Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0313
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0313, 1499 aa
  1>>>pF1KSDA0313 1499 - 1499 aa - 1499 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0300+/-0.00116; mu= 2.2973+/- 0.070
 mean_var=230.2315+/-45.522, 0's: 0 Z-trim(109.9): 78  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.084526
 statistics sampled from 11124 (11198) to 11124 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.344), width:  16
 Scan time:  5.080

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4        (1499) 9857 1216.3       0
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1509) 5188 646.9 1.3e-184
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1504) 5084 634.2 8.8e-181
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1609) 5084 634.2 9.4e-181
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1601) 4629 578.7 4.7e-164
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       (1391) 4625 578.2 5.9e-164
CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5       ( 827) 3242 409.5 2.2e-113
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 791)  594 86.5 3.4e-16
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 840)  594 86.6 3.6e-16
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 858)  594 86.6 3.7e-16
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 867)  594 86.6 3.7e-16
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       (1011)  594 86.6 4.2e-16
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7        ( 730)  576 84.3 1.5e-15
CCDS11363.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17     ( 456)  545 80.4 1.4e-14
CCDS77023.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17     ( 505)  545 80.5 1.5e-14
CCDS77022.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17     ( 511)  545 80.5 1.5e-14
CCDS31784.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12      ( 881)  532 79.0 7.1e-14
CCDS41775.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12      ( 923)  532 79.0 7.4e-14


>>CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4             (1499 aa)
 initn: 9857 init1: 9857 opt: 9857  Z-score: 6504.7  bits: 1216.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9857; 100.0% identity (100.0% similar) in 1499 aa overlap (1-1499:1-1499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASDPLMSRDIVRDCLEKDPIDRTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASDPLMSRDIVRDCLEKDPIDRTD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGEELDSWSVILNGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGEELDSWSVILNGS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQDYCRILNQVEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQDYCRILNQVEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTFIEDFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTFIEDFLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD TYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFENN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFENN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD QLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD QDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMI
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD AKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD FLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKSE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD TSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLPPFGINS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLPPFGINS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKGYTLAPSGTVDNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKGYTLAPSGTVDNF
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD SDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGMGRMERRTMIEPDQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGMGRMERRTMIEPDQY
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD SLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGRGSWTSCSSGSHDNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGRGSWTSCSSGSHDNI
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD QTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHSTKYNRQNQSRESLEQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHSTKYNRQNQSRESLEQA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVTTEETKPVPMPAHIAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVTTEETKPVPMPAHIAV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD ASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVAR
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490         
pF1KSD SSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
             1450      1460      1470      1480      1490         

>>CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1509 aa)
 initn: 5191 init1: 2409 opt: 5188  Z-score: 3427.6  bits: 646.9 E(32554): 1.3e-184
Smith-Waterman score: 5730; 66.5% identity (84.2% similar) in 1384 aa overlap (20-1393:165-1505)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
                                     :::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
          140       150       160       170       180       190    

      50        60        70        80        90        100        
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
       :.::::::::::::::::::.::.::. :::  ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
          200       210       220       230       240        250   

      110       120       130       140       150       160        
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
       .::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
           260       270       280       290       300       310   

      170       180       190       200       210       220        
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
       ::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
           320       330       340       350       360       370   

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
       ::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
           380       390       400       410       420       430   

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
       .::::.:::::::::::: ::..:: ::::::.  ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
           440       450       460       470       480       490   

      350       360       370       380       390       400        
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
       ::::::::::.:::  ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
           500       510       520       530       540       550   

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
       :::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
           560       570       580       590       600       610   

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
       :::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.::  .  :.::. . :: .:: ::::: 
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
           620        630        640       650        660       670

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
       :::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .:  . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
              680       690       700       710       720       730

       590       600             610       620       630       640 
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPD------LPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREF
       ::::    .:::: .:.      .::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::
CCDS54 DLLQPTTSMLDFS-NPSAVGFYYIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEF
              740        750       760       770       780         

