Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0851
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0851, 587 aa
  1>>>pF1KSDA0851 587 - 587 aa - 587 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2294+/-0.00122; mu= 18.7881+/- 0.073
 mean_var=61.2860+/-12.145, 0's: 0 Z-trim(100.2): 38  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.163830
 statistics sampled from 6011 (6026) to 6011 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.185), width:  16
 Scan time:  2.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33745.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3        ( 587) 3917 935.2       0
CCDS82762.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3        ( 484) 3258 779.4       0
CCDS7616.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10        (1132)  895 221.0 6.3e-57
CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1526)  634 159.4   3e-38
CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1295)  632 158.9 3.7e-38
CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1350)  632 158.9 3.8e-38
CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21         (1612)  632 158.9 4.4e-38
CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6           (1496)  598 150.9 1.1e-35
CCDS5078.1 FIG4 gene_id:9896|Hs108|chr6            ( 907)  249 68.3 4.8e-11


>>CCDS33745.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3             (587 aa)
 initn: 3917 init1: 3917 opt: 3917  Z-score: 5000.1  bits: 935.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3917; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPIFGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPIFGI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LGTIHLVAGNYLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGTIHLVAGNYLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD MLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD EVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVET
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD EQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANHMDGFQRHFDSQVIIYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANHMDGFQRHFDSQVIIYG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD KQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDQVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDQVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD EMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD YYKNNFSDGFRQDSIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YYKNNFSDGFRQDSIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       
pF1KSD MAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKID
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKID
              550       560       570       580       

>>CCDS82762.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3             (484 aa)
 initn: 3258 init1: 3258 opt: 3258  Z-score: 4159.6  bits: 779.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3258; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (104-587:1-484)

            80        90       100       110       120       130   
pF1KSD VITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82                               MLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYF
                                             10        20        30

           140       150       160       170       180       190   
pF1KSD STTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQPEVHRFALPVLHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQPEVHRFALPVLHGF
               40        50        60        70        80        90

           200       210       220       230       240       250   
pF1KSD ITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASF
              100       110       120       130       140       150

           260       270       280       290       300       310   
pF1KSD VQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGS
              160       170       180       190       200       210

           320       330       340       350       360       370   
pF1KSD EKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDS
              220       230       240       250       260       270

           380       390       400       410       420       430   
pF1KSD AGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKI
              280       290       300       310       320       330

           440       450       460       470       480       490   
pF1KSD YKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQD
              340       350       360       370       380       390

           500       510       520       530       540       550   
pF1KSD SIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYV
              400       410       420       430       440       450

           560       570       580       
pF1KSD LFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKID
              460       470       480    

>>CCDS7616.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10             (1132 aa)
 initn: 949 init1: 438 opt: 895  Z-score: 1135.4  bits: 221.0 E(32554): 6.3e-57
Smith-Waterman score: 1010; 38.0% identity (66.8% similar) in 437 aa overlap (101-509:146-576)

               80        90       100       110       120       130
pF1KSD YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDG
                                     :: . .  . .  . . .  .:.  .. ..
CCDS76 KPEKIIPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSES
         120       130       140       150       160       170     

              140       150       160       170         180        
pF1KSD FYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELS--AQPEVHRFALP
       ::.: :::::...:: :  . : .   : ...:.:: :: .....:.  . :.:  . .:
CCDS76 FYYSLTYDLTNSVQRQS--TGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIP
         180       190         200       210       220       230   

      190       200                                210       220   
pF1KSD VLHGFITMHSCSIN-------------------------GKYFDWILISRRSCFRAGVRY
       ...::. ..   .:                            :   ::::::  :::.::
CCDS76 MIQGFVQIEELVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRY
           240       250       260       270       280       290   

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD YVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVAN
         ::.:..:..::.:::::..: ..   ::::::::.::::::  . .:.: :....  .
CCDS76 KRRGVDKNGNVANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQV-GYRYNPRPRLDRSEK
           300       310       320       330        340       350  

            290       300       310       320       330       340  
pF1KSD H-MDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHK
       . .  :  ::. :. :: :::::::..: : :: . ...  .:  .... . :..::::.
CCDS76 ETVAYFCAHFEEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSHLTYVSFDFHE
            360       370       380       390       400       410  

            350       360       370       380       390       400  
pF1KSD ECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSL
       .:..:... .. : : . ..  ....  :: :: :. .:::.:: :::::::::::.:. 
CCDS76 HCRGMKFENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAG-VICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAA
            420       430       440        450       460       470 

