Result of FASTA (ccds) for pF1KB8804
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8804, 350 aa
  1>>>pF1KB8804 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2995+/-0.00136; mu= 16.2952+/- 0.080
 mean_var=112.7200+/-31.699, 0's: 0 Z-trim(100.9): 290  B-trim: 893 in 2/46
 Lambda= 0.120802
 statistics sampled from 5863 (6291) to 5863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.193), width:  16
 Scan time:  2.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350) 2317 415.7  3e-116
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  841 158.5 8.4e-39
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  841 158.5 8.5e-39
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  837 157.8 1.4e-38
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  830 156.5 3.1e-38
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  722 137.7 1.4e-32
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  718 137.0 2.3e-32
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  708 135.3 7.9e-32
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  685 131.3 1.3e-30
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  684 131.1 1.4e-30
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  681 130.6 2.1e-30
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  679 130.2 2.7e-30
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  676 129.7 3.7e-30
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  669 128.5 8.6e-30
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360)  661 127.1 2.3e-29
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  656 126.2 4.1e-29
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  655 126.0 4.8e-29
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  655 126.1 5.2e-29
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  653 125.7 5.9e-29
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374)  646 124.5 1.4e-28
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  645 124.3 1.6e-28
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  629 121.5 1.1e-27
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  623 120.4 2.2e-27
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  623 120.5 2.3e-27
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  611 118.4 9.9e-27
CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3            ( 333)  487 96.7 2.9e-20
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  458 91.7   1e-18
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 344)  448 89.9 3.3e-18
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 356)  448 89.9 3.4e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  437 88.0 1.3e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  434 87.5 1.9e-17
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19          ( 350)  433 87.3 2.1e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  430 86.8   3e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  430 86.9 3.2e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  430 86.9 3.2e-17
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12        ( 404)  418 84.8 1.4e-16
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  416 84.4 1.7e-16
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  409 83.2 3.8e-16
CCDS5322.1 GPER1 gene_id:2852|Hs108|chr7           ( 375)  408 83.0 4.4e-16
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3           ( 360)  406 82.6 5.5e-16
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  399 81.4 1.3e-15
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  399 81.4 1.3e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  399 81.4 1.3e-15
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5          ( 352)  390 79.8 3.7e-15
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5           ( 374)  390 79.9 3.9e-15
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  389 79.7 4.5e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  388 79.5 4.9e-15
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8          ( 328)  377 77.5 1.7e-14
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13         ( 337)  374 77.0 2.5e-14
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14          ( 352)  374 77.0 2.6e-14


>>CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3               (350 aa)
 initn: 2317 init1: 2317 opt: 2317  Z-score: 2200.6  bits: 415.7 E(32554): 3e-116
Smith-Waterman score: 2317; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCWIICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCWIICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVND
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 VLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350
pF1KB8 ILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
              310       320       330       340       350

>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (372 aa)
 initn: 810 init1: 456 opt: 841  Z-score: 810.1  bits: 158.5 E(32554): 8.4e-39
Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (69.8% similar) in 358 aa overlap (3-349:17-371)

                             10        20        30        40      
pF1KB8               MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPV
                       : :.. :: :  .:    : ::. .: .: :.:::.:   :::.
CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNT---TVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPI
               10        20        30           40        50       

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB8 FLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWV
       . .:.  .:: ::..::  : :.:. .: ::.:.:::::::.:.:.:::::: .:...::
CCDS77 MYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSWV
        60        70        80        90       100       110       

        110       120       130       140           150       160  
pF1KB8 LGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWIICFCVW
       .:  .::.  :.: ..: ::: .: :::::::::.... :    .. :     . :  .:
CCDS77 FGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIW
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200         210       220
pF1KB8 MAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFLIMGVCY
       . : .::::.:..  .. ..    .    .   ..:.:  :. .. :::.::.: :. ::
CCDS77 ILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCY
       180       190       200       210       220       230       

              230       240       250       260       270       280
pF1KB8 FITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKR
       ..  :::..  :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ...  .    ..:..::.
CCDS77 LVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQ
       240       250       260       270       280       290       

              290       300       310       320           330      
pF1KB8 MDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--SVEEFPF
       ..:: .:: :.:  . :.::.::.:.:..:.: ..:. :  :  : .. ::  : ...  
CCDS77 LNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRHIRR
       300       310       320       330       340       350       

