Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0780
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0780, 1047 aa
  1>>>pF1KSDA0780 1047 - 1047 aa - 1047 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3717+/-0.00123; mu= 12.1120+/- 0.073
 mean_var=127.8925+/-24.671, 0's: 0 Z-trim(106.0): 58  B-trim: 198 in 1/52
 Lambda= 0.113410
 statistics sampled from 8677 (8731) to 8677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.268), width:  16
 Scan time:  3.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9          (1056) 6867 1136.0       0
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 813) 5531 917.3       0
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 835) 5531 917.3       0
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19        (1096) 2145 363.4 1.5e-99
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1            (1064) 2041 346.4   2e-94
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11         ( 523) 1734 296.0 1.4e-79
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11       ( 506) 1692 289.1 1.6e-77
CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 151)  992 174.3 1.8e-43
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12         (1690)  458 87.5 2.7e-16
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1379)  444 85.1 1.1e-15
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1559)  444 85.2 1.2e-15
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1560)  444 85.2 1.2e-15
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1570)  444 85.2 1.2e-15
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1482)  440 84.5 1.8e-15
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1539)  440 84.5 1.9e-15
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1544)  434 83.5 3.8e-15
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1580)  434 83.5 3.8e-15
CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3          (1119)  428 82.5 5.7e-15
CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3          (1213)  428 82.5 6.1e-15
CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3           (1214)  428 82.5 6.1e-15
CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3          (1220)  428 82.5 6.1e-15
CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22         (1058)  411 79.7 3.7e-14
CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22         (1189)  411 79.7 4.1e-14
CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX          ( 823)  385 75.4 5.8e-13
CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6         (1205)  379 74.5 1.6e-12
CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5          ( 790)  374 73.6 1.9e-12
CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5         ( 791)  374 73.6 1.9e-12
CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5         ( 834)  374 73.6   2e-12
CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17         (1093)  373 73.5 2.9e-12
CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10         (1027)  369 72.8 4.3e-12
CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10        (1068)  369 72.8 4.4e-12
CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4         ( 509)  350 69.5   2e-11
CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4         ( 830)  350 69.6 3.1e-11
CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4         ( 842)  350 69.6 3.1e-11


>>CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9               (1056 aa)
 initn: 6867 init1: 6867 opt: 6867  Z-score: 6076.3  bits: 1136.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6867; 99.7% identity (99.9% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD AHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD AVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AVTSQTFYEVMFDDGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD NIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFVSAGRCHLGTCQVNSLSSPHVS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:                   
CCDS64 NIAHMYQVEFEDGSQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGER
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040                
pF1KSD QAQQETYLGFWINSKKSQCNIFLSGTY         
                                           
CCDS64 KRQRVLSSRFKNEYVADPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ
             1030      1040      1050      

>>CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9              (813 aa)
 initn: 5531 init1: 5531 opt: 5531  Z-score: 4896.7  bits: 917.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5531; 99.9% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTC
       ::::::::::::::::::::::::::::                                
CCDS55 AVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI                           
              790       800       810                              

>>CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9              (835 aa)
 initn: 5531 init1: 5531 opt: 5531  Z-score: 4896.5  bits: 917.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5531; 99.9% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:23-830)

                                     10        20        30        
pF1KSD                       MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMES
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKHYGLPWKRTEEAAADTALTIMEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMES
               10        20        30        40        50        60

       40        50        60        70        80        90        
pF1KSD KGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKE
               70        80        90       100       110       120

      100       110       120       130       140       150        
pF1KSD FRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTV
              130       140       150       160       170       180

      160       170       180       190       200       210        
pF1KSD LDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHG
              190       200       210       220       230       240

      220       230       240       250       260       270        
pF1KSD KRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYH
              250       260       270       280       290       300

      280       290       300       310       320       330        
pF1KSD AGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGK
              310       320       330       340       350       360

      340       350       360       370       380       390        
pF1KSD DIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGA
              370       380       390       400       410       420

      400       410       420       430       440       450        
pF1KSD EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLST
              430       440       450       460       470       480

      460       470       480       490       500       510        
pF1KSD SVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVA
              490       500       510       520       530       540

      520       530       540       550       560       570        
pF1KSD ESNGVLTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESNGVLTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRP
              550       560       570       580       590       600

      580       590       600       610       620       630        
pF1KSD PARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATV
              610       620       630       640       650       660

      640       650       660       670       680       690        
pF1KSD ARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYSEENI
              670       680       690       700       710       720

      700       710       720       730       740       750        
pF1KSD EYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLC
              730       740       750       760       770       780

      760       770       780       790       800       810        
pF1KSD NLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS55 NLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI     
              790       800       810       820       830          

      820       830       840       850       860       870        
pF1KSD RVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKV

