Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0463
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0463, 1909 aa
  1>>>pF1KSDA0463 1909 - 1909 aa - 1909 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2582+/-0.00127; mu= 19.5734+/- 0.076
 mean_var=83.8741+/-16.391, 0's: 0 Z-trim(102.7): 61  B-trim: 45 in 1/48
 Lambda= 0.140043
 statistics sampled from 7026 (7080) to 7026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.217), width:  16
 Scan time:  5.760

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1         (1894) 12734 2584.1       0
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7        (1894) 8751 1779.4       0
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3         (1896) 8269 1682.0       0
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX        (1871) 7671 1561.2       0
CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7         ( 522) 1763 367.3 8.8e-101
CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7        ( 492) 1718 358.2 4.6e-98
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX         (1909) 1623 339.2   9e-92
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX         (1932) 1623 339.2 9.1e-92
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22       (1838) 1128 239.2 1.1e-61
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3        (1925) 1028 219.0 1.4e-55
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3          (2135)  902 193.6 7.1e-48
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12        (1568)  733 159.4   1e-37
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1390)  470 106.2 9.1e-22
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1408)  470 106.2 9.2e-22
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1351)  316 75.1 2.1e-12
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3           (1400)  316 75.1 2.1e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1294)  313 74.5   3e-12


>>CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1              (1894 aa)
 initn: 12734 init1: 12734 opt: 12734  Z-score: 13893.3  bits: 2584.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12734; 99.9% identity (99.9% similar) in 1894 aa overlap (16-1909:1-1894)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSTHRSRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
                      :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31                MEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSEN
                              10        20        30        40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RDWTFNHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSE
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLTLTNNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKT
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GTMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GTMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSL
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD IKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCK
         230       240       250       260       270       280     

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD DDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ
         290       300       310       320       330       340     

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD YHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFC
       ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKERLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFC
         350       360       370       380       390       400     

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPH
         410       420       430       440       450       460     

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGD
         470       480       490       500       510       520     

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDA
         530       540       550       560       570       580     

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD PDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PDLSAGIACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKI
         590       600       610       620       630       640     

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FVSTEFKFYNCSAHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRINISEDCPQLV
         650       660       670       680       690       700     

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD PTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNS
         710       720       730       740       750       760     

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGW
         770       780       790       800       810       820     

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD CSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGL
         830       840       850       860       870       880     

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD DFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKS
         890       900       910       920       930       940     

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD HQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIV
         950       960       970       980       990      1000     

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD CVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFN
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD LDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNN
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLI
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD GETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GETPCAVTVSETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAG
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD GSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTS
        1250      1260      1270      1280      1290      1300     

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD DLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFL
        1310      1320      1330      1340      1350      1360     

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD LTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKL
        1370      1380      1390      1400      1410      1420     

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD LLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSL
        1430      1440      1450      1460      1470      1480     

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD SEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQR
        1490      1500      1510      1520      1530      1540     

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD PRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSY
        1550      1560      1570      1580      1590      1600     

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KSD NIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKE
        1610      1620      1630      1640      1650      1660     

