Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0470, 1460 aa
  1>>>pF1KSDA0470 1460 - 1460 aa - 1460 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5706+/-0.00109; mu= 8.6433+/- 0.066
 mean_var=171.0230+/-34.557, 0's: 0 Z-trim(107.7): 51  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.098072
 statistics sampled from 9734 (9766) to 9734 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.3), width:  16
 Scan time:  4.110

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44338.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1         (1460) 9409 1344.8       0
CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1         (1486) 7242 1038.2       0
CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1         (1584) 4452 643.5 1.5e-183
CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14     (1554)  635 103.4 5.5e-21
CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14     (1519)  400 70.1 5.6e-11


>>CCDS44338.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1              (1460 aa)
 initn: 9409 init1: 9409 opt: 9409  Z-score: 7199.8  bits: 1344.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9409; 99.9% identity (100.0% similar) in 1460 aa overlap (1-1460:1-1460)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASALKTTRLQSAGSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASALKTTRLQSAGSA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD MPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD TTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD GDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD DKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460
pF1KSD SIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
       ::::::::::::::::::::
CCDS44 SIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
             1450      1460

>>CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1              (1486 aa)
 initn: 8757 init1: 7242 opt: 7242  Z-score: 5542.6  bits: 1038.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9224; 96.9% identity (96.9% similar) in 1496 aa overlap (1-1460:1-1486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAGHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLEEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DQAVVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIRER
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRSTD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTPLT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELAD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120                    
pF1KSD RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSAS-------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
CCDS44 RTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASVNSRWRRFPTDYA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

                             1130      1140      1150      1160    
pF1KSD -----------------------ALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAH
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWTAH
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

         1170      1180      1190      1200      1210      1220    
pF1KSD REEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     
CCDS44 REEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREE-----
             1210      1220      1230      1240      1250          

         1230      1240      1250      1260      1270      1280    
pF1KSD GEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSR
            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----LVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSR
             1260      1270      1280      1290      1300      1310

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KSD DEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKT
             1320      1330      1340      1350      1360      1370

         1350      1360      1370      1380      1390      1400    
pF1KSD SSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHH
             1380      1390      1400      1410      1420      1430

         1410      1420      1430      1440      1450      1460
pF1KSD SPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
             1440      1450      1460      1470      1480      

>>CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1              (1584 aa)
 initn: 8743 init1: 4442 opt: 4452  Z-score: 3408.8  bits: 643.5 E(32554): 1.5e-183
Smith-Waterman score: 8579; 90.5% identity (90.6% similar) in 1528 aa overlap (67-1460:67-1584)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD RSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLF
         40        50        60        70        80        90      

        100       110       120       130       140       150      
pF1KSD TVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTE
        100       110       120       130       140       150      

        160       170       180       190       200       210      
pF1KSD ALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS44 ALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDA
        160       170       180       190       200       210      

        220       230       240       250       260       270      
pF1KSD KQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQVEEQSAAANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGAG
        220       230       240       250       260       270      

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD HASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHKSKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADW
        280       290       300       310       320       330      

        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD LAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATL
        340       350       360       370       380       390      

        400       410       420                                    
pF1KSD EEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQDQAV--------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::                                
CCDS44 EEHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQDQAVTSSAHHRGGHGVPHGKLLKQKSEEPSVSIPFL
        400       410       420       430       440       450      

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS44 QTALLRSSGSLGHRPSQEMDKMLKNQATSATSEKDNDDDQSDKGTYTIELENPNSEEVEA
        460       470       480       490       500       510      

                430       440       450       460       470        
pF1KSD ------VFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTS
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKMIDKVFGVDDNQDYNRPVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTS
        520       530       540       550       560       570      

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD SSGSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSGSKRWVSQWASLAANHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLAS
        580       590       600       610       620       630      

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD QGERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QGERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADR
        640       650       660       670       680       690      

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD PLSKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PLSKMNRAVNGETLKTGGDNKTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREE
        700       710       720       730       740       750      

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AQWTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQWTPTKLSSKNVSGQTDKCREETFKQESQPPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEIL
        760       770       780       790       800       810      

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD KSQTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KSQTPKGGDKKESSKSLVRQGSFTIEKPSPNIPIELIPHINKQTSSTPSSLALTSASRIR
        820       830       840       850       860       870      

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD ERSESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERSESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVD
        880       890       900       910       920       930      

      840       850       860       870       880       890        
pF1KSD TASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSPSKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSRS
        940       950       960       970       980       990      

      900       910       920       930       940       950        
pF1KSD TDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRTP
       1000      1010      1020      1030      1040      1050      

