Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0848, 977 aa
  1>>>pF1KSDA0848 977 - 977 aa - 977 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3134+/-0.000424; mu= 3.4798+/- 0.027
 mean_var=235.0723+/-49.119, 0's: 0 Z-trim(119.9): 283  B-trim: 1451 in 1/52
 Lambda= 0.083651
 statistics sampled from 34224 (34584) to 34224 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.405), width:  16
 Scan time: 13.460

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055741 (OMIM: 609679) SLIT and NTRK-like protei ( 977) 6637 814.8       0
NP_001305739 (OMIM: 609679) SLIT and NTRK-like pro ( 977) 6637 814.8       0
NP_001305740 (OMIM: 609679) SLIT and NTRK-like pro ( 977) 6637 814.8       0
XP_005254096 (OMIM: 609680) PREDICTED: SLIT and NT ( 958) 2256 286.1   6e-76
XP_005254095 (OMIM: 609680) PREDICTED: SLIT and NT ( 958) 2256 286.1   6e-76
NP_056382 (OMIM: 609680) SLIT and NTRK-like protei ( 958) 2256 286.1   6e-76
NP_001137481 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_115928 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like protei ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001137482 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
XP_005262402 (OMIM: 300561) PREDICTED: SLIT and NT ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001137475 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001137478 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001137477 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
XP_005262401 (OMIM: 300561) PREDICTED: SLIT and NT ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001137476 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
XP_005262400 (OMIM: 300561) PREDICTED: SLIT and NT ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
XP_005262399 (OMIM: 300561) PREDICTED: SLIT and NT ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001137480 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like pro ( 845) 1214 160.3 3.9e-38
NP_001171679 (OMIM: 300562) SLIT and NTRK-like pro ( 837) 1134 150.6 3.1e-35
NP_775101 (OMIM: 300562) SLIT and NTRK-like protei ( 837) 1134 150.6 3.1e-35
NP_001171678 (OMIM: 300562) SLIT and NTRK-like pro ( 837) 1134 150.6 3.1e-35
XP_005262422 (OMIM: 300562) PREDICTED: SLIT and NT ( 837) 1134 150.6 3.1e-35
XP_011529567 (OMIM: 300562) PREDICTED: SLIT and NT ( 837) 1134 150.6 3.1e-35
NP_115605 (OMIM: 221200,609681) SLIT and NTRK-like ( 841) 1078 143.9 3.4e-33
NP_001268432 (OMIM: 137580,609678,613229) SLIT and ( 696)  873 119.1 8.2e-26
NP_443142 (OMIM: 137580,609678,613229) SLIT and NT ( 696)  873 119.1 8.2e-26
NP_003053 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein is (1523)  370 58.6 2.8e-07
NP_001258875 (OMIM: 603745) slit homolog 3 protein (1530)  370 58.6 2.8e-07
NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466)  329 53.3 3.5e-06
NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466)  329 53.3 3.5e-06
XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-ric ( 719)  329 53.4 4.9e-06
NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and f ( 719)  329 53.4 4.9e-06
NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 719)  329 53.4 4.9e-06
XP_005274542 (OMIM: 300938) PREDICTED: matrix-remo (2853)  321 52.9 2.8e-05
XP_016876623 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_011534913 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_016876624 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
NP_001333072 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
NP_001333075 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_016876621 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_016876620 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_016876622 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
XP_016876618 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660)  305 50.5 3.4e-05
NP_037363 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat trans ( 660)  305 50.5 3.4e-05
NP_001333073 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660)  305 50.5 3.4e-05
NP_001333074 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660)  305 50.5 3.4e-05
NP_036425 (OMIM: 269400,605158) peroxidasin homolo (1479)  311 51.5 3.9e-05
NP_001258 (OMIM: 602178) chondroadherin precursor  ( 359)  295 49.1 4.9e-05


>>NP_055741 (OMIM: 609679) SLIT and NTRK-like protein 3   (977 aa)
 initn: 6637 init1: 6637 opt: 6637  Z-score: 4341.8  bits: 814.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6637; 99.9% identity (99.9% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_055 DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAGKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
              910       920       930       940       950       960

              970       
pF1KSD QTKPDYLEVLEKTTYRF
       :::::::::::::::::
NP_055 QTKPDYLEVLEKTTYRF
              970       

>>NP_001305739 (OMIM: 609679) SLIT and NTRK-like protein  (977 aa)
 initn: 6637 init1: 6637 opt: 6637  Z-score: 4341.8  bits: 814.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6637; 99.9% identity (99.9% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAGKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
              910       920       930       940       950       960

