seq1 = pF1KSDA1029.tfa, 2709 bp seq2 = pF1KSDA1029/gi568815593f_150548276.tfa (gi568815593f:150548276_150757084), 208809 bp >pF1KSDA1029 2709 >gi568815593f:150548276_150757084 (Chr5) 1-2028 (100001-102028) 100% -> 2029-2709 (108129-108809) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGGGGTACTCAGAGGAGGCTAGCTTGCTGCGGCACCTGGAGAAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAGGGGTACTCAGAGGAGGCTAGCTTGCTGCGGCACCTGGAGAAGGT 50 . : . : . : . : . : 51 GGCCAGTGAGGAGGAAGAGGTACCACTGGTGGTTTATCTAAAGGAGAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GGCCAGTGAGGAGGAAGAGGTACCACTGGTGGTTTATCTAAAGGAGAATG 100 . : . : . : . : . : 101 CAGCACTGCTGACAGCCAATGGGCTGCACCTGTCCCAAAACCGAGAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 CAGCACTGCTGACAGCCAATGGGCTGCACCTGTCCCAAAACCGAGAGGCC 150 . : . : . : . : . : 151 CAGCAGTCCTCACCGGCCCCACCTCCAGCTGAGGTCCACAGCCCAGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CAGCAGTCCTCACCGGCCCCACCTCCAGCTGAGGTCCACAGCCCAGCTGC 200 . : . : . : . : . : 201 AGATGTCAACCAAAACCTTGCCTCGCCCAGTGCCACGCTCACCACACCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 AGATGTCAACCAAAACCTTGCCTCGCCCAGTGCCACGCTCACCACACCAA 250 . : . : . : . : . : 251 CTTCTAACAGCAGCCACAATCCGCCAGCCACCGATGTCAATCAGAACCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 CTTCTAACAGCAGCCACAATCCGCCAGCCACCGATGTCAATCAGAACCCA 300 . : . : . : . : . : 301 CCGGCAACTGTTGTCCCACAGAGCCTGCCACTTTCTAGCATCCAACAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 CCGGCAACTGTTGTCCCACAGAGCCTGCCACTTTCTAGCATCCAACAGAA 350 . : . : . : . : . : 351 TTCCTCAGAGGCCCAACTCCCATCTAATGGCACAGGGCCTGCTTCCAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 TTCCTCAGAGGCCCAACTCCCATCTAATGGCACAGGGCCTGCTTCCAAAC 400 . : . : . : . : . : 401 CCAGCACCCTGTGTGCTGATGGGCAACCCCAGGCACCGGCTGAGGAGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 CCAGCACCCTGTGTGCTGATGGGCAACCCCAGGCACCGGCTGAGGAGGTG 450 . : . : . : . : . : 451 AGATGCAGCACACTCCTAATTGACAAGGTATCAACTCCAGCTACCACCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100451 AGATGCAGCACACTCCTAATTGACAAGGTATCAACTCCAGCTACCACCAC 500 . : . : . : . : . : 501 CAGCACCTTCTCCAGAGAAGCTACGCTCATCCCCAGCTCCAGGCCCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100501 CAGCACCTTCTCCAGAGAAGCTACGCTCATCCCCAGCTCCAGGCCCCCAG 550 . : . : . : . : . : 551 CCTCAGATTTCATGTCCAGCTCCCTGCTCATTGACATCCAGCCCAACACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100551 CCTCAGATTTCATGTCCAGCTCCCTGCTCATTGACATCCAGCCCAACACC 600 . : . : . : . : . : 601 CTAGTGGTGTCAGCAGATCAAGAGATGTCTGGGCGAGCAGCTGCCACCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100601 CTAGTGGTGTCAGCAGATCAAGAGATGTCTGGGCGAGCAGCTGCCACCAC 650 . : . : . : . : . : 651 GCCCACCAAGGTCTACAGTGAGGTCCACTTCACACTGGCCAAGCCCCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100651 GCCCACCAAGGTCTACAGTGAGGTCCACTTCACACTGGCCAAGCCCCCAT 700 . : . : . : . : . : 701 CAGTGGTCAACAGGACGGCCAGGCCTTTTGGGATCCAGGCGCCAGGGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100701 CAGTGGTCAACAGGACGGCCAGGCCTTTTGGGATCCAGGCGCCAGGGGGC 750 . : . : . : . : . : 751 ACCAGCCAGATGGAGAGGAGCCCCATGCTAGAGAGACGACATTTTGGGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100751 ACCAGCCAGATGGAGAGGAGCCCCATGCTAGAGAGACGACATTTTGGGGA 800 . : . : . : . : . : 801 GAAGGCCCCGGCTCCCCAGCCCCCCAGTTTGCCAGACAGGAGCCCCCGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100801 GAAGGCCCCGGCTCCCCAGCCCCCCAGTTTGCCAGACAGGAGCCCCCGGC 850 . : . : . : . : . : 851 CACAGAGACACATAATGTCCCGCAGCCCCATGGTGGAAAGGAGGATGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100851 