Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0680, 634 aa
  1>>>pF1KSDA0680 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9378+/-0.00104; mu= -18.8288+/- 0.063
 mean_var=421.0322+/-85.450, 0's: 0 Z-trim(116.1): 19  B-trim: 109 in 1/52
 Lambda= 0.062505
 statistics sampled from 16662 (16679) to 16662 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.512), width:  16
 Scan time:  3.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47492.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6        ( 634) 4121 385.6 1.1e-106
CCDS47493.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6        ( 645) 4095 383.3 5.6e-106
CCDS43512.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6        ( 554) 2662 254.0 3.9e-67
CCDS47494.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6        ( 565) 2662 254.0 3.9e-67
CCDS41293.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1       ( 702)  995 103.7 8.5e-22
CCDS41294.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1       ( 712)  995 103.7 8.6e-22
CCDS75401.1 PHACTR1 gene_id:221692|Hs108|chr6      ( 580)  886 93.9 6.6e-19
CCDS42895.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20     ( 518)  807 86.7 8.3e-17
CCDS56202.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20     ( 556)  807 86.8 8.8e-17
CCDS13480.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20     ( 559)  807 86.8 8.9e-17
CCDS13481.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20     ( 448)  774 83.7 5.7e-16


>>CCDS47492.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6             (634 aa)
 initn: 4121 init1: 4121 opt: 4121  Z-score: 2028.9  bits: 385.6 E(32554): 1.1e-106
Smith-Waterman score: 4121; 99.8% identity (99.8% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS47 GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRPKPKPKKSPVPPKGAT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630    
pF1KSD PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
              610       620       630    

>>CCDS47493.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6             (645 aa)
 initn: 4095 init1: 4095 opt: 4095  Z-score: 2016.2  bits: 383.3 E(32554): 5.6e-106
Smith-Waterman score: 4095; 99.7% identity (99.8% similar) in 631 aa overlap (4-634:15-645)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
                     .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGQTSVSTLSPQPGSVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KSD KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KSD TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS47 TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRPKPKP
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
              310       320       330       340       350       360

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KSD TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
              430       440       450       460       470       480

     470       480       490       500       510       520         
pF1KSD ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
              490       500       510       520       530       540

     530       540       550       560       570       580         
pF1KSD LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
              550       560       570       580       590       600

     590       600       610       620       630    
pF1KSD RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
              610       620       630       640     

>>CCDS43512.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6             (554 aa)
 initn: 2655 init1: 2655 opt: 2662  Z-score: 1318.8  bits: 254.0 E(32554): 3.9e-67
Smith-Waterman score: 3399; 87.4% identity (87.4% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-554)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGAT
       ::::::::::::::::::::                                        
CCDS43 GNGSVSEKTPPLEEQAEDKK----------------------------------------
              130       140                                        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
                                               ::::::::::::::::::::
CCDS43 ----------------------------------------AGSSHSKKTTGSKASASPST
                                                      150       160

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
              170       180       190       200       210       220

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
              230       240       250       260       270       280

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
              290       300       310       320       330       340

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
              350       360       370       380       390       400

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
              410       420       430       440       450       460

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLT
              470       480       490       500       510       520

              610       620       630    
pF1KSD PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
              530       540       550    

>>CCDS47494.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6             (565 aa)
 initn: 2655 init1: 2655 opt: 2662  Z-score: 1318.7  bits: 254.0 E(32554): 3.9e-67
Smith-Waterman score: 3373; 87.2% identity (87.3% similar) in 631 aa overlap (4-634:15-565)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
                     .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGQTSVSTLSPQPGSVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KSD KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KSD TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKP
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
CCDS47 TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKK-----------------------------
              130       140       150                              

     170       180       190       200       210       220         
pF1KSD KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT
                                                          :::::::::
CCDS47 ---------------------------------------------------AGSSHSKKT
                                                                160

     230       240       250       260       270       280         
pF1KSD TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS
              170       180       190       200       210       220

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA
              230       240       250       260       270       280

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK
              290       300       310       320       330       340

     410       420       430       440       450       460         
pF1KSD TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL
              350       360       370       380       390       400

     470       480       490       500       510       520         
pF1KSD ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE
              410       420       430       440       450       460

     530       540       550       560       570       580         
pF1KSD LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD
              470       480       490       500       510       520