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KSD GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD
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             1750      1760      1770      1780      1790      1800
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFN
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
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       :: .:.::.::.:::...: . :.:.:::.::: .:::: ::: :.: :: ::::::.:.
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       :::.::::.::::::::.::::::.::: : :: ::::::::.::..:...::::   . 
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       : ::::.:::::: .::::.::::: .. :...:. : .:..::.:.:::::::....  
CCDS43 DDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIPD
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       :::.:.:::.::.::::::.:::  .: :   ... .  :::..:::::.:  :.::: .
CCDS43 FDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPG---STTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV
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pF1KSD PFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALC
       :.:: :.::::::::::::.: :  :......  .::.::..::::::.  .  :.::::
CCDS43 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALC
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pF1KSD AFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCGLDINQPLGGS
        : .. :: .:: ::::::.:::.:.: ::  ::. :..: . :::::::::.: ::: :
CCDS43 IFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVS
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pF1KSD TPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVL
         :.:. ..: .::::::: .:::...:..:::::::::::::.:::  ...::: :.:.
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         : :.::::::: :.. ::.:::::.:::::::: :: .:::::.:::::::::.::: 
CCDS43 DPG-PVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGSGDPHCGWCVLHNT
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pF1KSD CSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAPDLSAGIACAF
       :.:...:... :: :::. ..::: :.:::..::::... :: : . ..:.::::. :.:
CCDS43 CTRKERCERSKEPRRFASEMKQCVRLTVHPNNISVSQYNVLLVLETYNVPELSAGVNCTF
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        .:.:..: : :.:. : ::. :.:: .:  . :   ..:::.:::::  :.:: : :::
CCDS43 EDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENGDHHVVQLQLKSKETGMTFASTSFVFYN
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       ::.:. :::::.: .::::::::..::::: ::::::::... ::::::. ...::.:: 
CCDS43 CSVHNSCLSCVESPYRCHWCKYRHVCTHDPKTCSFQEGRVKLPEDCPQLLRVDKILVPVE
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pF1KSD EVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFNSSSVQCQNSSYQYDGMDIS
        .:::::::.::::::::::::::.:::::. .::::::::::::::::.::.:.::.:.
CCDS43 VIKPITLKAKNLPQPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPALRFNSSSVQCQNTSYSYEGMEIN
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       :: :...:::::.: :::: . :::::::.:.:::::::::::  : ::::.:  .:::.
CCDS43 NLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCGAMRESCGLCLKADPDFACGWCQGPGQCTLR
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       ::: .  : ::. :. . ::.::.::::. :.:: ::::.:::.: ::::.: .:: ::.
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       :::: :.::   :: :::::::::.:  .  .: :..:.. :.::::..: : : :.. .
CCDS43 VAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPSQHAGFVEICVAVCRPEFMARSSQLYYFMTLT
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pF1KSD VLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGL
       . .:.: ::: ::::.:::::  :.:::.:.:..:.: : :. :: : ::: .  ::. .
CCDS43 LSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAGSNVVVMFGKQPCLFHRRSPSYIVC-NTTSSDEV
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pF1KSD GPVPVSVSVDRAHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIR
         . :::.::::.. ..: :.:..:: . ::::::::.::.::... : .::.::.:.::
CCDS43 LEMKVSVQVDRAKIHQDLVFQYVEDPTIVRIEPEWSIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIR
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pF1KSD VKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNNVQSLLIYNDT
       .: .::: .:.:.:.:.: .:: ::.:.       : .:::.::::...::::::: : :
CCDS43 AKHGGKEHINICEVLNATEMTCQAPALALGPDHQSDLTERPEEFGFILDNVQSLLILNKT
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pF1KSD KFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGG-AKLNYTVLIGETPCAVTV
       .: :::::.:: ..:.:.:. :::.::::::::: ::..:: .:::::::.:: ::.:::
CCDS43 NFTYYPNPVFEAFGPSGILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGEKPCTVTV
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pF1KSD SETQLLCEPPNLTGQHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVI
       :..::::: ::: :.::::..:::: .::: : .  :: :.::::::::..:.::.:...
CCDS43 SDVQLLCESPNLIGRHKVMARVGGMEYSPGMVYIAPDSPLSLPAIVSIAVAGGLLIIFIV
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pF1KSD IVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPY
        :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::.
CCDS43 AVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIPF
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pF1KSD LDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLEL
       ::::::.:::::::::::::::.::: :  :..:::.:::::::::::::::.:::::: 
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       :::::::::::::::::: ::..::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::
CCDS43 QRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLADLIDKNLESKNHPKLLLRRTESVA
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       ::::::::.:::.:::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQ
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       :.::::.:.::.::: ::::.:::.::::::::::::::::..:::: :.::.:.:::::
CCDS43 IDYKTLVLSCVSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKEKILDAIFKNVPCSHRPKAADMDLE
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pF1KSD WRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASIS
       ::::  ::..:::::::::::.:::::::: :::: : :::::: ::...::   ....:
CCDS43 WRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVPDGSVVALVSKQVTAYNAVNNSTVS
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pF1KSD RTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKEGDRGSKMVS
       ::: :.:.. .::::::::::::.::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS43 RTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESGVKMWHLVKNHEHGDQKEGDRGSKMVS
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pF1KSD EIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTDV
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CCDS43 EIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHGIHDPHV
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CCDS43 RHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSP
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pF1KSD SNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIY
       ::::::::::::::.::::::.::.:.:::::::::::::::::.:  ::: .:::.::.
CCDS43 SNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMNEFNTMSALSEIF
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pF1KSD SYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
       :::.:::::..: :..:.:  .:.::::.::.:. ::..:
CCDS43 SYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS
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       :: : . :  :.::::::..::. ::::::::  ::.:..::::::: : :: :.:::::
CCDS33 VQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYL
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       :::...:.: ::.. .   .:  :::.:: .:::..::::::::.:  . :.. :. .  
CCDS33 SSVQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVY
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pF1KSD HSDFVSSLIKIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYT
       ...:::: .:::::::.    :::.:.:.: :  :::.::.: .: . .. ..::. :.:
CCDS33 QDEFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDT-QLTSPDAAGEHFFT
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pF1KSD SRIVRLCKDDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFA
       :.::::: :::::.::: .:.:: .:::::::.: :::..:: .::. .... ..::::.
CCDS33 SKIVRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFT
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pF1KSD IFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAP
       .:..:::.  .:: .:::: : .:::. .:: :.::::.:::.: : :::.:.. : ..:
CCDS33 VFAQGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSP
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       . :::.::: :.::::::.. .::  :.. . : .:.::.: : : .:::.::.::...:
CCDS33 LQIDDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRK
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       : .:    ::   . :: : : ..:::::::...: ...:::.:.:.:::::::::: ::
CCDS33 ILVDLSNPGGRPALAYESV-VAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQY
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       :.:  ::.: :::::::.::..::::: :..: ::.::::.. :::.:.:.: ..::.  
CCDS33 TSCELCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMS
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       .  : : . ..::::::. :.: ..:: :. .  ... : ::. ..: :.   . :   .
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       .: :.:::::: :.:..: :::::.:: ::::::..: :::::::..:::. . :.: ::
CCDS33 KLYLKSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEG
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       :.:.::::::..:. .: .::: :::::: ::::::::::::::::...: :.  :: ::
CCDS33 RVNVSEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTAL
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       ::::::.:::::::.:.: :.:.: :...:::::::.:::::....::::: : ::::::
CCDS33 RFNSSSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGL
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CCDS33 CLKADPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPAS-WMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQ
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       ::::.:: : :::: : ..   :.:. : :.:. .::: :::::::.: :  : . .. :
CCDS33 GGTRLTITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALV
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       ..:. .:.:.. . : ...:::.:.   ..: ::: :::: . : : .:.:::.::: .:
CCDS33 EVCVRDCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVG
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pF1KSD NQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQRIEPE
       .. : :  :.  :: :..::...  : .:. ....::.. . .....: .:: . ::.::
CCDS33 GRPCSFSWRNSREIRCLTPPGQSP-GSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPE
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pF1KSD WSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPG
       ::: :: : ::.:: :: ...:::::.:..: :  : : : : ::..: :::...  :  
CCDS33 WSINSGGTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSP
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pF1KSD LDTVERPDEFGFVFNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNL
        .  :::::.:::..::.:::. :.:.:.:::.:..: :::::.:. ::.::.::::.::
CCDS33 PELGERPDELGFVMDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGLLELKPSSPLILKGRNL
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        ::: :...:::::::: :::..:::::::::: ::::::::: :..::. ::::...: 
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       :::::::::::.:..::.:::.... ::::::::::. : ::::::.:::::::::::::
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       :.: ::.::...: :::::::::: ::::::::::::::::::.:::..:::: ::::::
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       ::::.::::.:::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQM
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       ::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::.:::.::.::: :.:::.::.:
CCDS33 EKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAK
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pF1KSD EKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQV
       ::.:::.::.:::::::.:.::::::::::.::..:::::.::::..:::::::: ::::
CCDS33 EKLLDAAYKGVPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQV
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       .: : :::::::::.:::  :..... :.:::.: .: ..::::::::.::::::::::.
CCDS33 TDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTK-SLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGT
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       :.::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::
CCDS33 KLWHLVKNHDHLDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSAL
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       ::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS33 PLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDA
            1720      1730      1740      1750      1760      1770 

         1790      1800      1810      1820      1830      1840    
pF1KSD CLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDM
       ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::
CCDS33 CLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDM
            1780      1790      1800      1810      1820      1830 

