seq1 = pF1KSDA0969.tfa, 3144 bp seq2 = pF1KSDA0969/gi568815597r_204123473.tfa (gi568815597r:204123473_204373727), 250255 bp >pF1KSDA0969 3144 >gi568815597r:204123473_204373727 (Chr1) (complement) 1-102 (100001-100102) 100% -> 103-207 (105416-105520) 99% -> 208-280 (106181-106253) 100% -> 281-381 (108686-108786) 100% -> 382-524 (112280-112422) 100% -> 525-1007 (113988-114470) 100% -> 1008-1524 (115859-116375) 100% -> 1525-1593 (123114-123182) 100% -> 1594-1674 (124464-124544) 100% -> 1675-1824 (124758-124907) 100% -> 1825-1920 (126268-126363) 100% -> 1921-2032 (128002-128113) 100% -> 2033-2172 (128725-128864) 100% -> 2173-2302 (131914-132043) 100% -> 2303-2409 (132247-132353) 100% -> 2410-2583 (143142-143315) 99% -> 2584-2751 (144624-144791) 99% -> 2752-2885 (144867-145000) 100% -> 2886-3031 (145500-145645) 100% -> 3032-3144 (150143-150255) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCCAATAAAACAGGTGGGAAACGCCCGGCTACCACCAACAGTGACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCCAATAAAACAGGTGGGAAACGCCCGGCTACCACCAACAGTGACAT 50 . : . : . : . : . : 51 ACCCAACCACAACATGGTGTCCGAGGTCCCTCCAGAGCGGCCCAGCGTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 ACCCAACCACAACATGGTGTCCGAGGTCCCTCCAGAGCGGCCCAGCGTCC 100 . : . : . : . : . : 101 GG GCAACTCGCACAGCCCGCAAAGCCATCGCCTTTGGCAAG ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 100101 GGGTA...CAGGCAACTCGCACAGCCCGCAAAGCCGTCGCCTTTGGCAAG 150 . : . : . : . : . : 142 CGCTCACACTCCATGAAGCGGAACCCCAATGCACCTGTCACCAAGGCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105455 CGCTCACACTCCATGAAGCGGAACCCCAATGCACCTGTCACCAAGGCGGG 200 . : . : . : . : . : 192 CTGGCTCTTCAAACAG GCCAGCTCCGGGGTTAAGCAGTGGA ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 105505 CTGGCTCTTCAAACAGGTG...CAGGCCAGCTCCGGGGTTAAGCAGTGGA 250 . : . : . : . : . : 233 ACAAGCGCTGGTTCGTCCTGGTGGATCGCTGCCTCTTCTACTATAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 106206 ACAAGCGCTGGTTCGTCCTGGTGGATCGCTGCCTCTTCTACTATAAAGGT 300 . : . : . : . : . : 281 ATGAGAAGGAAGAGAGTATCCTGGGCAGCATCCCCCTCCTGAG >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106256 G...CAGATGAGAAGGAAGAGAGTATCCTGGGCAGCATCCCCCTCCTGAG 350 . : . : . : . : . : 324 CTTCCGGGTAGCCGCAGTGCAGCCCTCAGACAACATCAGCCGGAAACACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108729 CTTCCGGGTAGCCGCAGTGCAGCCCTCAGACAACATCAGCCGGAAACACA 400 . : . : . : . : . : 374 CGTTTAAG GCTGAGCATGCCGGGGTCCGCACCTACTTCTTC ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 108779 CGTTTAAGGTC...CAGGCTGAGCATGCCGGGGTCCGCACCTACTTCTTC 450 . : . : . : . : . : 415 AGTGCCGAGAGCCCCGAGGAGCAAGAGGCCTGGATCCAGGCCATGGGGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112313 