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KSD LTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSEL
       1060      1070      1080      1090      1100      1110      

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KSD ADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGRRNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSA
       1120      1130      1140      1150      1160      1170      

     1080      1090      1100      1110      1120                  
pF1KSD SSRTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSAS-----------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
CCDS44 SSRTAEAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASVNSRWRRFPTD
       1180      1190      1200      1210      1220      1230      

                               1130      1140      1150      1160  
pF1KSD -------------------------ALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWT
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YASTSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQEDYIRDWT
       1240      1250      1260      1270      1280      1290      

           1170      1180      1190      1200      1210      1220  
pF1KSD AHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREEVGD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS44 AHREEIARISQDLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREE---
       1300      1310      1320      1330      1340      1350      

           1230      1240      1250      1260      1270      1280  
pF1KSD LHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTW
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -------LVDRVFDESLNFRKIPPLVHSKTPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTW
                 1360      1370      1380      1390      1400      

           1290      1300      1310      1320      1330      1340  
pF1KSD SRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIV
       1410      1420      1430      1440      1450      1460      

           1350      1360      1370      1380      1390      1400  
pF1KSD KTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNN
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

           1410      1420      1430      1440      1450      1460
pF1KSD HHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
       1530      1540      1550      1560      1570      1580    

>--
 initn: 439 init1: 439 opt: 439  Z-score: 340.2  bits: 75.7 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 439; 100.0% identity (100.0% similar) in 66 aa overlap (1-66:1-66)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
       ::::::                                                      
CCDS44 GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
               70        80        90       100       110       120

>>CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14          (1554 aa)
 initn: 1933 init1: 635 opt: 635  Z-score: 490.2  bits: 103.4 E(32554): 5.5e-21
Smith-Waterman score: 2000; 32.9% identity (56.8% similar) in 1554 aa overlap (1-1379:1-1487)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDL
       :: ::::::::.:.:::::::.:::::..:::::::::::::::::::: . ::: ::::
CCDS45 MSATSWFLVSSSGARHRLPRELIFVGREECELMLQSRSVDKQHAVINYDQDRDEHWVKDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQ
       ::::::::::.:::.: :.::::.: .:::::.:.... . . :::::::::::.: :::
CCDS45 GSLNGTFVNDMRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP
       .: :.   . :..   ..   ....   :         :....    .:  : :::::::
CCDS45 VSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KGDRRPGTEAASYR-TPLYGQP
              130       140                150       160        170

              190       200       210       220         230        
pF1KSD SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSA--AANEEVLFPFCREP
       ::::.:. .     . .:.:  .  ..        ..:  :  .  :  :     : :::
CCDS45 SWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKG-------PVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREP
              180       190              200       210       220   

      240       250       260       270           280       290    
pF1KSD SYFEIPTKEFQQPSQITESTIHEIPTKDTPSSHITGA----GHASFTIEFDDSTPGKVTI
       :::::::::  ::::  :   ::.::::. ..   .:    .:::::::::: .:::. :
CCDS45 SYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKI
           230       240       250       260       270       280   

          300        310       320       330       340       350   
pF1KSD RDHVTKFTSDQRHK-SKKSSPGTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEED
       .::.:::.  ::.  .:...::          :.. :.::::::.::.:  .      .:
CCDS45 KDHITKFSLRQRRPPGKEATPGE---------MVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDD
           290       300                310       320       330    

           360       370       380       390          400       410
pF1KSD SKSIKSDVPVYLKRLKGNKHDDGTQSDSENAGAHRRCSKRATLE---EHLRRHHSEHKKL
        .: :::.::. . :::.::.::::::::.  :.   .  . ::   :..: ... ..  
CCDS45 RHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDP
          340       350       360       370       380       390    

              420          430                 440       450       
pF1KSD QKVQATEKHQDQAVV---FGVDD-----NQDYNR-----PVINEKHKDLIKDWALSSAAA
       :..     :..:: :   :  :      .:....     :  ....     :    :. :
CCDS45 QELL----HNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPA
              400       410       420       430       440       450

       460           470           480       490        500        
pF1KSD VMEE--RK--PLTTSGFHH--SEE--GTSSSGSKRWVSQWASLAA-NHTRHDQEERIMEF
        ..   :.  :  ......  .::  :. : .:.  .  ..:..  ..  .:   . .. 
CCDS45 PVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRE
              460       470       480       490       500       510

      510       520       530       540       550       560        
pF1KSD SAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQR
       :.:    .  ..     .  .  ... ..        : ::: . .:. :.   . .   
CCDS45 SSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTY
              520       530       540       550       560       570