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD LARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRT
       .::  .. ::..:::.   : :  .   ..::.  ::.:... ..:::::.::: :::::
CCDS76 IARVVMEQQLKKLGVMPPEQPLPVK--CNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRT
             480       490         500       510       520         

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD GKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFL
       :.:   :.. :: ::  ::: : :.:..::  :::. :   ...: :             
CCDS76 GERKLAGVMKDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVIDLMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHK
     530       540       550       560       570       580         

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD ALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQ
                                                                   
CCDS76 ENQRSHQELISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAY
     590       600       610       620       630       640         

>>CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1526 aa)
 initn: 499 init1: 254 opt: 634  Z-score: 800.0  bits: 159.4 E(32554): 3e-38
Smith-Waterman score: 747; 31.3% identity (63.1% similar) in 504 aa overlap (10-501:12-486)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPI-
                  ::   : .. ::.     .. : ..  .. :  ...:..  .. .. . 
CCDS54 MAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVET--RHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLD
               10        20          30        40        50        

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pF1KSD -FGILGTIHLVAGN----YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQL
        .:.::...:  :.    ::...:  ..::..    :...:. . .: .       : . 
CCDS54 AYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLR------IDSSD
       60        70        80        90       100             110  

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pF1KSD QDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHL
       .:    .. . .:::  .:::. . .   .:.   :.   .::..    .:.:: ::  :
CCDS54 EDR---ISEVRKVLNSGNFYFAWSASGI-SLDLSLNAHRSMQEQT----TDNRFFWNQSL
               120       130        140       150           160    

            180        190       200       210       220       230 
pF1KSD LRELSAQP-EVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSE
         .:.    .   . : .. : . ...     :     :::: :: :::.:. ::: ...
CCDS54 HLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDD
          170       180       190       200       210       220    

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pF1KSD GHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKY-KPLPQISK-VANHMDGFQ
       ::.::::::::.:. . : .::.: :::.:.:: : :.:.  .   ..:.    .  .:.
CCDS54 GHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQ-PGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFD
          230       240       250        260       270       280   

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pF1KSD RHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMV-SSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMR
       ::: .   .::::.:.::...: .:. : ..: . . .:  .. .... ::.:.  :. .
CCDS54 RHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGK
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pF1KSD WDRL-SILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRS
        ..: :.:  :: .. :  ..:  ... .:   : :. :.::.::::::: .:..:. . 
CCDS54 AEKLHSVLKPQVQKFLD-YGFFYFNGS-EVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEM
           350       360         370       380       390       400 

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pF1KSD LQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTH
       :  ::. ::   ...: .   .:...... :. :... .: :::::::.      :: ..
CCDS54 LAKQLEALG---LAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALE------GK-AK
             410          420       430       440              450 

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pF1KSD LGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSID-LFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPI
        : . ::  :. :  .::: :. .:..:: :.:::                         
CCDS54 AGKLKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRASSKV
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pF1KSD IMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKI
                                                                   
CCDS54 LKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQD
             520       530       540       550       560       570 

>>CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1295 aa)
 initn: 507 init1: 254 opt: 632  Z-score: 798.6  bits: 158.9 E(32554): 3.7e-38
Smith-Waterman score: 735; 31.2% identity (62.5% similar) in 504 aa overlap (10-501:12-483)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPI-
                  ::   : .. ::.     .. : ..  .. :  ...:..  .. .. . 
CCDS54 MAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVET--RHKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLD
               10        20          30        40        50        

         60        70            80        90       100       110  
pF1KSD -FGILGTIHLVAGN----YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQL
        .:.::...:  :.    ::...:  ..::..    :...:. . .: .       : . 
CCDS54 AYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLR------IDSSD
       60        70        80        90       100             110  

            120       130       140       150       160       170  
pF1KSD QDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHL
       .:    .. . .:::  .:::. . .   .:.   :.   .::..    .:.:: ::  :
CCDS54 EDR---ISEVRKVLNSGNFYFAWSASGI-SLDLSLNAHRSMQEQT----TDNRFFWNQSL
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pF1KSD LRELSAQP-EVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSE
         .:.    .   . : .. : . ...     :     :::: :: :::.:. ::: ...
CCDS54 HLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRGTNDD
          170       180       190       200       210       220    

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pF1KSD GHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKY-KPLPQISK-VANHMDGFQ
       ::.::::::::.:. . : .::.: :::.:.:: : :.:.  .   ..:.    .  .:.
CCDS54 GHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQ-PGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFD
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pF1KSD RHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMV-SSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMR
       ::: .   .::::.:.::...: .:. : ..: . . .:  .. .... ::.:.  :. .
CCDS54 RHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGK
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pF1KSD WDRL-SILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRS
        ..: :.:  :: .. :  ..:  ... .:   : :. :.::.::::::: .:..:. . 
CCDS54 AEKLHSVLKPQVQKFLD-YGFFYFNGS-EVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEM
           350       360         370       380       390       400 

