Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0798
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0798, 652 aa
  1>>>pF1KSDA0798 652 - 652 aa - 652 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3656+/-0.000999; mu= 18.0637+/- 0.062
 mean_var=420.8538+/-87.645, 0's: 0 Z-trim(108.0): 2020  B-trim: 62 in 1/51
 Lambda= 0.062519
 statistics sampled from 13823 (16104) to 13823 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.476), E-opt: 0.2 (0.189), width:  16
 Scan time:  7.390

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2120 208.0 1.1e-52
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2120 208.1 1.2e-52
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2120 208.1 1.2e-52
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 2050 201.5 8.3e-51
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743) 2050 201.6 8.5e-51
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745) 2050 201.6 8.5e-51
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311076 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 2050 201.6 8.6e-51
NP_001311071 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 2050 201.6 8.7e-51
NP_001311077 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 2050 201.6 8.7e-51
NP_001311082 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
XP_016885305 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
XP_006724618 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
NP_001311080 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 2050 201.7 8.7e-51
XP_016885299 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885304 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885301 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885300 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
NP_001311083 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885303 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_016885302 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
XP_006724613 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 2050 201.7 8.8e-51
NP_001311084 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 821) 2050 201.7 8.8e-51
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 2020 198.8 5.3e-50
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 2019 198.7 5.6e-50
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 2019 198.7 5.6e-50
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 2013 198.2 8.2e-50
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1993 196.3 2.8e-49
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1993 196.4 2.9e-49
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1993 196.4 2.9e-49
NP_001269130 (OMIM: 300819) zinc finger protein 63 ( 657) 1984 195.5   5e-49
NP_001032824 (OMIM: 300819) zinc finger protein 63 ( 657) 1984 195.5   5e-49
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1971 194.2   1e-48
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1971 194.2   1e-48


>>NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is  (864 aa)
 initn: 6213 init1: 2120 opt: 2120  Z-score: 1066.6  bits: 208.0 E(85289): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 2312; 51.4% identity (72.7% similar) in 663 aa overlap (23-652:13-668)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVSKPDALSKL
                             ::: : :: :::.:::: ::::.:.::: .::: . ::
NP_001           MDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVMLENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKL
                         10        20        30        40        50

               70        80         90       100       110         
pF1KSD ERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFGNTASQTKS
       :.:::   .. .  .. ::..  ..:: .. : ::.  : :. .  : ..::.       
NP_001 EQGEELCMVQAQVPNQTCPNTVWKIDDLMDWHQENKDKLGSTAKSFECTTFGK-------
               60        70        80        90       100          

     120       130         140       150       160       170       
pF1KSD LCLFRENHDTFELYIK--TLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGNYEELYSAA
       :::.  .. . .   :  :  ..:. .. ...   :: . :.  ::::.:...:.   . 
NP_001 LCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQVHGKSFFHSKHEQTVIGI
           110       120       130       140       150       160   

                                     180       190       200       
pF1KSD KF------------------------------SVSTKANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHVC
       :.                              :   :: :.:: .  ::.::  :: . :
NP_001 KYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTHAEEKPYGC
           170       180       190       200       210       220   

       210       220       230       240       250       260       
pF1KSD SECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECG
       .:::: : .:: :  :.:.::::: . :. : :.:: .:.:  :::::  :. . : :::
NP_001 NECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGENPYECCECG
           230       240       250       260       270       280   

       270       280       290       300       310       320       
pF1KSD KVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFT
       :::. :..:. ::.::.:.:::.::::::.:  : .::.:.: ::::: : :.:: :.:.
NP_001 KVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYECNECQKAFN
           290       300       310       320       330       340   

       330       340       350       360       370       380       
pF1KSD GKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSR
        :: :..:::::::::::.::.:::.:: :  .:.::  ::: ::: : .:::::..::.
NP_001 TKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCGKGFSLKSQ
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       390       400       410       420       430       440       
pF1KSD MIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIH
       .: :::.::: :::.:.::::.:  :: ::.: :.:: :: . :..:::.:. ::.::::
NP_001 LIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFSFKSQLIIH
           410       420       430       440       450       460   