      570       580                            590                 
pF1KSD SEIGEKQDTELQEK-----------ETPT----------QVYQKDKQDAD----------
       .   : ::::..:            :.:            : . :....:          
CCDS45 TIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMAL
              580       590       600       610       620       630

             600       610         620            630              
pF1KSD ------RPLSKMNRAVNGETLKTG--GDNKTLLHLGS-----SAPGKEKSETDK-----E
             :::.   .: .      :  : .: . . .:     : ::  ..   .     :
CCDS45 LQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPE
              640       650       660       670       680       690

     640       650        660       670       680          690     
pF1KSD TSLVKQTLAKLQQ-QEQREEAQWTPTKLSSKNVSGQTDKCREET---FKQESQPPEKNSG
        ::  .   .: :   .: ..   : . : ..  :  .   :.    : ::   :.. : 
CCDS45 GSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPES-SRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSD
              700       710        720       730       740         

         700            710                   720              730 
pF1KSD HSTSKGDR-----VAQSESKRRKAEE------------ILKSQTP-------KGGDKKES
        : : : :     :  ..:.::. .:                 ::       ..::   :
CCDS45 ASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLS
     750       760       770       780       790       800         

             740                       750                         
pF1KSD SKSLVRQGSFT----IEKPSP------------NIPIELIP-----------------HI
        : :.  :.        .:::             . :.: :                  .
CCDS45 RKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESF
     810       820       830       840       850       860         

      760       770               780       790       800       810
pF1KSD NKQTSSTPSSLA----LTSASRIRE----RSESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKL
       .:. .: : . .    ..:   ...    :.  .:  :. :: ::::.::...: :::.:
CCDS45 TKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQ-DTHLILKETETALAALEARL
     870       880       890       900        910       920        

                 820       830       840       850       860       
pF1KSD REDNKTD---EGPDTPSYNRDNSISPESDVDTASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKD
         .:..:   :: .::   .: ..: .::::::::.:: .:    ::  .  .   :  .
CCDS45 L-SNSVDAECEGGSTPRPPED-ALSGDSDVDTASTVSLRSG----KSGPSPTTPQPLRAQ
       930       940        950       960           970       980  

       870         880       890         900       910       920   
pF1KSD RCSTGSP--SKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSR--STDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVD
       .  . ::  ..:   ..  .:::.  .. .     ::.:     :. .   :.  . :.:
CCDS45 KEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLD
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

           930       940       950            960       970        
pF1KSD LTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRT-----PLTSADEHVHSKLEGSKVTKS
         ....   . :   ::.:.:..::      ::      : .     .  . .. . ..:
CCDS45 WPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASS
           1050      1060      1070      1080      1090      1100  

      980       990      1000      1010      1020      1030        
pF1KSD KTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSK
       . .:    . ..:..:  :::::.: :::::::.:::.: ::....:...       ...
CCDS45 QKGP---QALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP----EPVGR
              1110      1120      1130      1140      1150         

     1040       1050      1060      1070      1080      1090       
pF1KSD PPTGR-RNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASSRTAEAIIRSGARLVPSD
       : . . ...::.:.::.::. : ::... :: ::. .:.: :.:..:    :    .   
CCDS45 PAAEQAKKLSRLDILAMPRK-RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEA
        1160      1170       1180      1190      1200      1210    

      1100      1110      1120      1130      1140            1150 
pF1KSD KFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSASALKTTRLQSAGSA------MPTSSSFKHRI
       .   :  ::. .  .  .  : . . :::   .::.   :::.       :   .     
CCDS45 RAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARS-GSARYTSTTQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDE
         1220      1230       1240      1250      1260      1270   

             1160      1170          1180      1190      1200      
pF1KSD KEQEDY-IRDWTAHREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTA
       .: . : .   ::.  ::::.::    :.:..:.::.::::. :.. ::  : :...:. 
CCDS45 EEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNM
          1280      1290      1300      1310      1320      1330   

       1210      1220      1230      1240       1250      1260     
pF1KSD ATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPP-LVHSKTPEGNNGRSGDPRP
        .::.:.:..:::          ::.:. . ::::.:.::  ..:.  . : . : .   
CCDS45 PSTPASTISAREE----------LVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCE---
          1340                1350      1360      1370      1380   

        1270      1280      1290      1300      1310      1320     
pF1KSD QAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKTAGKIRILFKDKDRN
             : :. .. :  .:.::. :::.:. : :.:. ::.. .. : :..:::..  : 
CCDS45 ------DALA-NKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRA
                    1390      1400      1410      1420      1430   

