Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0854
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0854, 837 aa
  1>>>pF1KSDA0854 837 - 837 aa - 837 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1738+/-0.0004; mu= 9.3828+/- 0.025
 mean_var=202.5952+/-40.525, 0's: 0 Z-trim(118.7): 35  B-trim: 0 in 0/57
 Lambda= 0.090107
 statistics sampled from 31966 (32001) to 31966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.375), width:  16
 Scan time: 14.260

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055758 (OMIM: 609185) zinc fingers and homeobox ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_011515234 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_011515233 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_005250893 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
XP_005250894 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc finger ( 837) 5541 733.6 8.7e-211
NP_001017926 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeo ( 873)  600 91.3   2e-17
NP_009153 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeobox ( 873)  600 91.3   2e-17
XP_011527022 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 956)  521 81.1 2.7e-14
XP_016883226 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 956)  521 81.1 2.7e-14
NP_055850 (OMIM: 609598) zinc fingers and homeobox ( 956)  521 81.1 2.7e-14
XP_016883227 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 956)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527015 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527016 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527013 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527007 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527020 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_006723812 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_005260398 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527010 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_005260400 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_006723811 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527003 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527006 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527008 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527011 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527005 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527009 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527019 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_016883225 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14
XP_011527004 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc finger ( 969)  521 81.1 2.7e-14


>>NP_055758 (OMIM: 609185) zinc fingers and homeoboxes p  (837 aa)
 initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541  Z-score: 3905.3  bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       
pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
              790       800       810       820       830       

>>XP_011515234 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an  (837 aa)
 initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541  Z-score: 3905.3  bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
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pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
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pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
              790       800       810       820       830       

>>XP_011515233 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an  (837 aa)
 initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541  Z-score: 3905.3  bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
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pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
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pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
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pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
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pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
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pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
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pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
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>>XP_005250893 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an  (837 aa)
 initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541  Z-score: 3905.3  bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
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pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
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pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
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pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
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pF1KSD PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
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pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
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pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
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pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
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pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
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pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
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>>XP_005250894 (OMIM: 609185) PREDICTED: zinc fingers an  (837 aa)
 initn: 5541 init1: 5541 opt: 5541  Z-score: 3905.3  bits: 733.6 E(85289): 8.7e-211
Smith-Waterman score: 5541; 100.0% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
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pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
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pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTGDSDSGIS
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pF1KSD VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSKTPIMKPGKPKADAKKVPKKPEEITPENHVEGTARLVTDTAEILSRLGGVELLQDTLG
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pF1KSD HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTKYNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASK
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pF1KSD HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPKR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PHIAQVPEPPPKVANPPLTPASDRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLAR
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pF1KSD SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEIKKWFSDHRYRCQRGIVHITSESLAKDQLAIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQ
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pF1KSD VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAVLDSMGSGKK
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pF1KSD GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQDVGAPNGALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQ
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pF1KSD LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKATKPMAESP
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pF1KSD KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPAKPSEATSDRSEGSSRDGQ
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pF1KSD GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSELAESDSDCVPAEAGQA
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>>NP_001017926 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeoboxe  (873 aa)
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pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
       :::.::::::::: .:   :::   :.    ..:     : :      .. :. :...::
NP_001 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
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        :  .  ..:.::..:::::::: ..: .:: :: ::: .::::.::  :::.:::: ::
NP_001 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
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pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
       .::.::.:: :.:::: :::: ..::::::..::.:.  .   :..      .. .:  :
NP_001 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
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pF1KSD DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEGTARLVTDT
       .::::.:::::::  : :.. :.          ::.. : :: :  :. ::. .  ....
NP_001 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
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pF1KSD ---AEILSRLGGVEL--------LQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
          . :..:.             .   :..:. .:.   : ::.::: .:.:.   ::.:
NP_001 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
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pF1KSD LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
       ::.:  ..:..:::::::..:.. :.: .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::
NP_001 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
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pF1KSD KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
       .:.::::...:: ::::.:....  .   : ::::   :::.:: .::::::.. .:   
NP_001 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
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     390       400       410        420       430        440       
pF1KSD CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
        .::.:.:::: .... .   .: : :  . .:  : ::     :  .  ..: :     
NP_001 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
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pF1KSD KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
       ::::::.:.::.:.:..::: :.:. ::...:::...:::::::: ::  ::.      .
NP_001 KKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCL
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pF1KSD HITSESL------AKDQLA----IAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
       :....:       ..:. .    .....  .... .:::.::::::::  :...:. :::
NP_001 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
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pF1KSD KSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAV-LDSMGSGKKGQDVGAPN
       .::  :. ::.:::..:::.:::::.::.:..: .   :. . .:  ..:.. ...:  .
NP_001 NSSVLTDEELNRLRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETS
      590       600       610       620       630       640        