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pF1KSD LQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTH
       :  ::. ::   ...: .   .:...... :. :... .: :::::::.      ::   
CCDS54 LAKQLEALG---LAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALE------GKAK-
             410          420       430       440             450  

       470       480       490        500       510       520      
pF1KSD LGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSID-LFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPI
          . ::  :. :  .::: :. .:..:: :.:::                         
CCDS54 ---LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQT
                460       470       480       490       500        

        530       540       550       560       570       580      
pF1KSD IMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQKEKI
                                                                   
CCDS54 LQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKL
      510       520       530       540       550       560        

>>CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1350 aa)
 initn: 507 init1: 254 opt: 632  Z-score: 798.3  bits: 158.9 E(32554): 3.8e-38
Smith-Waterman score: 735; 31.2% identity (62.5% similar) in 504 aa overlap (10-501:51-522)

                                    10        20        30         
pF1KSD                      MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTE
                                     ::   : .. ::.     .. : ..  .. 
CCDS33 CGRRRRRSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVET--RHKEECLMFESGAVA
               30        40        50        60          70        

      40        50          60        70            80        90   
pF1KSD VTLAVKKDVPPSAVTRPI--FGILGTIHLVAGN----YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKAT
       :  ...:..  .. .. .  .:.::...:  :.    ::...:  ..::..    :...:
CCDS33 VLSSAEKEAIKGTYSKVLDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVT
       80        90       100       110       120       130        

           100       110       120       130       140       150   
pF1KSD DFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEF
       . . .: .       : . .:    .. . .:::  .:::. . .   .:.   :.   .
CCDS33 STEFISLR------IDSSDEDR---ISEVRKVLNSGNFYFAWSASGI-SLDLSLNAHRSM
      140             150          160       170        180        

           160       170       180        190       200       210  
pF1KSD QEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQP-EVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILIS
       ::..    .:.:: ::  :  .:.    .   . : .. : . ...     :     :::
CCDS33 QEQT----TDNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLIS
      190           200       210       220       230       240    

            220       230       240       250       260       270  
pF1KSD RRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKY
       : :: :::.:. ::: ...::.::::::::.:. . : .::.: :::.:.:: : :.:. 
CCDS33 RLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQ-PGLQV
          250       260       270       280       290        300   

             280        290       300       310       320          
pF1KSD -KPLPQISK-VANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMV-SSLG
        .   ..:.    .  .:.::: .   .::::.:.::...: .:. : ..: . . .:  
CCDS33 GSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEH
           310       320       330       340       350       360   

     330       340       350        360       370       380        
pF1KSD SGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRL-SILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSN
       .. .... ::.:.  :. . ..: :.:  :: .. :  ..:  ... .:   : :. :.:
CCDS33 AADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQKFLD-YGFFYFNGS-EVQRCQSGTVRTN
           370       380       390        400        410       420 

      390       400       410       420       430       440        
pF1KSD CMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQ
       :.::::::: .:..:. . :  ::. ::   ...: .   .:...... :. :... .: 
CCDS33 CLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALG---LAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKI
             430       440          450       460       470        

      450       460       470       480       490        500       
pF1KSD YAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSID-LFLGNYSVDEL
       :::::::.      ::      . ::  :. :  .::: :. .:..:: :.:::      
CCDS33 YAGTGALE------GKAK----LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDL
      480             490           500       510       520        

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD ESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFII
                                                                   
CCDS33 ADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFR
      530       540       550       560       570       580        

>>CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21              (1612 aa)
 initn: 507 init1: 254 opt: 632  Z-score: 797.1  bits: 158.9 E(32554): 4.4e-38
Smith-Waterman score: 735; 31.2% identity (62.5% similar) in 504 aa overlap (10-501:51-522)

                                    10        20        30         
pF1KSD                      MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTE
                                     ::   : .. ::.     .. : ..  .. 
CCDS33 CGRRRRRSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVET--RHKEECLMFESGAVA
               30        40        50        60          70        

      40        50          60        70            80        90   
pF1KSD VTLAVKKDVPPSAVTRPI--FGILGTIHLVAGN----YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKAT
       :  ...:..  .. .. .  .:.::...:  :.    ::...:  ..::..    :...:
CCDS33 VLSSAEKEAIKGTYSKVLDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKIQESEVFRVT
       80        90       100       110       120       130        

