Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0317
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0317, 823 aa
  1>>>pF1KSDA0317 823 - 823 aa - 823 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7541+/-0.00102; mu= 18.0774+/- 0.062
 mean_var=72.6571+/-14.261, 0's: 0 Z-trim(104.3): 59  B-trim: 23 in 1/47
 Lambda= 0.150465
 statistics sampled from 7764 (7823) to 7764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.24), width:  16
 Scan time:  2.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14         ( 823) 5556 1216.0       0
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX         (4374)  716 165.7 1.5e-39
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16         ( 431)  685 158.5 2.2e-38
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16         ( 754)  685 158.6 3.6e-38
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16         ( 870)  685 158.7   4e-38
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20         ( 752)  675 156.5 1.6e-37
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20         ( 862)  675 156.5 1.8e-37
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20         ( 903)  675 156.5 1.9e-37
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8           ( 922)  644 149.8   2e-35
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 834)  593 138.7   4e-32
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 854)  593 138.7 4.1e-32
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 911)  593 138.7 4.3e-32
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 947)  593 138.7 4.5e-32
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 955)  593 138.7 4.5e-32
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 967)  593 138.7 4.6e-32
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18       ( 975)  593 138.7 4.6e-32
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6          ( 909)  588 137.6 9.2e-32
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         ( 900)  586 137.2 1.2e-31
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         (1247)  586 137.2 1.6e-31
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         (1303)  586 137.2 1.7e-31
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15         (1319)  586 137.2 1.7e-31
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7          (1083)  540 127.2 1.5e-28
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7        ( 731)  500 118.5 4.3e-26
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7        ( 757)  500 118.5 4.4e-26
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7         (1572)  503 119.3 5.3e-26
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7          (1606)  503 119.3 5.4e-26
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17       ( 748)  498 118.0 5.9e-26
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2         (1216)  500 118.6 6.6e-26
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2         (1572)  500 118.6 8.3e-26
CCDS9129.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12         (1068)  490 116.4 2.7e-25
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10       ( 776)  447 107.0 1.3e-22
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10      ( 780)  447 107.0 1.3e-22
CCDS64946.1 UBR5 gene_id:51366|Hs108|chr8          (2798)  385 93.8 4.5e-18
CCDS34933.1 UBR5 gene_id:51366|Hs108|chr8          (2799)  385 93.8 4.5e-18
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15         ( 852)  377 91.8 5.3e-18
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15         ( 872)  377 91.8 5.4e-18
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15         ( 875)  377 91.8 5.4e-18
CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15         (4861)  317 79.1   2e-13
CCDS63145.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2         (1722)  291 73.3 4.1e-12
CCDS33391.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2         (1992)  291 73.3 4.6e-12
CCDS63146.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2         (2040)  291 73.3 4.7e-12
CCDS41939.1 HECTD1 gene_id:25831|Hs108|chr14       (2610)  277 70.3 4.8e-11


>>CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14              (823 aa)
 initn: 5556 init1: 5556 opt: 5556  Z-score: 6512.7  bits: 1216.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5556; 100.0% identity (100.0% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MFYVIGGITVSVVAFFFTIKFLFELAARVVSFLQNEDRERRGDRTIYDYVRGNYLDPRSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MFYVIGGITVSVVAFFFTIKFLFELAARVVSFLQNEDRERRGDRTIYDYVRGNYLDPRSC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KVSWDWKDPYEVGHSMAFRVHLFYKNGQPFPAHRPVGLRVHISHVELAVEIPVTQEVLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVSWDWKDPYEVGHSMAFRVHLFYKNGQPFPAHRPVGLRVHISHVELAVEIPVTQEVLQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNSNVVKVAFTVRKAGRYEITVKLGGLNVAYSPYYKIFQPGMVVPSKTKIVCHFSTLVLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNSNVVKVAFTVRKAGRYEITVKLGGLNVAYSPYYKIFQPGMVVPSKTKIVCHFSTLVLT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD CGQPHTLQIVPRDEYDNPTNNSMSLRDEHNYTLSIHELGPQEEESTGVSFEKSVTSNRQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CGQPHTLQIVPRDEYDNPTNNSMSLRDEHNYTLSIHELGPQEEESTGVSFEKSVTSNRQT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FQVFLRLTLHSRGCFHACISYQNQPINNGEFDIIVLSEDEKNIVERNVSTSGVSIYFEAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FQVFLRLTLHSRGCFHACISYQNQPINNGEFDIIVLSEDEKNIVERNVSTSGVSIYFEAY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LYNATNCSSTPWHLPPMHMTSSQRRPSTAVDEEDEDSPSECHTPEKVKKPKKVYCYVSPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYNATNCSSTPWHLPPMHMTSSQRRPSTAVDEEDEDSPSECHTPEKVKKPKKVYCYVSPK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QFSVKEFYLKIIPWRLYTFRVCPGTKFSYLGPDPVHKLLTLVVDDGIQPPVELSCKERNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QFSVKEFYLKIIPWRLYTFRVCPGTKFSYLGPDPVHKLLTLVVDDGIQPPVELSCKERNI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PNRPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNRPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFET
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD DDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD NLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820   
pF1KSD HSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
              790       800       810       820   