CACAGAGACACATAATGTCCCGCAGCCCCATGGTGGAAAGGAGGATGATG 900 . : . : . : . : . : 901 GGGCAGCGAAGCCCGGCCTCAGAGAGACGCCCCTTGGGGAACTTCACTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100901 GGGCAGCGAAGCCCGGCCTCAGAGAGACGCCCCTTGGGGAACTTCACTGC 950 . : . : . : . : . : 951 ACCCCCCACCTACACTGAGACCTTGTCCACAGCCCCTCTGGCTTCCTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100951 ACCCCCCACCTACACTGAGACCTTGTCCACAGCCCCTCTGGCTTCCTGGG 1000 . : . : . : . : . : 1001 TGAGGTCTCCTCCCTCATATTCTGTCCTGTATCCCAGCTCCGACCCCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101001 TGAGGTCTCCTCCCTCATATTCTGTCCTGTATCCCAGCTCCGACCCCAAG 1050 . : . : . : . : . : 1051 TCTTCTCATCTGAAGGGCCAGGCGGTTCCTGCCAGCAAGACGGGCATTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101051 TCTTCTCATCTGAAGGGCCAGGCGGTTCCTGCCAGCAAGACGGGCATTCT 1100 . : . : . : . : . : 1101 GGAGGAGTCGATGGCCCGCCGGGGCAGCCGCAAATCCATGTTTACTTTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101101 GGAGGAGTCGATGGCCCGCCGGGGCAGCCGCAAATCCATGTTTACTTTCG 1150 . : . : . : . : . : 1151 TGGAGAAGCCCAAGGTGACCCCGAATCCAGACTTGCTGGATCTGGTACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101151 TGGAGAAGCCCAAGGTGACCCCGAATCCAGACTTGCTGGATCTGGTACAG 1200 . : . : . : . : . : 1201 ACAGCGGATGAGAAGCGGCGGCAGAGGGACCAGGGGGAGGTAGGCGTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101201 ACAGCGGATGAGAAGCGGCGGCAGAGGGACCAGGGGGAGGTAGGCGTGGA 1250 . : . : . : . : . : 1251 GGAGGAGCCCTTCGCACTGGGGGCCGAGGCCTCCAACTTCCAGCAGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101251 GGAGGAGCCCTTCGCACTGGGGGCCGAGGCCTCCAACTTCCAGCAGGAGC 1300 . : . : . : . : . : 1301 CAGCACCTCGTGACAGGGCCAGCCCCGCGGCGGCGGAGGAGGTGGTACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101301 CAGCACCTCGTGACAGGGCCAGCCCCGCGGCGGCGGAGGAGGTGGTACCA 1350 . : . : . : . : . : 1351 GAGTGGGCCTCCTGCCTCAAGTCACCCCGCATCCAGGCCAAGCCGAAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101351 GAGTGGGCCTCCTGCCTCAAGTCACCCCGCATCCAGGCCAAGCCGAAGCC 1400 . : . : . : . : . : 1401 CAAACCCAACCAGAACCTCTCCGAGGCCTCTGGGAAGGGAGCTGAGCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101401 CAAACCCAACCAGAACCTCTCCGAGGCCTCTGGGAAGGGAGCTGAGCTCT 1450 . : . : . : . : . : 1451 ACGCCCGCCGCCAGTCACGGATGGAGAAATATGTCATCGAGTCTTCAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101451 ACGCCCGCCGCCAGTCACGGATGGAGAAATATGTCATCGAGTCTTCAAGC 1500 . : . : . : . : . : 1501 CACACGCCAGAGCTGGCCCGCTGCCCATCACCTACCATGTCCCTGCCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101501 CACACGCCAGAGCTGGCCCGCTGCCCATCACCTACCATGTCCCTGCCTTC 1550 . : . : . : . : . : 1551 CTCCTGGAAATACCCCACTAACGCCCCCGGGGCCTTCCGAGTGGCATCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101551 CTCCTGGAAATACCCCACTAACGCCCCCGGGGCCTTCCGAGTGGCATCCC 1600 . : . : . : . : . : 1601 GAAGCCCAGCCCGGACCCCGCCTGCCTCCCTCTACCATGGCTACCTGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101601 GAAGCCCAGCCCGGACCCCGCCTGCCTCCCTCTACCATGGCTACCTGCCT 1650 . : . : . : . : . : 1651 GAGAACGGGGTCCTGCGCCCAGAGCCCACCAAGCAGCCGCCATACCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101651 GAGAACGGGGTCCTGCGCCCAGAGCCCACCAAGCAGCCGCCATACCAGCT 1700 . : . : . : . : . : 1701 GCGCCCCTCGCTCTTTGTCCTCTCACCTATCAAGGAGCCTGCCAAGGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101701 GCGCCCCTCGCTCTTTGTCCTCTCACCTATCAAGGAGCCTGCCAAGGTCT 1750 . : . : . : . : . : 1751 CACCAAGAGCTGCCTCGCCCGCCAAGCCCAGCTCCTTGGACCTGGTGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101751 CACCAAGAGCTGCCTCGCCCGCCAAGCCCAGCTCCTTGGACCTGGTGCCC 1800 . : . : . : . : . : 1801 AACCTGCCCAAGGGGGCTCTCCCTCCATCTCCTGCCCTGCCTCGGCCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101801 AACCTGCCCAAGGGGGCTCTCCCTCCATCTCCTGCCCTGCCTCGGCCCTC 1850 . : . : . : . : . : 1851 GCGCTCCTCACCGGGCCTCTACACCTCCCCCGGCCAGGACAGCCTGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101851 GCGCTCCTCACCGGGCCTCTACACCTCCCCCGGCCAGGACAGCCTGCAGC 1900 . : . : . : . : . : 1901 CCACTGCCGTGAGCCCTCCTTACGGCGGTGACATCTCCCCCGTGTCTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101901 CCACTGCCGTGAGCCCTCCTTACGGCGGTGACATCTCCCCCGTGTCTCCC 1950 . : . : . : . : . : 1951 TCCAGGGCGTGGTCTCCCCGAGCCAAGCAGGCCCCCAGGCCCTCCTTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101951 TCCAGGGCGTGGTCTCCCCGAGCCAAGCAGGCCCCCAGGCCCTCCTTCTC 2000 . : . : . : . : . : 2001 TACCCGGAACGCCGGGATCGAGGCTCAG GACCGCCGGGAGA ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 102001 TACCCGGAACGCCGGGATCGAGGCTCAGGTG...CAGGACCGCCGGGAGA 2050 . : . : . : . : . : 2042 GCCTGCCCACCTCCCCACCCTGGACGCCGGGCGCGTCCCGGCCCCCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108142 GCCTGCCCACCTCCCCACCCTGGACGCCGGGCGCGTCCCGGCCCCCCAGC 2100 . : . : . : . : . : 2092 AGCCTAGACGGCTGGGTGAGCCCGGGCCCGTGGGAGCCAGGTCGCGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108192 AGCCTAGACGGCTGGGTGAGCCCGGGCCCGTGGGAGCCAGGTCGCGGGAG 2150 . : . : . : . : . : 2142 CAGCATGAGCAGCCCCCCGCCGCTGCCGCCGCCACCGCCCATGTCTCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108242 CAGCATGAGCAGCCCCCCGCCGCTGCCGCCGCCACCGCCCATGTCTCCCT 2200 . : . : . : . : . : 2192 CGTGGAGCGAGCGCTCGGTGTCCCCGCTGCGACCTGAGACCGAGGCGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108292 CGTGGAGCGAGCGCTCGGTGTCCCCGCTGCGACCTGAGACCGAGGCGCGG 2250 . : . : . : . : . : 2242 CCCCCCAGCCGCCAGCTGCAGGCGCTTCTGGCGCGAAACATCATCAATGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108342 CCCCCCAGCCGCCAGCTGCAGGCGCTTCTGGCGCGAAACATCATCAATGC 2300 . : . : . : . : . : 2292 GGCCCGGCGCAAGAGCGCCTCCCCGCGGTCGGCGGGCGCCGAGAACCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108392 GGCCCGGCGCAAGAGCGCCTCCCCGCGGTCGGCGGGCGCCGAGAACCCGC 2350 . : . : . : . : . : 2342 GGCCCTTCTCCCCGCCGAGGGCGCCACCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108442 GGCCCTTCTCCCCGCCGAGGGCGCCACCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCC 2400 . : . : . : . : . : 2392 CCGCCCCCGCGCATGCGCTCGCCACAGCCCGCCCGCCCCGGCTCGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108492 CCGCCCCCGCGCATGCGCTCGCCACAGCCCGCCCGCCCCGGCTCGGCTGC 2450 . : . : . : . : . : 2442 TGTGCCGGGGGCAGCCTTCGCGCCCATCCCGCGGAGCCCGTTGCCCGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108542 TGTGCCGGGGGCAGCCTTCGCGCCCATCCCGCGGAGCCCGTTGCCCGCCG 2500 . : . : . : . : . : 2492 GTCCTTCGTCCTGCACCAGTCCCCGGAGCCCGCTGCCCGCGCCTCCCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108592 GTCCTTCGTCCTGCACCAGTCCCCGGAGCCCGCTGCCCGCGCCTCCCAGG 2550 . : . : . : . : . : 2542 CCCTTCCTCTACCGCCGCTCGCCCACGGACTCCGACGTGTCCCTCGACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108642 CCCTTCCTCTACCGCCGCTCGCCCACGGACTCCGACGTGTCCCTCGACTC 2600 . : . : . : . : . : 2592 CGAGGACTCCGGGGCTAAGTCTCCAGGCATCCTGGGCTACAATATCTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108692 CGAGGACTCCGGGGCTAAGTCTCCAGGCATCCTGGGCTACAATATCTGTC 2650 . : . : . : . : . : 2642 CCCGCGGGTGGAATGGCAGCCTTCGGCTCAAGCGTGGCAGCCTCCCCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108742 CCCGCGGGTGGAATGGCAGCCTTCGGCTCAAGCGTGGCAGCCTCCCCGCC 2700 . : . 2692 GAGGCCTCCTGCACCACC |||||||||||||||||| 108792 GAGGCCTCCTGCACCACC