         1850      1860      1870      1880      1890      1900    
pF1KSD NAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINA
       .::::::::::  .:: .:::.:::::..::..:...:::.:::::::::  :.::....
CCDS33 SAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDT
            1840      1850      1860      1870      1880      1890 

            
pF1KSD MSIES
       :.. :
CCDS33 MALSS
            

>>CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX             (1871 aa)
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                                     :: :: ... : .  : :   : .:     
CCDS14                             MPSVCLLLLLF-LAVGGALGNRPFRAFVV--T
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       : :..::.::. :: :.:::.:::.::. :::   :: ::: :::  ::::  .. :.. 
CCDS14 DTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLAPNLTELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHR
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       :. ..:.::::.:::.  ::.::::..::.:..::::::: : :: :.::::::....  
CCDS14 LAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSGAQEPD
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pF1KSD TMYGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLI
       .: ::::..    .:::.:::::::..::::::::::  : .:. :..   ...:::: :
CCDS14 SMAGVIVEQGQGPSKLFVGTAVDGKSEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQI
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pF1KSD KIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKD
       :::::::.:   :::.:::::.:..::::::.: .: . . ...::. :.::.:::.:  
CCDS14 KIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSASFVYFLTLQLDTQQTL-LDTAGEKFFTSKIVRMCAG
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pF1KSD DPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQY
       : .:.::: .:.::.  ::::::.:.:.:::::  ::::... ...::::.:::.:::. 
CCDS14 DSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQSAHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNR
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pF1KSD HHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCG
         :: .. :: : .  :: .:. :.::::.:::.: : :::.:.. : ..:. :. ::::
CCDS14 ASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQSCYRGEGTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNFCG
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pF1KSD LDINQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHG
       : .::::::   .::: : . : : :.:::.:.:  .::::.::.::.:::.:.::   .
CCDS14 LVLNQPLGGLHVIEGLPLLADSTDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDA
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        . :: : :. ::::::::. :: :.:..:..::.::...:::.:::: .:. ::.::::
CCDS14 HL-YETVPVV-DGSPILRDLLFSPDHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDP
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pF1KSD HCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAP
       :::::.:.. : :.  :  :  :. ::  .:.::.. :.:...::.  .  :.... ..:
CCDS14 HCGWCVLRHRCCREGACLGASAPHGFAEELSKCVQVRVRPNNVSVTSPGVQLTVTLHNVP
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       :::::..:::   .: :. .  : ...: ::. ... ..   .     ..::: ::::: 
CCDS14 DLSAGVSCAFEAAAENEAVLLPSGELLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGV
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        :....: :::::. : :.:::.: . :::::::. ::  :  :::::::..  : ::..
CCDS14 RFAGADFVFYNCSVLQSCMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSRPHECSFQEGRVHSPEGCPEI
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       .:. ..::::: ..:.::.:.:::::::::..::::. .::  .::::.:::::::::::
CCDS14 LPSGDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQN
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pF1KSD SSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECG
       .::.:.: . ..  .::.:::.:.: ::.: .... :::: ::: ::::::::: .:.::
CCDS14 ASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCG
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pF1KSD WCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLG
       :: .:.:: :. :: .:.. :.  :.....::.:.::.:  . :: :::::::: : :::
CCDS14 WCISEHRCQLRTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLG
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pF1KSD LDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTS-GPVRLCIGECKPEFMT
       :   :..  ..:::: :. .:.::: ::.::::: ..:: .   :::.::.:.:. .: :
CCDS14 LLSREVG--LRVAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCVGDCSADFRT
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pF1KSD KSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE
       .:.: :.::.:.  ...: ::: :::: .::.:  : ::: :.: . .. :.:  :. . 
CCDS14 QSEQVYSFVTPTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSLDAGSRVTVTVRDSECQFVRRDAKA
          930       940       950       960       970       980    

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pF1KSD IVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDS-NLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTIT
       :::.:: :. : . .:.....:::...: .: . : .:: : :.:: ::: .: : .:..
CCDS14 IVCISPLSTLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVS
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pF1KSD GFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFV
       : .: ..::::.:.:. : :..:.:.:.: :.. : ::..           :.::::::.
CCDS14 GTHLLTVQEPRVRAKYRGIETTNTCQVINDTAMLCKAPGIFLGRPQPRAQGEHPDEFGFL
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pF1KSD FNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYT
       ...::.    : ..: :::.:.:: :.:.:::: :::: ..:::::: : :.:...::::
CCDS14 LDHVQTARSLNRSSFTYYPDPSFEPLGPSGVLDVKPGSHVVLKGKNLIPAAAGSSRLNYT
         1110      1120      1130      1140      1150      1160    

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       ::::  ::..:::.:::::. :. ::.. ::: :::. :  :.. . ..  :::::....
CCDS14 VLIGGQPCSLTVSDTQLLCDSPSQTGRQPVMVLVGGLEFWLGTLHISAERALTLPAMMGL
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       ::::.:::. .  ::.:::::... : ::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINE
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       ::. .:.  ::.:::::::.:::::::: ::::.::..  :    :::::.::.::....
CCDS14 LTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLFPGIEAHPVLKELDTPPN----VEKALRLFGQLLHSR
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       .:.::::.::: : ::::::::.:::: :..::.::.::: .:::::.:::.::::.:::
CCDS14 AFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSRLDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNH
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       ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEPLFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEAR
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       :::::::::::::.:::: :.:: :.::.: ..::::::::.:::.:.:.::.:::..::
CCDS14 YSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPY
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pF1KSD SQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQT
       ::::.: ::::::::::..:..:::::.::::: ::::::.: ::::.: :.:::::::.
CCDS14 SQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLNSLAHYQVTDGSLVALVPKQV
             1530      1540      1550      1560      1570      1580

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pF1KSD SSYNIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD
       :.::.  : ...: :.:::.: .: ..::::::::::::::: :.:.:.:::::::::.:
CCDS14 SAYNMANSFTFTR-SLSRYESLLRTASSPDSLRSRAPMITPDQETGTKLWHLVKNHDHAD
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pF1KSD QKEGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDE
       ..::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::
CCDS14 HREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDE
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pF1KSD QADRHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSC
       :::...: : :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 QADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSC
    1700      1710      1720      1730      1740      1750         

      1800      1810      1820      1830      1840      1850       
pF1KSD STSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAV
       :::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::. .::::::.:::.::::::: 
CCDS14 STSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHAS
    1760      1770      1780      1790      1800      1810         

      1860      1870      1880      1890      1900         
pF1KSD EFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
       .:..::::::.: ::.:: .:.. ::..: . :...:  :.::.:. .: .:
CCDS14 DFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKLEQIISLVSSDS
    1820      1830      1840      1850      1860      1870 

>>CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7              (522 aa)
 initn: 1717 init1: 971 opt: 1763  Z-score: 1922.8  bits: 367.3 E(32554): 8.8e-101
Smith-Waterman score: 1763; 55.0% identity (79.4% similar) in 491 aa overlap (44-526:31-513)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KSD LSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQG
                                     :: .  . .: ::..:  .  ::::.: . 
CCDS58 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAE-GFNHLVVDER
               10        20        30        40         50         

            80        90       100       110       120       130   
pF1KSD TGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLI
       :: .:.::.::.:::...: . :.:.:::.::: .:::: ::: :.: :: ::::::.:.
CCDS58 TGHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLL
      60        70        80        90       100       110         

           140       150       160       170       180       190   
pF1KSD IDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGE
       :::.::::.::::::::.::::::.::: : :: ::::::::.::..:...::::   . 
CCDS58 IDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSNL
     120       130       140       150       160       170         

