Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0921
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0921, 1642 aa
  1>>>pF1KSDA0921 1642 - 1642 aa - 1642 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2220+/-0.000546; mu= 2.7506+/- 0.034
 mean_var=411.5080+/-85.463, 0's: 0 Z-trim(118.3): 176  B-trim: 802 in 2/54
 Lambda= 0.063224
 statistics sampled from 30934 (31113) to 30934 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time: 16.280

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_620060 (OMIM: 600566) neurexin-2-beta isoform a (1642) 11111 1030.0       0
XP_016874062 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1479) 7302 682.5 7.4e-195
XP_016874054 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1703) 6491 608.6 1.5e-172
XP_016877290 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1544) 6361 596.7 5.2e-169
NP_001317012 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1452) 6222 584.0 3.3e-165
NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1460) 6199 581.9 1.4e-164
NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1447) 6185 580.6 3.4e-164
XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1654) 5948 559.0 1.2e-157
XP_016874056 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1685) 5940 558.3  2e-157
XP_016874057 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1682) 5936 558.0 2.6e-157
XP_016877282 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1678) 5854 550.5 4.6e-155
XP_016877293 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1467) 5843 549.4 8.5e-155
XP_016860813 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1475) 5739 539.9 6.1e-152
XP_016860814 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1472) 5723 538.5 1.7e-151
NP_001317013 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1485) 5670 533.6 4.8e-150
NP_001317016 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1440) 5668 533.4 5.3e-150
NP_001317025 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1437) 5652 532.0 1.5e-149
XP_011535669 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1657) 5652 532.0 1.6e-149
XP_011531480 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1484) 5626 529.6 7.7e-149
XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1541) 5405 509.5 9.3e-143
XP_016860809 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495) 5333 502.9 8.6e-141
NP_001317014 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1498) 5333 502.9 8.6e-141
XP_016877296 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1449) 5307 500.5 4.4e-140
XP_016877289 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1553) 5301 500.0 6.7e-140
XP_011535675 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1446) 5299 499.8 7.2e-140
XP_016860804 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1502) 5171 488.1 2.4e-136
XP_011531474 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1505) 5171 488.1 2.4e-136
XP_011531485 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1225) 5091 480.7 3.3e-134
XP_016877281 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1683) 4978 470.6 5.2e-131
XP_006720385 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1683) 4978 470.6 5.2e-131
XP_016877284 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1675) 4898 463.3 8.2e-129
XP_016877283 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1675) 4898 463.3 8.2e-129
NP_001317124 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 5 [ (1571) 4889 462.4 1.4e-128
XP_016877294 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1464) 4887 462.2 1.5e-128
XP_011535668 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1679) 4888 462.4 1.5e-128
XP_011535672 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1575) 4879 461.5 2.6e-128
XP_016877292 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1468) 4877 461.3 2.8e-128
XP_005268275 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1684) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535666 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_016877279 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_016877280 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535665 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535667 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1687) 4794 453.8 5.9e-126
XP_011535671 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1583) 4785 452.9  1e-125
XP_011535674 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1476) 4783 452.7 1.1e-125
XP_011535673 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1479) 4783 452.7 1.1e-125
XP_011535670 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1586) 4783 452.8 1.1e-125
XP_016860807 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1499) 4652 440.8 4.3e-122
XP_016877285 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1667) 4612 437.2 5.8e-121
XP_016877295 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1462) 4601 436.1 1.1e-120


>>NP_620060 (OMIM: 600566) neurexin-2-beta isoform alpha  (1642 aa)
 initn: 11111 init1: 11111 opt: 11111  Z-score: 5496.5  bits: 1030.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11111; 100.0% identity (100.0% similar) in 1642 aa overlap (1-1642:1-1642)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 PEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 EAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLND
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD NEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 NEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD HLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD HLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD WHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 WHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD DCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 DCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD VDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQ
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pF1KSD VDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KSD VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTT
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 QNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFY
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KSD PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 PFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 EDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KSD LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 LQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KSD ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKE
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             1630      1640  
pF1KSD KAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::::::::::::::::::
NP_620 KAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
             1630      1640  

