Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0638
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0638, 1377 aa
  1>>>pF1KSDA0638 1377 - 1377 aa - 1377 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0915+/-0.00112; mu= -16.5511+/- 0.067
 mean_var=463.0626+/-94.062, 0's: 0 Z-trim(115.1): 28  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.059601
 statistics sampled from 15683 (15705) to 15683 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.482), width:  16
 Scan time:  5.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11        (1377) 9054 793.9       0
CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11       (1319) 5996 531.0 8.6e-150
CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3         (1210) 1322 129.0 7.7e-29
CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3        (1237) 1322 129.1 7.9e-29
CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3        (1253) 1144 113.8 3.2e-24


>>CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11             (1377 aa)
 initn: 9054 init1: 9054 opt: 9054  Z-score: 4223.5  bits: 793.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9054; 100.0% identity (100.0% similar) in 1377 aa overlap (1-1377:1-1377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
             1330      1340      1350      1360      1370       

>>CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11            (1319 aa)
 initn: 6290 init1: 5987 opt: 5996  Z-score: 2802.7  bits: 531.0 E(32554): 8.6e-150
Smith-Waterman score: 8527; 95.8% identity (95.8% similar) in 1377 aa overlap (1-1377:1-1319)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
       ::::::::::::                                               :
CCDS44 RPFPKTTSTLKE-----------------------------------------------V
              910                                                  

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
           920       930       940       950       960       970   

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
           980       990      1000      1010      1020      1030   

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
          1160      1170      1180      1190      1200      1210   

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
          1220      1230      1240      1250      1260      1270   

             1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
                  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----------SPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
                     1280      1290      1300      1310         

>>CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3              (1210 aa)
 initn: 2253 init1: 999 opt: 1322  Z-score: 631.2  bits: 129.0 E(32554): 7.7e-29
Smith-Waterman score: 2255; 39.5% identity (62.6% similar) in 1277 aa overlap (188-1376:22-1209)

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
                                     :.: :.:.: :..:.::    :    ::  
CCDS29          MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
                        10        20        30           40        

       220          230        240          250       260       270
pF1KSD ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
        .: :   :::   : :: :: :. :.  :   .:.: . .::... ..     ::  . 
CCDS29 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
             50        60         70        80              90     

              280       290           300       310        320     
pF1KSD SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
       : .: . .  . : .:  ...  :.  :      .. .:  ::   :::.:  . .  : 
CCDS29 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
          100       110       120       130       140       150    

         330       340       350        360        370       380   
pF1KSD GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
         :    :.  .    :.:.:.     :. : .  . :::.  :   . :  .:.:.:::
CCDS29 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
             160       170            180       190       200      

           390        400       410       420       430        440 
pF1KSD FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
             : . .:  .:  .:    ..  .:: .     .:.  . ..:  :  .:.:   
CCDS29 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLR--TRKYSSSSLSHMGAYSRSL---
             210       220       230         240       250         

             450         460       470             480        490  
pF1KSD ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
         ::: :   ...  :  :: . ::.    . :  .  :      :  ::   .. .  :
CCDS29 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
          260       270        280       290       300       310   

            500        510          520       530       540        
pF1KSD RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
        . .:  ..:  . .:.. :  : .:.    : .   :    ..:. :  .:..::  :.
CCDS29 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
           320       330       340       350       360          370

      550       560                       570       580       590  
pF1KSD GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY
       : :  .   ..:..: :       ::.          :. ::::.::. :: ..:::..:
CCDS29 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
               380       390       400       410       420         

            600       610       620           630       640        
pF1KSD HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
       :::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :.    :  . .. .:..    : :
CCDS29 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
      430       440       450       460       470       480        

      650                             660       670       680      
pF1KSD AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE
       . ..                      :.  ::. .. :.   .  : :  .. :  ::  
CCDS29 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT
      490       500       510       520       530       540        

         690                  700       710       720       730    
pF1KSD NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV
             :::      ::.      .  :     . . :. :.:: :  .:...:.:: ..
CCDS29 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI
      550       560       570       580       590       600        

          740       750       760       770       780       790    
pF1KSD KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE
       :....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .:  :. :.
CCDS29 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKD
      610       620       630       640       650       660        

          800       810       820       830       840       850    
pF1KSD AEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQ
       :. :..:.: ::::::::::.:::..::.:   : :::  ::  :.:..:::... : .:
CCDS29 ADLLDVESKHFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQ
      670       680       690       700       710       720        

