seq1 = pF1KSDA0688.tfa, 2511 bp seq2 = pF1KSDA0688/gi568815597r_161091141.tfa (gi568815597r:161091141_161298627), 207487 bp >pF1KSDA0688 2511 >gi568815597r:161091141_161298627 (Chr1) (complement) 1-633 (100001-100633) 99% -> 634-957 (101748-102071) 100% -> 958-1090 (102325-102457) 100% -> 1091-1261 (102993-103163) 100% -> 1262-1548 (104407-104693) 100% -> 1549-1735 (104802-104988) 100% -> 1736-1911 (105240-105415) 99% -> 1912-2087 (106388-106563) 100% -> 2088-2511 (107064-107487) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCCCAGACAGGCTCGCATCCCGGGAGGGGCTTGGCAGGGCGCTGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCCCAGACAGGCTCGCATCCCGGGAGGGGCTTGGCAGGGCGCTGGCT 50 . : . : . : . : . : 51 GTGGGGAGCCCAACCCTGCCTCCTGCTCCCCATTGTGCCGCTCTCCTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GTGGGGAGCCCAACCCTGCCTCCTGCTCCCCATTGTGCCGCTCTCCTGGC 100 . : . : . : . : . : 101 TGGTGTGGCTGCTTCTGCTACTGCTGGCCTCTCTCCTGCCCTCAGCCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGGTGTGGCTGCTTCTGCTACTGCTGGCCTCTCTCCTGCCCTCAGCCCGG 150 . : . : . : . : . : 151 CTGGCCAGCCCCCTCCCCCGGGAGGAGGAGATCGTGTTTCCAGAGAAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CTGGCCAGCCCCCTCCCCCGGGAGGAGGAGATCGTGTTTCCAGAGAAGCT 200 . : . : . : . : . : 201 CAACGGCAGCGTCCTGCCTGGCTCGGGCACCCCTGCCAGGCTGTTGTGCC |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| 100201 CAACGGCAGCGTCCTGCCTGGCTCGGGCGCCCCTGCCAGGCTGTTGTGCC 250 . : . : . : . : . : 251 GCTTGCAGGCCTTTGGGGAGACGCTGCTACTAGAGCTGGAGCAGGACTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 GCTTGCAGGCCTTTGGGGAGACGCTGCTACTAGAGCTGGAGCAGGACTCC 300 . : . : . : . : . : 301 GGTGTGCAGGTCGAGGGGCTGACAGTGCAGTACCTGGGCCAGGCGCCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 GGTGTGCAGGTCGAGGGGCTGACAGTGCAGTACCTGGGCCAGGCGCCTGA 350 . : . : . : . : . : 351 GCTGCTGGGTGGAGCAGAGCCTGGCACCTACCTGACTGGCACCATCAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 GCTGCTGGGTGGAGCAGAGCCTGGCACCTACCTGACTGGCACCATCAATG 400 . : . : . : . : . : 401 GAGATCCGGAGTCGGTGGCATCTCTGCACTGGGATGGGGGAGCCCTGTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 GAGATCCGGAGTCGGTGGCATCTCTGCACTGGGATGGGGGAGCCCTGTTA 450 . : . : . : . : . : 451 GGCGTGTTACAATATCGGGGGGCTGAACTCCACCTCCAGCCCCTGGAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100451 GGCGTGTTACAATATCGGGGGGCTGAACTCCACCTCCAGCCCCTGGAGGG 500 . : . : . : . : . : 501 AGGCACCCCTAACTCTGCTGGGGGACCTGGGGCTCACATCCTACGCCGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100501 AGGCACCCCTAACTCTGCTGGGGGACCTGGGGCTCACATCCTACGCCGGA 550 . : . : . : . : . : 551 AGAGTCCTGCCAGCGGTCAAGGTCCCATGTGCAACGTCAAGGCTCCTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100551 AGAGTCCTGCCAGCGGTCAAGGTCCCATGTGCAACGTCAAGGCTCCTCTT 600 . : . : . : . : . : 601 GGAAGCCCCAGCCCCAGACCCCGAAGAGCCAAG CGCTTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 100601 GGAAGCCCCAGCCCCAGACCCCGAAGAGCCAAGGTA...CAGCGCTTTGC 650 . : . : . : . : . : 642 TTCACTGAGTAGATTTGTGGAGACACTGGTGGTGGCAGATGACAAGATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101756 TTCACTGAGTAGATTTGTGGAGACACTGGTGGTGGCAGATGACAAGATGG 700 . : . : . : . : . : 692 CCGCATTCCACGGTGCGGGGCTAAAGCGCTACCTGCTAACAGTGATGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101806 CCGCATTCCACGGTGCGGGGCTAAAGCGCTACCTGCTAACAGTGATGGCA 750 . : . : . : . : . : 742 GCAGCAGCCAAGGCCTTCAAGCACCCAAGCATCCGCAATCCTGTCAGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101856 