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD QRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTH
       :: ::::.:: : ::::.:  : .:: :::::.:::::.:..:::.: ..: :..:::::
NP_001 QRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQLIIHQRTH
           470       480       490       500       510       520   

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD TGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEK
       :::::. :.:: :.:  ::::.:::::::::::. :.::::.::.:  ::::. .::  :
NP_001 TGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVK
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       570       580       590       600       610       620       
pF1KSD SCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVC
          ::.:.. :. ...: .:.. ::: :::::.::::.:  :: ::.:.::::::::  :
NP_001 PYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHEC
           590       600       610       620       630       640   

       630       640       650                                     
pF1KSD SECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP                                   
        :: :.:: . .:::::: :.:..:                                   
NP_001 RECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECG
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>--
 initn: 1807 init1: 916 opt: 920  Z-score: 481.7  bits: 99.8 E(85289): 4.3e-20
Smith-Waterman score: 923; 64.1% identity (82.6% similar) in 195 aa overlap (373-567:669-863)

            350       360       370       380       390       400  
pF1KSD KPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYI
                                     : :.::::.:. :...: :::::.::::: 
NP_001 KPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYG
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            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD CSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSEC
       ::::::.:  :: ::.:.:.:. :: : :.::::.:  ::.::.:.:::.: .:: ::.:
NP_001 CSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQC
      700       710       720       730       740       750        

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD GKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGF
        :.:  : ::.:::: :: ::::.::::::.:: :: :..:::::.::::: :::::: :
NP_001 EKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTF
      760       770       780       790       800       810        

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD AFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKET
       . :: : .::::::::::  :.::::.:  :  ::.::. :...:               
NP_001 SQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH              
      820       830       840       850       860                  

            590       600       610       620       630       640  
pF1KSD ELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIV

>>NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is  (947 aa)
 initn: 6213 init1: 2120 opt: 2120  Z-score: 1066.3  bits: 208.1 E(85289): 1.2e-52
Smith-Waterman score: 2312; 51.4% identity (72.7% similar) in 663 aa overlap (23-652:96-751)

                       10        20        30        40        50  
pF1KSD         MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVS
                                     ::: : :: :::.:::: ::::.:.::: .
NP_001 FISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVMLENYSNLVSLGYQHT
          70        80        90       100       110       120     

             60        70        80         90       100       110 
pF1KSD KPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFG
       ::: . :::.:::   .. .  .. ::..  ..:: .. : ::.  : :. .  : ..::
NP_001 KPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPNTVWKIDDLMDWHQENKDKLGSTAKSFECTTFG
         130       140       150       160       170       180     

             120       130         140       150       160         
pF1KSD NTASQTKSLCLFRENHDTFELYIK--TLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGN
       .       :::.  .. . .   :  :  ..:. .. ...   :: . :.  ::::.:..
NP_001 K-------LCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQVHGKSFFHSK
                190       200       210       220       230        

     170                                     180       190         
pF1KSD YEELYSAAKF------------------------------SVSTKANSTKSQVSKHQRTH
       .:.   . :.                              :   :: :.:: .  ::.::
NP_001 HEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTH
      240       250       260       270       280       290        

     200       210       220       230       240       250         
pF1KSD EIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREK
         :: . :.:::: : .:: :  :.:.::::: . :. : :.:: .:.:  :::::  :.
NP_001 AEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGEN
      300       310       320       330       340       350        

     260       270       280       290       300       310         
pF1KSD SFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYIC
        . : ::::::. :..:. ::.::.:.:::.::::::.:  : .::.:.: ::::: : :
NP_001 PYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYEC
      360       370       380       390       400       410        

     320       330       340       350       360       370         
pF1KSD SECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECG
       .:: :.:. :: :..:::::::::::.::.:::.:: :  .:.::  ::: ::: : .::
NP_001 NECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCG
      420       430       440       450       460       470        