        340        350
pF1KB8 DSEG-PTEPTSTFSI
       .: .  .: :.::: 
CCDS77 SSMSVEAETTTTFSP
       360       370  

>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (378 aa)
 initn: 810 init1: 456 opt: 841  Z-score: 810.0  bits: 158.5 E(32554): 8.5e-39
Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (69.8% similar) in 358 aa overlap (3-349:23-377)

                                   10        20        30        40
pF1KB8                     MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFA
                             : :.. :: :  .:    : ::. .: .: :.:::.: 
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNT---TVDYTLFESLCSKKDVRNFK
               10        20        30           40        50       

               50        60        70        80        90       100
pF1KB8 KVFLPVFLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVN
         :::.. .:.  .:: ::..::  : :.:. .: ::.:.:::::::.:.:.:::::: .
CCDS11 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
        60        70        80        90       100       110       

              110       120       130       140           150      
pF1KB8 AVHGWVLGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWI
       :...::.:  .::.  :.: ..: ::: .: :::::::::.... :    .. :     .
CCDS11 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL
       120       130       140       150       160       170       

        160       170       180       190       200         210    
pF1KB8 ICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFL
        :  .:. : .::::.:..  .. ..    .    .   ..:.:  :. .. :::.::.:
CCDS11 SCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLL
       180       190       200       210       220       230       

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB8 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS
        :. ::..  :::..  :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ...  .    ..
CCDS11 AMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSST
       240       250       260       270       280       290       

          280       290       300       310       320           330
pF1KB8 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--S
       :..::...:: .:: :.:  . :.::.::.:.:..:.: ..:. :  :  : .. ::  :
CCDS11 CELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSS
       300       310       320       330       340       350       

              340        350
pF1KB8 VEEFPFDSEG-PTEPTSTFSI
        ...  .: .  .: :.::: 
CCDS11 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
       360       370        

>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3                (369 aa)
 initn: 808 init1: 380 opt: 837  Z-score: 806.3  bits: 157.8 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 837; 36.6% identity (68.9% similar) in 325 aa overlap (6-322:12-336)

                     10         20        30        40        50   
pF1KB8       MALEQNQSTDYYYEE-NEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFV
                  :.. ::  :  . :.   ...  .. : :..::.::. ::: .  .::.
CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB8 IGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCK
       .:  :::.:. .: :  . .: ::...::::.::::.: ::::::. :.  : .  .:::
CCDS27 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150           160         
pF1KB8 ITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKP----CWIICFCVWMAAILLS
       .....: .:: : . .. :::.:::.:....       .       ..:: .:. :  : 
CCDS27 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
              130       140       150       160       170       180

     170       180          190       200       210       220      
pF1KB8 IPQLVFYTVNDN---ARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITART
       ::....  ....   : :  ..:   .:..:. .  :.. .:: .::..:. :: :  .:
CCDS27 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
              190       200       210       220       230       240

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB8 LMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQ
       :..  . .  . ::: .::. ::...:.::: . . ..::    .:..: .:  .:: .:
CCDS27 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
              250       260       270       280       290       300

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB8 VTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTS
       ::..::.:::::::.::::.:  :.  ..:. :. :                        
CCDS27 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
              310       320       330       340       350       360

        350     
pF1KB8 TFSI     
                
CCDS27 ETTSGALSL
                

>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3                (357 aa)
 initn: 808 init1: 380 opt: 830  Z-score: 799.9  bits: 156.5 E(32554): 3.1e-38
Smith-Waterman score: 830; 36.8% identity (68.8% similar) in 321 aa overlap (10-322:4-324)

               10         20        30        40        50         
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEE-NEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGN
                ::  :  . :.   ...  .. : :..::.::. ::: .  .::..:  ::
CCDS27       MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALGN
                     10        20        30        40        50    

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 SMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALY
       :.:. .: :  . .: ::...::::.::::.: ::::::. :.  : .  .:::.....:
CCDS27 SLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCKVVNSMY
           60        70        80        90       100       110    

     120       130       140       150           160       170     
pF1KB8 TLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKP----CWIICFCVWMAAILLSIPQLVF
        .:: : . .. :::.:::.:....       .       ..:: .:. :  : ::....
CCDS27 KMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILY
          120       130       140       150       160       170    

         180          190       200       210       220       230  
pF1KB8 YTVNDN---ARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPN
         ....   : :  ..:   .:..:. .  :.. .:: .::..:. :: :  .::..  .
CCDS27 SQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKK
          180       190       200       210       220       230    

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB8 IKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIA
        .  . ::: .::. ::...:.::: . . ..::    .:..: .:  .:: .:::..::
CCDS27 SSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQTIA
          240       250       260       270       280       290    