              970       
pF1KSD QTKPDYLEVLEKTTYRF
       :::::::::::::::::
NP_001 QTKPDYLEVLEKTTYRF
              970       

>>NP_001305740 (OMIM: 609679) SLIT and NTRK-like protein  (977 aa)
 initn: 6637 init1: 6637 opt: 6637  Z-score: 4341.8  bits: 814.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6637; 99.9% identity (99.9% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAGKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
              910       920       930       940       950       960

              970       
pF1KSD QTKPDYLEVLEKTTYRF
       :::::::::::::::::
NP_001 QTKPDYLEVLEKTTYRF
              970       

>>XP_005254096 (OMIM: 609680) PREDICTED: SLIT and NTRK-l  (958 aa)
 initn: 2348 init1: 1044 opt: 2256  Z-score: 1484.5  bits: 286.1 E(85289): 6e-76
Smith-Waterman score: 2420; 42.2% identity (68.5% similar) in 1011 aa overlap (4-974:9-953)

                    10        20        30        40           50  
pF1KSD      MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID---EPCFDPCYCEV
               .. . :::    :  .:.:.:.. :. .  .  .: ::   : : . : :: 
XP_005 MHTCCPPVTLEQDLHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYYGEICDNACPCEE
               10        20          30          40        50      

             60        70        80        90       100       110  
pF1KSD KESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNA
       :.... . :...:. ..:.:.      ..: :. : . .:: : :.. ..:  ..::.:.
XP_005 KDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNV
         60        70        80        90       100       110      

            120       130       140       150       160       170  
pF1KSD LQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNL
       .:::.::::.::. :.::.:..:::...:.:::::::.:::::.::: :. :: .:: .:
XP_005 IQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKL
        120       130       140       150       160       170      

            180       190       200       210       220       230  
pF1KSD SKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEEN
         :.::::::::.  ::.:::. : ::::::::::::.: : :.:.:. . ..:::::::
XP_005 HLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDK-VVELQLEEN
        180       190       200       210       220        230     

            240       250       260       270       280         290
pF1KSD PWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCP--LLSDSEVE
       ::::.::...::.::. : :.:::::..:::::..::.:: :. : ::::  :.:: :..
XP_005 PWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRLISDYEMR
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pF1KSD ASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPR--PPSTS
            :..  :  .   : :.:. .::  :.::. ::   : :: :.::  ::  : : .
XP_005 -----PQTPLSTTGYLHTTPASV-NSVA-TSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQ
              300       310         320       330       340        

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pF1KSD QALYPG-PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRP
        .   :  :  :   :::. :.:. :::.:.:::.:.::::.:::.:: ...:.:: :.:
XP_005 PSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKP
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pF1KSD LNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGND
        : ::.::. : :  . :.:: . ..::::::::::::..:: :: .: ::. :.:::: 
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pF1KSD IEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT
       ::.:.: .: :::::.::....:.::::: ..:. .:::.:::::::::...:. .:.: 
XP_005 IERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGL
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pF1KSD SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVG
       .: :::::.:.:  :::.:::..:....::::..::::::::.: .: :.: ..   .: 
XP_005 TLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVD
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pF1KSD DVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQ---PGDSHLIGAP-----TSA
       .:.:..:..... :.:.:. :.:::..  :. .  .:..   :. .  . .:     ...
XP_005 EVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAV-TPAVRLNSTG
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pF1KSD SPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVD
       .:  ..  ::   :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:.   ... ... :
XP_005 APASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNS-D
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pF1KSD LTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQM
       .....:: . ..    :::::.::  .       :.:  :.   :.::::::::::. .:
XP_005 VSSFNMQ-YSVY----GGGGGTGGHPHAHVHHRGPAL--PKVKTPAGHVYEYIPHPLGHM
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pF1KSD CNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGMGEALLGSEQFAE
       :.::::. ::           : .:. :: ..  . ..  :  : : .        :.  
XP_005 CKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQQPP----PQLQL
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pF1KSD TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAG
        : :         :...:                  :: . :: . :: .      :: .
XP_005 QPGE---------EERRE-----------------SHHLRSPAYS-VSTIEPRE--DLLS
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pF1KSD FRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLYGTVPKLKELHVH
         .        .. :   :..   :. :   : :.  ::.       :   :.  .:. .
XP_005 PVQDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSL--PEYPK-FPCS----PAAYTFSPNY-DLR-R
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pF1KSD PPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTKPDYLEVLEKTTY
       :  . .:    :.::.: .:.:  .. :.  . ....::::.:::...::::::::: : 
XP_005 PHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFV--EPNRNEYLELKAKLNVEPDYLEVLEKQTT
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pF1KSD RF  
           