>>CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX              (4374 aa)
 initn: 596 init1: 197 opt: 716  Z-score: 823.3  bits: 165.7 E(32554): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 723; 34.6% identity (67.2% similar) in 396 aa overlap (439-822:3994-4373)

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. : ..:..::...     .  ....: :
CCDS35 TVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRR
          3970      3980      3990      4000      4010      4020   

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR
         ..:.: .  .  :  . .. . .::. ::. : ::  :::. .: . .:.    :: :
CCDS35 DHVFEDSYRELHRKSPEEMKNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALF-R
          4030      4040      4050      4060      4070      4080   

      530       540          550       560       570       580     
pF1KSD FSDNNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFL
        : ....    ::.    : ::  ....:.::.:.: .:..       .:..  ::::: 
CCDS35 TSPGDRVTYTINPSSHCNPNHL--SYFKFVGRIVAKAVYDN-------RLLECYFTRSFY
           4090      4100        4110      4120             4130   

         590       600       610       620         630       640   
pF1KSD AQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEM--ELVFAEEKYNKSGQLDKVVELM
        .:.:  ..:  .:..: .::.. : ..:.::.: .  .:.:. :  .. : . .: .: 
CCDS35 KHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLV-YLLENDVSTLGYDLTFSTE-VQEFG-VCEVRDLK
          4140      4150       4160      4170       4180       4190

           650       660       670       680       690       700   
pF1KSD TGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELL
        .::.  ::. ::  :..:. :.:... .....  ::.:. :..:. :..:: :.:::::
CCDS35 PNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELL
             4200      4210      4220      4230      4240      4250

           710       720       730       740       750       760   
pF1KSD MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP
       . :   :...:.:...     ...     ..::: .. :. : . :..:::.::.:..: 
CCDS35 ISGLPTIDIDDLKSNTEY--HKYQSNSIQIQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPL
             4260        4270      4280      4290      4300        

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pF1KSD GGFAAL-----CPSFQIIAAPTHST--LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEG
        :::::       .:::     .::  ::.:::::::: ::.:.:.:....:: :::.: 
CCDS35 QGFAALEGMNGIQKFQI-HRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQEC
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        820   
pF1KSD CEGFGML
        ::::. 
CCDS35 SEGFGLA
      4370    

>>CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16              (431 aa)
 initn: 661 init1: 208 opt: 685  Z-score: 802.6  bits: 158.5 E(32554): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 694; 36.3% identity (63.2% similar) in 375 aa overlap (460-821:74-429)

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD HKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSK
                                     :.: ..:::..:.:.:..   :..  :  .
CCDS58 TKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRR
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pF1KSD NFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQAL-VHPNPN-RPAHL
        . .... ::.::.::  :::: :. . ...    ::   . ::  : ..:  .  : ::
CCDS58 RLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHL
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pF1KSD RLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYK
          ...: ::...  ::       . ... . ::  :  .... :   : .:. :::::.
CCDS58 --TYFRFIGRFIAMALY-------HGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYN
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pF1KSD SKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVV--ELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLL
       : . .: .:.. :  .:: : ..       : ::.  ::  :: .  ::. ::  :. ::
CCDS58 S-IVWIKENNLEECGLELYFIQDME----ILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLL
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       ...:..  :.:... :: :.::..: . :  :::.::::..::  .:..::..  ..   
CCDS58 TDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYR-
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pF1KSD GSWHFRE--KVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPS-----FQII
          :. .  : ..::: ::. . .:.  :::::.::. .:: :::: :  :     : : 
CCDS58 ---HYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCID
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pF1KSD AAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
        .  .. :: .:::::.: :: : :::.... :  :: :  ::::  
CCDS58 KVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEE-TEGFGQE
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>>CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16              (754 aa)
 initn: 691 init1: 208 opt: 685  Z-score: 798.8  bits: 158.6 E(32554): 3.6e-38
Smith-Waterman score: 694; 36.3% identity (63.2% similar) in 375 aa overlap (460-821:397-752)

