Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0696
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0696, 542 aa
  1>>>pF1KSDA0696 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8749+/-0.00133; mu= 9.9940+/- 0.077
 mean_var=137.4051+/-29.987, 0's: 0 Z-trim(104.2): 177  B-trim: 299 in 1/51
 Lambda= 0.109414
 statistics sampled from 7565 (7780) to 7565 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.239), width:  16
 Scan time:  2.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5        ( 542) 3696 596.1 3.5e-170
CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5        ( 529) 3361 543.2 2.9e-154
CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5        ( 508) 3359 542.9 3.5e-154
CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10           ( 569) 3049 494.0  2e-139
CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10           ( 605) 3049 494.0 2.1e-139
CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10          ( 579) 3045 493.3 3.2e-139
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2          ( 415)  434 81.1 2.9e-15
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4         ( 589)  411 77.6 4.7e-14
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 627)  411 77.6 4.9e-14
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 707)  411 77.6 5.4e-14
CCDS75680.1 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7        ( 248)  394 74.6 1.6e-13
CCDS5925.2 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7         ( 376)  394 74.7 2.1e-13
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9           ( 334)  370 70.9 2.7e-12
CCDS3108.1 COPB2 gene_id:9276|Hs108|chr3           ( 906)  369 71.1 6.4e-12
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10           ( 800)  358 69.3 1.9e-11
CCDS11291.1 NLE1 gene_id:54475|Hs108|chr17         ( 485)  348 67.5   4e-11
CCDS45619.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17       ( 752)  348 67.7 5.5e-11
CCDS11199.3 FBXW10 gene_id:10517|Hs108|chr17       (1052)  349 68.0 6.4e-11
CCDS73996.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17       ( 714)  346 67.4 6.6e-11


>>CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5             (542 aa)
 initn: 3696 init1: 3696 opt: 3696  Z-score: 3168.8  bits: 596.1 E(32554): 3.5e-170
Smith-Waterman score: 3696; 100.0% identity (100.0% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-542)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCLQISNGTSSVIVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCLQISNGTSSVIVS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
              490       500       510       520       530       540

         
pF1KSD SR
       ::
CCDS34 SR
         

>>CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5             (529 aa)
 initn: 3441 init1: 3361 opt: 3361  Z-score: 2883.1  bits: 543.2 E(32554): 2.9e-154
Smith-Waterman score: 3408; 94.3% identity (95.8% similar) in 543 aa overlap (1-542:1-529)

               10        20        30        40         50         
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCL-QISNGTSSVIV
       ::::::::::::::: .          ...:..      .  :.   : :::::::::::
CCDS47 MEPDSVIEDKTIELMNT----------SVMEDQNE----DESPKKNTLWQISNGTSSVIV
               10                  20            30        40      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD SRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
         50        60        70        80        90       100      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD ITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWK
        110       120       130       140       150       160      

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GLSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSEN
        170       180       190       200       210       220      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD SKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSD
        230       240       250       260       270       280      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD STVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVL
        290       300       310       320       330       340      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD VGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSG
        350       360       370       380       390       400      

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD SSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAP
        410       420       430       440       450       460      

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD ASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTY
        470       480       490       500       510       520      

     540  
pF1KSD ISR
       :::
CCDS47 ISR
          

>>CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5             (508 aa)
 initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359  Z-score: 2881.6  bits: 542.9 E(32554): 3.5e-154
Smith-Waterman score: 3370; 93.7% identity (93.7% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQSMPSVRCLQISNGTSSVIVS
       :::::::::::::::                                  :::::::::::
CCDS47 MEPDSVIEDKTIELM----------------------------------ISNGTSSVIVS
               10                                          20      

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFI
         30        40        50        60        70        80      

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKG
         90       100       110       120       130       140      

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENS
        150       160       170       180       190       200      

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDS
        210       220       230       240       250       260      

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLV
        270       280       290       300       310       320      

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGS
        330       340       350       360       370       380      

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPA
        390       400       410       420       430       440      

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYI
        450       460       470       480       490       500      

         
pF1KSD SR
       ::
CCDS47 SR
         

>>CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10                (569 aa)
 initn: 2160 init1: 2160 opt: 3049  Z-score: 2616.5  bits: 494.0 E(32554): 2e-139
Smith-Waterman score: 3049; 84.2% identity (93.0% similar) in 530 aa overlap (20-542:41-569)

                          10        20        30            40     
pF1KSD            MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLV---ESMC-ALSCLQSMPSV
                                     :. . .:: :    :..: : . ...   :
CCDS75 KALKFMNSSEREDCNNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCV
               20        30        40        50        60        70

          50        60        70        80        90       100     
pF1KSD RCLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHG
          ...:::::.:: ..:   ..:.:::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS75 AKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHG
               80        90       100       110       120       130

         110       120       130       140       150       160     
pF1KSD HINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWK
       ::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::: :: :.:::::
CCDS75 HINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWK
              140       150       160       170       180       190