XP_005 FSQF
           

>>XP_005254095 (OMIM: 609680) PREDICTED: SLIT and NTRK-l  (958 aa)
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pF1KSD      MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID---EPCFDPCYCEV
               .. . :::    :  .:.:.:.. :. .  .  .: ::   : : . : :: 
XP_005 MHTCCPPVTLEQDLHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYYGEICDNACPCEE
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pF1KSD KESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNA
       :.... . :...:. ..:.:.      ..: :. : . .:: : :.. ..:  ..::.:.
XP_005 KDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNV
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pF1KSD LQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNL
       .:::.::::.::. :.::.:..:::...:.:::::::.:::::.::: :. :: .:: .:
XP_005 IQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKL
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pF1KSD SKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEEN
         :.::::::::.  ::.:::. : ::::::::::::.: : :.:.:. . ..:::::::
XP_005 HLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDK-VVELQLEEN
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pF1KSD PWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCP--LLSDSEVE
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XP_005 PWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRLISDYEMR
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pF1KSD ASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPR--PPSTS
            :..  :  .   : :.:. .::  :.::. ::   : :: :.::  ::  : : .
XP_005 -----PQTPLSTTGYLHTTPASV-NSVA-TSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQ
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pF1KSD QALYPG-PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRP
        .   :  :  :   :::. :.:. :::.:.:::.:.::::.:::.:: ...:.:: :.:
XP_005 PSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKP
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pF1KSD LNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGND
        : ::.::. : :  . :.:: . ..::::::::::::..:: :: .: ::. :.:::: 
XP_005 YNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNR
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pF1KSD IEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT
       ::.:.: .: :::::.::....:.::::: ..:. .:::.:::::::::...:. .:.: 
XP_005 IERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGL
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XP_005 TLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVD
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       .:.:..:..... :.:.:. :.:::..  :. .  .:..   :. .  . .:     ...
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pF1KSD SPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVD
       .:  ..  ::   :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:.   ... ... :
XP_005 APASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNS-D
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pF1KSD LTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQM
       .....:: . ..    :::::.::  .       :.:  :.   :.::::::::::. .:
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pF1KSD CNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGMGEALLGSEQFAE
       :.::::. ::           : .:. :: ..  . ..  :  : : .        :.  
XP_005 CKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQQPP----PQLQL
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pF1KSD TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAG
        : :         :...:                  :: . :: . :: .      :: .
XP_005 QPGE---------EERRE-----------------SHHLRSPAYS-VSTIEPRE--DLLS
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pF1KSD FRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLYGTVPKLKELHVH
         .        .. :   :..   :. :   : :.  ::.       :   :.  .:. .
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pF1KSD PPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTKPDYLEVLEKTTY
       :  . .:    :.::.: .:.:  .. :.  . ....::::.:::...::::::::: : 
XP_005 PHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFV--EPNRNEYLELKAKLNVEPDYLEVLEKQTT
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pF1KSD RF  
           
XP_005 FSQF
           

>>NP_056382 (OMIM: 609680) SLIT and NTRK-like protein 5   (958 aa)
 initn: 2348 init1: 1044 opt: 2256  Z-score: 1484.5  bits: 286.1 E(85289): 6e-76
Smith-Waterman score: 2420; 42.2% identity (68.5% similar) in 1011 aa overlap (4-974:9-953)

                    10        20        30        40           50  
pF1KSD      MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID---EPCFDPCYCEV
               .. . :::    :  .:.:.:.. :. .  .  .: ::   : : . : :: 
NP_056 MHTCCPPVTLEQDLHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYYGEICDNACPCEE
               10        20          30          40        50      

             60        70        80        90       100       110  
pF1KSD KESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNA
       :.... . :...:. ..:.:.      ..: :. : . .:: : :.. ..:  ..::.:.
NP_056 KDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNV
         60        70        80        90       100       110      

            120       130       140       150       160       170  
pF1KSD LQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNL
       .:::.::::.::. :.::.:..:::...:.:::::::.:::::.::: :. :: .:: .:
NP_056 IQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKL
        120       130       140       150       160       170      

            180       190       200       210       220       230  
pF1KSD SKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEEN
         :.::::::::.  ::.:::. : ::::::::::::.: : :.:.:. . ..:::::::
NP_056 HLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDK-VVELQLEEN
        180       190       200       210       220        230     