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD HKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSK
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CCDS58 TKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRR
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pF1KSD NFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQAL-VHPNPN-RPAHL
        . .... ::.::.::  :::: :. . ...    ::   . ::  : ..:  .  : ::
CCDS58 RLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHL
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pF1KSD RLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYK
          ...: ::...  ::       . ... . ::  :  .... :   : .:. :::::.
CCDS58 --TYFRFIGRFIAMALY-------HGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYN
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pF1KSD SKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVV--ELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLL
       : . .: .:.. :  .:: : ..       : ::.  ::  :: .  ::. ::  :. ::
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pF1KSD AQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVG
       ...:..  :.:... :: :.::..: . :  :::.::::..::  .:..::..  ..   
CCDS58 TDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYR-
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pF1KSD GSWHFRE--KVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPS-----FQII
          :. .  : ..::: ::. . .:.  :::::.::. .:: :::: :  :     : : 
CCDS58 ---HYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCID
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pF1KSD AAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
        .  .. :: .:::::.: :: : :::.... :  :: :  ::::  
CCDS58 KVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEE-TEGFGQE
      710       720       730       740        750    

>>CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16              (870 aa)
 initn: 691 init1: 208 opt: 685  Z-score: 797.8  bits: 158.7 E(32554): 4e-38
Smith-Waterman score: 694; 36.3% identity (63.2% similar) in 375 aa overlap (460-821:513-868)

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD HKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSK
                                     :.: ..:::..:.:.:..   :..  :  .
CCDS10 TKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRR
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     490       500       510       520       530        540        
pF1KSD NFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQAL-VHPNPN-RPAHL
        . .... ::.::.::  :::: :. . ...    ::   . ::  : ..:  .  : ::
CCDS10 RLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHL
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pF1KSD RLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYK
          ...: ::...  ::       . ... . ::  :  .... :   : .:. :::::.
CCDS10 --TYFRFIGRFIAMALY-------HGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYN
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pF1KSD SKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVV--ELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLL
       : . .: .:.. :  .:: : ..       : ::.  ::  :: .  ::. ::  :. ::
CCDS10 S-IVWIKENNLEECGLELYFIQDME----ILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLL
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pF1KSD AQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVG
       ...:..  :.:... :: :.::..: . :  :::.::::..::  .:..::..  ..   
CCDS10 TDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYR-
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pF1KSD GSWHFRE--KVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPS-----FQII
          :. .  : ..::: ::. . .:.  :::::.::. .:: :::: :  :     : : 
CCDS10 ---HYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCID
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pF1KSD AAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML
        .  .. :: .:::::.: :: : :::.... :  :: :  ::::  
CCDS10 KVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEE-TEGFGQE
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>>CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20              (752 aa)
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Smith-Waterman score: 713; 34.7% identity (65.1% similar) in 392 aa overlap (439-821:377-750)

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pF1KSD PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. ::..:.   .:. : . : :.:  :.:
CCDS58 DHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQ-HIKIT--VTR
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pF1KSD HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR
       ..:.:.:..   .:: .:  . . :.:  ::.::.::  :::: :. . ...    ::  
CCDS58 KTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFPGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEY
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pF1KSD FSDNNQAL-VHPNPN-RPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA
        . .:  : ..:     : :  ::...: ::...  :...       ... . :.  :  
CCDS58 AGKDNYCLQINPASYINPDH--LKYFRFIGRFIAMALFHG-------KFIDTGFSLPFYK
           470       480         490       500              510    

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pF1KSD QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMT
       .:..  .  : .:. :::::.: . .. .:.. :  .:. :. .: .  :.. :  .:  
CCDS58 RILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLI-WVKENNIEECDLEMYFSVDK-EILGEI-KSHDLKP
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pF1KSD GGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLM
       .:..  ::. ::  :. ..:..::.  :.:... :..:.::..:.. :  :: .:::.:.
CCDS58 NGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLL
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pF1KSD CGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG
       ::  .:...:.. ::.    . .  ...: :::  :. . .:.  :::::.::. .:: :
CCDS58 CGMQEIDLNDWQRHAIYRHYA-RTSKQIM-WFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVG
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pF1KSD GFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEG
       ::: :  :     : :  .  .. :: .:::::.: :: : :::.... : .:: :  ::
CCDS58 GFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEE-TEG
     690       700       710       720       730       740         