>>XP_016874062 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2-beta  (1479 aa)
 initn: 8344 init1: 6594 opt: 7302  Z-score: 3619.3  bits: 682.5 E(85289): 7.4e-195
Smith-Waterman score: 9245; 86.6% identity (86.6% similar) in 1673 aa overlap (1-1642:1-1479)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
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pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
       :::::::::::::::::::                        :::::::::::::::::
XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
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pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::
XP_016 VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYLVTISVDGILTTTGYTQEDYTM
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pF1KSD LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
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pF1KSD GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
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pF1KSD SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
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pF1KSD LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
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pF1KSD FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
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pF1KSD LRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMA
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pF1KSD GAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNAR
              850       860       870       880       890       900

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pF1KSD FGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIE
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pF1KSD LVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNG
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KSD ARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KSD ERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALIT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1110      1120      1130      1140      1150      1160         
pF1KSD YTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

    1170      1180      1190      1200      1210      1220         
pF1KSD DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1230      1240      1250      1260      1270      1280         
pF1KSD RDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

    1290      1300      1310      1320      1330      1340         
pF1KSD DMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
XP_016 DMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPST--
             1330      1340      1350      1360      1370          

    1350      1360      1370      1380      1390      1400         
pF1KSD ELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQA
                                                                   
XP_016 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1410      1420      1430      1440      1450      1460         
pF1KSD ERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLR
                                                                   
XP_016 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1470      1480      1490      1500      1510      1520         
pF1KSD TDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPG
                                                                   
XP_016 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1530      1540      1550      1560      1570      1580         
pF1KSD VTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYK
                   ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ------------ANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYK
                 1380      1390      1400      1410      1420      

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pF1KSD YRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       1430      1440      1450      1460      1470         

>>XP_016874054 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2-beta  (1703 aa)
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Smith-Waterman score: 10959; 96.4% identity (96.4% similar) in 1703 aa overlap (1-1642:1-1703)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               10        20        30        40        50        60

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pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
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pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
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pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
       :::::::::::::::::::                        :::::::::::::::::
XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::
XP_016 VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYLVTISVDGILTTTGYTQEDYTM
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
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pF1KSD GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD LRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMA
              790       800       810       820       830       840

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pF1KSD GAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNAR
              850       860       870       880       890       900

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pF1KSD FGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIE
              910       920       930       940       950       960

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNG
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pF1KSD ARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KSD ERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALIT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1110      1120      1130      1140      1150      1160         
pF1KSD YTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KSD DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG----------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                
XP_016 DITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGNFDNERLAIARQRIPY
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

                        1220      1230      1240      1250         
pF1KSD --------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDP
                     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDP
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pF1KSD NVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDST
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KSD TQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KSD YPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTD
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KSD DEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KSD PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVI
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

    1560      1570      1580      1590      1600      1610         
pF1KSD RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVK
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

    1620      1630      1640  
pF1KSD EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :::::::::::::::::::::::
XP_016 EKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
             1690      1700   

>>XP_016877290 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1544 aa)
 initn: 6493 init1: 3618 opt: 6361  Z-score: 3155.2  bits: 596.7 E(85289): 5.2e-169
Smith-Waterman score: 6823; 63.6% identity (81.7% similar) in 1632 aa overlap (17-1642:16-1544)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
                       .:: .: .   :::: : :.::::: ::  :.. ..:::...::
XP_016  MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRW-DASTRSDLSFQFKTN
                10        20        30        40         50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
       .. .::::::::: :::: : :::::..:::...::: :.:. .  : :. ::.....::
XP_016 VSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLS-NKQVNDSSWHFLMVSRD
       60        70        80        90       100        110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
         ::.: .:::....:.. .:  :.:.::::.::.: :.: :::::. :.  : :.::. 
XP_016 RLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLIL
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       .:: :.  : ::::.:..  .  : :.  . :: :::.: .:  :.  :::: ::.:::.
XP_016 DLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGP-CG--ERPCENGGICFLL-DGHPTCDCSTTGYGGKL
       180       190       200          210        220       230   