           100       110       120       130       140       150   
pF1KSD DFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEF
       . . .: .       : . .:    .. . .:::  .:::. . .   .:.   :.   .
CCDS33 STEFISLR------IDSSDEDR---ISEVRKVLNSGNFYFAWSASGI-SLDLSLNAHRSM
      140             150          160       170        180        

           160       170       180        190       200       210  
pF1KSD QEMSLLERADQRFVWNGHLLRELSAQP-EVHRFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILIS
       ::..    .:.:: ::  :  .:.    .   . : .. : . ...     :     :::
CCDS33 QEQT----TDNRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLIS
      190           200       210       220       230       240    

            220       230       240       250       260       270  
pF1KSD RRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKY
       : :: :::.:. ::: ...::.::::::::.:. . : .::.: :::.:.:: : :.:. 
CCDS33 RLSCERAGTRFNVRGTNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQ-PGLQV
          250       260       270       280       290        300   

             280        290       300       310       320          
pF1KSD -KPLPQISK-VANHMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMV-SSLG
        .   ..:.    .  .:.::: .   .::::.:.::...: .:. : ..: . . .:  
CCDS33 GSHRVRMSRGFEANAPAFDRHFRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEH
           310       320       330       340       350       360   

     330       340       350        360       370       380        
pF1KSD SGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRL-SILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSN
       .. .... ::.:.  :. . ..: :.:  :: .. :  ..:  ... .:   : :. :.:
CCDS33 AADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSVLKPQVQKFLD-YGFFYFNGS-EVQRCQSGTVRTN
           370       380       390        400        410       420 

      390       400       410       420       430       440        
pF1KSD CMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQ
       :.::::::: .:..:. . :  ::. ::   ...: .   .:...... :. :... .: 
CCDS33 CLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALG---LAEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKI
             430       440          450       460       470        

      450       460       470       480       490        500       
pF1KSD YAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSID-LFLGNYSVDEL
       :::::::.      ::      . ::  :. :  .::: :. .:..:: :.:::      
CCDS33 YAGTGALE------GKAK----LKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDL
      480             490           500       510       520        

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD ESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFII
                                                                   
CCDS33 ADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFR
      530       540       550       560       570       580        

>>CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6                (1496 aa)
 initn: 540 init1: 242 opt: 598  Z-score: 754.2  bits: 150.9 E(32554): 1.1e-35
Smith-Waterman score: 690; 30.8% identity (60.4% similar) in 520 aa overlap (26-517:27-512)

                10        20        30        40         50        
pF1KSD  MATAAYEQLKLHITPEKFYVEACDDGADDVLTIDRVSTEVTLAVK-KDVPPSAVTR--P
                                 : :: : .. ..: .::: . :.:  .   .   
CCDS52 MALSKGLRLLGRLGAEGDCSVLLEARGRDDCLLFE-AGTVATLAPEEKEVIKGQYGKLTD
               10        20        30         40        50         

         60            70        80        90       100       110  
pF1KSD IFGILGTIHLVAG----NYLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQL
        .: :: ..: .:    ..:...:   .::.. .  ..: :  :    ..        . 
CCDS52 AYGCLGELRLKSGGTSLSFLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQE--------EA
      60        70        80        90       100               110 

            120       130            140       150       160       
pF1KSD QDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFS-----TTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFV
       .... ..: :...:.   ::::     . .:::   :. .. : :.          . : 
CCDS52 KEEERLIA-LKKILSSGVFYFSWPNDGSRFDLTVRTQKQGDDSSEW---------GNSFF
              120       130       140       150                160 

       170       180         190       200       210       220     
pF1KSD WNGHLLRELSAQPEVH--RFALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYV
       :: .::.    : .:    . : .. : .:...   . :     :.:: :: :.:.:...
CCDS52 WN-QLLHVPLRQHQVSCCDWLLKIICGVVTIRTVYASHKQAKACLVSRVSCERTGTRFHT
              170       180       190       200       210       220

         230       240       250       260       270         280   
pF1KSD RGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKY--KPLPQISKVAN
       ::....::..:::::::..... . .:::: :::.:.:: : :.:.   . :     .  
CCDS52 RGVNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQ-PGLQVGSHHLRLHRGLEA
              230       240       250       260        270         

           290       300       310       320        330       340  
pF1KSD HMDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMV-SSLGSGMMRYIAFDFHK
       .  .:.::.      ::.::..::....:.:. :...:  .. .:  .:   .: ::::.
CCDS52 NAPAFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKKLLWASCHAGDTPMINFDFHQ
     280       290       300       310       320       330         