>>CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19             (1096 aa)
 initn: 3845 init1: 2113 opt: 2145  Z-score: 1900.7  bits: 363.4 E(32554): 1.5e-99
Smith-Waterman score: 3832; 55.5% identity (76.4% similar) in 1039 aa overlap (11-1002:10-1043)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
                 :::::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.:::::::::: 
CCDS12  MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
       :::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS12 YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
       ::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::.::.:::  :::::::::::
CCDS12 RKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYF
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS12 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFL
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
       ::::::::: .::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 RHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWID
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
       :::::  :::::::::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.::  ..::...: 
CCDS12 YGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWS
     300       310       320       330       340       350         

               370       380                            390        
pF1KSD QRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGA
         : ... :  :  .  ::  :.:: ..                     .::.. :::  
CCDS12 ASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPE
     360       370       380       390       400       410         

      400          410       420       430       440       450     
pF1KSD EV---PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSC
       :    :.:     . . .:. ..  ::: :.:.::.....  .   :      .. ..  
CCDS12 EEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEA
     420       430        440       450       460       470        

           460       470       480       490       500       510   
pF1KSD L--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPE-
       :   . .   .      :.    .:.  . .   .:      ::.   :     :.  . 
CCDS12 LWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKA
      480       490       500       510       520       530        

                      520       530         540       550          
pF1KSD -------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLEPGEIPAVPSGERNSF-KVPS
              ::... :   ..:   .   : .:  :  .:   .    . .  : .  ..::
CCDS12 AFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPS
      540       550       560       570       580       590        

      560       570       580       590       600       610        
pF1KSD -IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
        ... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: ::::    .: ::.: . ..  .::.
CCDS12 TFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASP-FSGEEDVSDPDAL-RPLL
      600       610       620       630        640       650       

      620        630       640       650       660        670      
pF1KSD HL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND-ARWETKLDEVV
        : :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: .  ....:   :        ..
CCDS12 SLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATL
        660       670       680       690       700       710      

        680         690       700       710       720       730    
pF1KSD TSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
        :..  ::.::::::::  . :: :  : :... .:::: ::.:.:::..::::::::  
CCDS12 PSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRP
        720       730       740       750       760       770      

          740       750       760       770       780       790    
pF1KSD HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
       . . .:: :.::  .::::::::::::::::..: . .: ::.::.::::.:: :: :: 
CCDS12 ELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERH
        780       790       800       810       820       830      

          800       810       820       830       840       850    
pF1KSD QIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
        .:.. :: :: ::::..::.:.:.:::::::::: .: .::::::::::::::::::::
CCDS12 PVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
        840       850       860       870       880       890      

          860       870       880       890       900       910    
pF1KSD YVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFDD
       :::.:::..:: . .. .    ...:.::.::::.::  :: :::....::: ::: :::
CCDS12 YVVSITCLKHKSGGHAVQLL--RAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDD
        900       910         920       930       940       950    

          920       930       940       950       960       970    
pF1KSD GSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDGS
       ::.: . .::.:.::::..::::.:::.:...: ::.:: ::...:  .:.:::::::::
CCDS12 GSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGS
          960       970       980       990      1000      1010    

          980       990       1000      1010      1020      1030   
pF1KSD QIAMKREDIYTLDEELPKRVKARF-VSAGRCHLGTCQVNSLSSPHVSQAQQETYLGFWIN
       :...:: ::.::.:::::::..:. .:.:                               
CCDS12 QLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGR
         1020      1030      1040      1050      1060      1070    

>>CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1                 (1064 aa)
 initn: 3850 init1: 2040 opt: 2041  Z-score: 1808.9  bits: 346.4 E(32554): 2e-94
Smith-Waterman score: 3837; 55.2% identity (77.0% similar) in 1045 aa overlap (4-1001:3-1021)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
          .: :. :::: .:::: :.:::::.:..:.::.::.::::::::::.::::::::  
CCDS49  MASESET-LNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRAS
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
       :::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:::..::: ::::::: ..:.::
CCDS49 YDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELE
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
       :::::::::  ::::::.::..:.. ::::::.:: :.::.::.: ::.:::::::::::
CCDS49 RKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYF
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
       :::::.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::.::::.:.:.:.:::
CCDS49 GMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFL
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
       ::::::::: .::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.
CCDS49 RHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIE
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
       ::: : ::.:::::::::::.:::::::.::.::: :::  .:::: ::    ::.  .:
CCDS49 YGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPT----PEAAEFL
      300       310       320       330       340           350    

              370       380                           390       400
pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEE--------------------EVSDEVDGAEV
       .. .   .:.   .: .   .  .  ::                     :. .::. .:.
CCDS49 KESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSEL
          360       370       380       390       400       410    

