .CAGATGAACCAGAGTCCAAGGAACCTGTGGAGAAAGAGGAGGAGCCAGA 1400 . : . : . : . : . : 1302 TCCTGAGCCTCCTCCTGTAACACCCCAAGTGGGTGAGGGCAGAAAGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116329 TCCTGAGCCTCCTCCTGTAACACCCCAAGTGGGTGAGGGCAGAAAGAGCC 1450 . : . : . : . : . : 1352 GTAAGTTCTCTCGCCTCTCCTGTCTCCGCCGTCGCCGCCACCCACCCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116379 GTAAGTTCTCTCGCCTCTCCTGTCTCCGCCGTCGCCGCCACCCACCCAAA 1500 . : . : . : . : . : 1402 GTTGGTGATGACAGTGACCTGAGTGAAGGCTTTGAATCGGACTCAAGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116429 GTTGGTGATGACAGTGACCTGAGTGAAGGCTTTGAATCGGACTCAAGCCA 1550 . : . : . : . : . : 1452 TGACTCAGCCCGGGCCAGTGAGGGCTCAGACAGTGGCTCTGACAAGAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116479 TGACTCAGCCCGGGCCAGTGAGGGCTCAGACAGTGGCTCTGACAAGAGTC 1600 . : . : . : . : . : 1502 TTGAAGGTGGGGGAACGGCCTTTGATGCTGAAACAGACTCGGAAATGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116529 TTGAAGGTGGGGGAACGGCCTTTGATGCTGAAACAGACTCGGAAATGAAT 1650 . : . : . : . : . : 1552 AGCCAGGAGTCCCGATCAGACTTGGAAGATATGGAGGAAGAGGAGGGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116579 AGCCAGGAGTCCCGATCAGACTTGGAAGATATGGAGGAAGAGGAGGGGAC 1700 . : . : . : . : . : 1602 ACGGTCACCAACCCTGGAGCCCCCTCGGGGCAGATCAGAGGCTCCCGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116629 ACGGTCACCAACCCTGGAGCCCCCTCGGGGCAGATCAGAGGCTCCCGATT 1750 . : . : . : . : . : 1652 CCCTCAATGGCCCACTGGGCCCCAGTGAGGCTAGCATTGCCAGCAATCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116679 CCCTCAATGGCCCACTGGGCCCCAGTGAGGCTAGCATTGCCAGCAATCTA 1800 . : . : . : . : . : 1702 CAAGCCATGTCCACCCAGATGTTCCAGACTAAGCGCTGCTTCCGACTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116729 CAAGCCATGTCCACCCAGATGTTCCAGACTAAGCGCTGCTTCCGACTGGC 1850 . : . : . : . : . : 1752 CCCCACCTTTAGCAACCTGCTCCTCCAGCCCACCACCAACCCTCATACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116779 CCCCACCTTTAGCAACCTGCTCCTCCAGCCCACCACCAACCCTCATACCT 1900 . : . : . : . : . : 1802 CGGCCAGCCACAGGCCTTGCGTCAATGGGGATGTAGACAAGCCTTCAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116829 CGGCCAGCCACAGGCCTTGCGTCAATGGGGATGTAGACAAGCCTTCAGAG 1950 . : . : . : . : . : 1852 CCAG CCTCTGAGGAGGGCTCTGAGTCGGAGGGGAGTGAGTC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116879 CCAGGTA...CAGCCTCTGAGGAGGGCTCTGAGTCGGAGGGGAGTGAGTC 2000 . : . : . : . : . : 1893 CAGTGGACGCTCCTGTCGGAATGAGCGCAGCATCCAGGAGAAGCTTCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119130 CAGTGGACGCTCCTGTCGGAATGAGCGCAGCATCCAGGAGAAGCTTCAGG 2050 . : . : . : . : . : 1943 TCCTGATGGCCGAAGGTCTGCTTCCTGCTGTGAAAGTCTTCCTGGACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119180 TCCTGATGGCCGAAGGTCTGCTTCCTGCTGTGAAAGTCTTCCTGGACTGG 2100 . : . : . : . : . : 1993 CTTCGGACCAACCCCGACCTCATCATCGTGTGTGCGCAG AG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 119230 CTTCGGACCAACCCCGACCTCATCATCGTGTGTGCGCAGGTG...CAGAG 2150 . : . : . : . : . : 2034 CTCTCAAAGTCTGTGGAACCGCCTGTCTGTGTTGCTGAATCTGTTGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121257 CTCTCAAAGTCTGTGGAACCGCCTGTCTGTGTTGCTGAATCTGTTGCCTG 2200 . : . : . : . : . : 2084 CTGCTGGTGAACTCCAGGAGTCTG GCCTGGCCTTGTGTCCT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 121307 CTGCTGGTGAACTCCAGGAGTCTGGTG...CAGGCCTGGCCTTGTGTCCT 2250 . : . : . : . : . : 2125 GAGGTCCAAGATCTTCTTGAAGGTTGTGAACTGCCTGACCTCCCCTCTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122054 GAGGTCCAAGATCTTCTTGAAGGTTGTGAACTGCCTGACCTCCCCTCTAG 2300 . : . : . : . : . : 2175 