        1330      1340      1350      1360      1370      1380     
pF1KSD WDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALNNMGFP
       :.:.:... ::.::::.:::. ::::::.::.::.:::..:::..::.:.:. :      
CCDS45 WEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSL
          1440      1450      1460      1470      1480      1490   

        1390      1400      1410      1420      1430      1440     
pF1KSD SAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFN
                                                                   
CCDS45 ASSAQPGLGKGRVAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFL
          1500      1510      1520      1530      1540      1550   

>>CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14          (1519 aa)
 initn: 1525 init1: 356 opt: 400  Z-score: 310.6  bits: 70.1 E(32554): 5.6e-11
Smith-Waterman score: 1409; 29.2% identity (53.4% similar) in 1552 aa overlap (112-1452:42-1515)

              90       100       110       120       130       140 
pF1KSD KLEDKLRFGYDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDS
                                     :::.: :::.: :.   . :..   ..   
CCDS45 KLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYC
              20        30        40        50        60        70 

             150       160       170       180       190       200 
pF1KSD KVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPE
       ....   :         :....    .:  : :::::::::::.:. .     . .:.: 
CCDS45 EASNPRPE---------KGDRRPGTEAASYR-TPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPY
                       80        90        100       110       120 

             210       220         230       240       250         
pF1KSD EKNHEAGTSGCSIDAKQVEEQSA--AANEEVLFPFCREPSYFEIPTKEFQQPSQITESTI
        .  ..        ..:  :  .  :  :     : ::::::::::::  ::::  :   
CCDS45 PERPKG-------PVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPA
                    130       140       150       160       170    

     260       270           280       290       300        310    
pF1KSD HEIPTKDTPSSHITGA----GHASFTIEFDDSTPGKVTIRDHVTKFTSDQRHK-SKKSSP
       ::.::::. ..   .:    .:::::::::: .:::. :.::.:::.  ::.  .:...:
CCDS45 HEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATP
          180       190       200       210       220       230    

          320       330       340       350       360       370    
pF1KSD GTQDLLGIQTGMMAPENKVADWLAQNNPPQMLWERTEEDSKSIKSDVPVYLKRLKGNKHD
       :          :.. :.::::::.::.:  .      .: .: :::.::. . :::.::.
CCDS45 GE---------MVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHE
                   240       250       260       270       280     

          380       390          400       410       420           
pF1KSD DGTQSDSENAGAHRRCSKRATLE---EHLRRHHSEHKKLQKVQATEKHQDQAVV---FGV
       ::::::::.  :.   .  . ::   :..: ... ..  :..     :..:: :   :  
CCDS45 DGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELL----HNQQAFVIEFFDE
         290       300       310       320           330       340 

      430                 440       450       460           470    
pF1KSD DD-----NQDYNR-----PVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEE--RK--PLTTSGFHH--
       :      .:....     :  ....     :    :. : ..   :.  :  ......  
CCDS45 DTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREK
             350       360       370       380       390       400 

              480       490        500       510       520         
pF1KSD SEE--GTSSSGSKRWVSQWASLAA-NHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRS
       .::  :. : .:.  .  ..:..  ..  .:   . .. :.:    .  ..     .  .
CCDS45 TEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLT
             410       420       430       440       450       460 

     530       540       550       560       570       580         
pF1KSD TGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEEKSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEK-------
         ... ..        : ::: . .:. :.   . .   .   : ::::..:        
CCDS45 PHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQV
             470       480       490       500       510       520 

                          590                       600       610  
pF1KSD ----ETPT----------QVYQKDKQDAD----------------RPLSKMNRAVNGETL
           :.:            : . :....:                :::.   .: .    
CCDS45 FGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLP
             530       540       550       560       570       580 

              620            630            640       650          
pF1KSD KTG--GDNKTLLHLGS-----SAPGKEKSETDK-----ETSLVKQTLAKLQQ-QEQREEA
         :  : .: . . .:     : ::  ..   .     : ::  .   .: :   .: ..
CCDS45 VPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADS
             590       600       610       620       630       640 

     660       670       680          690       700            710 
pF1KSD QWTPTKLSSKNVSGQTDKCREET---FKQESQPPEKNSGHSTSKGDR-----VAQSESKR
          : . : ..  :  .   :.    : ::   :.. :  : : : :     :  ..:.:
CCDS45 PAGPES-SRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDSRR
              650       660       670       680       690       700

                         720              730       740            
pF1KSD RKAEE------------ILKSQTP-------KGGDKKESSKSLVRQGSFT----IEKPSP
       :. .:                 ::       ..::   : : :.  :.        .:::
CCDS45 RSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSP
              710       720       730       740       750       760