             650       660       670       680       690       700 
pF1KSD AVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDED
       ..:.. : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 GLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDED
     790       800       810       820       830       840         

             710       720       730       740       750       760 
pF1KSD AQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFE
       ::::..:::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::
CCDS54 AQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFE
     850       860       870       880       890       900         

             770       780       790       800       810       820 
pF1KSD EVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVAR
       ...:::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS54 DIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVAR
     910       920       930       940       950       960         

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD LRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLH
       :: ::::::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::
CCDS54 LRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLH
     970       980       990      1000      1010      1020         

             890       900       910       920       930       940 
pF1KSD EGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNA
       :::::::::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: :::.:::::::::::::.
CCDS54 EGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNS
    1030      1040      1050      1060      1070      1080         

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KSD TVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCE
       ..::: : :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: :
CCDS54 NMLDV-QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWE
    1090       1100      1110      1120      1130      1140        

            1010       1020      1030      1040      1050      1060
pF1KSD PATNTLPKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVS
       :: .:: :: ..:. .:: : :::  :...:     : ::       :...: ::::::.
CCDS54 PAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVN
     1150      1160      1170      1180             1190      1200 

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KSD LYPSRKKVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTS
       :.: :::  .:: : .. . ::   :.:. .:: :    ::..::::: :::  ::::.:
CCDS54 LHPIRKKGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPAS
            1210       1220         1230         1240      1250    

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KSD PQSSPRKGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIV
       ::.::.::::: ::.  ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... 
CCDS54 PQGSPHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVP
         1260      1270      1280      1290      1300      1310    

             1190      1200      1210      1220      1230      1240
pF1KSD ETNLGMGRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLD
       :.. .. . :. . :  :. . :    . .  .:    .: :: :.::.::..     ..
CCDS54 ESTGALEKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIE
         1320       1330      1340       1350      1360            

             1250      1260      1270       1280      1290         
pF1KSD AADSGRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIM
       ::::::::::::::.::::.:.. . .::. :  . :::.:   ::    :     :.  
CCDS54 AADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEP
    1370      1380      1390      1400      1410            1420   

    1300      1310      1320      1330      1340      1350         
pF1KSD FSDHSTKYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESS
       .:  ..     .: . :::    : ::.::..  ..  : . ::.:.:  .  :  ::::
CCDS54 YSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESS
          1430      1440          1450       1460        1470      

    1360      1370      1380      1390      1400      1410         
pF1KSD SLTSVTTEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHS
               . : .  :.. .:.::: ::::  ..                          
CCDS54 E-----GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV                      
            1480      1490      1500                               

    1420      1430      1440      1450      1460      1470         
pF1KSD HPARKPPDYNVALQRSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLA

>>CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1504 aa)
 initn: 5210 init1: 2409 opt: 5084  Z-score: 3359.1  bits: 634.2 E(32554): 8.8e-181
Smith-Waterman score: 5759; 66.8% identity (84.5% similar) in 1378 aa overlap (20-1393:165-1500)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
                                     :::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
          140       150       160       170       180       190    

      50        60        70        80        90        100        
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
       :.::::::::::::::::::.::.::. :::  ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
          200       210       220       230       240        250   

      110       120       130       140       150       160        
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
       .::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
           260       270       280       290       300       310   

      170       180       190       200       210       220        
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
       ::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
           320       330       340       350       360       370   

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
       ::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
           380       390       400       410       420       430   

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
       .::::.:::::::::::: ::..:: ::::::.  ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
           440       450       460       470       480       490   

      350       360       370       380       390       400        
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
       ::::::::::.:::  ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
           500       510       520       530       540       550   

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
       :::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
           560       570       580       590       600       610   

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
       :::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.::  .  :.::. . :: .:: ::::: 
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
           620        630        640       650        660       670

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
       :::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .:  . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
              680       690       700       710       720       730

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
       ::::    .::::   :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:.. 
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
              740       750       760       770       780       790