            240       250       260       270       280         290
pF1KSD PWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCP--LLSDSEVE
       ::::.::...::.::. : :.:::::..:::::..::.:: :. : ::::  :.:: :..
NP_056 PWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRLISDYEMR
         240       250       260       270       280       290     

              300       310       320       330       340          
pF1KSD ASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPR--PPSTS
            :..  :  .   : :.:. .::  :.::. ::   : :: :.::  ::  : : .
NP_056 -----PQTPLSTTGYLHTTPASV-NSVA-TSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQ
              300       310         320       330       340        

      350        360       370       380       390       400       
pF1KSD QALYPG-PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRP
        .   :  :  :   :::. :.:. :::.:.:::.:.::::.:::.:: ...:.:: :.:
NP_056 PSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKP
      350       360       370       380       390       400        

       410       420       430       440       450       460       
pF1KSD LNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGND
        : ::.::. : :  . :.:: . ..::::::::::::..:: :: .: ::. :.:::: 
NP_056 YNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNR
      410       420       430       440       450       460        

       470       480       490       500       510       520       
pF1KSD IEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT
       ::.:.: .: :::::.::....:.::::: ..:. .:::.:::::::::...:. .:.: 
NP_056 IERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGL
      470       480       490       500       510       520        

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVG
       .: :::::.:.:  :::.:::..:....::::..::::::::.: .: :.: ..   .: 
NP_056 TLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVD
      530       540       550       560       570       580        

       590       600       610       620          630              
pF1KSD DVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQ---PGDSHLIGAP-----TSA
       .:.:..:..... :.:.:. :.:::..  :. .  .:..   :. .  . .:     ...
NP_056 EVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAV-TPAVRLNSTG
      590       600       610       620       630        640       

     640       650         660       670       680       690       
pF1KSD SPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVD
       .:  ..  ::   :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:.   ... ... :
NP_056 APASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNS-D
       650       660       670       680       690       700       

       700       710       720              730       740       750
pF1KSD LTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQM
       .....:: . ..    :::::.::  .       :.:  :.   :.::::::::::. .:
NP_056 VSSFNMQ-YSVY----GGGGGTGGHPHAHVHHRGPAL--PKVKTPAGHVYEYIPHPLGHM
        710            720       730         740       750         

              760                  770       780       790         
pF1KSD CNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGMGEALLGSEQFAE
       :.::::. ::           : .:. :: ..  . ..  :  : : .        :.  
NP_056 CKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQQPP----PQLQL
     760       770       780       790       800       810         

     800       810       820       830       840       850         
pF1KSD TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAG
        : :         :...:                  :: . :: . :: .      :: .
NP_056 QPGE---------EERRE-----------------SHHLRSPAYS-VSTIEPRE--DLLS
                  820                        830        840        

     860       870       880          890       900       910      
pF1KSD FRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLYGTVPKLKELHVH
         .        .. :   :..   :. :   : :.  ::.       :   :.  .:. .
NP_056 PVQDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSL--PEYPK-FPCS----PAAYTFSPNY-DLR-R
        850       860       870          880           890         

        920       930       940        950       960       970     
pF1KSD PPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTKPDYLEVLEKTTY
       :  . .:    :.::.: .:.:  .. :.  . ....::::.:::...::::::::: : 
NP_056 PHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFV--EPNRNEYLELKAKLNVEPDYLEVLEKQTT
       900        910       920         930       940       950    

           
pF1KSD RF  
           
NP_056 FSQF
           

>>NP_001137481 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like protein  (845 aa)
 initn: 2191 init1: 1010 opt: 1214  Z-score: 805.6  bits: 160.3 E(85289): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 2199; 44.3% identity (70.8% similar) in 808 aa overlap (15-817:5-765)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
                     .:.. . :.: :    :   :. .   . :   : :: ::....:.
NP_001           MLSGVWFLSVLTVA-G----ILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNIN
                         10             20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
       :..::::..: .     : ..:.:. : . .:: : :.. .:::...::::.::.:.:::
NP_001 CENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGA
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
       :.::: ::::.:..:::...:.::::::::::::::::: :. ::.::: .:.::.::::
NP_001 FSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLIL
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
       ::::.  ::.:.:. : :::::::::::::. . :.:.::: ..::.:::::::::::..
NP_001 NDNLLLSLPSNVFRFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIG-GIMEIQLEENPWNCTCDL
         170       180       190       200        210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
       . ::.::. :  :..::.:.:::::..::::. .. . .:::  : :.  .:    :...
NP_001 LPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASD--SSQRGSHADT
          230         240       250       260       270         280