     820   
pF1KSD FGML
       ::  
CCDS58 FGQE
      750  

>>CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20              (862 aa)
 initn: 611 init1: 206 opt: 675  Z-score: 786.2  bits: 156.5 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 713; 34.7% identity (65.1% similar) in 392 aa overlap (439-821:487-860)

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. ::..:.   .:. : . : :.:  :.:
CCDS13 DHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQ-HIKIT--VTR
        460       470       480       490       500        510     

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR
       ..:.:.:..   .:: .:  . . :.:  ::.::.::  :::: :. . ...    ::  
CCDS13 KTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFPGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEY
           520       530       540       550       560       570   

      530        540        550       560       570       580      
pF1KSD FSDNNQAL-VHPNPN-RPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA
        . .:  : ..:     : :  ::...: ::...  :...       ... . :.  :  
CCDS13 AGKDNYCLQINPASYINPDH--LKYFRFIGRFIAMALFHG-------KFIDTGFSLPFYK
           580       590         600       610              620    

        590       600       610       620         630       640    
pF1KSD QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMT
       .:..  .  : .:. :::::.: . .. .:.. :  .:. :. .: .  :.. :  .:  
CCDS13 RILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLI-WVKENNIEECDLEMYFSVDK-EILGEI-KSHDLKP
          630       640        650       660        670        680 

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pF1KSD GGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLM
       .:..  ::. ::  :. ..:..::.  :.:... :..:.::..:.. :  :: .:::.:.
CCDS13 NGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLL
             690       700       710       720       730       740 

          710       720       730       740       750       760    
pF1KSD CGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG
       ::  .:...:.. ::.    . .  ...: :::  :. . .:.  :::::.::. .:: :
CCDS13 CGMQEIDLNDWQRHAIYRHYA-RTSKQIM-WFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVG
             750       760         770       780       790         

          770            780       790       800       810         
pF1KSD GFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEG
       ::: :  :     : :  .  .. :: .:::::.: :: : :::.... : .:: :  ::
CCDS13 GFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEE-TEG
     800       810       820       830       840       850         

     820   
pF1KSD FGML
       ::  
CCDS13 FGQE
      860  

>>CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20              (903 aa)
 initn: 611 init1: 206 opt: 675  Z-score: 785.9  bits: 156.5 E(32554): 1.9e-37
Smith-Waterman score: 713; 34.7% identity (65.1% similar) in 392 aa overlap (439-821:528-901)

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. ::..:.   .:. : . : :.:  :.:
CCDS58 DHNRRTTTYIDPRTGKSALDNGPQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQ-HIKIT--VTR
       500       510       520       530       540        550      

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR
       ..:.:.:..   .:: .:  . . :.:  ::.::.::  :::: :. . ...    ::  
CCDS58 KTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFPGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEY
          560       570       580       590       600       610    

      530        540        550       560       570       580      
pF1KSD FSDNNQAL-VHPNPN-RPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA
        . .:  : ..:     : :  ::...: ::...  :...       ... . :.  :  
CCDS58 AGKDNYCLQINPASYINPDH--LKYFRFIGRFIAMALFHG-------KFIDTGFSLPFYK
          620       630         640       650              660     

        590       600       610       620         630       640    
pF1KSD QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMT
       .:..  .  : .:. :::::.: . .. .:.. :  .:. :. .: .  :.. :  .:  
CCDS58 RILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLI-WVKENNIEECDLEMYFSVDK-EILGEI-KSHDLKP
         670       680        690       700        710        720  

          650       660       670       680       690       700    
pF1KSD GGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLM
       .:..  ::. ::  :. ..:..::.  :.:... :..:.::..:.. :  :: .:::.:.
CCDS58 NGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLL
            730       740       750       760       770       780  

          710       720       730       740       750       760    
pF1KSD CGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG
       ::  .:...:.. ::.    . .  ...: :::  :. . .:.  :::::.::. .:: :
CCDS58 CGMQEIDLNDWQRHAIYRHYA-RTSKQIM-WFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVG
            790       800        810        820       830       840

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pF1KSD GFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEG
       ::: :  :     : :  .  .. :: .:::::.: :: : :::.... : .:: :  ::
CCDS58 GFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEE-TEG
              850       860       870       880       890          

     820   
pF1KSD FGML
       ::  
CCDS58 FGQE
     900   

>>CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8                (922 aa)
 initn: 650 init1: 204 opt: 644  Z-score: 749.3  bits: 149.8 E(32554): 2e-35
Smith-Waterman score: 654; 33.2% identity (62.8% similar) in 392 aa overlap (439-821:547-920)