         170       180       190         200       210       220   
pF1KSD KLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNW
       :::::::::: ::.::.::::: ::::::.: ::  :::::::.::::::::::::::::
CCDS75 KLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNW
              200       210       220       230       240       250

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD RCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSV
       :::::.::::.::::.:::::::::::.::.::::::.::::::..::: ..::::::::
CCDS75 RCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSV
              260       270       280       290       300       310

           290       300       310       320       330       340   
pF1KSD LCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIA
       ::::::::::.:::::::::::::::::.::::::: ::::::::.::.:::::::::::
CCDS75 LCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIA
              320       330       340       350       360       370

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD VWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHK
       :::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS75 VWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHK
              380       390       400       410       420       430

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
              440       450       460       470       480       490

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD KIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVP
       ::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::  
CCDS75 KIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLN-D
              500       510       520       530       540          

           530        540  
pF1KSD PSAQNET-RSPSRTYTYISR
       :.:: :  ::::::::::::
CCDS75 PAAQAEPPRSPSRTYTYISR
     550       560         

>>CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10                (605 aa)
 initn: 2304 init1: 2160 opt: 3049  Z-score: 2616.2  bits: 494.0 E(32554): 2.1e-139
Smith-Waterman score: 3049; 84.2% identity (93.0% similar) in 530 aa overlap (20-542:77-605)

                          10        20        30            40     
pF1KSD            MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLV---ESMC-ALSCLQSMPSV
                                     :. . .:: :    :..: : . ...   :
CCDS75 ALTAFQNSSEREDCNNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCV
         50        60        70        80        90       100      

          50        60        70        80        90       100     
pF1KSD RCLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHG
          ...:::::.:: ..:   ..:.:::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS75 AKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHG
        110       120       130       140       150       160      

         110       120       130       140       150       160     
pF1KSD HINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWK
       ::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::::::::::: :: :.:::::
CCDS75 HINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWK
        170       180       190       200       210       220      

         170       180       190         200       210       220   
pF1KSD KLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNW
       :::::::::: ::.::.::::: ::::::.: ::  :::::::.::::::::::::::::
CCDS75 KLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNW
        230       240       250       260       270       280      

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD RCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSV
       :::::.::::.::::.:::::::::::.::.::::::.::::::..::: ..::::::::
CCDS75 RCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSV
        290       300       310       320       330       340      

           290       300       310       320       330       340   
pF1KSD LCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIA
       ::::::::::.:::::::::::::::::.::::::: ::::::::.::.:::::::::::
CCDS75 LCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIA
        350       360       370       380       390       400      

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD VWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHK
       :::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS75 VWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHK
        410       420       430       440       450       460      

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDG
        470       480       490       500       510       520      

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD KIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVP
       ::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::  
CCDS75 KIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLN-D
        530       540       550       560       570       580      

           530        540  
pF1KSD PSAQNET-RSPSRTYTYISR
       :.:: :  ::::::::::::
CCDS75 PAAQAEPPRSPSRTYTYISR
         590       600     

>>CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10               (579 aa)
 initn: 2304 init1: 2160 opt: 3045  Z-score: 2613.0  bits: 493.3 E(32554): 3.2e-139
Smith-Waterman score: 3114; 80.0% identity (89.6% similar) in 575 aa overlap (5-542:6-579)

                10        20        30                             
pF1KSD  MEPDSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESM----------------------CALS
            .:...:....:::.::::::::..:..::                      ::  
CCDS73 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQTYNSCARL
               10        20        30        40        50        60

        40                    50        60        70        80     
pF1KSD CLQ---------SMPSVRCL---QISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSE
       ::.         .: .  :.   ...:::::.:: ..:   ..:.:::.::.:::.::::
CCDS73 CLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSE
               70        80        90       100       110       120

          90       100       110       120       130       140     
pF1KSD SDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLC
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.:::
CCDS73 SDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLC
              130       140       150       160       170       180

         150       160       170       180       190         200   
pF1KSD AAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNS
       ::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: ::::::.: ::  ::::
CCDS73 AAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNS
              190       200       210       220       230       240

           210       220       230       240       250       260   
pF1KSD FYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIK
       :::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.:::::::::::.::.::::::.::
CCDS73 FYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIK
              250       260       270       280       290       300

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD IWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAV
       ::::..::: ..::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::: :::
CCDS73 IWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAV
              310       320       330       340       350       360

           330       340       350       360       370       380   
pF1KSD LHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDR
       :::::.::.::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDR
              370       380       390       400       410       420

           390       400       410       420       430       440   
pF1KSD TIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHE
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHE
              430       440       450       460       470       480

           450       460       470       480       490       500   
pF1KSD ELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEF
       ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEF
              490       500       510       520       530       540

           510       520       530        540  
pF1KSD QIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNET-RSPSRTYTYISR
       ::.:::::::::::::::  :.:: :  ::::::::::::
CCDS73 QIVSSSHDDTILIWDFLN-DPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
              550        560       570         

>>CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2               (415 aa)
 initn: 407 init1: 124 opt: 434  Z-score: 387.5  bits: 81.1 E(32554): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 504; 29.2% identity (64.9% similar) in 291 aa overlap (243-517:137-414)