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
       : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS54 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
              800       810       820       830       840       850

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
       :::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS54 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
              860       870       880       890       900       910

       770       780       790       800       810       820       
pF1KSD TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
       ::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS54 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
              920       930       940       950       960       970

       830       840       850       860       870       880       
pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
       :::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS54 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
              980       990      1000      1010      1020      1030

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
       :::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: :::.:::::::::::::...::: 
CCDS54 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDV-
             1040      1050      1060      1070      1080          

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
       : :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS54 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
    1090      1100      1110      1120      1130      1140         

      1010       1020      1030      1040      1050      1060      
pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
        :: ..:. .:: : :::  :...:     : ::       :...: ::::::.:.: ::
CCDS54 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
    1150      1160      1170      1180             1190      1200  

       1070      1080      1090      1100      1110      1120      
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
       :  .:: : .. . ::   :.:. .:: :    ::..::::: :::  ::::.:::.::.
CCDS54 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
            1210         1220         1230      1240      1250     

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
       ::::: ::.  ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... :.. ..
CCDS54 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

       1190      1200      1210      1220      1230      1240      
pF1KSD GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
        . :. . :  :. . :    . .  .:    .: :: :.::.::..     ..::::::
CCDS54 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
        1320       1330       1340      1350      1360         1370

       1250      1260      1270       1280      1290      1300     
pF1KSD GSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHST
       ::::::::.::::.:.. . .::. :  . :::.:   ::    :     :.  .:  ..
CCDS54 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
             1380      1390      1400            1410      1420    

        1310      1320      1330      1340      1350      1360     
pF1KSD KYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVT
            .: . :::    : ::.::..  ..  : . ::.:.:  .  :  ::::      
CCDS54 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESSE-----
         1430          1440       1450      1460        1470       

        1370      1380      1390      1400      1410      1420     
pF1KSD TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKP
         . : .  :.. .:.::: ::::  ..                                
CCDS54 GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV                            
           1480      1490      1500                                

>>CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1609 aa)
 initn: 5504 init1: 2409 opt: 5084  Z-score: 3358.6  bits: 634.2 E(32554): 9.4e-181
Smith-Waterman score: 6038; 65.1% identity (83.2% similar) in 1491 aa overlap (20-1499:165-1609)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
                                     :::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
          140       150       160       170       180       190    

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pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
       :.::::::::::::::::::.::.::. :::  ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
          200       210       220       230       240        250   

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pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
       .::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
           260       270       280       290       300       310   

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pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
       ::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
           320       330       340       350       360       370   

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pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
       ::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
           380       390       400       410       420       430   

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pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
       .::::.:::::::::::: ::..:: ::::::.  ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
           440       450       460       470       480       490   

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pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
       ::::::::::.:::  ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
           500       510       520       530       540       550   

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pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
       :::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
           560       570       580       590       600       610   

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pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
       :::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.::  .  :.::. . :: .:: ::::: 
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
           620        630        640       650        660       670

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
       :::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .:  . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
              680       690       700       710       720       730

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
       ::::    .::::   :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:.. 
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
              740       750       760       770       780       790

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pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
       : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS54 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
              800       810       820       830       840       850

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pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
       :::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS54 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
              860       870       880       890       900       910

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pF1KSD TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
       ::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS54 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
              920       930       940       950       960       970

       830       840       850       860       870       880       
pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
       :::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS54 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
              980       990      1000      1010      1020      1030

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
       :::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: :::.:::::::::::::...::: 
CCDS54 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDV-
             1040      1050      1060      1070      1080          

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pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
       : :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS54 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
    1090      1100      1110      1120      1130      1140         

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pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
        :: ..:. .:: : :::  :...:     : ::       :...: ::::::.:.: ::
CCDS54 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
    1150      1160      1170      1180             1190      1200  

       1070      1080      1090      1100      1110      1120      
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
       :  .:: : .. . ::   :.:. .:: :    ::..::::: :::  ::::.:::.::.
CCDS54 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
            1210         1220         1230      1240      1250     