     590       600       610       620       630    
pF1KSD RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
              530       540       550       560     

>>CCDS41293.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1            (702 aa)
 initn: 1205 init1: 688 opt: 995  Z-score: 504.8  bits: 103.7 E(32554): 8.5e-22
Smith-Waterman score: 1293; 40.1% identity (59.5% similar) in 676 aa overlap (34-634:37-702)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KSD AVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLE
                                     .: .:::::::::::::.::::.::: :::
CCDS41 EADQPTTEPGMVLDSVEAGDTTPPTKRKSKFSGFGKIFKPWKWRKKKSSDKFKETSEVLE
         10        20        30        40        50        60      

            70        80        90          100       110       120
pF1KSD RKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENS---NGHMIPIGEESTREENVVKSEE
       :::: :. ::::..:::: : :.: :.   .  ..   :::  :::.  .     :. : 
CCDS41 RKISMRKPREELVKRGVLLEDPEQGGEDPGKPSDAMLKNGHTTPIGNARSSSPVQVEEEP
         70        80        90       100       110       120      

              130            140          150       160            
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAE-----DKKENTENHS---ETPAAPALPPSAP---PKPRSKPKP
          .  .:. : :.  .      .. :.: .:   ..:  : :::. :    .  :. . 
CCDS41 VRLASLRKAIPEEDLKKRLGSTGSQPNSEAESVPENVPKPPLLPPKRPLSSSHEASEGQA
        130       140       150       160       170       180      

     170                         180                190            
pF1KSD KKS------------------PVPPKGATAGA---------SHKGDEVP--PIKKNTKA-
       : .                  :.   .::. :         :     .:  : . :: : 
CCDS41 KDATSSGGTARFIISTSITTAPAATTAATSLAKTVNLSVTPSPAPRTLPAAPASTNTTAT
        190       200       210       220       230       240      

            200       210       220               230              
pF1KSD -------PGKQAPVPPPKPASRNTTREAA--------GSSHSKKTT------GSKASASP
              :.:: :.:::::: ::..   :        :.  :: .       :  ... :
CCDS41 PSLTHMVPAKQPPIPPPKPAHRNSNPVIAELSQAINSGTLLSKPSPPLPPKRGIPSTSVP
        250       260       270       280       290       300      

      240           250       260       270       280       290    
pF1KSD STSS----TSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGE
       .  :    :.. :.  .:  . . :.      . .. . :. .:.  .   .     :  
CCDS41 TLESAAAITTKTPSDEREKSTCSMGSELLPMISPRSPSPPLPTHIPPEPPRTPPFPAKTF
        310       320       330       340       350       360      

          300          310       320       330        340       350
pF1KSD PAETRVE---SFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAP-APSPLAPPLPLEDQCITAS
        .  ..:   :. :.: .:  :.:.    : ..      :  :: : :::::. .   : 
CCDS41 QVVPEIEFPPSLDLHQEIPQQEDQKKEVPKRILDQNFGEPHIPSRL-PPLPLHIRIQQAL
        370       380       390       400       410        420     

                360       370       380       390       400        
pF1KSD DTPVVLVSV--GADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELG
        .:. .. .  :.    : :  ..  ..:. .   ::    .: .. :  :    .::  
CCDS41 TSPLPMTPILEGSHRAHSLLFENSDSFSEDSS---TLGRTRSLPITIEMLKVPDDEEEEE
         430       440       450          460       470       480  

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD KTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESA
       .: :. ..   :  .:   .  .   ..: . .::::.::: : :.:::::    : .::
CCDS41 QTCPSTFSEE-MTPTSVIPKLPQCLREEEEKESDSDSEGPIQYRDEEDEDE----SYQSA
            490        500       510       520       530           

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD LASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTE
       ::.:..:.::::.::..:::. :: . :     :.:: .:::.:::. :.:::::::: :
CCDS41 LANKVKRKDTLAMKLNHRPSEPEL-NLNSWPCKSKEEWNEIRHQIGNTLIRRLSQRPTPE
       540       550       560        570       580       590      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KSD ELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDY
       ::::::::. ::: ..:  : :.::::.:::: ::::::: ::.::::::::::::. ::
CCDS41 ELEQRNILQPKNEADRQAEKREIKRRLTRKLSQRPTVAELLARKILRFNEYVEVTDAQDY
        600       610       620       630       640       650      