          860       870       880       890       900       910    
pF1KSD AGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEME
       :..:  :: .:.......::  ...::.:::.:  ::..: ::.::. :: . .::::  
CCDS29 ANHIVQQAQREQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGY
      730       740       750       760       770       780        

          920       930       940       950         960       970  
pF1KSD KLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQL--QVYRSKMDGEATSP
        . .  ..     .  ..     :: :.  .. :   . ::.    . .::  . .    
CCDS29 -ISVNEINEPCGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHK
       790       800       810       820       830       840       

            980       990      1000       1010        1020         
pF1KSD LPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDI
            :  :: .. .:: : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .:::  .: 
CCDS29 EGLYLSDTLPRKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDS
       850       860       870       880       890       900       

    1030      1040      1050      1060      1070      1080         
pF1KSD ETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHH
       :..:.:  .  ..: . : .:. .:. ...:.:..   ...:    .:           :
CCDS29 ESRRML--RGYNHQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH----YP----------DH
       910         920       930       940                     950 

    1090      1100      1110      1120      1130      1140         
pF1KSD SILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIE
       :               ..:.:::::.::::::::::     ::::::.::::  ....::
CCDS29 SY-------------KDQAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIE
                          960       970            980       990   

    1150      1160      1170      1180      1190      1200         
pF1KSD EMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEV
       :::..::.:::::.::.:::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.::::
CCDS29 EMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEV
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

    1210      1220      1230      1240      1250      1260         
pF1KSD KMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGK
       :.::.: .::::::::::.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::
CCDS29 KIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGK
          1060      1070      1080      1090      1100      1110   

    1270      1280      1290      1300      1310      1320         
pF1KSD IKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKKRFFRFTMV
       ::.:::::::::: :::.:::.::::::::::::::::::::::::..: :         
CCDS29 IKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANK---------
          1120      1130      1140      1150      1160             

    1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD TESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
         :::: ::: ::::::.::::::: ::::::::::::::::::.:. 
CCDS29 --SPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
           1170      1180      1190      1200      1210

>>CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3             (1237 aa)
 initn: 2253 init1: 999 opt: 1322  Z-score: 631.1  bits: 129.1 E(32554): 7.9e-29
Smith-Waterman score: 2255; 39.5% identity (62.6% similar) in 1277 aa overlap (188-1376:49-1236)

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
                                     :.: :.:.: :..:.::    :    ::  
CCDS46 VQHFDSSKIMEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
       20        30        40        50        60                  

       220          230        240          250       260       270
pF1KSD ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
        .: :   :::   : :: :: :. :.  :   .:.: . .::... ..     ::  . 
CCDS46 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
      70        80        90        100        110             120 

              280       290           300       310        320     
pF1KSD SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
       : .: . .  . : .:  ...  :.  :      .. .:  ::   :::.:  . .  : 
CCDS46 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
             130       140       150       160       170       180 

         330       340       350        360        370       380   
pF1KSD GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
         :    :.  .    :.:.:.     :. : .  . :::.  :   . :  .:.:.:::
CCDS46 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
                190       200            210       220       230   

           390        400       410       420       430        440 
pF1KSD FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
             : . .:  .:  .:    ..  .:: .     .:.  . ..:  :  .:.:   
CCDS46 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLR--TRKYSSSSLSHMGAYSRSL---
                240       250       260         270       280      

             450         460       470             480        490  
pF1KSD ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
         ::: :   ...  :  :: . ::.    . :  .  :      :  ::   .. .  :
CCDS46 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
             290       300        310       320       330       340

            500        510          520       530       540        
pF1KSD RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
        . .:  ..:  . .:.. :  : .:.    : .   :    ..:. :  .:..::  :.
CCDS46 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
              350       360       370       380        390         

      550       560                       570       580       590  
pF1KSD GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY
       : :  .   ..:..: :       ::.          :. ::::.::. :: ..:::..:
CCDS46 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
       400        410       420       430       440        450     

            600       610       620           630       640        
pF1KSD HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
       :::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :.    :  . .. .:..    : :
CCDS46 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
         460       470       480       490       500       510     

      650                             660       670       680      
pF1KSD AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE
       . ..                      :.  ::. .. :.   .  : :  .. :  ::  
CCDS46 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT
         520       530       540       550       560       570     

         690                  700       710       720       730    
pF1KSD NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV
             :::      ::.      .  :     . . :. :.:: :  .:...:.:: ..
CCDS46 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI
         580       590       600       610       620       630     