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
       ::::: ::.  ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... :.. ..
CCDS54 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

       1190      1200      1210      1220      1230      1240      
pF1KSD GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
        . :. . :  :. . :    . .  .:    .: :: :.::.::..     ..::::::
CCDS54 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
        1320       1330       1340      1350      1360         1370

       1250      1260      1270       1280      1290      1300     
pF1KSD GSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHST
       ::::::::.::::.:.. . .::. :  . :::.:   ::    :     :.  .:  ..
CCDS54 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
             1380      1390      1400            1410      1420    

        1310      1320      1330      1340      1350      1360     
pF1KSD KYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVT
            .: . :::    : ::.::..  ..  : . ::.:.:  .  :  ::::      
CCDS54 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESSE-----
         1430          1440       1450      1460        1470       

        1370      1380      1390            1400      1410         
pF1KSD TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIA------RKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEG-H
         . : .  :.. .:.::: ::::.      .:. ::::::::::::.:: ..:. :: :
CCDS54 GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPH
           1480      1490      1500      1510      1520      1530  

     1420      1430      1440      1450      1460      1470        
pF1KSD SHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRL
       .:   :::::.::.:::.:.  : .   :.:...     . :. :..:: :. .   :.:
CCDS54 TH--LKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKL
             1540      1550      1560      1570      1580      1590

     1480      1490         
pF1KSD APYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
       .   .   ..: ::.::::::
CCDS54 GDVTDA--DSEADENEQVSAV
               1600         

>>CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1601 aa)
 initn: 5636 init1: 2409 opt: 4629  Z-score: 3058.8  bits: 578.7 E(32554): 4.7e-164
Smith-Waterman score: 5957; 64.7% identity (82.7% similar) in 1491 aa overlap (20-1499:165-1601)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
                                     :::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS34 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
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pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
       :.::::::::::::::::::.::.::. :::  ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS34 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
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pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
       .::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS34 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
           260       270       280       290       300       310   

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pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
       ::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS34 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
           320       330       340       350       360       370   

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pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
       ::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS34 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
           380       390       400       410       420       430   

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
       .::::.:::::::::::: ::..:: ::::::.  ::::::::.::::::::::::::::
CCDS34 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
           440       450       460       470       480       490   

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pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
       ::::::::::.:::  ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS34 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
           500       510       520       530       540       550   

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
       :::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS34 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
           560       570       580       590       600       610   

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pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
       :::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.::  .  :.::. . :: .:: ::::: 
CCDS34 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
           620        630        640       650        660       670

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pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
       :::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .:  . .:. ::::::.:
CCDS34 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
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       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
       ::::    .::::   :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:.. 
CCDS34 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
              740       750       760       770       780       790

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pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
       : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS34 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
              800       810       820       830       840       850

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pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
       :::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS34 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
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pF1KSD TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
       ::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS34 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
              920       930       940       950       960       970

       830       840       850       860       870       880       
pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
       :::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS34 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
              980       990      1000      1010      1020      1030

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
       :::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: :        ::::::::...::: 
CCDS34 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDV-
             1040      1050      1060              1070      1080  

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
       : :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS34 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
            1090      1100      1110      1120      1130      1140 

      1010       1020      1030      1040      1050      1060      
pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
        :: ..:. .:: : :::  :...:     : ::       :...: ::::::.:.: ::
CCDS34 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
            1150      1160      1170             1180      1190    

       1070      1080      1090      1100      1110      1120      
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
       :  .:: : .. . ::   :.:. .:: :    ::..::::: :::  ::::.:::.::.
CCDS34 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
         1200          1210         1220      1230      1240       

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
       ::::: ::.  ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... :.. ..
CCDS34 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

       1190      1200      1210      1220      1230      1240      
pF1KSD GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
        . :. . :  :. . :    . .  .:    .: :: :.::.::..     ..::::::
CCDS34 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
      1310       1320      1330       1340      1350         1360  

