Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0685
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0685, 927 aa
1>>>pF1KSDA0685 927 - 927 aa - 927 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9366+/-0.000914; mu= 10.6247+/- 0.055
mean_var=175.7594+/-35.504, 0's: 0 Z-trim(111.7): 18 B-trim: 143 in 1/52
Lambda= 0.096742
statistics sampled from 12597 (12612) to 12597 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16
Scan time: 4.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS56236.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 927) 6230 882.4 0
CCDS33681.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 932) 6150 871.2 0
CCDS56235.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 933) 6138 869.5 0
CCDS74881.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 959) 3658 523.4 7.9e-148
CCDS53673.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 867) 1960 286.4 1.6e-76
CCDS53671.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 879) 1790 262.7 2.2e-69
CCDS53672.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 873) 1777 260.9 7.8e-69
CCDS53674.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 844) 1685 248.0 5.6e-65
CCDS53675.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 791) 1391 207.0 1.2e-52
CCDS8182.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 793) 1391 207.0 1.2e-52
CCDS46186.1 PPP6R1 gene_id:22870|Hs108|chr19 ( 881) 1217 182.7 2.7e-45
>>CCDS56236.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 (927 aa)
initn: 6230 init1: 6230 opt: 6230 Z-score: 4707.7 bits: 882.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6230; 100.0% identity (100.0% similar) in 927 aa overlap (1-927:1-927)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
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CCDS56 MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD INQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 INQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFSDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFSDYQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWTAVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWTAVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCADS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMA
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KSD VTAAPAMVATLGTVTKDGQMPRQKELP
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VTAAPAMVATLGTVTKDGQMPRQKELP
910 920
>>CCDS33681.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 (932 aa)
initn: 6148 init1: 4577 opt: 6150 Z-score: 4647.4 bits: 871.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6150; 99.8% identity (99.9% similar) in 919 aa overlap (1-919:1-918)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD INQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 INQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFSDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFSDYQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWTAVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAP
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSE-GAMWTAVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAP
670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTR
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCADS
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMA
840 850 860 870 880 890
910 920
pF1KSD VTAAPAMVATLGTVTKDGQMPRQKELP
::::::::::::::::::.
CCDS33 VTAAPAMVATLGTVTKDGKTDAPPEGAALNGPV
900 910 920 930
>>CCDS56235.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 (933 aa)
initn: 5803 init1: 2963 opt: 6138 Z-score: 4638.3 bits: 869.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6138; 99.7% identity (99.8% similar) in 920 aa overlap (1-919:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD ALES-QDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYA
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ALESRQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VSSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VSSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SINQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SINQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD PHENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PHENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LTRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFSDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LTRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFSDY
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD IQPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IQPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRD
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD APGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWTAVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSA
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 APGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSE-GAMWTAVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSA
670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD PEEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PEEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVT
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD RKAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RKAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCAD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SRLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SRLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIM
840 850 860 870 880 890
900 910 920
pF1KSD AVTAAPAMVATLGTVTKDGQMPRQKELP
:::::::::::::::::::.
CCDS56 AVTAAPAMVATLGTVTKDGKTDAPPEGAALNGPV
900 910 920 930
>>CCDS74881.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 (959 aa)
initn: 5136 init1: 3533 opt: 3658 Z-score: 2767.5 bits: 523.4 E(32554): 7.9e-148
Smith-Waterman score: 6086; 96.9% identity (97.0% similar) in 946 aa overlap (1-919:1-945)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSYAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD INQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 INQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD TRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDL------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLVSTHHL
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540 550 560 570
pF1KSD ---------------------AFSDYQIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HSSSEDEDIEGAFPNELSLQQAFSDYQIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRI
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580 590 600 610 620 630
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRIQPFDDDEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPH
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640 650 660 670 680 690
pF1KSD ASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDAPGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWTAVFDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS74 ASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDAPGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSE-GAMWTAVFDE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAPEEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSH
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760 770 780 790 800 810
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTRKAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVSR
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pF1KSD GPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCADSRLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GPGREAPPLPTVARTEEAVGRVGCADSRLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATVAITTAL
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880 890 900 910 920
pF1KSD SKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMAVTAAPAMVATLGTVTKDGQMPRQKELP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS74 SKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMAVTAAPAMVATLGTVTKDGKTDAPPEGAALNGPV
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:::::::...::.: ::..: :::.:::::.:.::::::::.::..:: . .:.:.:::.