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB8 LFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI  
       .:::::::.::::.:  :.  ..:. :. :                              
CCDS27 FFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETTSGA
          300       310       320       330       340       350    

>>CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3               (342 aa)
 initn: 655 init1: 379 opt: 722  Z-score: 698.4  bits: 137.7 E(32554): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 722; 33.7% identity (67.7% similar) in 350 aa overlap (12-350:6-342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
                  :.:.  ...  : :: :    ..:  .:.::::: .  .::: ::.:::
CCDS27       MAEHDYHEDYGFSSFNDSSQEE----HQDFLQFSKVFLPCMYLVVFVCGLVGNS
                     10        20            30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
       .:..:  .:.: .. :::...:: .:::... ::::::  ..: ::.:..:::   ..::
CCDS27 LVLVISIFYHKLQSLTDVFLVNLPLADLVFVCTLPFWAYAGIHEWVFGQVMCKSLLGIYT
               60        70        80        90       100       110

              130       140         150         160       170      
pF1KB8 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS--QSGVGKPCW--IICFCVWMAAILLSIPQLVFY
       .:: ..: .:.::..::...:.:. .  .. . .  :  .  . .:. ..:.:.::... 
CCDS27 INFYTSMLILTCITVDRFIVVVKATKAYNQQAKRMTWGKVTSLLIWVISLLVSLPQIIYG
              120       130       140       150       160       170

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 TVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKIS
       .: .  . :     :   ......   .. .:: .:.: : ::: .  .::..  ...  
CCDS27 NVFNLDKLIC---GYHDEAISTVVLATQMTLGFFLPLLTMIVCYSVIIKTLLHAGGFQKH
              180          190       200       210       220       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 RPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHS
       : ::... :. ::..::.:.:..:: :.    :  .:: ...      :.:::.:: ...
CCDS27 RSLKIIFLVMAVFLLTQMPFNLMKFIRSTHWEYYAMTSFHYT------IMVTEAIAYLRA
       230       240       250       260             270       280 

        300       310       320            330         340         
pF1KB8 CLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSW-----RRQRQSVEEFP--FDSEGPTEPTSTFS
       ::::.::.:.. .:..   :..:  :        .: .: :.    :..   .: :: :.
CCDS27 CLNPVLYAFVSLKFRKNFWKLVKDIGCLPYLGVSHQWKSSEDNSKTFSASHNVEATSMFQ
             290       300       310       320       330       340 

     350
pF1KB8 I
       .
CCDS27 L
        

>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3                 (360 aa)
 initn: 611 init1: 378 opt: 718  Z-score: 694.4  bits: 137.0 E(32554): 2.3e-32
Smith-Waterman score: 718; 36.7% identity (68.4% similar) in 316 aa overlap (10-319:8-320)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
                :   .:. ... : : .    : :: .. :...::: . ..:::.:: :::
CCDS26   MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNS
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
       .:: .   ::. :. ::::.::::..:::..:.::::.  :.  ::.:  .::. : .: 
CCDS26 VVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLCKMISWMYL
       60        70        80        90       100       110        

              130       140        150        160       170        
pF1KB8 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTK-VPSQSGVGKPCWIIC-FCVWMAAILLSIPQLVF---
       ..: ::. :.  .:::::.:... : :  .      .:  . .: .:.. :.: ..:   
CCDS26 VGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFSTC
      120       130       140       150       160       170        

         180       190       200        210       220       230    
pF1KB8 YTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICI-GFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIK
       ::  ... :   .   :...   ... ::: : :.:.:. ::  :: .  :::..  : :
CCDS26 YTERNHTYCKTKYS--LNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEK
      180       190         200       210       220       230      

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB8 ISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALF
        .. .:....::..:.    ::::: : ... .   .. .:.. . .: :::.::..:. 
CCDS26 KNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETL-VELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFV
        240       250       260        270       280       290     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 HSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI    
       : :::::.: :.: .:..:.... :                                   
CCDS26 HCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHD
         300       310       320       330       340       350     

>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2                (360 aa)
 initn: 638 init1: 363 opt: 708  Z-score: 684.9  bits: 135.3 E(32554): 7.9e-32
Smith-Waterman score: 708; 32.9% identity (67.1% similar) in 356 aa overlap (3-345:6-359)

                  10        20        30             40        50  
pF1KB8    MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELI-----CIKEDVREFAKVFLPVFLTIVF
            .:...  :..  :.  : .:. .   ..     :  :.. :. : :. .. ..::
CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESL-EINKYFVVIIYALVF
               10        20        30        40         50         

