Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0554
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0554, 617 aa
  1>>>pF1KSDA0554 617 - 617 aa - 617 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2559+/-0.000921; mu= 4.5479+/- 0.056
 mean_var=227.9777+/-46.881, 0's: 0 Z-trim(114.0): 21  B-trim: 420 in 1/53
 Lambda= 0.084943
 statistics sampled from 14612 (14626) to 14612 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.449), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS48040.1 FNBP1 gene_id:23048|Hs108|chr9         ( 617) 4142 520.3  3e-147
CCDS53343.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1        ( 605) 1949 251.5 2.3e-66
CCDS74271.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19        ( 601) 1501 196.6 7.8e-50
CCDS60192.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1        ( 547) 1386 182.5 1.3e-45
CCDS53344.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1        ( 551) 1386 182.5 1.3e-45
CCDS12172.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19        ( 545) 1322 174.6 2.9e-43
CCDS74272.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19        ( 593) 1322 174.7 3.1e-43


>>CCDS48040.1 FNBP1 gene_id:23048|Hs108|chr9              (617 aa)
 initn: 4142 init1: 4142 opt: 4142  Z-score: 2757.1  bits: 520.3 E(32554): 3e-147
Smith-Waterman score: 4142; 100.0% identity (100.0% similar) in 617 aa overlap (1-617:1-617)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SNSRGEGKPDLKFGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SNSRGEGKPDLKFGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVDE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAWLA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD EVEGRLPARSEQARRQSGLYDSQNPPTVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEMKVLATDFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EVEGRLPARSEQARRQSGLYDSQNPPTVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEMKVLATDFD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD DEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNEDEEGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNEDEEGY
              550       560       570       580       590       600

              610       
pF1KSD VPTSYVEVCLDKNAKDS
       :::::::::::::::::
CCDS48 VPTSYVEVCLDKNAKDS
              610       

>>CCDS53343.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1             (605 aa)
 initn: 2049 init1: 983 opt: 1949  Z-score: 1304.8  bits: 251.5 E(32554): 2.3e-66
Smith-Waterman score: 2381; 56.2% identity (82.2% similar) in 624 aa overlap (1-617:1-605)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
       ::::::::::::.:.::::::::.::.: :::::: ::: .:::::::: ::: ::..::
CCDS53 MSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
       .::  ..::: ::.. :::.::::::.::..:.:: ..  .: ::...:: ::: ....:
CCDS53 DEEP-RFTSCVAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAHRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEG
                70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
       :::::... ::::...::..:::.:.::..::: .:..: : :.::::::::.:: ..: 
CCDS53 RKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATKADVEKAKQQLNLRT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
       .::...: .:.. ::.:: :::..... ::.:....:::.::: ....: .. .:. .:.
CCDS53 HMADENKNEYAAQLQNFNGEQHKHFYVVIPQIYKQLQEMDERRTIKLSECYRGFADSERK
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
       :::::.:::.:.. ::.:.:.. :::.:....:::::::::. ::::.: . ::.::...
CCDS53 VIPIISKCLEGMILAAKSVDERRDSQMVVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTI
     240       250       260       270       280       290         

               310        320       330       340       350        
pF1KSD SNSRGE-GKPDLKFG-GKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQ
       : :. : :: : :   ::.::::: : :: :       : : ::  :.:   :..::: :
CCDS53 SASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKKPK-------P-QSPPLTPTSLFTSSTPNGSQ
     300       310       320       330               340       350 

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD SPKQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKV
           . ::. . .::. :.::.:  ::::::: :.:.: . ::::.::::::::::::..
CCDS53 FLTFSIEPVHYCMNEIKTGKPRIPSFRSLKRGWSVKMGPALEDFSHLPPEQRRKKLQQRI
             360       370       380       390       400       410 

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD DELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAW
       ::::.:.::: ::.::..:::::: ::::::::.::. ::::. .::..::.: .: :::
CCDS53 DELNRELQKESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMEIHKNEAW
             420       430       440       450       460       470 

      480       490       500       510        520           530   
pF1KSD LAEVEGRLPARSEQARRQSGLYDSQNPPTVNN-CAQDRESPDGSYTEEQSQE----SEMK
       :.::::.  .:..  ::.:.         .:.  .: ::::.::::.. .::     ...
CCDS53 LSEVEGKTGGRGD--RRHSS--------DINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQH
             480                 490       500       510       520 