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: ..:: ::.::.:.:::: .::::: :: :..:::: ::::: ::.:: .. ::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
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pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::... ::.:: ::.. ::::: :..:..:::::::.:::::::..:.:: ::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
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pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
:::.::::::.::::::..::::.:::.:::::.::.::::.::: :.:.. ::::::.
CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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pF1KSD ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSY-A
.::.:. .::::.:.: ...:: .::. :.::::::::: :: .. :. .: .
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
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pF1KSD VSSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTP
:..:::..:. :: .::.:::.::::... :: :::. :.::.::. ::...::.:::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD SINQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEP
::: .: .::.. ..:..::::::::::: :::.::: ::.
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILAS------------------
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: :: . . : : : :: .. :::::: :..::::::: :.. :: :: :.: :::
CCDS53 PFENTENATITDQD--STGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGH
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pF1KSD LTRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDLAFS--
:::::: .:.. ..:: .. ....:. :: . : :::.: .: :::.::::::. .
CCDS53 LTRIANCIVHSTDKGPNSALVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCH
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pF1KSD ---------DY------------QIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPFDRIAEI
:. :.::::.::.::::::::.:::::: :. :::...:
CCDS53 IHSSSDDEIDFKETGFSQDSSLQQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDI
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pF1KSD NFNIDADEDSPSAALFEACCSDRIQPFDD--DEDEDIWEDSDTRCAARVMARPRFGAPHA
::.....: : . :::::::..::: ::: ...:::::.. . . . : :. .
CCDS53 NFTLNTNE-SGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDS
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pF1KSD SESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDAPGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWTAVFDEP
:: ... .:: :..: :. .. : .: : :.: :: :
CCDS53 EESTDSEE-----EDG-----AKQDL----FEPSSANTE-DKMEVDLSEPPNWSANFDVP
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pF1KSD ANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAP-EEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPVDTECSH
..: :: . .:::.::.. : .: :::.:..: .... : .:::. : :
CCDS53 METTHGAP--LDSVGSDVWSTEEPMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETS-
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pF1KSD AEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTRKAP-LLASDSSSSGGSHSEDGDQKAASAMDAVS
. ..: .: : . : .: .: ..::.: .:. :. . ..:.
CCDS53 ---------TEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGEEDAESTDKVTETVMN---
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pF1KSD RGPGREAPPLPTVARTEEAV-----GRVGCADSRLLSPACPAPKEVTAAPAVAVPPEATV
: .:. : . :.:: :: :... ... . : :. . : :. :: ..
CCDS53 -GGMKETLSLTVDAKTETAVFKSEEGKLSTSQDAACKDAEECPETAEAKCAAPRPPSSSP
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pF1KSD AITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMAVTAAPAMVATLGTVTKDGQMPRQKELP
CCDS53 EQRTGQPSAPGDTSVNGPV
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pF1KSD MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
:::::::...::.: ::..: :::.:::::.:.::::::::.::..:: . .:.:.:::.
CCDS53 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
: ..:: ::.::.:.:::: .::::: :: :..:::: ::::: ::.:: .. ::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
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pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::... ::.:: ::.. ::::: :..:..:::::::.:::::::..:.:: ::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
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pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
:::.::::::.::::::..::::.:::.:::::.::.::::.::: :.:.. ::::::.
CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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pF1KSD ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSY-A
.::.:. .::::.:.: ...:: .::. :.::::::::: :: .. :. .: .
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
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pF1KSD VSSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTP
:..:::..:. :: .::.:::.::::... :: :::. :.::.::. ::...::.:::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD SINQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEP
::: .: .::.. ..:..::::::::::: :::.::: ::.