AGTGCCGAGAGCCCCGAGGAGCAAGAGGCCTGGATCCAGGCCATGGGGGA 500 . : . : . : . : . : 465 GGCTGCTCGAGTACAGATCCCTCCAGCCCAGAAGTCAGTGCCCCAAGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112363 GGCTGCTCGAGTACAGATCCCTCCAGCCCAGAAGTCAGTGCCCCAAGCTG 550 . : . : . : . : . : 515 TGCGGCACAG CCATGAGAAGCCAGACTCGGAGAACGTCCCA ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 112413 TGCGGCACAGGTG...CAGCCATGAGAAGCCAGACTCGGAGAACGTCCCA 600 . : . : . : . : . : 556 CCCAGCAAGCACCACCAGCAGCCACCCCACAACAGCCTCCCTAAGCCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114019 CCCAGCAAGCACCACCAGCAGCCACCCCACAACAGCCTCCCTAAGCCTGA 650 . : . : . : . : . : 606 GCCAGAGGCCAAGACTCGAGGGGAGGGTGATGGCCGAGGCTGTGAGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114069 GCCAGAGGCCAAGACTCGAGGGGAGGGTGATGGCCGAGGCTGTGAGAAGG 700 . : . : . : . : . : 656 CAGAGAGAAGGCCTGAGAGGCCAGAAGTCAAGAAAGAGCCTCCGGTGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114119 CAGAGAGAAGGCCTGAGAGGCCAGAAGTCAAGAAAGAGCCTCCGGTGAAA 750 . : . : . : . : . : 706 GCCAATGGCCTCCCAGCTGGACCGGAGCCAGCCTCAGAGCCGGGCAGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114169 GCCAATGGCCTCCCAGCTGGACCGGAGCCAGCCTCAGAGCCGGGCAGCCC 800 . : . : . : . : . : 756 TTACCCCGAGGGCCCAAGAGTGCCAGGGGGTGGGGAACAGCCTGCCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114219 TTACCCCGAGGGCCCAAGAGTGCCAGGGGGTGGGGAACAGCCTGCCCAGC 850 . : . : . : . : . : 806 CCAATGGCTGGCAGTACCACTCCCCAAGCCGGCCAGGGAGCACAGCTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114269 CCAATGGCTGGCAGTACCACTCCCCAAGCCGGCCAGGGAGCACAGCTTTC 900 . : . : . : . : . : 856 CCGTCTCAGGATGGAGAGACTGGGGGACACCGGCGGAGTTTCCCACCACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114319 CCGTCTCAGGATGGAGAGACTGGGGGACACCGGCGGAGTTTCCCACCACG 950 . : . : . : . : . : 906 CACCAACCCTGACAAAATTGCCCAGCGCAAGAGCTCCATGAACCAGCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114369 CACCAACCCTGACAAAATTGCCCAGCGCAAGAGCTCCATGAACCAGCTTC 1000 . : . : . : . : . : 956 AGCAGTGGGTGAATCTGCGCCGGGGGGTACCCCCGCCTGAAGACCTTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114419 AGCAGTGGGTGAATCTGCGCCGGGGGGTACCCCCGCCTGAAGACCTTCGG 1050 . : . : . : . : . : 1006 AG TCCCTCTAGGTTCTATCCTGTGTCTCGCAGGGTCCCTGA ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114469 AGGTG...CAGTCCCTCTAGGTTCTATCCTGTGTCTCGCAGGGTCCCTGA 1100 . : . : . : . : . : 1047 GTACTATGGCCCCTACTCCTCCCAGTACCCCGATGATTATCAGTACTACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115898 GTACTATGGCCCCTACTCCTCCCAGTACCCCGATGATTATCAGTACTACC 1150 . : . : . : . : . : 1097 CGCCAGGAGTGCGGCCGGAGAGCATCTGTTCCATGCCGGCCTATGATCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115948 CGCCAGGAGTGCGGCCGGAGAGCATCTGTTCCATGCCGGCCTATGATCGG 