           200       210       220       230       240       250   
pF1KSD DGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSH
       : ::::.:::::: .::::.::::: .. :...:. : .:..::.:.:::::::....  
CCDS58 DDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIPD
     180       190       200       210       220       230         

           260       270         280       290       300       310 
pF1KSD FDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPE--TPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSL
       :::.:.:::.::.::::::.:::  .: :   ... .  :::..:::::.:  :.::: .
CCDS58 FDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPG---STTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV
     240       250       260          270       280       290      

             320       330       340       350       360       370 
pF1KSD PFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALC
       :.:: :.::::::::::::.: :  :......  .::.::..::::::.  .  :.::::
CCDS58 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALC
        300       310       320       330       340       350      

             380       390       400       410       420       430 
pF1KSD AFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCGLDINQPLGGS
        : .. :: .:: ::::::.:::.:.: ::  ::. :..: . :::::::::.: ::: :
CCDS58 IFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVS
        360       370       380       390       400       410      

             440       450       460       470       480       490 
pF1KSD TPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVL
         :.:. ..: .::::::: .:::...:..:::::::::::  . :: .::.  : ..: 
CCDS58 DMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKSFGTGP-QGGITQEWIGV-
        420       430       440       450       460        470     

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pF1KSD KDGSPILRDMAFSIDQR---YLYVMSERQVT--RV-PVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGW
        .:.:   ..: : .:    ::   :.. ..  :: :.  :                   
CCDS58 -EGDPPGANIA-SQEQMLCVYLQCSSHKAISDQRVQPLLCCFLNVPGNSS          
           480        490       500       510       520            

         550       560       570       580       590       600     
pF1KSD CALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAPDLSA

>>CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7             (492 aa)
 initn: 1700 init1: 971 opt: 1718  Z-score: 1874.1  bits: 358.2 E(32554): 4.6e-98
Smith-Waterman score: 1718; 58.3% identity (82.9% similar) in 432 aa overlap (44-473:31-458)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KSD LSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQG
                                     :: .  . .: ::..:  .  ::::.: . 
CCDS43 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAE-GFNHLVVDER
               10        20        30        40         50         

            80        90       100       110       120       130   
pF1KSD TGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLI
       :: .:.::.::.:::...: . :.:.:::.::: .:::: ::: :.: :: ::::::.:.
CCDS43 TGHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLL
      60        70        80        90       100       110         

           140       150       160       170       180       190   
pF1KSD IDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGE
       :::.::::.::::::::.::::::.::: : :: ::::::::.::..:...::::   . 
CCDS43 IDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSNL
     120       130       140       150       160       170         

           200       210       220       230       240       250   
pF1KSD DGKLFIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSH
       : ::::.:::::: .::::.::::: .. :...:. : .:..::.:.:::::::....  
CCDS43 DDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIPD
     180       190       200       210       220       230         

           260       270         280       290       300       310 
pF1KSD FDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPE--TPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSL
       :::.:.:::.::.::::::.:::  .: :   ... .  :::..:::::.:  :.::: .
CCDS43 FDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPG---STTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV
     240       250       260          270       280       290      

             320       330       340       350       360       370 
pF1KSD PFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALC
       :.:: :.::::::::::::.: :  :......  .::.::..::::::.  .  :.::::
CCDS43 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALC
        300       310       320       330       340       350      

             380       390       400       410       420       430 
pF1KSD AFPIRAINLQIKGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPIDDNFCGLDINQPLGGS
        : .. :: .:: ::::::.:::.:.: ::  ::. :..: . :::::::::.: ::: :
CCDS43 IFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTIDDNFCGLDMNAPLGVS
        360       370       380       390       400       410      

             440       450       460       470       480       490 
pF1KSD TPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVL
         :.:. ..: .::::::: .:::...:..:::::::::::.                  
CCDS43 DMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKMPGTSLCPTLELQTGPRSH
        420       430       440       450       460       470      

             500       510       520       530       540       550 
pF1KSD KDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNM
                                                                   
CCDS43 RATVTLELLFSSCSSN                                            
        480       490                                              

>>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX              (1909 aa)
 initn: 2266 init1: 605 opt: 1623  Z-score: 1761.1  bits: 339.2 E(32554): 9e-92
Smith-Waterman score: 3461; 34.3% identity (61.8% similar) in 1973 aa overlap (36-1901:27-1898)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KSD SRLLTAAPLSMEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTF
                                     : .. .::.::   .     : . :   :.
CCDS14     MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNT--TL
                   10        20        30        40        50      

          70        80        90       100       110       120     
pF1KSD NHLTVHQGTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLT
       :::..  : :..::::.::...:. .: ....  :::  :. .: :      : ..  ::
CCDS14 NHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQA-QLT
           60        70        80        90       100       110    

         130       140       150       160        170       180    
pF1KSD NNVNKLLIIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLF-ILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTM-
       .:.:.::...   ..:.:::.. ::::.  :: :.  .: .     .  . ..:  :.  
CCDS14 DNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVAT
           120       130       140       150       160       170   

           190       200        210        220       230       240 
pF1KSD YGVIVRSEGEDGKLFIGTAVDGKQDY-FPTLSSRKLP-RDPESSAMLDYELHSDFVSSLI
        :..:   :.:  :... .. :: .   : :. :.:   .: ::  :   . .::     
CCDS14 VGLVVPLPGRD-LLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFSSEGLGRLVVGDF-----
           180        190       200       210       220            

             250       260       270       280       290       300 
pF1KSD KIPSDTLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKD
                 : ..  :. .::..  .::.  .    .:.  ..     : : ..:.:  
CCDS14 ----------SDYNNSYVGAFADARSAYFVFRR----RGARAQAE----YRSYVARVCLG
                 230       240       250               260         

             310       320       330       340       350       360 
pF1KSD DPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQY
       : ...::: .:..:   :    :.:::.:: ::              .:...:. : .  
CCDS14 DTNLYSYVEVPLACQGQG----LIQAAFLA-PG--------------TLLGVFAAGPRGT
     270       280           290                      300       310

             370       380       390            400       410      
pF1KSD HHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG-----EGNLELNWLLGKDVQCTKAPVPID
       .     .::::::.  .. ...   . :: .      :  : .   :   .:.  :.   
CCDS14 Q-----AALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDSP
                   320       330       340       350       360     

         420        430       440       450       460       470    
pF1KSD DNF-CGLD-INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIR
       ... :: .   .:..:  :.:   :   ..  ...::.   .:. ..:.:  .:.: :. 
CCDS14 ESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQP-VSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVF
         370       380       390        400       410       420    

          480       490       500       510       520       530    
pF1KSD ADGPPHGGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGE
         :  .: : :.  .:   :: :  :. .. .  .:::.. .:: :.:: .: :.  :. 
CCDS14 LHGS-QGQV-YHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCAS
           430        440       450       460       470       480  