              250       260           270       280       290      
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGK----EEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRT
       :::.     : .:: .. .:.    :: ::::.:.:..:::::.::::::.:::::.:.:
XP_016 CSEDVSQDPGLSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKT
           240       250       260       270       280       290   

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD LQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTR
        :::::.::::::::::::.::.::: ::::::::::::.::::::::::::::::.:::
XP_016 WQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTR
           300       310       320       330       340       350   

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD NLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNF
       :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
XP_016 NLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNF
           360       370       380       390       400       410   

        420       430       440       450       460       470      
pF1KSD MGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALP
       :::::.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::
XP_016 MGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLP
           420       430       440       450       460       470   

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD RWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLL
       .:..:: ::::.::::::::::.::..:.      .  ..  ..:.::.:::::.:::::
XP_016 KWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLL
           480       490       500       510       520       530   

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD DMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELY
       ::::: ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...:
XP_016 DMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMY
           540       550       560       570       580       590   

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD LGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCS
       ::::::. :. : :: :.::: :  :::::.:::::::::...: ::: :.:.::   ::
XP_016 LGGLPEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCS
           600        610       620       630       640       650  

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pF1KSD RETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPN
       : . ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: 
XP_016 RMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPM
            660       670       680       690       700       710  

        720       730       740       750       760       770      
pF1KSD AMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLGKGPETLFAGH
       .:::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: ::::::::::.::.
XP_016 VMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLGKGPETLYAGQ
            720       730       740       750       760       770  

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD KLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPS
       :::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.:.::::::
XP_016 KLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPS
            780       790       800       810       820       830  

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pF1KSD NFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQA
       .:::::..:.:::  :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::::.::::::
XP_016 SFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQA
            840       850       860       870       880       890  

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pF1KSD YASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPV
       :.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...:::::.:.
XP_016 YTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPL
            900       910       920       930       940       950  

        960       970       980       990      1000      1010      
pF1KSD NDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLV
       :::::::::..:: .:.:.::.:...:::  :::.::::::.::..::...:.:::::::
XP_016 NDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLV
            960       970       980       990      1000      1010  

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pF1KSD ASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWD
       ::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.::::::::.:::.
XP_016 ASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWE
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

       1080      1090      1100      1110      1120      1130      
pF1KSD GFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSA
       ::::::.::::.:  :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: :::::::::  ...
XP_016 GFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDG
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  

       1140      1150      1160      1170      1180      1190      
pF1KSD VLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGN
       .:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: :  . :.:::::::::::.:::
XP_016 ILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGN
           1140      1150      1160      1170      1180      1190  

       1200      1210      1220      1230      1240      1250      
pF1KSD ATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAE
       ::::::.:::::.::.::::::::.:: : :::.:.:: ::::.:::::.::::: .:::
XP_016 ATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAE
           1200      1210      1220      1230      1240      1250  

       1260      1270      1280      1290      1300      1310      
pF1KSD SDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLR
       ..::.. .: .::::: ::.: ...::  ..  .:.::.:::::::::::::..::    
XP_016 NNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRS----
           1260      1270        1280      1290      1300          

       1320      1330      1340      1350      1360      1370      
pF1KSD DSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPP
        .. : :.: ::.:::: :::::. ::::::                             
XP_016 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPST-----------------------------
       1310      1320      1330                                    

       1380      1390      1400      1410      1420      1430      
pF1KSD PTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLP
                                          : :     . .: : .:  . .  :
XP_016 -----------------------------------DKS-----LSTSIFEGG--YKAHAP
                                         1340             1350     

       1440      1450      1460      1470      1480      1490      
pF1KSD PTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMN
         ...::  .    :.:::  :       :.:    :... :..       :.:::::::
XP_016 KWESKDFRPNKVSETSRTTTTS-----LSPELIRFTASSSSGMV-------PKLPAGKMN
        1360      1370           1380      1390             1400   

         1500      1510      1520      1530      1540      1550    
pF1KSD HRD--PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPG
       .::  : :: .   ::    ::..:        : .:: : : ..:::::: :: :  ::
XP_016 NRDLKP-QPDIVLLPL----PTAYELDSTKLKSPLITS-PMFRNVPTANPTEPGIRRVPG
           1410          1420      1430       1440      1450       