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD VLATDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRR
          ..:::::.:..:::::: :::.: :.:.::::... :::.::.::::::::::: ::
CCDS53 GHHNEFDDEFEDDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARR
             530       540       550       560       570       580 

           600       610       
pF1KSD NEDEEGYVPTSYVEVCLDKNAKDS
       .. :::::::::..: :.::.: :
CCDS53 QNGEEGYVPTSYIDVTLEKNSKGS
             590       600     

>>CCDS74271.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19             (601 aa)
 initn: 2023 init1: 1217 opt: 1501  Z-score: 1008.1  bits: 196.6 E(32554): 7.8e-50
Smith-Waterman score: 2148; 51.4% identity (81.6% similar) in 615 aa overlap (1-611:1-601)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
       :.:::::::::. ::.:::::.:.:..:.::::::::.: .::::::.: ::: ::. .:
CCDS74 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
       .. : :... ..:.. :.:.::.:::.:...::.. .. ..:..: ::.::::: .:..:
CCDS74 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
       :.:::..:. .::::.:::.:::::.::..: :  :..: :::.::::::::.:::..: 
CCDS74 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
       .:::.:: .:.. ::.::..: ..: ...:.::.:.:.:.::: .:.: ..   .:.. .
CCDS74 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
       :.:::.:::.:.  ::...: ::::...:: .::::  :::.::::..:::.:. ::.::
CCDS74 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SNSRGEGKPDLKFGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSP
       . . ..:.:.:.  :.:. : ::: ::::       :. ::  : ..  :::.:::: ::
CCDS74 G-TPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNK-------PRPPPLSPLGGPVPSALPNGPPSP
               310       320              330       340       350  

              370        380       390       400       410         
pF1KSD KQQKEPLSHRFNEFMTS-KPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKVD
       .. ..::.  ..:.  : ::..  :::: ::   .  .. ::::.:::::.::.:::...
CCDS74 RSGRDPLAI-LSEISKSVKPRLASFRSL-RG--SRGTVVTEDFSHLPPEQQRKRLQQQLE
            360        370        380         390       400        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD ELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAWL
       : ..:.:::.:::.:. :::::: :.:::::::::. ..::. .:::.:..:.::.::::
CCDS74 ERSRELQKEVDQREALKKMKDVYEKTPQMGDPASLEPQIAETLSNIERLKLEVQKYEAWL
      410       420       430       440       450       460        

     480        490       500         510       520       530      
pF1KSD AEVEGR-LPARSEQARRQSGLYD--SQNPPTVNNCAQDRESPDGSYTEEQSQESEMKVLA
       ::.:.: :  :...  :..   :  .. ::  .. . .... ..:  :  :.::.   . 
CCDS74 AEAESRVLSNRGDSLSRHARPPDPPASAPPDSSSNSASQDTKESS-EEPPSEESQDTPIY
      470       480       490       500       510        520       

        540       550       560       570       580       590      
pF1KSD TDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRRNED
       :.::..:. :::   :: : :.: :::..:::::..::: : ..::::::::::.::.: 
CCDS74 TEFDEDFE-EEPTSPIGHCVAIYHFEGSSEGTISMAEGEDLSLMEEDKGDGWTRVRRKEG
       530        540       550       560       570       580      

        600       610       
pF1KSD EEGYVPTSYVEVCLDKNAKDS
        ::::::::..: :.      
CCDS74 GEGYVPTSYLRVTLN      
        590       600       

>>CCDS60192.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1             (547 aa)
 initn: 1884 init1: 983 opt: 1386  Z-score: 932.5  bits: 182.5 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 2110; 52.1% identity (76.3% similar) in 624 aa overlap (1-617:1-547)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
       ::::::::::::.:.::::::::.::.: :::::: ::: .:::::::: ::: ::..::
CCDS60 MSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
       .::  ..::: ::.. :::.::::::.::..:.:: ..  .: ::...:: ::: ....:
CCDS60 DEEP-RFTSCVAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAHRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEG
                70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
       :::::... ::::...::..:::.:.::..::: .:..: : :.::::::::.:: ..: 
CCDS60 RKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATKADVEKAKQQLNLRT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
       .::...: .:.. ::.:: :::..... ::.:....:::.::: ....: .. .:. .:.
CCDS60 HMADENKNEYAAQLQNFNGEQHKHFYVVIPQIYKQLQEMDERRTIKLSECYRGFADSERK
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
       :::::.:::.:.. ::.:.:.. :::.:....:::::::::. ::::.: . ::.::...
CCDS60 VIPIISKCLEGMILAAKSVDERRDSQMVVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTI
     240       250       260       270       280       290         