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
         .   ::   ..        . ..  .... ::  ..: :::   ...    :    ::
NP_001 HVQRLSPTMNPAL--------NPTRAPKASRPPKMRNRP-TPRVTVSKDRQSFG----PI
              290               300       310        320           

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
         :::. :.:. ::..:.:. . .: ::.:::.:: :.:::.: :.: . :::::..: .
NP_001 MVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYL
       330       340       350       360       370       380       

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
       : .:..:. ..:::::::::::::. .:.::: :: .:. :.:::: .: : :.:: :::
NP_001 QTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQ
       390       400       410       420       430       440       

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
       ::.:::.:.:::.::.: .:. . ::.::::::::::.:: . :.::.:.:::::.:.: 
NP_001 SLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFS
       450       460       470       480       490       500       

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
       .::: :::..: :..::::.:::::::::.. .:.: :  .:  ....: :.:: . . .
NP_001 HLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGE
       510       520       530       540       550       560       

              610       620       630         640       650        
pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTS--ASPYEFSPPGGPVPLSVLIL
        .. .  :..::.    .:   . .  . .:   .: :  .::  .      ::::::::
NP_001 ILKFLGREAICPD----SPNLSDGTVLSMNHNTDTPRSLSVSPSSYPELHTEVPLSVLIL
       570       580           590       600       610       620   

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD SLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGG
       .:::.:. .:  .::::..::.:: : .:   .  ...:....:.:              
NP_001 GLLVVFILSVCFGAGLFVFVLKRR-KGVPSVPRNTNNLDVSSFQLQY-------------
           630       640        650       660                      

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD SGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERG
           :  .  . .:.   ::::.::: :: :::.::::  .: . ::     .  :    
NP_001 ----GSYNTETHDKTD--GHVYNYIPPPVGQMCQNPIYMQKEGDPVAYYRNLQEFSYSNL
         670       680         690       700       710       720   

      780       790          800       810       820       830     
pF1KSD GPGTQPPGMGEALLGSEQFAE---TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNH
           . :.     ... .. :   ::.: .  :... :. ::                  
NP_001 EEKKEEPATPAYTISATELLEKQATPREPELLYQNIAERVKELPSAGLVHYNFCTLPKRQ
           730       740       750       760       770       780   

         840       850       860       870       880       890     
pF1KSD HHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPC
                                                                   
NP_001 FAPSYESRRQNQDRINKTVLYGTPRKCFVGQSKPNHPLLQAKPQSEPDYLEVLEKQTAIS
           790       800       810       820       830       840   

>>NP_115928 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like protein 2   (845 aa)
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                     .:.. . :.: :    :   :. .   . :   : :: ::....:.
NP_115           MLSGVWFLSVLTVA-G----ILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNIN
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       :..::::..: .     : ..:.:. : . .:: : :.. .:::...::::.::.:.:::
NP_115 CENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGA
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       :.::: ::::.:..:::...:.::::::::::::::::: :. ::.::: .:.::.::::
NP_115 FSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLIL
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       ::::.  ::.:.:. : :::::::::::::. . :.:.::: ..::.:::::::::::..
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       . ::.::. :  :..::.:.:::::..::::. .. . .:::  : :.  .:    :...
NP_115 LPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASD--SSQRGSHADT
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         .   ::   ..        . ..  .... ::  ..: :::   ...    :    ::
NP_115 HVQRLSPTMNPAL--------NPTRAPKASRPPKMRNRP-TPRVTVSKDRQSFG----PI
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pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
         :::. :.:. ::..:.:. . .: ::.:::.:: :.:::.: :.: . :::::..: .
NP_115 MVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYL
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pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
       : .:..:. ..:::::::::::::. .:.::: :: .:. :.:::: .: : :.:: :::
NP_115 QTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQ
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pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
       ::.:::.:.:::.::.: .:. . ::.::::::::::.:: . :.::.:.:::::.:.: 
NP_115 SLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFS
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pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
       .::: :::..: :..::::.:::::::::.. .:.: :  .:  ....: :.:: . . .
NP_115 HLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGE
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pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTS--ASPYEFSPPGGPVPLSVLIL
        .. .  :..::.    .:   . .  . .:   .: :  .::  .      ::::::::
NP_115 ILKFLGREAICPD----SPNLSDGTVLSMNHNTDTPRSLSVSPSSYPELHTEVPLSVLIL
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pF1KSD SLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGG
       .:::.:. .:  .::::..::.:: : .:   .  ...:....:.:              
NP_115 GLLVVFILSVCFGAGLFVFVLKRR-KGVPSVPRNTNNLDVSSFQLQY-------------
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pF1KSD SGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERG
           :  .  . .:.   ::::.::: :: :::.::::  .: . ::     .  :    
NP_115 ----GSYNTETHDKTD--GHVYNYIPPPVGQMCQNPIYMQKEGDPVAYYRNLQEFSYSNL
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pF1KSD GPGTQPPGMGEALLGSEQFAE---TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNH
           . :.     ... .. :   ::.: .  :... :. ::                  
NP_115 EEKKEEPATPAYTISATELLEKQATPREPELLYQNIAERVKELPSAGLVHYNFCTLPKRQ
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pF1KSD HHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPC
                                                                   