            350       360       370       380         390       400
pF1KSD ECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVAN--QEGVFRSNCMDCLDRTNVIQ
         :. . ..:  ::    ... :   : : . :. :.   :.:..: ::.:::::::..:
CCDS52 FAKGGKLEKLETLLRPQLKLHWE--DFDVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRTNTVQ
     340       350       360         370       380       390       

              410       420       430       440       450       460
pF1KSD SLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFT
       :..: . :. ::. ::.    ..    :.: . .:  :. :... .: ..:. ::.    
CCDS52 SFIALEVLHLQLKTLGL----SSKPIVDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALE----
       400       410           420       430       440             

              470       480       490            500           510 
pF1KSD RTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSIDLFL-----GNYSVDE----LESHS
         :: ...: . ::  :: :  ..:: :: .:..: :.:     :.  .:.    :.: .
CCDS52 --GK-AKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDSTA
       450        460       470       480       490       500      

             520       530       540       550       560       570 
pF1KSD PLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNG
        : .::                                                      
CCDS52 LLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQLS
        510       520       530       540       550       560      

>>CCDS5078.1 FIG4 gene_id:9896|Hs108|chr6                 (907 aa)
 initn: 594 init1: 137 opt: 249  Z-score: 311.7  bits: 68.3 E(32554): 4.8e-11
Smith-Waterman score: 626; 28.4% identity (57.7% similar) in 532 aa overlap (58-519:93-614)

        30        40        50        60        70        80       
pF1KSD DDVLTIDRVSTEVTLAVKKDVPPSAVTRPIFGILGTIHLVAGNYLIVITKKIKVGEFFSH
                                     ::..: .... : :...:::. :.... .:
CCDS50 VRELLGRLDLGNRTKMGQKGSSGLFRAVSAFGVVGFVRFLEGYYIVLITKRRKMADIGGH
             70        80        90       100       110       120  

        90       100       110       120       130       140       
pF1KSD VVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQ---
       ...:. : ...   .  ...:     :.  .: ....:   ..:::: .:::.:.::   
CCDS50 AIYKVEDTNMIYIPNDSVRVTH---PDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNL
            130       140          150       160       170         

                      150           160                  170       
pF1KSD ------------RLSNTSPE----FQEMSLLERADQ-----------RFVWNGHLLRELS
                   .....  :    :.. .:. .. .           ..::::.::  ..
CCDS50 TVLRMPLEMLKSEMTQNRQESFDIFEDEGLITQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGELLDIIK
     180       190       200       210       220       230         

       180        190       200       210       220       230      
pF1KSD AQPEVHR-FALPVLHGFITMHSCSINGKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAAN
       .   ::: . : ..:::  . .  : :.     ::.:::   ::.:.  :: . :: .::
CCDS50 ST--VHRDWLLYIIHGFCGQSKLLIYGRPVYVTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDVAN
     240         250       260       270       280       290       

        240              250       260       270       280         
pF1KSD FVETEQIV-------HYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANHMDGFQ
        ::::::.          :: .:.::.:::.:..:::  .  . : : :.   .. : : 
CCDS50 EVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVRGSVPLYWSQDIST-MMPKPPIT--LDQADPFA
       300       310       320       330        340         350    

     290           300        310          320       330           
pF1KSD R----HFDSQVIIYGKQVII-NLINQKGS---EKPLEQTFATMVSSLGSGM-----MRYI
       .    :::..   .:. .:: ::.... .   :. : . ... :. :.. .     . ::
CCDS50 HVAALHFDQMFQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERILSEELVAAVTYLNQFLPPEHTIVYI
          360       370       380       390       400       410    

        340          350       360            370               380
pF1KSD AFDFHKECKNMR---WDRLSILLDQVAEMQDEL-----SYFLV--------DSAGQVVAN
        .:. :  :.      :::... ..:..    .     ::  .        . .: :. .
CCDS50 PWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDSYCSILRPDEKWNELGGCVIPT
          420       430       440       450       460       470    

                 390       400       410       420       430       
pF1KSD ---QEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNA
          : :..:.::.:::::::. : .... .:  ::  ::..    .:. . .  ..... 
CCDS50 GRLQTGILRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLID-KPNLQFDTDAVRLFEEL
          480       490       500       510        520       530   

       440       450       460       470       480       490       
pF1KSD WADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSIDL
       . :.... . ::.:.  ..   :            :  ... :::.: :::. :::::.:
CCDS50 YEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDADRQDSINL
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