1200 . : . : . : . : . : 1147 ATCAGCCCGCCCTGGGCCCTGGAGGACAAGCGCCATGCCTTCCGCAATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115998 ATCAGCCCGCCCTGGGCCCTGGAGGACAAGCGCCATGCCTTCCGCAATGG 1250 . : . : . : . : . : 1197 GGGTGGCCCTGCCTACCAGCTGCGAGAGTGGAAGGAGCCCGCCAGCTACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116048 GGGTGGCCCTGCCTACCAGCTGCGAGAGTGGAAGGAGCCCGCCAGCTACG 1300 . : . : . : . : . : 1247 GGCGGCAGGATGCCACCGTCTGGATCCCAAGCCCCTCCCGGCAGCCAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116098 GGCGGCAGGATGCCACCGTCTGGATCCCAAGCCCCTCCCGGCAGCCAGTC 1350 . : . : . : . : . : 1297 TATTATGATGAGCTGGATGCCGCCTCTAGCTCCCTGCGCCGCCTGTCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116148 TATTATGATGAGCTGGATGCCGCCTCTAGCTCCCTGCGCCGCCTGTCCCT 1400 . : . : . : . : . : 1347 GCAGCCCCGCTCCCACTCTGTGCCCCGCTCACCCAGCCAGGGCTCCTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116198 GCAGCCCCGCTCCCACTCTGTGCCCCGCTCACCCAGCCAGGGCTCCTACA 1450 . : . : . : . : . : 1397 GCCGTGCCCGCATTTACTCCCCTGTCCGCTCACCCAGTGCCCGTTTTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116248 GCCGTGCCCGCATTTACTCCCCTGTCCGCTCACCCAGTGCCCGTTTTGAG 1500 . : . : . : . : . : 1447 CGGCTGCCACCTCGCAGTGAGGACATCTATGCTGACCCTGCTGCCTATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116298 CGGCTGCCACCTCGCAGTGAGGACATCTATGCTGACCCTGCTGCCTATGT 1550 . : . : . : . : . : 1497 GATGAGGCGATCCATCAGCTCCCCCAAG GTCCCTCCATACC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 116348 GATGAGGCGATCCATCAGCTCCCCCAAGGTG...CAGGTCCCTCCATACC 1600 . : . : . : . : . : 1538 CAGAAGTGTTCCGGGACAGCCTCCACACCTACAAGTTAAACGAGCAAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123127 CAGAAGTGTTCCGGGACAGCCTCCACACCTACAAGTTAAACGAGCAAGAC 1650 . : . : . : . : . : 1588 ACAGAT AAGCTGCTGGGAAAATTGTGTGAGCAGAACAAGGT ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123177 ACAGATGTA...TAGAAGCTGCTGGGAAAATTGTGTGAGCAGAACAAGGT 1700 . : . : . : . : . : 1629 GGTGAGGGAGCAGGACCGGCTGGTGCAGCAGCTCCGAGCTGAGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 124499 GGTGAGGGAGCAGGACCGGCTGGTGCAGCAGCTCCGAGCTGAGAAGGTG. 1750 . : . : . : . : . : 1675 GAGAGCCTGGAAAGTGCCTTGATGGGGACCCACCAGGAGCTGGAG ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124549 ..CAGGAGAGCCTGGAAAGTGCCTTGATGGGGACCCACCAGGAGCTGGAG 1800 . : . : . : . : . : 1720 ATGTTTGGAAGCCAGCCCGCCTACCCAGAAAAGCTGCGACACAAAAAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124803 ATGTTTGGAAGCCAGCCCGCCTACCCAGAAAAGCTGCGACACAAAAAGGA 1850 . : . : . : . : . : 1770 TTCACTGCAGAACCAGCTCATCAACATCCGCGTGGAGCTGTCTCAGGCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124853 TTCACTGCAGAACCAGCTCATCAACATCCGCGTGGAGCTGTCTCAGGCGA 