Result of SIM4 for pF1KSDA1029

seq1 = pF1KSDA1029.tfa, 2709 bp
seq2 = pF1KSDA1029/gi568815593f_150548276.tfa (gi568815593f:150548276_150757084), 208809 bp

>pF1KSDA1029 2709
>gi568815593f:150548276_150757084 (Chr5)

1-2028  (100001-102028)   100% ->
2029-2709  (108129-108809)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGGGTACTCAGAGGAGGCTAGCTTGCTGCGGCACCTGGAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGGGTACTCAGAGGAGGCTAGCTTGCTGCGGCACCTGGAGAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCAGTGAGGAGGAAGAGGTACCACTGGTGGTTTATCTAAAGGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCAGTGAGGAGGAAGAGGTACCACTGGTGGTTTATCTAAAGGAGAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCACTGCTGACAGCCAATGGGCTGCACCTGTCCCAAAACCGAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGCACTGCTGACAGCCAATGGGCTGCACCTGTCCCAAAACCGAGAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCAGTCCTCACCGGCCCCACCTCCAGCTGAGGTCCACAGCCCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCAGTCCTCACCGGCCCCACCTCCAGCTGAGGTCCACAGCCCAGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGATGTCAACCAAAACCTTGCCTCGCCCAGTGCCACGCTCACCACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGATGTCAACCAAAACCTTGCCTCGCCCAGTGCCACGCTCACCACACCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTCTAACAGCAGCCACAATCCGCCAGCCACCGATGTCAATCAGAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTCTAACAGCAGCCACAATCCGCCAGCCACCGATGTCAATCAGAACCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGCAACTGTTGTCCCACAGAGCCTGCCACTTTCTAGCATCCAACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGCAACTGTTGTCCCACAGAGCCTGCCACTTTCTAGCATCCAACAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTCCTCAGAGGCCCAACTCCCATCTAATGGCACAGGGCCTGCTTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTCCTCAGAGGCCCAACTCCCATCTAATGGCACAGGGCCTGCTTCCAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAGCACCCTGTGTGCTGATGGGCAACCCCAGGCACCGGCTGAGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAGCACCCTGTGTGCTGATGGGCAACCCCAGGCACCGGCTGAGGAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGATGCAGCACACTCCTAATTGACAAGGTATCAACTCCAGCTACCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGATGCAGCACACTCCTAATTGACAAGGTATCAACTCCAGCTACCACCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCACCTTCTCCAGAGAAGCTACGCTCATCCCCAGCTCCAGGCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGCACCTTCTCCAGAGAAGCTACGCTCATCCCCAGCTCCAGGCCCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTCAGATTTCATGTCCAGCTCCCTGCTCATTGACATCCAGCCCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTCAGATTTCATGTCCAGCTCCCTGCTCATTGACATCCAGCCCAACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTAGTGGTGTCAGCAGATCAAGAGATGTCTGGGCGAGCAGCTGCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTAGTGGTGTCAGCAGATCAAGAGATGTCTGGGCGAGCAGCTGCCACCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCCACCAAGGTCTACAGTGAGGTCCACTTCACACTGGCCAAGCCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCCCACCAAGGTCTACAGTGAGGTCCACTTCACACTGGCCAAGCCCCCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGTGGTCAACAGGACGGCCAGGCCTTTTGGGATCCAGGCGCCAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGTGGTCAACAGGACGGCCAGGCCTTTTGGGATCCAGGCGCCAGGGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACCAGCCAGATGGAGAGGAGCCCCATGCTAGAGAGACGACATTTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACCAGCCAGATGGAGAGGAGCCCCATGCTAGAGAGACGACATTTTGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAGGCCCCGGCTCCCCAGCCCCCCAGTTTGCCAGACAGGAGCCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAGGCCCCGGCTCCCCAGCCCCCCAGTTTGCCAGACAGGAGCCCCCGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACAGAGACACATAATGTCCCGCAGCCCCATGGTGGAAAGGAGGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACAGAGACACATAATGTCCCGCAGCCCCATGGTGGAAAGGAGGATGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGGCAGCGAAGCCCGGCCTCAGAGAGACGCCCCTTGGGGAACTTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGCAGCGAAGCCCGGCCTCAGAGAGACGCCCCTTGGGGAACTTCACTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACCCCCCACCTACACTGAGACCTTGTCCACAGCCCCTCTGGCTTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACCCCCCACCTACACTGAGACCTTGTCCACAGCCCCTCTGGCTTCCTGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAGGTCTCCTCCCTCATATTCTGTCCTGTATCCCAGCTCCGACCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAGGTCTCCTCCCTCATATTCTGTCCTGTATCCCAGCTCCGACCCCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCTTCTCATCTGAAGGGCCAGGCGGTTCCTGCCAGCAAGACGGGCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCTTCTCATCTGAAGGGCCAGGCGGTTCCTGCCAGCAAGACGGGCATTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAGGAGTCGATGGCCCGCCGGGGCAGCCGCAAATCCATGTTTACTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAGGAGTCGATGGCCCGCCGGGGCAGCCGCAAATCCATGTTTACTTTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGAGAAGCCCAAGGTGACCCCGAATCCAGACTTGCTGGATCTGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGAGAAGCCCAAGGTGACCCCGAATCCAGACTTGCTGGATCTGGTACAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACAGCGGATGAGAAGCGGCGGCAGAGGGACCAGGGGGAGGTAGGCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACAGCGGATGAGAAGCGGCGGCAGAGGGACCAGGGGGAGGTAGGCGTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGAGGAGCCCTTCGCACTGGGGGCCGAGGCCTCCAACTTCCAGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGAGGAGCCCTTCGCACTGGGGGCCGAGGCCTCCAACTTCCAGCAGGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CAGCACCTCGTGACAGGGCCAGCCCCGCGGCGGCGGAGGAGGTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CAGCACCTCGTGACAGGGCCAGCCCCGCGGCGGCGGAGGAGGTGGTACCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GAGTGGGCCTCCTGCCTCAAGTCACCCCGCATCCAGGCCAAGCCGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GAGTGGGCCTCCTGCCTCAAGTCACCCCGCATCCAGGCCAAGCCGAAGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAAACCCAACCAGAACCTCTCCGAGGCCTCTGGGAAGGGAGCTGAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAAACCCAACCAGAACCTCTCCGAGGCCTCTGGGAAGGGAGCTGAGCTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACGCCCGCCGCCAGTCACGGATGGAGAAATATGTCATCGAGTCTTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACGCCCGCCGCCAGTCACGGATGGAGAAATATGTCATCGAGTCTTCAAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CACACGCCAGAGCTGGCCCGCTGCCCATCACCTACCATGTCCCTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CACACGCCAGAGCTGGCCCGCTGCCCATCACCTACCATGTCCCTGCCTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTCCTGGAAATACCCCACTAACGCCCCCGGGGCCTTCCGAGTGGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTCCTGGAAATACCCCACTAACGCCCCCGGGGCCTTCCGAGTGGCATCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GAAGCCCAGCCCGGACCCCGCCTGCCTCCCTCTACCATGGCTACCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GAAGCCCAGCCCGGACCCCGCCTGCCTCCCTCTACCATGGCTACCTGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAGAACGGGGTCCTGCGCCCAGAGCCCACCAAGCAGCCGCCATACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAGAACGGGGTCCTGCGCCCAGAGCCCACCAAGCAGCCGCCATACCAGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GCGCCCCTCGCTCTTTGTCCTCTCACCTATCAAGGAGCCTGCCAAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GCGCCCCTCGCTCTTTGTCCTCTCACCTATCAAGGAGCCTGCCAAGGTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CACCAAGAGCTGCCTCGCCCGCCAAGCCCAGCTCCTTGGACCTGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CACCAAGAGCTGCCTCGCCCGCCAAGCCCAGCTCCTTGGACCTGGTGCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AACCTGCCCAAGGGGGCTCTCCCTCCATCTCCTGCCCTGCCTCGGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AACCTGCCCAAGGGGGCTCTCCCTCCATCTCCTGCCCTGCCTCGGCCCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GCGCTCCTCACCGGGCCTCTACACCTCCCCCGGCCAGGACAGCCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GCGCTCCTCACCGGGCCTCTACACCTCCCCCGGCCAGGACAGCCTGCAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CCACTGCCGTGAGCCCTCCTTACGGCGGTGACATCTCCCCCGTGTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCACTGCCGTGAGCCCTCCTTACGGCGGTGACATCTCCCCCGTGTCTCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TCCAGGGCGTGGTCTCCCCGAGCCAAGCAGGCCCCCAGGCCCTCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TCCAGGGCGTGGTCTCCCCGAGCCAAGCAGGCCCCCAGGCCCTCCTTCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TACCCGGAACGCCGGGATCGAGGCTCAG         GACCGCCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102001 TACCCGGAACGCCGGGATCGAGGCTCAGGTG...CAGGACCGCCGGGAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 GCCTGCCCACCTCCCCACCCTGGACGCCGGGCGCGTCCCGGCCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108142 GCCTGCCCACCTCCCCACCCTGGACGCCGGGCGCGTCCCGGCCCCCCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 AGCCTAGACGGCTGGGTGAGCCCGGGCCCGTGGGAGCCAGGTCGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108192 AGCCTAGACGGCTGGGTGAGCCCGGGCCCGTGGGAGCCAGGTCGCGGGAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 CAGCATGAGCAGCCCCCCGCCGCTGCCGCCGCCACCGCCCATGTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108242 CAGCATGAGCAGCCCCCCGCCGCTGCCGCCGCCACCGCCCATGTCTCCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 CGTGGAGCGAGCGCTCGGTGTCCCCGCTGCGACCTGAGACCGAGGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108292 CGTGGAGCGAGCGCTCGGTGTCCCCGCTGCGACCTGAGACCGAGGCGCGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 CCCCCCAGCCGCCAGCTGCAGGCGCTTCTGGCGCGAAACATCATCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108342 CCCCCCAGCCGCCAGCTGCAGGCGCTTCTGGCGCGAAACATCATCAATGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 GGCCCGGCGCAAGAGCGCCTCCCCGCGGTCGGCGGGCGCCGAGAACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108392 GGCCCGGCGCAAGAGCGCCTCCCCGCGGTCGGCGGGCGCCGAGAACCCGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342 GGCCCTTCTCCCCGCCGAGGGCGCCACCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108442 GGCCCTTCTCCCCGCCGAGGGCGCCACCGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 CCGCCCCCGCGCATGCGCTCGCCACAGCCCGCCCGCCCCGGCTCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108492 CCGCCCCCGCGCATGCGCTCGCCACAGCCCGCCCGCCCCGGCTCGGCTGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 TGTGCCGGGGGCAGCCTTCGCGCCCATCCCGCGGAGCCCGTTGCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108542 TGTGCCGGGGGCAGCCTTCGCGCCCATCCCGCGGAGCCCGTTGCCCGCCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 GTCCTTCGTCCTGCACCAGTCCCCGGAGCCCGCTGCCCGCGCCTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108592 GTCCTTCGTCCTGCACCAGTCCCCGGAGCCCGCTGCCCGCGCCTCCCAGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542 CCCTTCCTCTACCGCCGCTCGCCCACGGACTCCGACGTGTCCCTCGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108642 CCCTTCCTCTACCGCCGCTCGCCCACGGACTCCGACGTGTCCCTCGACTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2592 CGAGGACTCCGGGGCTAAGTCTCCAGGCATCCTGGGCTACAATATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108692 CGAGGACTCCGGGGCTAAGTCTCCAGGCATCCTGGGCTACAATATCTGTC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2642 CCCGCGGGTGGAATGGCAGCCTTCGGCTCAAGCGTGGCAGCCTCCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108742 CCCGCGGGTGGAATGGCAGCCTTCGGCTCAAGCGTGGCAGCCTCCCCGCC

   2700     .    :    .
   2692 GAGGCCTCCTGCACCACC
        ||||||||||||||||||
 108792 GAGGCCTCCTGCACCACC

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