          540       550       560       570       580       590    
pF1KSD CLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISVSEHSRL--
       ::.. :: ::::.:.. :.:. .: .: . :..  :  .  :  .: .:.  ..: :   
CCDS14 CLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEED-SHCLHIQSLLPGHHPRQEQ
            490       500       510       520        530       540 

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pF1KSD --LSLVVSDAPDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKD-VPVIPLDQDWFG
         ..: :   : :.:   . ::::.   . ..: : .: :..: :.: ::. :   :   
CCDS14 GQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTP-PQDQVPLNPPGTDHVT
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pF1KSD LELQLRSKETGKIFVSTEFKFYNCSAHQL------CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCT---H
       . : :  ...    ..:.:.::.::: :       : .::.: .:::::   . :.   :
CCDS14 VPLALMFEDV--TVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEH
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pF1KSD DP----TTCSFQEGRINISED--CPQLVPTE-EILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRG
        :    :  : ::  :..     :::.       :.:::  . ..:..::: . ..   .
CCDS14 CPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPAS
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pF1KSD YECVLNIQGAIHRVPALRF----NSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIID
       ..: :.. : .. .::       .:. ..::  .. : .:.  .: : . :. .    .:
CCDS14 FHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQF-YPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLD
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pF1KSD NPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGWCS-GERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSH
       : . : : :: ::  . .:. :  :.:.. : ::. :.  :     :   .   :     
CCDS14 NTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELL-----
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pF1KSD NVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIA
          :  :.:  .  ..::::::  .:: : :::  :... . :.::. ::.: :. :  .
CCDS14 ---CPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTS
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pF1KSD EQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTM
        .:::  . :  ::: ::::. :    : .   : :..:. .: .:::.:  ::..:::.
CCDS14 ARIVCVTSPAPNGTT-GPVRVAIKSQPPGI---SSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQ
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pF1KSD VTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE-IVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVD
       .:: :..: .:.......:.: : .      : ::: . :..   .:  ..: :  .:..
CCDS14 LTIRGQHLQTGGNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQA---APGEAAVLVVFGHAQ
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pF1KSD SNL---QFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVC
        .:    :.:  .:..   ::  :. .:   . . : .:::.:.: . : ...   :.. 
CCDS14 RTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQAS
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pF1KSD KVVNTTTL---TCLAP--------------------------SLTTDYRPGLDTVERPDE
       ..         .: ::                          ::     :..    .:..
CCDS14 RAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPDRAHPQR
            1070      1080      1090      1100      1110      1120 

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pF1KSD FGFVFNNVQSLLIYND--TKFIYYPNPTFELLS---PTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPA
         :...:::  .   .    :.: ::: .  ::   :.     :::  . ..:..:    
CCDS14 VFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGL---N
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pF1KSD SGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEPP-------NLTGQHKVMVHVGGMVFSPGS
        : .: .  : ::.  : : :...:.: ::::       : .:  . .:..:.. .. : 
CCDS14 LGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGSGLPQFVVQMGNVQLALGP
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pF1KSD VSVISDSLLT-LP--AIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLE
       :.  ..  :. .:  : .... :...:.  :... . :..::..     ... .:...::
CCDS14 VQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLE
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       . :. .:.. :..:.:....:.:::. ::::.::::::: :..:::    :.  . :  :
CCDS14 TGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGHGGCPLQPKPEGPG
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pF1KSD -NGQ-QHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEY
        .:.   :...:  ...:.:.:.::::.:.::: : :::.::: .::::.  .:.:.:::
CCDS14 EDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEY
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        ::... ::.::  . . ..: :::.:::::...::.::::... :. ::.: :::::.:
CCDS14 LTDIMRTLLGDLAAHYV-HRN-PKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYM
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       :. ::. :..:::.::.::.:. .:....:.:...:.. : :   :.:      .: :  
CCDS14 LFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQ
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pF1KSD -IPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTK
        .:..::. :::::::::.:: :::..:.:::: .  .:::::.:  ....:.:::.:. 
CCDS14 RVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSV
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        .. :::::::.::.: : ..:.:::.      .  ...::..  .:          :  
CCDS14 TQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQ------LHRGSTISQSLAQR---------CP--
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pF1KSD LRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD----------QKEGDRGSKMVSEIYLTRLLA
       :    : .    :.:: .:::::  .. .          ..:  : .: . ::::::::.
CCDS14 LGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPAR-AKAIPEIYLTRLLS
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pF1KSD TKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTDVRHTWKSNCL
        :::::::::: :....: :.:   .:.:.::.::.::: :..:.:.:  . : ::.: :
CCDS14 MKGTLQKFVDDTFQAILS-VNR--PIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSL
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pF1KSD PLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKD
        ::::::..::::..::.. .. .:: :.:.::::.:::.::::..:.::: ::::::..
CCDS14 LLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYARE
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pF1KSD IPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEE
       :: ::. :::::::: .    : :.::. ::: :  ..   . : ::.:.:... .: ..
CCDS14 IPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQ
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pF1KSD LIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES   
       .:.:::.:  ... .:: ...:.           
CCDS14 IISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
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>>CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX              (1932 aa)
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        .     : . :   :.:::..  : :..::::.::...:. .: ....  :::  :. .
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       : :      : ..  ::.:.:.::...   ..:.:::.. ::::.  :: :.  .: .  
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          .  . ..:  :.   :..:   :.:  :... .. :: .   : :. :.:   .: :
CCDS55 DPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPLPGRD-LLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFS
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       :  :   . .::               : ..  :. .::..  .::.  .    .:.  .
CCDS55 SEGLGRLVVGDF---------------SDYNNSYVGAFADARSAYFVFRR----RGARAQ
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pF1KSD SAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNIT
       .     : : ..:.:  : ...::: .:..:   :    :.:::.:: ::          
CCDS55 AE----YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQG----LIQAAFLA-PG----------
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pF1KSD SQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG-----EGNLELN
           .:...:. : .  .     .::::::.  .. ...   . :: .      :  : .
CCDS55 ----TLLGVFAAGPRGTQ-----AALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEAT
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pF1KSD WLLGKDVQCTKAPVPIDDNF-CGLD-INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNG
          :   .:.  :.   ... :: .   .:..:  :.:   :   ..  ...::.   .:
CCDS55 VEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQP-VSAVAALQADG
             380       390       400       410        420       430

       460       470       480       490       500       510       
pF1KSD YSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQ
       . ..:.:  .:.: :.   :  .: : :.  .:   :: :  :. .. .  .:::.. .:
CCDS55 HMIAFLGDTQGQLYKVFLHGS-QGQV-YHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQ
              440       450         460       470       480        