1900 . : . : . : . : . : 1820 CCACG GCCCTGACAAACAGCACCATAGAGTATGAGCACCTC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124903 CCACGGTA...TAGGCCCTGACAAACAGCACCATAGAGTATGAGCACCTC 1950 . : . : . : . : . : 1861 GAGTCTGAGGTCTCTGCCCTGCACGATGACCTCTGGGAGCAGCTCAATTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126304 GAGTCTGAGGTCTCTGCCCTGCACGATGACCTCTGGGAGCAGCTCAATTT 2000 . : . : . : . : . : 1911 GGACACCCAG AATGAGGTGCTGAACCGGCAAATCCAAAAGG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 126354 GGACACCCAGGTG...CAGAATGAGGTGCTGAACCGGCAAATCCAAAAGG 2050 . : . : . : . : . : 1952 AGATCTGGAGGATCCAGGACGTGATGGAGGGGCTGAGGAAGAACAACCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128033 AGATCTGGAGGATCCAGGACGTGATGGAGGGGCTGAGGAAGAACAACCCC 2100 . : . : . : . : . : 2002 TCCCGGGGCACGGACACCGCCAAGCACAGAG GAGGACTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 128083 TCCCGGGGCACGGACACCGCCAAGCACAGAGGTG...AAGGAGGACTTGG 2150 . : . : . : . : . : 2043 CCCCTCAGCCACCTACAGCTCCAACAGCCCGGCCAGCCCCCTCAGCTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128735 CCCCTCAGCCACCTACAGCTCCAACAGCCCGGCCAGCCCCCTCAGCTCTG 2200 . : . : . : . : . : 2093 CCAGCCTCACCAGCCCCCTGAGCCCCTTTTCACTGGTGTCGGGCTCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128785 CCAGCCTCACCAGCCCCCTGAGCCCCTTTTCACTGGTGTCGGGCTCTCAG 2250 . : . : . : . : . : 2143 GGGTCCCCCACCAAGCCTGGCTCCAACGAG CCCAAGGCAAA ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 128835 GGGTCCCCCACCAAGCCTGGCTCCAACGAGGTA...CAGCCCAAGGCAAA 2300 . : . : . : . : . : 2184 CTATGAACAAAGCAAGAAAGACCCCCACCAGACATTGCCCCTGGACACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131925 CTATGAACAAAGCAAGAAAGACCCCCACCAGACATTGCCCCTGGACACCC 2350 . : . : . : . : . : 2234 CCAGAGACATCAGCCTTGTGCCCACCAGGCAAGAGGTAGAGGCAGAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131975 CCAGAGACATCAGCCTTGTGCCCACCAGGCAAGAGGTAGAGGCAGAGAAG 2400 . : . : . : . : . : 2284 CAGGCAGCTCTCAACAAAG TTGGCGTTGTGCCCCCTCGGAC |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 132025 CAGGCAGCTCTCAACAAAGGTA...CAGTTGGCGTTGTGCCCCCTCGGAC 2450 . : . : . : . : . : 2325 AAAATCGCCCACTGATGATGAGGTGACCCCATCAGCAGTGGTAAGAAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132269 AAAATCGCCCACTGATGATGAGGTGACCCCATCAGCAGTGGTAAGAAGGA 2500 . : . : . : . : . : 2375 ATGCCAGTGGGCTCACCAATGGACTCTCCTCCCAG GAACGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 132319 ATGCCAGTGGGCTCACCAATGGACTCTCCTCCCAGGTG...CAGGAACGC 2550 . : . : . : . : . : 2416 CCCAAGAGTGCTGTGTTTCCTGGCGAGGGGAAGGTCAAGATGAGCGTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143148 CCCAAGAGTGCTGTGTTTCCTGGCGAGGGGAAGGTCAAGATGAGCGTGGA 2600 . : . : . : . : . : 2466 