               310        320       330       340       350        
pF1KSD SNSRGE-GKPDLKFG-GKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQ
       : :. : :: : :   ::.::::: : ::                          :.:: 
CCDS60 SASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKK--------------------------PKGP-
     300       310       320                                 330   

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD SPKQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKV
                                  .:            ::::.::::::::::::..
CCDS60 ---------------------------AL------------EDFSHLPPEQRRKKLQQRI
                                                   340       350   

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD DELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAW
       ::::.:.::: ::.::..:::::: ::::::::.::. ::::. .::..::.: .: :::
CCDS60 DELNRELQKESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMEIHKNEAW
           360       370       380       390       400       410   

      480       490       500       510        520           530   
pF1KSD LAEVEGRLPARSEQARRQSGLYDSQNPPTVNN-CAQDRESPDGSYTEEQSQE----SEMK
       :.::::.  .:..  ::.:.         .:.  .: ::::.::::.. .::     ...
CCDS60 LSEVEGKTGGRGD--RRHSS--------DINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQH
           420         430               440       450       460   

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD VLATDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRR
          ..:::::.:..:::::: :::.: :.:.::::... :::.::.::::::::::: ::
CCDS60 GHHNEFDDEFEDDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARR
           470       480       490       500       510       520   

           600       610       
pF1KSD NEDEEGYVPTSYVEVCLDKNAKDS
       .. :::::::::..: :.::.: :
CCDS60 QNGEEGYVPTSYIDVTLEKNSKGS
           530       540       

>>CCDS53344.1 FNBP1L gene_id:54874|Hs108|chr1             (551 aa)
 initn: 1880 init1: 983 opt: 1386  Z-score: 932.5  bits: 182.5 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 2106; 51.9% identity (76.0% similar) in 622 aa overlap (1-615:1-545)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
       ::::::::::::.:.::::::::.::.: :::::: ::: .:::::::: ::: ::..::
CCDS53 MSWGTELWDQFDSLDKHTQWGIDFLERYAKFVKERIEIEQNYAKQLRNLVKKYCPKRSSK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
       .::  ..::: ::.. :::.::::::.::..:.:: ..  .: ::...:: ::: ....:
CCDS53 DEEP-RFTSCVAFFNILNELNDYAGQREVVAEEMAHRVYGELMRYAHDLKTERKMHLQEG
                70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
       :::::... ::::...::..:::.:.::..::: .:..: : :.::::::::.:: ..: 
CCDS53 RKAQQYLDMCWKQMDNSKKKFERECREAEKAQQSYERLDNDTNATKADVEKAKQQLNLRT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
       .::...: .:.. ::.:: :::..... ::.:....:::.::: ....: .. .:. .:.
CCDS53 HMADENKNEYAAQLQNFNGEQHKHFYVVIPQIYKQLQEMDERRTIKLSECYRGFADSERK
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
       :::::.:::.:.. ::.:.:.. :::.:....:::::::::. ::::.: . ::.::...
CCDS53 VIPIISKCLEGMILAAKSVDERRDSQMVVDSFKSGFEPPGDFPFEDYSQHIYRTISDGTI
     240       250       260       270       280       290         

               310        320       330       340       350        
pF1KSD SNSRGE-GKPDLKFG-GKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQ
       : :. : :: : :   ::.::::: : ::                          :.:: 
CCDS53 SASKQESGKMDAKTTVGKAKGKLWLFGKK--------------------------PKGPA
     300       310       320                                 330   

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD SPKQQKEPLSHRFNEFMTSKPKIHCFRSLKRGLSLKLGATPEDFSNLPPEQRRKKLQQKV
                                                ::::.::::::::::::..
CCDS53 L----------------------------------------EDFSHLPPEQRRKKLQQRI
                                                   340       350   