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pF1KSD VTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQCVSL
       : :.:: .: :.  :. ::.. :: ::::.:.. :.:. .: .: . :..  :  .  : 
CCDS55 VDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEED-SH
      490       500       510       520       530       540        

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pF1KSD AVHPSSISVSEHSRL----LSLVVSDAPDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISP
        .: .:.  ..: :     ..: :   : :.:   . ::::.   . ..: : .: :..:
CCDS55 CLHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTP
       550       560       570       580       590        600      

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pF1KSD GPKD-VPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKIFVSTEFKFYNCSAHQL------CLSCVNSA
        :.: ::. :   :   . : :  ...    ..:.:.::.::: :       : .::.: 
CCDS55 -PQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDV--TVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSI
         610       620       630         640       650       660   

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pF1KSD FRCHWCKYRNLCT---HDP----TTCSFQEGRINISED--CPQLVPTE-EILIPVGEVKP
       .:::::   . :.   : :    :  : ::  :..     :::.       :.:::  . 
CCDS55 WRCHWCPQSSHCVYGEHCPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESH
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pF1KSD ITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRF----NSSSVQCQNSSYQYDGMDIS
       ..:..::: . ..   ...: :.. : .. .::       .:. ..::  .. : .:.  
CCDS55 LALRVRNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQF-YPSMSQR
           730       740       750       760       770        780  

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pF1KSD NLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFECGWCS-GERRCTL
       .: : . :. .    .:: . : : :: ::  . .:. :  :.:.. : ::. :.  :  
CCDS55 ELPVPIYVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRY
            790       800       810       820       830       840  

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pF1KSD HQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHV
          :   .   :        :  :.:  .  ..::::::  .:: : :::  :... . :
CCDS55 GPLCPPGAVELL--------CPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAV
            850               860       870       880       890    

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pF1KSD QVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNP
       .::. ::.: :. :  . .:::  . :  ::: ::::. :    : .   : :..:. .:
CCDS55 SVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPNGTT-GPVRVAIKSQPPGI---SSQHFTYQDP
          900       910       920        930       940          950

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pF1KSD SVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE-IVCVSPPSSN
        .:::.:  ::..:::..:: :..: .:.......:.: : .      : ::: . :.. 
CCDS55 VLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQTGGNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQA-
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pF1KSD GLGPVPVSVSVDRAHVDSNL---QFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQ
         .:  ..: :  .:.. .:    :.:  .:..   ::  :. .:   . . : .:::.:
CCDS55 --APGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQ
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

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pF1KSD EPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTL---TCLAP--------------------------S
       .: . : ...   :.. ..         .: ::                          :
CCDS55 RPLLSVWLEADAEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSS
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

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pF1KSD LTTDYRPGLDTVERPDEFGFVFNNVQSLLIYND--TKFIYYPNPTFELLS---PTGVLDQ
       :     :..    .:..  :...:::  .   .    :.: ::: .  ::   :.     
CCDS55 LLLCRSPAVPDRAHPQRVFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRL
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

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pF1KSD KPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEPP-------NLTG
       :::  . ..:..:     : .: .  : ::.  : : :...:.: ::::       : .:
CCDS55 KPGHVLDVEGEGL---NLGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGSG
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pF1KSD QHKVMVHVGGMVFSPGSVSVISDSLLT-LP--AIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSR
         . .:..:.. .. : :.  ..  :. .:  : .... :...:.  :... . :..::.
CCDS55 LPQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSK
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pF1KSD ENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRTYAMRVL
       .     ... .:...::. :. .:.. :..:.:....:.:::. ::::.::::::: :..
CCDS55 QALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAF
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pF1KSD FPGIEDHPVLRELEVQG-NGQ-QHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRSFSMRDR
       :::    :.  . :  : .:.   :...:  ...:.:.:.::::.:.::: : :::.:::
CCDS55 FPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDR
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

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pF1KSD GNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFA
        .::::.  .:.:.::: ::... ::.::  . . ..: :::.:::::...::.::::..
CCDS55 CHVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYV-HRN-PKLMLRRTETMVEKLLTNWLS
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       . :. ::.: :::::.::. ::. :..:::.::.::.:. .:....:.:...:.. : : 
CCDS55 ICLYAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLM
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pF1KSD C-VNPDN---ENSPE---IPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWR
         :.:      .: :   .:..::. :::::::::.:: :::..:.:::: .  .:::::
CCDS55 VLVGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWR
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pF1KSD QGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRT
       .:  ....:.:::.:.  .. :::::::.::.: : ..:.:::.      .  ...::..
CCDS55 SGLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQ------LHRGSTISQS
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pF1KSD SISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD----------QKEG
         .:          :  :    : .    :.:: .:::::  .. .          ..: 
CCDS55 LAQR---------CP--LGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREP
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pF1KSD DRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADR
        : .: . ::::::::. :::::::::: :....: :.:   .:.:.::.::.::: :..
CCDS55 AR-AKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILS-VNR--PIPIAVKYLFDLLDELAEK
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pF1KSD HSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSE
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CCDS55 HGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSE
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CCDS55 HKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHC
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CCDS43 DEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQ
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        : :  :   ::.: . .: .:    .:.: : :     :.  :  :. . .. ..  ..
CCDS43 SSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLS--TN
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pF1KSD TLALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFH
       :  .:. :.        .: .:.:.  : .  .  : :        . ..:.:..::...
CCDS43 TQQFVAAFE--------DGPYVFFVFNQQD--KHPARNR-------TLLARMCREDPNYY
          220               230         240              250       

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pF1KSD SYVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPD
       ::. . . :    ..     ::.    :  :: .    ..  ::.:.::. ...   :  
CCDS43 SYLEMDLQCRDPDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGP--
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pF1KSD DSALCAFPIRAINLQIKGRLQSCYQG--EGNLELNWLLGKDVQCT-KAPVPIDDNFCGLD
        ..:: ::.  .. ....  ..:: :  :.   .   .  :.::  .::    .  :: .
CCDS43 GAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSE
       310       320       330       340       350       360       

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pF1KSD -INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGG
        .  :::.   ..: ..   .   .:.:.  . :...:.:.::..:.. :.     : : 
CCDS43 HLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL--TPDG-
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pF1KSD VQYEMVSVLKD-GSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDP
       .. :. :.: . .. . ::...: :   ::.:.. .: :.::. : .: :: .: .: ::
CCDS43 TSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDP
          430       440       450       460       470       480    

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pF1KSD HCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQ-CVSL-AVHPSSISVSEHSRLLSLVVSD
       .::::.... :.:. .: .: : ...  : :. ::.. ...:...:   .... .:.:: 
CCDS43 YCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEV-QLTVSP
          490       500       510       520       530        540   