      610       620       630       640       650       660        
pF1KSD GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
        :    :. :::  ..:    .    :. ::.:.:.:.:.:::::.:.:::.:: ..::.
NP_001 PA----DE-SGAPKSGST---GKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLA
      650            660          670       680       690       700

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pF1KSD RTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKAT-KPMAES---P----
       ::.:: :: ..:   :.:..::.  ::    .. .: ... ...  .: ...   :    
NP_001 RTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRP
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pF1KSD ------------------KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
                         :.:  .. .::   : : :.::..::.. ..: : ..     
NP_001 RGSKRINNWDRGPSLIKFKTGTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVR-----
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pF1KSD KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEESS-VVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
          :  ..:.. :    .  .:::: . :.:  :    :..  .: ::.:          
NP_001 ---EWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEVIDDQE----EDEEETDDSDTWEPPRHVKRKL
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             830       
pF1KSD LAESDSDCVPAEAGQA
                       
NP_001 SKSDD           
      870              

>>NP_009153 (OMIM: 604764) zinc fingers and homeoboxes p  (873 aa)
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Smith-Waterman score: 1887; 39.8% identity (66.5% similar) in 890 aa overlap (1-811:1-858)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
       :::.::::::::: .:   :::   :.    ..:     : :      .. :. :...::
NP_009 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
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pF1KSD IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
        :  .  ..:.::..:::::::: ..: .:: :: ::: .::::.::  :::.:::: ::
NP_009 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
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pF1KSD KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
       .::.::.:: :.:::: :::: ..::::::..::.:.  .   :..      .. .:  :
NP_009 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
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pF1KSD DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEGTARLVTDT
       .::::.:::::::  : :.. :.          ::.. : :: :  :. ::. .  ....
NP_009 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
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pF1KSD ---AEILSRLGGVEL--------LQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
          . :..:.             .   :..:. .:.   : ::.::: .:.:.   ::.:
NP_009 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
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pF1KSD LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
       ::.:  ..:..:::::::..:.. :.: .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::
NP_009 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
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pF1KSD KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
       .:.::::...:: ::::.:....  .   : ::::   :::.:: .::::::.. .:   
NP_009 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
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pF1KSD CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
        .::.:.:::: .... .   .: : :  . .:  : ::     :  .  ..: :     
NP_009 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
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pF1KSD KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
       ::::::.:.::.:.:..::: :.:. ::...:::...:::::::: ::  ::.      .
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pF1KSD HITSESL------AKDQLA----IAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
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NP_009 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
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pF1KSD GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
        :    :. :::  ..:    .    :. ::.:.:.:.:.:::::.:.:::.:: ..::.
NP_009 PA----DE-SGAPKSGST---GKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLA
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pF1KSD RTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKAT-KPMAES---P----
       ::.:: :: ..:   :.:..::.  ::    .. .: ... ...  .: ...   :    
NP_009 RTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRP
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pF1KSD ------------------KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
                         :.:  .. .::   : : :.::..::.. ..: : ..     
NP_009 RGSKRINNWDRGPSLIKFKTGTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVR-----
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pF1KSD KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEESS-VVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
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NP_009 ---EWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEVIDDQE----EDEEETDDSDTWEPPRHVKRKL
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pF1KSD LAESDSDCVPAEAGQA
                       
NP_009 SKSDD           
      870              

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       . .                .: : .:           :.   :..  :. : :. . .::
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       : .::..   ::.:.:.:. . :::.::::::.::: .::...:.:::...:::..::::
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       .::::::::.:.::::::: .::::: :::::: . : : .  .: ..:.::: ...:: 
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pF1KSD -----SLVLTQ-VTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPL--VTPQAAPEPKRPHIAQ-
            .:..:: . ...  .. ::. :.:..: ..    :.  :  ...   :  . :: 
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       .    :....  .  ::    ::..::.. ::.:: ..::: ..:: .: .::::.  :.
XP_011 LLTACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKVTGLSTREV
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       .:::::.::.:.     :...     :.  :.                       ::   
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pF1KSD WFSERRKLRDSME-------------QAVLDSMGSGKKGQD--VGAPNGALS--------
       :::::::  .. :             .:. :  :    ...  :.. ::.:         
XP_011 WFSERRKKVNAEETKKAEENASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGENGSLEMPSSHILA
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pF1KSD --------------RLDQLSGAQLTSSLPSPSP----------------AIAKSQEQVHL
                     :. . .: .   .: . .:                .  :. .: ::
XP_011 ERKVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGKVSCKKTAQQRHL
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       ::. :..::::. :.::.. :.::: : :.:::: ..:  ::.: .::.:.:..  .   
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XP_011 KMGEETRAVADTGSEDQGPGTGELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTS
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>>XP_016883226 (OMIM: 609598) PREDICTED: zinc fingers an  (956 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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