     380       390       400       410       420       430         
pF1KSD KGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFT
       :::..::..: :::.::: :::.:.::::.:  :: ::.: :.:: :: . :..:::.:.
NP_001 KGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFS
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pF1KSD VKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSG
        ::.:::::: ::::.:: : ::::.:  : .:: :::::.:::::.:..:::.: ..: 
NP_001 FKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQ
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pF1KSD LMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVH
       :..::::::::::. :.:: :.:  ::::.:::::::::::. :.::::.::.:  ::::
NP_001 LIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVH
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     560       570       580       590       600       610         
pF1KSD QQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTH
       . .::  :   ::.:.. :. ...: .:.. ::: :::::.::::.:  :: ::.:.:::
NP_001 KGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTH
      660       670       680       690       700       710        

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pF1KSD TGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP                           
       :::::  : :: :.:: . .:::::: :.:..:                           
NP_001 TGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEK
      720       730       740       750       760       770        

NP_001 PYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKC
      780       790       800       810       820       830        

>--
 initn: 1807 init1: 916 opt: 920  Z-score: 481.4  bits: 99.9 E(85289): 4.5e-20
Smith-Waterman score: 923; 64.1% identity (82.6% similar) in 195 aa overlap (373-567:752-946)

            350       360       370       380       390       400  
pF1KSD KPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYI
                                     : :.::::.:. :...: :::::.::::: 
NP_001 KPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYG
             730       740       750       760       770       780 

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pF1KSD CSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSEC
       ::::::.:  :: ::.:.:.:. :: : :.::::.:  ::.::.:.:::.: .:: ::.:
NP_001 CSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQC
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pF1KSD GKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGF
        :.:  : ::.:::: :: ::::.::::::.:: :: :..:::::.::::: :::::: :
NP_001 EKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTF
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pF1KSD AFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKET
       . :: : .::::::::::  :.::::.:  :  ::.::. :...:               
NP_001 SQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH              
             910       920       930       940                     

            590       600       610       620       630       640  
pF1KSD ELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIV

>>NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 isofo  (947 aa)
 initn: 6213 init1: 2120 opt: 2120  Z-score: 1066.3  bits: 208.1 E(85289): 1.2e-52
Smith-Waterman score: 2312; 51.4% identity (72.7% similar) in 663 aa overlap (23-652:96-751)

                       10        20        30        40        50  
pF1KSD         MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVS
                                     ::: : :: :::.:::: ::::.:.::: .
NP_003 FISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVMLENYSNLVSLGYQHT
          70        80        90       100       110       120     

             60        70        80         90       100       110 
pF1KSD KPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHNAFG
       ::: . :::.:::   .. .  .. ::..  ..:: .. : ::.  : :. .  : ..::
NP_003 KPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPNTVWKIDDLMDWHQENKDKLGSTAKSFECTTFG
         130       140       150       160       170       180     

             120       130         140       150       160         
pF1KSD NTASQTKSLCLFRENHDTFELYIK--TLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGN
       .       :::.  .. . .   :  :  ..:. .. ...   :: . :.  ::::.:..
NP_003 K-------LCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQVHGKSFFHSK
                190       200       210       220       230        

     170                                     180       190         
pF1KSD YEELYSAAKF------------------------------SVSTKANSTKSQVSKHQRTH
       .:.   . :.                              :   :: :.:: .  ::.::
NP_003 HEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTH
      240       250       260       270       280       290        

     200       210       220       230       240       250         
pF1KSD EIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREK
         :: . :.:::: : .:: :  :.:.::::: . :. : :.:: .:.:  :::::  :.
NP_003 AEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGEN
      300       310       320       330       340       350        

     260       270       280       290       300       310         
pF1KSD SFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYIC
        . : ::::::. :..:. ::.::.:.:::.::::::.:  : .::.:.: ::::: : :
NP_003 PYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYEC
      360       370       380       390       400       410        

     320       330       340       350       360       370         
pF1KSD SECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECG
       .:: :.:. :: :..:::::::::::.::.:::.:: :  .:.::  ::: ::: : .::
NP_003 NECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCG
      420       430       440       450       460       470        