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pF1KSD APDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKET
        : ::    . : ::.     ..: :  ::: ::  ...:: :  ::  .. .::  .. 
CCDS43 LPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR-
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pF1KSD GKIFVST-EFKFYNC-SAHQL-----CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTH-DPTTCSFQEG-
       :.::... .. ::.: .: .:     :.:::.. . :.:    . : . .:.    ..: 
CCDS43 GNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGI
              610       620       630       640       650          

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD -RINISEDCPQLVPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRV--
        : .. ..:::..    ..::...   ......::   ....      :.. . . .   
CCDS43 VRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSS------LHVGSDLLKFME
       660       670       680       690             700       710 

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pF1KSD PALRFNSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRES
       :.   .:..   .. . ..:. .  .: . . :   :.  ::.   :.: ::.:.  : .
CCDS43 PVTMQESGTFAFRTPKLSHDANE--TLPLHLYVKSYGK-NIDS--KLHVTLYNCSFGRSD
             720       730         740        750         760      

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pF1KSD CGLCLKADRKFECGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPP
       :.::  :.  ..:.::.:. ::. .  :.. :           .:  : ::.:   .:: 
CCDS43 CSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVYEALCNTTS-----------ECPPPVITRIQPETGPL
        770       780       790                  800       810     

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pF1KSD EGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSG--
        :: :.:: : :::.. ..: ....:::  :.  : .: .. .::: .  : .  :.:  
CCDS43 GGGIRITILGSNLGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVE
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pF1KSD -PVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSS--V
         :   .:.  :.       :.:: .:. ::..: .::..::: .:: : .: .::.  :
CCDS43 VDVFGKLGRSPPNV------QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDV
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pF1KSD AVYLGNQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQ
        : :..  :.   .  ... ::. :...  : . . ::   . : . .. : : ..: ..
CCDS43 RVTLNGVPCKVT-KFGAQLQCVTGPQATR-GQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLR
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pF1KSD RIEPEWSIASGHTPLTITG--------FNLDVIQEPRIRVKFNGK-ESVNVCKVV-----
        .::  :.:::   ...::        : . :: ::    .   . ::..   ::     
CCDS43 AFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYV
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pF1KSD --NTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERPDEFGFV----FNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPT
         : : .. :.:..     :     :.:. ....    ... ..::  .   : : :.::
CCDS43 FHNDTKVVFLSPAV-----P-----EEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPT
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pF1KSD FELLSPTGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEP
       ::  . :: . .. .. :  .: ::    .     .  ...:   :.. :..::.: :::
CCDS43 FE--NFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMT---LQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEP
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       :..    :              .:. :.  .  : :   . .::  :.:   . :.    
CCDS43 PEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVP---
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pF1KSD LLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDL
        ..... . .  : :::.. .   .... :...::  :  .::. :..:. .... :.:.
CCDS43 -MVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDV
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pF1KSD DRSGIPYLDYRTYAMRVLF-P---GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKV
        ..::: :::.::. ::.: :   : .:  .  .:..    .  ::.::  :..:.:.: 
CCDS43 HEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKS
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pF1KSD FLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHP
       ::..::.::: :: :: : .   :::. ..:.:.::: ::... :. .:... .  :: :
CCDS43 FLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-P
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pF1KSD KLLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARY
       ::.:::.:.:.:.::.::... :...::. :::::. :. :::.:.::::.::.  .:.:
CCDS43 KLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKY
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pF1KSD SLSEDKLIRQQIEYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYS
       .:..  :. ...::  : .. .  : :.   :::::::::::.::::::.: ::.. : :
CCDS43 TLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQD-EGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCS
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pF1KSD QRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTS
         ::  .. :::: :  :.. :.: :.:.. :: :::.::::::.: : ... :      
CCDS43 CWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL------
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pF1KSD SYNIPASASISRTSISRY--DSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHG
                 :....:.   ::.    :   .:          ::   .:::::.  :. 
CCDS43 ----------SKVGVSQQPEDSQQDLPGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEV
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pF1KSD DQKEGDRGS-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIK
       :. .. :::       : ..::::::::..:::::.:::..:.....    : :.: :.:
CCDS43 DEGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAP---GHAVPPAVK
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       :.::::::::..:.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.:   ..:: :::.
CCDS43 YFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVI
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       ::::::.:. .::.:..:::::::::::.: .::. :: ::  : ..  .::::::..::
CCDS43 AQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLA
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pF1KSD EQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
       : :: :.  .: : ::...:.:..:: .:.:.:::.:  :....::....:.  :.    
CCDS43 EISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKV
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CCDS43 TDL
          

>>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3             (1925 aa)
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CCDS33    MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPT
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        .   ::.: ::.: .: ... ...:::.::: :.: :  ..  ..        :..   
CCDS33 EHPRRLTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVT
          120       130       140       150       160       170    

                  180        190        200        210          220
pF1KSD HYLSSVN-----KTGTMYGVIVR-SEGEDG-KLFIGTAVDGK-QDYFP---TLSSRKLPR
        . : .:      ...  :...  . :  : .:..:..  :  ...::   .: ....  
CCDS33 VFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFEN
          180       190       200       210       220       230    

              230         240         250       260       270      
pF1KSD DPESSAMLDYELHSDFVS--SLIKIPSDT--LALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQP-
        ::  :. . . ..:...  ..   :::   : . .     .  ::.:. :..     : 
CCDS33 TPEI-AIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSA-FLHPSDPPPG
           240       250       260       270       280        290  

          280          290               300        310       320  
pF1KSD -ETPEGVAINS---AGDLFYTSR--IVRLC------KDDPKF-HSYVSLPFGCTRAGVEY
        ..   .:.::   :::    .:  ..:.:       :  :. .::..: . :  ::   
CCDS33 AQSYAYLALNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQC--AGGAG
            300       310       320       330       340         350

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD RLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRAINLQI
       :          ::  ..  ..    . :::.: . : .       .::::: .  .   :
CCDS33 R----------GDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAI
                        360       370       380       390       400

            390       400            410             420        430
pF1KSD KGRLQSCYQGEGNLELNWLLGKDVQ-----CTKA------PVPIDDNFCGL-DINQPLGG
       ..   .:.  :   ..  .: . ::     : .       :  .:   ::   ...::. 
CCDS33 RAARTACFV-EPAPDVVAVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLD---CGAAHLQHPLSI
               410       420       430       440          450      

              440       450       460       470       480       490
pF1KSD STPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSV
         :...  .. .    .::::    :.:..::.:: .:.: ::  .      :. ..:.:
CCDS33 LQPLKATPVFRAPG--LTSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLN-ESMQVVSRRVVTV
        460       470         480       490       500        510   

              500        510       520       530       540         
pF1KSD LKDGSPILRDMAFS-IDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALH
          : :. . : :.  :. :::.:. .:..:: : .:. ..:::.:....: .::::::.
CCDS33 AY-GEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALE
            520       530       540       550       560       570  