       1250      1260      1270       1280      1290      1300     
pF1KSD GSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHST
       ::::::::.::::.:.. . .::. :  . :::.:   ::    :     :.  .:  ..
CCDS34 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
           1370      1380      1390         1400         1410      

        1310      1320      1330      1340      1350      1360     
pF1KSD KYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVT
            .: . :::    : ::.::..  ..  : . ::.:.:  .  :  ::::      
CCDS34 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESSE-----
       1420          1430       1440      1450        1460         

        1370      1380      1390            1400      1410         
pF1KSD TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIA------RKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEG-H
         . : .  :.. .:.::: ::::.      .:. ::::::::::::.:: ..:. :: :
CCDS34 GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPH
         1470      1480      1490      1500      1510      1520    

     1420      1430      1440      1450      1460      1470        
pF1KSD SHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRL
       .:   :::::.::.:::.:.  : .   :.:...     . :. :..:: :. .   :.:
CCDS34 TH--LKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKL
           1530      1540      1550      1560      1570      1580  

     1480      1490         
pF1KSD APYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
       .   .   ..: ::.::::::
CCDS34 GDVTDA--DSEADENEQVSAV
             1590      1600 

>>CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (1391 aa)
 initn: 5037 init1: 2409 opt: 4625  Z-score: 3057.1  bits: 578.2 E(32554): 5.9e-164
Smith-Waterman score: 5207; 72.8% identity (88.8% similar) in 1111 aa overlap (20-1127:165-1248)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
                                     :::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
          140       150       160       170       180       190    

      50        60        70        80        90        100        
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
       :.::::::::::::::::::.::.::. :::  ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
          200       210       220       230       240        250   

      110       120       130       140       150       160        
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
       .::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
           260       270       280       290       300       310   

      170       180       190       200       210       220        
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
       ::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
           320       330       340       350       360       370   

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
       ::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
           380       390       400       410       420       430   

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
       .::::.:::::::::::: ::..:: ::::::.  ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
           440       450       460       470       480       490   

      350       360       370       380       390       400        
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
       ::::::::::.:::  ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
           500       510       520       530       540       550   

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
       :::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
           560       570       580       590       600       610   

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
       :::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.::  .  :.::. . :: .:: ::::: 
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
           620        630        640       650        660       670

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
       :::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .:  . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
              680       690       700       710       720       730

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
       ::::    .::::   :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:.. 
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
              740       750       760       770       780       790

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
       : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS54 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
              800       810       820       830       840       850

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
       :::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS54 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
              860       870       880       890       900       910

       770       780       790       800       810       820       
pF1KSD TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
       ::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS54 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
              920       930       940       950       960       970

       830       840       850       860       870       880       
pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
       :::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS54 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
              980       990      1000      1010      1020      1030

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
       :::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: :        ::::::::...::: 
CCDS54 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDV-
             1040      1050      1060              1070      1080  

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
       : :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS54 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
            1090      1100      1110      1120      1130      1140 

      1010       1020      1030      1040      1050      1060      
pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
        :: ..:. .:: : :::  :...:     : ::       :...: ::::::.:.: ::
CCDS54 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
            1150      1160      1170             1180      1190    

       1070      1080      1090      1100      1110      1120      
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
       :  .:: : .. . ::   :.:. .:: :    ::..::::: :::  ::::.:::.::.
CCDS54 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
         1200          1210         1220      1230      1240       

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
       :                                                           
CCDS54 KVGSIISDHSSKISGQSCPGIGGAYLQKKILQITRSTAKRTDSTEKATEENRDRTSCENT
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

>>CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5            (827 aa)
 initn: 3157 init1: 2409 opt: 3242  Z-score: 2149.0  bits: 409.5 E(32554): 2.2e-113
Smith-Waterman score: 3242; 73.8% identity (90.7% similar) in 667 aa overlap (20-684:165-827)