      590       600       610       620       630    
pF1KSD DRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       ::::::::..::::::::::::::::::.::::::::..:::.:::
CCDS41 DRRADKPWTKLTPADKAAIRKELNEFKSSEMEVHEESKHFTRYHRP
        660       670       680       690       700  

>>CCDS41294.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1            (712 aa)
 initn: 1205 init1: 688 opt: 995  Z-score: 504.7  bits: 103.7 E(32554): 8.6e-22
Smith-Waterman score: 1293; 40.1% identity (59.5% similar) in 676 aa overlap (34-634:47-712)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KSD AVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLE
                                     .: .:::::::::::::.::::.::: :::
CCDS41 EADQPTTEPGMVLDSVEAGDTTPPTKRKSKFSGFGKIFKPWKWRKKKSSDKFKETSEVLE
         20        30        40        50        60        70      

            70        80        90          100       110       120
pF1KSD RKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENS---NGHMIPIGEESTREENVVKSEE
       :::: :. ::::..:::: : :.: :.   .  ..   :::  :::.  .     :. : 
CCDS41 RKISMRKPREELVKRGVLLEDPEQGGEDPGKPSDAMLKNGHTTPIGNARSSSPVQVEEEP
         80        90       100       110       120       130      

              130            140          150       160            
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAE-----DKKENTENHS---ETPAAPALPPSAP---PKPRSKPKP
          .  .:. : :.  .      .. :.: .:   ..:  : :::. :    .  :. . 
CCDS41 VRLASLRKAIPEEDLKKRLGSTGSQPNSEAESVPENVPKPPLLPPKRPLSSSHEASEGQA
        140       150       160       170       180       190      

     170                         180                190            
pF1KSD KKS------------------PVPPKGATAGA---------SHKGDEVP--PIKKNTKA-
       : .                  :.   .::. :         :     .:  : . :: : 
CCDS41 KDATSSGGTARFIISTSITTAPAATTAATSLAKTVNLSVTPSPAPRTLPAAPASTNTTAT
        200       210       220       230       240       250      

            200       210       220               230              
pF1KSD -------PGKQAPVPPPKPASRNTTREAA--------GSSHSKKTT------GSKASASP
              :.:: :.:::::: ::..   :        :.  :: .       :  ... :
CCDS41 PSLTHMVPAKQPPIPPPKPAHRNSNPVIAELSQAINSGTLLSKPSPPLPPKRGIPSTSVP
        260       270       280       290       300       310      

      240           250       260       270       280       290    
pF1KSD STSS----TSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGE
       .  :    :.. :.  .:  . . :.      . .. . :. .:.  .   .     :  
CCDS41 TLESAAAITTKTPSDEREKSTCSMGSELLPMISPRSPSPPLPTHIPPEPPRTPPFPAKTF
        320       330       340       350       360       370      

          300          310       320       330        340       350
pF1KSD PAETRVE---SFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAP-APSPLAPPLPLEDQCITAS
        .  ..:   :. :.: .:  :.:.    : ..      :  :: : :::::. .   : 
CCDS41 QVVPEIEFPPSLDLHQEIPQQEDQKKEVPKRILDQNFGEPHIPSRL-PPLPLHIRIQQAL
        380       390       400       410       420        430     

                360       370       380       390       400        
pF1KSD DTPVVLVSV--GADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELG
        .:. .. .  :.    : :  ..  ..:. .   ::    .: .. :  :    .::  
CCDS41 TSPLPMTPILEGSHRAHSLLFENSDSFSEDSS---TLGRTRSLPITIEMLKVPDDEEEEE
         440       450       460          470       480       490  

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD KTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESA
       .: :. ..   :  .:   .  .   ..: . .::::.::: : :.:::::    : .::
CCDS41 QTCPSTFSEE-MTPTSVIPKLPQCLREEEEKESDSDSEGPIQYRDEEDEDE----SYQSA
            500        510       520       530       540           

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD LASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTE
       ::.:..:.::::.::..:::. :: . :     :.:: .:::.:::. :.:::::::: :
CCDS41 LANKVKRKDTLAMKLNHRPSEPEL-NLNSWPCKSKEEWNEIRHQIGNTLIRRLSQRPTPE
       550       560       570        580       590       600      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KSD ELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDY
       ::::::::. ::: ..:  : :.::::.:::: ::::::: ::.::::::::::::. ::
CCDS41 ELEQRNILQPKNEADRQAEKREIKRRLTRKLSQRPTVAELLARKILRFNEYVEVTDAQDY
        610       620       630       640       650       660      