         1560      1570      1580      1590      1600      1610    
pF1KSD AVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSN
       : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::
XP_016 ASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSN
      1460      1470      1480      1490      1500      1510       

         1620      1630      1640  
pF1KSD GAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :...:::  .. :.  : .::::.::::
XP_016 GTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV
      1520       1530      1540    

>>NP_001317012 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1 i  (1452 aa)
 initn: 4616 init1: 3514 opt: 6222  Z-score: 3087.0  bits: 584.0 E(85289): 3.3e-165
Smith-Waterman score: 6416; 61.1% identity (76.5% similar) in 1652 aa overlap (14-1642:16-1452)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
NP_001 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
NP_001 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
      60        70        80        90       100       110         

       120       130        140       150       160         170    
pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
NP_001 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

          180         190            200       210          220    
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
NP_001 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

          230       240       250       260       270       280    
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQ
         : ::::.::: :: ::.                ::::..:::::.:.::::::.::::
NP_001 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQ----------------GKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQ
     240        250                       260       270       280  

          290       300       310       320       330       340    
pF1KSD SSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKF
       ::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::::::
NP_001 SSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKF
            290       300       310       320       330       340  

          350       360              370       380       390       
pF1KSD NDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFY
       ::::::::.::::::::.:::::::       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFY
            350       360       370       380       390       400  

       400       410       420       430       440       450       
pF1KSD IGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCED
       .::::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.
NP_001 VGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCEN
            410       420       430       440       450       460  

       460       470       480       490       500       510       
pF1KSD VAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSA
       ::.:::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: . 
NP_001 VATLDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQM
            470       480       490       500       510       520  

       520       530       540       550       560       570       
pF1KSD QRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRS
        ..:.::.:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  
NP_001 IKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLR
            530       540       550       560       570       580  

       580       590       600       610       620       630       
pF1KSD TPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSR
       ::. : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.
NP_001 TPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSK
            590       600        610       620       630       640 

       640       650       660       670       680       690       
pF1KSD DLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCER
       :.: .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :::
NP_001 DIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCER
             650       660       670       680       690       700 

       700       710       720       730       740       750       
pF1KSD EATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGG
       :::::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:
NP_001 EATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAG
             710       720       730       740       750       760 

       760       770       780       790       800        810      
pF1KSD QMKLTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLE
       ..::::::::::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. ::::: : :::
NP_001 RVKLTVNLGKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLE
             770       780       790       800       810       820 

        820       830       840       850       860       870      
pF1KSD FHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIV
       ::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.
NP_001 FHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNII
             830       840       850       860       870       880 

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pF1KSD ADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIH
       :::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.:
NP_001 ADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLH
             890       900       910       920       930       940 

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pF1KSD YVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLK
       :::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::
NP_001 YVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLK
             950       960       970       980       990      1000 

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pF1KSD GELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGP
       ..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.::::.::
NP_001 SDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGP
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

       1060      1070      1080      1090      1100      1110      
pF1KSD STTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPND
       :::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: :::::
NP_001 STTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPND
            1070      1080      1090      1100      1110      1120 

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pF1KSD RPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEP
       ::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.: 
NP_001 RPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEES
            1130      1140      1150      1160      1170      1180 

       1180      1190      1200      1210      1220      1230      
pF1KSD NAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPF
       :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::..::.::
NP_001 NAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPF
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

       1240      1250      1260      1270      1280      1290      
pF1KSD QGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIM
       :::.::::::::::: .:::.: :.   :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.::
NP_001 QGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIM
            1250      1260      1270      1280       1290      1300

       1300      1310      1320      1330      1340      1350      
pF1KSD ETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPII
       :::::.::.:.:::. :: ..  .:.:::.:::::::::::::.. ::::.         
NP_001 ETTTTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS---------
             1310       1320      1330      1340      1350         