               410       420       430       440       450         
pF1KSD -PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTS
        :. :  ... ...:   : . .: :..: ..  ..  .    . ::  ... .   ...
CCDS49 FPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQVEDGLTFP---DYSDSTEVKFEELKNVK
          420       430       440       450          460       470 

     460       470        480                490       500         
pF1KSD VTEDIKTEDDKAYAYR-SVPSIS---------SEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPK
       . :. . :.. : :   ::   :         :.  .:  :..:  .   :. :: :   
CCDS49 LEEEDEEEEQAAAALDLSVNPASVGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETS---
             480       490       500       510       520           

     510       520       530          540       550        560     
pF1KSD SPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNG---LEPGEIPAVPSGERN-SFKVPSIAE---
        : :: . ... ::::      :.:...:   .  ::  .  .:    ::.   .::   
CCDS49 EPLSCRAQGQT-GVLT------VHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAARSFSERELAEVAD
      530        540             550       560       570       580 

                  570       580       590       600       610      
pF1KSD ------GENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKP
              ::: ::. :.:::. : . :..:  :.  ::.:  : :. :::.::::.::::
CCDS49 EYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPLVL--QECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKP
             590       600       610         620       630         

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD LIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVV
       : .:::.. ::: ::.:.: :.:.. ::::.: ... ::. . .. ...     . ....
CCDS49 LSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIFQTYHQVEFGGFNQNC---GNASDLA
     640       650       660       670       680          690      

        680       690         700       710       720       730    
pF1KSD TSEGKTKPLIPEMCFIYS--EENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
        .. .::::::::::  .    .:. : :  .:::::::.:.:: :: :::::::::.: 
CCDS49 PQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTP--YLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPP
        700       710       720         730       740       750    

          740       750       760       770       780       790    
pF1KSD HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
        .  . :.:.::. ::   .::::.::::::.......:.:: ::::. :.::.:. ::.
CCDS49 AKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERS
          760       770       780       790       800       810    

          800       810       820       830       840       850    
pF1KSD QIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
        .::..::: :.:::::::..: ::..: :.:::.::::..:::.::.::::.:.:::::
CCDS49 PVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWP
          820       830       840       850       860       870    

          860       870        880       890       900       910   
pF1KSD YVVNITCFRHKVNPNV-KSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFD
       .:: :::::::. ::. ..:.  . :..:: ::.::.: :.:.:.:. .:..::::: ::
CCDS49 FVVFITCFRHKI-PNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFD
          880        890       900       910       920       930   

           920       930       940       950       960       970   
pF1KSD DGSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDG
       ::::: . .::::::.:::..:::::::::::.: ::..::::. .:.  .:::::::::
CCDS49 DGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDG
           940       950       960       970       980       990   

           980       990      1000      1010      1020      1030   
pF1KSD SQIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFVSAGRCHLGTCQVNSLSSPHVSQAQQETYLGFWIN
       ::...::.:.::::::::::::.:.  :                                
CCDS49 SQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDY
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

>>CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11              (523 aa)
 initn: 1728 init1: 1728 opt: 1734  Z-score: 1542.0  bits: 296.0 E(32554): 1.4e-79
Smith-Waterman score: 1741; 51.2% identity (74.4% similar) in 516 aa overlap (11-511:13-523)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPR
                   ::.:.:: :.:. ::: .:.::.:::::.:::::::::.::::::: :
CCDS83 METMKSKANCAQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKAR
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD QCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYED
       . ::.:...:: .:.::...:..:.::::. .:::::: :.:.:::: :: :: . ..::
CCDS83 ETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYHKKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFED
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD LERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYL
       ::::::::  . .:::::::.::..::.. .::...:.:. :..:.:::. :::::::::
CCDS83 LERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGVVIEGVNTPYL
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDA
       :::::::::::::::::::::::::.::::.::..:::::.::::::. .::.::.:: :
CCDS83 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGA
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KSD FLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRW
       :::::..::::.:::. ::::..:::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::
CCDS83 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
              250       260       270       280       290       300

      300       310       320       330       340        350       
pF1KSD IDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKP-TPAS---TP
       :::::.:. :.: .  : .::: ::: .::.::.:::.:.:  ..:: .: .:::   . 
CCDS83 IDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQPERYDLWKRGQDRAVVDHMEPRVPASQELST
              310       320       330       340       350       360

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD EVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSE
       . .. : ::  .   .   . ::  :  : : .       .  . .:  ..:.    ...
CCDS83 QKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARH-SPWPMAARSGTRCHTLVCSSLPRRSAVSG--TATQ
              370       380        390       400       410         