          740       750       760       770       780       790    
pF1KSD KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE
       :....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .:  :. :.
CCDS46 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKD
         640       650       660       670       680       690     

          800       810       820       830       840       850    
pF1KSD AEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQ
       :. :..:.: ::::::::::.:::..::.:   : :::  ::  :.:..:::... : .:
CCDS46 ADLLDVESKHFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQ
         700       710       720       730       740       750     

          860       870       880       890       900       910    
pF1KSD AGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEME
       :..:  :: .:.......::  ...::.:::.:  ::..: ::.::. :: . .::::  
CCDS46 ANHIVQQAQREQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGY
         760       770       780       790       800       810     

          920       930       940       950         960       970  
pF1KSD KLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQL--QVYRSKMDGEATSP
        . .  ..     .  ..     :: :.  .. :   . ::.    . .::  . .    
CCDS46 -ISVNEINEPCGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHK
          820       830       840       850       860       870    

            980       990      1000       1010        1020         
pF1KSD LPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDI
            :  :: .. .:: : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .:::  .: 
CCDS46 EGLYLSDTLPRKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDS
          880       890       900       910       920       930    

    1030      1040      1050      1060      1070      1080         
pF1KSD ETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHH
       :..:.:  .  ..: . : .:. .:. ...:.:..   ...:    .:           :
CCDS46 ESRRML--RGYNHQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH----YP----------DH
          940         950       960       970                      

    1090      1100      1110      1120      1130      1140         
pF1KSD SILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIE
       :               ..:.:::::.::::::::::     ::::::.::::  ....::
CCDS46 SY-------------KDQAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIE
      980                    990      1000           1010      1020

    1150      1160      1170      1180      1190      1200         
pF1KSD EMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEV
       :::..::.:::::.::.:::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.::::
CCDS46 EMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

    1210      1220      1230      1240      1250      1260         
pF1KSD KMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGK
       :.::.: .::::::::::.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::
CCDS46 KIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1270      1280      1290      1300      1310      1320         
pF1KSD IKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKKRFFRFTMV
       ::.:::::::::: :::.:::.::::::::::::::::::::::::..: :         
CCDS46 IKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANK---------
             1150      1160      1170      1180      1190          

    1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD TESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
         :::: ::: ::::::.::::::: ::::::::::::::::::.:. 
CCDS46 --SPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
              1200      1210      1220      1230       

>>CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3             (1253 aa)
 initn: 2080 init1: 999 opt: 1144  Z-score: 548.3  bits: 113.8 E(32554): 3.2e-24
Smith-Waterman score: 2163; 38.3% identity (60.5% similar) in 1320 aa overlap (188-1376:22-1252)

       160       170       180       190       200       210       
pF1KSD PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
                                     :.: :.:.: :..:.::    :    ::  
CCDS46          MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
                        10        20        30           40        

       220          230        240          250       260       270
pF1KSD ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
        .: :   :::   : :: :: :. :.  :   .:.: . .::... ..     ::  . 
CCDS46 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
             50        60         70        80              90     

              280       290           300       310        320     
pF1KSD SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
       : .: . .  . : .:  ...  :.  :      .. .:  ::   :::.:  . .  : 
CCDS46 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
          100       110       120       130       140       150    

         330       340       350        360        370       380   
pF1KSD GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
         :    :.  .    :.:.:.     :. : .  . :::.  :   . :  .:.:.:::
CCDS46 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
             160       170            180       190       200      

           390        400       410       420       430        440 
pF1KSD FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
             : . .:  .:  .:    ..  .:: .     .:.  . ..:  :  .:.:   
CCDS46 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLR--TRKYSSSSLSHMGAYSRSL---
             210       220       230         240       250         

             450         460       470             480        490  
pF1KSD ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
         ::: :   ...  :  :: . ::.    . :  .  :      :  ::   .. .  :
CCDS46 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
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        . .:  ..:  . .:.. :  : .:.    : .   :    ..:. :  .:..::  :.
CCDS46 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
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       : :  .   ..:..: :       ::.          :. ::::.::. :: ..:::..:
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       :::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :.    :  . .. .:..    : :
CCDS46 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
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       . ..                      :.  ::. .. :.   .  : :  .. :  ::  
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             :::      ::.      .  :     . . :. :.:: :  .:...:.:: ..
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       :::.:::..::.:   : :::  ::  :.:..:::... : .::..:  :: .:......
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CCDS46 QAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLL
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CCDS46 ESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYL
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CCDS46 PVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRT
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CCDS46 IYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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