       1360      1370      1380      1390      1400      1410      
pF1KSD TEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDC
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       1420      1430      1440      1450      1460      1470      
pF1KSD EEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGA
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       1480      1490      1500      1510      1520      1530      
pF1KSD PGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGF
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       1540      1550       1560      1570      1580      1590     
pF1KSD PHLPTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDE
            ::::  : : : ::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----ANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDE
                  1360      1370      1380      1390      1400     

        1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KSD GSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       :::.::.::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
NP_001 GSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
        1410      1420      1430      1440      1450  

>>NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1 i  (1460 aa)
 initn: 5985 init1: 3507 opt: 6199  Z-score: 3075.6  bits: 581.9 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 6451; 61.4% identity (77.1% similar) in 1649 aa overlap (14-1642:16-1460)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
NP_001 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
NP_001 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
NP_001 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
NP_001 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSH
         : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: ..    :.::::..:::::.:.::::::.
NP_001 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQ
     240        250       260       270       280       290        

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD NPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPV
       ::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::
NP_001 NPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPV
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KSD NGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGG
       ::::::::::::.:::::::        :::::::::::::::::::::::::::::.::
NP_001 NGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGG
      360       370               380       390       400       410

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD SPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAA
       ::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.
NP_001 SPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVAT
              420       430       440       450       460       470

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pF1KSD LDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRA
       :::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: .  ..
NP_001 LDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKV
              480       490       500       510       520       530

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pF1KSD DYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPF
       :.::.:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  ::.
NP_001 DFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPY
              540       550       560       570       580       590

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pF1KSD LATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLR
        : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.:
NP_001 TAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIR
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pF1KSD GLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREAT
        .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::
NP_001 QMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREAT
     650       660       670       680       690       700         

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pF1KSD VLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMK
       ::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:
NP_001 VLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVK
     710       720       730       740       750       760         

              770       780       790       800        810         
pF1KSD LTVNLGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLEFHN
       :::::::::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. ::::: : ::::::
NP_001 LTVNLGKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHN
     770       780       790       800       810       820         

     820       830       840       850       860       870         
pF1KSD IETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADP
       :::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.:::
NP_001 IETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADP
     830       840       850       860       870       880         

     880       890       900       910       920       930         
pF1KSD VTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVF
       ::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.::::
NP_001 VTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVF
     890       900       910       920       930       940         

     940       950       960       970       980       990         
pF1KSD DLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGEL
       ::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::..:
NP_001 DLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDL
     950       960       970       980       990      1000         

    1000      1010      1020      1030      1040      1050         
pF1KSD YIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTT
       ::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.::::.:::::
NP_001 YIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTT
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

    1060      1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KSD CTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPS
       : :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: ::::::::
NP_001 CQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPS
    1070      1080      1090      1100      1110      1120         

    1120      1130      1140      1150      1160      1170         
pF1KSD TRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAI
       :: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.: :::
NP_001 TRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAI
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

    1180      1190      1200      1210      1220      1230         
pF1KSD VSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQ
       ..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::..::.:::::
NP_001 INDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQ
    1190      1200      1210      1220      1230      1240         

    1240      1250      1260      1270      1280      1290         
pF1KSD VSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETT
       .::::::::::: .:::.: :.   :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::
NP_001 LSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETT
    1250      1260      1270      1280       1290      1300        

    1300      1310      1320      1330      1340      1350         
pF1KSD TTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITED
       ::.::.:.:::. :: ..  .:.:::.:::::::::::::.. ::::.::          
NP_001 TTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGG----------
     1310      1320       1330      1340      1350                 

    1360      1370      1380      1390      1400      1410         
pF1KSD SLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEP
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1420      1430      1440      1450      1460      1470         
pF1KSD IEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGV
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1480      1490      1500      1510      1520      1530         
pF1KSD LFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHL
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

    1540      1550       1560      1570      1580      1590        
pF1KSD PTANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSY
         ::::  : : : ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -LANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSY
       1360      1370      1380      1390      1400      1410      

     1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KSD QVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       .::.::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
NP_001 HVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
       1420      1430      1440      1450      1460