          420       430       440              450        460      
pF1KSD KSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDH-------IKLSGNS-CLSTSVTEDI--
          :::.  .  .:.   . .   :. .  . .        :: ..   :.: . . .  
CCDS83 PRAAAVHSSKKPSSTPSSTPGPSAQIIHPSNGRRGRGRPPQKLRAQELTLQTPAKRPLLA
       420       430       440       450       460       470       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD -KTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSTGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGV
         :   ..   . .:  ..  :  .::: : ..: :.  :  ::   :            
CCDS83 GTTCTASGPEPEPLPEDGALMDKPVPLSPGLQHPVKA--SGCSWAPVP            
       480       490       500       510         520               

           530       540       550       560       570       580   
pF1KSD LTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSFKVPSIAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSP

>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11            (506 aa)
 initn: 1692 init1: 1692 opt: 1692  Z-score: 1505.1  bits: 289.1 E(32554): 1.6e-77
Smith-Waterman score: 1692; 64.8% identity (86.6% similar) in 352 aa overlap (8-359:7-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
              :: : :  :::: :.:::: .:: :.:::::.:::.::::::::::::: :: 
CCDS44  MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQM
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
       ::::...:: .:.::...::.:.::::. .:::: : ..:.:::: :: :: . .. :::
CCDS44 YDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHQNFADLE
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
       ..:::.     :::::::.::...:.. .::...:.:.::..:.:::. :::::::::::
CCDS44 QRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYF
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::.::..:::::..:::::. .::. :.::.:::
CCDS44 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFL
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
       :::..::::.:::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::::
CCDS44 RHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWID
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
       :::.:. :.: .. : .::: :::  ::. :.:::. .:.  ..::.:  : . :.. : 
CCDS44 YGKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWR
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
                                                                   
CCDS44 DDIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSL
     360       370       380       390       400       410         

>>CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9              (151 aa)
 initn: 992 init1: 992 opt: 992  Z-score: 894.0  bits: 174.3 E(32554): 1.8e-43
Smith-Waterman score: 992; 100.0% identity (100.0% similar) in 145 aa overlap (1-145:1-145)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
       :::::::::::::::::::::::::                                   
CCDS78 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEVHSYLQ                             
              130       140       150                              

>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12              (1690 aa)
 initn: 458 init1: 458 opt: 458  Z-score: 406.1  bits: 87.5 E(32554): 2.7e-16
Smith-Waterman score: 473; 31.5% identity (64.3% similar) in 238 aa overlap (92-303:359-596)

              70        80        90       100          110        
pF1KSD DDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGK---YCTPRYL-DYE
                                     . .:.. : ..:.. :   .  : ..   :
CCDS41 DVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTE
      330       340       350       360       370       380        

       120       130           140                         150     
pF1KSD DLERKYWKNLTFVAPI----YGADINGSIYDEG------------------VDEWNIARL
        .:...:. .. .       :::::... .  :                  .. ::.  .
CCDS41 LVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNM
      390       400       410       420       430       440        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KSD NTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPP
        .. . :  . ...: :...:.:: ::  ..: :: ::   :::::::.::::.::..: 
CCDS41 PVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS
      450       460       470       480       490       500        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KSD EHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPY
       . ...::.. . . :   ..   .:.. .:...:.:: ..:.:  . .: ::::..::: 
CCDS41 HAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPR
      510       520       530       540       550       560        

         280       290       300       310       320       330     
pF1KSD GYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWK
       .::.:::.:.: ::..:: :. :.  :.                                
CCDS41 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLD
      570       580       590       600       610       620        

>>CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1379 aa)
 initn: 442 init1: 442 opt: 444  Z-score: 395.0  bits: 85.1 E(32554): 1.1e-15
Smith-Waterman score: 465; 34.0% identity (64.3% similar) in 238 aa overlap (92-303:323-560)

              70        80        90       100          110        
pF1KSD DDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGK---YCTPRYL-DYE
                                     . .:.. : ..:.: :   .  : ..   :
CCDS55 EIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTE
            300       310       320       330       340       350  

       120       130           140                    150          
pF1KSD DLERKYWKNLTFVAPI----YGADINGSIYDEGV-------------DEWNIARLN-TVL
        .:...:. .. .       :::::... .  :              .:.  .  : .:.
CCDS55 LVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVM
            360       370       380       390       400       410  

     160           170       180       190       200       210     
pF1KSD DVVEEE--CGIS--IEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPP
        :.:.   : :.  : :...:.:: ::  ..: :: ::   :::::::.::::.::..: 
CCDS55 PVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS
            420       430       440       450       460       470  

         220       230       240       250       260       270     
pF1KSD EHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPY
         ...::.. . . :   ..   .:.. .::..:..: ..:.:  . .: ::::.:::: 
CCDS55 LAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPR
            480       490       500       510       520       530  

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pF1KSD GYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWK
       .::.:::.:.: ::..:: :. :.  :.                                
CCDS55 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLD
            540       550       560       570       580       590  




1047 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 03:05:40 2016 done: Thu Nov  3 03:05:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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