     380       390       400       410       420       430         
pF1KSD KGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFT
       :::..::..: :::.::: :::.:.::::.:  :: ::.: :.:: :: . :..:::.:.
NP_003 KGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFS
      480       490       500       510       520       530        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KSD VKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSG
        ::.:::::: ::::.:: : ::::.:  : .:: :::::.:::::.:..:::.: ..: 
NP_003 FKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQ
      540       550       560       570       580       590        

     500       510       520       530       540       550         
pF1KSD LMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVH
       :..::::::::::. :.:: :.:  ::::.:::::::::::. :.::::.::.:  ::::
NP_003 LIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVH
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pF1KSD QQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTH
       . .::  :   ::.:.. :. ...: .:.. ::: :::::.::::.:  :: ::.:.:::
NP_003 KGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTH
      660       670       680       690       700       710        

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pF1KSD TGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP                           
       :::::  : :: :.:: . .:::::: :.:..:                           
NP_003 TGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEK
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NP_003 PYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKC
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>--
 initn: 1807 init1: 916 opt: 920  Z-score: 481.4  bits: 99.9 E(85289): 4.5e-20
Smith-Waterman score: 923; 64.1% identity (82.6% similar) in 195 aa overlap (373-567:752-946)

            350       360       370       380       390       400  
pF1KSD KPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYI
                                     : :.::::.:. :...: :::::.::::: 
NP_003 KPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYG
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pF1KSD CSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSEC
       ::::::.:  :: ::.:.:.:. :: : :.::::.:  ::.::.:.:::.: .:: ::.:
NP_003 CSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQC
             790       800       810       820       830       840 

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pF1KSD GKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGF
        :.:  : ::.:::: :: ::::.::::::.:: :: :..:::::.::::: :::::: :
NP_003 EKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTF
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pF1KSD AFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKET
       . :: : .::::::::::  :.::::.:  :  ::.::. :...:               
NP_003 SQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH              
             910       920       930       940                     

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pF1KSD ELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIV

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                                     :. .:   ... :....  ..   : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
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pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
        ::..     ::: :  ..:   :  ... :  ...  :  :      .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
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pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
             : ::.:  .  : ..:    .. :.. . .. : ::: ..  :  .  ..  : 
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
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pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
        .....   :. : :.     . ::.. .::: :  ::.. :.. .:.: .: :.  :  
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
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pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
       :.:::::: :: :.:::. :: :  ::.::  .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
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pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
       :::: :.::::::  . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
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pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
       .:..:::.:  : .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
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pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
       ::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
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pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
       :  :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.:  :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
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pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
       :....:.: ::::::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...: 
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
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pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
        :...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .:: 
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
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pF1KSD THNGNKP                                 
        :.:.::                                 
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
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>>NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
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pF1KSD     MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
                                     :. .:   ... :....  ..   : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
        10        20        30        40        50        60       

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pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
        ::..     ::: :  ..:   :  ... :  ...  :  :      .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
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pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
             : ::.:  .  : ..:    .. :.. . .. : ::: ..  :  .  ..  : 
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
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pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
        .....   :. : :.     . ::.. .::: :  ::.. :.. .:.: .: :.  :  
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
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pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
       :.:::::: :: :.:::. :: :  ::.::  .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
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pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
       :::: :.::::::  . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
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pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
       .:..:::.:  : .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
           360       370       380       390       400       410   

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pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
       ::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
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pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
       :  :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.:  :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
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pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
       :....:.: ::::::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...: 
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
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pF1KSD THNGNKP                                 
        :.:.::                                 
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
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>>NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
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                   10        20        30        40         50     
pF1KSD     MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
                                     :. .:   ... :....  ..   : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
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pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
        ::..     ::: :  ..:   :  ... :  ...  :  :      .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
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pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
             : ::.:  .  : ..:    .. :.. . .. : ::: ..  :  .  ..  : 
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
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pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
        .....   :. : :.     . ::.. .::: :  ::.. :.. .:.: .: :.  :  
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
           180       190       200       210       220       230   