      590       600       610       620       630    
pF1KSD DRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       ::::::::..::::::::::::::::::.::::::::..:::.:::
CCDS41 DRRADKPWTKLTPADKAAIRKELNEFKSSEMEVHEESKHFTRYHRP
        670       680       690       700       710  

>>CCDS75401.1 PHACTR1 gene_id:221692|Hs108|chr6           (580 aa)
 initn: 720 init1: 522 opt: 886  Z-score: 453.0  bits: 93.9 E(32554): 6.6e-19
Smith-Waterman score: 1081; 38.1% identity (59.2% similar) in 633 aa overlap (4-634:83-580)

                                          10        20        30   
pF1KSD                            MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGK
                                     :.. ... .   ::. . :..:::..:..:
CCDS75 DDIDRRPIRRVRSKSDTPYLAEARISFNLGAAEEVERLAAMRSDSLVPGTHTPPIRRRSK
             60        70        80        90       100       110  

            40        50        60        70        80        90   
pF1KSD LSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTV
       ....:.::::::::::: :.::..:::.:::::: ::::::::.::::::. :.::....
CCDS75 FANLGRIFKPWKWRKKK-SEKFKHTSAALERKISMRQSREELIKRGVLKEIYDKDGELSI
            120        130       140       150       160       170 

           100       110       120       130       140       150   
pF1KSD NFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAP
       . :          :.: .. . ..: . .  .  .  :.    .  . .. . :.   .:
CCDS75 SNE----------EDSLENGQSLSSSQLSLPALSEMEPVPMPRDPCSYEVLQPSDIMDGP
                       180       190       200       210       220 

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD ALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPAS
          :.:: :    :   . :.::: .       : ..  .. ...  :.:.       :.
CCDS75 --DPGAPVKLPCLPVKLSPPLPPKKVMICMPVGGPDLSLVSYTAQKSGQQGV------AQ
               230       240       250       260       270         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD RNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQ
       .. :   .  .:. .  ::...  :::  :.: :   .              : :  :. 
CCDS75 HHHTVLPSQIQHQLQY-GSHGQHLPST--TGSLPMHPS--------------GCRMIDEL
           280        290         300                     310      

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD PITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAP
         :  .. .                :.::   :: :: .   ... ..:      :. : 
CCDS75 NKTLAMTMQ----------------RLESS--EQRVPCSTSYHSSGLHS---GDGVTKA-
        320                       330         340          350     

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD SPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSV
       .:.. :           ..:.:..                   :   :. ..   .    
CCDS75 GPMGLP--------EIRQVPTVVI-------------------ECDDNKENVPHES----
          360               370                          380       

           400       410       420       430       440       450   
pF1KSD NRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTD
       . :...:. :.::                                              .
CCDS75 DYEDSSCLYTREE----------------------------------------------E
           390                                                     

           460        470       480       490       500       510  
pF1KSD DEDEDEDEDGS-GESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQ
       .:.::::.:.:   :.:: :. :.:.:::::.:::::.:::.:::: : ..::: :.:::
CCDS75 EEEEDEDDDSSLYTSSLAMKVCRKDSLAIKLSNRPSKRELEEKNILPRQTDEERLELRQQ
       400       410       420       430       440       450       

            520       530       540       550       560       570  
pF1KSD IGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARR
       :::::.::::::::.:::::::::: .::.:::: : :.::::.:::: :::: ::. :.
CCDS75 IGTKLTRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEEQEEKREIKRRLTRKLSQRPTVEELRERK
       460       470       480       490       500       510       