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILAS------------------
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pF1KSD PHENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGH
: :: . . : : : :: .. :::::: :..::::::: :.. :: :: :.: :::
CCDS53 PFENTENATITDQD--STGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGH
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD LTRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDL-----
:::::: .:.. ..:: .. ....:. :: . : :::.: .: :::.::::::
CCDS53 LTRIANCIVHSTDKGPNSALVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCH
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD ------------------------AFSDYQIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPF
::::::.::::.::.::::::::.:::::: :. :
CCDS53 IHSSSDDEIDFKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSF
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580 590 600 610 620
pF1KSD DRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRIQPFDD--DEDEDIWEDSDTRCAARVMARPR
::...:::.....: : . :::::::..::: ::: ...:::::.. . . . :
CCDS53 DRVSDINFTLNTNE-SGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSS
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pF1KSD FGAPHASESCSKNGPERGGQDGKASLEAHRDAPGAGAPPAPGKKEAPPVEGDSEAGAMWT
:. . :: ... .:: :..: :. .. : .: : :.
CCDS53 SGSTDSEESTDSEE-----EDG-----AKQDL----FEPSSANTE-DKMEVDLSEPPNWS
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pF1KSD AVFDEPANSTPTAPGVVRDVGSSVWAAGTSAP-EEKGWAKFTDFQPFCCSESGPRCSSPV
: :: : ..: :: . .:::.::.. : .: :::.:..: .... : .:::
CCDS53 ANFDVPMETTHGAP--LDSVGSDVWSTEEPMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPV
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pF1KSD DTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVTRKAP-LLASDSSSSGGSHSEDGDQKAAS
. : : . ..: .: : . : .: .: ..::.: .:. :. . .
CCDS53 EMETS----------TEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGEEDAESTDKVTET
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pF1KSD AMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAV-----------GRVGCADSRLLSPACPAPKEVTA
.:. : .:. : . :.:: :: :... ... . : :. . :
CCDS53 VMN----GGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAEECPETAEA
800 810 820 830 840
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pF1KSD APAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMAVTAAPAMVATLGTVT
:. :: ..
CCDS53 KCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
850 860 870
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
:::::::...::.: ::..: :::.:::::.:.::::::::.::..:: . .:.:.:::.
CCDS53 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
: ..:: ::.::.:.:::: .::::: :: :..:::: ::::: ::.:: .. ::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
::::::... ::.:: ::.. ::::: :..:..:::::::.:::::::..:.:: ::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
:::.::::::.::::::..::::.:::.:::::.::.::::.::: :.:.. ::::::.
CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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pF1KSD ALESQDCVEQLLKNMFDGDRTESCLVSGTQVLLTLLETRRVGTEGLVDSFSQGLERSY-A
.::.:. .::::.:.: ...:: .::. :.::::::::: :: .. :. .: .
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
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pF1KSD VSSSVLHGIEPRLKDFHQLLLNPPKKKAILTTIGVLEEPLGNARLHGARLMAALLHTNTP
:..:::..:. :: .::.:::.::::... :: :::. :.::.::. ::...::.:::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SINQELCRLNTMDLLLDLFFKYTWNNFLHFQVELCIAAILSHAAREERTEASGSESRVEP
::: .: .::.. ..:..::::::::::: :::.::: ::.
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILAS------------------
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pF1KSD PHENGNRSLETPQPAASLPDNTMVTHLFQKCCLVQRILEAWEANDHTQAAGGMRRGNMGH
: :: . . : : : :: .. :::::: :..::::::: :.. :: :: :.: :::
CCDS53 PFENTENATITDQD--STGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGH
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pF1KSD LTRIANAVVQNLERGPVQTHISEVIRGLPADCRGRWESFVEETLTETNRRNTVDL-----
:::::: .:.. ..:: .. ....:. :: . : :::.: .: :::.::::::
CCDS53 LTRIANCIVHSTDKGPNSALVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCH
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD ------------------------AFSDYQIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPF
::::::.::::.::.::::::::.:::::: :. :
CCDS53 IHSSSDDEIDFKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSF
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD DRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRIQPFDD--DEDEDIWEDSDTRCAARVMARPR
::...:::.....: : . :::::::..::: ::: ...:::::.. . . . :
CCDS53 DRVSDINFTLNTNE-SGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSS
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:40:39 2016 done: Thu Nov 3 02:40:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]