         230       240       250       260       270       280     
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
       :.:::::: :: :.:::. :: :  ::.::  .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
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pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
       :::: :.::::::  . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
       .:..:::.:  : .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
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pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
       ::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
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pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
       :  :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.:  :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
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pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
       :....:.: ::::::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...: 
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
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pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
        :...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .:: 
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
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pF1KSD THNGNKP                                 
        :.:.::                                 
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
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>>NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
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pF1KSD     MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
                                     :. .:   ... :....  ..   : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
        10        20        30        40        50        60       

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pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
        ::..     ::: :  ..:   :  ... :  ...  :  :      .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
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pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
             : ::.:  .  : ..:    .. :.. . .. : ::: ..  :  .  ..  : 
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
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pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
        .....   :. : :.     . ::.. .::: :  ::.. :.. .:.: .: :.  :  
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
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pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
       :.:::::: :: :.:::. :: :  ::.::  .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
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pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
       :::: :.::::::  . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
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pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
       .:..:::.:  : .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
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pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
       ::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
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pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
       :  :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.:  :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
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pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
       :....:.: ::::::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...: 
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pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
        :...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .:: 
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pF1KSD THNGNKP                                 
        :.:.::                                 
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
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>>NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
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Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)

                   10        20        30        40         50     
pF1KSD     MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
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NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
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pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
        ::..     ::: :  ..:   :  ... :  ...  :  :      .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
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pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
             : ::.:  .  : ..:    .. :.. . .. : ::: ..  :  .  ..  : 
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
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pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
        .....   :. : :.     . ::.. .::: :  ::.. :.. .:.: .: :.  :  
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pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
       .:..:::.:  : .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
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pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
       ::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
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pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
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       :....:.: ::::::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...: 
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        :...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .:: 
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
           600       610       620       630       640       650   

         650                                   
pF1KSD THNGNKP                                 
        :.:.::                                 
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
           660       670       680       690   

>>NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
 initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050  Z-score: 1033.2  bits: 201.5 E(85289): 8.3e-51
Smith-Waterman score: 2055; 47.9% identity (71.4% similar) in 637 aa overlap (27-652:38-660)

                   10        20        30        40         50     
pF1KSD     MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSM-GYQVSKPD
                                     :. .:   ... :....  ..   : .. .
NP_001 HQSCSGEAIGKMQQQGIPGGIFFHCERFDQPIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNN
        10        20        30        40        50        60       

          60             70          80        90       100        
pF1KSD ALSKL-----ERGEEPWTMEDERH--SRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKSVEQYHEHN
        ::..     ::: :  ..:   :  ... :  ...  :  :      .:: . . :.::
NP_001 LLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRL--HNCD-----TILKHTLNSHNHN
        70        80        90       100              110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KSD AFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG
             : ::.:  .  : ..:    .. :.. . .. : ::: ..  :  .  ..  : 
NP_001 ----RNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGAN-SCEHDHYEKHLSHKQAPTH-
                  130       140       150        160       170     

      170       180          190       200       210       220     
pF1KSD NYEELYSAAKFSVSTKAN---STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHER
        .....   :. : :.     . ::.. .::: :  ::.. :.. .:.: .: :.  :  
NP_001 -HQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPS
           180       190       200       210       220       230   

         230       240       250       260       270       280     
pF1KSD VHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTG
       :.:::::: :: :.:::. :: :  ::.::  .: . ::::::.: ..: :..: : :::
NP_001 VYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTG
           240       250       260       270       280       290   

         290       300       310       320       330       340     
pF1KSD EKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPY
       :::: :.::::::  . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::
NP_001 EKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPY
           300       310       320       330       340       350   

         350       360       370       380       390       400     
pF1KSD ICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSE
       .:..:::.:  : .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:
NP_001 VCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTE
           360       370       380       390       400       410   

         410       420       430       440       450       460     
pF1KSD CGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKG
       ::: : ...:: .::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.
NP_001 CGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKA
           420       430       440       450       460       470   