                  750                        760       770         
pF1KSD ------------NIPIELIP-----------------HINKQTSSTPSSLA----LTSAS
                    . :.: :                  ..:. .: : . .    ..:  
CCDS45 PARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHP
              770       780       790       800       810       820

             780       790       800       810          820        
pF1KSD RIRE----RSESLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTD---EGPDTPSYNRD
        ...    :.  .:  :. :: ::::.::...: :::.:  .:..:   :: .::   .:
CCDS45 LLQDLAATRAARMDFHSQ-DTHLILKETETALAALEARLL-SNSVDAECEGGSTPRPPED
              830        840       850        860       870        

      830       840       850       860       870         880      
pF1KSD NSISPESDVDTASTISLVTGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTGSP--SKDVTKSSSSGA
        ..: .::::::::.:: .:    ::  .  .   :  ..  . ::  ..:   ..  .:
CCDS45 -ALSGDSDVDTASTVSLRSG----KSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSA
       880       890           900       910       920       930   

        890         900       910       920       930       940    
pF1KSD REKMEKKTKSR--STDVGSRADGRKFVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSS
       ::.  .. .     ::.:     :. .   :.  . :.:  ....   . :   ::.:.:
CCDS45 REQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMAS
           940       950       960       970       980       990   

          950            960       970       980       990         
pF1KSD DQETYSCKPHGRT-----PLTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRP
       ..::      ::      : .     .  . .. . ..:. .:    . ..:..:  :::
CCDS45 NHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASSQKGP---QALTRSNSLSTPRP
          1000      1010      1020      1030         1040      1050

    1000      1010      1020      1030      1040       1050        
pF1KSD TRTSLLRRARLGEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGR-RNISRIDLLAQPRRT
       ::.: :::::::.:::.: ::....:...       ...: . . ...::.:.::.::. 
CCDS45 TRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGN----PEPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRK-
             1060      1070          1080      1090      1100      

     1060      1070      1080                    1090          1100
pF1KSD RLGSLSARSDSEATISRSSASSRTAE--------------AIIRSGARLV----PSDKFS
       : ::... :: ::. .:.: :.:..:              :. :..:  .    : . ::
CCDS45 RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFS
        1110      1120      1130      1140      1150      1160     

             1110      1120               1130       1140          
pF1KSD PRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSAS---------ALKTTRLQ-SAGSAMP---TSSSF
        : :..:    :... ... : . :.:         . : :: . :...  :   .::  
CCDS45 -RARSGSARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRA
         1170      1180      1190      1200      1210      1220    

      1150      1160                 1170          1180      1190  
pF1KSD KHRIKEQEDYIRD-----------WTAHREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSV
       . :    .:   :            ::.  ::::.::    :.:..:.::.::::. :..
CCDS45 RSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTL
         1230      1240      1250      1260      1270      1280    

           1200      1210      1220      1230      1240       1250 
pF1KSD TSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDTREEVGDLHGEMHKLVDRVFDESLNFRKIPP-LVHSK
        ::  : :...:.  .::.:.:..:::          ::.:. . ::::.:.::  ..:.
CCDS45 GSSEPAHSASLSNMPSTPASTISAREE----------LVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSR
         1290      1300      1310                1320      1330    

            1260      1270      1280      1290      1300      1310 
pF1KSD TPEGNNGRSGDPRPQAAEPPDHLTITRRRTWSRDEVMGDNLLLSSVFQFSKKIRQSIDKT
         . : . : .         : :. .. :  .:.::. :::.:. : :.:. ::.. .. 
CCDS45 DFDQNMNDSCE---------DALA-NKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHL
         1340                1350      1360      1370      1380    

            1320      1330      1340      1350      1360      1370 
pF1KSD AGKIRILFKDKDRNWDDIESKLRAESEVPIVKTSSMEISSILQELKRVEKQLQAINAMID
       : :..:::..  : :.:.:... ::.::::.:::. ::::::.::.::.:::..:::..:
CCDS45 AEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVD
         1390      1400      1410      1420      1430      1440    

            1380       1390      1400      1410      1420      1430
pF1KSD PDGTLEALN-NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHHSPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAE
       :.:.:. :. : .. :.  :.  : . .        .:.:  .   :.:: ::      .
CCDS45 PSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGRVA--------AQSPP-SPASAEALLPAL--PLRN
         1450      1460      1470               1480        1490   

             1440      1450      1460
pF1KSD FENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE
       : .  : .  :.    : ::.:        
CCDS45 FPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI    
          1500      1510             




1460 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 01:50:26 2016 done: Thu Nov  3 01:50:26 2016
 Total Scan time:  4.110 Total Display time:  0.350

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com