CCTTCTGCTCCCAGAGGACATGGCTCTTCGTAACCTGCCCCCGCTCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122104 CCTTCTGCTCCCAGAGGACATGGCTCTTCGTAACCTGCCCCCGCTCCGAG 2350 . : . : . : . : . : 2225 CTGCCCACAGACGCTTTAACTTTGACACGGATCGGCCCCTGCTCAGCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122154 CTGCCCACAGACGCTTTAACTTTGACACGGATCGGCCCCTGCTCAGCACC 2400 . : . : . : . : . : 2275 TTAGAGGAG TCAGTGGTGCGCATCTGCTGCATCCGCAGCTT |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 122204 TTAGAGGAGGTA...CAGTCAGTGGTGCGCATCTGCTGCATCCGCAGCTT 2450 . : . : . : . : . : 2316 TGGTCATTTCATCGCCCGCCTGCAAGGCAGCATCCTGCAGTTCAACCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123532 TGGTCATTTCATCGCCCGCCTGCAAGGCAGCATCCTGCAGTTCAACCCAG 2500 . : . : . : . : . : 2366 AGGTTGGCATCTTCGTCAGCATTGCCCAGTCTGAGCAGGAGAGCCTGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123582 AGGTTGGCATCTTCGTCAGCATTGCCCAGTCTGAGCAGGAGAGCCTGCTG 2550 . : . : . : . : . : 2416 CAGCAGGCCCAGGCACAGTTCCGAATG GCACAGGAGGAAGC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 123632 CAGCAGGCCCAGGCACAGTTCCGAATGGTG...TAGGCACAGGAGGAAGC 2600 . : . : . : . : . : 2457 TCGTCGGAACAGGCTCATGAGAGACATGGCTCAGCTACGACTTCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 129169 TCGTCGGAACAGGCTCATGAGAGACATGGCTCAGCTACGACTTCAGGTA. 2650 . : . : . : . : . : 2503 CTCGAAGTGTCTCAGCTGGAGGGCAGCCTGCAGCAGCCCAAGGCC ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129219 ..CAGCTCGAAGTGTCTCAGCTGGAGGGCAGCCTGCAGCAGCCCAAGGCC 2700 . : . : . : . : . : 2548 CAGTCAGCCATGTCTCCCTACCTCGTCCCTGACACCCAGGCCCTCTGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129630 CAGTCAGCCATGTCTCCCTACCTCGTCCCTGACACCCAGGCCCTCTGCCA 2750 . : . : . : . : . : 2598 CCATCTCCCTGTCATCCGCCAACTGGCCACCAGTGGCCGCTTCATTGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129680 CCATCTCCCTGTCATCCGCCAACTGGCCACCAGTGGCCGCTTCATTGTCA 2800 . : . : . : . : . : 2648 TCATCCCAAGGACAG TGATCGATGGCCTGGATTTGCTGAAG |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 129730 TCATCCCAAGGACAGGTA...CAGTGATCGATGGCCTGGATTTGCTGAAG 2850 . : . : . : . : . : 2689 AAGGAACACCCAGGGGCCCGGGATGGGATTCGGTACCTGGAGGCAGAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130185 AAGGAACACCCAGGGGCCCGGGATGGGATTCGGTACCTGGAGGCAGAGTT 2900 . : . : . : . : . : 2739 TAAAAAAGGAAACAG GTACATTCGCTGCCAGAAAGAGGTGG |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 130235 TAAAAAAGGAAACAGGTG...CAGGTACATTCGCTGCCAGAAAGAGGTGG 2950 . : . : . : . : . : 2780 GAAAGAGCTTTGAGCGGCATAAGCTGAAGAGGCAGGATGCAGATGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 131212 GAAAGAGCTTTGAGCGGCATAAGCTGAAGAGGCAGGATGCAGATGCCTGG 3000 . : . : . : . : . : 2829 GACTCTCTATAAGATCCTAGACAGCTGCAAACAGCTGACTCT >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131262 TA...CAGGACTCTCTATAAGATCCTAGACAGCTGCAAACAGCTGACTCT 3050 . : . : . : . : . : 2871 GGCCCAGGGGGCAGGTGAGGAGGATCCGAGTGGCATGGTGACCATCATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131709 GGCCCAGGGGGCAGGTGAGGAGGATCCGAGTGGCATGGTGACCATCATCA 3100 . : . : . : . : . : 2921 CAGGCCTTCCACTGGACAACCCCAGCGTGCTTTCAGGCCCCATGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 131759 CAGGCCTTCCACTGGACAACCCCAGCGTGCTTTCAGGCCCCATGCAGGTG 3150 . : . : . : . : . : 2968 GCAGCCCTGCAGGCCGCTGCCCACGCCAGTGTGGACATCAAGAA ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131809 ...CAGGCAGCCCTGCAGGCCGCTGCCCACGCCAGTGTGGACATCAAGAA 3200 . : . : . : . 3012 TGTTCTGGACTTCTACAAGCAGTGGAAGGAAATTGGT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132037 TGTTCTGGACTTCTACAAGCAGTGGAAGGAAATTGGT