                          10        20        30        40         
pF1KSD            MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
                                     :::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
          140       150       160       170       180       190    

      50        60        70        80        90        100        
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
       :.::::::::::::::::::.::.::. :::  ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
          200       210       220       230       240        250   

      110       120       130       140       150       160        
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
       .::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
           260       270       280       290       300       310   

      170       180       190       200       210       220        
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
       ::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
           320       330       340       350       360       370   

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
       ::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
           380       390       400       410       420       430   

      290       300       310       320       330       340        
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
       .::::.:::::::::::: ::..:: ::::::.  ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
           440       450       460       470       480       490   

      350       360       370       380       390       400        
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
       ::::::::::.:::  ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
           500       510       520       530       540       550   

      410       420       430       440       450       460        
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
       :::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
           560       570       580       590       600       610   

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
       :::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.::  .  :.::. . :: .:: ::::: 
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
           620        630        640       650        660       670

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
       :::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .:  . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
              680       690       700       710       720       730

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
       ::::    .::::   :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:.. 
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
              740       750       760       770       780       790

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
       : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.::                       
CCDS54 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGR                       
              800       810       820                              

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CCDS74 GVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHM
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       :  :.: : .:: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:..:    ..::...:.:
CCDS74 RMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQG
      110       120       130       140       150       160        

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       ::  :: .::.:::.:. :  : .  :  :..::    ..     . .  . :.:.:. .
CCDS74 EEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRV
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pF1KSD AQQDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEE
        ..:. ::: .:: :  ...:. . :.: :.     .:.: ..   .:.:.    . :  
CCDS74 DKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVP---AGNRASN---QGNSQPQQKYTV--
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        : .   ..: :: : :          .  :.  .:  : : .    ..  :...     
CCDS74 MSGTPEKILEHFLETIRL---------EATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLC----
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        ::.. ..  .  .. :.:::           : . :::.. :.       : .  .   
CCDS74 -PALVAHYHAQPSQGTEQEKMDY---------ALNNKRRVIRLV-------LQWAAM---
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                               :: . :      ......                  
CCDS74 -----------------------YGDLLQE------DDVSMA------------------
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           ..:. . .:.. :  :           : . ..:.:    :...  ..... .:: 
CCDS74 ---FLEEFYVSVSDDARMIA-----------ALKEQLPEL----EKIV--KQISEDAKA-
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                           ::: .. .    .  :  .  ::        :. :.    
CCDS74 --------------------PQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ--------PIRGS----
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                            :.:: .:.  :.    : .   :..::: :.:. .    
CCDS74 ---------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEV-ISAVAD--KL
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       .. .   . ..:   : :. .   :...: ..  . ..:: .     . ..: .    ::
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pF1KSD LLRESQISLLQL-STVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRS-KTSCANLKRFEE
           . .. ..: :. ..: :... ..:::  ..  : :   :  .. : . :::  : .
CCDS74 GPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLR
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        .:.  :::..::   ..  ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. ::. . :.::
CCDS74 RFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRL
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pF1KSD RTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHE
         ::::::.:..:.. ....:.:::::   ::  :.  .:.::.::..:.. ::.:: ::
CCDS74 ALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYR--LTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE
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pF1KSD GNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNAT
       :: . .:.::::::.::::.  : :  . :  ..:                         
CCDS74 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
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CCDS74 RTLSQMSHRLEPRRP                                             
        780       790                                              