GCAGCAGCCAAGGCCTTCAAGCACCCAAGCATCCGCAATCCTGTCAGCTT 800 . : . : . : . : . : 792 GGTGGTGACTCGGCTAGTGATCCTGGGGTCAGGCGAGGAGGGGCCCCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101906 GGTGGTGACTCGGCTAGTGATCCTGGGGTCAGGCGAGGAGGGGCCCCAAG 850 . : . : . : . : . : 842 TGGGGCCCAGTGCTGCCCAGACCCTGCGCAGCTTCTGTGCCTGGCAGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101956 TGGGGCCCAGTGCTGCCCAGACCCTGCGCAGCTTCTGTGCCTGGCAGCGG 900 . : . : . : . : . : 892 GGCCTCAACACCCCTGAGGACTCGGACCCTGACCACTTTGACACAGCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102006 GGCCTCAACACCCCTGAGGACTCGGACCCTGACCACTTTGACACAGCCAT 950 . : . : . : . : . : 942 TCTGTTTACCCGTCAG GACCTGTGTGGAGTCTCCACTTGCG ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 102056 TCTGTTTACCCGTCAGGTG...CAGGACCTGTGTGGAGTCTCCACTTGCG 1000 . : . : . : . : . : 983 ACACGCTGGGTATGGCTGATGTGGGCACCGTCTGTGACCCGGCTCGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102350 ACACGCTGGGTATGGCTGATGTGGGCACCGTCTGTGACCCGGCTCGGAGC 1050 . : . : . : . : . : 1033 TGTGCCATTGTGGAGGATGATGGGCTCCAGTCAGCCTTCACTGCTGCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102400 TGTGCCATTGTGGAGGATGATGGGCTCCAGTCAGCCTTCACTGCTGCTCA 1100 . : . : . : . : . : 1083 TGAACTGG GTCATGTCTTCAACATGCTCCATGACAACTCCA ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 102450 TGAACTGGGTA...CAGGTCATGTCTTCAACATGCTCCATGACAACTCCA 1150 . : . : . : . : . : 1124 AGCCATGCATCAGTTTGAATGGGCCTTTGAGCACCTCTCGCCATGTCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103026 AGCCATGCATCAGTTTGAATGGGCCTTTGAGCACCTCTCGCCATGTCATG 1200 . : . : . : . : . : 1174 GCCCCTGTGATGGCTCATGTGGATCCTGAGGAGCCCTGGTCCCCCTGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103076 GCCCCTGTGATGGCTCATGTGGATCCTGAGGAGCCCTGGTCCCCCTGCAG 1250 . : . : . : . : . : 1224 TGCCCGCTTCATCACTGACTTCCTGGACAATGGCTATG GGC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 103126 TGCCCGCTTCATCACTGACTTCCTGGACAATGGCTATGGTA...CAGGGC 1300 . : . : . : . : . : 1265 ACTGTCTCTTAGACAAACCAGAGGCTCCATTGCATCTGCCTGTGACTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104410 ACTGTCTCTTAGACAAACCAGAGGCTCCATTGCATCTGCCTGTGACTTTC 1350 . : . : . : . : . : 1315 CCTGGCAAGGACTATGATGCTGACCGCCAGTGCCAGCTGACCTTCGGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104460 CCTGGCAAGGACTATGATGCTGACCGCCAGTGCCAGCTGACCTTCGGGCC 1400 . : . : . : . : . : 1365 CGACTCACGCCATTGTCCACAGCTGCCGCCGCCCTGTGCTGCCCTCTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104510 CGACTCACGCCATTGTCCACAGCTGCCGCCGCCCTGTGCTGCCCTCTGGT 1450 . : . : . : . : . : 1415 GCTCTGGCCACCTCAATGGCCATGCCATGTGCCAGACCAAACACTCGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104560 GCTCTGGCCACCTCAATGGCCATGCCATGTGCCAGACCAAACACTCGCCC 1500 . : . : . : . : . : 1465 TGGGCCGATGGCACACCCTGCGGGCCCGCACAGGCCTGCATGGGTGGTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104610 TGGGCCGATGGCACACCCTGCGGGCCCGCACAGGCCTGCATGGGTGGTCG 1550 . : . : . : . : . : 1515 CTGCCTCCACATGGACCAGCTCCAGGACTTCAAT ATTCCAC ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 104660 CTGCCTCCACATGGACCAGCTCCAGGACTTCAATGTG...CAGATTCCAC 1600 . : . : . : . : . : 1556 AGGCTGGTGGCTGGGGTCCTTGGGGACCATGGGGTGACTGCTCTCGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104809 AGGCTGGTGGCTGGGGTCCTTGGGGACCATGGGGTGACTGCTCTCGGACC 1650 . : . : . : . : . : 1606 TGTGGGGGTGGTGTCCAGTTCTCCTCCCGAGACTGCACGAGGCCTGTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104859 