             580       590       600       610       620       630 
pF1KSD IL-RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRF
       :: ::..::::.:. ::::::::::.::: :::::::::::::::::::::: ::..:::
CCDS75 ILIRFSDYVEVADAQDYDRRADKPWTRLTAADKAAIRKELNEFKSTEMEVHELSRHLTRF
       520       530       540       550       560       570       

          
pF1KSD HRP
       :::
CCDS75 HRP
       580

>>CCDS42895.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20          (518 aa)
 initn: 683 init1: 422 opt: 807  Z-score: 415.2  bits: 86.7 E(32554): 8.3e-17
Smith-Waterman score: 924; 34.1% identity (58.1% similar) in 628 aa overlap (8-634:1-518)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSA
              .:..  :  .  ..: .::: .:..::.:.:.::::::::::: ..:...:..
CCDS42        MDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTS
                      10        20        30        40         50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEE
       .::.:.. ::.:::::..:.: :. .::..  .   : .:     : .:      :.:: 
CCDS42 ALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAESKTC--NPDG-----GPRS------VQSE-
             60        70         80               90              

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGAT
                ::  .        .:. .   : :. : ..     :  :: .:        
CCDS42 ---------PPTPK--------SETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSS--------
                100               110       120       130          

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD AGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPST
         :.:  : .   :  . . :..: .    :.. . ..  ::..                
CCDS42 --AAHLDDAA---KMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGAD----------------
              140          150       160       170                 

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD SSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRV
        : .: :.  ...:.             .  . :.       .... :... :. .  ..
CCDS42 -SLDSPPRPLERSVG-------------QLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQA
              180                    190       200       210       

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVG
        :.:      .:. .  :.... .  : .. .  :: :   .:.   . .         :
CCDS42 SSMK------SADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQG
       220             230       240       250       260       270 

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLM
        .   :  .:.. :       : .  :..  . .::.:  :    :  .:          
CCDS42 RE---SKGSPKKRL-----DVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRT----------
                280            290       300       310             

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLA
              .:.:.: ..:    .:.    .:  .::.  .:   ::  .:  : .. . ::
CCDS42 -------AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISG--TLPRKCKK-ELLA
                  320       330       340       350          360   

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD IKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKN
       .:: :::::.::::.::. : ..::::::::::  :: .::::::..::::.::::::.:
CCDS42 VKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRN
           370       380       390       400       410       420   

              550       560       570        580       590         
pF1KSD EEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARL
       .. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: ::..::::. . ::::::::::.::
CCDS42 DQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRL
           430       440       450       460       470       480   

     600       610       620       630    
pF1KSD TPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       . ::::::::::::.::.:::::  :...::::::
CCDS42 SAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
           490       500       510        

>>CCDS56202.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20          (556 aa)
 initn: 683 init1: 422 opt: 807  Z-score: 414.7  bits: 86.8 E(32554): 8.8e-17
Smith-Waterman score: 937; 34.2% identity (58.0% similar) in 634 aa overlap (2-634:33-556)

                                            10        20        30 
pF1KSD                              MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRK
                                     : : : .:..  :  .  ..: .::: .:.
CCDS56 GRGGGRARCPAPLRSLLGAFGARDAAAAARDPAQDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRN
             10        20        30        40        50        60  

              40        50        60        70        80        90 
pF1KSD GKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDV
       .::.:.:.::::::::::: ..:...:...::.:.. ::.:::::..:.: :. .::.. 
CCDS56 SKLATLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAES
             70        80         90       100       110        120

             100       110       120       130       140       150 
pF1KSD TVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPA
        .   : .:     : .:      :.::          ::  .        .:. .   :
CCDS56 KTC--NPDG-----GPRS------VQSE----------PPTPK--------SETLTSEDA
                     130                       140                 

             160       170       180       190       200       210 
pF1KSD APALPPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKP
        :. : ..     :  :: .:          :.:  : .   :  . . :..: .    :
CCDS56 QPGSPLATGTDQVSLDKPLSS----------AAHLDDAA---KMPSASSGEEADAGSLLP
     150       160       170                    180       190      

             220       230       240       250       260       270 
pF1KSD ASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTD
       .. . ..  ::..                 : .: :.  ...:.             .  
CCDS56 TTNELSQALAGAD-----------------SLDSPPRPLERSVG-------------QLP
        200                        210       220                   

             280       290       300       310       320       330 
pF1KSD KQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAP
       . :.       .... :... :. .  .. :.:      .:. .  :.... .  : .. 
CCDS56 SPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMK------SADPSLRGQLSTPTGSPHLTT
        230       240       250             260       270       280

             340       350       360       370       380       390 
pF1KSD APSPLAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGL
       .  :: :   .:.   . .         : .   :  .:.. :       : .  :..  
CCDS56 VHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQGRE---SKGSPKKRL-----DVRLSRTSSVER
              290       300       310          320            330  