     550            560       570       580        590       600   
pF1KSD NMCSRRDKC-----QQAWEPNRFAASISQCVSLAVHPSSISV-SEHSRLLSLVVSDAPDL
       . :. .. :     :. :     . . :.: ...: :: :.: .:.  ..  . .. :.:
CCDS33 TRCTLQQDCTNSSQQHFWTSA--SEGPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSL
            580       590         600       610       620       630

            610           620       630        640       650       
pF1KSD SAG-IACAFGN----LTEVEGQVSGSQVICISPGPKD-VPVIPLDQDWFGLELQLRSKET
       :.  .:: .::    ...: : . : :.   .  :.:  : .: .::   .:...: .  
CCDS33 SGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVN--
              640       650       660       670       680          

       660       670             680       690       700       710 
pF1KSD GKIFVSTEFKFYNCS------AHQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHDPTTCSFQEGRIN
       :. .:...: .:.::       :  : ::... . : ::. .. :. . . :  . .  .
CCDS33 GRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTS
      690       700       710       720       730       740        

             720       730       740       750       760       770 
pF1KSD ISEDCPQLVPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRVPALRFN
         .:::. . .    .:.:  . : .   :    :..  . :: ....  ..   :.  :
CCDS33 -PQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQGA--ALECSFGLEEIFE---AVWVN
       750       760       770       780         790          800  

             780       790       800       810       820       830 
pF1KSD SSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCL-
        : :.: ..   .     . . ... .      ..:.:. . : .:.::    .:. :: 
CCDS33 ESVVRC-DQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQCLG
             810       820       830       840       850       860 

              840       850       860       870       880       890
pF1KSD KADRKFECGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTR
       . :    : : .:   : :.    .: .:          :  :.:  :  .::: .::: 
CCDS33 REDLGHLCMWSDG---CRLR----GPLQPMAG------TCPAPEIHAIEPLSGPLDGGTL
             870              880             890       900        

              900       910       920       930       940       950
pF1KSD VTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSGPVRLCIG
       .::.: :::  .:..:: : ..:: : ::: .: ..:.:::  : :  :  :: :   ..
CCDS33 LTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPA-PGPLSGVVT--VN
      910       920       930       940       950        960       

              960       970       980       990      1000          
pF1KSD ECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLGN-QTC
         :     ::......: : : ::.:  ::..::: .:: :. : .:: . : ... . :
CCDS33 ASKE---GKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPC
            970       980       990      1000      1010      1020  

    1010      1020      1030      1040       1050      1060        
pF1KSD EFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDR-AHVDSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIA
           :. . :.:. : ..   .:::: :  .: . : .:: : :...: .  : :. : .
CCDS33 TELMRTDTSIACTMPEGALP-APVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSPV
           1030      1040       1050      1060      1070      1080 

     1070      1080      1090      1100      1110      1120        
pF1KSD SGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFNGKESVNVCKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTV
       ::   .:..:  . ..:.  . :.  :.: . .:::.:.: .:: .:.  ..    .:  
CCDS33 SGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPT-LCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
            1090      1100      1110       1120      1130      1140

         1130      1140      1150        1160      1170      1180  
pF1KSD ----ERPDEFGFVFNNVQSLLIYNDTKFI--YYPNPTFELLSPTGVLDQKPGSPIILKGK
              :: . . . ..       ..:   : ::: :   .    . ..:: :. :  .
CCDS33 INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

           1190      1200       1210      1220          1230       
pF1KSD NLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAVT-VSETQLLCEPPN----LTGQHKVMVHVGGMVFS
       .    . :  . .: : ::.. : .  ::.  . :   .     .::  . ..::.  :.
CCDS33 KE-QDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGN--FN
              1210      1220      1230      1240      1250         

      1240      1250      1260      1270      1280      1290       
pF1KSD PGSVSVISDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLE
         ...... .      ::::.   :.::.. ...:...  :::. .   ..  .::...:
CCDS33 Q-TIATLQLGGSETAIIVSIVIC-SVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEME
       1260      1270       1280      1290      1300      1310     

      1300      1310      1320       1330      1340                
pF1KSD SRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRS-GIPYLDYRTYAMRVLFP--------------
       :..  : ...:::::::...::..:.:: :::.:.:. .. :..::              
CCDS33 SQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPS
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                     1350      1360      1370      1380      1390  
pF1KSD ----------GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRS
                 . : ::.: : ..  . . ..:....::..:.::: ::..:...:: :..
CCDS33 QTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKD
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

           1400      1410      1420      1430      1440      1450  
pF1KSD FSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKM
       :..::: ..:::.  .:.:.::: :...:.:: :::: .   :: :::.:::::::.:::
CCDS33 FAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDAS-AAKN-PKLMLRRTESVVEKM
        1440      1450      1460      1470        1480      1490   

           1460      1470      1480      1490      1500      1510  
pF1KSD LTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEY
       ::::... ... :.: .:::.:.: ::::::..:: ::::::.:::.:::. :.:..:: 
CCDS33 LTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEA
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           1520      1530      1540      1550      1560      1570  
pF1KSD KTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQ
       :   :: :. .. .   . :.... ::.::::::::.:  ::::::: ::: :.::::  
CCDS33 KPRNLN-VSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFA
           1560      1570      1580      1590      1600      1610  

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pF1KSD GRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRTS
       .     .:.: : :. .:   :.:::: ::.                  :: .::.. . 
CCDS33 SSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYK------------------IPEGASLAMSL
           1620      1630      1640                        1650    

           1640      1650      1660      1670       1680           
pF1KSD ISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDH-GDQKEGDRGS---KMV
       :.. :...   :   .:         : :   : .:::   :. .. :.. : :   :..
CCDS33 IDKKDNTL---GRVKDL---------DTE---KYFHLVLPTDELAEPKKSHRQSHRKKVL
         1660                  1670         1680      1690         

     1690      1700      1710      1720      1730      1740        
pF1KSD SEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTD
        ::::::::.::::::::.::::....:   : .  :::.::.::::.:::....: : :
CCDS33 PEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSI--REDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPD
    1700      1710      1720        1730      1740      1750       

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pF1KSD VRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDS
       . : ::.: ::::::::..::::::::: : .  ::::::.::.:.:.:: :. .:::::
CCDS33 TLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDS
      1760      1770      1780      1790      1800      1810       

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pF1KSD PSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEI
       :.:::::::.:: :.. :.::: .:  .  .:.:.:::.:::.:: .  :::   :. ::
CCDS33 PTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEI
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pF1KSD YSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES       
       :.:...:  ....::: .  ::: .: .: ::..  :           
CCDS33 YKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA
      1880      1890      1900      1910      1920     




1909 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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