TGTGGGGGTGGTGTCCAGTTCTCCTCCCGAGACTGCACGAGGCCTGTCCC 1700 . : . : . : . : . : 1656 CCGGAATGGTGGCAAGTACTGTGAGGGCCGCCGTACCCGCTTCCGCTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104909 CCGGAATGGTGGCAAGTACTGTGAGGGCCGCCGTACCCGCTTCCGCTCCT 1750 . : . : . : . : . : 1706 GCAACACTGAGGACTGCCCAACTGGCTCAG CCCTGACCTTC ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 104959 GCAACACTGAGGACTGCCCAACTGGCTCAGGTG...CAGCCCTGACCTTC 1800 . : . : . : . : . : 1747 CGCGAGGAGCAGTGTGCTGCCTACAACCACCGCACCGACCTCTTCAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105251 CGCGAGGAGCAGTGTGCTGCCTACAACCACCGCACCGACCTCTTCAAGAG 1850 . : . : . : . : . : 1797 CTTCCCAGGGCCCATGGACTGGGTTCCTCGCTACACAGGCGTGGCCCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105301 CTTCCCAGGGCCCATGGACTGGGTTCCTCGCTACACAGGCGTGGCCCCCC 1900 . : . : . : . : . : 1847 AGGACCAGTGCAAACTCACCTGCCAGGCCCGGGCACTGGGCTACTACTAT |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| 105351 AGGACCAGTGCAAACTCACCTGCCAGGCCCAGGCACTGGGCTACTACTAT 1950 . : . : . : . : . : 1897 GTGCTGGAGCCACGG GTGGTAGATGGGACCCCCTGTTCCCC |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 105401 GTGCTGGAGCCACGGGTG...CAGGTGGTAGATGGGACCCCCTGTTCCCC 2000 . : . : . : . : . : 1938 GGACAGCTCCTCGGTCTGTGTCCAGGGCCGATGCATCCATGCTGGCTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106414 GGACAGCTCCTCGGTCTGTGTCCAGGGCCGATGCATCCATGCTGGCTGTG 2050 . : . : . : . : . : 1988 ATCGCATCATTGGCTCCAAGAAGAAGTTTGACAAGTGCATGGTGTGCGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106464 ATCGCATCATTGGCTCCAAGAAGAAGTTTGACAAGTGCATGGTGTGCGGA 2100 . : . : . : . : . : 2038 GGGGACGGTTCTGGTTGCAGCAAGCAGTCAGGCTCCTTCAGGAAATTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106514 GGGGACGGTTCTGGTTGCAGCAAGCAGTCAGGCTCCTTCAGGAAATTCAG 2150 . : . : . : . : . : 2088 GTACGGATACAACAATGTGGTCACTATCCCCGCGGGGGCCA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106564 GTT...CAGGTACGGATACAACAATGTGGTCACTATCCCCGCGGGGGCCA 2200 . : . : . : . : . : 2129 CCCACATTCTTGTCCGGCAGCAGGGAAACCCTGGCCACCGGAGCATCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107105 CCCACATTCTTGTCCGGCAGCAGGGAAACCCTGGCCACCGGAGCATCTAC 2250 . : . : . : . : . : 2179 TTGGCCCTGAAGCTGCCAGATGGCTCCTATGCCCTCAATGGTGAATACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107155 TTGGCCCTGAAGCTGCCAGATGGCTCCTATGCCCTCAATGGTGAATACAC 2300 . : . : . : . : . : 2229 GCTGATGCCCTCCCCCACAGATGTGGTACTGCCTGGGGCAGTCAGCTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107205 GCTGATGCCCTCCCCCACAGATGTGGTACTGCCTGGGGCAGTCAGCTTGC 2350 . : . : . : . : . : 2279 GCTACAGCGGGGCCACTGCAGCCTCAGAGACACTGTCAGGCCATGGGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107255 GCTACAGCGGGGCCACTGCAGCCTCAGAGACACTGTCAGGCCATGGGCCA 2400 . : . : . : . : . : 2329 CTGGCCCAGCCTTTGACACTGCAAGTCCTAGTGGCTGGCAACCCCCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107305 CTGGCCCAGCCTTTGACACTGCAAGTCCTAGTGGCTGGCAACCCCCAGGA 2450 . : . : . : . : . : 2379 CACACGCCTCCGATACAGCTTCTTCGTGCCCCGGCCGACCCCTTCAACGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107355 CACACGCCTCCGATACAGCTTCTTCGTGCCCCGGCCGACCCCTTCAACGC 2500 . : . : . : . : . : 2429 CACGCCCCACTCCCCAGGACTGGCTGCACCGAAGAGCACAGATTCTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107405 CACGCCCCACTCCCCAGGACTGGCTGCACCGAAGAGCACAGATTCTGGAG 2550 . : . : . : 2479 ATCCTTCGGCGGCGCCCCTGGGCGGGCAGGAAA ||||||||||||||||||||||||||||||||| 107455 ATCCTTCGGCGGCGCCCCTGGGCGGGCAGGAAA