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR
                                     :. :.  : : : : .    : :.  .:::
CCDS62 HNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQIAYERGFRWKLAHF-RYLCQSNALPSHVKI--NVSR
        520       530       540       550        560         570   

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pF1KSD HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR
       ..:.:.:..    ..  :  . . :.:. ::.::.::  :::: :. . ...    ::  
CCDS62 QTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIFRGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEY
           580       590       600       610       620       630   

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pF1KSD FSDNNQAL-VHPNPN-RPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA
        . ::  : ..:  .  : :  :... : ::...  :...       ... . :.  :  
CCDS62 AGKNNYCLQINPASTINPDH--LSYFCFIGRFIAMALFHG-------KFIDTGFSLPFYK
           640       650         660       670              680    

        590       600       610       620         630       640    
pF1KSD QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE--MELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMT
       .... ..  : .:. : :::.: . .: .:.. :  .:. :. . ..  :.. .  .:  
CCDS62 RMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLI-WIRDNNIEECGLEMYFSVD-MEILGKVTSH-DLKL
          690       700        710       720        730        740 

          650       660       670       680       690       700    
pF1KSD GGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLM
       ::..  ::. ::  :..:....:..  :.:... :: :.::.:: . :  :::.:::...
CCDS62 GGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVML
             750       760       770       780       790       800 

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pF1KSD CGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG
       ::  .....:.. ..:    . . .. .  :::  :.   .:   :::::.::. .:: :
CCDS62 CGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQII--WFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLG
             810       820         830       840       850         

          770            780       790       800       810         
pF1KSD GFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEG
       ::: :  :     : :  .   . :: .:::::.: :: : :::.... : .:: :  ::
CCDS62 GFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEE-TEG
     860       870       880       890       900       910         

     820   
pF1KSD FGML
       ::  
CCDS62 FGQE
      920  

>>CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18            (834 aa)
 initn: 615 init1: 260 opt: 593  Z-score: 690.2  bits: 138.7 E(32554): 4e-32
Smith-Waterman score: 764; 31.0% identity (59.9% similar) in 568 aa overlap (303-820:287-830)

            280       290       300       310         320       330
pF1KSD IIVLSEDEKNIVERNVSTSGVSIYFEAYLYNATNCSSTPWHL--PPMHMTSSQRRPSTAV
                                     .::: ..   ::  : ..   :   :....
CCDS45 KGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNN---HLIEPQIRRPRSLSSPTVTL
        260       270       280       290          300       310   

                 340       350         360        370        380   
pF1KSD D---EEDEDSPSECHTPEKVKKPK--KVYCYVSPK-QFSVKEFYLKIIP-WRLYTFRVCP
       .   :  .::: .  . . ...:.  .   : ::: : .: . .:   : :..   :. :
CCDS45 SAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLP--PGWEM---RIAP
           320       330       340       350         360           

                     390            400        410            420  
pF1KSD -GTKF---------SYLGPD---PVH--KLLTLVVDD-GIQPP-----VELSCKERNILA
        :  :         ..  :    :::  .  .:  .: :  ::     ..:. .   :  
CCDS45 NGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDH
      370       380       390       400       410       420        

                  430            440       450       460       470 
pF1KSD ATFI------RSLHKNIGG-----SETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHAL
        . :      :  .  : :     :. :..: ..:...:..     :. .  .:. :. .
CCDS45 NSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKK-PADIPN-RFEMKLHRNNI
      430       440       450       460        470        480      

             480       490        500       510       520       530
pF1KSD LESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFS
       .: : .   . .  :  :  . . :..:..::.::  :::: :. : .:.    ::   .
CCDS45 FEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSA
        490       500       510       520       530       540      

               540       550       560       570       580         
pF1KSD DNNQAL-VHPNPNRPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQII
        .: .: ..:: .   . .:... : ::..:  .....:  ..       : : :  ...
CCDS45 TDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGF-------FIRPFYKMML
        550       560       570       580              590         

     590       600       610       620         630       640       
pF1KSD GLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELMTGGA
       : ..  . .:. : :.:.: . .::.:: .:..:.:   ::..... :.:    :  .:.
CCDS45 GKQITLNDMESVDSEYYNS-LKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVD----LKPNGS
     600       610        620       630       640           650    

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD QTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGT
       .  ::: ::  :..:. :.:....:..... ::.:..::.: .:. ::::::::::::: 
CCDS45 EIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGL
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