            220       230       240       250          260         
pF1KSD IQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDD---EKIISGLRDNSIKIWDKTS
                                     :: . ...   .:: .:  :.. :.:.  .
CCDS24 FITGSYDRTCKLWDTASGEELNTLEGHRNVVYAIAFNNPYGDKIATGSFDKTCKLWSVET
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KSD LECLKVLTGHTGSVLCLQYDER--VIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLR
        .: ... :::. ..::... .  ...::: :.:...::...:: . ::  :.  .. : 
CCDS24 GKCYHTFRGHTAEIVCLSFNPQSTLVATGSMDTTAKLWDIQNGEEVYTLRGHSAEIISLS
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pF1KSD F--SNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDF--DDKYIVSASGDR
       :  :.  ..: : :....:::  ..  ..   .:.:: : .. ..:  : . :...: :.
CCDS24 FNTSGDRIITGSFDHTVVVWDADTGRKVN---ILIGHCAEISSASFNWDCSLILTGSMDK
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pF1KSD TIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGI--ACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEG
       : :.:.... . : ::.::   :  .:..:  .:....:.:.: :...     :.  :::
CCDS24 TCKLWDATNGKCVATLTGHDDEILDSCFDYTGKLIATASADGTARIFSAATRKCIAKLEG
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pF1KSD HEELVRCIRFDNK--RIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQ
       ::  .  : :. .  ....:. :   ..:: :..          ::..:  :. ..:   
CCDS24 HEGEISKISFNPQGNHLLTGSSDKTARIWDAQTG---------QCLQVLEGHTDEIFSCA
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pF1KSD FDEFQ---IISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR
       :. ..   .:..:.:.:  ::                         
CCDS24 FN-YKGNIVITGSKDNTCRIWR                        
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>>CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4              (589 aa)
 initn: 1010 init1: 411 opt: 411  Z-score: 365.8  bits: 77.6 E(32554): 4.7e-14
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CCDS34 TFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSCEPTQVKH
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       . . ..:..:::::. ::..    .:  .::.:. ..:  :  .:. : :...:  :   
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CCDS34 ----------LWREKCKEEGIDEPLHIKRRKVIKP--GFIHSPWKSAYIRQHRIDTNWRR
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        :. . .:..::.: :..::...::: ..::  :. .:  ... .  .:. :.: .. ::
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CCDS34 VYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTV
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       :.::....          ::.::    .:.. :  :::..  .:.:: : :. .::.   
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>>CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4               (627 aa)
 initn: 1010 init1: 411 opt: 411  Z-score: 365.5  bits: 77.6 E(32554): 4.9e-14
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CCDS37 MMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYW-RILAEDNL---
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pF1KSD LIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL-FKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRC
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CCDS37 ----------LWREKCKEEGIDEPLHIKRRKVIKP--GFIHSPWKSAYIRQHRIDTNWRR
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pF1KSD GRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLC
       :. .  ..  ...... . :::.  ..:.::  ::..:.:. .. .::..:.::::.:  
CCDS37 GELKSPKVL-KGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLVGHTGGVWS
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pF1KSD LQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVW
        :. . .:..::.: :..::...::: ..::  :. .:  ... .  .:. :.: .. ::
CCDS37 SQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGSRDATLRVW
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pF1KSD DMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRG
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CCDS37 DIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLHTLQGHTNR
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pF1KSD IACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKI
       .  ::.    ::::: :..::.::.: : :...: ::. :.  ... .. .:::  :. .
CCDS37 VYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTV
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pF1KSD KVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNV
       :.::....          ::.::    .:.. :  :::..  .:.:: : :. .::.   
CCDS37 KIWDIKTGQ---------CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTG
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pF1KSD PPSAQNETRSPSRTYTYISR                                 
                                                            
CCDS37 EFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDVDMK
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>>CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4               (707 aa)
 initn: 1010 init1: 411 opt: 411  Z-score: 364.8  bits: 77.6 E(32554): 5.4e-14
Smith-Waterman score: 848; 32.0% identity (64.9% similar) in 447 aa overlap (77-519:238-651)

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CCDS37 TFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSCEPTQVKH
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pF1KSD INSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKK
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CCDS37 MMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYW-RILAEDNL---
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pF1KSD LIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL-FKNRPTDGPPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRC
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CCDS37 ----------LWREKCKEEGIDEPLHIKRRKVIKP--GFIHSPWKSAYIRQHRIDTNWRR
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pF1KSD GRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLC
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CCDS37 GELKSPKVL-KGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLVGHTGGVWS
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pF1KSD LQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVW
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CCDS37 SQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGSRDATLRVW
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pF1KSD DMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRG
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       .  ::.    ::::: :..::.::.: : :...: ::. :.  ... .. .:::  :. .
CCDS37 VYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILVSGNADSTV
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       :.::....          ::.::    .:.. :  :::..  .:.:: : :. .::.   
CCDS37 KIWDIKTGQ---------CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTVKLWDLKTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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