>>CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2            (840 aa)
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        50        60        70        80        90       100       
pF1KSD CSITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASDPLMSRDIV
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CCDS63 GVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHM
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       :  :.: : .:: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:..:    ..::...:.:
CCDS63 RMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQG
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pF1KSD EELDSWSVILNGSVEVT-YPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCI
       ::  :: .::.:::.:. :  : .  :  :..::    ..     . .  . :.:.:. .
CCDS63 EEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRV
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        ..:. ::: .:: :  ...:. . :.: :.     .:.: ..   .:.:.    . :  
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pF1KSD HSVVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEG
        : .   ..: :: : :          .  :.  .:  : : .    ..  :...     
CCDS63 MSGTPEKILEHFLETIRL---------EATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLC----
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pF1KSD DPAMT-RFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGS
        ::.. ..  .  .. :.:::           : . :::.. :.       : .  .   
CCDS63 -PALVAHYHAQPSQGTEQEKMDY---------ALNNKRRVIRLV-------LQWAAM---
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                               :: . :      ......                  
CCDS63 -----------------------YGDLLQE------DDVSMA------------------
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pF1KSD NLFVFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKAN
           ..:. . .:.. :  :           : . ..:.:    :...  ..... .:: 
CCDS63 ---FLEEFYVSVSDDARMIA-----------ALKEQLPEL----EKIV--KQISEDAKA-
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pF1KSD TVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSS
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CCDS63 --------------------PQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ--------PIRGS----
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pF1KSD NPDLLQSHHRILDFSATPDLPDQVL-RVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVT
                            :.:: .:.  :.    : .   :..::: :.:. .    
CCDS63 ---------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEV-ISAVAD--KL
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       .. .   . ..:   : :. .   :...: ..  . ..:: .     . ..: .    ::
CCDS63 GSGEGLIIVKMSSGGEKVVLK---PNDVSVFTT-LTINGRLFACPREQFDSL-TPLPEQE
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pF1KSD LLRESQISLLQL-STVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRS-KTSCANLKRFEE
           . .. ..: :. ..: :... ..:::  ..  : :   :  .. : . :::  : .
CCDS63 GPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLR
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CCDS63 RFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRL
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pF1KSD RTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHE
         ::::::.:..:.. ....:.:::::   ::  :.  .:.::.::..:.. ::.:: ::
CCDS63 ALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYR--LTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE
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pF1KSD GNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNAT
       :: . .:.::::::.::::.  : :  . :  ..:                         
CCDS63 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
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CCDS63 RTLSQMSHRLEPRRP                                             
         830       840                                             

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CCDS63 GVLNHVDQEHHFQDKYLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHM
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       :  :.: : .:: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:..:    ..::...:.:
CCDS63 RMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQG
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       ::  :: .::.:::.:. :  : .  :  :..::    ..     . .  . :.:.:. .
CCDS63 EEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRV
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        ..:. ::: .:: :  ...:. . :.: :.     .:.: ..   .:.:.    . :  
CCDS63 DKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVP---AGNRASN---QGNSQPQQKYTV--
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pF1KSD HSVVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEG
        : .   ..: :: : :          .  :.  .:  : : .    ..  :...     
CCDS63 MSGTPEKILEHFLETIRL---------EATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLC----
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pF1KSD DPAMT-RFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGS
        ::.. ..  .  .. :.:::           : . :::.. :.       : .  .   
CCDS63 -PALVAHYHAQPSQGTEQEKMDY---------ALNNKRRVIRLV-------LQWAAM---
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pF1KSD EKGFGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKT
                               :: . :      ......                  
CCDS63 -----------------------YGDLLQE------DDVSMA------------------
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           ..:. . .:.. :  :           : . ..:.:    :...  ..... .:: 
CCDS63 ---FLEEFYVSVSDDARMIA-----------ALKEQLPEL----EKIV--KQISEDAKA-
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                           ::: .. .    .  :  .  ::        :. :.    
CCDS63 --------------------PQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ--------PIRGS----
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                            :.:: .:.  :.    : .   :..::: :.:. .    
CCDS63 ---------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEV-ISAVAD--KL
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CCDS63 GSGEGLIIVKMSSGGEKVVLK---PNDVSVFTT-LTINGRLFACPREQFDSL-TPLPEQE
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           . .. ..: :. ..: :... ..:::  ..  : :   :  .. : . :::  : .
CCDS63 GPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLR
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        .:.  :::..::   ..  ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. ::. . :.::
CCDS63 RFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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