             400       410       420       430       440       450 
pF1KSD SVNRENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILY
       . .::.:  :    :  .:                 .:.:.: ..:    .:.    .: 
CCDS56 GKEREEAWSFDGALENKRT-----------------AAKESEENKENLIINSELKDDLLL
            340       350                        360       370     

             460       470       480       490       500       510 
pF1KSD TDDEDEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQ
        .::.  .:   ::  .:  : .. . ::.:: :::::.::::.::. : ..::::::::
CCDS56 YQDEEALNDSIISG--TLPRKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQ
         380         390        400       410       420       430  

             520       530       540       550       560       570 
pF1KSD QIGTKLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQAR
       ::  :: .::::::..::::.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :
CCDS56 QIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDR
            440       450       460       470       480       490  

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD RIL-RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTR
       .:: ::..::::. . ::::::::::.::. ::::::::::::.::.:::::  :...::
CCDS56 KILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTR
            500       510       520       530       540       550  

           
pF1KSD FHRP
       ::::
CCDS56 FHRP
           

>>CCDS13480.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20          (559 aa)
 initn: 683 init1: 422 opt: 807  Z-score: 414.7  bits: 86.8 E(32554): 8.9e-17
Smith-Waterman score: 929; 34.1% identity (58.1% similar) in 630 aa overlap (6-634:40-559)

                                        10        20        30     
pF1KSD                          MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLS
                                     : .:..  :  .  ..: .::: .:..::.
CCDS13 CLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLA
      10        20        30        40        50        60         

          40        50        60        70        80        90     
pF1KSD TIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNF
       :.:.::::::::::: ..:...:...::.:.. ::.:::::..:.: :. .::..  .  
CCDS13 TLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAESKTC-
      70        80         90       100       110        120       

         100       110       120       130       140       150     
pF1KSD ENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPAL
        : .:     : .:      :.::          ::  .        .:. .   : :. 
CCDS13 -NPDG-----GPRS------VQSE----------PPTPK--------SETLTSEDAQPGS
         130                            140               150      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KSD PPSAPPKPRSKPKPKKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRN
       : ..     :  :: .:          :.:  : .   :  . . :..: .    :.. .
CCDS13 PLATGTDQVSLDKPLSS----------AAHLDDAA---KMPSASSGEEADAGSLLPTTNE
        160       170                 180          190       200   

         220       230       240       250       260       270     
pF1KSD TTREAAGSSHSKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPI
        ..  ::.                 .: .: :.  ...:.             .  . :.
CCDS13 LSQALAGA-----------------DSLDSPPRPLERSVG-------------QLPSPPL
           210                        220                    230   

         280       290       300       310       320       330     
pF1KSD TSHLSSDTTTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSP
              .... :... :. .  .. :.:      .:. .  :.... .  : .. .  :
CCDS13 LPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMK------SADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRP
           240       250       260             270       280       

         340       350       360       370       380       390     
pF1KSD LAPPLPLEDQCITASDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNR
       : :   .:.   . .         : .   :  .:.. :       : .  :..  . .:
CCDS13 LPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQGRE---SKGSPKKRL-----DVRLSRTSSVERGKER
       290       300       310          320            330         

         400       410       420       430       440       450     
pF1KSD ENAKCFTTKEELGKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDE
       :.:  :    :  .:                 .:.:.: ..:    .:.    .:  .::
CCDS13 EEAWSFDGALENKRT-----------------AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDE
     340       350                        360       370       380  

         460       470       480       490       500       510     
pF1KSD DEDEDEDGSGESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGT
       .  .:   ::  .:  : .. . ::.:: :::::.::::.::. : ..::::::::::  
CCDS13 EALNDSIISG--TLPRKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEM
            390         400        410       420       430         

         520       530       540       550       560       570     
pF1KSD KLVRRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-
       :: .::::::..::::.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: 
CCDS13 KLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILI
     440       450       460       470       480       490         

          580       590       600       610       620       630    
pF1KSD RFNEYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
       ::..::::. . ::::::::::.::. ::::::::::::.::.:::::  :...::::::
CCDS13 RFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
     500       510       520       530       540       550         




634 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 02:39:56 2016 done: Thu Nov  3 02:39:57 2016
 Total Scan time:  3.340 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com