NP_115 FAPSYESRRQNQDRINKTVLYGTPRKCFVGQSKPNHPLLQAKPQSEPDYLEVLEKQTAIS
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>>NP_001137482 (OMIM: 300561) SLIT and NTRK-like protein  (845 aa)
 initn: 2191 init1: 1010 opt: 1214  Z-score: 805.6  bits: 160.3 E(85289): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 2199; 44.3% identity (70.8% similar) in 808 aa overlap (15-817:5-765)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
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NP_001           MLSGVWFLSVLTVA-G----ILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNIN
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pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
       :..::::..: .     : ..:.:. : . .:: : :.. .:::...::::.::.:.:::
NP_001 CENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGA
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pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
       :.::: ::::.:..:::...:.::::::::::::::::: :. ::.::: .:.::.::::
NP_001 FSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLIL
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pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
       ::::.  ::.:.:. : :::::::::::::. . :.:.::: ..::.:::::::::::..
NP_001 NDNLLLSLPSNVFRFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIG-GIMEIQLEENPWNCTCDL
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pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
       . ::.::. :  :..::.:.:::::..::::. .. . .:::  : :.  .:    :...
NP_001 LPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASD--SSQRGSHADT
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pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
         .   ::   ..        . ..  .... ::  ..: :::   ...    :    ::
NP_001 HVQRLSPTMNPAL--------NPTRAPKASRPPKMRNRP-TPRVTVSKDRQSFG----PI
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pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
         :::. :.:. ::..:.:. . .: ::.:::.:: :.:::.: :.: . :::::..: .
NP_001 MVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYL
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pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
       : .:..:. ..:::::::::::::. .:.::: :: .:. :.:::: .: : :.:: :::
NP_001 QTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQ
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pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
       ::.:::.:.:::.::.: .:. . ::.::::::::::.:: . :.::.:.:::::.:.: 
NP_001 SLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFS
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pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
       .::: :::..: :..::::.:::::::::.. .:.: :  .:  ....: :.:: . . .
NP_001 HLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGE
       510       520       530       540       550       560       

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pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTS--ASPYEFSPPGGPVPLSVLIL
        .. .  :..::.    .:   . .  . .:   .: :  .::  .      ::::::::
NP_001 ILKFLGREAICPD----SPNLSDGTVLSMNHNTDTPRSLSVSPSSYPELHTEVPLSVLIL
       570       580           590       600       610       620   

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pF1KSD SLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGG
       .:::.:. .:  .::::..::.:: : .:   .  ...:....:.:              
NP_001 GLLVVFILSVCFGAGLFVFVLKRR-KGVPSVPRNTNNLDVSSFQLQY-------------
           630       640        650       660                      

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD SGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERG
           :  .  . .:.   ::::.::: :: :::.::::  .: . ::     .  :    
NP_001 ----GSYNTETHDKTD--GHVYNYIPPPVGQMCQNPIYMQKEGDPVAYYRNLQEFSYSNL
         670       680         690       700       710       720   

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pF1KSD GPGTQPPGMGEALLGSEQFAE---TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNH
           . :.     ... .. :   ::.: .  :... :. ::                  
NP_001 EEKKEEPATPAYTISATELLEKQATPREPELLYQNIAERVKELPSAGLVHYNFCTLPKRQ
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pF1KSD HHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPC
                                                                   
NP_001 FAPSYESRRQNQDRINKTVLYGTPRKCFVGQSKPNHPLLQAKPQSEPDYLEVLEKQTAIS
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>>XP_005262402 (OMIM: 300561) PREDICTED: SLIT and NTRK-l  (845 aa)
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