         470       480       490       500       510       520     
pF1KSD FPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFK
       :  :::: .::..: ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.:  :
NP_001 FIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQK
           480       490       500       510       520       530   

         530       540       550       560       570       580     
pF1KSD SNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELA
       :....:.: ::::::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...: 
NP_001 SHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLI
           540       550       560       570       580       590   

         590       600       610       620       630       640     
pF1KSD LHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQR
        :...:: :::: :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .:: 
NP_001 THQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQI
           600       610       620       630       640       650   

         650                                   
pF1KSD THNGNKP                                 
        :.:.::                                 
NP_001 IHTGKKPYACTECQKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
           660       670       680       690   

>>NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (743 aa)
 initn: 3875 init1: 2011 opt: 2050  Z-score: 1033.0  bits: 201.6 E(85289): 8.5e-51
Smith-Waterman score: 2276; 49.4% identity (70.3% similar) in 688 aa overlap (8-652:27-710)

                                  10        20        30        40 
pF1KSD                    MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIY
                                 ...:::::.:. :::: : : :. :: :: :: :
NP_001 MAANGDSPPWSPALAAEGRGSSCEASVSFEDVTVDFSKEEWQHLDPAQRRLYWDVTLENY
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80         90       100
pF1KSD SNLLSMGYQVSKPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENNEVD-DHLQDHLENQRMLKS
       :.:::.:::. : .:  :::.:: :: .: :   . : :.   : :.:... :::  : :
NP_001 SHLLSVGYQIPKSEAAFKLEQGEGPWMLEGEAPHQSCSEELWQDNDQLEQRQENQNNLLS
               70        80        90       100       110       120

                    110       120        130       140       150   
pF1KSD ------VEQYHEHNAFGNTASQTKSLC-LFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEIN
              :. .::. . .    : .:   ... :.   .  .::.:.    :.:..   .
NP_001 HVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLVPSIKRLHNCDTILKHTLNSH----NHNRNSATK
              130       140       150       160           170      

           160       170       180              190       200      
pF1KSD NSTKFSGDGKSFLHGNYEELYSAAKFSVST-------KANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHV
       :  :. :.:..: :.        :: ....       :  : :.  ..::. :  :: .:
NP_001 NLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNENAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYV
        180       190       200       210       220       230      

        210       220                                   230        
pF1KSD CSECGKAFVKKSQLTDHERVH----------------------------TGEKPYGCTLC
       :.::  .:..::.: .:.:.:                            :::::: :: :
NP_001 CTECVMGFTQKSHLFEHQRIHAGEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQC
        240       250       260       270       280       290      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD AKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGF
       .:::. :: :  ::.::  .: . ::::::.: ..: :..: : ::::::: :.::::::
NP_001 GKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGF
        300       310       320       330       340       350      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD PGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKH
         . .: .::..::::: : :.::::.:: :: : .::: :::::::.:..:::.:  : 
NP_001 SQNSDLSIHQKTHTGEKHYECNECGKAFTRKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKS
        360       370       380       390       400       410      

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD YVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIV
       .   ::: ::::::: :..:::.:: ::..  ::: :::::::::.:::: : ...:: .
NP_001 HFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTT
        420       430       440       450       460       470      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD HQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRT
       ::..:: :: :.:.::::.:: .: :: ::.:::::::: :. :::.:  :::: .::..
NP_001 HQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKHQKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKS
        480       490       500       510       520       530      

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD HTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGE
       : ::. :.:..:::.:: .: : .::: :::::::.: ::::.:  ::....:.: ::::
NP_001 HIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIHTGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGE
        540       550       560       570       580       590      

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD KPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYG
       ::. ::.::: :: :  : :::.::: ::  ::.:::..:. ...:  :...:: :::: 
NP_001 KPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYE
        600       610       620       630       640       650      

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD CNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP      
       :..::: :: :::: .::..::::. . ::.: ::: .: .: .::  :.:.::      
NP_001 CGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTEC
        660       670       680       690       700       710      

NP_001 QKAFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD
        720       730       740   




652 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 03:13:22 2016 done: Thu Nov  3 03:13:23 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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