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 VIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMC
       ...: :::.:. .  : .  :. ::::.::::.::::. .:::.::.. :.::..: ..:
CCDS24 LLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLC
      60        70        80        90       100       110         

            120       130       140       150         160       170
pF1KB8 KITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCWI--ICFCVWMAAILLSI
       :..: :  .:: ::. .:::::.:::.:.... ... . :   .  ::. .:  ..::..
CCDS24 KVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHA-TRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLAL
     120       130       140       150        160       170        

              180       190          200       210       220       
pF1KB8 PQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSM---KALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTL
       : :.:  .  ..   :   . .:..    . :...:   .::.::.:::  :: .: :::
CCDS24 PVLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTL
      180       190       200       210       220       230        

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB8 MKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQV
       .:    .  : ..:...::..:..  ::::.: .  ..     .  .:.  ...: :...
CCDS24 FKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDA
      240       250       260       270       280       290        

       290       300       310       320          330       340    
pF1KB8 TESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQ---RQSVEEFPFDSEGPTEP
       :: ....::::::..:.:.: .:.. ..:.   .:   ..   ..:   :  .: : :  
CCDS24 TEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTST
      300       310       320       330       340       350        

          350
pF1KB8 TSTFSI
       :     
CCDS24 TL    
      360    

>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (387 aa)
 initn: 587 init1: 356 opt: 685  Z-score: 662.9  bits: 131.3 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 685; 35.4% identity (67.7% similar) in 316 aa overlap (8-320:32-342)

                                      10        20        30       
pF1KB8                        MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVR
                                     . : . :    :  ..:..    :   :. 
CCDS54 REPLEAFKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTEN--FEYDDLAEACYIGDIV
              10        20        30        40          50         

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB8 EFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFW
        :. ::: .: ...:.:::.:: .::   .  :: .. ::.:.::::..:::.. :::::
CCDS54 VFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFW
      60        70        80        90       100       110         

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB8 AVNAVHGWVLGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCW--
       .   ..   : . :::.:.:.. ..: ... :.. ::::::.:.. . ..:  ..     
CCDS54 THYLINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIV-LAANSMNNRTVQHG
     120       130       140       150       160        170        

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB8 -IICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFL
         : . :: ::::.. ::..:   ..: .:.  .:. :     .: ..    .::..:.:
CCDS54 VTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKEN-ECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLL
      180       190       200        210       220       230       

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB8 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS
       ::. :::   .::..  : : .. .:..: :::::..   :::.. : ... . :... :
CCDS54 IMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKL-YDFFPS
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KB8 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEF
       :.: : . .:..:::..:. : ::::..:.: : .:. :....  :              
CCDS54 CDMRKDLRLALSVTETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDF
        300       310       320       330       340       350      

          340       350               
pF1KB8 PFDSEGPTEPTSTFSI               
                                      
CCDS54 SSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
        360       370       380       

>>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (355 aa)
 initn: 587 init1: 356 opt: 684  Z-score: 662.4  bits: 131.1 E(32554): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 684; 36.1% identity (69.2% similar) in 302 aa overlap (22-320:12-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
                            ..:..    :   :.  :. ::: .: ...:.:::.:: 
CCDS43           MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNL
                         10        20        30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
       .::   .  :: .. ::.:.::::..:::.. :::::.   ..   : . :::.:.:.. 
CCDS43 LVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLHNAMCKFTTAFFF
               60        70        80        90       100       110

              130       140       150          160       170       
pF1KB8 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCW---IICFCVWMAAILLSIPQLVFYT
       ..: ... :.. ::::::.:.. . ..:  ..       : . :: ::::.. ::..:  
CCDS43 IGFFGSIFFITVISIDRYLAIV-LAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTK
              120       130        140       150       160         

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pF1KB8 VNDNARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKISR
        ..: .:.  .:. :     .: ..    .::..:.:::. :::   .::..  : : ..
CCDS43 QKEN-ECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAK
     170        180       190       200       210       220        

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pF1KB8 PLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHSC
        .:..: :::::..   :::.. : ... . :... ::.: : . .:..:::..:. : :
CCDS43 AIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKL-YDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAFSHCC
      230       240       250        260       270       280       

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pF1KB8 LNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI       
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CCDS43 LNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTS
       290       300       310       320       330       340       




350 residues in 1 query   sequences
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 start: Sat Nov  5 09:40:27 2016 done: Sat Nov  5 09:40:28 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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