GGAGCAGATTGACCGAATGCGGCGGCACCAGAGTGGCTCCATGAAGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 143198 GGAGCAGATTGACCGAATGCGGCGGCACCAGAGTGGCTCCATGAGGGAGA 2650 . : . : . : . : . : 2516 AGCGGAGGAGCCTGCAGCTCCCGGCCAGCCCGGCCCCCGACCCCAGTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143248 AGCGGAGGAGCCTGCAGCTCCCGGCCAGCCCGGCCCCCGACCCCAGTCCC 2700 . : . : . : . : . : 2566 CGGCCAGCCTACAAAGTG GTGCGCCGCCACCGCAGCATCCA ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 143298 CGGCCAGCCTACAAAGTGGTA...TAGGTGCGCCGCCACCGCAGCATCCA 2750 . : . : . : . : . : 2607 CGAGGTAGACATCTCCAACCTGGAGGCAGCCCTGCGGGCAGAGGAGCCTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144647 TGAGGTAGACATCTCCAACCTGGAGGCAGCCCTGCGGGCAGAGGAGCCTG 2800 . : . : . : . : . : 2657 GCGGGCATGCCTACGAGACACCCCGGGAGGAAATTGCCCGGCTTCGCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144697 GCGGGCATGCCTACGAGACACCCCGGGAGGAAATTGCCCGGCTTCGCAAA 2850 . : . : . : . : . : 2707 ATGGAGCTAGAGCCCCAGCATTATGACGTGGACATCAATAAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 144747 ATGGAGCTAGAGCCCCAGCATTATGACGTGGACATCAATAAGGAGGTG.. 2900 . : . : . : . : . : 2752 CTCTCCACTCCAGACAAAGTCCTCATCCCTGAACGGTACATTGACC .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144797 .TAGCTCTCCACTCCAGACAAAGTCCTCATCCCTGAACGGTACATTGACC 2950 . : . : . : . : . : 2798 TGGAGCCTGACACTCCCCTGAGCCCTGAGGAGTTGAAGGAGAAGCAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144913 TGGAGCCTGACACTCCCCTGAGCCCTGAGGAGTTGAAGGAGAAGCAGAAG 3000 . : . : . : . : . : 2848 AAGGTGGAGAGGATCAAGACACTCATTGCCAAATCCAG TAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 144963 AAGGTGGAGAGGATCAAGACACTCATTGCCAAATCCAGGTA...CAGTAT 3050 . : . : . : . : . : 2889 GCAGAACGTGGTGCCCATCGGCGAGGGGGACTCTGTGGACGTGCCCCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145503 GCAGAACGTGGTGCCCATCGGCGAGGGGGACTCTGTGGACGTGCCCCAGG 3100 . : . : . : . : . : 2939 ACTCAGAGAGCCAGCTGCAGGAGCAGGAGAAGCGGATTGAAATCTCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145553 ACTCAGAGAGCCAGCTGCAGGAGCAGGAGAAGCGGATTGAAATCTCCTGC 3150 . : . : . : . : . : 2989 GCCCTGGCGACCGAGGCCTCCCGCAGGGGCCGCATGCTGTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 145603 GCCCTGGCGACCGAGGCCTCCCGCAGGGGCCGCATGCTGTCTGGTG...C 3200 . : . : . : . : . : 3032 TGCAATGTGCCACCCCAAGCCCTCCCACCTCCCCTGCTTCCCCGGCTC >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150141 AGTGCAATGTGCCACCCCAAGCCCTCCCACCTCCCCTGCTTCCCCGGCTC 3250 . : . : . : . : . : 3080 CTCCAGCAAACCCCCTGTCGTCTGAATCCCCACGGGGCGCCGACAGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150191 CTCCAGCAAACCCCCTGTCGTCTGAATCCCCACGGGGCGCCGACAGCAGC 3300 . : . 3130 TATACCATGCGGGTC ||||||||||||||| 150241 TATACCATGCGGGTC