>>NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin-1 i  (1447 aa)
 initn: 5158 init1: 3507 opt: 6185  Z-score: 3068.8  bits: 580.6 E(85289): 3.4e-164
Smith-Waterman score: 6408; 61.2% identity (76.8% similar) in 1645 aa overlap (14-1642:16-1447)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
                      : ::::   :  ..:::: :. :::.:. .: .:   .:.::.:.
NP_001 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
               10        20        30        40         50         

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
       : ..:.:.::.:: : ::::::.:.  :::.: :.. :::::::  :::: :  :: : .
NP_001 TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
      60        70        80        90       100       110         

       120       130        140       150       160         170    
pF1KSD TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
        :. : :.: .:  ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .::  ::..:. . :
NP_001 RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
     120       130       140       150       160       170         

          180         190            200       210          220    
pF1KSD FRGLLANLKLGERP--PALLGSQGL-----RGATADPLCAPARNP---CANGGLCTVLAP
       :.: . .....     :.  :   :      .. ..:  :  ..    : :::.:.:.  
NP_001 FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDD
     180       190       200       210       220       230         

          230       240       250       260       270       280    
pF1KSD GEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLNSEGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQ
         : ::::.::: :: ::.      : ::: ....::::..:::::.:.::::::.::::
NP_001 QAV-CDCSRTGFRGKDCSQ------GLAHLMMGDQGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQ
     240        250             260       270       280       290  

          290       300       310       320       330       340    
pF1KSD SSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKF
       ::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::::::::::::::
NP_001 SSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKF
            300       310       320       330       340       350  

          350       360       370       380       390       400    
pF1KSD NDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNT
       ::::::::.:::::::        :::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
NP_001 NDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPST
            360               370       380       390       400    

          410       420       430       440       450       460    
pF1KSD ADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPV
       :::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.:::.
NP_001 ADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPI
          410       420       430       440       450       460    

          470       480       490       500       510       520    
pF1KSD TFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFA
       :::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.      ..: .  ..:.::
NP_001 TFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFA
          470       480       490       500       510       520    

          530       540       550       560       570       580    
pF1KSD MELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATG
       .:.:::::::::::::: ::..:  .::::::: :::::::::.:.::::.  ::. : :
NP_001 IEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPG
          530       540       550       560       570       580    

          590       600       610       620       630       640    
pF1KSD DSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAE
       .::::::..:::::::::. .. : .: ::::: :  :::::.:::::::.:.:.: .::
NP_001 ESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAE
          590       600        610       620       630       640   

          650       660       670       680       690       700    
pF1KSD AQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSY
       .:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::::::
NP_001 VQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSY
           650       660       670       680       690       700   

          710       720       730       740       750       760    
pF1KSD DGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVN
       ::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::.:..:::::
NP_001 DGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVN
           710       720       730       740       750       760   

          770       780       790       800        810       820   
pF1KSD LGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLEFHNIETG
       :::::::::::..::::::::::::::::::.:.::.  .. ::::: : ::::::::::
NP_001 LGKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETG
           770       780       790       800       810       820   

           830       840       850       860       870       880   
pF1KSD IMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFK
       :.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.:::::::
NP_001 IITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFK
           830       840       850       860       870       880   

           890       900       910       920       930       940   
pF1KSD SRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGN
       ..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.::::::::
NP_001 TKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGN
           890       900       910       920       930       940   

           950       960       970       980       990      1000   
pF1KSD GPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGG
       : .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::..:::::
NP_001 GANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGG
           950       960       970       980       990      1000   

          1010      1020      1030      1040      1050      1060   
pF1KSD LSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEE
       ..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::   ::.::::.:::::: :.
NP_001 VAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQED
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

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pF1KSD SCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMD
       ::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: :::::::::: :
NP_001 SCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRAD
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pF1KSD RLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDG
       :::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.: :::..::
NP_001 RLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDG
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pF1KSD KYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGL
       ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.: :::..::.:::::.:::
NP_001 KYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGL
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pF1KSD YYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMA
       :::::::: .:::.: :.   :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.:
NP_001 YYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLA
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pF1KSD TTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDP
       :.:.:::. :: ..  .:.:::.:::::::::::::.. ::::.                
NP_001 TSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSS----------------
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pF1KSD PPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEAS
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