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD DELNKEIQKEMDQRDAITKMKDVYLKNPQMGDPASLDHKLAEVSQNIEKLRVETQKFEAW
       ::::.:.::: ::.::..:::::: ::::::::.::. ::::. .::..::.: .: :::
CCDS53 DELNRELQKESDQKDALNKMKDVYEKNPQMGDPGSLQPKLAETMNNIDRLRMEIHKNEAW
           360       370       380       390       400       410   

      480       490       500       510        520           530   
pF1KSD LAEVEGRLPARSEQARRQSGLYDSQNPPTVNN-CAQDRESPDGSYTEEQSQE----SEMK
       :.::::.  .:..  ::.:.         .:.  .: ::::.::::.. .::     ...
CCDS53 LSEVEGKTGGRGD--RRHSS--------DINHLVTQGRESPEGSYTDDANQEVRGPPQQH
           420         430               440       450       460   

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD VLATDFDDEFDDEEPLPAIGTCKALYTFEGQNEGTISVVEGETLYVIEEDKGDGWTRIRR
          ..:::::.:..:::::: :::.: :.:.::::... :::.::.::::::::::: ::
CCDS53 GHHNEFDDEFEDDDPLPAIGHCKAIYPFDGHNEGTLAMKEGEVLYIIEEDKGDGWTRARR
           470       480       490       500       510       520   

           600       610           
pF1KSD NEDEEGYVPTSYVEVCLDKNAKDS    
       .. :::::::::..: :.::.:      
CCDS53 QNGEEGYVPTSYIDVTLEKNSKGAVTYI
           530       540       550 

>>CCDS12172.1 TRIP10 gene_id:9322|Hs108|chr19             (545 aa)
 initn: 1891 init1: 1217 opt: 1322  Z-score: 890.2  bits: 174.6 E(32554): 2.9e-43
Smith-Waterman score: 1903; 47.6% identity (75.6% similar) in 614 aa overlap (1-611:1-545)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSWGTELWDQFDNLEKHTQWGIDILEKYIKFVKERTEIELSYAKQLRNLSKKYQPKKNSK
       :.:::::::::. ::.:::::.:.:..:.::::::::.: .::::::.: ::: ::. .:
CCDS12 MDWGTELWDQFEVLERHTQWGLDLLDRYVKFVKERTEVEQAYAKQLRSLVKKYLPKRPAK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EEEEYKYTSCKAFISNLNEMNDYAGQHEVISENMASQIIVDLARYVQELKQERKSNFHDG
       .. : :... ..:.. :.:.::.:::.:...::.. .. ..:..: ::.::::: .:..:
CCDS12 DDPESKFSQQQSFVQILQEVNDFAGQRELVAENLSVRVCLELTKYSQEMKQERKMHFQEG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKAQQHIETCWKQLESSKRRFERDCKEADRAQQYFEKMDADINVTKADVEKARQQAQIRH
       :.:::..:. .::::.:::.:::::.::..: :  :..: :::.::::::::.:::..: 
CCDS12 RRAQQQLENGFKQLENSKRKFERDCREAEKAAQTAERLDQDINATKADVEKAKQQAHLRS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QMAEDSKADYSSILQKFNHEQHEYYHTHIPNIFQKIQEMEERRIVRMGESMKTYAEVDRQ
       .:::.:: .:.. ::.::..: ..: ...:.::.:.:.:.::: .:.: ..   .:.. .
CCDS12 HMAEESKNEYAAQLQRFNRDQAHFYFSQMPQIFDKLQDMDERRATRLGAGYGLLSEAELE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VIPIIGKCLDGIVKAAESIDQKNDSQLVIEAYKSGFEPPGDIEFEDYTQPMKRTVSDNSL
       :.:::.:::.:.  ::...: ::::...:: .::::  :::.::::..:::.:. ::.::
CCDS12 VVPIIAKCLEGMKVAANAVDPKNDSHVLIELHKSGFARPGDVEFEDFSQPMNRAPSDSSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SNSRGEGKPDLKFGGKSKGKLWPFIKKNKLMSLLTSPHQPPPPPPASASPSAVPNGPQSP
       . . ..:.:.:.  :.:. : ::: ::::  ...:                         
CCDS12 G-TPSDGRPELRGPGRSRTKRWPFGKKNK--TVVT-------------------------
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        ..:.:::.:::.:. :::::: :.:::::::::. ..::. .:::.:..:.::.:::::
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       :.:.: :  :...  :..   :  .. ::  .. . .... ..:  :  :.::.   . :
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       ::::::::..: :.      
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