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pF1KSD GFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAP
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

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NP_001 ----------------------------------------------------------AN
                                                                   

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pF1KSD PTGPGERGP-PGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQ
       ::  : : : ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.
NP_001 PTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDE
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pF1KSD SRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::::::::::::::: :.. :. .: ::::::::::
NP_001 SRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
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>>XP_016877288 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3 isof  (1654 aa)
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       .. .::::::::: :::: : :::::..:::...::: :.:. .  : :. ::.....::
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         ::.: .:::....:.. .:  :.:.::::.::.: :.: :::::. :.  : :.::. 
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       .:: :.  : ::::.:..  .  : :.  . :: :::.: .:  :.  :::: ::.:::.
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pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSEGK----EEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRT
       :::.     : .:: .. .:.    :: ::::.:.:..:::::.::::::.:::::.:.:
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        :::::.::::::::::::.::.::: ::::::::::::.::::::::::::::::.:::
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       :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
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       ::::: ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...:
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       : . ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: 
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       .:::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: :::         .:
XP_016 VMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSK
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       :::::.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::
XP_016 GPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTE
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pF1KSD RRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSS
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       .:::::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...:::  :::.::::::.::..::...
XP_016 IKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQG
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       :.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::.:::::: :.::::
XP_016 MYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCAN
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pF1KSD QGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAV
       ::::.:::.::::::.::::.:  :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: :::::
XP_016 QGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAV
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pF1KSD GFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHV
       ::::  ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: :  . :.::::::
XP_016 GFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHV
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       :..::     .. : :.: ::.:::: :::::. ::::::::::..:...:: :  ::.:
XP_016 RKNRS----TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGGELVIPLLVEDPLATPPIA
                 1320      1330      1340      1350      1360      

      1370      1380      1390      1400      1410       1420      
pF1KSD TRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEP-IEASGFA
       ::.: .  :::: :.:: . .:.:.:    .    .: :: ... .. :..  .  ::..
XP_016 TRAPSITLPPTFRPLLTIIETTKDSL----SMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYG
       1370      1380      1390          1400      1410      1420  

       1430      1440      1450           1460                     
pF1KSD SGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSP-----RKPAP-------RPNL-----R
       :::.:::.::::::::::::: ::::..   :      .  ::       :::      :
XP_016 SGETFDSNLPPTDDEDFYTTFSLVTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSR
           1430      1440      1450      1460      1470      1480  

    1470      1480          1490        1500      1510      1520   
pF1KSD TDGATGAPGVL-FAPSAPA---PNLPAGKMNHRD--PLQPLLENPPLGPGAPTSFEPRRP
       :  .. .: .. :. :. .   :.:::::::.::  : :: .   ::    ::..:    
XP_016 TTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLKP-QPDIVLLPL----PTAYELDST
           1490      1500      1510       1520          1530       

          1530      1540      1550      1560      1570      1580   
pF1KSD PPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILIL
           : .:: : : ..:::::: :: :  ::: :::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLKSPLITS-PMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILIL
      1540       1550      1560      1570      1580      1590      

          1590      1600      1610      1620      1630      1640  
pF1KSD LYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
       ::::::::::::::::::..::::::::::::...:::  .. :.  : .::::.::::
XP_016 LYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV
       1600      1610      1620      1630       1640      1650    

>>XP_016874056 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2-beta  (1685 aa)
 initn: 10365 init1: 5940 opt: 5940  Z-score: 2947.2  bits: 558.3 E(85289): 2e-157
Smith-Waterman score: 10911; 97.4% identity (97.4% similar) in 1674 aa overlap (12-1642:12-1685)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
                  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               10        20        30        40        50        60

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
              130       140       150       160       170       180

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
              190       200       210       220       230       240

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pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
       :::::::::::::::::::                        :::::::::::::::::
XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::
XP_016 VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYLVTISVDGILTTTGYTQEDYTM
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
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pF1KSD DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
              490       500       510       520       530       540

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pF1KSD GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
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pF1KSD SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
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pF1KSD LRLELDGGQMKLTVNL------------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQL
       ::::::::::::::::            ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRLELDGGQMKLTVNLDCLRVGCAPSAAGKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQL
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pF1KSD SVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCK
              850       860       870       880       890       900

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pF1KSD DGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLF
              910       920       930       940       950       960

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pF1KSD NSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLK
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KSD IDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KSD LIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KSD TYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KSD GTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLT
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KSD IFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KSD LSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDD
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KSD EDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KSD ARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KSD SPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPRKPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTS
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

      1520      1530      1540      1550      1560      1570       
pF1KSD FEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

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pF1KSD LCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKD
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

      1640  
pF1KSD KEYYV
       :::::
XP_016 KEYYV
            

>>XP_016874057 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2-beta  (1682 aa)
 initn: 10357 init1: 5932 opt: 5936  Z-score: 2945.3  bits: 558.0 E(85289): 2.6e-157
Smith-Waterman score: 10934; 97.6% identity (97.6% similar) in 1674 aa overlap (9-1642:9-1682)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLRTN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATRALLLYLDDGGDCDFLELLLVDGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLLTRD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARRTALAVDGEARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSALTLSTVKYEPPFRGLLA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLKLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLCTVLAPGEVGCDCSHTGFGGKF
              190       200       210       220       230       240

              250                               260       270      
pF1KSD CSEEEHPMEGPAHLTLNSE------------------------GKEEFVATFKGNEFFCY
       :::::::::::::::::::                        :::::::::::::::::
XP_016 CSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVHQPTKGKEEFVATFKGNEFFCY
              250       260       270       280       290       300

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEAL
              310       320       330       340       350       360

        340       350       360              370       380         
pF1KSD VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMV-------TISVDGILTTTGYTQEDYTM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::
XP_016 VEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYLVTISVDGILTTTGYTQEDYTM
              370       380       390       400       410       420

     390       400       410       420       430       440         
pF1KSD LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQG
              430       440       450       460       470       480

     450       460       470       480       490       500         
pF1KSD DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGG
              490       500       510       520       530       540

     510       520       530       540       550       560         
pF1KSD GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKG
              550       560       570       580       590       600

     570       580       590       600       610       620         
pF1KSD SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRD
              610       620       630       640       650       660

     630       640       650       660       670       680         
pF1KSD LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTG
              670       680       690       700       710       720

     690       700       710       720       730       740         
pF1KSD FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADT
              730       740       750       760       770       780

     750       760                770       780       790       800
pF1KSD LRLELDGGQMKLTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVD
       ::::::::::::::::         .::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRLELDGGQMKLTVNLDCLRVGCAPSKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVD
              790       800       810       820       830       840

              810       820       830       840       850       860
pF1KSD NVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGD
              850       860       870       880       890       900

              870       880       890       900       910       920
pF1KSD ITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSG
              910       920       930       940       950       960

              930       940       950       960       970       980
pF1KSD NGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDS
              970       980       990      1000      1010      1020

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KSD RTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KSD DALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1110      1120      1130      1140      1150      1160
pF1KSD FGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1170      1180      1190      1200      1210      1220
pF1KSD GVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1230      1240      1250      1260      1270      1280
pF1KSD SQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1290      1300      1310      1320      1330      1340
pF1KSD ETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDL
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1350      1360      1370      1380      1390      1400
pF1KSD EECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARR
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1410      1420      1430      1440      1450      1460
pF1KSD PPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSLPPTDDEDFYTTFPLVTDRTTLLSPR
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1470      1480      1490      1500      1510      1520
pF1KSD KPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KPAPRPNLRTDGATGAPGVLFAPSAPAPNLPAGKMNHRDPLQPLLENPPLGPGAPTSFEP
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1530      1540      1550      1560      1570      1580
pF1KSD RRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCI
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1590      1600      1610      1620      1630      1640
pF1KSD LILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEY
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

         
pF1KSD YV
       ::
XP_016 YV
         




1642 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 04:13:14 2016 done: Thu Nov  3 04:13:16 2016
 Total Scan time: 16.280 Total Display time:  0.860

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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